| NRXN2 |
|---|
|
| โครงสร้างที่มีอยู่ |
|---|
| พีดีบี | การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB |
|---|
| รายชื่อรหัส PDB |
|---|
4เอ็นเอ็กซ์อาร์ |
|
|
| ตัวระบุ |
|---|
| ชื่อเรียกอื่น | NRXN2 , นิวเร็กซิน 2 |
|---|
| รหัสภายนอก | โอมิม : 600566 ; เอ็มจีไอ : 1096362 ; โฮโมโลยีน : 86984 ; การ์ดยีน : NRXN2 ; OMA : NRXN2 - ออโธล็อก |
|---|
|
|
| รูปแบบการแสดงออกของ RNA |
|---|
| บีจี | | มนุษย์ | เมาส์ (ออร์โธล็อก) |
|---|
| สูงสุดที่แสดงใน | - ซีกขวาของสมองน้อย
- เปลือกสมองส่วนหน้า
- กลีบหน้าผากด้านขวา
- อะมิกดาล่า
- ไจรัสซิงกูเลต
- คอร์เทกซ์ซิงกูเลตส่วนหน้า
- พื้นที่บรอดแมน 9
- ส่วนนูนของปมประสาท
- พาราฟลอคคูลัสของสมองน้อย
- เวอร์มิสของสม cerebellum
|
| | สูงสุดที่แสดงใน | - สมองน้อย
- เปลือกสมองน้อย
- ปุ่มรับกลิ่น
- เปลือกสมองส่วนรับภาพหลัก
- ร่องหน้าผากส่วนบน
- ไฮโปทาลามัส
- สไตรอาตัมของแกนประสาท
- เซลล์แกรนูลของเดนเตตไจรัสในฮิปโปแคมปัส
- ฮิปโปแคมปัสแท้
- ชั้นของเรตินา
|
| | ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม |
|
|---|
| ไบโอ GPS |   | | ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม |
|
|---|
|
| ออนโทโลยีของยีน |
|---|
| หน้าที่ระดับโมเลกุล | - การจับโปรตีนในกลุ่มนิวโรลิจิน
- กิจกรรมตัวรับสัญญาณผ่านเยื่อหุ้มเซลล์
- การจับกันของโมเลกุลการยึดเกาะของเซลล์
- กิจกรรมควบคุมช่องแคลเซียม
- การจับไอออนโลหะ
| | ส่วนประกอบของเซลล์ | - ส่วนประกอบสำคัญของเยื่อหุ้มเซลล์
- เมมเบรน
- เยื่อหุ้มพลาสมา
- พรีไซแนปส์
- สารประกอบที่มีโปรตีน
| | กระบวนการทางชีวภาพ | - การยึดเกาะระหว่างเซลล์ประสาท
- การยึดเกาะของเซลล์
- การส่งสัญญาณ
- การรวมกลุ่มของเกฟิรินมีส่วนเกี่ยวข้องกับการประกอบโครงสร้างโพสต์ไซแนปส์
- การรวมกลุ่มของโปรตีนความหนาแน่นหลังไซแนปส์ 95
- พฤติกรรมการเปล่งเสียง
- การเรียนรู้เสียงร้อง
- การรวมกลุ่มของนิวโรลิจินมีส่วนเกี่ยวข้องกับการประกอบเยื่อหุ้มเซลล์หลังไซแนปส์
- พฤติกรรมของผู้ใหญ่
- การประกอบเยื่อหุ้มเซลล์หลังไซแนปส์
- พฤติกรรมทางสังคม
- การประกอบไซแนปส์
- การหลั่งสารสื่อประสาท
- การส่งสัญญาณประสาททางเคมี
| | แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO |
|
| ออร์โธล็อก |
|---|
| สายพันธุ์ | มนุษย์ | หนู |
|---|
| เอนเทรซ | | |
|---|
| วงดนตรี | | |
|---|
| ยูนิโปรท | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | | NM_015080 NM_138732 NM_138734 NM_001376262 NM_001376263 |
