เมื่อ TSA อยู่ภายใต้กระทรวงคมนาคมหัวหน้าหน่วยงานจะถูกเรียกว่า ปลัดกระทรวงคมนาคมฝ่ายความมั่นคง หลังจากที่ย้ายไปอยู่ภายใต้กระทรวงความมั่นคงแห่งชาติในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2546 ตำแหน่งนี้จึงถูกจัดประเภทใหม่เป็น ผู้บริหารสำนักงานบริหารความปลอดภัยด้านการขนส่ง (Transportation Security Administration)

ตลอดระยะเวลา 23 ปีที่ผ่านมา หน่วยงาน TSA มีผู้ดำรงตำแหน่งผู้บริหาร 7 คน และผู้รักษาการผู้บริหาร 6 คน หลายคนเข้ารับตำแหน่งหลังจากเคยดำรงตำแหน่งนายทหารชั้นประทวน ของหน่วยยามฝั่งมาก่อน รวมถึง ลอย เนฟเฟนเจอร์ และเปโคสเก

หลังจากการผ่านร่างพระราชบัญญัติการอนุมัติใหม่ของ FAA ปี 2018ซึ่งรวมถึงบทบัญญัติที่รู้จักกันในชื่อพระราชบัญญัติการปรับปรุง TSA ให้ทันสมัย ​​วาระของผู้บริหารถูกกำหนดให้เป็นวาระห้าปีโดยมีผลย้อนหลังไปถึงจุดเริ่มต้นของวาระของผู้บริหารคนปัจจุบัน David Pekoske นอกจากนี้ยังทำให้ตำแหน่งรองผู้บริหารเป็นตำแหน่งที่ได้รับการแต่งตั้งทางการเมือง^{[ 14 ]}

#	รูปภาพ	ชื่อ	ระยะเวลา	หมายเหตุ
1		จอห์น แมกาว	28 มกราคม 2545 – 18 กรกฎาคม 2545	รัฐมนตรีช่วยว่าการกระทรวงคมนาคมฝ่ายความมั่นคง
2		เจมส์ ลอย	19 กรกฎาคม 2545 – 7 ธันวาคม 2546	ดำรงตำแหน่งปลัดกระทรวงคมนาคมด้านความมั่นคง จนกว่าจะมีการเปลี่ยนผ่านไปสู่กระทรวงความมั่นคงแห่งชาติ
3		เดวิด เอ็ม. สโตน	8 ธันวาคม 2546 – ​​3 มิถุนายน 2548	ปฏิบัติหน้าที่จนถึงเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2547 เมื่อได้รับการยืนยันจากวุฒิสภาสหรัฐอเมริกา[ 15 ]
—		เคนเนธ คาสปริซิน	4 มิถุนายน 2548 – 26 กรกฎาคม 2548	การแสดง[ 16 ] [ 17 ]
4		คิป ฮอว์ลีย์	27 กรกฎาคม 2548 – 20 มกราคม 2552
—		เกล รอสไซด์ส	20 มกราคม 2552 – 24 มิถุนายน 2553	การแสดง
5		จอห์น เอส. พิสโทล	25 มิถุนายน 2553 – 31 ธันวาคม 2557
—		เมลวิน เจ. คาร์ราเวย์	1 มกราคม 2558 – 1 มิถุนายน 2558	รักษาการ มอบหมายให้ไปที่สำนักงานบังคับใช้กฎหมายของรัฐและท้องถิ่นของ DHS หลังจากการรั่วไหลของ ผลการทดสอบ ทีมสีแดงของ ผู้ตรวจราชการ DHS ที่แสดงให้เห็นถึงความล้มเหลวในการคัดกรองที่จุดตรวจ TSA [ 18 ] [ 19 ]
—		มาร์ค แฮทฟิลด์ จูเนียร์	1 มิถุนายน 2558 – 4 มิถุนายน 2558	การแสดง[ 18 ]
—		ฟรานซิส เอ็กซ์. เทย์เลอร์	4 มิถุนายน 2558 – 3 กรกฎาคม 2558	ดำรงตำแหน่งรักษาการและควบคู่กันไปในตำแหน่งรองปลัดกระทรวงความมั่นคงแห่งมาตุภูมิฝ่ายข่าวกรองและการวิเคราะห์
6		ปีเตอร์ วี. เนฟเฟนเจอร์	4 กรกฎาคม 2558 – 20 มกราคม 2560
—		ฮูบัน เอ. โกวาเดีย	20 มกราคม 2560 – 10 สิงหาคม 2560	การแสดง
7		เดวิด เปโคสเก	10 สิงหาคม 2560 – 20 มกราคม 2568 [ 20 ]	ปฏิบัติหน้าที่ควบคู่กันไปในตำแหน่งรองเลขาธิการกระทรวงความมั่นคงแห่งชาติตั้งแต่วันที่ 11 เมษายน ถึง 13 พฤศจิกายน 2019 โดยมอบหมายการดำเนินงานประจำวันให้แก่รองผู้บริหารรักษาการ แพทริเซีย ค็อกสเวลล์[ 21 ]ปฏิบัติหน้าที่ควบคู่กันไปในตำแหน่งเลขาธิการกระทรวงความมั่นคงแห่งชาติตั้งแต่วันที่ 20 มกราคม 2021 จนกระทั่งอเลฮานโดร มายอร์กัสได้รับการยืนยันจากวุฒิสภา[ 22 ]ในขณะที่ดำรงตำแหน่งเลขาธิการรักษาการ TSA อยู่ภายใต้การดูแลของผู้ช่วยผู้บริหารฝ่ายปฏิบัติการด้านความปลอดภัย ดาร์บี ลาจอย[ 23 ] [ 24 ]ถูกปลดออกจากตำแหน่งโดยประธานาธิบดีโดนัลด์ ทรัมป์ เมื่อวันที่ 20 มกราคม 2025
—		เมลานี ฮาร์วีย์	20 มกราคม 2025 – 18 กุมภาพันธ์ 2025	การแสดง[ 25 ] [ 26 ]
—		อดัม สตาล	18 กุมภาพันธ์ 2568 – 21 เมษายน 2568	การแสดง[ 27 ]
—		ฮา เหงียน แม็คนีลล์	21 เมษายน 2568 – ปัจจุบัน	การแสดง[ 1 ]

หัวหน้าของ TSA คือผู้บริหารสูงสุดซึ่งเป็นผู้นำความพยายามขององค์กรในการรักษาความปลอดภัยสนามบิน ทางรถไฟ ท่าเรือ และโครงสร้างพื้นฐานด้านการขนส่งที่สำคัญอื่น ๆ ของประเทศ ผู้ช่วยผู้บริหารสูงสุดคือรองผู้บริหารสูงสุด ซึ่งมีบทบาทในการให้การสนับสนุนและคำแนะนำในการดำเนินภารกิจของหน่วยงาน นอกจากนี้ TSA ยังได้รับประโยชน์จากความเชี่ยวชาญและภาวะผู้นำของรองผู้ช่วยผู้บริหารสูงสุดและเจ้าหน้าที่บริหารอื่น ๆ ซึ่งมีส่วนร่วมในด้านต่าง ๆ ของการดำเนินงานของหน่วยงานด้วยความรู้และทักษะ ทีมผู้นำที่มีโครงสร้างนี้เป็นแกนหลักของ TSA ทำงานร่วมกันเพื่อรักษาและยกระดับความปลอดภัยของเครือข่ายการขนส่งของประเทศ ผู้ช่วยผู้บริหารสูงสุดฝ่ายบังคับใช้กฎหมายยังดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการบริหารของสำนักงานผู้รักษาความปลอดภัยทางอากาศแห่งสหรัฐอเมริกาด้วย

