หลักเกณฑ์การตั้งชื่อหรือหลักเกณฑ์การตั้งชื่อคือกฎเกณฑ์ต่างๆ ที่ควบคุมการตั้งชื่อสิ่งมีชีวิต การกำหนดมาตรฐานชื่อทางวิทยาศาสตร์ของสิ่งมีชีวิตช่วยให้นักวิจัยสามารถอภิปรายผลการค้นพบ (รวมถึงการค้นพบสายพันธุ์ใหม่) ได้

เมื่อการศึกษาชีววิทยาเริ่มมีความเชี่ยวชาญเฉพาะด้านมากขึ้น จึงมีการนำรหัสเฉพาะมาใช้กับสิ่งมีชีวิตประเภทต่างๆ

สำหรับผู้ใช้งานทั่วไปที่รู้จักแต่เพียงชื่อของสายพันธุ์และทราบอยู่บ้างว่าสายพันธุ์ต่างๆ สามารถจัดอยู่ในสกุลวงศ์และกลุ่มอนุกรมวิธานระดับสูงกว่าได้ อาจจะไม่สังเกตเห็นว่ามีรหัสมากกว่าหนึ่งรหัส แต่หากพิจารณาให้เหนือกว่าระดับพื้นฐานนี้แล้ว รหัสเหล่านี้มีวิธีการทำงานที่แตกต่างกันอย่างมาก

ในอนุกรมวิธานระบบ การตั้ง ชื่อแบบทวิภาค ("ระบบการตั้งชื่อสองคำ") หรือที่เรียกว่าระบบการตั้งชื่อแบบไบนารีเป็นระบบที่เป็นทางการในการตั้งชื่อ สิ่งมีชีวิตแต่ละ ชนิดโดยตั้งชื่อที่ประกอบด้วยสองส่วน ซึ่งทั้งสองส่วนใช้รูปแบบไวยากรณ์ภาษาละตินแม้ว่าจะสามารถอิงจากคำในภาษาอื่นได้ก็ตาม ชื่อดังกล่าวเรียกว่าชื่อทวิภาค (ซึ่งอาจย่อเหลือเพียง "binomial"), binomen , binominal nameหรือชื่อวิทยาศาสตร์ในทางไม่เป็นทางการ ในอดีตเรียกอีกอย่างว่าชื่อภาษาละตินในรหัสทางสัตววิทยา ICZN ระบบนี้ยังเรียกว่าระบบการตั้งชื่อแบบทวิภาค (โดยใช้คำต่อท้าย-inalแทน-ial ) ^{[ 1 ]}ซึ่งหมายถึง "ระบบการตั้งชื่อสองชื่อ" ^{[ 2 ]}

ส่วนแรกของชื่อ – ชื่อสกุล – ระบุสกุลที่สปีชีส์นั้นสังกัดอยู่ ในขณะที่ส่วนที่สอง – ชื่อเฉพาะหรือ ชื่อ เฉพาะ – แยกแยะสปีชีส์ภายในสกุลนั้น ตัวอย่างเช่น มนุษย์ยุคใหม่สังกัดสกุลHomoและภายในสกุลนี้สังกัดสปีชีส์Homo sapiens ไทแรนโนซอรัสเร็กซ์ น่าจะ เป็นชื่อวิทยาศาสตร์ที่ไม่ใช่มนุษย์ที่เป็นที่รู้จักกันอย่างแพร่หลายที่สุด^{[ 3 ]}

