ปลายN-terminus (หรือที่รู้จักกันในชื่อ_ปลายอะมิโน , ปลายNH₂ , ปลาย N-terminalหรือปลายอะมีน ) คือจุดเริ่มต้นของโปรตีนหรือพอลิเปปไทด์โดยหมายถึง หมู่เอ มีน อิสระ (-NH₂ ₎ที่อยู่ปลายสุดของพอลิเปปไทด์ ภายในเปปไทด์ หมู่เอมีนจะเชื่อมต่อกับหมู่คาร์บอกซิลิกของกรดอะมิโนอีกตัวหนึ่ง ทำให้เกิดเป็นสายโซ่ ซึ่งจะเหลือหมู่คาร์บอกซิลิกอิสระอยู่ที่ปลายด้านหนึ่งของเปปไทด์ เรียกว่า ปลายC-terminusและหมู่เอมีนอิสระอยู่ที่ปลายอีกด้านหนึ่ง เรียกว่า ปลาย N-terminus ตามธรรมเนียมแล้ว ลำดับของเปปไทด์จะเขียนจากปลาย N-terminus ไปยังปลาย C-terminus จากซ้ายไปขวา (ในระบบการเขียนแบบ LTR ) ^{[ 1 ]}สิ่งนี้เชื่อมโยง ทิศทาง การแปลกับทิศทางของข้อความ เพราะเมื่อโปรตีนถูกแปลจากอาร์เอ็นเอส่งสารโปรตีนจะถูกสร้างขึ้นจากปลาย N ไปยังปลาย C เนื่องจากกรดอะมิโนจะถูกเพิ่มเข้าไปที่ปลายคาร์บอกซิลของโปรตีน

กรดอะมิโนแต่ละชนิดมี หมู่ เอมีนและหมู่คาร์บอกซิล กรดอะมิโนเชื่อมต่อกันด้วยพันธะเปปไทด์ซึ่งเกิดขึ้นจากปฏิกิริยาการกำจัดน้ำที่เชื่อมหมู่คาร์บอกซิลของกรดอะมิโนหนึ่งเข้ากับ หมู่ เอมีนของกรดอะมิโนถัดไปในลักษณะหัวต่อท้ายเพื่อสร้าง สาย โซ่โพลีเปปไทด์ สายโซ่นี้มีปลายสองข้าง คือ หมู่เอมีน ปลาย N และหมู่คาร์บอกซิลที่ไม่ได้เชื่อมต่อปลาย C ^{[ 2 ]}

เมื่อโปรตีนถูกแปลจากอาร์เอ็นเอส่งสาร โปรตีนจะถูกสร้างขึ้นจากปลาย N ไปยังปลาย C ปลายอะมิโนของกรดอะมิโน (บนทีอาร์เอ็นเอ ที่มีประจุ ) ในระหว่างขั้นตอนการยืดตัวของการแปล จะเชื่อมต่อกับปลายคาร์บอกซิลของสายโซ่ที่กำลังเติบโต เนื่องจากรหัสเริ่มต้นของรหัสพันธุกรรมกำหนดกรดอะมิโนเมไทโอนีนลำดับโปรตีนส่วนใหญ่จึงเริ่มต้นด้วยเมไทโอนีน (หรือในแบคทีเรียไมโทคอนเดรียและคลอโรพลาสต์ จะเป็น รูปแบบที่ดัดแปลง แล้วคือ เอ็น -ฟอร์มิลเมไทโอนีนหรือ fMet) อย่างไรก็ตาม โปรตีนบางชนิดได้รับการดัดแปลงหลังการแปลเช่น โดยการตัดออกจากสารตั้งต้นของโปรตีนและดังนั้นจึงอาจมีกรดอะมิโนที่แตกต่างกันที่ปลาย N ของโปรตีนนั้น

