เรือบาร์เน็ตต์ได้เคลื่อนย้ายกองกำลังไปยังตำแหน่งป้องกันในแปซิฟิก ตะวันตกเฉียงใต้ พร้อมกับขบวนเรือ BT 202 ซึ่งออกจากนครนิวยอร์กในวันที่ 9 เมษายน 1942 ผ่านคลองปานามาในวันที่ 18 เมษายน 1942 และมาถึงเวลลิงตัน ประเทศนิวซีแลนด์ ในวันที่ 22 พฤษภาคม 1942 หลังจากการรบที่ทะเลคอรัลเรือบาร์เน็ตต์ได้ขนส่งผู้รอดชีวิต 1,360 คนจากเรือ USS Lexington (CV-2)จากนูเมอาไปยังซานดิเอโก [ ^{2 ] ใน}บรรดาผู้รอดชีวิตเหล่านั้นมีเจ้าหน้าที่บริหารของ เรือ Lexington คือ ผู้บัญชาการ มอร์ตัน ที. เซลิกแมนผู้สื่อข่าวสงครามของ Chicago Tribune สแตนลีย์ จอห์นสตันและนักบินเครื่องบินทิ้งระเบิดดำดิ่ง โรเบิร์ต ดิกสัน ผู้ส่งข้อความที่น่าจดจำที่สุดของการรบที่ทะเลคอรัลว่า "Scratch one flattop." ^{[ 2 ]}ระหว่างการเดินทาง ดิกสันสังเกตเห็นเซลิกแมนแบ่งปันข้อความลับกับจอห์นสตัน รวมถึงข้อมูลที่ถอดรหัสเกี่ยวกับการวางแผนของญี่ปุ่นสำหรับการรบที่มิดเวย์^{[ 2 ]} บทความ ของจอห์นสตันในหนังสือพิมพ์ชิคาโกทริบูนที่ตีพิมพ์หลังการรบมีข้อมูลที่อาจเปิดเผยว่ารหัสลับทางทะเลของญี่ปุ่นไม่ปลอดภัยอีกต่อไป^{[ 2 ]}พลเรือเอกเออร์เนสต์ คิงค้นพบแหล่งที่มาของการละเมิดความปลอดภัยผ่านคำตอบของดิกสันต่อผู้สอบสวนของเอฟบีไอ^{[ 2 ]}การเข้ารหัสลับของญี่ปุ่นยังคงไม่เปลี่ยนแปลงหลังจากบทความดังกล่าว ดังนั้นบทลงโทษของเซลิกแมนจึงเป็นการห้ามเลื่อนตำแหน่งอย่างถาวรเพื่อหลีกเลี่ยงการเผยแพร่ข่าวเกี่ยวกับการดำเนินการอย่างเป็นทางการเพิ่มเติม^{[ 2 ]}เซลิกแมนเกษียณอายุในปี 1944 ^{[ 2 ]}

หลังจากส่ง ผู้รอดชีวิต จากเลกซิงตันไปยังซานดิเอโกแล้วเรือบาร์เน็ตต์ได้แล่นไปยังซานฟรานซิสโก^{[ 2 ]}เพื่อรับทหารจากกองพันที่ 1 นาวิกโยธินเพื่อขนส่งไปยังแปซิฟิกใต้^{[ 3 ]}เรือบาร์เน็ตต์แล่นออกจากซานฟรานซิสโกพร้อมกับขบวนเรือ PW 2095 ในวันที่ 23 มิถุนายน พ.ศ. 2485 การมอบหมายกองพันที่ 1 นาวิกโยธินให้ไปยกพลขึ้นบกที่กัวดาลคาแนลเกิดขึ้นหลังจากที่เรือบาร์เน็ตต์บรรทุกสินค้าเชิงพาณิชย์เพื่ออัดวัสดุให้ได้มากที่สุดลงในระวางบรรทุกที่มีอยู่^{[ 4 ]}เรือบาร์เน็ตต์ได้รับมอบหมายให้กองขนส่ง B สำหรับการยกพลขึ้นบกที่กัวดาลคาแนล โดยบรรทุกกองบัญชาการกองพันที่ 1 นาวิกโยธินและกองพันที่ 1 นาวิกโยธินที่ 1 ^{[ 5 ]}เรือบาร์เน็ตต์มาถึงเวลลิงตันประเทศนิวซีแลนด์ในช่วงต้นเดือนกรกฎาคมเพื่อจัดเรียงสินค้าใหม่เป็นสินค้าสำหรับการรบ เพื่อให้สิ่งของที่มีความสำคัญน้อยกว่าอยู่ด้านล่างของวัสดุที่จำเป็นในช่วงเริ่มต้นของการโจมตีสะเทินน้ำสะเทินบก^{[ 