การนำระบบการตั้งชื่อสปีชีส์นี้มาใช้อย่างเป็นทางการ นั้นได้รับการยกย่องให้แก่ คาร์ล ลินเนียสโดยเริ่มอย่างมีประสิทธิภาพจากผลงานSpecies Plantarum ของเขา ในปี 1753 ^{[ 4 ]}แต่ก่อนหน้านั้น ในปี 1622 กัสปาร์ด บาฮิน ได้นำเสนอ ชื่อสกุลจำนวนมากในหนังสือPinax theatri botanici (ภาษาอังกฤษ, นิทรรศการภาพประกอบของพืช ) ซึ่งต่อมาลินเนียสได้นำมาใช้ ^{[ 5 ]} การนำชื่อสองส่วน (ระบบการตั้งชื่อแบบทวิภาค) มาใช้สำหรับสปีชีส์โดยลินเนียสเป็นการลดความซับซ้อนที่น่ายินดี เพราะเมื่อความรู้เกี่ยวกับความหลากหลายทางชีวภาพของเราขยายตัว ความยาวของชื่อก็เพิ่มขึ้นเช่นกัน ซึ่งหลายชื่อก็ยาวเกินไป^{[ 6 ]}

เมื่อนักธรรมชาติวิทยาทั่วโลกต่างนำระบบการตั้งชื่อแบบทวิภาคมาใช้ ก็ได้เกิดความคิดเห็นที่แตกต่างกันออกไปเกี่ยวกับรายละเอียดต่างๆ และเริ่มเห็นได้ชัดเจนมากขึ้นว่าจำเป็นต้องมีกฎเกณฑ์ที่ละเอียดถี่ถ้วนเพื่อควบคุมชื่อวิทยาศาสตร์ตั้งแต่กลางศตวรรษที่ 19 เป็นต้นมา จึงมีความริเริ่มหลายประการในการกำหนดกฎเกณฑ์ที่เป็นที่ยอมรับทั่วโลก ปัจจุบัน รหัสการตั้งชื่อควบคุมการตั้งชื่อดังต่อไปนี้:

• สาหร่ายราและพืช – ประมวลกฎการตั้งชื่อสากลสำหรับสาหร่าย รา และพืช ( ICN ) ซึ่งในเดือนกรกฎาคม 2554 ได้เข้ามาแทนที่ประมวลกฎการตั้งชื่อทางพฤกษศาสตร์สากล ( ICBN ) และกฎการตั้งชื่อทางพฤกษศาสตร์สากล ฉบับก่อน หน้า
• สัตว์ – หลักเกณฑ์สากลว่าด้วยการตั้งชื่อทางสัตววิทยา ( ICZN )
• แบคทีเรียและอาร์เคียที่เพาะเลี้ยงในเซลล์ – หลักเกณฑ์การตั้งชื่อจุลินทรีย์โปรคาริโอตสากล ( ICNP ) ซึ่งเข้ามาแทนที่หลักเกณฑ์การตั้งชื่อแบคทีเรียสากล ( ICNB ) ในปี 2551
• แบคทีเรียและอาร์เคียที่ได้รับการอธิบายจากข้อมูลลำดับ – หลักเกณฑ์การตั้งชื่อของโปรคาริโอตที่อธิบายจากข้อมูลลำดับ ( SeqCode )
• พืชปลูก – หลักเกณฑ์การตั้งชื่อพืชปลูกสากล ( ICNCP )
• กลุ่มพืช – หลักเกณฑ์สากลว่าด้วยการตั้งชื่อทางพฤกษศาสตร์สังคม (ICPN)
• ไวรัส – รหัสสากลว่าด้วยการจำแนกและการตั้งชื่อไวรัส (ICVCN); ดูเพิ่มเติมที่ การ จำแนกประเภทไวรัส

จุดเริ่มต้น ซึ่งก็คือเวลาที่รหัสเหล่านี้มีผลบังคับใช้ (โดยปกติจะมีผลย้อนหลัง) จะแตกต่างกันไปในแต่ละกลุ่ม และบางครั้งก็แตกต่างกันไปในแต่ละระดับ^{[ 7 ]}ในพฤกษศาสตร์และวิทยาเห็ดราจุดเริ่มต้นมักจะเป็นวันที่ 1 พฤษภาคม 1753 ( Linnaeus , Species plantarum ) ในสัตววิทยา จุดเริ่มต้น คือวันที่ 1 มกราคม 1758 (Linnaeus, Systema Naturae , ฉบับที่ 10 ) ในทางกลับกันแบคทีริโอวิทยาเริ่มต้นใหม่อีกครั้ง โดยเริ่มใหม่ทั้งหมดในปี 1980 (Skerman et al., "Approved Lists of Bacterial Names") แม้ว่าจะยังคงใช้ชื่อผู้เขียนและวันที่ตีพิมพ์เดิม^{[ 8 ]}

