อ่าน 3 นาที
เซอร์ปิน่า2
สารยับยั้งเปปติเดสเซอรีน กลุ่ม A (อัลฟา-1 แอนติโปรตีเนส แอนติทริปซิน) สมาชิก 2 เป็น โปรตีน ที่ใน มนุษย์ ถูกเข้ารหัสโดย ยีน SERPINA2 สารยับยั้งเปปติเดสเซอ รีน กลุ่ม A สมาชิก 2...
เซอร์ปิน่า2
| เซอร์ปิน่า2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | SERPINA2 , ARGS, ATR, PIL, SERPINA2P, psiATR, ตระกูล serpin A สมาชิก 2 (ยีน/ยีนเทียม) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | GeneCards : SERPINA2 ; OMA : SERPINA2 - ออโธโลจี | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
สารยับยั้งเปปติเดสเซอรีน กลุ่ม A (อัลฟา-1 แอนติโปรตีเนส แอนติทริปซิน) สมาชิก 2เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนSERPINA2 สารยับยั้งเปปติเดสเซอ รีนกลุ่ม A สมาชิก 2 จัดอยู่ในกลุ่มโปรตีนเซอรีนซึ่งมีหน้าที่ยับยั้งโปรตีเอสเซอรีน[ 3 ]
การค้นพบ
SERPINA2 เป็นที่รู้จักในฐานะยีนเทียมเนื่องจากมีโครงสร้างและฟังก์ชันที่คล้ายคลึงกับSERPINA1 มาก ในระหว่างการโคลนยีนอัลฟา 1- แอนติทริ ปซิน พบว่าSERPINA2ไม่มีโปรโมเตอร์แต่มีลำดับยีนที่คล้ายคลึงกับSERPINA1 อย่างมาก [ 4 ]
ตำแหน่งของยีน
SERPINA2ตั้งอยู่ที่ 14q32.13 [ 5 ]
การแสดงออกและตำแหน่งของยีน
การคาดการณ์นอกเซลล์ของ SERPIN และกลุ่มโดเมนทั่วไปแสดงให้เห็นว่าการแปลตำแหน่ง ER ของ SERPINA2 มีแนวโน้มที่จะมากขึ้น โมทีฟ ER ทั่วไปเหล่านี้บ่งชี้ว่าการแปลตำแหน่งของพวกมันมีแนวโน้มที่จะอยู่ใน ER มากที่สุด[ 6 ]
โครงสร้าง
การศึกษาประชากรบ่งชี้ว่ายีนนี้มีลักษณะเป็นโพลีมอร์ฟิกการลบการ กลายพันธุ์ แบบเฟรมชิฟต์และ การกลายพันธุ์ ของรหัสเริ่มต้น ที่สำคัญ (ATG เป็น ATA) พบในประชากรบางกลุ่ม รวมถึงอัลลีลที่สามารถเข้ารหัสโปรตีนที่ทำงานได้ ยีนนี้อาจเป็นยีนเทียมที่กำลังวิวัฒนาการ[ 7 ]จีโนมอ้างอิงมีการกลายพันธุ์ของรหัสเริ่มต้นและมี การลบส่วน ของรหัส แบบจำลองสามมิติของ SERPINA2 ถูกสร้างขึ้นโดยใช้โครงสร้างผลึกในรูปแบบที่ไม่ถูกลบ ซึ่งมีความคล้ายคลึงกับโปรตีน SERPINA1 แบบจำลองนี้ถูกสร้างขึ้นโดยใช้ swissmodel ในEXPASYและแสดงให้เห็นว่า SERPINA2 ยังคงรักษา ลูปศูนย์กลางปฏิกิริยา SERPINซึ่งเข้ากันได้ดีที่สุดกับกิจกรรมการยับยั้งโปรตีเอส ลำดับคอนเซนซัสที่อยู่รอบลูปศูนย์กลางปฏิกิริยามีความแตกต่างกันอย่างมากจนตอนนี้มี โมทีฟทริ ปโตแฟนซารินแทนที่จะเป็น โมทีฟ เมไทโอนีนเซริน[ 6 ]
การทำงาน