|---|
NM_001376265 NM_001376266 NM_001376267 NM_001400681 NM_001400682 |
| |
|---|
NM_001205234 NM_001205235 NM_020253 NM_001369363 |
|
|---|
| RefSeq (โปรตีน) | | NP_055895 NP_620060 NP_620063 NP_001363191 NP_001363192 |
|---|
NP_001363194 NP_001363195 NP_001363196 NP_055895.1 NP_620060.1 |
| |
|---|
NP_001192163 NP_001192164 NP_064649 NP_001356292 |
|
|---|
| สถานที่ตั้ง (UCSC) | Chr 11: 64.61 – 64.72 Mb | Chr 19: 6.47 – 6.59 Mb |
|---|
| การค้นหาใน PubMed | [ 3 ] | [ 4 ] |
|---|
|
| วิกิดาต้า |
|
Neurexin-2-alphaเป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนNRXN2 [ 5 ] [ 6 ]
นิวเร็กซินเป็นโปรตีนตระกูลหนึ่งที่ทำหน้าที่ในระบบประสาทของสัตว์มีกระดูกสันหลังในฐานะโมเลกุลยึดเกาะเซลล์และตัวรับ โปรตีนเหล่านี้ถูกเข้ารหัสโดยยีนหลายตัวที่ไม่เชื่อมโยงกัน ซึ่งสองยีนคือNRXN1และNRXN3เป็นยีนที่ใหญ่ที่สุดที่รู้จักในมนุษย์ ยีนสามตัว (NRXN1-3) ใช้โปรโมเตอร์ทางเลือกสองตัวและมี เอ็กซอน ที่ถูกตัดต่อแบบทางเลือก จำนวนมาก เพื่อสร้างทรานสคริปต์ mRNA และไอโซฟอร์มโปรตีนที่แตกต่างกันหลายพันแบบ ทรานสคริปต์ส่วนใหญ่ผลิตจากโปรโมเตอร์ต้นน้ำและเข้ารหัสไอโซฟอร์มอัลฟา-นิวเร็กซิน ส่วนทรานสคริปต์จำนวนน้อยกว่ามากผลิตจากโปรโมเตอร์ปลายน้ำและเข้ารหัสไอโซฟอร์ม เบตา-นิวเร็กซิน อัลฟา-นิวเร็กซินมีลำดับคล้ายปัจจัยการเจริญเติบโตของผิวหนัง ( EGF-like ) และโดเมนลามินิน Gและแสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับนิวเร็กโซฟิลิน เบตา-นิวเร็กซินไม่มีลำดับคล้าย EGF และมีโดเมนลามินิน G น้อยกว่าอัลฟา-นิวเร็กซิน[ 6 ]
อ่านเพิ่มเติม
- นากาจิมะ ดี, โอคาซากิ เอ็น, ยามาคาวะ เอช และ คณะ (2546) "การสร้างโคลน cDNA ที่พร้อมแสดงออกสำหรับยีน KIAA: การดูแลโคลน KIAA cDNA 330 โคลนด้วยตนเอง " ดีเอ็นเอเรส9 (3): 99– 106. ดอย : 10.1093/dnares/ 9.3.99 PMID 12168954 .
- Ichtchenko K, Nguyen T, Südhof TC (1996). "โครงสร้าง การตัดต่อทางเลือก และการจับกับนิวเร็กซินของนิวโรลิกินหลายชนิด" J. Biol. Chem . 271 (5): 2676– 2682. doi : 10.1074/jbc.271.5.2676 . PMID 8576240 .
- Hata Y, Butz S, Südhof TC (1996). "CASK: โฮโมล็อก dlg/PSD95 ตัวใหม่ที่มีโดเมนโปรตีนไคเนสที่ขึ้นอยู่กับแคลโมดูลินที่ปลาย N ซึ่งระบุได้จากการโต้ตอบกับนิวเร็กซิน" . J. Neurosci . 16 (8): 2488– 94. doi : 10.1523/JNEUROSCI.16-08-02488.1996 . PMC 6578772 . PMID 8786425 .