สำนักงานใหญ่^{[ 28 ]}

• ผู้บริหารของ TSA
• รองผู้บริหาร
  • หัวหน้าคณะเจ้าหน้าที่
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายกิจการนิติบัญญัติ
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายสื่อสารเชิงกลยุทธ์และกิจการสาธารณะ
  • ผู้ช่วยผู้บริหารฝ่ายธุรการ ด้านการบังคับใช้กฎหมาย
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร หน่วยงานรักษาความปลอดภัยทางอากาศของรัฐบาลกลาง
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายสืบสวน
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายรักษาความปลอดภัยและการจัดการปฏิบัติการ
  • ผู้ช่วยผู้บริหารฝ่ายสนับสนุนภารกิจ
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายทำสัญญาและการจัดซื้อจัดจ้าง
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายทรัพยากรบุคคล
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายสิ่งอำนวยความสะดวกและการบริหาร
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายตรวจสอบ
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายฝึกอบรมและพัฒนา
  • ผู้ช่วยผู้บริหารฝ่ายปฏิบัติการด้านความปลอดภัย
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายปฏิบัติตามกฎระเบียบ
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายปฏิบัติการการบินภายในประเทศ
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายปฏิบัติการระหว่างประเทศ
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายจัดการปฏิบัติการ
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายปฏิบัติการภาคพื้นดิน
  • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายเทคโนโลยีและระบบ
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายเทคโนโลยีสารสนเทศ
    • ผู้ช่วยผู้ดูแลระบบ ฝ่ายความสามารถด้านความปลอดภัย
    • ผู้ช่วยผู้ดูแลระบบ โปรแกรม Trusted Traveler และการออกใบอนุญาต
    • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายปฏิบัติการตรวจสอบประวัติ
  • หัวหน้าฝ่ายกฎหมาย
  • ผู้ช่วยผู้บริหาร/หัวหน้าฝ่ายการเงิน, สำนักงานหัวหน้าฝ่ายการเงิน
  • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายสิทธิพลเมืองและเสรีภาพ ผู้ตรวจการแผ่นดิน และการมีส่วนร่วมของผู้เดินทาง
  • ผู้ช่วยผู้บริหารฝ่ายข่าวกรอง
  • ผู้ช่วยผู้บริหาร ฝ่ายกลยุทธ์ นโยบาย และการมีส่วนร่วม
  • ผู้อำนวยการบริหาร โครงการปรับปรุงระบบ TSA ให้ทันสมัย

การบริหารส่วนภูมิภาค

• ผู้อำนวยการฝ่ายพื้นผิวระดับภูมิภาค (RSD)

การบริหารจัดการระดับศูนย์กลางหรือสนามบินประเภท X

• ผู้อำนวยการฝ่ายความมั่นคงแห่งรัฐบาลกลาง (FSD)
• รองผู้อำนวยการฝ่ายความมั่นคงแห่งสหพันธรัฐ (DFSD)
  • ผู้ช่วยผู้อำนวยการฝ่ายความมั่นคงแห่งรัฐบาลกลางด้านการสนับสนุนภารกิจ (AFSD-MS)
  • ผู้ช่วยผู้อำนวยการฝ่ายความปลอดภัยแห่งรัฐบาลกลางด้านการคัดกรอง (AFSD-S)
  • ผู้ช่วยผู้อำนวยการฝ่ายความมั่นคงแห่งรัฐบาลกลางด้านการตรวจสอบ (AFSD-I)
  • ผู้ช่วยผู้อำนวยการฝ่ายความมั่นคงแห่งรัฐบาลกลางด้านการบังคับใช้กฎหมาย (AFSD-LE)
  • ผู้ช่วยผู้อำนวยการฝ่ายความมั่นคงแห่งรัฐบาลกลาง (AFSD-G)

ระดับสนามบิน

• ผู้จัดการความปลอดภัยด้านการขนส่ง (TSM)
  • เจ้าหน้าที่ควบคุมดูแลความปลอดภัยด้านการขนส่ง (STSO)
    • หัวหน้าเจ้าหน้าที่รักษาความปลอดภัยด้านการขนส่ง (LTSO)
      • เจ้าหน้าที่รักษาความปลอดภัยด้านการขนส่ง (TSO)

เมื่อวันที่ 11 กันยายน 2018 TSA ได้นำธงใหม่มาใช้ ซึ่งแสดงถึงค่านิยมหลักและหลักการก่อตั้ง การออกแบบมีลักษณะเป็นนกอินทรีอเมริกันสีขาวที่ได้รับการออกแบบอย่างมีสไตล์ ตั้งอยู่ตรงกลางภายในวงแหวนสีแดงและสีขาวบนพื้นสีน้ำเงิน โดยปีกที่พลิ้วไหวอย่างมีชีวิตชีวาของนกอินทรีนั้นกางออกในท่าทางที่แสดงถึงการปกป้อง การเฝ้าระวัง และความมุ่งมั่น ปีกของนกอินทรีที่ทะลุผ่านวงแหวนสีแดงและสีขาวแสดงถึงเสรีภาพในการเคลื่อนไหว มีดาว 9 ดวงและรัศมี 11 เส้นแผ่ออกมาจากด้านบนของนกอินทรีเพื่ออ้างอิงถึงวันที่ 11 กันยายน นอกจากนี้ยังมีการแสดงถึงแผ่นดิน (ถนน) และทะเล ซึ่งเป็นตัวแทนของรูปแบบการขนส่ง^{[ 29 ]}

สำหรับปีงบประมาณ 2020 TSA มีงบประมาณประมาณ 7.68 พันล้านดอลลาร์^{[ 31 ]}

ส่วนหนึ่งของงบประมาณ TSA มาจากค่าธรรมเนียม 5.60 ดอลลาร์ต่อผู้โดยสาร หรือที่รู้จักกันในชื่อ ค่าธรรมเนียมความปลอดภัย 11 กันยายนสำหรับการเดินทางทางอากาศเที่ยวเดียวที่เริ่มต้นจากสหรัฐอเมริกา โดยไม่เกิน 11.20 ดอลลาร์ต่อการเดินทางไปกลับ ในปี 2020 ค่าธรรมเนียมผู้โดยสารนี้มีมูลค่ารวม 2.4 พันล้านดอลลาร์ หรือประมาณ 32% ของงบประมาณที่รัฐสภาจัดสรรในปีนั้น^{[ 32 ]}

