ฐานทัพอากาศ RAF Shipton เริ่มใช้งานในเดือนกันยายน พ.ศ. 2459 ในฐานะจุดลงจอดสำหรับฝูงบินที่ 76 (ป้องกันบ้านเกิด) ของกองทัพอากาศอังกฤษ สถานที่แห่งนี้อยู่ห่าง จากฐานทัพ อากาศ RAF Linton-on-Ouseไปทางทิศตะวันออกเฉียงใต้4 ไมล์ (6.4 กม.) ห่าง จากเมืองย อร์ก ไป ทางทิศเหนือ 5 ไมล์ (8 กม.) ^{[ 1 ]}และห่างจากเมืองชิปตันไปทางทิศเหนือ1.9 ไมล์ (3 กม.) ใกล้กับหมู่บ้านเบนิงบรอห์ ^{[ 2 ]}ฝูงบินที่ 76 มีกองบัญชาการอยู่ที่ริปอน^{[ 3 ]}และเช่นเดียวกับฐานลงจอดสำรองอื่นๆ ที่พวกเขาดำเนินการอยู่ ยังไม่แน่ชัดว่าชิปตันเคยมีกิจกรรมการบินใดๆ หรือไม่ หลังจากสงครามยุติลง กองทัพอากาศอังกฤษได้ขายสถานที่แห่งนี้ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2462 ^{[ 4 ]}   

มันถูกฟื้นฟูขึ้นมาอีกครั้งในช่วงสงครามโลกครั้งที่สองในฐานะฐานทัพของหน่วยซ่อมบำรุงหมายเลข 60 (เดิมคือหน่วยกู้ซากหมายเลข 5) ^{[ 5 ]}ซึ่งได้รับมอบหมายให้รื้อทุกอย่างที่มีมูลค่าเศษเหล็กเพื่อนำชิ้นส่วนที่สามารถนำมาใช้ได้ พวกเขามีหน้าที่กู้ซากเครื่องบินที่ตกเป็นส่วนหนึ่งของกระบวนการกู้ซาก และในช่วงหนึ่ง กระท่อมยามที่ชิปตันก็กลายเป็นลำตัวเครื่องบินที่คว่ำลง^{[ 6 ]}พื้นที่รับผิดชอบของหน่วยซ่อมบำรุงหมายเลข 60 ครอบคลุมถึงนอร์ธยอร์คมัวร์สพีคดิสทริกต์และไกลออกไปทางเหนือถึงไบลธ์ในนอร์ธัมเบอร์แลนด์เมื่อพวกเขาไปกู้ซาก เครื่องบิน ลุฟท์วาฟ เฟ่ที่ตก จากบริเวณท่าเรือ^{[ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]} หน่วยซ่อมบำรุงหมายเลข 60 กู้ซาก เครื่องบิน Handley Page Halifaxที่ตกจากเวิร์นไซด์ซึ่งกระจัดกระจายไปทั่วบริเวณกว้าง อุบัติเหตุเกิดขึ้นในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2486 และความหนาวเย็นจัดและตำแหน่งที่สูงทำให้การกู้ซากเป็นไปได้ยากมาก แต่ชิ้นส่วนที่มีค่าทั้งหมดก็ถูกส่งกลับไปยังฐานหลักที่ชิปตันได้ภายในวันที่ 6 มกราคม พ.ศ. 2487 ^{[ 10 ]}ในช่วงเวลานี้ ชิปตันถูกใช้เป็นสนามบินกระจายกำลัง^{[หมายเหตุ 1 ]}สำหรับ เครื่องบินทิ้งระเบิด Armstrong Whitworth Whitleyของฝูงบินที่ 58จากลินตัน-ออน-โอสที่อยู่ใกล้เคียง เครื่องบิน Whitley ถูกนำมาที่นี่เพื่อกระจายจำนวนเครื่องบินไปยังพื้นที่ทางภูมิศาสตร์ที่กว้างขึ้นในกรณีที่ศัตรูโจมตีลินตัน^{[ 13 ]}

ในปี พ.ศ. 2489 กองพันที่ 60 MU ได้ถอนตัวออกจากพื้นที่และย้ายไปที่ ฐานทัพ ^{อากาศ} RAF Rufforth [ ^{14 ]}แม้ว่าจะมีหลักฐานที่บ่งชี้ว่าพวกเขายังคงปฏิบัติการเล็กๆ น้อยๆ ที่ Shipton จนถึงปี พ.ศ. 2492 เมื่อมีการยืนยันว่าสำนักงานใหญ่ตั้งอยู่ที่ฐานทัพอากาศRAF Church Fenton ^{[ 15 ]}

