อ่าน 9 นาที
อาร์เอ็นเอฟ8
E3 ยูบิควิติน-โปรตีนไลเกส RNF8 เป็น เอนไซม์ ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีน RNF8 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] RNF8 มีกิจกรรมทั้งในระบบภูมิคุ้มกัน [ 8 ] และในการซ่อมแซม DNA
อาร์เอ็นเอฟ8
| อาร์เอ็นเอฟ8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | RNF8 , โปรตีนนิ้วริง 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 611685 ; เอ็มจีไอ : 1929069 ; โฮโมโลยีน : 2944 ; การ์ดยีน : RNF8 ; OMA : RNF8 - ออโธโลจี | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
E3 ยูบิควิติน-โปรตีนไลเกส RNF8เป็นเอนไซม์ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนRNF8 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] RNF8 มีกิจกรรมทั้งในระบบภูมิคุ้มกัน[ 8 ]และในการซ่อมแซม DNA
การทำงาน
โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้มีโมทิฟนิ้ว RINGและโดเมน FHAโปรตีนนี้แสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับเอนไซม์ยูบิควิตินคอนจูเกตติ้ง คลาส II หลายชนิด (E2) รวมถึงUBE2E1 /UBCH6, UBE2E2และUBE2E3และอาจทำหน้าที่เป็นยูบิควิตินไลเกส (E3) ในการ ยูบิ ควิตินไนเซชันของโปรตีนนิวเคลียร์บางชนิด มีรายงานตัวแปรทรานสคริปต์ที่ตัดต่อแบบทางเลือกซึ่งเข้ารหัสไอโซฟอร์มที่แตกต่างกัน[ 7 ]
RNF8 ส่งเสริมการซ่อมแซมความเสียหายของ DNA ผ่านเส้นทางการซ่อมแซม DNA สามเส้นทาง ได้แก่การซ่อมแซมแบบโฮโมโลจัสรีคอมบิเนชัน (HRR) [ 9 ]การเชื่อมต่อปลายที่ไม่เหมือนกัน (NHEJ) [ 10 ] [ 11 ]และการซ่อมแซมแบบตัดนิวคลีโอไทด์ (NER) [ 10 ] ความเสียหายของ DNA ถือเป็นสาเหตุหลักของมะเร็งและการขาดการซ่อมแซม DNA สามารถทำให้เกิดการกลายพันธุ์ที่นำไปสู่มะเร็งได้[ 12 ] การขาด RNF8 ทำให้หนูมีแนวโน้มที่จะเป็นมะเร็ง[ 13 ] [ 14 ]
การปรับโครงสร้างโครมาติน
หลังจากเกิดการแตกหักของสายดีเอ็นเอสองสายโครมาตินจำเป็นต้องคลายตัวเพื่อให้สามารถซ่อมแซมดีเอ็นเอได้ ไม่ว่าจะโดยกลไก HRRหรือNHEJมีสองเส้นทางที่ทำให้โครมาตินคลายตัว เส้นทางหนึ่งเริ่มต้นโดยPARP1และอีกเส้นทางหนึ่งเริ่มต้นโดย γH2AX (รูปแบบฟอสโฟรีเลตของ โปรตีน H2AX ) (ดูการปรับโครงสร้างโครมาติน ) การปรับโครงสร้างโครมาตินที่เริ่มต้นโดย γH2AX ขึ้นอยู่กับ RNF8 ดังที่อธิบายไว้ด้านล่าง
ฮิสโตนชนิด H2AX คิดเป็นประมาณ 10% ของฮิสโตน H2A ในโครมาตินของมนุษย์[ 15 ] ณ ตำแหน่งที่เกิดการแตกของสายดีเอ็นเอคู่ ขอบเขตของโครมาตินที่มี γH2AX ที่ถูกฟอสโฟรีเลตมีประมาณสองล้านคู่เบส[ 15 ]
