SLX4IP
โปรตีนที่ทำปฏิกิริยากับ SLX4คือโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีน SLX4IP [ 5 ]
การทำงาน
โปรตีนที่ทำปฏิกิริยากับ SLX4 (SLX4IP) มีอยู่ใน รูปแบบ โมโนเมอร์และทำปฏิกิริยากับ คอมเพล็กซ์มัลติโปรตีน SLX4 - XPF - ERCC1ซึ่งมีหน้าที่ในการประกอบHolliday junction resolvaseในบทบาทของการซ่อมแซมและบำรุงรักษา DNA [ 6 ]
SLX4IP ได้รับการพิสูจน์แล้วว่ามีปฏิสัมพันธ์โดยตรงกับ ปลาย N-terminalของ โปรตีน SLX4ซึ่งมีบทบาทในการประสานงานของเอนโดนิวคลีเอสที่เฉพาะเจาะจงกับโครงสร้าง DNA ที่แตกต่างกันหลายชนิด[ 7 ]
นอกจากนี้ ยังพบว่า SLX4IP มีส่วนเกี่ยวข้องในการควบคุมการยืดเทโลเมียร์ แบบทางเลือก โดยผ่านการสะสมและการโต้ตอบกับโปรตีนSLX4 , BLMและXPF [ 8 ]
ตำแหน่งและการแสดงออก
ยีน SLX4IP ตั้งอยู่บนแขนสั้น (p) ของโครโมโซม 20ที่ตำแหน่ง 12.2 (20p12.2) [ 9 ]ยีน SLX4IP ของมนุษย์ประกอบด้วยเอ็กซอน 14 เอ็กซอนโดย cDNA มีความยาว 204,000 คู่เบสเรียงตัวอยู่บนสายบวก[ 9 ]ซึ่งเข้ารหัสโปรตีนที่มีกรดอะมิโน 408 ตัว และมีมวลโมเลกุล 45,552 ดาลตัน[ 10 ]
พบว่าโฮโมล็อก ของยีน SLX4IP ได้รับการอนุรักษ์ไว้ในสิ่งมีชีวิตที่ไม่ใช่มนุษย์หลายชนิด รวมถึงหนู หนูแรต กบ ไก่ สุนัข ลิงรีซัส และชิมแปนซี [ 11 ] นอกจากนี้ยังพบออร์โธล็อก ของยีน SLX4IP ของมนุษย์ในสิ่งมีชีวิตอื่นๆ อีก 283 ชนิด [ 11 ]
โปรตีน SLX4IP มีการแสดงออกในระดับสูงสุดในผิวหนังและอัณฑะ รวมถึงมีการแสดงออกในเนื้อเยื่ออื่นๆ อีก 26 ชนิด[ 12 ]
ความสำคัญทางคลินิก
มะเร็ง
มะเร็งเม็ดเลือดขาวชนิดลิมโฟบลาสติกเฉียบพลัน
การลบแบบโซมาติกและโมโนอัลลีลิกของบริเวณ 5' ของ SLX4IP พบว่าเกิดขึ้นในผู้ป่วยโรคมะเร็งเม็ดเลือดขาวชนิดเฉียบพลัน ในเด็ก (ALL) ร้อยละ 30 และในกรณีของ โรคมะเร็งเม็ดเลือดขาวชนิดเฉียบพลันที่มีการจัดเรียง ETV6 / RUNX1ใหม่ พบการลบในมากกว่าร้อยละ 60 ของกรณี[ 13 ]โดยการวิเคราะห์จุดแตกหักของ SLX4IP พบว่ามีการรวมตัวใหม่แบบV(D)J ที่ไม่ถูกต้องตามลักษณะเฉพาะ [ 13 ]พบว่าการลบเหล่านี้มีแนวโน้มไปทางเพศชายอย่างมีนัยสำคัญ[ 13 ]
การยืดเทโลเมียร์แบบทางเลือก
เพื่อให้เซลล์มะเร็งสามารถคงความสามารถในการแพร่กระจายได้อย่างไม่จำกัด พวกมันสามารถควบคุมเทโลเมียร์ของโครโมโซมได้โดยการรวมตัวใหม่ผ่านกระบวนการที่เรียกว่าการยืดเทโลเมียร์แบบทางเลือก (ALT) [ 14 ]การรวมตัวใหม่นี้แสดงให้เห็นว่าต้องอาศัยการสะสมของ SLX4IP ที่เทโลเมียร์ ALT เนื่องจากการต่อต้านกิจกรรมBLM ที่ไม่จำเพาะเจาะจง [ 8 ] BLM มีหน้าที่ในการขยายเทโลเมียร์เนื่องจากเป็น เฮลิเคส RecQที่สำคัญต่อการรวมตัวแบบโฮโมโลจัสและการจำลองดีเอ็นเอ[ 15 ]
