อาร์บีบีพี4

Q: ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ อาร์บีบีพี4

โปรตีนที่จับกับฮิ ส โตน RBBP4 (หรือที่รู้จักกันในชื่อ RbAp48 หรือ NURF55 ) เป็น โปรตีน ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน RBBP4 [ 5 ] [ 6 ]

Q: ปฏิสัมพันธ์

มีการแสดงให้เห็นว่า RBBP4 มีปฏิสัมพันธ์ กับ:

อาร์บีบีพี4
โครงสร้างที่มีอยู่
พีดีบี	การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB
รายชื่อรหัส PDB
	2XU7 , 3GFC , 4PBY , 4PBZ , 4PC0 , 4R7A , 5FXY
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	RBBP4 , NURF55, RBAP48, lin-53, โปรตีนจับกับเรตินอบลาสโตมา 4, โปรตีนจับกับ RB 4, ปัจจัยปรับโครงสร้างโครมาติน
รหัสภายนอก	โอมิม : 602923 ; เอ็มจีไอ : 1194912 ; โฮโมโลยีน : 21153 ; GeneCards : RBBP4 ; OMA : RBBP4 - ออโธล็อก
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ )
คริส.	โครโมโซม 1 (มนุษย์)
จบ	32,686,211 bp
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ )
คริส.	โครโมโซม 4 (เมาส์)
จบ	129,229,163 bp
รูปแบบการแสดงออกของ RNA
	สูงสุดที่แสดงใน
	ส่วนนูนของปมประสาท; โซนโพรงสมอง; เซลล์ไขกระดูก; อัณฑะข้างขวา; อัณฑะซ้าย; โมโนไซต์; เนื้อเยื่อบุผิวของลำไส้ใหญ่; ภาคผนวก; เกาะลางเกอร์ฮันส์; เซลล์สโตรมัลของเยื่อบุโพรงมดลูก;
	สูงสุดที่แสดงใน
	เซลล์พาเนธ; ส่วนนูนของปมประสาทตรงกลาง; คอนไดล์; เยื่อทรงตัวของท่อหูชั้นใน; ฟอสซ่า; ท่ออสุจิ; ร่องรอยดั้งเดิม; ไตส่วนเม็ดเลือด; ผนังหน้าท้อง; เซลล์ต้นกำเนิดเม็ดเลือดในตับทารกในครรภ์;
	ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม
	ไม่มีข้อมูล
ออนโทโลยีของยีน
หน้าที่ระดับโมเลกุล	การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับของบริเวณควบคุมซิสของ RNA polymerase II; กิจกรรมที่ต้องอาศัย ATP ในการออกฤทธิ์ต่อ DNA; การจับตัวของฮิสโตน; การจับกับฮิสโตนดีอะเซทิเลส; การจับโปรตีน; การจับตัวของดีเอ็นเอในนิวคลีโอโซม; กิจกรรมของฮิสโตนดีอะเซทิเลส;
ส่วนประกอบของเซลล์	คอมเพล็กซ์ NuRD; คอมเพล็กซ์ ESC/E(Z); คอมเพล็กซ์ CAF-1; คอมเพล็กซ์ไซน์3; นิวคลีโอพลาสม์; ศูนย์ NURF; นิวเคลียส; ไซโตซอล; สารประกอบที่มีโปรตีน;
กระบวนการทางชีวภาพ	การปรับโครงสร้างโครมาติน; การควบคุมการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; CENP-A ประกอบด้วยการประกอบโครมาติน; การถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การควบคุมวงจรเซลล์; การประกอบโครมาตินที่ขึ้นอยู่กับการจำลองดีเอ็นเอ; การจำลองดีเอ็นเอ; การควบคุมการแสดงออกของยีนในเชิงลบ (เอพิเจเนติกส์); วงจรเซลล์; การควบคุมเชิงลบของการเพิ่มจำนวนประชากรเซลล์; การควบคุมการส่งสัญญาณโดยตัวกลางคลาส p53; การดีอะเซทิเลชันของฮิสโตน; การตอบสนองต่อฮอร์โมนการเจริญเติบโต; การควบคุมเชิงลบของการเปลี่ยนผ่านจากระยะ G0 ไปสู่ระยะ G1; การจัดระเบียบโครมาติน;
	แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก
	5928
	19646
	ENSG00000162521
	ENSMUSG00000057236
	Q09028
	Q60972
	NM_005610 NM_001135255 NM_001135256
	NM_009030
	NP_001128727 NP_001128728 NP_005601
	NP_033056
	วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์	ดู/แก้ไขเมาส์