γH2AX เพียงอย่างเดียวไม่ได้ทำให้โครมาตินคลายตัว แต่ภายในไม่กี่วินาทีหลังจากการฉายรังสี โปรตีน "Mediator of the DNA damage checkpoint 1" ( MDC1 ) จะจับกับ γH2AX โดยเฉพาะ[ 16 ] [ 17 ] ซึ่งเกิดขึ้นพร้อมกับการสะสมของโปรตีน RNF8 และโปรตีนซ่อมแซม DNA NBS1ที่จับกับMDC1 ในเวลาเดียวกัน [ 18 ] RNF8 เป็นตัวกลางในการคลายโครมาตินอย่างกว้างขวางผ่านการโต้ตอบกับโปรตีนCHD4ใน ภายหลัง [ 19 ] ซึ่งเป็นส่วนประกอบของคอมเพล็กซ์ NuRDที่ทำหน้าที่ปรับโครงสร้างนิวคลีโอโซมและกำจัดหมู่แอซีทิล
RNF8 ในกระบวนการซ่อมแซมแบบโฮโมโลจัสรีคอมบิเนชัน
การตัดปลาย DNAเป็นขั้นตอนสำคัญในการซ่อมแซม HRR ซึ่งสร้างส่วนยื่น 3' ที่เป็นฐานในการดึงดูดโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการซ่อมแซม HRR คอมเพล็กซ์ MRNซึ่งประกอบด้วยMre11 , Rad50และNBS1ดำเนินการขั้นตอนเริ่มต้นของการตัดปลายนี้[ 20 ] RNF8 ทำการยูบิควิตินไนเซชันNBS1 (ทั้งก่อนและหลังเกิดความเสียหายของ DNA) และการยูบิควิตินไนเซชันนี้จำเป็นสำหรับการซ่อมแซมแบบโฮโมโลจัสรีคอมบิเนชันที่มีประสิทธิภาพ[ 9 ] อย่างไรก็ตาม การยูบิควิตินไนเซชันของ NBS1 โดย RNF8 ไม่จำเป็นสำหรับบทบาทของ NBS1 ในกระบวนการซ่อมแซม DNA อื่น ซึ่งก็คือ การซ่อมแซม DNA แบบเชื่อมต่อปลายที่เกิดจากไมโครโฮโมโลจี ซึ่งมีข้อผิดพลาดได้ง่าย[ 9 ]
ดูเหมือนว่า RNF8 จะมีบทบาทอื่นๆ ใน HRR ด้วยเช่นกัน RNF8 ทำหน้าที่เป็นยูบิควิตินไลเกส โดยจะเติมโมโนยูบิควิตินให้กับ γH2AX เพื่อยึดโมเลกุลซ่อมแซม DNA ไว้ที่รอยโรคของ DNA [ 21 ] โดยเฉพาะอย่างยิ่ง กิจกรรมของ RNF8 จำเป็นต่อการดึงดูด BRCA1 สำหรับการซ่อมแซมแบบโฮโมโลจัสรีคอมบิเนชัน[ 22 ]
RNF8 ในกระบวนการเชื่อมต่อปลายที่ไม่เหมือนกัน (Non-Homologous End Joining)
โปรตีน Kuเป็นโปรตีนเชิงซ้อนแบบไดเมอร์ ซึ่งเป็นเฮเทอโรไดเมอร์ของพอลิเปปไทด์ สองชนิด คือKu70และKu80โปรตีน Ku มีโครงสร้างเป็นวงแหวน ขั้นตอนแรกใน การซ่อมแซม DNA แบบเชื่อมต่อปลายที่ไม่เหมือนกันของสายคู่ที่ขาด คือการที่โปรตีน Ku (ที่มีโครงสร้างโปรตีนเป็นวงแหวน) เลื่อนไปบนปลาย แต่ละด้าน ของDNA ที่ขาด โปรตีน Ku สองตัว ตัวหนึ่งอยู่ที่ปลายแต่ละด้านที่ขาด จะจับกันและสร้างสะพาน[ 23 ] [ 24 ] ซึ่งจะปกป้องปลาย DNA และสร้างแพลตฟอร์มสำหรับเอนไซม์ซ่อมแซม DNA ต่อไปให้ทำงาน หลังจากที่ปลายที่ขาดเชื่อมต่อกันแล้ว โปรตีน Ku สองตัวยังคงล้อมรอบ DNA ที่สมบูรณ์แล้วและไม่สามารถเลื่อนออกจากปลายได้อีกต่อไป โปรตีน Ku ต้องถูกกำจัดออกไป มิฉะนั้นจะทำให้เซลล์สูญเสียความสามารถในการอยู่รอด[ 25 ] การกำจัดโปรตีน Ku เกิดขึ้นได้จากการยูบิควิตินของ RNF8 ต่อ Ku80 ทำให้โปรตีน Ku หลุดออกจากวงแหวนโปรตีน Ku [ 26 ]หรือโดย การยูบิควิตินของโปรตีน Ku ที่ได้รับการส่งเสริมโดย NEDD8ทำให้โปรตีน Ku หลุดออกจาก DNA [ 25 ]
