ในปี 1954 ศาลฎีกาสหรัฐฯ ตัดสินในคดีBrown v. Board of Educationว่าการแบ่งแยกเชื้อชาติในโรงเรียนรัฐบาลนั้นขัดต่อรัฐธรรมนูญ แต่เมื่อไคลด์ เคนนาร์ดทหารผ่านศึกผิวดำจากสงครามเกาหลี พยายามสมัครเข้าเรียนที่วิทยาลัยมิสซิสซิปปีเซาเทิร์นในช่วงปลายทศวรรษ 1950 ประธานวิทยาลัยวิลเลียม แมคเคน ได้พยายามอย่างมากกับกลุ่มการเมืองในรัฐและผู้นำคนผิวดำในท้องถิ่นเพื่อขัดขวาง เคนนาร์ดถูกปฏิเสธถึงสามครั้ง หลังจากที่เขาเขียนจดหมายเกี่ยวกับการรวมกลุ่มทางการศึกษาไปยังหนังสือพิมพ์ท้องถิ่น เขาถูกจับกุมสองครั้งด้วยข้อหาอาชญากรรมที่ถูกสร้างขึ้น ในที่สุดเขาก็ถูกตัดสินว่ามีความผิดและถูกจำคุกเจ็ดปีในเรือนจำของรัฐ

การมีส่วนร่วมโดยตรงของแมคเคนในการละเมิดระบบยุติธรรมนี้ยังไม่ชัดเจน เขาน่าจะทราบว่าข้อกล่าวหาต่อเคนนาร์ดนั้นเป็นเท็จ แต่ทั้งเขาและเจ้าหน้าที่รัฐคนอื่นๆ ก็ไม่ได้คัดค้าน^{[ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ]}ในระหว่างการพูดคุยกับนักธุรกิจในชิคาโก ซึ่งได้รับการสนับสนุนจากคณะกรรมการอำนาจอธิปไตยแห่งรัฐมิสซิสซิปปีแมคเคนกล่าวว่า “เรายืนยันว่าในด้านการศึกษาและสังคม เราจะรักษาสังคมที่แบ่งแยกไว้ ... ด้วยความยุติธรรม ผมยอมรับว่าเราไม่ได้สนับสนุนการลงคะแนนเสียงของคนผิวดำ” เขากล่าว “คนผิวดำต้องการให้การควบคุมรัฐบาลยังคงอยู่ในมือของคนผิวขาว” ^{[ 13 ] [ 14 ] [ 16 ]}ในที่สุดเคนนาร์ดก็ได้รับการปล่อยตัวโดยมีเงื่อนไขในปี 1963 เมื่อเขาป่วยหนักด้วยโรคมะเร็ง เขาเสียชีวิตในอีกหกเดือนต่อมา

ในช่วงต้นทศวรรษ 1960 แรงกดดันระดับชาติเพิ่มมากขึ้นในการบูรณาการสถาบันการศึกษาชั้นสูงของมิสซิสซิปปี แมคเคนเป็นที่รู้จักกันดีว่าคัดค้านอย่างรุนแรงต่อการมีนักศึกษาผิวดำที่มหาวิทยาลัยมิสซิสซิปปีเซาเทิร์น ในปี 1962 เจมส์ เมเรดิธพยายามลงทะเบียนเรียนที่มหาวิทยาลัยมิสซิสซิปปีซึ่งเป็นสถาบันหลักของรัฐ^{[ 13 ]}การลงทะเบียนของเขาสำเร็จลุล่วงไปได้หลังจากเกิดการจลาจลของคนผิวขาวและการใช้กองกำลังของรัฐบาลกลางเพื่อยุติความรุนแรง

ภายในฤดูใบไม้ร่วงปี 1965 ทั้ง มหาวิทยาลัย โอเลมิสและมหาวิทยาลัยรัฐมิสซิสซิปปีได้เปิดรับนักศึกษาผิวสีเข้าเรียนแล้ว โดยมหาวิทยาลัยโอเลมิสเกิดขึ้นอย่างรุนแรง ส่วนมหาวิทยาลัยรัฐมิสซิสซิปปีเกิดขึ้นอย่างสันติ แมคเคน ผู้นำมหาวิทยาลัยโอเลมิส และผู้นำของรัฐตระหนักว่ารัฐจำเป็นต้องเปิดรับนักศึกษาผิวสีเพื่อดึงดูดธุรกิจจากภายนอกรัฐ พวกเขาจึงวางแผนลับอย่างละเอียดสำหรับการรับนักศึกษาผิวดำสองคนแรกของมหาวิทยาลัยโอเลมิสเข้าเรียน มีการแต่งตั้งอาจารย์ผู้ดูแลและติวเตอร์อย่างลับๆ ให้กับนักศึกษาแต่ละคนเพื่อช่วยในการปรับตัว ตำรวจมหาวิทยาลัยได้รับคำสั่งให้ป้องกันหรือหยุดยั้งเหตุการณ์ใดๆ ที่เกิดขึ้นกับนักศึกษาผิวดำทั้งสองคนอย่างรวดเร็ว ผู้นำด้านกีฬา สมาคมนักศึกษา และการเมืองถูกเกณฑ์มาเพื่อรักษาความสงบและปกป้องมหาวิทยาลัยจากข่าวเสียๆ หายๆ ที่มหาวิทยาลัยโอเลมิสเคยประสบในช่วงที่มีการจลาจลต่อต้านการรับเมเรดิธเข้าเรียน

