ในวิทยาศาสตร์พืชสเปิร์โมสเฟียร์คือบริเวณรอบเมล็ดซึ่งดิน จุลินทรีย์ และเมล็ดที่กำลังงอกมีปฏิสัมพันธ์กัน^{[ 1 ]}บริเวณนี้เป็นพื้นที่เล็ก ๆ โดยทั่วไปอยู่ห่างจากเมล็ด 1–10 มม. แต่จะแตกต่างกันไปตามชนิดของเมล็ด ความหลากหลายของจุลินทรีย์ ในดิน ระดับความชื้นในดิน และปัจจัยอื่น ๆ^{[ 2 ]}

ภายในสเปิร์มโมสเฟียร์ มีปฏิสัมพันธ์ที่ซับซ้อนเกิดขึ้นระหว่างเมล็ดที่กำลังงอก ดิน และจุลินทรีย์^{[ 3 ] [ 1 ]} เนื่องจากการงอกเป็นกระบวนการที่สั้น สเปิร์มโมสเฟียร์จึงเกิดขึ้นชั่วคราว แต่ผลกระทบของกิจกรรมจุลินทรีย์ภายในส เปิร์มโมสเฟียร์สามารถส่งผลกระทบอย่างรุนแรงและยาวนานต่อพืชที่กำลังพัฒนา^{[ 3 ]}สเปิร์มโมสเฟียร์ยังสามารถส่งผลกระทบต่อการจัดการความเครียดระหว่างการงอกได้ ดังที่เห็นได้จาก สายพันธุ์ Bacillusและต้นถั่วลิสง^{[ 4 ]}

เมล็ดพืชปล่อยโมเลกุลต่างๆ ที่มีอิทธิพลต่อชุมชนจุลินทรีย์โดยรอบ ทั้งยับยั้งหรือกระตุ้นการเจริญเติบโต^{[ 1 ] [ 3 ]}องค์ประกอบของสารที่ปล่อยออกมาจะแตกต่างกันไปตามชนิดของพืชและคุณสมบัติของดิน เช่นค่า pHและปริมาณความชื้น ชนิดของดินมีความสำคัญมากกว่าชนิดของเมล็ดพืช โดยเฉพาะดินที่มีปริมาณอินทรียวัตถุสูง^{[ 5 ]}

ด้วยผลกระทบทางชีวเคมีเหล่านี้ สเปิร์โมสเฟียร์จึงพัฒนาทั้งลงล่าง—เพื่อสร้างไรโซสเฟียร์ (เมื่อ รากของพืชงอกออกมา) ^{[ 3 ]} —และขึ้นบนเพื่อสร้างไลโมสเฟียร์ซึ่งเป็นดินที่ล้อมรอบลำต้น ของ พืชที่ กำลังเติบโต และฟิลโลสเฟียร์ซึ่งเป็นชุมชนจุลินทรีย์บนส่วนของพืชที่อยู่เหนือดิน โดยเฉพาะอย่างยิ่ง จุลินทรีย์ในดอกสามารถมีบทบาทในองค์ประกอบของสเปิร์โมสเฟียร์ เช่นในพืชเช่นข้าวสาลี^{[ 6 ]}องุ่น^{[ 7 ]}และข้าว^{[ 8 ]}เมื่อเมล็ดงอก หน้าที่ของชุมชนจุลินทรีย์จะเปลี่ยนแปลงไปมากกว่าองค์ประกอบ^{[ 5 ]}

สเปิร์มโมสเฟียร์ยังทำหน้าที่เป็นตัวควบคุมทางชีวภาพสำหรับเมล็ดที่กำลังงอก ซึ่งหมายความว่าจุลินทรีย์ที่เป็นประโยชน์บางชนิดสามารถปกป้องเมล็ดจากเชื้อโรคพืชได้ เชื้อโรคพืชหลายชนิด เช่นFusariumและPythium ultimumสามารถเข้ายึดครองเมล็ดที่กำลังงอกใหม่ได้ภายในไม่กี่ชั่วโมงหลังการปลูก^{[ 9 ]}เมล็ดสามารถปล่อยโมเลกุลและสารอาหารที่ดึงดูดจุลินทรีย์ที่เป็นประโยชน์ไปยังสเปิร์มโมสเฟียร์ ซึ่งจะช่วยป้องกันการเข้ายึดครองของเชื้อโรค^{[ 5 ]}มีการวิจัยเฉพาะในด้านนี้กับเมล็ดฝ้าย โดยเมล็ดฝ้ายถูกเคลือบด้วยแบคทีเรียที่เป็นประโยชน์ ซึ่งป้องกันไม่ให้เมล็ดติดเชื้อPythium ultimum ^{[ 10 ]}