4 ]}เรือบาร์เน็ตต์ออกเดินทางจากนิวซีแลนด์ในวันที่ 22 กรกฎาคม เพื่อฝึกซ้อมการยกพลขึ้นบกในวันที่ 26 กรกฎาคม ที่เกาะโคโรในฟิจิจากนั้นกองกำลังยกพลขึ้นบกก็ออกเดินทางจากโคโรในวันที่ 31 กรกฎาคม และเริ่มการยกพลขึ้นบกที่กัวดาลคาแนลในวันที่ 7 สิงหาคม เรือบาร์ เน็ตต์ได้รับความเสียหายจาก เครื่องบินทิ้งระเบิดมิต ซูบิชิ G4M ที่ตก ในระหว่างการโจมตีทางอากาศในวันที่ 8 สิงหาคม^{[ 6 ]}เรือบาร์เน็ตต์ออกเดินทางไปยังนูเมอาในวันที่ 9 สิงหาคม โดยบรรทุกผู้รอดชีวิต 860 คนจากเรือที่จมในการรบที่เกาะซาโวหลังจากขนส่งกองพันที่ 2 นาวิกโยธินที่ 8 จากตองกาไปยังกัวดาลคาแนลในช่วงปลายเดือนตุลาคม เรือบาร์เน็ตต์ใช้เวลาตลอดเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2485 ในการขนส่งทหารและเสบียงระหว่างทูลากิและกัวดาลคาแนล เรือบาร์เน็ตต์จอดทอดสมออยู่นอกชายฝั่งลุงกาพอยต์เพื่อขนถ่ายสินค้า ขณะที่เรือยูเอสเอส อัลชิบา (AKA-6)ที่แล่นมาด้วยกันถูกเรือดำน้ำขนาดเล็กHa-10 ยิงตอร์ปิโด เมื่อวันที่ 28 พฤศจิกายน พ.ศ. 2485 ^{[ 7 ]}เรือบาร์เน็ตต์ได้ขนส่งนาวิกโยธินที่ได้รับบาดเจ็บ 94 นาย และผู้รอดชีวิตชาวอเมริกัน 381 นาย จากเรือพิฆาตที่จมลงในยุทธนาวีที่กัวดาลคาแนล ไปยังเอสปิริตูซานโต จากนั้นได้ขนส่ง ผู้รอดชีวิตจากน อร์ทแฮมป์ ตัน 866 นาย จาก ยุทธนาวีที่ทัสซาฟารองกากลับบ้านที่ซานดิเอโกไม่กี่วันก่อนวันคริสต์มาส^{[ 8 ]}

หลังจากการซ่อมแซมครั้งใหญ่ที่อู่ต่อเรือชายฝั่งตะวันตกเป็นเวลาหนึ่งเดือน เรือ บาร์เน็ตต์ได้รับการจัดประเภทใหม่เป็น APA-5 เมื่อวันที่ 1 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2486 และถูกย้ายไปยังชายฝั่งตะวันออกในเดือนมีนาคม เรือ บาร์เน็ตต์ บรรทุกทหารของกองพลทหารราบที่ 45 เพื่อเข้า ร่วมการฝึกซ้อมยกพลขึ้นบกที่ อ่าวเชซาพีค ณ ซีดาร์พอยต์ รัฐแมริแลนด์ เมื่อวันที่ 12 เมษายน เรือบาร์เน็ตต์แล่นออกจากนอร์ฟอล์ก รัฐเวอร์จิเนีย เมื่อวันที่ 10 พฤษภาคม พ.ศ. 2486 พร้อมกับขบวนเรือ UGF 8A ในฐานะเรือธงของกองพลขนส่งที่ 3 ซึ่งบัญชาการโดยพลเรือตรีแคมป์เบลล์ เอ็ดการ์ โดยมีเรือUSS Savannah (CL-42)และเรือพิฆาต 12 ลำคุ้มกัน และมาถึงเมืองโอราน ประเทศแอลจีเรีย เมื่อวันที่ 23 พฤษภาคม พ.ศ. 2486 เมื่อวันที่ 5 กรกฎาคม พ.ศ. 2486 เรือบาร์เน็ตต์แล่นไปกับขบวนเรือ NCF 1 ซึ่งบรรทุกทีมรบกรมทหารที่ 26 พร้อมกับพลเอกธีโอดอร์ รูสเวลต์ จูเนียร์^{[ 9 ]}ไปยังการยึดครองซิซิลี เรือบาร์เน็ตต์เดินทางมาถึงเมืองเจลา เกาะซิซิลี เวลา 00:25 น. ของวันที่ 10 กรกฎาคม พ.