ดับเบิลยูดีอาร์5

Q: ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ดับเบิลยูดีอาร์5

โปรตีน WD repeat-containing protein 5 เป็น โปรตีน ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน WDR5 [ 5 ] [ 6 ]

Q: ปฏิสัมพันธ์

WDR5 ได้รับการแสดงให้เห็นว่า มีปฏิสัมพันธ์ กับ Host cell factor C1 [ 7 ] [ 8 ] และ MLL [ 7 ] นอกจากนี้ยังมีปฏิสัมพันธ์กับ long non-coding RNA HOTTIP และlncRNA NeST [ 9 ] [ 10 ] WDR5 เป็นตัวกำหนดที่สำคัญสำหรับ การ ดึงดูด MYC ไปยัง โครมาติน [ 11 ]

ดับเบิลยูดีอาร์5
โครงสร้างที่มีอยู่
พีดีบี	การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB
รายชื่อรหัส PDB
	2CNX , 2CO0 , 2G99 , 2G9A , 2GNQ , 2H13 , 2H14 , 2H68 , 2H6K , 2H6N , 2H6Q , 2H9L , 2H9M , 2H9N , 2H9P , 2O9K , 3EG6 , 3EMH , 3MXX , 3N0D , 3N0E , 3P4F , 3PSL , 3SMR , 3UR4 , 3UVK , 3UVL , 3UVM , 3UVN , 3UVO , 4A7J , 4CY1 , 4CY2 , 4ERQ , 4ERY , 4ERZ , 4ES0 , 4ESG , 4EWR , 4GM3 , 4GM8 , 4GM9 , 4GMB , 4IA9 , 4O45 , 4QL1 , 4Y7R , 5EAL , 5EAP , 5EAR , 4QQE , 5EAM
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	WDR5 , BIG-3, CFAP89, SWD3, โปรตีนที่มีโดเมน WD repeat 5, โดเมน WD repeat 5
รหัสภายนอก	โอมิม : 609012 ; เอ็มจีไอ : 2155884 ; โฮโมโลยีน : 59931 ; การ์ดยีน : WDR5 ; OMA : WDR5 - ออโธโลจี
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ )
คริส.	โครโมโซม 9 (มนุษย์)
จบ	134,159,968 bp
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ )
คริส.	โครโมโซม 2 (เมาส์)
จบ	27,426,547 bp
รูปแบบการแสดงออกของ RNA
	สูงสุดที่แสดงใน
	ผิวหนังบริเวณแขน; อัณฑะซ้าย; อัณฑะข้างขวา; อสุจิ; กล้ามเนื้อน่อง; ซีกสมองน้อย; ซีกขวาของสมองน้อย; ต่อมใต้สมองส่วนหน้า; โอโอไซต์รอง; ต่อมเพศ;
	สูงสุดที่แสดงใน
	โอโอไซต์รอง; โอโอไซต์ปฐมภูมิ; ไซโกต; ร่องรอยดั้งเดิม; ท่อรวมไขกระดูก; เอพิบลาสต์; เม็ดเลือดขาวชนิดแกรนูโลไซต์; ไตส่วนเม็ดเลือด; โซไมต์; โซนโพรงสมอง;
	ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม
	ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม
ออนโทโลยีของยีน
หน้าที่ระดับโมเลกุล	กิจกรรมของฮิสโตนเมทิลทรานสเฟอเรส (จำเพาะ H3-K4); กิจกรรมของฮิสโตนอะเซทิลทรานสเฟอเรส (เฉพาะ H4-K8); กิจกรรมของฮิสโตนอะเซทิลทรานสเฟอเรส (จำเพาะ H4-K5); การจับฮิสโตนที่ถูกเมทิลเลต; การจับโปรตีน; กิจกรรมของฮิสโตนอะเซทิลทรานสเฟอเรส (จำเพาะ H4-K16); กิจกรรมของฮิสโตน-ไลซีน เอ็น-เมทิลทรานสเฟอเรส; การจับตัวของฮิสโตน;
ส่วนประกอบของเซลล์	ชุด Set1C/COMPASS คอมเพล็กซ์; โครงสร้างทางกายวิภาคภายในเซลล์; นิวคลีโอพลาสม์; คอมเพล็กซ์ MLL1; คอมเพล็กซ์ MLL3/4; คอมเพล็กซ์ฮิสโตนอะเซทิลทรานสเฟอเรส; นิวเคลียส; คอมเพล็กซ์ฮิสโตนเมทิลทรานสเฟอเรส; ฐานของซีเลีย;
กระบวนการทางชีวภาพ	การพัฒนาระบบโครงกระดูก; การควบคุมการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การอะเซทิเลชันของฮิสโตน H4-K5; การเมทิลเลชันของฮิสโตน H3-K4; การอะเซทิเลชันของฮิสโตน H3; การอะเซทิเลชันของฮิสโตน H4-K16; การพัฒนาการฉายภาพของเซลล์ประสาท; การอะเซทิเลชันของฮิสโตน H4-K8; การประกอบซีเลียม; การดัดแปลงโปรตีนหลังการสังเคราะห์; การควบคุมการแบ่งตัวของเมกะคาริโอไซต์; การจัดระเบียบโครมาติน;
	แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก
	11091
	140858
	ENSG00000196363
	ENSMUSG00000026917
	พี61964
	พี61965
	NM_017588 NM_052821
	NM_080848
	NP_060058 NP_438172
	NP_543124
	วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์	ดู/แก้ไขเมาส์

