เอนไซม์ตัด (หรือเอนโดนิวคลีเอสตัด ) เป็นเอนไซม์ ที่ตัดเพียงสายเดียวของ โมเลกุลDNAหรือRNAสองสาย^{[ 1 ]}ที่ ลำดับ นิวคลีโอไท ด์ที่จดจำเฉพาะ ที่เรียกว่าไซต์จำกัดเอนไซม์ดังกล่าวไฮโดรไลซ์ (ตัด) เพียงสายเดียวของ DNA คู่ เพื่อสร้างโมเลกุล DNA ที่ " ถูกตัด " แทนที่จะถูกตัดขาด^{[ 2 ] [ 3 ]}

สามารถใช้สำหรับการขยายการแทนที่สาย^{[ 4 ​​]}ปฏิกิริยาการขยายเอนไซม์ตัดสาย การย่อยสลายเอ็กโซนิวคลีโอไลติก การสร้างช่องว่างเล็กๆ^{[ 5 ]}หรือการแปลแบบนิก [ ^{6 ] กระบวนการ}หลังนี้ประสบความสำเร็จในการรวมนิวคลีโอไทด์ที่ติดฉลากกัมมันตรังสีและนิวคลีโอไทด์เรืองแสง ทำให้สามารถศึกษาบริเวณเฉพาะบนดีเอ็นเอสองสายได้^{[ 6 ] [ 7 ]}มีการศึกษาเอนไซม์ตัดสายมากกว่า 200 ชนิด และ 15 ชนิดมีจำหน่ายในเชิงพาณิชย์^{[ 8 ]}และถูกนำมาใช้ในการวิจัยและในผลิตภัณฑ์เชิงพาณิชย์เป็นประจำ

เอนไซม์ตัดNb.BbvCIถูกนำมาใช้สำเร็จในการรวมนิวคลีโอไทด์ที่ติดฉลากฟลูออโรโครมเข้าไปในตำแหน่งเฉพาะของลำดับ DNA ผ่านการแปลแบบนิค^{[ 9 ]}

• เอนไซม์ตัดสายของ New England Biolabs
• เอนไซม์ตัดสายของ Fermentas