นอกจากนี้ งบประมาณส่วนน้อยของ TSA มาจากเงินทอนและเงินสดจำนวนเล็กน้อยที่ผู้เดินทางทิ้งไว้ที่จุดตรวจรักษาความปลอดภัยในสนามบิน ซึ่ง TSA ได้รับอนุญาตให้เก็บไว้ตั้งแต่ปี 2005 ภายใต้มาตรา 44945 ของประมวลกฎหมายสหรัฐอเมริกา มาตรา 49 ตั้งแต่ปีงบประมาณ 2008 ถึงปีงบประมาณ 2018 มีเงินที่ถูกทิ้งไว้รวมทั้งสิ้น 6,904,035.98 ดอลลาร์สหรัฐ รวมถึงจำนวนเงินสูงสุดเป็นประวัติการณ์ที่ 960,105.49 ดอลลาร์สหรัฐในปีงบประมาณ 2018 ^{[ 33 ]}ในปีงบประมาณ 2019 มีเงินจำนวน 926,030.44 ดอลลาร์สหรัฐที่ไม่มีผู้มาขอรับคืน^{[ 34 ]}

ในบรรดาประเภทของพนักงาน TSA ได้แก่: ^{[ 35 ]}

ในปี 2551 เจ้าหน้าที่ TSA เริ่มสวมเครื่องแบบใหม่ที่มี เสื้อปฏิบัติหน้าที่ สีน้ำเงินรอยัลกางเกงสีน้ำเงินเข้ม (เกือบดำ) และเข็มขัดสีดำ^{[ 60 ]}สนามบินแห่งแรกที่นำเครื่องแบบใหม่มาใช้คือสนามบินนานาชาติบัลติมอร์/วอชิงตันตั้งแต่วันที่ 11 กันยายน 2551 เจ้าหน้าที่ TSO ทุกคนเริ่มสวมเครื่องแบบใหม่ แถบหนึ่งแถบที่ขอบด้านนอกของแผ่นบ่า แต่ละข้าง แสดงถึง TSO สองแถบสำหรับหัวหน้า TSO และสามแถบสำหรับหัวหน้างาน TSO

เจ้าหน้าที่ตำรวจจะได้รับตราประจำตำแหน่งและเครื่องหมายยศหลังจากสำเร็จหลักสูตรฝึกอบรม ซึ่งรวมถึงหลักสูตร 3 สัปดาห์ที่ศูนย์ฝึกอบรมเจ้าหน้าที่บังคับใช้กฎหมายแห่งสหพันธรัฐ (FLETC) ใน เมืองกลินโค รัฐจอร์เจีย

ระบบบุคลากรที่ TSA ใช้เดิมนั้นอิงตามระบบบุคลากรของ FAA ^{[ 61 ]}

แตกต่างจากพนักงานส่วนใหญ่ของรัฐบาลกลาง พนักงานของ TSA ไม่ได้อยู่ในระบบเงินเดือนGeneral Scheduleแต่ใช้ระบบเงินเดือนแบบแบ่งระดับ โดยมีการปรับเพิ่มตามผลงานแทน

ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2564 รัฐมนตรีว่าการกระทรวงความมั่นคงแห่งชาติอเลฮานโดร มายอร์กัสได้ออกบันทึกข้อความซึ่งสั่งการให้ผู้บริหาร TSA จ่ายเงินเดือนให้พนักงาน "ในระดับที่ไม่ต่ำกว่าพนักงานในระดับเงินเดือนทั่วไป" นอกจากนี้ยังสั่งการให้ TSO ได้รับสิทธิในการเจรจาต่อรองร่วมกัน ที่ขยายมากขึ้นซึ่งสอดคล้อง กับมาตรา 5 ของประมวลกฎหมายสหรัฐอเมริกาและการอุทธรณ์การดำเนินการที่ไม่เป็นผลดีต่อ คณะ กรรมการคุ้มครองระบบคุณธรรม^{[ 62 ]}

ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2566 ระบบการจ่ายเงินแบบใหม่ที่สะท้อนตารางเงินเดือนทั่วไปได้รับการนำมาใช้ตามการจัดสรรงบประมาณโดยพระราชบัญญัติการจัดสรรงบประมาณรวม พ.ศ. 2566สำหรับ TSO บันไดอาชีพเริ่มต้นที่ระดับ D และก้าวหน้าไปถึงระดับ F หัวหน้า TSO และ TSO ระดับหัวหน้างานจะอยู่ในระดับ F และ G ^{[ 63 ]}บันไดอาชีพกำลังอยู่ระหว่างการดำเนินการสำหรับบุคลากรที่ไม่ใช่ TSO ด้วยเช่นกัน^{[ 64 ]}

ในปี 2011 อดีตผู้บริหาร TSA จอห์น พิสโทล ได้มอบสิทธิการเจรจาต่อรองร่วมกันแบบจำกัดให้กับเจ้าหน้าที่รักษาความปลอดภัยด้านการขนส่ง หลังจากการเลือกตั้งสหภาพแรงงานระหว่างสหภาพแรงงานพนักงานรัฐบาลกลางสองแห่ง ได้แก่สหพันธ์พนักงานรัฐบาลอเมริกันและ สหภาพพนักงานกระทรวงการคลัง แห่งชาติ^{[ 65 ]}ในเดือนพฤษภาคม 2024 ได้มีการลงนามข้อตกลงการเจรจาต่อรองร่วมกันแบบขยายที่มีระยะเวลา 7 ปี ระหว่าง TSA และ AFGE ^{[ 66 ]}

ในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2568 รัฐมนตรีว่าการกระทรวงความมั่นคงแห่งชาติKristi Noem ได้ออกบันทึกข้อความที่ยกเลิกข้อตกลงการเจรจาต่อรองร่วม พ.ศ. 2567 AFGE เรียกการกระทำนี้ว่าเป็น "การกระทำตอบโต้" สำหรับการท้าทาย การปลดพนักงานรัฐบาลจำนวนมากของประธานาธิบดีโดนัลด์ ทรัมป์และสาบานว่าจะต่อสู้กับเรื่องนี้^{[ 67 ]}

เพื่อให้สามารถตรวจค้นสัมภาระของผู้โดยสารเพื่อการคัดกรองความปลอดภัย TSA จะตัดหรือทำลายตัวล็อกที่พวกเขาไม่สามารถเปิดเองได้ หน่วยงานได้อนุญาตให้สองบริษัทสร้างแม่กุญแจสายรัดที่ล็อกได้ และกระเป๋าเดินทางที่มีตัวล็อกในตัวซึ่งสามารถเปิดและล็อกใหม่ได้ด้วยเครื่องมือและข้อมูลที่ผู้ผลิตตัวล็อกจัดหาให้แก่ TSA ซึ่งได้แก่Travel SentryและSafe Skies Locks [ ^{158 ] บาง}ครั้งเจ้าหน้าที่ TSA จะตัดตัวล็อกเหล่านี้ออกแทนที่จะเปิด และ TSA ได้รับเรื่องร้องเรียนมากกว่า 3,500 เรื่องในปี 2011 เกี่ยวกับการดัดแปลงตัวล็อก^{[ 159 ]} คริสโตเฟอร์ เอลเลียตต์ นักข่าวท่องเที่ยวและ บรรณาธิการ National Geographic Travelerอธิบายว่าตัวล็อกเหล่านี้ "ไร้ประโยชน์" ในการปกป้องสินค้าภายใน^{[ 160 ]}ในขณะที่ SmarterTravel เขียนไว้ในช่วงต้นปี 2010 ว่า "ยังไม่มีข้อสรุปเกี่ยวกับประสิทธิภาพของมัน" พร้อมทั้งตั้งข้อสังเกตว่ามันเปิดได้ง่ายเพียงใด^{[ 161 ]}

ในเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2557 หนังสือพิมพ์ The Washington Postได้เผยแพร่ภาพถ่ายของกุญแจหลักทั้งเจ็ดดอกของ TSA โดยไม่ได้ตั้งใจในบทความ^{[ 162 ]}เกี่ยวกับการจัดการสัมภาระของ TSA ภาพถ่ายดังกล่าวถูกลบออกจากบทความต้นฉบับในภายหลัง แต่ยังคงปรากฏอยู่ในสำเนาที่เผยแพร่ซ้ำบางฉบับ^{[ 163 ]}ในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2558 เรื่องนี้ได้รับความสนใจจากเว็บไซต์ข่าว^{[ 164 ]}โดยใช้ภาพถ่ายดังกล่าว นักวิจัยด้านความปลอดภัยและประชาชนทั่วไปสามารถสร้างสำเนาที่ใช้งานได้ของกุญแจหลักโดยใช้เทคนิคการพิมพ์ 3 มิติ^{[ 165 ] [ 166 ]}เหตุการณ์ดังกล่าวได้กระตุ้นให้เกิดการอภิปรายเกี่ยวกับผลกระทบด้านความปลอดภัยของการใช้กุญแจหลัก^{[ 164 ]}

แม้ว่า TSA จะเป็นที่รู้จักมากที่สุดจากบทบาทในสนามบิน แต่ TSA ยังรับผิดชอบกฎระเบียบที่เกี่ยวข้องกับการขนส่งอื่นๆ ด้วย รวมถึงกฎระเบียบที่ไม่มีผู้โดยสาร ตัวอย่างเช่น TSA รับผิดชอบในการกำหนดกฎระเบียบด้านความปลอดภัยทางไซเบอร์หลังจากการโจมตีด้วยแรนซัมแวร์ Colonial Pipelineในเดือนพฤษภาคม 2021 ณ เดือนสิงหาคม 2022 พวกเขาได้ออกคำสั่งด้านความปลอดภัยทางไซเบอร์ฉบับปรับปรุงสำหรับผู้ให้บริการน้ำมันและก๊าซ โดยมุ่งเน้นที่มาตรการตามประสิทธิภาพมากขึ้น หลังจากได้รับข้อมูลอย่างกว้างขวางจากหน่วยงานกำกับดูแลของรัฐบาลกลางและผู้มีส่วนได้ส่วนเสียในภาคเอกชน^{[ 167 ]}

สำนักงานสืบสวนของ TSA ^{[ 168 ]}ทีมสีแดงของ TSA [ ^{169 ]}และ สำนักงาน ผู้ตรวจการทั่วไปของกระทรวงความมั่นคงแห่งชาติ ดำเนินการปฏิบัติการลับเพื่อทดสอบประสิทธิภาพของกระบวนการคัดกรองในสนามบินเป็นประจำ มาตรการบางอย่างที่ TSA ใช้ถูกกล่าวหาว่าไม่มีประสิทธิภาพและทำให้เกิดความรู้สึกปลอดภัยที่ผิดพลาด^{[ 170 ] [ 171 ]}สิ่งนี้ทำให้ผู้เชี่ยวชาญด้านความปลอดภัยBruce Schneierบัญญัติศัพท์คำว่า " โรงละครความปลอดภัย" ^{เพื่อ}อธิบายมาตรการเหล่านั้น^{[ 172 ]}

รายงานปี 2004 โดยสำนักงานผู้ตรวจการทั่วไปของกระทรวงความมั่นคงแห่งชาติพบว่าเจ้าหน้าที่ TSA ได้ร่วมมือกับCovenant Aviation Security (CAS) ที่สนามบินนานาชาติซานฟรานซิสโกเพื่อแจ้งเตือนเจ้าหน้าที่ตรวจค้นเกี่ยวกับการทดสอบลับ^{[ 173 ]}ตั้งแต่เดือนสิงหาคม 2003 จนถึงเดือนพฤษภาคม 2004 มีการให้รายละเอียดที่แม่นยำของเจ้าหน้าที่ลับแก่เจ้าหน้าที่ตรวจค้น การแจกรายละเอียดดังกล่าวหยุดลง แต่จนถึงเดือนมกราคม 2005 เจ้าหน้าที่ตรวจค้นยังคงได้รับการแจ้งเตือนทุกครั้งที่มีการดำเนินการลับ^{[ 174 ]}เมื่อไม่พบการกระทำผิดใดๆ จากฝ่าย CAS สัญญาจึงได้รับการต่ออายุออกไปอีกสี่ปี พนักงาน CAS และ TSA บางคนได้รับการลงโทษทางวินัย แต่ไม่มีใครถูกไล่ออก^{[ 175 ] [ 176 ]}

รายงานเกี่ยวกับการปฏิบัติการลับที่ดำเนินการในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2549 ที่สนามบินนานาชาติเนวาร์กลิเบอร์ตี้ถูกเผยแพร่สู่สื่อมวลชน เจ้าหน้าที่ตรวจค้นล้มเหลวในการทดสอบความปลอดภัยลับ 20 จาก 22 ครั้ง โดยพลาดอาวุธปืนและระเบิดจำนวนมากสำนักงานตรวจสอบบัญชีของรัฐบาลเคยชี้ให้เห็นถึงความล้มเหลวในการทดสอบลับซ้ำแล้วซ้ำเล่าของเจ้าหน้าที่ TSA มาก่อน^{[ 177 ] [ 178 ]}การเปิดเผยผลการทดสอบลับขัดกับนโยบายของ TSA และหน่วยงานจึงตอบสนองโดยการเริ่มการสอบสวนภายในเพื่อค้นหาแหล่งที่มาของการรั่วไหล^{[ 179 ]}

ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2550 หนังสือพิมพ์ไทม์ส ยูเนียนแห่งอัลบานี รัฐนิวยอร์กรายงานว่าเจ้าหน้าที่ตรวจค้นของ TSA ที่สนามบินนานาชาติอัลบานีไม่ผ่านการทดสอบความปลอดภัยแบบลับๆ หลายครั้งที่ดำเนินการโดย TSA หนึ่งในนั้นคือความล้มเหลวในการตรวจจับระเบิดปลอม^{[ 180 ]}

ในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2553 ABC News Houston รายงานในบทความเกี่ยวกับชายคนหนึ่งที่เผลอนำปืนที่ลืมไว้ผ่านด่านตรวจความปลอดภัยของสนามบิน โดยระบุว่า "อัตราความล้มเหลวสูงถึง 70 เปอร์เซ็นต์ที่สนามบินหลักบางแห่ง" ^{[ 84 ]}

ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2554 TSA ได้ไล่พนักงานตรวจกระเป๋า 36 คนที่สนามบินโฮโนลูลู ออก เนื่องจากปล่อยให้กระเป๋าผ่านโดยไม่ตรวจสอบเป็นประจำ^{[ 181 ]}

ในปี 2011 ศิลปินชื่อ Geoff McGann ถูก TSA ควบคุมตัว จับกุม และตั้งข้อหาเนื่องจากสวมนาฬิกาที่มีสายไฟและส่วนประกอบคล้ายฟิวส์ที่มองเห็นได้ แม้ว่าจะไม่มีส่วนประกอบที่ระเบิดได้ก็ตาม^{[ 182 ]}

ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2555 ทนายความชาวอเมริกัน Jonathan Corbett ได้เผยแพร่วิดีโอที่แสดงให้เห็นถึงช่องโหว่ในเครื่องสแกนร่างกายของ TSA ซึ่งจะทำให้วัตถุที่เป็นโลหะผ่านไปได้โดยไม่ถูกตรวจพบ^{[ 183 ]} TSA ลดความสำคัญของช่องโหว่นี้ลง แม้ว่าจะไม่ได้ปฏิเสธก็ตาม^{[ 184 ]}และนักวิจัยได้ยืนยันการมีอยู่ของช่องโหว่นี้ในภายหลัง^{[ 185 ]}

ในเดือนพฤษภาคม 2555 รายงานจากสำนักงานผู้ตรวจการทั่วไปของกระทรวงความมั่นคงแห่งชาติระบุว่า TSA "ไม่มีความเข้าใจอย่างถ่องแท้" เกี่ยวกับการละเมิดความปลอดภัยที่สนามบินต่างๆ ทั่วประเทศ โดยสนามบินบางแห่งดำเนินการน้อยมากในการแก้ไขหรือรายงานการละเมิดความปลอดภัย ข้อค้นพบเหล่านี้จะเป็นนำเสนอต่อรัฐสภา^{[ 186 ]} มีรายงานในปี 2012 ว่า ส.ส. ดาร์เรล อิสซาซึ่งดำรงตำแหน่งประธานคณะกรรมการกำกับดูแลและปฏิรูปการปกครองของสภาผู้แทนราษฎร ในขณะนั้น และ ส.ส. จอห์น ไมกาซึ่งดำรงตำแหน่งประธานคณะกรรมการคมนาคมและโครงสร้างพื้นฐานของสภา ผู้แทนราษฎรในขณะนั้น ได้จัดการประชุมร่วมกันหลายครั้งเกี่ยวกับการพิจารณาต้นทุนและผลประโยชน์ของโครงการความปลอดภัยต่างๆ รวมถึงเครื่องสแกนร่างกายแบบเต็มตัวบัตรประจำตัวพนักงานขนส่ง (TWIC) และโครงการตรวจจับพฤติกรรม เป็นต้น^{[ 187 ]}

การสืบสวนในปี 2015 โดยผู้ตรวจการทั่วไปของกระทรวงความมั่นคงแห่งชาติเปิดเผยว่านักสืบปลอมตัวสามารถลักลอบนำสิ่งของต้องห้ามผ่านจุดตรวจได้ถึง 95% ของความพยายามทั้งหมด^{[ 188 ]}

ในเดือนเมษายน พ.ศ. 2558 สถานีข่าว NBC Denver ได้นำเสนอเรื่องราวเกี่ยวกับพนักงานสองคนที่เกี่ยวข้องกันซึ่งประสานงานกันเพื่อรายงานผู้โดยสารที่หน้าตาดีอย่างไม่ถูกต้องเพื่อล่วงละเมิดทางเพศ ตามรายงานของ NBC แม้ว่า TSA จะไล่พนักงานทั้งสองออก แต่ก็ได้ดำเนินการเพื่อปกป้องตัวตนของพนักงาน ซึ่ง NBC ชี้ว่าเป็นความพยายามที่จะปกป้องพวกเขาจากการดำเนินคดีโดยรัฐ ในที่สุดอัยการของรัฐก็ปฏิเสธที่จะดำเนินคดีกับบุคคลเหล่านั้น เนื่องจากไม่มีผู้โดยสารที่ถูกล่วงละเมิดทางเพศโดยไม่รู้ตัวคนใดออกมาร้องเรียน หลังจากเหตุการณ์ดังกล่าว นิตยสาร Time ได้นำเสนอเรื่องราวโดยอ้างคำพูดของอดีตพนักงาน TSA ที่กล่าวว่าการล่วงละเมิดทางเพศเป็นเรื่องปกติในที่ทำงาน^{[ 193 ] [ 194 ]}

ในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2558 เจ้าหน้าที่ TSA ถูกตั้งข้อหาล่วงละเมิดทางเพศนักเรียนแลกเปลี่ยนชาวเกาหลีที่สนามบินนิวยอร์ก ลาการ์เดีย หลังจากที่หญิงสาวปฏิบัติตามคำสั่งของเขาให้เข้าไปในห้องน้ำเพื่อทำการตรวจสอบเพิ่มเติม เจ้าหน้าที่คนดังกล่าวได้ทำร้ายเธอ TSA ได้ออกแถลงการณ์หลังจากไล่พนักงานคนนั้นออก โดยระบุว่าผู้โดยสารควรทราบว่า TSA ไม่ได้ทำการตรวจสอบผู้โดยสารหลังจากที่พวกเขาผ่านจุดตรวจความปลอดภัยแล้ว แม้ว่า TSA จะมีสุนัขดมกลิ่นกระเป๋าเดินทางในพื้นที่ปลอดภัยเพื่อหาสิ่งของต้องห้ามซึ่งจะต้องมีการตรวจสอบโดยมนุษย์ก็ตาม^{[ 195 ] [ 196 ]}

ในปี 2021 อดีตเจ้าหน้าที่ TSA โจนาธาน โลเมลี ถูกตัดสินว่ามีความผิดฐานทำร้ายร่างกาย หลังจากเหตุการณ์ที่เขาหลอกผู้หญิงคนหนึ่งให้โชว์หน้าอกโดยอ้างว่าเป็นส่วนหนึ่งของการตรวจค้นเพื่อความปลอดภัย^{[ 197 ]}

ในปี 2012 มีผู้คนจำนวนหนึ่งรวมถึงพนักงาน TSA ถูกจับกุมที่สนามบินลอสแอนเจลิสหลังจากพบว่าพวกเขาเป็นส่วนหนึ่งของแก๊งค้ายาเสพติด^{[ 198 ]}

ในปี 2021 พนักงาน TSA คนหนึ่งถูกจับกุมที่สนามบิน JFK หลังจากที่เธอพยายามลักลอบนำปืนผ่านเครื่องตรวจจับโลหะ^{[ 199 ]}

TSA ถูกวิพากษ์วิจารณ์เรื่องการเพิ่มขึ้นของการขโมยสัมภาระหลังจากเริ่มดำเนินการ^{[ 200 ]}การขโมยที่รายงานรวมถึงสินค้ามีค่าและอันตรายเช่น แล็ปท็อป เครื่องประดับ^{[ 201 ]}ปืน^{[ 202 ]}และมีด^{[ 203 ]}การขโมยดังกล่าวทำให้เกิดความกังวลว่าการเข้าถึงแบบเดียวกันอาจทำให้สามารถนำระเบิดขึ้นเครื่องบินได้^{[ 204 ]}