ในฐานะส่วนหนึ่งของโครงการป้องกันภัยล่วงหน้าของสหราชอาณาจักร (ที่รู้จักกันในชื่อROTOR ) บังเกอร์สามชั้นถูกสร้างขึ้นที่มุมตะวันตกเฉียงเหนือของพื้นที่สนามบินในปี 1953 ^{[ 16 ]}ในตอนแรก การดำเนินงานดำเนินการจากค่ายทหารอิมฟาลในยอร์ก^{[ 17 ]}แต่เมื่อบังเกอร์ได้รับการเปิดใช้งานในปี 1954 การควบคุมจึงถูกโอนไปยังชิปตัน^{[ 18 ]}ชิปตันเป็นหนึ่งในหกศูนย์ปฏิบัติการภาค (SOC) ที่กระจายอยู่ทั่วบริเตนใหญ่ (อีกห้าแห่งอยู่ที่เหมืองหินบาร์นตันในเอดินบะระบาวเบิร์กใกล้เมืองน อริช บ็อกซ์ ใน วิ ลต์ เชอ ร์ กู ส นาร์กใกล้เมืองเพรสตันและ เคลเวดอน แฮทช์ในเอสเซ็กซ์ ) ^{[ 19 ] [ 20 ]}

บทบาทเริ่มต้นของ SOC คือการกำกับการปฏิบัติการทางอากาศและเที่ยวบินต่อต้านการแทรกซึมในฝั่งตะวันออกของอังกฤษ รายงานต่างๆ ถูกส่งเข้ามายังไซต์จากสถานีเรดาร์ที่กระจายอยู่ตามแนวชายฝั่งตะวันออกของอังกฤษ เนื่องจากบทบาทด้านการป้องกันภัยทางอากาศ จึงเป็นกองบัญชาการของภาคเหนือ ( กองบัญชาการเครื่องบินขับไล่กลุ่มที่ 12 ) ^{[ 21 ]}และมีอำนาจบังคับบัญชาโดยรวมของ ฝูงบิน ที่ 19 , 66 , 92 , 152 , 264 , 275 , 607 , 608และ609ซึ่งกระจายอยู่ระหว่างสนามบินที่ Church Fenton, Linton-on-Ouse, OustonและThornaby ^{[ 22 ]}ในช่วงเวลานี้ เจ้าหน้าที่บางส่วนมาจากหน่วยควบคุมเครื่องบินขับไล่หมายเลข West Riding ฝูงบินที่3609 ^{[ 23 ]}

บริเวณดังกล่าวประกอบด้วยกลุ่มบังเกอร์หลัก ป้อมยาม และที่พักอาศัยสำรอง แม้ว่าที่พักอาศัยหลักจะอยู่ที่ฐานทัพอากาศ RAF Linton-on-Ouse ที่อยู่ใกล้เคียงก็ตาม^{[ 24 ]}บริเวณนี้เป็นศูนย์ปฏิบัติการฉุกเฉิน (SOC) หลักเพียงสามปีก่อนที่ศูนย์ที่RAF Boulmerจะเข้ามารับหน้าที่หลักในปี 1957 ^{[ 25 ]}ในช่วงทศวรรษ 1970, 1980 และ 1990 บังเกอร์แห่งนี้เป็นที่ตั้งของรัฐบาลระดับภูมิภาค (RSG) ^{[ 26 ]}ซึ่งต่อมาได้เปลี่ยนเป็นสำนักงานใหญ่รัฐบาลระดับภูมิภาค (RGHQ) ^{[ 27 ]}มีการเพิ่มชั้นที่สี่ในปี 1976 ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของโครงการปรับปรุงใหม่เป็นเวลาห้าปี^{[ 20 ]}

ในปี พ.ศ. 2535 ได้มีการตัดสินใจขายบังเกอร์นิวเคลียร์บางส่วนที่ถือว่าไม่จำเป็นหลังจากสิ้นสุดสงครามเย็น โดยชิปตันเป็นหนึ่งในนั้น^{[ 28 ]}และปิดตัวลงในปี พ.ศ. 2536 ^{[ 24 ]}และกำจัดทิ้งในปี พ.ศ. 2539 ^{[ 18 ]}