ด้วยเหตุนี้ นักศึกษาผิวดำGwendolyn Elaine ArmstrongและRaylawni Branchจึงได้รับการลงทะเบียนเรียนโดยไม่มีเหตุการณ์ใดๆ เกิดขึ้นในเดือนกันยายน พ.ศ. 2508 ^{[ 17 ] [ 18 ]}ในปี พ.ศ. 2561 USM ได้เปิดตัวเครื่องหมาย Freedom Trail Marker เพื่อเป็นเกียรติแก่ Clyde Kennard ที่ด้านหน้า Kennard Washington Hall ซึ่งตั้งชื่อตามเขาและWalter Washington นักศึกษาปริญญาเอกชาวแอฟริกันอเมริกันคนแรกที่สำเร็จการศึกษาจาก USM ไม่นานหลังจากนั้น ในพิธีสำเร็จการศึกษาในเดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2561 Kennard ได้รับรางวัล Doctor of Humane Letters honoris causa หลัง มรณกรรม^{[ 19 ] [ 20 ]}นักเรียนใน ชั้นเรียน Sunday School ของ Kennard ที่ Mary Magdalene Baptist Church ในEatonville รัฐมิสซิสซิปปีได้รับรางวัลนี้ในนามของเขา

ระหว่างปี พ.ศ. 2498 ถึง พ.ศ. 2508 USM และ McCain ได้ละเมิดสิทธิพลเมืองของนักศึกษาเกย์และเลสเบี้ยน นักศึกษาเกย์และเลสเบี้ยน โดยเฉพาะผู้ชายรักร่วมเพศ ถูกเลือกปฏิบัติและถูกไล่ออก McCain มีเจตนาที่จะกำจัดความไม่บริสุทธิ์ทางเพศทั้งหมดออกจากมหาวิทยาลัย^{[ 21 ]}

ในปี พ.ศ. 2512 สมาคมวัฒนธรรมแอฟริกันอเมริกัน (AACS) ได้ก่อตั้งขึ้น อัลวิน วิลเลียมส์ สมาชิกคนแรกๆ ขององค์กรและศาสตราจารย์กิตติคุณด้านสื่อของมหาวิทยาลัย เรียก AACS ว่าเป็น "ส่วนสำคัญของชีวิตนักศึกษาสำหรับนักศึกษาผิวดำ" ที่เข้าเรียนในมหาวิทยาลัยในช่วงปลายทศวรรษ พ.ศ. 2503 องค์กรนี้ได้รับการเปลี่ยนชื่อเป็นองค์กรนักศึกษาแอฟริกันอเมริกัน (AASO) ในช่วงทศวรรษ พ.ศ. 2533 ^{[ 22 ]}

ช่วงเปลี่ยนผ่านจากทศวรรษ 1960 ถึงทศวรรษ 1970 เกี่ยวข้องกับการเคลื่อนไหวทางสังคมที่เพิ่มขึ้นและการเปลี่ยนแปลงครั้งใหญ่ในมหาวิทยาลัย เพื่อตอบสนองต่อความกังวลที่เพิ่มขึ้นของนักศึกษาผิวดำ มหาวิทยาลัยจึงเร่งความพยายามในการจ้างอาจารย์ผิวดำ ในปี 1972 ชื่อ "นายพลแนท" (นายพลเนธาน เบดฟอร์ด ฟอร์เรสต์ แห่งฝ่ายสัมพันธมิตร) ถูกยกเลิกและเปลี่ยนเป็น "โกลเด้นอีเกิลส์" แทน ในปี 1974 เฟรด คุก นักฟุตบอลที่โดดเด่น ได้รับเลือกให้เป็นมิสเตอร์ยูเอสเอ็มคนแรกที่เป็นคนผิวดำ องค์กรกรีกของคนผิวดำแห่งแรกเปิดตัวในปี 1975 ^{[ 9 ]}เมื่อแมคเคนเกษียณในปี 1975 จำนวนนักศึกษาได้เพิ่มขึ้นเป็น 11,000 คน^{[ 18 ]}

ในช่วงหลายปีหลังจากการปรับปรุงมหาวิทยาลัยโดยแมคเคน มหาวิทยาลัยเซาเทิร์นมิสซิสซิปปีก็ยังคงขยายตัวอย่างมาก การเปลี่ยนแปลงต่างๆ ได้แก่ การเปลี่ยนระบบไตรมาสเป็นระบบภาคการศึกษา การก่อตั้งสถาบันวิทยาศาสตร์พอลิเมอร์ การปรับโครงสร้างโรงเรียน 10 แห่งของมหาวิทยาลัยให้เป็น 6 วิทยาลัย รวมถึงวิทยาลัยพยาบาล การเข้าร่วมเป็นสมาชิกของConference USAการนำระบบการเรียนการสอนออนไลน์มาใช้ และการขยายวิทยาเขตชายฝั่งอ่าวเม็กซิโก

ในช่วงต้นศตวรรษที่ 21 มหาวิทยาลัยเซาเทิร์นมิสซิสซิปปีพัฒนาขึ้นภายใต้การดำรงตำแหน่งของประธานเชลบี เทมส์ วาระการดำรงตำแหน่งของเขามีลักษณะเด่นคือปริมาณงานวิจัยที่ดำเนินการในมหาวิทยาลัยเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญ USM ได้รับการจัดประเภทเป็นมหาวิทยาลัย "ระดับปริญญาเอก/งานวิจัยเชิงลึก" โดยมูลนิธิคาร์เนกีในช่วงยุคของเทมส์^{[ 7 ]}ตามข้อมูลของมูลนิธิวิทยาศาสตร์แห่งชาติ USM ใช้เงิน 61 ล้านดอลลาร์ในการวิจัยและพัฒนาในปี 2018 ซึ่งจัดอยู่ในอันดับที่ 183 ของประเทศ^{[ 30 ]}