โปรตีนที่จับกับฮิ สโตน RBBP4 (หรือที่รู้จักกันในชื่อRbAp48หรือNURF55 ) เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนRBBP4 ^[⁵^]^[⁶^]

การทำงาน

ยีนนี้เข้ารหัสโปรตีนนิวเคลียร์ที่แสดงออกอย่างแพร่หลายซึ่งอยู่ในกลุ่มย่อยของ โปรตีน WD-repeat ที่มีการอนุรักษ์สูง โปรตีนนี้มีอยู่ในโปรตีนคอมเพล็กซ์ที่เกี่ยวข้องกับการอะเซทิเลชันของฮิสโตนและ การประกอบ โครมาตินเป็นส่วนหนึ่งของคอมเพล็กซ์ Mi-2/NuRDซึ่งมีส่วนเกี่ยวข้องกับการปรับโครงสร้างโครมาตินและการยับยั้งการถอดรหัสที่เกี่ยวข้องกับการดีอะเซทิเลชันของฮิ สโตน โปรตีนที่เข้ารหัสนี้ยังเป็นส่วนหนึ่งของ คอมเพล็กซ์ โคเรเพรสเซอร์ ซึ่งเป็นส่วนประกอบสำคัญของการปิดเสียงการถอดรหัส พบได้ในโปรตีนเซลล์หลายชนิดที่จับกับโปรตีนเรตินอบลาสโตมา โดยตรง เพื่อควบคุมการแพร่กระจายของเซลล์ โปรตีนนี้ดูเหมือนจะมีส่วนเกี่ยวข้องกับการยับยั้งการถอดรหัสของยีนที่ตอบสนองต่อE2F ด้วย ^{[ 7 ]}

ความสำคัญทางคลินิก

การลดลงของ RbAp48 ในเดนเตตไจรัส (DG) ของฮิปโปแคมปัสในสมอง นั้น คาดว่าจะเป็นสาเหตุหลักของการสูญเสียความจำในผู้สูงอายุตาม ปกติ ^{[ 8 ]} การลดลงของ RbAp48 ที่เกี่ยวข้องกับอายุนั้นพบได้ใน DG จากเนื้อเยื่อหลังการเสียชีวิตของมนุษย์และในหนูทดลอง นอกจากนี้การแทรกยีน ของ RbAp48 ใน รูปแบบ ที่ยับยั้งการทำงานจะทำให้เกิดความบกพร่องทางความจำในหนูอายุน้อยคล้ายกับที่พบในหนูอายุมาก การใช้การถ่ายโอนยีนแบบเลนติ ไวรัส เพื่อเพิ่มการแสดงออกของ RbAp48 ในสมองจะช่วยย้อนกลับความบกพร่องทางความจำในหนูอายุมาก^{[ 8 ]}

RBBP4 ทำงานอย่างน้อยบางส่วนผ่านทางเส้นทางPKA - CREB1 - CPB ^{[ 8 ]}ดังนั้น แนวทางการรักษาที่เป็นไปได้วิธีหนึ่งในการฟื้นฟูความจำที่สูญเสียไปเนื่องจากอายุคือการใช้ยาที่กระตุ้นเส้นทาง PKA-CREB1-CPB ก่อนหน้านี้มีการแสดงให้เห็นแล้วว่าสารกระตุ้นโดปามีน D1/D5 เช่น6-Br-APBและSKF-38,393ซึ่งจับคู่กับอะเดนิลไซเคลสในเชิงบวกและ สาร ยับยั้งcAMP phosphodieserase อย่างโรลิพรามช่วยลดความบกพร่องของความจำในหนูทดลองสูงอายุ^{[ 9 ]}

ปฏิสัมพันธ์

มีการแสดงให้เห็นว่า RBBP4 มีปฏิสัมพันธ์กับ:

BRCA1 , ^{[ 10 ]}
CREBBP , ^{[ 11 ]}
GATAD2B , ^{[ 12 ]}
HDAC1 , ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}^{[ 19 ]}^{[ 20 ]}^{[ 21 ]}^{[ 22 ]}^{[ 23 ]}
HDAC2 , ^{[ 13 ]}^{[ 21 ]}^{[ 24 ]}^{[ 25 ]}
HDAC3 , ^{[ 15 ]}
MTA2 , ^{[ 14 ]}^{[ 20 ]}
RB , ^{[ 15 ]}^{[ 26 ]}^{[ 27 ]}
SAP30 , ^{[ 20 ]}^{[ 28 ]}^{[ 29 ]} และ
SIN3A . ^{[ 18 ]}^{[ 28 ]}

อ่านเพิ่มเติม

"RBBP4 โปรตีนจับกับเรตินอบลาสโตมา 4 [Homo sapiens (มนุษย์)]"เบเธสดา รัฐแมริแลนด์: ศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ (NCBI) สืบค้นเมื่อ6 กันยายน 2013
Bauw G, Rasmussen HH, van den Bulcke M และคณะ (1990). "การแยกโปรตีนด้วยเจลอิเล็กโทรโฟเรซิสแบบสองมิติ การถ่ายโอนโปรตีนด้วยไฟฟ้า และการจัดลำดับไมโคร: การเชื่อมโยงโดยตรงระหว่างโปรตีนและยีน" Electrophoresis . 11 (7): 528– 36. doi : 10.1002/elps.1150110703 . PMID 1699755 . S2CID 24768114 .
Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL (1999). "โปรตีนสามชนิดกำหนดคลาสของฮิสโตนดีอะเซทิเลสของมนุษย์ที่เกี่ยวข้องกับ Hda1p ของยีสต์" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 96 (9): 4868– 73. Bibcode : 1999PNAS...96.4868G . doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . PMC 21783 . PMID 10220385 .
Hassig CA, Tong JK, Fleischer TC และคณะ (1998). "บทบาทของกิจกรรมฮิสโตนดีอะเซทิเลสในการยับยั้งการถอดรหัสที่เกิดจาก HDAC1" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 95 (7): 3519– 24. Bibcode : 1998PNAS...95.3519H . doi : 10.1073 / pnas.95.7.3519 . PMC 19868. PMID 9520398 .
Marheineke K, Krude T (1998). "กิจกรรมการประกอบนิวคลีโอโซมและการแปลตำแหน่งภายในเซลล์ของ CAF-1 ของมนุษย์เปลี่ยนแปลงไปในระหว่างวงจรการแบ่งเซลล์" J. Biol. Chem . 273 (24): 15279– 86. doi : 10.1074/jbc.273.24.15279 . PMID 9614144 .
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: วิธีง่ายๆ ในการแทนที่โครงสร้าง cap ของ mRNA ยูคาริโอตด้วยโอลิโกไรโบนิวคลีโอไทด์" Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Qian YW, Lee EY (1995). "โปรตีนที่จับกับเรตินอบลาสโตมาคู่ที่มีคุณสมบัติที่เกี่ยวข้องกับตัวควบคุมเชิงลบของ ras ในยีสต์" . J. Biol. Chem . 270 (43): 25507– 13. doi : 10.1074/jbc.270.43.25507 . PMID 7503932 .
Rasmussen HH, van Damme J, Puype M และคณะ (1993). "ลำดับไมโครของโปรตีน 145 ชนิดที่บันทึกไว้ในฐานข้อมูลโปรตีนเจลสองมิติของเซลล์เคราติโนไซต์ผิวหนังมนุษย์ปกติ" Electrophoresis . 13 (12): 960– 9. doi : 10.1002/elps.11501301199 . PMID 1286667 . S2CID 41855774 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K และคณะ (1997). "การสร้างและลักษณะเฉพาะของไลบรารี cDNA ที่อุดมด้วยความยาวเต็มและอุดมด้วยปลาย 5'" Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Taunton J, Hassig CA, Schreiber SL (1996). "เอนไซม์ฮิสโตนดีอะเซทิเลสของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมที่เกี่ยวข้องกับตัวควบคุมการถอดรหัส Rpd3p ของยีสต์" Science . 272 (5260): 408– 11. Bibcode : 1996Sci...272..408T . doi : 10.1126/science.272.5260.408 . PMID 8602529 . S2CID 25717734 .
Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR และคณะ (1998). "การกำจัดหมู่แอซีทิลออกจากโครมาตินโดยคอมเพล็กซ์ปรับโครงสร้างนิวคลีโอโซมที่ขึ้นอยู่กับ ATP" Nature . 395 (6705): 917– 21. Bibcode : 1998Natur.395..917T . doi : 10.1038/27699 . PMID 9804427 . S2CID 4355885 .
Verreault A, Kaufman PD, Kobayashi R, Stillman B (1998). "ดีเอ็นเอของนิวคลีโอโซมควบคุมหน่วยย่อยที่จับกับฮิสโตนหลักของอะเซทิลทรานสเฟอเรส Hat1 ของมนุษย์" . Curr. Biol . 8 (2): 96– 108. Bibcode : 1998CBio....8...96V . doi : 10.1016/S0960-9822(98)70040-5 . PMID 9427644 . S2CID 201273 .
Verreault A, Kaufman PD, Kobayashi R, Stillman B (1996). "การประกอบนิวคลีโอโซมโดยคอมเพล็กซ์ของ CAF-1 และฮิสโตน H3/H4 ที่ถูกอะซิทิเลต" . Cell . 87 (1): 95– 104. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81326-4 . PMID 8858152 . S2CID 1416453 .
Wolffe AP, Urnov FD, Guschin D (2001). "คอมเพล็กซ์โค-รีเพรสเซอร์และการปรับโครงสร้างโครมาตินเพื่อการยับยั้ง" Biochem. Soc. Trans . 28 (4): 379– 86. doi : 10.1042/0300-5127:0280379 . PMID 10961924 .
Yarden RI, Brody LC (1999). "BRCA1 มีปฏิสัมพันธ์กับส่วนประกอบของคอมเพล็กซ์ฮิสโตนดีอะเซทิเลส" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 96 (9): 4983– 8. Bibcode : 1999PNAS...96.4983Y . doi : 10.1073/pnas.96.9.4983 . PMC 21803 . PMID 10220405 .
Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H และคณะ (1999). "การวิเคราะห์หน่วยย่อยของ NuRD เผยให้เห็นคอมเพล็กซ์แกนกลางของฮิสโตนดีอะเซทิเลสและความเชื่อมโยงกับการเมทิลเลชั่นของ DNA" Genes Dev . 13 ( 15): 1924– 35. doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . PMC 316920. PMID 10444591 .
Zhang Y, Iratni R, Erdjument-Bromage H และคณะ (1997). "ฮิสโตนดีอะเซทิเลสและ SAP18 ซึ่งเป็นพอลิเปปไทด์ชนิดใหม่ เป็นส่วนประกอบของคอมเพล็กซ์ Sin3 ในมนุษย์" . Cell . 89 (3): 357– 64. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80216-0 . PMID 9150135 .
Zhang Y, Sun ZW, Iratni R และคณะ (1998). "SAP30 โปรตีนใหม่ที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้ระหว่างมนุษย์และยีสต์ เป็นส่วนประกอบของคอมเพล็กซ์ฮิสโตนดีอะเซทิเลส" . Mol. Cell . 1 (7): 1021– 31. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 . PMID 9651585 .
Zhang Y, LeRoy G, Seelig HP และคณะ (1998). "ออโตแอนติเจน Mi2 ที่จำเพาะต่อโรคเดอร์มาโตไมโอซิสเป็นส่วนประกอบของคอมเพล็กซ์ที่มีกิจกรรมของฮิสโตนดีอะเซทิเลสและการปรับโครงสร้างนิวคลีโอโซม" . Cell . 95 (2): 279– 89. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . PMID 9790534 . S2CID 18786866 .
Zhang Y, Dufau ML (2003). "กลไกคู่ของการควบคุมการถอดรหัสของยีนตัวรับฮอร์โมนลูทีไนซิงโดยตัวรับนิวเคลียร์ออร์แฟนและคอมเพล็กซ์ฮิสโตนดีอะเซทิเลส" J. Steroid Biochem. Mol. Biol . 85 ( 2– 5): 401– 14. doi : 10.1016/S0960-0760(03)00230-9 . PMID 12943729 . S2CID 28512341 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[

[

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

อาร์บีบีพี4

การทำงาน

ความสำคัญทางคลินิก

ปฏิสัมพันธ์

อ่านเพิ่มเติม

ข้อมูลสำคัญจากบทความ