โปรตีน WD repeat-containing protein 5เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนWDR5 ^[⁵^]^[⁶^]

ยีนนี้เข้ารหัสโปรตีนในกลุ่ม WD repeat WD repeat คือบริเวณที่มีการอนุรักษ์น้อยที่สุดประมาณ 40 กรดอะมิโน โดยทั่วไปจะอยู่ระหว่างไกลซีน-ฮิสทีดีนและทริปโตเฟน-แอสปาร์ติก (GH-WD) ซึ่งอาจช่วยอำนวยความสะดวกในการสร้างคอมเพล็กซ์เฮเทอโรไตรเมอริกหรือมัลติโปรตีน สมาชิกในกลุ่มนี้เกี่ยวข้องกับกระบวนการต่างๆ ในเซลล์ รวมถึงการดำเนินไปของวงจรเซลล์ การส่งสัญญาณ การตายของเซลล์ และการควบคุมยีน โปรตีนนี้มี WD repeat 7 อัน มีการระบุตัวแปรการถอดรหัสที่ตัดต่อแบบอื่นที่เข้ารหัสโปรตีนเดียวกัน^{[ 6 ]}

ปฏิสัมพันธ์

WDR5 ได้รับการแสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับHost cell factor C1 ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}และMLL [ ^{7 ]}นอกจากนี้ยังมีปฏิสัมพันธ์กับlong non-coding RNA HOTTIPและlncRNA NeST ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} WDR5 เป็นตัวกำหนดที่สำคัญสำหรับ การ ^{ดึงดูด} MYCไปยังโครมาติน^{[ 11 ]}

