โปรตีนสเคลอแร็กซิส เป็นสมาชิกของซูเปอร์แฟมิลีเบสิกเฮลิกซ์-ลูป-เฮลิกซ์ ( bHLH) ของปัจจัยการถอดรหัส^{[ 1 ]} ปัจจุบันมีการระบุยีนสองยีน ( SCXAและSCXBตามลำดับ) ที่เข้ารหัสโปรตีนสเคลอแร็กซิสที่เหมือนกัน

เชื่อกันว่าเซลล์ต้นกำเนิด ที่แสดงออกถึงสเคลอแรกเริ่ม จะนำไปสู่การก่อตัวของเนื้อเยื่อเอ็น และจุดยึดกล้ามเนื้ออื่นๆ ในที่สุด ^{[ 1 ]} สเคลอแรกซิสมีส่วนเกี่ยวข้องกับ การก่อตัวของ มีโซเดอร์มและแสดงออกในซินเดโทม (กลุ่มของเนื้อเยื่อตัวอ่อนที่พัฒนาไปเป็นเอ็นและหลอดเลือด) ของโซไมต์ ที่กำลังพัฒนา (ส่วนดั้งเดิมหรือช่องของตัวอ่อน) ^{[ 2 ]}

ตำแหน่งของซินเดโทมภายในโซไมต์ถูกกำหนดโดยFGFที่หลั่งออกมาจากศูนย์กลางของไมโอโทม (กลุ่มเนื้อเยื่อตัวอ่อนที่พัฒนาเป็นกล้ามเนื้อโครงร่าง ) จากนั้น FGF จะกระตุ้นให้ สเคลอโรโทม ด้านหน้าและด้านหลัง ที่อยู่ติดกัน (กลุ่มเนื้อเยื่อตัวอ่อนที่พัฒนาเป็นโครงกระดูกแกนกลาง ) กลายเป็นเซลล์เอ็น ซึ่งในที่สุดจะทำให้เซลล์ที่แสดงสเคลอแรกซิสในอนาคตอยู่ระหว่างเนื้อเยื่อสองประเภทที่พวกมันจะเชื่อมต่อกันในที่สุด^{[ 3 ]}

การแสดงออกของสเคลอแร็กซิสจะพบได้ทั่วทั้งสเคลอโรโทม (แทนที่จะเป็นเพียงสเคลอแร็กซิสที่อยู่ด้านหน้าและด้านหลังของไมโอโทมโดยตรง) เมื่อมีการแสดงออกของFGF8มากเกินไป ซึ่งแสดงให้เห็นว่าเซลล์สเคลอแร็กซิสทั้งหมดสามารถแสดงออกสเคลอแร็กซิสได้เมื่อตอบสนองต่อสัญญาณ FGF แม้ว่าปฏิสัมพันธ์ของ FGF จะแสดงให้เห็นว่าจำเป็นสำหรับการแสดงออกของสเคลอแร็กซิส แต่ก็ยังไม่ชัดเจนว่าเส้นทางการส่งสัญญาณ FGF กระตุ้นให้ซินเดโทมหลั่งสเคลอแร็กซิสโดยตรงหรือโดยอ้อมผ่านเส้นทางการส่งสัญญาณรอง เป็นไปได้มากที่สุดว่าเซลล์ซินเดโทมสามารถกำหนดตำแหน่งของตนเองได้อย่างแม่นยำและเริ่มแสดงออกสเคลอแร็กซิสได้โดยการอ่านความเข้มข้น ของ FGF อย่างระมัดระวัง (ที่มาจากไมโอโทม) ^{[ 3 ]}การพัฒนาของตัวอ่อนส่วนใหญ่เป็นไปตามแบบจำลองนี้ของการเหนี่ยวนำชะตากรรมของเซลล์เฉพาะผ่านการอ่านการไล่ระดับความเข้มข้นของโมเลกุลส่งสัญญาณโดยรอบ

ปัจจัยการถอดรหัส bHLH ได้รับการพิสูจน์แล้วว่ามีหน้าที่หลากหลายในกระบวนการพัฒนา^{[ 4 ]}โดยเฉพาะอย่างยิ่ง มีบทบาทสำคัญในการควบคุมการแบ่งเซลล์การแพร่กระจายและการควบคุมการเกิดมะเร็ง^{[ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]}จนถึงปัจจุบัน มีการรายงานโปรตีน ยูคาริโอต 242 ชนิด ที่อยู่ในกลุ่ม HLH superfamily ซึ่งมีรูปแบบการแสดงออกที่หลากหลายในยูคาริโอตทั้งหมดตั้งแต่ยีสต์ไปจนถึงมนุษย์^{[ 7 ]}

ในด้านโครงสร้าง โปรตีน bHLH มีลักษณะเฉพาะคือ “โดเมนที่มีการอนุรักษ์สูงซึ่งประกอบด้วยกรดอะมิโน พื้นฐานที่เรียง ตัวอยู่ติดกับเกลียวอัลฟาแอมฟิพาติก สองอัน ที่คั่นด้วยลูป” ^{[ 8 ] [ 9 ]}

เกลียวเหล่านี้มีคุณสมบัติการทำงานที่สำคัญ โดยเป็นส่วนหนึ่งของโดเมนการจับกับ DNA และการกระตุ้นการถอดรหัส ในส่วนของสเคลอแรกซิส บริเวณ bHLH ครอบคลุมกรดอะมิโนลำดับที่ 78 ถึง 131 นอกจากนี้ยังคาดการณ์ว่าบริเวณที่อุดมไปด้วยโพรลีนจะอยู่ระหว่างกรดอะมิโนลำดับที่ 161–170 ส่วนของกรดอะมิโนพื้นฐานซึ่งช่วยในการจับกับ DNA พบอยู่ใกล้กับปลาย N-terminal ของสเคลอแรกซิส^{[ 1 ] [ 10 ]}

โปรตีน HLH ที่ขาดโดเมนพื้นฐานนี้ได้รับการแสดงให้เห็นว่าควบคุมกิจกรรมของโปรตีน bHLH ในเชิงลบและเรียกว่าสารยับยั้งการแยกแยะ (Id) ^{[ 11 ]}โปรตีน HLH พื้นฐานทำงานตามปกติในรูปของไดเมอร์และจับกับลำดับ DNA เฮกซานิวคลีโอไทด์เฉพาะ (CAANTG) ที่รู้จักกันในชื่อE-boxจึงเปิดการแสดงออกของยีนต่างๆ ที่เกี่ยวข้องกับการพัฒนาและการอยู่รอดของเซลล์