ข้อยกเว้นในพฤกษศาสตร์: ^{[ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]}

• SpermatophytaและPteridophytaชื่อเหนือสกุล: 4 สิงหาคม 1789 ( Jussieu , Genera plantarum );
• Musci (ยกเว้น Sphagnaceae): 1 มกราคม 1801 ( Hedwig , Species muscorum );
• SphagnaceaeและHepaticae (รวมถึงAnthocerotae ) ชื่อเหนือสกุล: 4 สิงหาคม 1789 (Jussieu, Genera plantarum );
• ( เชื้อรา :) ไมโครสปอริเดียอยู่ภายใต้การควบคุมของICZN (ถือว่าเป็นสัตว์) และดูด้านล่างสำหรับเชื้อราฟอสซิล^{[ 12 ]}
• ( สาหร่าย :)
  • Nostocaceae homocysteae: 1 มกราคม พ.ศ. 2435 (Gomont, " Monographie des Oscillariées ");
  • Nostocaceae heterocysteae: 1 มกราคม พ.ศ. 2429 ( Bornet & Flahault , " Révision des Nostocacées hétérocystées ");
  • Desmidiaceae : 1 มกราคม พ.ศ. 2391 ( Ralfs , British Desmidieae );
  • Oedogoniaceae : 1 มกราคม 1900 ( Hirn , " Monographie und Iconographie der Oedogoniaceen ");
• พืชฟอสซิลสาหร่าย ( ยกเว้น ไดอะตอม ) และรา: 31 ธันวาคม 1820 (สเติร์นเบิร์ก ,ฟลอร่า เดอร์ วอร์เวลท์ )

ข้อยกเว้นในสัตววิทยา: ^{[ 13 ]}

• แมงมุม : 1757 ( เสมียน , Aranei Svecici ).

นอกจากนี้ ยังมีความแตกต่างในวิธีการทำงานของรหัสต่างๆ ด้วย ตัวอย่างเช่นICN (รหัสสำหรับสาหร่าย เชื้อรา และพืช) ห้ามใช้ คำซ้ำซ้อน ในขณะที่ICZN (รหัสสำหรับสัตว์) อนุญาตให้ใช้ คำซ้ำซ้อน ได้

รหัสเหล่านี้มีความแตกต่างกันในด้านคำศัพท์ และมีโครงการระยะยาวเพื่อ "ประสาน" เรื่องนี้ ตัวอย่างเช่นICNใช้คำว่า "valid" ใน "valid publication of a name" (=การกระทำของการเผยแพร่ชื่ออย่างเป็นทางการ) โดยมี "establishing a name" เป็นคำที่เทียบเท่า ใน ICZN ส่วน ICZNใช้คำว่า "valid" ใน "valid name" (="ชื่อที่ถูกต้อง") โดยมี "correct name" เป็นคำ ที่เทียบเท่า ใน ICNการประสานเรื่องนี้มีความคืบหน้าอย่างจำกัดมาก

มีความแตกต่างกันในแง่ของประเภทที่ ใช้ รหัสทางแบคทีเรียวิทยานิยมใช้วัฒนธรรมประเภทที่มีชีวิต แต่ก็อนุญาตให้ ^ใช้ประเภทอื่นได้ มีการถกเถียงกันอย่างต่อเนื่องว่าประเภทใดมีประโยชน์มากกว่าในกรณีเช่นไซยาโนแบคทีเรีย [ ^{14 ]}