การซ่อมแซมการเชื่อมโยงข้ามระหว่างสาย
ใน DNA การเชื่อมโยงข้ามสาย (ICLs) จำเป็นต้องได้รับการซ่อมแซมเนื่องจากมีความเป็นพิษสูง ซึ่งมักนำไปสู่โรคต่างๆ เช่นโรคโลหิตจางแฟนโคนี[ 16 ] SLX4IP มีบทบาทในฟังก์ชันการซ่อมแซม ICL ของคอมเพล็กซ์ SLX4-XPF-ERCC1 เนื่องจากการจับพร้อมกันของทั้ง SLX4 และ XPF-ERCC1 ซึ่งรักษาเสถียรภาพของคอมเพล็กซ์และส่งเสริมการโต้ตอบระหว่างบริเวณ SLX4 และ XPF-ERCC1 [ 6 ] [ 17 ]เมื่อ SLX4IP ถูกกำจัดออกจากเซลล์ที่ได้รับการรักษา พบว่ามีการสะสมในระยะ G2/M ของวงจรเซลล์ ซึ่งเป็นระยะที่การแก้ไขจุดเชื่อมต่อชั่วคราวระหว่างการซ่อมแซม ICL เกิดขึ้นเป็นประจำ[ 17 ] [ 18 ]
เอชไอวี-1
โปรตีนเสริมVpr ของ HIV-1สามารถหยุดการดำเนินไปของเซลล์เจ้าบ้านผ่านวงจรธรรมชาติได้อย่างมีประสิทธิภาพในระยะเปลี่ยน ผ่าน G2/M [ 19 ]พบว่าการหยุดชะงักนี้เกิดจากการกระตุ้นก่อนกำหนดของคอมเพล็กซ์เอนโดนิวคลีเอส เฉพาะโครงสร้าง SLX4 ซึ่ง SLX4IP มีปฏิสัมพันธ์โดยตรงด้วย[ 20 ]จากการวิจัยนี้ยังพบว่าคอมเพล็กซ์ SLX4 มีส่วนเกี่ยวข้องกับการควบคุมภูมิคุ้มกันโดยกำเนิด เนื่องจากมีการควบคุมเชิงลบของ การผลิต อินเตอร์เฟรอนชนิดที่ 1ทั้งเมื่อถูกกระตุ้นโดยธรรมชาติและโดย HIV-1 [ 20 ]
อ่านเพิ่มเติม
- Svendsen JM, Smogorzewska A, Sowa ME, O'Connell BC, Gygi SP, Elledge SJ, Harper JW (กรกฎาคม 2552). "BTTBD12/SLX4 ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมประกอบเป็น Holliday junction resolvase และจำเป็นสำหรับการซ่อมแซม DNA" . Cell . 138 (1): 63– 77. doi : 10.1016/j.cell.2009.06.030 . PMC 2720686 . PMID 19596235 .
- Ghosal G, Leung JW, Nair BC, Fong KW, Chen J (ตุลาคม 2012). "โปรตีนที่จับกับแอนติเจนของนิวเคลียสเซลล์ที่กำลังแบ่งตัว (PCNA) C1orf124 เป็นตัวควบคุมการสังเคราะห์แบบข้ามรอยโรค"วารสารเคมีชีวภาพ 287 (41): 34225– 33. doi : 10.1074 /jbc.M112.400135 . PMC 3464530 . PMID 22902628 .
- Warnatz HJ, Schmidt D, Manke T, Piccini I, Sultan M, Borodina T และ คณะ (กรกฎาคม 2554) "ยีนเป้าหมาย BTB และ CNC homology 1 (BACH1) มีส่วนเกี่ยวข้องกับการตอบสนองต่อความเครียดออกซิเดชันและการควบคุมวงจรเซลล์"วารสารชีวเคมี 286 ( 26 ): 23521– 32. doi : 10.1074/jbc.M111.220178 . PMC 3123115 . PMID 21555518 .