ศ. 2486 และเริ่มลำเลียงทหารขึ้นฝั่งเวลา 02:45 น. เพื่อเข้า ร่วมการรบ สะเทินน้ำสะเทินบกที่เจลาในระหว่างการโจมตีด้วยระเบิดSM-79 ของอิตาลี ^{[ 10 ]}นอกชายฝั่งเกาะซิซิลี เมื่อวันที่ 11 กรกฎาคม พ.ศ. 2486 ระเบิดลูกหนึ่งระเบิดใกล้กับ หัวเรือด้านซ้ายของ บาร์เน็ตต์ ตรงข้ามกับช่องเปิดด้านหน้า ทำให้เกิดรูที่ตัวเรือและน้ำท่วมตามมา เรือถูกทำให้เอียงไปทางด้านขวาเพื่อให้รูอยู่เหนือน้ำ มีผู้เสียชีวิต 7 คน และบาดเจ็บ 35 คน ทั้งหมดเป็นทหารบก ในช่วงเย็นของวันที่ 12 กรกฎาคมเรือบาร์เน็ตต์แล่นด้วยกำลังของตนเองพร้อมกับขบวนเรือ CNF 1 ไปยังแอลเจียร์ประเทศแอลจีเรีย เพื่อซ่อมแซม และมาถึงในวันที่ 15 กรกฎาคม^{[ 8 ]}

เรือบาร์เน็ตต์ออกเดินทางจากเมืองโอรานพร้อมทหาร 1,398 นายจากกองพลทหารราบที่ 36 เมื่อวันที่ 5 กันยายน 1943 ในขบวนเรือ SNF 1 ไปยัง จุดยกพลขึ้นบก ที่ซาเลอร์โนในวันที่ 9 กันยายน และออกจากซาเลอร์โนในวันที่ 10 กันยายน พร้อมขบวนเรือ NSF 1 เพื่อกลับไปยังโอรานในวันที่ 14 กันยายน เรือบาร์เน็ตต์ออกจากโอรานในวันที่ 30 กันยายน พร้อมทหารสื่อสาร ตำรวจ และผู้เชี่ยวชาญด้านอาวุธยุทโธปกรณ์ 1,011 นาย ในขบวนเรือ NSF 4 และมาถึงเนเปิลส์ ประเทศอิตาลี ในวันที่ 6 ตุลาคม หลังจากขนถ่ายกำลังพลแล้วเรือบาร์เน็ตต์ออกจากเนเปิลส์ในวันที่ 7 ตุลาคม พร้อมขบวนเรือ SNF 4 และกลับไปยังโอรานในวันที่ 10 ตุลาคม เมื่อวันที่ 25 ตุลาคมเรือบาร์เน็ตต์ได้ออกเดินทางจากออรานอีกครั้งพร้อมกับทหาร 1,247 นายจากกองพลยานเกราะที่ 1 ในขบวนเรือ NSF 6 เดินทางถึงเนเปิลส์ในวันที่ 28 ตุลาคม และออกเดินทางในวันเดียวกันพร้อมกับขบวนเรือ SNF 6 เพื่อกลับไปยังออรานในวันที่ 1 พฤศจิกายน พ.ศ. 2486 จากนั้น เรือบาร์เน็ตต์ได้ขนส่งทหารกองกำลังสนับสนุน 1,383 นายไปยังอิตาลีในวันที่ 13 พฤศจิกายน และรับทหารเครือจักรภพขึ้นเรือเพื่อออกจากออรานพร้อมกับขบวนเรือ MKF 26 โดยมีเรือHMS Glasgow (C21) คุ้มกัน และเดินทางถึงลิเวอร์พูล ประเทศอังกฤษ ในวันที่ 9 ธันวาคม พ.ศ. 2486 เรือบาร์เน็ตต์ออกจากอังกฤษในวันที่ 18 ธันวาคม พ.ศ. 2486 พร้อมกับขบวนเรือ UC 8 และเดินทางถึงนครนิวยอร์กในวันที่ 2 มกราคม พ.ศ. 2487 ^{[ 8 ]}