แนวทางที่รุนแรงยิ่งขึ้นเกิดขึ้นในปี พ.ศ. 2540 เมื่อคณะกรรมการระหว่างประเทศด้านการตั้งชื่อทางชีววิทยา (ICB) ของIUBS / IUMS นำเสนอ ร่าง BioCode ที่ถกเถียงกันมานาน โดยเสนอให้แทนที่รหัส ที่มีอยู่ทั้งหมด ด้วยการประสานรหัสเหล่านั้น^{[ 15 ] [ 16 ]}เดิมทีวันที่วางแผนไว้สำหรับการนำร่าง BioCode ไปใช้คือวันที่ 1 มกราคม พ.ศ. 2543 แต่ไม่บรรลุ ข้อตกลงในการแทนที่ รหัส ที่มีอยู่

ในปี 2554 มีการเสนอ BioCode ฉบับปรับปรุงใหม่ ซึ่งแทนที่จะแทนที่รหัส ที่มีอยู่เดิม จะเป็นบริบทที่เป็นหนึ่งเดียวสำหรับรหัสเหล่านั้น โดยอ้างอิงถึงรหัสเหล่านั้นเมื่อจำเป็น^{[ 17 ] [ 18 ] [ 19 ]}การเปลี่ยนแปลงในรหัสที่มีอยู่เดิมกำลังดำเนินการไปในทิศทางที่เสนอไว้อย่างช้าๆ^{[ 20 ] [ 21 ]}อย่างไรก็ตาม ผู้เข้าร่วมการอภิปรายครั้งสำคัญครั้งสุดท้ายเกี่ยวกับร่าง BioCode สรุปว่ามันอาจจะไม่ถูกนำไปใช้ในช่วงชีวิตของพวกเขา^{[ 22 ]}

ผู้เขียนหลายคนพบปัญหาในการใช้ระบบ Linnean ในการจำแนกประเภททางวิวัฒนาการ^{[ 23 ]}อันที่จริง ผู้สนับสนุนระบบการตั้งชื่อตามลำดับชั้นในยุคแรก เช่นAlphonse de Candolleและผู้เขียนรหัสการตั้งชื่อของAmerican Ornithologists' Union ฉบับปี 1886 ได้คาดการณ์ไว้แล้วว่าในอนาคต ระบบการตั้งชื่อตามลำดับชั้นจะต้องถูกยกเลิก^{[ 24 ] [ 6 ]}รหัสอีกฉบับหนึ่งที่พัฒนาขึ้นตั้งแต่ปี 1998 คือPhyloCodeซึ่งปัจจุบันควบคุมชื่อที่กำหนดภายใต้ระบบการตั้งชื่อทางวิวัฒนาการแทนที่จะใช้ระบบการตั้งชื่อแบบ Linnaean แบบดั้งเดิม แนวทางใหม่นี้จำเป็นต้องใช้คำจำกัดความทางวิวัฒนาการที่อ้างถึง "ตัวระบุ" ซึ่งคล้ายกับ "ชนิด" ภายใต้ระบบการตั้งชื่อตามลำดับชั้น คำจำกัดความดังกล่าวจะจำกัดขอบเขตของกลุ่มสิ่งมีชีวิตภายใต้แผนภูมิวิวัฒนาการที่กำหนด และระบบการตั้งชื่อประเภทนี้ไม่จำเป็นต้องใช้ลำดับชั้นสัมบูรณ์ ประมวลกฎหมายดังกล่าวมีผลบังคับใช้ในปี 2020 พร้อมกับการตีพิมพ์หนังสือPhylonymsซึ่งเป็นหนังสือที่รวบรวมรายชื่อชื่อแรกที่ได้รับการกำหนดขึ้นภายใต้ประมวลกฎหมายนั้น

