เมื่อวันที่ 16 พฤษภาคม 2556 นายวัน จูไนดี ได้รับการแต่งตั้งเป็นรองรัฐมนตรีว่าการกระทรวงมหาดไทย ภายใต้ คณะรัฐมนตรีของนายกรัฐมนตรีนาจิบ ราซัก [ ^{13 ] ใน}ระหว่างดำรงตำแหน่งดังกล่าว เขาได้กล่าวว่าอัตราการเกิด คดี ข่มขืนตามกฎหมายในหมู่ชาวมาเลย์นั้นสูงกว่า เนื่องจาก "ความอ่อนไหวทางวัฒนธรรม" ของชุมชนชาวมาเลย์เกี่ยวกับเยาวชน ซึ่งนำไปสู่การรายงานคดีมากกว่าเมื่อเทียบกับ "ผู้ที่ไม่ใช่ชาวมาเลย์" ซึ่งอาจยอมรับการข่มขืนตามกฎหมายได้มากกว่า^{[ 14 ]}อย่างไรก็ตาม คำกล่าวของเขาถูกตีความผิดและบิดเบือนโดยนายชง เชียง เจนสมาชิกสภาผู้แทนราษฎรเขตบันดาร์กูชิง สิ่งที่นายวัน จูไนดี กล่าวจริง ๆ คือ "ชาวมาเลย์มีแนวโน้มที่จะอ่อนไหวมากกว่าใน การรายงาน ในขณะที่ผู้ที่ไม่ใช่ชาวมาเลย์มีความอ่อนไหวน้อยกว่าในการรายงานคดีข่มขืนตามกฎหมายต่อตำรวจ" ข้อสังเกตนี้อ้างอิงจากสถิติของกรมทะเบียนราษฎร^{[ 15 ]}

ในเดือนกรกฎาคม 2558 นาจิบประกาศปรับคณะรัฐมนตรี โดยแต่งตั้งวาน จูไนดี เป็นรัฐมนตรีว่าการกระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมทำให้เขาเป็นรัฐมนตรีคนที่สองจากรัฐซาราวักที่ดำรงตำแหน่งนี้ ต่อจากอาเดนัน ซาเต็มเขาเห็นว่าการแต่งตั้งครั้งนี้อาจเป็นประโยชน์ต่อผลประโยชน์ของรัฐซาราวัก โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการผลักดันให้มีการเพิ่มค่าธรรมเนียมจากทรัพยากรน้ำมันและก๊าซเขาเชื่อว่าการมีตัวแทนจากรัฐซาราวักในกระทรวงดังกล่าวจะช่วยให้การสื่อสารกับรัฐบาลกลางราบรื่นยิ่งขึ้น โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกระบวนการเรียกร้องสิทธิ์ที่เกี่ยวข้องกับปิโตรนาสความมุ่งมั่นของเขาในการจัดการทรัพยากรอย่างยั่งยืนทำให้เขาได้รับการยกย่องจากเจ้าหน้าที่กระทรวง ซึ่งขนานนามเขาว่า "รัฐมนตรีผู้ยิ่งใหญ่"

ในเดือนพฤศจิกายน 2559 นายวัน จูไนดี นำคณะผู้แทนมาเลเซียเข้าร่วมการประชุมภาคี ครั้งที่ 22 (COP22) ของข้อตกลงปารีสว่าด้วยการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศณเมืองมาราเกชประเทศโมร็อกโกเพื่อยืนยันความมุ่งมั่นของมาเลเซียในการแก้ไขปัญหาการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ มาเลเซียได้ให้สัตยาบันข้อตกลงปารีส ทำให้เป็นประเทศที่ 111 ที่ให้สัตยาบัน นายวัน จูไนดี ยังได้จัดตั้งศาลามาเลเซียเพื่อจัดแสดงความพยายามของประเทศในการต่อสู้กับการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ โดยเน้นที่การจัดการป่าไม้และพลังงานหมุนเวียน นอกจากนี้ เขายังสนับสนุน ประเด็น ความหลากหลายทางชีวภาพในการประชุมอนุสัญญาว่าด้วยความหลากหลายทางชีวภาพ ณ เมืองแคนคูนประเทศเม็กซิโกซึ่งนำไปสู่การประกาศใช้นโยบายความหลากหลายทางชีวภาพแห่งชาติ ปี 2559-2568 ซึ่งเป็นแนวทางในการจัดการความหลากหลายทางชีวภาพในมาเลเซีย

ภายใต้การนำของ Wan Junaidi ประเทศมาเลเซียได้รับการเสนอชื่อจากกัวเตมาลาให้เป็นประธานกลุ่มประเทศที่มีความหลากหลายทางวัฒนธรรมสูงที่มีแนวคิดเดียวกัน (LMMC) ซึ่งเป็นตัวแทนของภูมิภาคเอเชียตั้งแต่ปี 2017 ถึง 2018

ในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2563 การพัฒนาทางการเมืองครั้งสำคัญนำไปสู่การล่มสลายของ รัฐบาลผสม ปากาตัน ฮารัปปัน (PH) และการลาออกของนายกรัฐมนตรีมหาธีร์ โมฮัมหมัดซึ่งดำรงตำแหน่งมา 22 เดือน หลังจากเหตุการณ์เหล่านี้ รัฐบาลผสม เปริกาทัน นาซิออนัล (PN) นำโดยนายกรัฐมนตรีมูฮยิดดิน ยัสซินได้เข้ารับตำแหน่ง^{[ 16 ] [ 17 ]}ภายใต้คณะรัฐมนตรีของมูฮยิดดินวาน จูไนดี กลับมารับราชการในคณะรัฐมนตรีในฐานะ รัฐมนตรี ว่าการกระทรวงพัฒนาผู้ประกอบการและสหกรณ์

ในช่วงเริ่มต้นของการแพร่ระบาดกระทรวงได้จัดสรรเงิน 200 ล้านริงกิตภายใต้โครงการกระตุ้นเศรษฐกิจเพิ่มเติม (Rakyat Prihatin PKS) เพื่อสนับสนุนผู้ประกอบการรายย่อยที่ได้รับผลกระทบจากวิกฤตในเดือนเมษายน โดยมีเป้าหมายที่จะให้ผู้ประกอบการรายย่อยจำนวน 33,000 รายได้รับประโยชน์จากโครงการฟื้นฟูธุรกิจจากโควิด (Covid Business Recovery Micro: CBRM) โดยให้เงินช่วยเหลือรายละไม่เกิน 10,000 ริงกิต โครงการนี้ให้เงินทุนที่จำเป็นเพื่อช่วยให้ผู้ประกอบการที่ได้รับผลกระทบสามารถฟื้นตัวและกลับมาดำเนินธุรกิจได้โดยไม่มีค่าใช้จ่ายเพิ่มเติม เปิดให้ธุรกิจในทุกภาคส่วนเข้าร่วมได้ โดยมีระยะเวลาการชำระคืนสูงสุด 3 ปี พร้อมระยะเวลาผ่อนผัน 6 เดือน แม้แต่ผู้ประกอบการที่ติดบัญชีดำก็ยังได้รับการพิจารณาให้ความช่วยเหลือเป็นรายกรณี^{[ 18 ]}ในเดือนมิถุนายน รัฐบาลได้นำแผนฟื้นฟูเศรษฐกิจแห่งชาติ (PENJANA) มาใช้เพื่อช่วยให้วิสาหกิจขนาดกลางและขนาดย่อม (SME) ฟื้นตัวจากภาวะเศรษฐกิจตกต่ำ ผ่าน PENJANA รัฐบาลได้ให้ความช่วยเหลือทางการเงินส่งเสริมการเปลี่ยนแปลงทางดิจิทัลและให้การสนับสนุนเฉพาะภาคส่วน ความช่วยเหลือทางการเงินรวมถึงเงินสมทบจำนวน 140 ล้านริงกิตมาเลเซียเพื่ออำนวยความสะดวกในการเปลี่ยนไปใช้บริการออนไลน์ ในขณะที่สิ่งจูงใจและโครงการต่างๆ เช่น โครงการ PENJANA SME Financing และมาตรการบรรเทาภาษีมีเป้าหมายเพื่อบรรเทาภาระทางการเงินและกระตุ้นการเติบโต นอกจากนี้ โครงการริเริ่มต่างๆ เช่น แคมเปญ อีคอมเมิร์ซและ โครงการ สนับสนุนทางเทคนิค ยังช่วยเสริมความพยายามใน การเพิ่มความยืดหยุ่นและความสามารถในการแข่งขันทางธุรกิจในเศรษฐกิจดิจิทัล^{[ 19 ]}

ในเดือนสิงหาคม นายวัน จูไนดี พบว่าตนเองอยู่ในสถานการณ์ที่ขาดข้อมูลเกี่ยวกับการจัดสรรเงินทุนสาธารณะจำนวน 20 ล้านริงกิต ที่ลงทุนในบริษัท Aerodyne Ventures Sdn. Bhd. สำหรับโครงการรถยนต์บินได้ในสมัยรัฐบาล PH โดยระบุว่าเงินทุนดังกล่าวได้ถูกบริจาคให้กับบุคคลหรือกลุ่มบุคคลบางกลุ่มไปแล้ว เขากล่าวว่าภาคเอกชนเป็นผู้นำในการพัฒนาอุตสาหกรรมรถยนต์บินได้ โดยรัฐบาลทำหน้าที่เป็นผู้สนับสนุนผู้ประกอบการ SME ในด้านบริการโดรน ในการตอบสนองต่อคำเรียกร้องของคณะกรรมการบัญชีสาธารณะให้ตรวจสอบการลงทุน เขาได้ยอมรับว่าบริษัท VentureTech Sdn. Bhd. มีส่วนเกี่ยวข้องในการส่งต่อเงินทุนไปยัง Aerodyne