ในปี 2547 มีรายงานการร้องเรียนเกี่ยวกับการขโมยสัมภาระมากกว่า 17,000 ครั้ง^{[ 201 ]}ณ ปี 2547 เจ้าหน้าที่ตรวจสัมภาระ 60 คนถูกจับกุมในข้อหาขโมยสัมภาระ^{[ 201 ]}ซึ่งจำนวนนี้เพิ่มขึ้นเป็น 200 คนในปี 2551 ^{[ 205 ]}มีรายงานการร้องเรียนเกี่ยวกับการขโมยและความเสียหายต่อ TSA จำนวน 11,700 ครั้งในปี 2552 ซึ่งลดลงจาก 26,500 ครั้งในปี 2547 ซึ่งเป็นผลมาจากการติดตั้งกล้องและสายพานลำเลียงในสนามบิน^{[ 206 ]}มีรายงานการขโมยทั้งหมด 25,016 ครั้งในช่วงระยะเวลาห้าปีตั้งแต่ปี 2553 ถึง 2557 ^{[ 207 ]}

ข้อมูล ณ ปี 2011TSA จ้างเจ้าหน้าที่ตรวจสอบทั้งหมดประมาณ 60,000 คน (นับรวมทั้งการตรวจสอบสัมภาระและผู้โดยสาร) ^{[ 208 ]}และมีเจ้าหน้าที่ TSA ประมาณ 500 คนถูกไล่ออกหรือถูกพักงานเนื่องจากขโมยของจากกระเป๋าเดินทางของผู้โดยสารนับตั้งแต่มีการก่อตั้งหน่วยงานในเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2544 สนามบินที่มีรายงานการขโมยมากที่สุดตั้งแต่ปี พ.ศ. 2553 ถึง พ.ศ. 2557 คือสนามบินนานาชาติจอห์น เอฟ. เคนเนดีตามด้วยสนามบินนานาชาติลอสแอนเจลิสและสนามบินนานาชาติออร์แลนโด^{[ 207 ]}

ในปี 2551 รายงานการสืบสวนของWTAEในพิตต์สเบิร์กพบว่า แม้จะมีรายงานการขโมยสัมภาระมากกว่า 400 ครั้ง ซึ่ง TSA ได้ชดเชยให้กับผู้โดยสารประมาณครึ่งหนึ่ง แต่ก็ไม่มีการจับกุมผู้ใดเลย^{[ 209 ]}ตามนโยบายของ TSA จะไม่แบ่งปันรายงานการขโมยสัมภาระกับสถานีตำรวจท้องถิ่น^{[ 209 ]}

ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2555 ABC News ได้สัมภาษณ์อดีตเจ้าหน้าที่ TSA ชื่อ Pythias Brown ซึ่งยอมรับว่าขโมยสิ่งของมูลค่ากว่า 800,000 ดอลลาร์สหรัฐฯ ในระหว่างที่ทำงานกับหน่วยงานดังกล่าว Brown ระบุว่าการขโมยนั้น "สะดวกมาก" และขวัญกำลังใจที่ย่ำแย่ภายในหน่วยงานทำให้เจ้าหน้าที่ขโมยของจากผู้โดยสาร^{[ 210 ]}

ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2566 NBC Miami ได้นำเสนอเรื่องราวเกี่ยวกับพนักงาน TSA 3 คนที่ถูกจับกุมในข้อหาลักทรัพย์ครั้งใหญ่ หลังจากถูกบันทึกภาพจากกล้องวงจรปิดขณะขโมยเงินสดและสินค้าอื่นๆ จากกระเป๋าถือ^{[ 211 ]}

TSA ยังถูกวิพากษ์วิจารณ์ว่าไม่ตอบสนองต่อการโจรกรรมอย่างเหมาะสมและไม่ชดเชยค่าเสียหายให้กับผู้โดยสารสำหรับสินค้าที่ถูกขโมย ตัวอย่างเช่น ระหว่างปี 2011 ถึง 2012 ผู้โดยสารที่สนามบินนานาชาติฮาร์ตส์ฟิลด์-แจ็กสัน แอตแลนตารายงานว่าทรัพย์สินสูญหายหรือเสียหายมูลค่า 300,000 ดอลลาร์สหรัฐฯ จาก TSA แต่หน่วยงานดังกล่าวชดเชยให้เพียง 35,000 ดอลลาร์สหรัฐฯ เท่านั้น^{[ 212 ]}พบสถิติที่คล้ายกันที่สนามบินนานาชาติแจ็กสันวิลล์ ผู้โดยสารรายงานว่าสินค้าสูญหายหรือเสียหายมูลค่า 22,000 ดอลลาร์สหรัฐฯ ในช่วง 15 เดือน แต่ TSA ชดเชยให้เพียง 800 ดอลลาร์สหรัฐฯ เท่านั้น^{[ 213 ]}

คำวิจารณ์ทั่วไปอื่นๆ ของหน่วยงานนี้ยังรวมถึงข้อกล่าวหาว่าพนักงาน TSA นอนหลับในเวลางาน^{[ 224 ] [ 225 ] [ 226 ] [ 227 ]}หลีกเลี่ยงการตรวจสอบความปลอดภัย^{[ 228 ]}และล้มเหลวในการใช้ดุลยพินิจที่ดีและสามัญสำนึก^{[ 229 ] [ 230 ] [ 231 ]}

เจ้าหน้าที่ TSA ยังถูกกล่าวหาและถูกตัดสินว่ามีความผิดฐานปฏิบัติอย่างไม่เหมาะสมต่อผู้โดยสาร ล่วงละเมิดทางเพศผู้โดยสาร^{[ 232 ] [ 233 ] [ 234 ] [ 235 ]}ใช้ขั้นตอนการตรวจคัดกรองที่รุกล้ำ รวมถึงการสัมผัสอวัยวะเพศ รวมทั้งอวัยวะเพศของเด็ก^{[ 236 ]} ใช้ เครื่องสแกนร่างกายในทางที่ผิดเพื่อจ้องมองผู้โดยสารหญิง^{[ 237 ]}ค้นตัวผู้โดยสารหรือสัมภาระของพวกเขาเพื่อหาสิ่งของอื่นที่ไม่ใช่อาวุธหรือวัตถุระเบิด^{[ 238 ]}และขโมยของจากผู้โดยสาร^{[ 209 ] [ 239 ] [ 240 ] [ 241 ] [ 242 ] [ 243 ] [ 244 ] [ 245 ]} TSA ไล่เจ้าหน้าที่ 28 คนออกและพักงานอีก 15 คน หลังจากการสอบสวนพบว่าพวกเขาไม่ได้สแกนสัมภาระที่โหลดใต้ท้องเครื่องเพื่อหาวัตถุระเบิด^{[ 246 ]}