โปรติสต์บางชนิดซึ่งบางครั้งเรียกว่าโปรติสต์แอมบิเรกนัลได้รับการพิจารณาว่าเป็นทั้งโปรโตซัวและสาหร่ายหรือโปรโตซัวและเชื้อราและชื่อเหล่านี้ได้รับการตีพิมพ์ภายใต้ICZNหรือICNหรือ ทั้งสองอย่าง ^{[ 25 ] [ 26 ]}การใช้ภาษาสองแบบที่เกิดขึ้นตลอดแผนการจำแนกประเภทโปรติสต์ส่งผลให้เกิดความสับสน^{[ 27 ] [ 28 ] [ 29 ]}

กลุ่มที่นักโปรโตซัววิทยาและนักสาหร่ายวิทยา ต่างอ้างสิทธิ์ ได้แก่ยูเกลนิดส์ไดโนแฟลเจลเลต คริปโตโมนาดส์แฮปโทไฟต์ กล อโคไฟ ต์ เฮเทอโรค อนต์หลาย ชนิด (เช่น คริโซไฟ ต์ราฟิโดไฟ ต์ ซิลิโคแฟ ล เจลเลต แซ นโทไฟต์บางชนิดโปร เท อโรโมนาดส์ ) สาหร่ายสีเขียวโมนาดอยด์บางชนิด( โว ลโวคาเลียนและพราซิโนไฟต์ ) โคอาโนแฟลเจลเลต ไบโคโซเอซิด ส์อีบริอิดส์และคลอราแรคนิโอไฟต์

ราเมือก ราพลาสโมเดียม และสิ่งมีชีวิต " คล้ายเชื้อรา " อื่นๆ ที่ทั้งนักโปรโตซัววิทยาและนักไมโควิทยา กล่าวอ้าง ได้แก่ไมซีโต ซั วพลาสโมดิโอฟอริ ด อะคราซิดและลาบิรินทูโลไมซีตส่วนเชื้อราที่ทั้งนักโปรโตซัววิทยาและนักไมโควิทยา กล่าวอ้าง ได้แก่ไคทริดบลาสโตแคลดและเชื้อรา ในลำไส้

กลุ่มที่เป็นปัญหาอื่นๆ ได้แก่ไซยาโนแบคทีเรีย (ICNP/ICN), โรเซลลิดาและไมโครสปอริเดีย (ICZN/ICN)

รหัสทางสัตววิทยาไม่ได้ควบคุมชื่อของกลุ่มอนุกรมวิธานที่ต่ำกว่าชนิดย่อยหรือสูงกว่าวงศ์ใหญ่ มีความพยายามมากมายที่จะนำระเบียบมาใช้ในการตั้งชื่อกลุ่มอนุกรมวิธานเหล่านี้^{[ 30 ] [ 31 ]}รวมถึง PhyloCodeระบบการตั้งชื่อ Duplostensional ^{[ 32 ] [ 33 ]}และการตั้งชื่อแบบ circumscriptional ^{[ 34 ] [ 35 ]}

รหัสพฤกษศาสตร์ใช้เป็นหลักกับลำดับชั้นของวงศ์ใหญ่และต่ำกว่า มีกฎบางประการสำหรับชื่อที่อยู่เหนือลำดับชั้นของวงศ์ใหญ่ แต่หลักการลำดับความสำคัญไม่ใช้กับชื่อเหล่านั้น และหลักการของการกำหนดตัวอย่างต้นแบบเป็นทางเลือก ชื่อเหล่านี้อาจเป็นชื่อต้นแบบ โดยอัตโนมัติ หรือเป็นชื่อเชิงพรรณนา [ ^{36 ] [ 37 ] ใน}บางกรณี กลุ่มอนุกรมวิธานอาจมีชื่อที่เป็นไปได้สองชื่อ (เช่นChrysophyceae Pascher, 1914, nom. descrip. ; Hibberd, 1976, nom. typificatum ) ชื่อเชิงพรรณนามีปัญหา เนื่องจากหากกลุ่มอนุกรมวิธานถูกแบ่งออก จะไม่ชัดเจนว่ากลุ่มใหม่ใดจะใช้ชื่อที่มีอยู่ ในขณะที่ชื่อต้นแบบนั้น กลุ่มใหม่ที่ยังคงมีตัวอย่างต้นแบบของชื่อนี้จะใช้ชื่อที่มีอยู่ อย่างไรก็ตาม ชื่อต้นแบบก่อให้เกิดปัญหาพิเศษสำหรับจุลินทรีย์^{[ 29 ]}