หลังจากที่มูฮยิดดินลาออกจากตำแหน่งนายกรัฐมนตรีเมื่อวันที่ 16 สิงหาคม พ.ศ. 2564 เนื่องจากรัฐบาลสูญเสียเสียงข้างมากท่ามกลางวิกฤตทางการเมืองที่กำลังดำเนินอยู่ คณะรัฐมนตรีของเขาก็ถูกยุบ^{[ 20 ]}

หลังจากมูฮยิดดินลาออก อิสมาอิล ซาบรี ยาคอบได้รับการแต่งตั้งให้ดำรงตำแหน่งต่อจากเขา ในคณะรัฐมนตรีของเขาอิสมาอิล ซาบรี ได้แต่งตั้งวาน จูไนดี เป็นรัฐมนตรีว่าการกระทรวงรัฐสภาและกฎหมายในสำนักนายกรัฐมนตรี

ในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2564 กระทรวงภายใต้การดูแลของ Wan Junaidi ได้รับการยอมรับในด้านผลงานที่โดดเด่น การยอมรับนี้อิงตามการวิจัยที่ดำเนินการโดยหน่วยงานวิจัยอิสระ ได้แก่ ILHAM Centre และ O2 Research Malaysia (O2) ซึ่งประเมินผลสัมฤทธิ์ของกระทรวงต่างๆ ภายใต้ตัวชี้วัดประสิทธิภาพหลัก (KPI) 100 วัน กระทรวงดังกล่าวได้รับการจัดอันดับที่สาม รองจากกระทรวงสาธารณสุขและกระทรวงการคลัง^{[ 21 ]}

ในฐานะรัฐมนตรีว่าการกระทรวงกฎหมาย วาน จูไนดี มีบทบาทสำคัญในการบูรณาการข้อตกลงมาเลเซีย ค.ศ. 1963 (MA63) เข้ากับการเจรจาระหว่างรัฐบาลกลางและรัฐบาลซาราวักและ ซาบา ห์ ที่กำลังดำเนินอยู่ ^{[ 22 ]}หนึ่งในความสำเร็จที่โดดเด่นที่สุดคือการแก้ไขมาตรา 160ของรัฐธรรมนูญแห่งสหพันธรัฐ ซึ่งฟื้นฟูสิทธิบางประการของซาราวักที่ถูกลดทอนไป โดยการรวมบทบัญญัติจาก MA63 ^{[ 23 ]}รายงานคอบโบลด์ [ ^{24 ] และรายงาน ของ}คณะกรรมการระหว่างรัฐบาล (IGC) เข้าไว้ในรัฐธรรมนูญ^{[ 24 ] [ 22 ]}ความเป็นผู้นำของวาน จูไนดี ยังอำนวยความสะดวกในการดำเนินการตามนโยบายต่างๆ ที่ส่งผลกระทบต่อซาราวัก รวมถึงนโยบายด้านการศึกษาและการเป็นสมาชิกในคณะกรรมการรายได้ภายในประเทศ^{[ 22 ] [ 25 ]}

นอกจากนี้ Wan Junaidi ยังเป็นผู้นำในการแก้ไขรัฐธรรมนูญเพื่อห้ามสมาชิกสภาผู้แทนราษฎรย้ายพรรคในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2565 สภาผู้แทนราษฎรได้ผ่านร่างกฎหมายนี้ด้วยคะแนนเสียงส่วนใหญ่กว่าสองในสาม ร่างกฎหมายนี้ยังได้รับการสนับสนุนจากวุฒิสมาชิก 52 คนจากทั้งหมด 60 คนผ่านการลงคะแนนเสียงแบบกลุ่มในวุฒิสภาด้วยการบังคับใช้กฎหมายนี้ สมาชิกสภาผู้แทนราษฎรที่ออกจากพรรคของตนจะสูญเสียสมาชิกภาพ^{[ 26 ]}