การทำงานของมหาวิทยาลัยเทมส์ในการตอบสนองต่อความเสียหายที่เกิดจากพายุเฮอริเคนแคทรีนาได้รับการยกย่องจากชุมชน ในเดือนตุลาคมปี 2548 สภาอาจารย์ของวิทยาเขตกัลฟ์พาร์คได้ผ่านมติแสดงความขอบคุณ หนังสือพิมพ์Hattiesburg Americanรายงานว่าสุนทรพจน์ของมหาวิทยาลัยเทมส์ต่อคณาจารย์ที่ Hattiesburg หลังเหตุการณ์แคทรีนาได้รับการตอบรับเป็นอย่างดี มหาวิทยาลัยเทมส์ไม่ได้เลิกจ้างพนักงานมหาวิทยาลัยแม้แต่คนเดียวหลังพายุ แม้ว่าวิทยาเขตกัลฟ์พาร์คเพียงแห่งเดียวจะได้รับความเสียหายมากกว่า 100 ล้านดอลลาร์ (ในทางตรงกันข้าม มหาวิทยาลัยทูเลนในนิวออร์ลีนส์ได้เลิกจ้างพนักงานประมาณ 25% และยกเลิกโครงการกีฬาและวิชาการที่สำคัญหลายโครงการ รวมถึงสาขาวิทยาการคอมพิวเตอร์และโครงการวิศวกรรมส่วนใหญ่ ในการปรับโครงสร้างองค์กรหลังจากวิทยาเขตปิดทำการและได้รับความเสียหาย)

ฝ่ายบริหารของมหาวิทยาลัยเทมส์ได้จัดหาเงินทุนและกำกับดูแลโครงการก่อสร้างหลายโครงการในมหาวิทยาลัย โดยมักร่วมมือกับภาคเอกชน ส่วนต่อเติมของอาคารสหภาพนักศึกษาเป็นที่ตั้งของ ร้านหนังสือ Barnes & Noble ที่ใหญ่เป็นอันดับสอง ในภาคใต้ของสหรัฐฯ ซึ่งเปิดให้บริการแก่ชุมชน Barnes & Noble จ่ายค่าเช่าปีละ 1.5 ล้านดอลลาร์ นอกจากนี้ เทมส์ยังเจรจาข้อตกลงด้านบริการอาหารกับAramarkซึ่งจะบริจาคเงิน 9 ล้านดอลลาร์ให้กับโครงการก่อสร้างของมหาวิทยาลัย การปรับปรุงอื่นๆ ได้แก่ ร้านอาหารระดับหรู Power House (ซึ่งดัดแปลงมาจากโรงไฟฟ้าของวิทยาลัยเดิม) หมู่บ้านหอพักนักศึกษาหญิงมูลค่า 15 ล้านดอลลาร์ ส่วนต่อเติมสำหรับกีฬาฟุตบอล บาสเกตบอล และเบสบอล และองค์ประกอบการออกแบบเมืองเพื่อให้มหาวิทยาลัยเปิดโล่ง เป็นมิตรกับสิ่งแวดล้อม และเป็นมิตรต่อคนเดินเท้ามากขึ้น

มหาวิทยาลัยประสบกับการตกอันดับอย่างไม่คาดคิดและเป็นที่กล่าวถึงอย่างกว้างขวางจาก "ระดับ 3" ไปสู่ ​​"ระดับ 4" ใน การจัดอันดับวิทยาลัยของ US News & World Reportในปี 2547 ซึ่งตรงกับช่วงที่เกิดข้อโต้แย้งเกี่ยวกับเชลบี เทมส์อย่างรุนแรง เมื่อเขาไล่ศาสตราจารย์ที่มีตำแหน่งถาวรออกเนื่องจาก "ความเห็นต่าง" หลายองค์กรตรวจสอบความถูกต้องตามกฎหมายของการกระทำของเขา เนื่องจากตำแหน่งถาวรมีไว้เพื่อปกป้องความเป็นอิสระทางวิชาการ ในปี 2547 สภาคณะอาจารย์ของ USM ได้แสดงความไม่พอใจต่อเทมส์หลังจากมีการรับฟังข้อกล่าวหา^{[ 31 ]}ต่อมาสภาคณะอาจารย์ได้เผยแพร่การทบทวนการบริหารงานของเทมส์โดยอธิบายถึงข้อโต้แย้งต่างๆ^{[ 32 ]}หลังจากเทมส์ลาออก ในปี 2552 US News & World Reportจัดอันดับมหาวิทยาลัยอีกครั้งให้อยู่ในส่วนบนของ "ระดับ 3" ^{[ 33 ]}ในการ จัดอันดับวิทยาลัย ของ US News & World Report ปี 2554 USM อยู่ใน "ระดับ 2" ในปี 2016 USM ได้รับการจัดอันดับโดย US News & World Report เป็นอันดับ 125 ในกลุ่มมหาวิทยาลัยของรัฐระดับชาติ และอันดับ 220 ในกลุ่มมหาวิทยาลัยระดับชาติ^{[ 34 ]}

มหาวิทยาลัยมิสซิสซิปปี (USM) ยังได้รับการจัดอันดับสูงจากนิตยสาร Washington Monthlyซึ่งเคยวิพากษ์วิจารณ์การจัดอันดับของUS News & World Reportและได้พัฒนาระบบการจัดอันดับของตนเอง การจัดอันดับเหล่านี้พยายามประเมินคุณค่าของสถาบันอย่างรอบด้านมากขึ้น โดย USM ได้รับการจัดอันดับที่ 98 จากสถาบันระดับปริญญาเอก 245 แห่ง ซึ่งเป็นอันดับสูงสุดของโรงเรียนใด ๆ ในรัฐมิสซิสซิปปีณ ปี 2018วอชิงตันมันธ์ลี่จัดอันดับ USM อยู่ที่อันดับ 235 ทั่วประเทศ^{[ 28 ]}

เมื่อวันที่ 10 กุมภาพันธ์ 2556 พายุทอร์นาโดรูปทรงลิ่มระดับ EF4ได้พัดถล่มวิทยาเขตของมหาวิทยาลัยเซาเทิร์นมิสซิสซิปปี ทำให้เกิดความเสียหายมูลค่าหลายสิบล้านดอลลาร์ พายุเริ่มก่อตัวขึ้นทางตะวันตกของเมืองแฮตตีสเบิร์ก และเคลื่อนตัวไปยังทางตะวันตกเฉียงใต้ของรัฐอลาบามา ทำลายอาคารสองหลังและสร้างความเสียหายให้กับอาคารอีกหกหลัง เนื่องจากนักศึกษาส่วนใหญ่ไม่อยู่ในมหาวิทยาลัยในช่วงปิดเทอมเทศกาลมาร์ดิกราส์ และมีการแจ้งเตือนเรื่องพายุทอร์นาโดล่วงหน้า จึงไม่มีผู้เสียชีวิตและมีผู้บาดเจ็บเพียงเล็กน้อยในวิทยาเขต

ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2558 มหาวิทยาลัยเซาเทิร์นมิสซิสซิปปีได้ออกแถลงการณ์เกี่ยวกับการถอดธงรัฐมิสซิสซิปปีออกจากวิทยาเขต USM ทั้งหมด^{[ 35 ]}

เมื่อวันที่ 25 ตุลาคม พ.ศ. 2558 อธิการบดีมหาวิทยาลัย Rodney D. Bennett ได้ออกแถลงการณ์อีกฉบับหนึ่ง โดยประกาศว่ามหาวิทยาลัยจะชักธงเฉพาะที่เขารู้สึกว่าแสดงถึงความสามัคคีของนักศึกษาทุกคนเท่านั้น นับตั้งแต่มีการถอดธงประจำรัฐออก การประท้วงเพื่อนำธงกลับมาจึงกลายเป็นเรื่องปกติในวันอาทิตย์ที่วิทยาเขต Hattiesburg ^{[ 36 ]}

การดำเนินงานของมหาวิทยาลัยในพื้นที่ชายฝั่งอ่าวรัฐมิสซิสซิปปีเริ่มต้นขึ้นในปี 1947 เมื่อวิทยาลัยมิสซิสซิปปีเซาเทิร์นได้จัดชั้นเรียนขึ้นเป็นครั้งแรกที่อาคารแวนฮุกฮอลล์ ในบริเวณค่ายเมธอดิสต์ในเมืองบิโลซีในปี 1958 การดำเนินงานได้ย้ายไปยังโรงเรียนมัธยมต้นแมรี แอล. ไมเคิล ในเมืองบิโลซี เพื่อตอบสนองความต้องการด้านการศึกษาของสาขาวิชาชีพต่างๆ มหาวิทยาลัยจึงย้ายที่ตั้งในปี 1964 ไปยังฐานทัพอากาศคีสเลอร์ นอกจากนี้ยังได้รับอาคารเรียนสำหรับชั้นเรียนภาคค่ำจากวิทยาเขตเจฟเฟอร์สันเดวิสของ วิทยาลัยมิสซิสซิปปีกัลฟ์โคสต์ จูเนียร์คอลเลจ และเรียกสถานที่แห่งนี้ว่าศูนย์ประจำเขตแฮร์ริสันเคาน์ตี ของมหาวิทยาลัย มิสซิสซิปปี (USM Harrison County Resident Center)

ในเดือนกันยายน ปี 1966 มหาวิทยาลัยเซาเทิร์นมิสซิสซิปปีได้ขยายการให้บริการโดยเพิ่มศูนย์นักศึกษาประจำเขตแจ็กสันเคาน์ตี ซึ่งตั้งอยู่บนวิทยาเขตแจ็กสันเคาน์ตีของวิทยาลัยชุมชนแมสซาชูเซตส์ (MGCC)ในเมืองกอเทียร์ ศูนย์แจ็กสันเคาน์ตีสร้างขึ้นเพื่อมหาวิทยาลัยโดยคณะกรรมการกำกับดูแลเขตแจ็กสันเคาน์ตี โดยได้รับการสนับสนุนจากเชลบี เทมส์ ในขณะที่ดำรงตำแหน่งรองประธานบริหารของ USM ศูนย์แห่งนี้สร้างขึ้นโดยมีจุดประสงค์เพื่อให้นักศึกษาในเขตแจ็กสันเคาน์ตีสามารถสำเร็จการศึกษาระดับปริญญาตรีสี่ปีในหลายสาขาผ่านโครงการร่วมระหว่าง MGCCC และ USM อย่างไรก็ตาม ในปี 2009 มหาวิทยาลัยได้ตัดสินใจปิดศูนย์แจ็กสันเคาน์ตีและรวมหลักสูตรไว้ที่สถานที่สอนอื่นๆ บนชายฝั่งอ่าวเม็กซิโก

วิทยาลัยสตรี Gulf Park ในGulfport รัฐมิสซิสซิปปีเปิดทำการในปี 1921 พิธีสำเร็จการศึกษาครั้งสุดท้ายจัดขึ้นในปี 1971 และมหาวิทยาลัย Southern Mississippi ได้เข้าครอบครองวิทยาเขตในปี 1972 ^{[ 45 ]}ในเดือนมีนาคม 1972 USM ได้ย้ายโครงการ Harrison County Resident Center จากวิทยาเขต Jefferson Davis ของ MGCCC ไปยังวิทยาเขต Gulf Park ซึ่งตั้งอยู่บนทางหลวงหมายเลข 90 ในLong Beachหนึ่งในแลนด์มาร์คที่โดดเด่นที่สุดในวิทยาเขตคือต้นโอ๊กมิตรภาพต้นโอ๊กขนาดใหญ่ต้นนี้ตั้งอยู่บนสนามหญ้าของ Hardy Hall และอาคารบริหาร มีอายุย้อนไปถึงประมาณปี 1487 การอ้างอิงที่เก่าแก่ที่สุดเกี่ยวกับชื่อ Friendship Oak พบได้ในบทความที่เขียนโดย Bob Davis ผู้สื่อข่าวของNew York Sunเขาบรรยายถึงต้นไม้ในหนังสือของเขาชื่อPeople, People, Everywhere (1936)