TSA ยังถูกกล่าวหาว่าใช้จ่ายอย่างฟุ่มเฟือยกับกิจกรรมที่ไม่เกี่ยวข้องกับความปลอดภัยของสนามบิน^{[ 247 ]}สิ้นเปลืองเงินในการจ้างงาน^{[ 248 ]}และมีผลประโยชน์ทับซ้อน^{[ 249 ]}

TSA ถูกกล่าวหาว่าปฏิบัติหน้าที่ได้ไม่ดีใน พื้นที่ชม พิธีสาบานตนเข้ารับตำแหน่งประธานาธิบดีในปี 2552ซึ่งทำให้ผู้ถือบัตรหลายพันคนถูกกีดกันไม่ให้เข้าร่วมงานในสภาพที่แออัด ในขณะที่ผู้ที่มาถึงก่อนที่จุดตรวจจะถูกจัดตั้งขึ้นก็หลีกเลี่ยงการตรวจคัดกรองไปได้เลย^{[ 250 ] [ 251 ]}

ในปี 2556 พนักงาน TSA หลายสิบคนถูกไล่ออกหรือถูกพักงานเนื่องจากเล่นการพนันผิดกฎหมายที่สนามบินนานาชาติพิตต์สเบิร์ก [ ^{252 ] และ}พนักงาน TSA แปดคนถูกจับกุมในข้อหาขโมยบัตรจอดรถที่สนามบินนานาชาติดัลลัส/ฟอร์ตเวิร์ธ

รายงาน ของ GAOในปี 2013 แสดงให้เห็นว่าการประพฤติมิชอบในหมู่พนักงาน TSA เพิ่มขึ้น 26% ระหว่างปี 2010 และ 2012 จาก 2,691 กรณีเป็น 3,408 กรณี^{[ 253 ]}รายงานของ GAO อีกฉบับหนึ่งระบุว่าไม่มีหลักฐานว่าโปรแกรมการตรวจจับพฤติกรรม Screening of Passengers by Observation Techniques (SPOT) ซึ่งมีงบประมาณประจำปีหลายร้อยล้านดอลลาร์นั้นมีประสิทธิภาพ^{[ 254 ]}

รายงานปี 2013 ของสำนักงานผู้ตรวจการทั่วไปกระทรวงความมั่นคงแห่งชาติกล่าวหาว่า TSA ใช้ผู้สืบสวนคดีอาญามาทำงานแทนพนักงานที่ได้รับค่าจ้างต่ำกว่า ทำให้สูญเสียเงินหลายล้านดอลลาร์ต่อปี^{[ 255 ]}

เมื่อวันที่ 3 ธันวาคม พ.ศ. 2556 สภาผู้แทนราษฎรแห่งสหรัฐอเมริกาได้ผ่านร่างกฎหมายปฏิรูปการจัดซื้อจัดจ้างด้านความปลอดภัยการขนส่ง (HR 2719; สภาที่ 113)เพื่อตอบสนองต่อคำวิจารณ์เกี่ยวกับกระบวนการจัดซื้อจัดจ้างของ TSA ว่าสิ้นเปลือง มีค่าใช้จ่ายสูง และไม่มีประสิทธิภาพ^{[ 256 ] [ 257 ]}หากร่างกฎหมายนี้กลายเป็นกฎหมาย จะกำหนดให้ TSA ต้องพัฒนาแผนการจัดซื้อเทคโนโลยีที่ครอบคลุม และนำเสนอรายงานต่อรัฐสภาเป็นประจำเกี่ยวกับความสำเร็จและความล้มเหลวในการปฏิบัติตามแผนนี้ รายงานเดือนเมษายน พ.ศ. 2556 จากสำนักงานผู้ตรวจการทั่วไปของกระทรวงความมั่นคงแห่งชาติระบุว่า TSA มีสินค้า 17,000 รายการ มูลค่าประมาณ 185.7 ล้านดอลลาร์สหรัฐ เก็บไว้ในคลังสินค้าเมื่อวันที่ 31 พฤษภาคม พ.ศ. 2555 ^{[ 258 ]}ผู้ตรวจสอบพบว่า "TSA จัดเก็บอุปกรณ์ที่ใช้ไม่ได้หรือล้าสมัย รักษาปริมาณสินค้าคงคลังสำรองที่ไม่เหมาะสม และไม่ได้พัฒนากระบวนการจัดการสินค้าคงคลังที่นำอุปกรณ์ไปใช้งานอย่างเป็นระบบ" ^{[ 258 ]}

ในเดือนมกราคม 2014 เจสัน เอ็ดเวิร์ด แฮร์ริงตันอดีตเจ้าหน้าที่ตรวจค้นของ TSA ที่สนามบินนานาชาติโอแฮร์กล่าวว่าเพื่อนร่วมงานที่ได้รับมอบหมายให้ตรวจสอบภาพสแกนร่างกายของผู้โดยสารสายการบินมักจะล้อเล่นเกี่ยวกับน้ำหนัก ความน่าดึงดูด และขนาดอวัยวะเพศชายและหญิงของผู้โดยสาร ตามคำกล่าวของแฮร์ริงตัน เจ้าหน้าที่ตรวจค้นจะแจ้งเตือนกันเองเกี่ยวกับผู้โดยสารหญิงที่น่าดึงดูดด้วยรหัสคำว่า "Hotel Papa" เพื่อให้เจ้าหน้าที่มีโอกาสดูรูปร่างเปลือยของผู้โดยสารในจอภาพสแกนเนอร์ร่างกาย และตอบโต้ผู้โดยสารที่ไม่สุภาพด้วยการทำให้พวกเขาเสียเวลาที่จุดตรวจ ผู้บริหาร TSA จอห์น พิสโทล ตอบกลับโดยกล่าวว่าเครื่องสแกนทั้งหมดได้รับการเปลี่ยนใหม่และห้องตรวจค้นถูกปิดใช้งานแล้ว เขาไม่ได้ปฏิเสธว่าพฤติกรรมที่แฮร์ริงตันอธิบายนั้นเกิดขึ้นจริง^{[ 259 ]}

ในเดือนพฤษภาคม 2016 นักแสดงหญิงSusan Sarandonอ้างว่าตลอดระยะเวลาการบริหารของบุช เธอถูก "คุกคามทุกครั้งที่เดินทางเข้าประเทศ" เธอกล่าวว่าเธอจ้างทนายความสองคนเพื่อติดต่อ TSA เพื่อสอบถามว่าทำไมเธอถึงถูกคุกคาม แต่เธอสันนิษฐานว่าเป็นเพราะเธอวิพากษ์วิจารณ์การบริหารของบุช เธอกล่าวว่าการคุกคามหยุดลงหลังจากที่ทนายความของเธอติดตามเรื่องนี้กับ TSA เป็นครั้งที่สอง^{[ 260 ]}

ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2561 คดีที่พิจารณาในศาลอุทธรณ์เขตที่สามตัดสินว่าเจ้าหน้าที่ TSA ไม่ใช่ "เจ้าหน้าที่สืบสวนหรือบังคับใช้กฎหมาย" ดังนั้นจึงไม่รับผิดภายใต้พระราชบัญญัติการเรียกร้องค่าเสียหายจากรัฐบาลกลาง (FTCA) คดีนี้ขยายมาจากหญิงคนหนึ่งที่ถูก TSA ควบคุมตัวและจับกุมในปี พ.ศ. 2549 แต่ต่อมาศาลยกฟ้องในข้อหาทางอาญา เธอจึงเรียกร้องค่าเสียหายภายใต้ FTCA สำหรับความเสียหายที่เกี่ยวข้องกับการจับกุมโดยมิชอบและเรื่องที่เกี่ยวข้อง^{[ 261 ]}