นอกจากนี้ Wan Junaidi ยังได้ปรับปรุงกระบวนการลงทะเบียนผู้มีสิทธิเลือกตั้งให้มีอายุ 18 ปี หรือที่รู้จักกันในชื่อ "Undi18" ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2564 ศาลสูงกูชิงได้ออกคำสั่งให้รัฐบาลลดอายุผู้มีสิทธิเลือกตั้งจาก 21 ปี เหลือ 18 ปี และดำเนินการลงทะเบียนผู้มีสิทธิเลือกตั้งโดยอัตโนมัติภายในสิ้นเดือนธันวาคม^{[ 27 ]}ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2565 การแก้ไขรัฐธรรมนูญเกี่ยวกับอายุขั้นต่ำในการเลือกตั้งและการลงทะเบียนผู้มีสิทธิเลือกตั้งโดยอัตโนมัติได้รับการอนุมัติภายใต้การกำกับดูแลของ Wan Junaidi หลังจากการนำคุณสมบัติอายุ 18 ปีสำหรับการเลือกตั้งและการลงทะเบียนผู้มีสิทธิเลือกตั้งโดยอัตโนมัติมาใช้ พลเมืองมาเลเซียทุกคนที่มีอายุ 18 ปีขึ้นไปที่ตรงตามเกณฑ์คุณสมบัติจะได้รับการลงทะเบียนโดยอัตโนมัติโดยไม่มีข้อยกเว้น^{[ 28 ]}

• มาเลเซีย
  • ผู้บัญชาการสูงสุดแห่งเครื่องราชอิสริยาภรณ์ผู้พิทักษ์ราชอาณาจักร (SMN) – ตุน (2024) ^{[ 34 ]}
  • ผู้บัญชาการแห่งเครื่องราชอิสริยาภรณ์แห่งความภักดีต่อพระมหากษัตริย์แห่งมาเลเซีย (PSM) – ตันศรี (2023) ^{[ 35 ]}
  • ผู้บัญชาการเครื่องราชอิสริยาภรณ์เกียรติคุณ (PJN) – ดาตุก (2003) ^{[ 36 ]}
  • เครื่องราชอิสริยาภรณ์ชั้นคอมพาเนียนแห่งความภักดีต่อพระมหากษัตริย์แห่งมาเลเซีย (JSM) (2000) ^{[ 37 ]}
  • ผู้ได้รับเหรียญเกียรติยศแห่งการบริการอันซื่อสัตย์ (PPS)
  • ผู้ได้รับเหรียญเกียรติยศด้านการบริการทั่วไป (PPA)
  • ผู้ได้รับเหรียญกล้าหาญแห่งชาติ (PJPN)
  • ผู้ได้รับเหรียญการติดตั้ง Yang di-Pertuan Agong ครั้งที่ 14
  • ผู้ได้รับเหรียญการติดตั้ง Yang di-Pertuan Agong ครั้งที่ 15
  • ผู้ได้รับเหรียญการติดตั้ง Yang di-Pertuan Agong ครั้งที่ 17
• ซาราวัก
  • อัศวินชั้นสูงสุดผู้บัญชาการและปรมาจารย์ชั้นสูงสุดแห่งดวงดาวแห่งซาราวัก (SBS) – เปฮิน ศรี (2024) ^{[ 7 ]}
  • อัศวินผู้บัญชาการแห่งเครื่องราชอิสริยาภรณ์อันสูงส่งที่สุดแห่งดวงดาวแห่งซาราวัก (PNBS) – ดาโต๊ะ ศรี (2014) ^{[ 38 ]}
  • สหายแห่งเครื่องราชอิสริยาภรณ์อันสูงส่งแห่งดวงดาวแห่งซาราวัก (JBS) (1998) ^{[ 39 ]}
  • เจ้าหน้าที่แห่งเครื่องราชอิสริยาภรณ์อันสูงส่งแห่งดวงดาวแห่งซาราวัก (PBS) (1992) ^{[ 40 ]}
  • ผู้ได้รับเหรียญที่ระลึกครบรอบ 40 ปีวันประกาศอิสรภาพของซาราวัก (ปี 2003)
  • ผู้ได้รับเหรียญที่ระลึกครบรอบ 50 ปีวันประกาศอิสรภาพรัฐซาราวัก (ปี 2013)
  • เหรียญทองของเหรียญครบรอบ 60 ปีแห่งการประกาศอิสรภาพของซาราวัก (2023) ^{[ 41 ]}
• มะละกา
  • ผู้บัญชาการสูงสุดแห่งเครื่องราชอิสริยาภรณ์มะละกา (DGSM) – ดาตุก เซรี (2017) ^{[ 42 ]}
• เปอร์ลิส
  • ผู้ได้รับเหรียญเงินกาญจนาภิเษก ตวนกู ไซเอ็ด สิระจุ๊ดดิน จามาลุลเลาะห์ (2568)

• Evolusi Parlimen และ Evolusi Speaker Parlimen Malaysia (2010) ISBN 9789834943073
• ฟัลซาฟาห์ มอรอล อิลมู เบอร์เพนกาป (2550) ISBN 9836294597