RNF8 ในกระบวนการซ่อมแซมแบบตัดนิวคลีโอไทด์
การก่อตัวของไพริมิดีนไดเมอร์ใน DNA ที่เกิดจาก รังสี UVอาจนำไปสู่การตายของเซลล์ได้ เว้นแต่ว่าความเสียหายจะได้รับการซ่อมแซม การซ่อมแซมความเสียหายเหล่านี้ส่วนใหญ่เกิดขึ้นโดยการซ่อมแซมการตัดนิวคลีโอไทด์[ 27 ] หลังจากการฉายรังสี UV แล้ว RNF8 จะถูกดึงดูดไปยังบริเวณที่เกิดความเสียหายของ DNA จากรังสี UV และทำการ ยูบิควิตินให้กับ ฮิสโตน H2A ซึ่งเป็นส่วนประกอบของโครมาตินการตอบสนองเหล่านี้ให้การป้องกันบางส่วนจากการฉายรังสี UV [ 10 ] [ 28 ]
การสร้างอสุจิบกพร่อง
การสร้างสเปิร์ม เป็นกระบวนการที่สเปิร์มถูกสร้างขึ้นจากเซลล์ต้นกำเนิดสเปิร์มโดยผ่านการแบ่งตัวแบบไมโทซิสและไมโอซิสหน้าที่หลักของไมโอซิสคือการซ่อมแซม DNA ของเซลล์สืบพันธุ์แบบโฮโมโลกัส รีคอมบิเนชัน RNF8 มีบทบาทสำคัญในการส่งสัญญาณการมีอยู่ของ DNA สายคู่ที่แตกหัก หนูตัวผู้ที่มียีน RNF8 ถูกตัดออกจะมีการสร้างสเปิร์มที่บกพร่อง เห็นได้ชัดว่าเกิดจากความบกพร่องในการซ่อมแซมแบบโฮโมโลกัสรีคอมบิเนชัน[ 13 ]
ปฏิสัมพันธ์
RNF8 ได้รับการแสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับตัวรับเรตินอยด์ X อัลฟา[ 29 ]
ดูเพิ่มเติม
อ่านเพิ่มเติม
- Maruyama K, Sugano S (ม.ค. 1994). "Oligo-capping: วิธีง่ายๆ ในการแทนที่โครงสร้าง cap ของ mRNA ยูคาริโอตด้วยโอลิโกไรโบนิวคลีโอไทด์" Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (ก.ย. 1996). "การทำให้เป็นมาตรฐานและการลบ: สองแนวทางเพื่ออำนวยความสะดวกในการค้นพบยีน" . Genome Research . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (ตุลาคม 1997). "การสร้างและลักษณะเฉพาะของไลบรารี cDNA ที่อุดมด้วยความยาวเต็มและอุดมด้วยปลาย 5'" Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
- Ito K, Adachi S, Iwakami R, Yasuda H, Muto Y, Seki N, Okano Y (พฤษภาคม 2544). "เอนไซม์ยูบิควิตินคอนจูเกตติ้งของมนุษย์ที่ขยายปลาย N (E2s) เป็นตัวกลางในการยูบิควิตินไนเซชันของ โปรตีนRING-finger, ARA54 และ RNF8"วารสารชีวเคมีแห่งยุโรป 268 ( 9): 2725–32 . doi : 10.1046/j.1432-1327.2001.02169.x . PMID 11322894
- Takano Y, Adachi S, Okuno M, Muto Y, Yoshioka T, Matsushima-Nishiwaki R, Tsurumi H, Ito K, Friedman SL, Moriwaki H, Kojima S, Okano Y (เมษายน 2547). "โปรตีน RING finger, RNF8, มีปฏิสัมพันธ์กับตัวรับเรตินอยด์ X อัลฟาและเพิ่มกิจกรรมกระตุ้นการถอดรหัส"วารสารชีวเคมี 279 ( 18 ): 18926– 34. doi : 10.1074/jbc.M309148200 . PMID 14981089 .