การ ศึกษา ของ ACLUพบว่า TSA มุ่งเป้าไปที่ชาวอาหรับ มุสลิม และละตินอย่างไม่สมส่วน แม้ว่า DHS จะอ้างว่าไม่ใช่เช่นนั้นก็ตาม^{[ 262 ]}

ผลสำรวจทางโทรศัพท์ของ CBS ที่ทำการสำรวจผู้คน 1,137 คน เมื่อวันที่ 15 พฤศจิกายน 2010 พบว่า 81% ของผู้ตอบแบบสอบถามเห็นด้วยกับการใช้เครื่องสแกนร่างกายแบบเต็มตัวของ TSA ^{[ 263 ]}ผลสำรวจของ ABC/Washington Post ที่จัดทำโดย Langer Associates และเผยแพร่เมื่อวันที่ 22 พฤศจิกายน 2010 พบว่า 64% ของชาวอเมริกันเห็นด้วยกับเครื่องสแกนเอ็กซ์เรย์ร่างกายแบบเต็มตัว แต่ 50% คิดว่าการตรวจค้นแบบ "เสริม" นั้นมากเกินไป โดย 37% รู้สึกเช่นนั้นอย่างรุนแรง นอกจากนี้ ผลสำรวจยังระบุว่าการต่อต้านนั้นต่ำที่สุดในกลุ่มผู้ที่เดินทางโดยเครื่องบินน้อยกว่าปีละครั้ง^{[ 264 ]}ผลสำรวจในภายหลังโดยZogby Internationalพบว่า 61% ของผู้มีสิทธิเลือกตั้งคัดค้านมาตรการใหม่ของ TSA ^{[ 265 ]}ในปี 2012 ผลสำรวจที่จัดทำโดยองค์กร Frequent Business Traveler พบว่า 56% ของผู้ที่เดินทางโดยเครื่องบินบ่อย "ไม่พอใจ" กับการทำงานของ TSA 57% ให้คะแนน TSA ว่า "ทำงานได้แย่" และ 34% ให้คะแนนว่า "พอใช้ได้" มีเพียง 1% ของผู้ตอบแบบสอบถามเท่านั้นที่ให้คะแนนการทำงานของหน่วยงานว่ายอดเยี่ยม^{[ 266 ]}ในทางตรงกันข้าม ผลสำรวจทางโทรศัพท์ของ Rasmussen Reports ในปี 2018 ซึ่งสำรวจชาวอเมริกันผู้ใหญ่ 1,000 คน พบว่า 45% ของผู้ตอบแบบสอบถามมีทัศนคติต่อ TSA อยู่ในระดับที่ค่อนข้างดีถึงดีมาก ในขณะที่ 39% มีทัศนคติที่ไม่ดี^{[ 267 ]}

ในปี 2556 สำนักงานผู้ตรวจการทั่วไปได้เผยแพร่รายงานชื่อ "การดำเนินการของ TSA ไม่เพียงพอที่จะแก้ไขข้อเสนอแนะของผู้ตรวจการทั่วไปเพื่อปรับปรุงสำนักงานตรวจสอบ" รายงานดังกล่าวกล่าวถึงประเด็นการประพฤติมิชอบหลายประเด็น แต่ประเด็นหลักของรายงานคือพนักงานสอบสวนคดีอาญาของ TSA ที่ได้รับค่าตอบแทนพิเศษแม้ว่าจะไม่ตรงตามคุณสมบัติขั้นต่ำที่จะได้รับค่าตอบแทนนี้ก็ตาม^{[ 268 ]}

พระราชบัญญัติการตรวจสอบความรับผิดชอบของสำนักงาน TSA ปี 2015 ที่เผยแพร่โดยคณะกรรมการพาณิชย์ วิทยาศาสตร์ และการขนส่ง อ้างอิงจากรายงานการสอบสวนที่พบปัญหาเกี่ยวกับ TSA พระราชบัญญัตินี้ยังติดตามรายงานของสำนักงานผู้ตรวจการทั่วไปในปี 2013 ซึ่งกำหนดให้ TSA ต้องปฏิบัติตามระเบียบของรัฐบาลกลางและแก้ไขค่าจ้างของพนักงานสอบสวนคดีอาญาของ TSA ^{[ 269 ]}หากไม่มีการดำเนินการใดๆ การใช้เงินในทางที่ผิดนี้คาดว่าจะทำให้ผู้เสียภาษีต้องเสียค่าใช้จ่าย 17 ล้านดอลลาร์ภายในระยะเวลาห้าปี^{[ 270 ]}

เพื่อเป็นการตอบสนอง TSA จึงว่าจ้างบริษัทที่ปรึกษาเพื่อช่วย TSA ในการปฏิบัติตามคำแนะนำของสำนักงานผู้ตรวจการทั่วไป อย่างไรก็ตาม สำนักงานผู้ตรวจการทั่วไปพบว่าการตอบสนองของ TSA ยังไม่เพียงพอ เนื่องจากพวกเขายังไม่ได้แก้ไขปัญหาส่วนใหญ่ที่ระบุไว้ในรายงาน^{[ 271 ]}

กลุ่มและบุคคลจำนวนมากได้เรียกร้องให้ยกเลิก TSA ในรูปแบบปัจจุบัน ซึ่งรวมถึง ส.ว. แรนด์ พอล^{[ 272 ]} (พรรครีพับลิกัน รัฐเคนตักกี้), ส.ส. จอห์น ไมกา^{[ 273 ]} (พรรครีพับลิกัน รัฐฟลอริดา), สถาบันคาโต [ ^{274 ] มูลนิธิ}ดาวน์ไซส์ ดีซี [ ^{275 ] ฟรี}ดอมเวิร์กส์ [ ^{276 ] และคอลัม นิ สต์แสดงความคิดเห็นจาก Forbes [ 277} ] Fox News ^{[ 278} ] National ^{Review [ 279} ] USA ^{Today [} 280 ] ^{Vox [ 281} ] The ^{Washington Examiner} [ 282 ^{] และ} The Washington Post [ ^{283 ]}

นักวิจารณ์ของ TSA มักอ้างว่าหน่วยงานนี้ "ไร้ประสิทธิภาพ รุกล้ำ ไร้ความสามารถ มีค่าใช้จ่ายสูงเกินควร หรือทั้งสี่อย่าง" เป็นเหตุผลในการเรียกร้องให้ยกเลิก^{[ 284 ]}ผู้ที่ต้องการยกเลิก TSA ได้อ้างถึงประสิทธิภาพและต้นทุนที่ลดลงของการตรวจคัดกรองที่ดำเนินการโดยบริษัทเอกชนที่มีคุณสมบัติเหมาะสมซึ่งปฏิบัติตามแนวทางของรัฐบาลกลาง^{[ 285 ]}