• การตั้งชื่อแบบทวินาม
• การตั้งชื่อทางพฤกษศาสตร์
• การตั้งชื่อทางเคมี
• ชื่อสามัญ
• การตั้งชื่อยีน
• อภิธานศัพท์การตั้งชื่อทางวิทยาศาสตร์
• รายชื่อกลุ่มสิ่งมีชีวิตที่ตั้งชื่อตามคำสลับอักษร
• การตั้งชื่อทางสัตววิทยา
• แผนภูมิวิวัฒนาการของสิ่งมีชีวิต (ชีววิทยา)

• Lahr, Daniel JG; Lara, Enrique; Mitchell, Edward AD (2012). "ถึงเวลาแล้วที่จะควบคุมระบบการตั้งชื่อยูคาริโอตจุลินทรีย์"วารสารชีววิทยาของสมาคมลินเนียน 107 ( 3): 469– 476. doi : 10.1111/j.1095-8312.2012.01962.x .
• แมคนีล เจ.; แบร์รี FR; บั๊ก ดับบลิวอาร์; เดมูลิน, ว.; กรอยเตอร์ ว.; ฮอว์กสเวิร์ธ, เดลลาโฮ; เฮเรนดีน ป.ล.; แน็ปป์ ส.; มาร์โฮลด์, เค.; ปราโด เจ.; พรูดอมม์ ฟาน ไรน์, WF; สมิธ GF; เวียร์เซมา, JH; เทอร์แลนด์, นิวเจอร์ซีย์ (2012) รหัสการตั้งชื่อสากลสำหรับสาหร่าย เชื้อรา และพืช (รหัสเมลเบิร์น) รับรองโดยการประชุมพฤกษศาสตร์นานาชาติครั้งที่ 18 เมลเบิร์น ประเทศออสเตรเลีย กรกฎาคม 2554 ฉบับที่ Regnum ผัก 154. ARG Gantner Verlag KG. ไอเอสบีเอ็น 978-3-87429-425-6.
• Turland, NJ; Wiersema, JH; Barry, FR; Greuter, W.; Hawksworth, DL; Herendeen, PS; Knapp, S.; Kusber, WH; Li, D.-Z.; Marhold, K.; May, TW; McNeill, J.; Monro, AM; Prado, J.; Price, MJ; Smith, GF (2018). ประมวลกฎการตั้งชื่อสากลสำหรับสาหร่าย เชื้อรา และพืช (ประมวลกฎเซินเจิ้น) ที่ได้รับการรับรองโดยการประชุมพฤกษศาสตร์นานาชาติครั้งที่ 19 ณ เมืองเซินเจิ้น ประเทศจีน กรกฎาคม 2017เล่มที่ Regnum Vegetabile 159 สำนักพิมพ์ Koeltz Botanical Books ISBN 978-3-946583-16-5.

วิกิมีเดียคอมมอน ส์มีสื่อที่เกี่ยวข้องกับรหัสการตั้งชื่อทางวิทยาศาสตร์

• Biocode พร้อมใช้งานจริงที่ Smithsonian Ocean Portal
• ICN : รหัสเซินเจิ้น (2018)
• ICZN : "หนังสือสีเขียว" (1999)
• รายชื่อชื่อจุลินทรีย์โปรคาริโอตพร้อมสถานะในระบบการตั้งชื่อ (1997) โดย เจพี ยูเซบี
• ฟิโลโค้ด