หลังจากซ่อมแซมที่อู่ต่อเรือเสร็จเรือบาร์เน็ตต์ได้แล่นออกจากนครนิวยอร์กพร้อมกับขบวนเรือ UT 8 เมื่อวันที่ 11 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2487 เพื่อไปถึงเมืองกูร็อก ประเทศสกอตแลนด์ เมื่อวันที่ 23 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2487 จากนั้น เรือบาร์เน็ตต์ได้เดินทางหลายเที่ยวเพื่อขนส่งทหารระหว่างกูร็อกและพลีมัธ ประเทศอังกฤษ และทำการฝึกซ้อมการยกพลขึ้นบกในอ่าวสตาร์ทเพื่อเตรียมพร้อมสำหรับการบุกนอร์มังดีเมื่อวันที่ 27 พฤษภาคม พ.ศ. 2487 เรือ บาร์เน็ตต์ได้จอดทอดสมอในอ่าวทอร์เพื่อบรรทุกทหารจากกองพันที่ 2 ของกรมทหารราบที่ 8 แห่งกองพลทหารราบที่ 4 ทหารเหล่านี้ได้ขึ้นฝั่งที่หาดยูทาห์เมื่อวันที่ 6 มิถุนายน ก่อนที่จะขนส่งผู้บาดเจ็บกลับไปยังฟัลเมาท์ ประเทศอังกฤษ เมื่อวันที่ 7 มิถุนายน^{[ 8 ]}

เรือบาร์เน็ตต์บรรทุกทหารที่กูร็อกในช่วงปลายเดือนมิถุนายน และส่งทหารเหล่านั้นไปยังเนเปิลส์ในวันที่ 16 กรกฎาคม จากนั้น เรือบาร์เน็ตต์ก็แล่นออกจากเนเปิลส์ในวันที่ 13 สิงหาคม พ.ศ. 2487 พร้อมกับขบวนเรือ SF 1A ในการเดินทางครั้งแรกจากทั้งหมดสามครั้งเพื่อจัดหาการสนับสนุนด้านโลจิสติกส์และขนส่งทหารอเมริกันและฝรั่งเศสเสรีจากเนเปิลส์ไปยังกาเวแลร์ แซงต์โทรเปซ และมาร์เซย์ระหว่างปฏิบัติการ ดรากูน เรือบาร์เน็ตต์ออกจากฝรั่งเศสในวันที่ 20 ตุลาคม และมาถึงนอร์ฟอล์ก รัฐเวอร์จิเนีย ในวันที่ 8 พฤศจิกายน พ.ศ. 2487 ^{[ 8 ]}

หลังจากเข้ารับการซ่อมบำรุงที่อู่ต่อเรือนอร์ฟอล์กเป็นเวลาหนึ่งเดือนเรือบาร์เน็ตต์ได้บรรทุกทหารที่นิวพอร์ต รัฐโรดไอแลนด์ ในเดือนธันวาคม และขนส่งพวกเขาผ่านคลองปานามาไปยังลองบีช รัฐแคลิฟอร์เนีย ในเดือนมกราคม เรือบาร์เน็ตต์ออกจากลองบีชในวันที่ 18 มกราคม 1945 และถึงเกาะกัวดาลคาแนลในวันที่ 9 กุมภาพันธ์ ที่นั่นเรือบาร์เน็ตต์ได้บรรทุกกำลังพลจากกองพลนาวิกโยธินที่ 1 และขนส่งพวกเขาไปยังอูลิติในเดือนมีนาคม ในฐานะส่วนหนึ่งของกลุ่มขนส่ง "เบเกอร์" (TG 53.2) เพื่อเข้าร่วมการ รบที่โอกินาวาเรือบาร์เน็ตต์มาถึงนอกชายฝั่งโอกินาวาในวันที่ 1 เมษายน และได้รับความเสียหายจากเหตุการณ์ยิงพวกเดียวกันเองในวันที่ 6 เมษายน การซ่อมแซมทำให้ต้องกลับไปยังซีแอตเติลในวันที่ 5 พฤษภาคม 1945 เรือบาร์เน็ตต์ขนส่งกำลังพลกองทัพบก 1,163 นายจากซีแอตเติลไปยังฮาวายในเดือนมิถุนายน และทหาร 1,308 นายจากฮาวายไปยังเลย์เตในเดือนกรกฎาคม จากนั้นเรือ บาร์เน็ตต์ได้ขนส่งผู้บาดเจ็บจากฟิลิปปินส์กลับไปยังแคลิฟอร์เนีย และอยู่ในซานดิเอโกเมื่อญี่ปุ่นยอมจำนน เรือบาร์เน็ตต์ ได้รับ ดาวแห่งการรบเจ็ดดวงสำหรับการรับใช้ในสงครามโลกครั้งที่สอง^{[ 8 ]}