กระดองของProtozoeaและสมาชิกอื่นๆ ของProtozoeidaeมีลักษณะยาวกว่าในThylacocephalans อื่นๆ อย่างไรก็ตาม อัตราส่วนระหว่างความยาวและความลึกของกระดองจะแตกต่างกันอย่างมากในแต่ละตัวอย่าง คุณลักษณะที่โดดเด่นที่สุดของกระดองคือหนามยาวสองอันที่ปลายทั้งสองข้างของสัตว์ โดยอันหลังจะโค้งขึ้น^{[ 3 ]} Sylvain และคณะ ได้เปรียบเทียบหนามเหล่านี้กับครัสเตเชียนที่ยังมีชีวิตอยู่ และตั้งสมมติฐานว่าโครงสร้างเหล่านี้จะช่วยให้สัตว์ลอยตัวและมีพลศาสตร์ของน้ำที่ดีขึ้น^{[ 2 ]}กระดองของสัตว์ถูกปกคลุมด้วยหลุมเล็กๆ สลับกันมากมาย ในขณะที่ยังมีชีวิตอยู่ กระดองของProtozoeaจะประกอบด้วยสองส่วนที่เชื่อมต่อกันตาม แนวกลางลำ ตัวด้านหลังของสัตว์ ตัวอย่างหลายชิ้นยังคงรักษาหนามเล็กๆ เจ็ดอันไว้ที่ส่วนท้ายของด้านล่างของกระดอง^{[ 3 ]} ความยาวของกระดองแตกต่างกันไปตั้งแต่ประมาณ2.5 ถึง 8 เซนติเมตร (0.98 ถึง 3.15 นิ้ว)สันนิษฐานว่าอาจเกิดจากพัฒนาการความแตกต่างทางเพศหรือการเปลี่ยนแปลงของสิ่งแวดล้อม ความแปรปรวนนี้ไม่สามารถอธิบายได้ด้วย กระบวนการ เกิดซากดึกดำบรรพ์แต่เป็นผลมาจากการเปลี่ยนแปลงของกระดองที่อ่อนนุ่มและยืดหยุ่น กระดองมีลวดลายเป็น "หลุมกลมเล็กๆ จำนวนมาก" ที่ปลายด้านหน้าและด้านหลังของกระดองมีหนาม 2 อันยื่นออกมา^{[ 3 ]}โครงสร้างขนาดเล็กคล้าย "ท่อ" บนกระดอง คล้ายกับท่ออวัยวะในกุ้งสมัยใหม่ อาจบ่งชี้ถึง วิถีชีวิต แบบว่ายน้ำหรือแบบอยู่ก้นน้ำ^{[ 4 ]}นอกจากนี้ กระดองของProtozoeaน่าจะมีน้ำหนักเบาและยืดหยุ่น ซึ่งจะช่วยให้เคลื่อนที่ได้เร็วขึ้นและลอยตัวได้ดีขึ้น^{[ 2 ]} 

ซากของระยางค์จับเหยื่อนั้นหายาก ในขณะที่ยังมีชีวิตอยู่Protozoeaจะมีระยางค์ที่บอบบาง 3 คู่ ซึ่งจะเชื่อมต่อกันด้วยเส้นใยกล้ามเนื้อที่ฐานใต้กระดอง ที่น่าสังเกตคือ เฉพาะส่วนปลายของระยางค์หน้าเท่านั้นที่จะมองเห็นได้จากภายนอกกระดอง ซึ่งเป็นลักษณะที่ไม่พบในthylacocephalans อื่นๆ ด้านหลังระยางค์หน้าจับเหยื่อจะมีระยางค์รูปพายขนาดเล็กหลายชุด ซึ่งจะช่วยให้สัตว์ว่ายน้ำได้^{[ 1 ]}

ภายในกระดองของโปรโตโซเอียมีเนื้อเยื่ออ่อนหลายชนิด รวมถึงกระเพาะอาหาร กล้ามเนื้อ และเหงือกรูปทรง " บาแกตต์ " 8 คู่ กล้ามเนื้อหลายมัดยังคงสภาพอยู่ รวมถึงกล้ามเนื้อที่ควบคุมการเคลื่อนไหวของกระเพาะอาหารและกล้ามเนื้อของลำตัว^{[ 3 ]}