ในเดือนกรกฎาคม ปี 1972 คณะกรรมการผู้บริหารสถาบันอุดมศึกษาของรัฐได้จัดตั้งศูนย์ USM Gulf Park และKeesler Air Force Base Center ขึ้นเป็นวิทยาเขตระดับภูมิภาคของมหาวิทยาลัยเพื่อสำเร็จการศึกษาระดับสูง โดยเปิดสอนหลักสูตรที่นำไปสู่ปริญญาในระดับปริญญาตรีและปริญญาโท การพัฒนาของมหาวิทยาลัยยังคงดำเนินต่อไป และในวันที่ 19 สิงหาคม ปี 2002 มหาวิทยาลัย Southern Miss ได้รับนักศึกษาใหม่รุ่นแรกในวิทยาเขต Gulf Park มหาวิทยาลัย USM เป็นมหาวิทยาลัยครบวงจรแห่งเดียวในรัฐที่มีสถานะเป็นมหาวิทยาลัยสองวิทยาเขต

ในช่วงต้นศตวรรษที่ 21 วิทยาเขตกัลฟ์พาร์คทำหน้าที่เป็นวิทยาเขตหลักสำหรับศูนย์การเรียนการสอนทางไกลหลายแห่ง ซึ่งรวมถึง:

• ศูนย์การสอนและวิจัยอวกาศสเตนนิสตั้งอยู่ในเขตแฮนค็อก เคาน์ตี ชายแดนระหว่างรัฐมิสซิสซิปปีและรัฐลุยเซียนา เป็นสถานที่ทดสอบเครื่องยนต์จรวดที่ใหญ่ที่สุดของนาซา นอกจากนี้ สเตนนิสยังเป็นที่ตั้งของภาควิชาวิทยาศาสตร์ทางทะเลของมหาวิทยาลัยอีกด้วย
• ศูนย์บริการนักศึกษาชายฝั่งอ่าว (Gulf Coast Student Service Center Teaching Site): ตั้งอยู่ในเมืองกัลฟ์พอร์ต สถานที่แห่งนี้กลายเป็นสถานที่ชั่วคราวของวิทยาเขตกัลฟ์พาร์คหลังจากพายุเฮอริเคนแคทรีนา ตั้งแต่ปี 2005 ถึง 2012
• ศูนย์การเรียนการสอนและวิจัยห้องปฏิบัติการวิจัยชายฝั่งอ่าว (GCRL) ซึ่งตั้งอยู่ในเมืองโอเชียนสปริงส์ เป็นที่ตั้งของภาควิชาวิทยาศาสตร์ชายฝั่ง ศูนย์วิจัยและพัฒนาการประมง ศูนย์การศึกษาทางทะเล และศูนย์เพาะเลี้ยงสัตว์น้ำทางทะเลธาด คอชแรน
• ศูนย์ฝึกอบรมพอยต์เคเด็ต ตั้งอยู่ที่บิโลซี เรือวิจัย R/V Tommy Munroขนาด 97 ฟุต เป็นส่วนหนึ่งของGCRLและจอดเทียบท่าที่พอยต์เคเด็ต
• ศูนย์คีสเลอร์ ซึ่งตั้งอยู่บนฐานทัพอากาศคีสเลอร์ในเมืองบิโลซี ให้บริการหลักสูตรต่างๆ สำหรับบุคลากรทางทหารและประชาชนทั่วไป

หน่วยงานอื่นๆ ของ USM ในภูมิภาคชายฝั่งอ่าวเม็กซิโก ได้แก่ ส่วนต่างๆ ของวิทยาลัยวิทยาศาสตร์ทางทะเล; ห้องปฏิบัติการวิจัยชายฝั่งอ่าวเม็กซิโกในโอเชียนสปริงส์; ศูนย์การศึกษาทางทะเลและพิพิธภัณฑ์สัตว์น้ำ JL Scott บนพอยต์เคเด็ตในบิโลซี; ศูนย์วิจัยวิทยาศาสตร์อุทกศาสตร์; และศูนย์วิทยาศาสตร์ทางทะเลที่ศูนย์อวกาศจอห์น ซี. สเตนนิส ในเคาน์ตีแฮนค็อก

เมื่อวันที่ 29 สิงหาคม พ.ศ. 2548 พายุเฮอริเคนแคทรีนา  ได้สร้าง ความเสียหายให้กับกัลฟ์พาร์คเป็นมูลค่าประมาณ 115 ล้านดอลลาร์ สหรัฐ ชั้นเรียนต่างๆ ถูกย้ายไปยังศูนย์เฮลท์มาร์คในกัลฟ์พอร์ต ในปี พ.ศ. 2555 วิทยาเขตกัลฟ์พอร์ตถูกปิด และสิ่งอำนวยความสะดวกทั้งหมดถูกย้ายกลับไปยังวิทยาเขตลองบีชที่ได้รับการปรับปรุงใหม่ ^{[ 46 ]}ต้นโอ๊คเฟรนด์ชิปรอดพ้นจากพายุลูกนี้ เช่นเดียวกับที่มันรอดพ้นจากพายุเฮอริเคนคามิลล์และพายุเล็กๆ น้อยๆ อีกมากมายที่พัดถล่มพื้นที่นี้

