แพทริค
PATRIC [ 1 ] (ศูนย์บูรณาการทรัพยากรระบบพยาธิวิทยา) เป็น เว็บไซต์ ชีวสารสนเทศ แบคทีเรีย จากศูนย์ทรัพยากรชีวสารสนเทศซึ่งสร้างขึ้นครั้งแรกในปี 2547 [ 2 ]ต่อมาได้รวมเข้ากับฐานข้อมูลการวิจัยไข้หวัดใหญ่และ ศูนย์ ทรัพยากรฐานข้อมูลและการวิเคราะห์เชื้อโรคไวรัสเพื่อสร้างศูนย์ทรัพยากรชีวสารสนเทศแบคทีเรียและไวรัส (BV-BRC) [ 3 ] เป็นระบบสารสนเทศที่บูรณาการฐานข้อมูลและเครื่องมือวิเคราะห์ โดยมุ่งเน้นที่ข้อมูลต่างๆ (ทรานสคริปโตมิก โปรตีโอมิก โครงสร้าง และชีวเคมี) ที่เกี่ยวข้องกับเชื้อโรคแบคทีเรีย PATRIC ช่วยอำนวยความสะดวกในการบูรณาการข้อมูล เชื้อโรคประเภทต่างๆเพื่อสนับสนุน การวิจัย ทางการแพทย์เกี่ยวกับโรคติดเชื้อแบคทีเรีย
ประวัติศาสตร์
PATRIC เริ่มต้นเป็นโครงการของ แผนก โครงสร้างพื้นฐานทางไซเบอร์ของVirginia Techและได้รับทุนสนับสนุนจากสถาบันโรคภูมิแพ้และโรคติดเชื้อแห่งชาติ ( NIAID ) ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของสถาบันสุขภาพแห่งชาติ ( NIH ) PATRIC ใช้ข้อมูลฟิโลจีโนมิกส์ของแบคทีเรีย ข้อมูลโปรตีโอมิกส์ และข้อมูลการทดลองต่างๆ ที่เชื่อมโยงกับเชื้อโรคเฉพาะจากแหล่งต่างๆ มากมาย[ 4 ]แพลตฟอร์ม PATRIC มีอินเทอร์เฟซสำหรับการเปรียบเทียบจีโนมิกส์ในปี 2019 NIAID ได้ให้ทุนสนับสนุนเพิ่มเติมแก่ ดร. Rick Stevensที่มหาวิทยาลัยชิคาโกสำหรับศูนย์ทรัพยากรชีวสารสนเทศ ซึ่งเป็นหน่วยงานหลักที่ PATRIC อยู่ภายใต้ในปัจจุบัน[ 5 ]
การครอบคลุมของแบคทีเรีย
ข้อมูลเกี่ยวกับแบคทีเรียสายพันธุ์ต่อไปนี้รวมอยู่ใน PATRIC:
ดูเพิ่มเติม
External links
- Official website
- Bioinformatics Resource Centers The NIAID page describing the goals and activities of the BRCs
- Pathogen Portal Hub site for the five BRCs; provides cross-BRC summary information