อ่านเพิ่มเติม

Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH และคณะ (2003). "การสร้างและการวิเคราะห์เบื้องต้นของลำดับ cDNA ของมนุษย์และหนูที่มีความยาวเต็มมากกว่า 15,000 ลำดับ" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Wysocka J, Myers MP, Laherty CD และคณะ (2003). "เอนไซม์ดีอะเซทิเลส Sin3 ของมนุษย์และเมทิลทรานสเฟอเรสฮิสโตน H3-K4 Set1/Ash2 ที่เกี่ยวข้องกับ trithorax ถูกยึดเข้าด้วยกันอย่างเลือกสรรโดยปัจจัยการเพิ่มจำนวนเซลล์ HCF-1" Genes Dev . 17 (7): 896– 911. doi : 10.1101/gad.252103 . PMC 196026 . PMID 12670868 .
Gori F, Demay MB (2004). "BIG-3 โปรตีน WD-40 repeat ชนิดใหม่ ถูกแสดงออกในแผ่นเจริญเติบโตที่กำลังพัฒนาและเร่งการแยกตัวของเซลล์กระดูกอ่อนในหลอดทดลอง" Endocrinology . 145 ( 3): 1050– 4. doi : 10.1210/en.2003-1314 . PMID 14657013 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T และคณะ (2004). "การจัดลำดับและลักษณะเฉพาะของ cDNA มนุษย์ความยาวเต็ม 21,243 รายการ" Nat . Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Yokoyama A, Wang Z, Wysocka J และคณะ (2004). "โปรโตออนโคโปรตีน MLL ของมะเร็งเม็ดเลือดขาวสร้างคอมเพล็กซ์เมทิลทรานสเฟอเรสฮิสโตนคล้าย SET1 ร่วมกับเมนินเพื่อควบคุมการแสดงออกของยีน Hox" . Mol. Cell. Biol . 24 (13): 5639– 49. doi : 10.1128/MCB.24.13.5639-5649.2004 . PMC 480881 . PMID 15199122 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA และคณะ (2004). "สถานะ คุณภาพ และการขยายตัวของโครงการ cDNA ความยาวเต็มของ NIH: ชุดสะสมยีนสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Andersen JS, Lam YW, Leung AK และคณะ (2005). "พลวัตของโปรตีนในนิวเคลียส" Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
Wysocka J, Swigut T, Milne TA และคณะ (2005). "WDR5 เชื่อมโยงกับฮิสโตน H3 ที่ถูกเมทิลเลชันที่ K4 และมีความสำคัญต่อการเมทิลเลชัน H3 K4 และการพัฒนาของสัตว์มีกระดูกสันหลัง" . Cell . 121 (6): 859– 72. doi : 10.1016/j.cell.2005.03.036 . PMID 15960974 . S2CID 17521631 .
Dou Y, Milne TA, Tackett AJ และคณะ (2005). "การเชื่อมโยงทางกายภาพและการทำงานประสานกันของเมทิลทรานสเฟอเรส H3 K4 MLL1 และอะเซทิลทรานสเฟอเรส H4 K16 MOF" . Cell . 121 (6): 873– 85. doi : 10.1016/j.cell.2005.04.031 . PMID 15960975 . S2CID 14717470 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T และคณะ (2005). "มุ่งสู่แผนที่ระดับโปรตีโอมของเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนของมนุษย์" Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Gori F, Friedman L, Demay MB (2006). "Wdr5 โปรตีน WD repeat ชนิดใหม่ ควบคุมการแยกตัวของเซลล์สร้างกระดูกและเซลล์กระดูกอ่อนในร่างกาย" วารสารปฏิสัมพันธ์ของระบบกล้ามเนื้อและกระดูกและระบบประสาท 5 ( 4): 338– 9. PMID 16340128
Lim J, Hao T, Shaw C และคณะ (2006). "เครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนกับโปรตีนสำหรับโรคอะแท็กเซียทางพันธุกรรมในมนุษย์และความผิดปกติของการเสื่อมของเซลล์พูร์คินเจ" . Cell . 125 (4): 801– 14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . S2CID 13709685 .
Ruthenburg AJ, Wang W, Graybosch DM และคณะ (2006). "การรับรู้และการนำเสนอฮิสโตน H3 โดยโมดูล WDR5 ของคอมเพล็กซ์ MLL1" Nat . Struct. Mol. Biol . 13 (8): 704– 12. doi : 10.1038/nsmb1119 . PMC 4698793. PMID 16829959 .
Couture JF, Collazo E, Trievel RC (2006). "การจดจำโมเลกุลของฮิสโตน H3 โดยโปรตีน WD40 WDR5" Nat. Struct. Mol. Biol . 13 (8): 698– 703. doi : 10.1038/nsmb1116 . PMID 16829960 . S2CID 26165068 .
Dou Y, Milne TA, Ruthenburg AJ และคณะ (2006). "การควบคุมกิจกรรมเมทิลทรานสเฟอเรส MLL1 H3K4 โดยส่วนประกอบหลัก" Nat . Struct. Mol. Biol . 13 (8): 713– 9. doi : 10.1038/nsmb1128 . PMID 16878130. S2CID 12849159 .
Schuetz A, Allali-Hassani A, Martín F และคณะ (2006). "พื้นฐานโครงสร้างสำหรับการจดจำโมเลกุลและการนำเสนอฮิสโตน H3 โดย WDR5" . EMBO J . 25 (18): 4245– 52. doi : 10.1038/sj.emboj.7601316 . PMC 1570438 . PMID 16946699 .
Ewing RM, Chu P, Elisma F และคณะ (2007). "การทำแผนที่ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนของมนุษย์ในระดับใหญ่ด้วยแมสสเปกโทรเมตรี" Mol . Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948. PMID 17353931 .
Bryan AF, Wang J, Howard GC และคณะ (2020). "WDR5 เป็นตัวควบคุมการแสดงออกของยีนสังเคราะห์โปรตีนที่ได้รับการอนุรักษ์" . Nucleic Acids Research . 48 (6): 2924– 2941. doi : 10.1093/nar/gkaa051 . PMC 7102967 . PMID 31996893 .

บทความเกี่ยวกับยีนบนโครโมโซมคู่ที่ 9 ของมนุษย์นี้ ยังไม่สมบูรณ์คุณสามารถช่วยวิกิพีเดียได้โดยการเพิ่มข้อมูลที่ขาดหายไป

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[

[

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

ดับเบิลยูดีอาร์5

ปฏิสัมพันธ์

อ่านเพิ่มเติม

ข้อมูลสำคัญจากบทความ