- Lehner B, Sanderson CM (กรกฎาคม 2547). "กรอบปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนสำหรับการย่อยสลาย mRNA ของมนุษย์" . Genome Research . 14 (7): 1315– 23. doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147 . PMID 15231747 .
- เรอัล เจเอฟ, เวนคาเตซาน เค, เฮา ที, ฮิโรซาเนะ-คิชิคาว่า ที, ดริคอต เอ, ลี เอ็น, เบอร์ริซ GF, กิบบอนส์ FD, เดรซ เอ็ม, อายีวี-เกเดฮูสซู เอ็น, คลิตกอร์ด เอ็น, ไซมอน ซี, บ็อกเซม เอ็ม, มิลสไตน์ เอส, โรเซนเบิร์ก เจ, โกลด์เบิร์ก ดีเอส, จาง แอลวี, หว่อง เอสแอล, แฟรงคลิน จี, ลี เอส, อัลบาลา เจเอส, ลิม เจ, ฟราฟตัน C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (ต.ค. 2005) "สู่แผนที่ระดับโปรตีโอมของเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนและโปรตีนของมนุษย์" ธรรมชาติ . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
ลิงก์ภายนอก
- RNF8+โปรตีน+มนุษย์ ที่ หัวข้อทางการ แพทย์ (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ อาร์เอ็นเอฟ8
E3 ยูบิควิติน-โปรตีนไลเกส RNF8 เป็น เอนไซม์ ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีน RNF8 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] RNF8 มีกิจกรรมทั้งในระบบภูมิคุ้มกัน [ 8 ] และในการซ่อมแซม DNA
การทำงาน
โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้มี โมทิฟนิ้ว RING และ โดเมน FHA โปรตีนนี้แสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับ เอนไซม์ยูบิควิตินคอนจูเกตติ้ง คลาส II หลายชนิด (E2) รวมถึง UBE2E1 /UBCH6, UBE2E2 และ UBE2E3 และอาจทำหน้าที่เป็น ยูบิควิตินไลเกส (E3) ในการ ยูบิ ควิตินไนเซชัน...
การปรับโครงสร้างโครมาติน
หลังจากเกิดการแตกหักของสายดีเอ็นเอสองสาย โครมาติน จำเป็นต้อง คลายตัว เพื่อให้สามารถซ่อมแซมดีเอ็นเอได้ ไม่ว่าจะโดย กลไก HRR หรือ NHEJ มีสองเส้นทางที่ทำให้โครมาตินคลายตัว เส้นทางหนึ่งเริ่มต้นโดย PARP1 และอีกเส้นทางหนึ่งเริ่มต้นโดย γH2AX (รูปแบบฟอสโฟรีเลตของ...
RNF8 ในกระบวนการซ่อมแซมแบบโฮโมโลจัสรีคอมบิเนชัน
การตัดปลาย DNA เป็นขั้นตอนสำคัญในการซ่อมแซม HRR ซึ่งสร้างส่วนยื่น 3' ที่เป็นฐานในการดึงดูดโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการซ่อมแซม HRR คอมเพล็กซ์ MRN ซึ่งประกอบด้วย Mre11 , Rad50 และ NBS1 ดำเนินการขั้นตอนเริ่มต้นของการตัดปลายนี้ [ 20 ] RNF8 ทำการยูบิควิตินไนเซชัน...