ปลาย N-terminus คือส่วนแรกของโปรตีนที่ออกจากไรโบโซมระหว่างการสังเคราะห์โปรตีนโดยมักจะมี ลำดับ เปปไทด์สัญญาณซึ่งเปรียบเสมือน " รหัสไปรษณีย์ ภายในเซลล์ " ที่นำทางโปรตีนไปยังออร์แกเนลล์ ที่เหมาะสม โดยปกติแล้วเปปไทด์สัญญาณจะถูกกำจัดออกไปที่ปลายทางโดยเอนไซม์เปปติเด สสัญญาณ กรดอะมิโนที่ปลาย N-terminus ของโปรตีนเป็นตัวกำหนดที่สำคัญของครึ่งชีวิต (โอกาสที่จะถูกย่อยสลาย) ของ โปรตีน ซึ่งเรียกว่ากฎปลาย N-terminus

เปปไทด์สัญญาณที่ปลาย N-terminus จะถูกจดจำโดยอนุภาคจดจำสัญญาณ (SRP) และส่งผลให้โปรตีนถูกส่งไปยังเส้นทางการหลั่งในเซลล์ยูคาริโอติก โปรตีนเหล่านี้ถูกสังเคราะห์ขึ้นที่เอน โดพลาสมิกเรติคูลัมแบบหยาบในเซลล์โปรคาริโอติก โปรตีนเหล่านี้ จะถูกส่งออกไปทางเยื่อหุ้มเซลล์ในคลอโรพลาสต์เปปไทด์สัญญาณจะนำโปรตีนไปยังไทลาคอยด์

เปปไทด์เป้าหมายไมโทคอนเดรียที่ปลาย N (mtTP) ช่วยให้โปรตีนสามารถนำเข้าสู่ไมโทคอนเดรียได้

เปปไทด์เป้าหมายคลอโรพลาสต์ (cpTP) บริเวณปลาย N-terminus ช่วยให้โปรตีนสามารถถูกนำเข้าสู่คลอโรพลาสต์ได้

ปลาย N ของโปรตีนสามารถถูกดัดแปลงได้ทั้งในระหว่างหรือหลังการแปล การดัดแปลงรวมถึงการกำจัดเมไทโอนีนเริ่มต้น (iMet) โดยอะมิโนเปปติเดสการติดกลุ่มเคมีขนาดเล็ก เช่นอะเซทิล โพ รพิ โอนิลและเมทิลและการเพิ่มตัวยึดเยื่อหุ้มเซลล์ เช่นกลุ่มพาลมิโทอิลและ ไมริสโตอิล ^{[ 3 ]}

การอะซิทิเลชันที่ปลาย Nเป็นรูปแบบหนึ่งของการดัดแปลงโปรตีนที่สามารถเกิดขึ้นได้ทั้งในโปรคาริโอตและยูคาริโอตมีการเสนอแนะว่าการอะซิทิเลชันที่ปลาย N สามารถป้องกันไม่ให้โปรตีนเคลื่อนที่ไปตามเส้นทางการหลั่งได้^{[ 4 ]}

ปลายด้าน N ของโปรตีนสามารถถูกดัดแปลงได้โดยการเพิ่มหมู่ไมริสโตอิล (myristoyl anchor) โปรตีนที่ถูกดัดแปลงด้วยวิธีนี้จะมีลำดับโมทีฟที่เป็นที่ยอมรับ (consensus motif) อยู่ที่ปลายด้าน N เพื่อทำหน้าที่เป็นสัญญาณการดัดแปลง

ปลาย N-terminus สามารถถูกดัดแปลงได้โดยการเพิ่มกรดไขมันเข้าไปเพื่อสร้างโปรตีนที่มีหมู่ N-acetyl รูปแบบการดัดแปลงที่พบได้บ่อยที่สุดคือการเพิ่มหมู่ palmitoyl เข้าไป

• ปลายซี
• TopFINDคือฐานข้อมูลทางวิทยาศาสตร์ที่ครอบคลุมเกี่ยวกับเอนไซม์โปรตีเอส ความจำเพาะของตำแหน่งการตัด สารตั้งต้น สารยับยั้ง และปลายโปรตีนที่เกิดจากกิจกรรมของเอนไซม์เหล่านั้น