• ห้องสมุดคุกซึ่งตั้งอยู่ภายในวิทยาเขตแฮตตีสเบิร์ก เป็นที่เก็บรวบรวมหนังสือ วารสาร ไมโครฟิล์ม เอกสารราชการ และวัสดุอื่น ๆ ที่สนับสนุนหลักสูตรการเรียนการสอนของมหาวิทยาลัยเซาท์เทิร์นมิสซิสซิปปีในทุกระดับชั้นโดยตรง
• หอสมุดและหอจดหมายเหตุแมคเคน (McCain Library and Archives)เป็นที่ตั้งของคอลเล็กชันพิเศษและหอจดหมายเหตุของมหาวิทยาลัยในวิทยาเขตแฮตตีสเบิร์ก คอลเล็กชันต่างๆ ประกอบด้วย วรรณกรรมเด็กของเดอ กรัมมอนด์ (de Grummond Children's Literature Collection) รวมถึงประวัติศาสตร์ปากเปล่าของรัฐมิสซิสซิปปี ต้นฉบับ และเอกสารเกี่ยวกับสงครามกลางเมือง
• ห้องสมุดกัลฟ์โคสต์ซึ่งตั้งอยู่ภายในวิทยาเขตลองบีช เป็นส่วนหนึ่งของระบบห้องสมุดมหาวิทยาลัยที่ให้บริการวิทยาเขตต่างๆ บนชายฝั่งอ่าว (วิทยาเขตกัลฟ์พาร์ค คีสเลอร์ และแจ็กสันเคาน์ตี) ห้องสมุดที่ทันสมัยแห่งนี้เป็นห้องสมุดมหาวิทยาลัยที่ครบวงจรเพียงแห่งเดียวบนชายฝั่งอ่าวของรัฐมิสซิสซิปปี
• ห้องสมุดกันเตอร์ตั้งอยู่ที่ห้องปฏิบัติการวิจัยชายฝั่งอ่าว (GCRL) วิทยาเขตโอเชียนสปริงส์ รัฐมิสซิสซิปปี ห้องสมุดแห่งนี้ให้บริการข้อมูลทางเทคนิคแก่เจ้าหน้าที่วิจัย คณาจารย์และนักศึกษาประจำ และผู้มาเยือน โดยมีเอกสารต่างๆ เช่น บทคัดย่อและเอกสารตีพิมพ์ซ้ำ หนังสือและวารสาร รายงานการสำรวจ วิทยานิพนธ์ และเอกสารอ้างอิง นอกจากนี้ยังมีหนังสือชุดพิเศษที่สนับสนุนหลักสูตรการศึกษาของห้องปฏิบัติการอีกด้วย

• ย่านนี้ตั้งอยู่ใกล้จุดตัดของทางหลวงหมายเลข 49 ของสหรัฐอเมริกาและถนนฮาร์ดี ย่านประวัติศาสตร์ของมหาวิทยาลัยประกอบด้วยอาคารดั้งเดิม 5 หลัง ได้แก่ Ogletree Alumni House, The Honor House, College Hall, Forrest Hall และ Hattiesburg Hall นอกจากนี้ยังเป็นสถานที่จัดงานเลี้ยงสังสรรค์ก่อนการแข่งขันฟุตบอลของนักศึกษามาอย่างยาวนาน และเป็นที่ตั้งของทะเลสาบไบรอน ซึ่งเป็นจุดศูนย์กลางของกิจกรรมต่างๆ ของมหาวิทยาลัยและงานแต่งงานหลายงาน
• ประตูเซ็นจูรี (Century Gate)เป็นกำแพงอิฐและหินที่ตั้งอยู่ด้านหน้ามหาวิทยาลัย ระหว่างถนนอีสต์เมโมเรียลไดรฟ์ (East Memorial Drive) และเวสต์เมโมเรียลไดรฟ์ (West Memorial Drive) สร้างขึ้นเพื่อเป็นอนุสรณ์ครบรอบ 100 ปีของการก่อตั้งมหาวิทยาลัยในปี 1910 บนกำแพงมีตราสัญลักษณ์ของมหาวิทยาลัยรวมถึงข้อความ "มหาวิทยาลัยเซาท์เทิร์นมิสซิสซิปปี" (The University of Southern Mississippi)
• สวนกุหลาบออลอเมริกันเป็นหนึ่งในสองสวนออลอเมริกันในรัฐ สวนแห่งนี้ที่มหาวิทยาลัยเซาเทิร์นมิสซิสซิปปีได้รับการพัฒนาโดยสมาคมกุหลาบแห่งเขตแฮตตีสเบิร์กในปี 1972 ภายใต้การนำของวิลเลียม วิชต์ ผู้ล่วงลับ ซึ่งเป็นชาวแฮตตีสเบิร์กและดำรงตำแหน่งประธานคนแรกของ HARS อนุสรณ์สถานเพื่อรำลึกถึงความพยายามของวิชต์ในการทำให้สวนแห่งนี้เป็นจริงตั้งอยู่ข้างๆ สวน ตั้งแต่การเปิดอย่างเป็นทางการในปี 1974 สวนกุหลาบเซาเทิร์นมิสซิสซิปปีได้รับรางวัลมากมายด้านการบำรุงรักษาและการจัดแสดง นักศึกษาหลายคนพยายามสร้างความประทับใจให้คนรักด้วยการเด็ดกุหลาบ ซึ่งหากถูกจับได้จะมีโทษปรับสูงถึง 500 ดอลลาร์

สวนกุหลาบออลอเมริกันเป็นสวนกุหลาบที่ตั้งอยู่ใกล้ถนนฮาร์ดีในวิทยาเขตของมหาวิทยาลัยเซาท์เทิร์นมิสซิสซิปปี สวนมีรูปทรงครึ่งวงกลมและมีกุหลาบลูกผสม หลายชนิด ในแปลงกุหลาบ 32 แปลง สวนแห่งนี้มีมาตั้งแต่ปี 1973 และได้รับการรับรองสถานะเป็น 'สวนกุหลาบสาธารณะ' โดยบริษัทออลอเมริกันโรสซีเลคชันในปี 1975 ^{[ 47 ]}นักชีววิทยาและนักพฤกษศาสตร์จำนวนมากจากทั่วโลกมาศึกษากุหลาบที่พบในสวนกุหลาบแห่งนี้^{[ 48 ] [ 49 ] [ 50 ] [ 51 ]}เนื่องจากมีกุหลาบหายากจำนวนมากในสวนกุหลาบ การเด็ดกุหลาบจึงขัดต่อระเบียบของวิทยาลัย และหากถูกจับได้จะถูกปรับ500ดอลลาร์