ก่อนหน้านี้ SERPINA2ถูกระบุว่าเป็นยีนเทียม อย่างไรก็ตาม เมื่อเร็วๆ นี้มีหลักฐานใหม่ที่ระบุว่าSERPINA2สร้างทรานสคริปต์ที่ใช้งานได้ซึ่งรับผิดชอบในการเข้ารหัสโปรตีนที่อยู่ในเอนโดพลาสมิกเรติคูลัมการศึกษาอย่างละเอียดเกี่ยวกับ ยีน SERPINA2ในกลุ่มชาติพันธุ์ต่างๆ ได้เผยให้เห็นว่าการเพิ่ม ยีน SERPINA2เข้าไปทำให้ เกิดลักษณะ แฮพลอไทป์โดยการลบบางส่วนซึ่งมีรูปแบบที่บ่งชี้ถึงการคัดเลือกเชิงบวกของการสูญเสียการทำงานของโปรตีน SERPINA2 [ 5 ]
การศึกษา SERPINA2 แสดงให้เห็นผลลัพธ์ที่แตกต่างกันเกี่ยวกับขอบเขตของการเสื่อมสภาพของลำดับที่อาจเกิดขึ้นได้[ 7 ] Bao et al. (1988) อธิบายในการศึกษาของเขาว่าลำดับที่มีไซต์การตัดต่อ RNAถูกเก็บรักษาไว้ใน SERPINA2 และเมื่อแสดงออก มันจะเข้ารหัสโปรตีนหลั่งใหม่ (SERPIN) ที่มีความจำเพาะต่อสารตั้งต้นที่แตกต่างกัน การศึกษาเหล่านี้เกี่ยวกับ SERPINA2 ในมนุษย์สรุปได้ว่าการคัดเลือกเชิงบวกเมื่อเร็ว ๆ นี้ได้รับการสนับสนุนจากการสูญเสียการทำงานของ SERPINA2 และการเกิดยีนเทียม[ 8 ] ยีนSERPINA2 ส่วนใหญ่แสดงออกใน เม็ดเลือดขาวและอัณฑะซึ่งทำให้มีการแสดงออกที่เหลืออยู่ในตับ SERPINA2 มีความเชื่อมโยงกับกระบวนการปรับตัวที่กำลังดำเนินอยู่ซึ่งเชื่อมโยงกับข้อได้เปรียบในบทบาทของความอุดมสมบูรณ์และการโต้ตอบระหว่าง โฮสต์ กับเชื้อโรค[ 6 ]
การกลายพันธุ์
การกลายพันธุ์ที่สำคัญในโคดอนเริ่มต้นและการลบ 2kb เหนือเอ็กซอน IV และส่วนหนึ่งของเอ็กซอน V การลบในโคดอนเริ่มต้นนี้เกิดขึ้นที่ความถี่ 30% [ 4 ]การศึกษาเกี่ยวกับSERPINA2 ในหลอดทดลองและในร่างกายแสดงให้เห็นว่ามันแสดงโปรตีนที่เสถียรที่มีการไกลโคซิเลชัน แบบ n-linked โดยมีน้ำหนักโมเลกุล 52kDa และเข้ากันได้กับ SERPIN ทั่วไป[ 6 ]
โรคที่เกี่ยวข้อง
SERPINA2 เป็นสมาชิกของตระกูล SERPIN ซึ่งเป็นที่รู้จักในฐานะยีนที่เข้ารหัสโปรตีน โรคที่เกี่ยวข้องกับยีนนี้คือโรคถุงลมโป่งพองเนื่องจากการขาดโปรตีน aat SERPINA2 มีฟังก์ชันคล้ายกับ SERPINA1 และเกี่ยวข้องกับฟังก์ชันของกิจกรรมยับยั้งเปปติเดสชนิดเซริน[ 9 ]
อ่านเพิ่มเติม
- Merkel PA, Xie G, Monach PA, Ji X, Ciavatta DJ (พฤษภาคม 2017). "การระบุโพลีมอร์ฟิซึมเชิงฟังก์ชันและการแสดงออกที่เกี่ยวข้องกับความเสี่ยงต่อโรคหลอดเลือดอักเสบที่เกี่ยวข้องกับแอนติบอดีต่อต้านนิวโทรฟิลไซโตพลาสมิก" . โรคข้ออักเสบและรูมาโตวิทยา . 69 (5). โฮโบเคน, นิวเจอร์ซีย์: 1054– 1066. doi : 10.1002/art.40034 . PMC 5434905 . PMID 28029757 .