- Kurschner C, Mermelstein PG, Holden WT, Surmeier DJ (1998). "CIPP โปรตีนโดเมน PDZ หลายวาเลนซ์ชนิดใหม่ ทำปฏิกิริยากับสมาชิกในกลุ่ม Kir4.0, หน่วยย่อยตัวรับ NMDA, นิวเร็กซิน และนิวโรลิกินอย่างเลือกสรร" Mol. Cell. Neurosci . 11 (3): 161– 172. doi : 10.1006/mcne.1998.0679 . PMID 9647694 . S2CID 36534759 .
- Hock B, Böhme B, Karn T และ คณะ (1998). "ปฏิสัมพันธ์ที่เกิดจากโดเมน PDZ ของตัวรับไทโรซีนไคเนสที่เกี่ยวข้องกับ Eph EphB3 และโปรตีนที่จับกับ ras AF6 ขึ้นอยู่กับกิจกรรมไคเนสของตัวรับ" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 95 (17): 9779– 9784. Bibcode : 1998PNAS...95.9779H . doi : 10.1073/pnas.95.17.9779 . PMC 21413 . PMID 9707552 .
- Bergman L, Silins G, Grimmond S และ คณะ (1999). "ลำดับคอนติ๊กคอสมิดที่พร้อมใช้งานขนาด 500 กิโลเบส และแผนที่ทรานสคริปต์ของบริเวณ MEN1 บน 11q13" Genomics . 55 (1): 49– 56. doi : 10.1006/geno.1998.5625 . PMID 9888998 .
- Nagase T, Ishikawa K, Suyama M และ คณะ (1999). "การทำนายลำดับรหัสของยีนมนุษย์ที่ไม่ระบุ XIII. ลำดับสมบูรณ์ของโคลน cDNA ใหม่ 100 โคลนจากสมองซึ่งเข้ารหัสโปรตีนขนาดใหญ่ในหลอดทดลอง" DNA Res . 6 (1): 63– 70. doi : 10.1093/dnares/6.1.63 . PMID 10231032 .
- Rowen L, Young J, Birditt B และ คณะ (2002). "การวิเคราะห์ยีนนิวเร็กซินของมนุษย์: การตัดต่อทางเลือกและการสร้างความหลากหลายของโปรตีน" Genomics . 79 (4): 587– 597. doi : 10.1006/geno.2002.6734 . PMID 11944992 .
- Tabuchi K, Südhof TC (2002). "โครงสร้างและวิวัฒนาการของยีนนิวเร็กซิน: ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับกลไกของการตัดต่อทางเลือก" Genomics . 79 (6): 849– 859. doi : 10.1006/geno.2002.6780 . PMID 12036300 .
- Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2003). "ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนขนาดใหญ่: การคัดกรองแบบทูไฮบริดโดยใช้ไลบรารีที่จัดประเภทตามหน้าที่ซึ่งประกอบด้วย cDNA ยาว" . Genome Res . 12 (11): 1773– 1784. doi : 10.1101/gr.406902 . PMC 187542 . PMID 12421765 .
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T และ คณะ (2004). "การจัดลำดับและลักษณะเฉพาะของ cDNA มนุษย์ความยาวเต็ม 21,243 รายการ" Nat . Genet . 36 (1): 40– 45. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
- Homma K, Kikuno RF, Nagase T และ คณะ (2004). "มีตัวแปรการต่อเชื่อมทางเลือกที่เข้ารหัสโดเมนโปรตีนที่ไม่เสถียรอยู่ในสมองของมนุษย์" J. Mol. Biol . 343 (5): 1207– 1220. doi : 10.1016/j.jmb.2004.09.028 . PMID 15491607 .
- Taylor TD, Noguchi H, Totoki Y และ คณะ (2006). "ลำดับดีเอ็นเอของโครโมโซม 11 ของมนุษย์และการวิเคราะห์รวมถึงการระบุยีนใหม่" Nature 440 ( 7083 ) : 497– 500. Bibcode : 2006Natur.440..497T . doi : 10.1038/nature04632 . PMID 16554811 .