• ทางเดินอีเกิลวอล์ค (Eagle Walk)ตั้งอยู่ใต้ดาดฟ้าชั้นบนของสนามกีฬาเอ็มเอ็ม โรเบิร์ตส์ (MM Roberts Stadium) สองชั่วโมงก่อนวันแข่งขันฟุตบอล จะมีการยิงปืนใหญ่เพื่อเริ่มต้นขบวนแห่ หน่วย ROTC วงดนตรีเดินขบวน "The Pride of Mississippi Marching Band" เจ้าหน้าที่มหาวิทยาลัย และนักฟุตบอลจะเดินขบวนผ่านถนนสายนี้ท่ามกลางเสียงเชียร์ของแฟนๆ นับพันคน ทุกฤดูใบไม้ร่วง นักศึกษาใหม่จะช่วยกันทาสีผนังและถนนใหม่ ซึ่งเป็นสิ่งที่พวกเขาทำมานานกว่าครึ่งศตวรรษแล้ว
• "โดม"เป็นชื่อเรียกเล่นของอาคารบริหารลูคัส ซึ่งตั้งอยู่ทางเข้ามหาวิทยาลัยจากถนนฮาร์ดี้ ชื่อนี้ได้มาจากการที่มีโดมขนาดใหญ่อยู่บนยอดหลังคา เดิมทีโดมมีสีส้มอมทองแดง แต่สีซีดจางลงจนกลายเป็นสีเขียวหมองๆ ในปี 2544 ได้มีการดำเนินโครงการบูรณะเพื่อทาสีโดมกลับคืนเป็นสีทองแดงดั้งเดิม โดมแห่งนี้เป็นที่ตั้งของสำนักงานอธิการบดี รองอธิการบดี และเจ้าหน้าที่สนับสนุนอื่นๆ
• จัตุรัสชูเมกเกอร์เป็นพื้นที่กว้างขวางที่อยู่ใกล้กับเดอะฮับและลานอาคารวิทยาศาสตร์วอล์คเกอร์ น้ำพุอิฐเป็นจุดศูนย์กลางของกิจกรรม "คืนวันศุกร์ที่น้ำพุ" ซึ่งเป็นการรวมตัวปลุกใจที่นำโดยนักเรียนก่อนการแข่งขันฟุตบอลในวันเสาร์ น้ำพุแห่งนี้เคยถูกพวกเด็กซนสาดฟองสบู่ใส่หลายครั้งแล้ว
• รูปปั้นลิตเติลร็อกตั้งอยู่ในย่านประวัติศาสตร์ของมหาวิทยาลัย โดยปกติแล้วจะมีการทาสีใหม่ทุกสัปดาห์ และใช้เพื่อส่งเสริมกิจกรรมกีฬา วิชาการ และศิลปะต่างๆ ของมหาวิทยาลัย ในบางครั้ง อาจพบว่ามีการวาดโลโก้ของสมาคมลับต่างๆ ที่มีอยู่ในมหาวิทยาลัยลงบนรูปปั้นด้วย
• รูปปั้นนกอินทรี ซึ่งมีชื่ออย่างเป็นทางการว่า "Lofty Return" เป็นประติมากรรม นกอินทรีทอง ขนาดมหึมา หนัก 3 ตันมีความสูง 22 ฟุต กว้าง 20 ฟุต และตั้งอยู่บนฐานสูง 8 ฟุต ตั้งอยู่ด้านหลัง Southern Hall หันหน้าไปทางถนน Hardy Street นอกจากนี้ยังมีการสร้างแบบจำลองที่มีขนาดเล็กกว่าเล็กน้อยไว้ในวิทยาเขต Gulf Park เพื่อเป็นสัญลักษณ์เชื่อมโยงวิทยาเขตทั้งสองเข้าด้วยกัน^{[ 52 ]}

มหาวิทยาลัยเซาท์เทิร์นมิสซิสซิปปีเพิ่งเริ่มการปรับโครงสร้างทางวิชาการใหม่ โดยเปลี่ยนโครงสร้างทางวิชาการของมหาวิทยาลัยและบทบาทของผู้บริหาร แผนนี้ลดจำนวนวิทยาลัยจากหกแห่งเหลือสี่แห่ง และรวมแผนกแบบดั้งเดิมเข้าเป็นโรงเรียนตามหัวข้อ^{[ 59 ] [ 60 ]}

นอกจากวิทยาลัยทางวิชาการแล้ว มหาวิทยาลัยเซาท์เทิร์นมิสซิสซิปปี ยังมีหลักสูตรอื่นๆ ดังต่อไปนี้:

• วิทยาลัยเกียรติยศ George R. Olliphant ^{[ 61 ]}
• การศึกษาระดับบัณฑิตศึกษา^{[ 62 ]}
• โครงการศึกษานานาชาติ^{[ 63 ]}
• หลักสูตรออนไลน์เต็มรูปแบบด้านการจัดการกีฬา (ปริญญาโท) และการศึกษาการฝึกสอนกีฬา (ปริญญาโท) ^{[ 64 ]}
• โรงเรียน DuBard สำหรับความผิดปกติทางภาษา^{[ 65 ]}
• ศูนย์การศึกษาผู้มีพรสวรรค์ ฟรานเซส เอ. คาร์เนส

มหาวิทยาลัยมีองค์กรกรีก 26 แห่งในวิทยาเขต ซึ่งรวมถึงสมาคมนักศึกษาชาย 14 แห่งและสมาคมนักศึกษาหญิง 12 แห่ง มีบ้านพักของสมาคมนักศึกษาชายและสมาคมนักศึกษาหญิงรวม 19 แห่ง^{[ 67 ]}

มหาวิทยาลัยเซาเทิร์นมิสซิสซิปปีมีหอพักนักศึกษา 13 แห่ง และมีนักศึกษาประมาณ 5,000 คนอาศัยอยู่ในหอพักของมหาวิทยาลัยตลอดปีการศึกษา

