มัดด์เข้าร่วม CIA ในปี 1985 ในฐานะนักวิเคราะห์ผู้เชี่ยวชาญด้านเอเชียใต้และตะวันออกกลาง ในปี 1992 เขาเข้าร่วม ศูนย์ต่อต้านการก่อการร้าย (CTC) ของ CIA ตั้งแต่ปี 1995 ถึง 1998 เขาดำรงตำแหน่งใน สภาข่าวกรองแห่งชาติในฐานะรองเจ้าหน้าที่ข่าวกรองแห่งชาติสำหรับตะวันออกใกล้และเอเชียใต้ ในปี 2001 เขาเริ่มภารกิจด้านนโยบายที่ทำเนียบขาว โดยได้รับมอบหมายจาก CIA ให้ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการฝ่ายกิจการอ่าวในสภาความมั่นคงแห่งชาติของทำเนียบขาวหลังจากการโจมตี 11 กันยายนและการรุกรานอัฟกานิสถาน ในเวลาต่อมา เขาได้ร่วมกับเอกอัครราชทูตเจมส์ ด็อบบินส์ในความพยายามที่จะจัดตั้งรัฐบาลใหม่ในอัฟกานิสถาน^{[ 9 ]}มัดด์กลับมาที่ CIA ในเดือนมกราคม 2002 เพื่อดำรงตำแหน่งรองผู้อำนวยการสำนักงานวิเคราะห์การก่อการร้ายของ CTC ^{[ 9 ] [ 8 ]}ที่นั่น เขาได้รับการเลื่อนตำแหน่งเป็นรองผู้อำนวยการ CTC ในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2546 และดำรงตำแหน่งจนถึงเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2548 ^{[ 9 ] [ 8 ] [ 10 ]}ระหว่างการให้สัมภาษณ์ในรายการThe Colbert Report ในปี พ.ศ. 2556 มัดด์ตอบคำถามเกี่ยวกับว่าเขาเคยส่งตัวใครหรือไม่ว่า "ผมเซ็นเอกสารเพื่อส่งตัวคน" และยังกล่าวอีกว่าเขาคิดว่าเป็นสิ่งที่ถูกต้อง^{[ 11 ]}

เมื่อวันที่ 12 สิงหาคม พ.ศ. 2548 โรเบิร์ต มุลเลอร์ผู้อำนวยการ FBI ได้แต่งตั้งมัดด์ให้ดำรงตำแหน่ง ผู้ช่วยผู้อำนวยการบริหาร ฝ่ายความมั่นคงแห่งชาติโดยมีภารกิจในการเปลี่ยนแปลง FBI ให้เป็นหน่วยงานข่าวกรองภายในประเทศ^{[ 9 ] [ 12 ] [ 13 ]}แนวคิดใหม่บางประการของมัดด์ถูกวิพากษ์วิจารณ์โดยเจ้าหน้าที่ FBI ว่า "คลุมเครือ" และมีความกังวลเกี่ยวกับการ "กำหนดเป้าหมายตามเชื้อชาติ" มัดด์สนับสนุนให้เจ้าหน้าที่เลื่อนการจับกุมผู้ต้องสงสัยก่อการร้ายออกไป และโต้แย้งว่าควรเฝ้าติดตามพวกเขาแทนเพื่อรวบรวมข้อมูลข่าวกรองเกี่ยวกับความเชื่อมโยงกับผู้ปฏิบัติงานรายอื่น ๆ รวมถึงข้อมูลเกี่ยวกับความสัมพันธ์ทางการเงินของกลุ่ม ซึ่งเป็นแนวคิดที่เขาพยายามนำไปใช้ในตอนแรกแต่ก็ทำได้ยาก^{[ 14 ]} ในเดือนเมษายน พ.ศ. 2552 ประธานาธิบดีโอบามาได้เสนอชื่อมัดด์ให้ดำรงตำแหน่งรองปลัดกระทรวงความมั่นคงแห่งชาติฝ่ายข่าวกรองและการวิเคราะห์ที่กระทรวงความมั่นคงแห่งชาติ^{[ 10 ]}ต่อมาเขาถอนตัวออกจากการพิจารณาหลังจากที่วุฒิสมาชิกKit Bondประกาศเจตนาที่จะสอบถาม Mudd เกี่ยวกับการมีส่วนร่วมของเขาใน โครงการ สอบสวนขั้นสูงของรัฐบาลบุช Mudd กล่าวว่าเขาเชื่อว่าเขาจะ "กลายเป็นสิ่งรบกวนประธานาธิบดี" หากการเสนอชื่อของเขายังคงดำเนินต่อไป^{[ 15 ] [ 16 ] [ 17 ]}ตั้งแต่ปี 2009 ถึง 2010 เขาเป็นที่ปรึกษาข่าวกรองอาวุโสของ FBI ^{[ 18 ]}

มัดด์ลาออกจากราชการในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2553 และต่อมาได้กลายเป็นผู้แสดงความคิดเห็นประจำในCNNบทวิจารณ์ของเขายังได้รับการเผยแพร่โดยเครือข่ายและสิ่งพิมพ์ต่างๆ อีกด้วย เขายังเขียนหนังสืออีกสามเล่ม^{[ 7 ]}

เมื่อวันที่ 20 สิงหาคม 2561 โดนัลด์ ทรัมป์ประธานาธิบดีสหรัฐฯ ในขณะนั้น ได้แนะนำว่าเขาอาจเพิกถอนการอนุมัติการรักษาความปลอดภัย ของมัดด์ โดยอ้างถึง "สภาพจิตใจ" ของมัดด์ในโพสต์บนทวิตเตอร์และอ้างอิงถึงการปรากฏตัวของมัดด์ในรายการ CNN เมื่อวันที่ 17 สิงหาคม มัดด์ได้มีส่วนร่วมในการสนทนาอย่างดุเดือดทางอากาศกับปารีส เดนาร์ด ผู้ร่วมรายการ CNN เกี่ยวกับความตั้งใจของทรัมป์ที่จะเพิกถอนการอนุมัติการรักษาความปลอดภัยของจอห์น เบรนแนน อดีต ผู้อำนวยการ CIA ไมเคิล เฮย์เดน อดีต ผู้อำนวยการ CIA และ NSAได้แสดงการสนับสนุนมัดด์ โดยเรียกเขาว่า "วีรบุรุษ" และ "ยักษ์ใหญ่ด้านการต่อต้านการก่อการร้าย" ^{[ 19 ] [ 20 ]}ณ เดือนมีนาคม 2562 การอนุมัติการรักษาความปลอดภัยของมัดด์ยังไม่ถูกเพิกถอน^{[ 21 ]}

ในช่วงต้นปี 2023 มัดด์ได้เกษียณจากตำแหน่งที่ CNN ^{[ 22 ]}