OMP ที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรง
E. coli OmpX, PDB : 1qj8 ​.
ตัวระบุ
เครื่องหมาย	ไอล์_ลอม
พีแฟม	PF06316
อินเตอร์โปร	IPR000758
โปรไซต์	PDOC00582
สโคป2	1qj9 / SCOPe / SUPFAM
ซูเปอร์แฟมิลี OPM	26
โปรตีน OPM	1qj8
โครงสร้างโปรตีนที่มีอยู่: พีดีบี   ‹ กำลังพิจารณารวมเทมเพลต ด้านล่าง ( ลิงก์ Protein Data Bank 3 ) เข้า กับลิงก์ PDBsum โปรดดูเทมเพลตสำหรับการอภิปรายเพื่อช่วยให้บรรลุข้อตกลงร่วมกัน›  แบบฟอร์ม A:24-171 ‹ กำลังพิจารณารวมเทมเพลต ด้านล่าง ( ลิงก์ Protein Data Bank 3 ) เข้า กับลิงก์ PDBsum โปรดดูเทมเพลตสำหรับการอภิปรายเพื่อช่วยให้บรรลุข้อตกลงร่วมกัน›  1q9g A:24-171 ‹ กำลังพิจารณารวมเทมเพลต ด้านล่าง ( ลิงก์ Protein Data Bank 3 ) เข้า กับลิงก์ PDBsum โปรดดูเทมเพลตสำหรับการอภิปรายเพื่อช่วยให้บรรลุข้อตกลงร่วมกัน›  1qj8 A:24-171 IPR000758 PF06316 ( ECOD ; PDBsum )   อัลฟาโฟลด์ IPR000758 PF06316

โปรตีนเยื่อหุ้มเซลล์ชั้นนอกที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรงของโรคหรือโปรตีนพื้นผิวชั้นนอก ( Osp ) ในบางบริบท จะถูกสร้างขึ้นในเยื่อหุ้มเซลล์ชั้นนอกของแบคทีเรียแกรมลบและมีความสำคัญต่อการอยู่รอดของแบคทีเรียภายในแมโครฟาจรวมถึงการบุกรุกเซลล์ยูคาริโอต

โปรตีนในกลุ่มนี้ประกอบด้วยโปรตีนคล้าย Ail/Lom จากแบคทีเรียและฟาจหลายชนิด โปรตีน Ail จาก Yersinia enterocoliticaเป็นปัจจัยก่อโรคที่รู้จักกันดี โปรตีนในกลุ่มนี้คาดว่าจะประกอบด้วยแผ่นเบต้าแบบทรานส์เมมเบรน 8 แผ่น และ ลูปที่สัมผัสกับผิวเซลล์ 4 ลูป เชื่อกันว่า Ail ส่งเสริมการบุกรุกโดยตรง และลูปที่ 2 มีตำแหน่งออกฤทธิ์ ซึ่งอาจเป็นโดเมนที่จับกับตัวรับ โปรตีน Lom จากฟาจถูกสร้างขึ้นระหว่างกระบวนการไลโซเจนี และเข้ารหัสโปรตีนเยื่อหุ้มเซลล์ของโฮสต์ Lom พบในเยื่อหุ้มเซลล์ชั้นนอกของแบคทีเรีย และมีความคล้ายคลึงกับโปรตีนก่อโรคของแบคทีเรียในกลุ่ม enterobacteriaอีกสองสกุล มีการเสนอแนะว่าไลโซเจนีอาจมีบทบาทในการอยู่รอดของแบคทีเรียในโฮสต์สัตว์ และอาจมีบทบาทในการก่อโรคด้วย

โปรตีนพื้นผิวภายนอก ของ Borrelia burgdorferi (ซึ่งเป็นสาเหตุของโรค Lyme ) มีบทบาทในการคงอยู่ภายในเห็บ (OspA, OspB, OspD) การถ่ายทอดไปยังโฮสต์ที่เป็นสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม (OspC, BBA64) การยึดเกาะกับเซลล์โฮสต์ (OspF, BBK32, DbpA, DbpB) และการหลีกเลี่ยงระบบภูมิคุ้มกันของโฮสต์ (VlsE) OspC กระตุ้นระบบภูมิคุ้มกันโดยกำเนิดผ่านการส่งสัญญาณผ่านตัวรับ TLR1 , TLR2และ TLR6 ^{[ 1 ]}

สมาชิกของกลุ่มนี้ได้แก่:

• PagC ซึ่งจำเป็นต่อSalmonella typhimuriumในการอยู่รอดในแมคโครฟาจและความรุนแรงในหนู^{[ 2 ]}
• โปรตีนเยื่อหุ้มชั้นนอก Rck ของพลาสมิดก่อโรคS. typhimuriumและS. enteritidis ^{[ 3 ]}
• Ail ซึ่งเป็นผลิตภัณฑ์ของ โครโมโซม Yersinia enterocoliticaที่สามารถเป็นตัวกลางในการยึดเกาะของแบคทีเรียและการบุกรุกเซลล์เยื่อบุผิว^{[ 4 ]}
• OmpX จากEscherichia coliที่ส่งเสริมการยึดเกาะและการเข้าสู่เซลล์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการต้านทานการโจมตีโดยระบบคอมพลีเมนต์ของมนุษย์^{[ 5 ]}
• โปรตีนเยื่อหุ้มชั้นนอกของ แบค ทีริ โอเฟจแลมบ์ดา Lom ^{[ 6 ]}
• OspA/B เป็นไลโปโปรตีนจากBorrelia burgdorferi OspA และ OspB มีความเหมือนกันของกรดอะมิโน 53% และน่าจะมีโครงสร้างโปรตีนแผ่นเบต้าแบบ "ตั้งอิสระ" ขนานกันในลักษณะเดียวกัน ซึ่งเชื่อมโยงกับพื้นผิวเยื่อหุ้มเซลล์ด้านนอกผ่านทางหมู่ซิสเทอีนปลาย NH2 ที่มีลิพิเดต ^{[ 7 ]} OspA
• OspC เป็นไลโปโปรตีนบนพื้นผิวหลักที่ผลิตโดยBorrelia burgdorferiเมื่อเห็บ ที่ติดเชื้อ ดูดเลือด OspC มีความจำเป็นสำหรับการบุกรุกต่อมน้ำลายของเห็บ^{[ 8 ]} B. burgdorferiที่ขาด OspC มีความสามารถในการถ่ายทอดไปยังหนูได้สำเร็จลดลงอย่างมาก (ประมาณ 800 เท่าน้อยกว่าสไปโรเคตควบคุมที่แสดงออก OspC) ^{[ 9 ]}การสังเคราะห์จะลดลงหลังจากถ่ายทอดไปยังโฮสต์ที่เป็นสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม^{[ 10 ]}โปรตีนนี้จะหายไปจากพื้นผิวของแบคทีเรียประมาณ 2 สัปดาห์หลังจากการติดเชื้อ^{[ 11 ]}

โครงสร้างผลึกของ OmpX จาก E. coli เผยให้เห็นว่า OmpX ประกอบด้วยเบต้าบาร์เรล แบบขนาน แปด สายที่อยู่ติดกัน ^{[ 12 ]}โครงสร้างแสดงให้เห็นวงแหวนสองวงของกรดอะมิโนอะโรมาติกและแถบของกรดอะมิโนที่ไม่เป็นขั้วซึ่งยึดติดกับส่วนภายในของเยื่อหุ้มเซลล์ แกนกลางของบาร์เรลประกอบด้วย เครือข่าย พันธะไฮโดรเจน ที่ขยายออกไป ของกรดอะมิโนที่มีการอนุรักษ์สูง ดังนั้น OmpX จึงมีลักษณะคล้ายไมเซลล์ แบบกลับ ด้าน โครงสร้างของ OmpX แสดงให้เห็นว่าส่วนของโปรตีนที่ทะลุผ่านเยื่อหุ้มเซลล์นั้นมีการอนุรักษ์ที่ดีกว่าลูปภายนอกเซลล์มาก ยิ่งไปกว่านั้น ลูปเหล่านี้ก่อตัวเป็นแผ่นเบต้าที่ยื่นออกมา ซึ่งขอบของแผ่นเบต้านั้นคาดว่าจะจับกับโปรตีนภายนอก มีการแนะนำว่าการจับแบบนี้ส่งเสริมการยึดเกาะและการบุกรุกของเซลล์ และช่วยป้องกันระบบคอมพลีเมนต์ แม้ว่า OmpX จะมีโครงสร้างเบต้าชีทแบบเดียวกันกับโปรตีนเยื่อหุ้มเซลล์ชั้นนอก A (OmpA) ที่มีโครงสร้างคล้ายคลึงกัน ( InterPro : IPR000498 ) แต่โครงสร้างทรงกระบอกของทั้งสองโปรตีนนั้นแตกต่างกันในแง่ของจำนวนแรงเฉือนและเครือข่ายพันธะไฮโดรเจนภายใน 

OspA จากBorrelia burgdorferiเป็นโปรตีนบนพื้นผิวด้านนอกที่มีลักษณะพิเศษ คือมีโดเมนทรงกลมสองโดเมนที่เชื่อมต่อกันด้วยเบต้าชีท ชั้นเดียวt. โปรตีนนี้ละลายได้ดีมาก มีสารตกค้าง LysและGluจำนวนมากสารตกค้างที่มีเอนโทรปีสูงเหล่านี้อาจทำให้การจัดเรียงผลึกไม่เอื้ออำนวย^{[ 13 ]}