• Southern Miss Nowเป็นแหล่งข่าวอย่างเป็นทางการของสำนักงานการสื่อสารของมหาวิทยาลัย^{[ 68 ]}
• Student Printzเป็นหนังสือพิมพ์ที่ดำเนินการโดยนักศึกษาของมหาวิทยาลัย ตีพิมพ์สัปดาห์ละครั้งในช่วงภาคเรียนฤดูใบไม้ร่วงและฤดูใบไม้ผลิ
• นิตยสารประจำปีของมหาวิทยาลัยชื่อ " The Southerner" ซึ่ง เป็นฉบับพิมพ์สีทั้งเล่ม ได้ถูกยกเลิกการตีพิมพ์ในปี 2015
• WUSM FM 88.5เป็นสถานีวิทยุสาธารณะ FM กำลังส่ง 3000 วัตต์ของมหาวิทยาลัยมิสซิสซิปปีตอนใต้ ตั้งอยู่บนชั้น 1 ของอาคารเซาเทิร์นฮอลล์
• Mississippi Review ^{[ 69 ] [ 70 ]}เป็นวารสารที่ตีพิมพ์รายไตรมาสซึ่งนำเสนอเรื่องสั้น บทกวี และบทความGordon Weaverก่อตั้งขึ้นในปี 1970 ^{[ 71 ]} Frederick Barthelmeดำรงตำแหน่งบรรณาธิการในปี 1977 ^{[ 72 ]}ในปี 1995 เป็นนิตยสารวรรณกรรมขนาดใหญ่ฉบับแรกที่เปิดตัวฉบับออนไลน์เต็มรูปแบบ [ ^{73 ] [ 74 ] ใน}ปี 1998 ฉบับพิมพ์เผยแพร่ปีละสองครั้ง ส่วนฉบับออนไลน์ซึ่งเป็นสิ่งพิมพ์แยกต่างหาก เผยแพร่รายเดือนยกเว้นเดือนสิงหาคมโดยCenter for Writersที่มหาวิทยาลัย Southern Mississippi ^{[ 71 ]}
• The Drawlเป็นสิ่งพิมพ์ที่นำเสนอประเพณีและประวัติศาสตร์ของมหาวิทยาลัย Southern Miss นักศึกษาใหม่ทุกคนจะได้รับThe Drawlในสัปดาห์แรกของการเรียน
• The Talonเป็นนิตยสารรายไตรมาสสำหรับศิษย์เก่าและเพื่อนของมหาวิทยาลัย^{[ 75 ]}
• Gulf and Caribbean Researchเป็นวารสารทางวิทยาศาสตร์ที่ผ่านการตรวจสอบโดยผู้ทรงคุณวุฒิ โดยมุ่งเน้นที่นิเวศวิทยาทางทะเลและชายฝั่ง การประมง และการศึกษาทางสมุทรศาสตร์จากอ่าวเม็กซิโกและทะเลแคริบเบียน วารสารนี้เผยแพร่ในรูปแบบออนไลน์เท่านั้น และได้รับการสนับสนุนจากห้องสมุด USM และห้องปฏิบัติการวิจัยชายฝั่งอ่าว^{[ 76 ]}

มหาวิทยาลัยเซาเทิร์นมิสซิสซิปปีเป็นหนึ่งในมหาวิทยาลัยไม่กี่แห่งในรัฐมิสซิสซิปปีที่ให้วันหยุดสองวันในแต่ละปีสำหรับเทศกาลมาร์ดิกราส์มหาวิทยาลัยจะไม่จัดการเรียนการสอนในวันจันทร์และวันอังคารก่อนวันพุธเถ้า

ในช่วงปลายทศวรรษ 1970 และต้นทศวรรษ 1980 นักศึกษาของมหาวิทยาลัย USM หลายคนแสดงความปรารถนาที่จะมีวันหยุดนี้ มหาวิทยาลัยตั้งอยู่ใกล้กับนิวออร์ลีนส์และมีความเชื่อมโยงกับบิโลซีและโมบายล์ ซึ่งเป็นสถานที่จัดงานมาร์ดิกราส์เช่นกัน ในปี 1981 เคน สตริบลิง ประธานสภานักศึกษาของ USM ได้จัดกิจกรรมรณรงค์ของนักศึกษาเพื่อกำหนดให้วันอังคารก่อนวันพุธรับเถ้า (มาร์ดิกราส์) เป็นวันหยุดประจำปี คณะกรรมการปฏิทินของมหาวิทยาลัยปฏิเสธคำขอ แต่สตริบลิงได้ยื่นอุทธรณ์ต่อออเบรย์ ลูคัส อธิการบดีของ USM ในงานเฉลิมฉลองคริสต์มาสประจำปีที่ USM ในเดือนธันวาคม 1981 ลูคัสประกาศว่า USM จะลองใช้วันหยุดในวันอังคารก่อนวันพุธรับเถ้าในปี 1982 เพื่อดูว่าจะเป็นอย่างไร สตริบลิงยื่นอุทธรณ์อีกครั้งในปี 1982 และลูคัสอนุญาตให้มีวันหยุดในวันอังคารก่อนวันพุธรับเถ้าในปี 1983 ปีต่อมา วันหยุดในวันอังคารก่อนวันพุธรับเถ้าจึงได้รับการบรรจุเป็นส่วนหนึ่งของปฏิทินของมหาวิทยาลัยอย่างถาวร

ในปี พ.ศ. 2546 สภานักศึกษาของมหาวิทยาลัยได้เพิ่มวันจันทร์ก่อนวันพุธเถ้าเป็นส่วนหนึ่งของวันหยุดมาร์ดิกราส์ ทำให้มีวันหยุดสองวันสำหรับกิจกรรมนี้และวันหยุดสุดสัปดาห์สี่วันสำหรับนักศึกษา แม้ว่านักศึกษา USM จำนวนมากจะเข้าร่วมการเฉลิมฉลองมาร์ดิกราส์ แต่ส่วนใหญ่ใช้วันหยุดสุดสัปเปนสี่วันเพื่อเตรียมตัวสอบกลางภาคหรือไปเยี่ยมครอบครัวและเพื่อนฝูง ความแปลกใหม่ของวันหยุดมาร์ดิกราส์ได้กลายเป็นเครื่องมือในการสรรหานักศึกษา^{[ 77 ]}