- Namciu SJ, Friedman RD, Marsden MD, Sarausad LM, Jasoni CL, Fournier RE (มีนาคม 2547). "การจัดเรียงลำดับและบริเวณยึดเกาะเมทริกซ์ของกลุ่มยีนยับยั้งเซรินโปรตีเอสของมนุษย์ที่ 14q32.1" Mammalian Genome . 15 (3): 162– 178. doi : 10.1007/s00335-003-2311-y . PMID 15014966 . S2CID 8594824 .
- Rollini P, Fournier RE (ธันวาคม 1997). "การเชื่อมโยงระดับโมเลกุลของยีนอัลฟา 1-แอนติทริปซินและคอร์ติโคสเตียรอยด์-ไบน์ดิงโกลบูลินของมนุษย์บนโครโมโซม 14q32.1" Mammalian Genome . 8 (12): 913– 916. doi : 10.1007/s003359900610 . PMID 9383284 . S2CID 25123395 .
- Gettins PG, Olson ST (สิงหาคม 2016). "เซอร์พินยับยั้ง ข้อมูลเชิงลึกใหม่เกี่ยวกับการพับตัว การเกิดพอลิเมอไรเซชัน การควบคุม และการกำจัด"วารสารชีวเคมี 473 ( 15): 2273– 2293. doi : 10.1042/bcj20160014 . PMC 5266585 . PMID 27470592 .
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เซอร์ปิน่า2
สารยับยั้งเปปติเดสเซอรีน กลุ่ม A (อัลฟา-1 แอนติโปรตีเนส แอนติทริปซิน) สมาชิก 2 เป็น โปรตีน ที่ใน มนุษย์ ถูกเข้ารหัสโดย ยีน SERPINA2 สารยับยั้งเปปติเดสเซอ รีน กลุ่ม A สมาชิก 2...
การค้นพบ
SERPINA2 เป็นที่รู้จักในฐานะ ยีนเทียม เนื่องจากมีโครงสร้างและฟังก์ชันที่คล้ายคลึงกับ SERPINA1 มาก ในระหว่างการโคลนยีนอัลฟา 1- แอนติทริ ปซิน พบว่า SERPINA2 ไม่มี โปรโมเตอร์ แต่มี ลำดับ ยีน ที่คล้ายคลึง กับ SERPINA1 อย่างมาก [ 4 ]
การแสดงออกและตำแหน่งของยีน
การคาดการณ์นอกเซลล์ของ SERPIN และกลุ่มโดเมนทั่วไปแสดงให้เห็นว่าการแปลตำแหน่ง ER ของ SERPINA2 มีแนวโน้มที่จะมากขึ้น โมทีฟ ER ทั่วไปเหล่านี้บ่งชี้ว่าการแปลตำแหน่งของพวกมันมีแนวโน้มที่จะอยู่ใน ER มากที่สุด [ 6 ]
โครงสร้าง
การศึกษาประชากรบ่งชี้ว่ายีนนี้มีลักษณะ เป็นโพลีมอร์ฟิก การลบ การ กลายพันธุ์ แบบเฟรมชิฟต์ และ การกลายพันธุ์ ของรหัสเริ่มต้น ที่สำคัญ (ATG เป็น ATA) พบในประชากรบางกลุ่ม รวมถึง อัลลีล ที่สามารถเข้ารหัสโปรตีนที่ทำงานได้ ยีนนี้อาจเป็นยีนเทียมที่กำลังวิวัฒนาการ [ 7...