หนูในเมืองนิวยอร์ก (NYC) แสดงให้เห็นถึงการปรับตัวเฉพาะถิ่นต่อแรงกดดันจากการคัดเลือกโดยอาหารในถิ่นที่อยู่อาศัยในเมือง เนื่องจากเป็นสัตว์กินอาหารแบบฉวยโอกาส ประชากร หนูเท้าขาว ในเมือง จึงดำรงชีวิตด้วยอาหารที่มนุษย์ทิ้งแล้ว ซึ่งเป็นแหล่งโภชนาการที่หาได้ง่าย ทำให้บริโภคไขมันและคาร์โบไฮเดรตมากกว่าประชากรในชนบทมาก ผลการศึกษาจีโนมิกส์ระดับภูมิทัศน์แสดงให้เห็นหลักฐานของการคัดเลือกเชิงบวกในยีนไมโทคอนเดรียของหนูในเมืองที่รับผิดชอบในการย่อยสลายและดูดซึมไขมันและคาร์โบไฮเดรต ประชากร หนูเท้าขาว ที่แยกตัวออก มาอาศัยอยู่ในสวนสาธารณะของ NYC แสดงให้เห็นถึงสัญญาณของการปรับตัวในระดับโมเลกุลต่อแหล่งอาหารในเมือง วิวัฒนาการที่แตกต่างกันของกระบวนการเผาผลาญ ใน ประชากรหนูเท้าขาวในเมืองนั้นเชื่อว่ามีส่วนช่วยให้พวกมันประสบความสำเร็จและอยู่รอดในป่าในเมือง NYC นอกจากนี้ รูปร่างของหนูเท้าขาวในเมืองอาจกำลังเปลี่ยนแปลงเพื่อปรับตัวให้เข้ากับแหล่งอาหารทางเลือก ตัวอย่างเช่น ฟันของหนูเท้าขาวในเมืองสั้นกว่าฟันของหนูในชนบท การเปลี่ยนแปลงลักษณะทางกายภาพนี้อาจอธิบายได้จากความพร้อมของแหล่งอาหารที่มีพลังงานสูงในป่าในเมือง ซึ่งทำให้ไม่จำเป็นต้องมีฟันที่ยาวและแข็งแรง^{[ 15 ]}

ประชากรในเมืองของP. leucopusอาจอยู่ภายใต้แรงกดดันการคัดเลือกเฉพาะเนื่องจากการสัมผัสกับมลพิษและสารพิษเป็นประจำเพิ่มมากขึ้น การศึกษา ทรานสคริปโตม เชิงเปรียบเทียบ พบหลักฐานของการคัดเลือกเชิงบวกที่กระทำต่อยีนของหนูในเมืองซึ่งมีบทบาทสำคัญในการล้างพิษและการเผาผลาญสารแปลกปลอม^{[ 16 ]}ยีนที่อยู่ภายใต้แรงกดดันการคัดเลือกเชิงบวก ได้แก่CYP1A1และ Hsp90 ซึ่งเกี่ยวข้องกับการเผาผลาญสารแปลกปลอมและยา^{[ 15 ]}ความเข้มข้นสูงของโลหะหนัก เช่น ตะกั่วและปรอทในดินสวนสาธารณะของนิวยอร์กซิตี้ก่อให้เกิดแรงกดดันการคัดเลือกเฉพาะที่น่าจะนำไปสู่การพัฒนาการปรับตัวทางเมตาบอลิซึมของประชากรในเมืองของP. leucopusต่อความเป็นพิษของสภาพแวดล้อมป่าในเมือง^{[ 16 ]}นอกจากนี้ การสัมผัสกับมลพิษยังเป็นที่ทราบกันดีว่าทำให้เกิดการไฮเปอร์เมทิลเลชันของ DNA ในหนูเท้าขาวในเมือง ยีนที่เข้ารหัส เอนไซม์ ดีเมทิเลสอยู่ภายใต้การคัดเลือกเชิงบวก ซึ่งหมายความว่าประชากรหนูเท้าขาวในเมืองที่อาศัยอยู่ในสภาพแวดล้อมที่มีมลพิษสูงจะได้รับประโยชน์เป็นพิเศษจากเอนไซม์ดีเมทิเลสที่ทำงานอยู่ซึ่งกำจัดหมู่เมทิลออกจาก DNA ^{[ 15 ]}

ประชากรหนูเท้าขาวที่อาศัยอยู่ในเมืองมีความหนาแน่นสูงในสวนสาธารณะในเมืองที่แยกตัวออกไป ซึ่งทำให้การแข่งขันของสเปิร์มเป็นแหล่งคัดเลือกที่มีประสิทธิภาพเป็นพิเศษในสภาพแวดล้อมในเมือง การศึกษาทางพันธุกรรมได้ระบุสัญญาณของการวิวัฒนาการระดับโมเลกุลของกระบวนการสืบพันธุ์ในประชากรหนูเท้าขาวในเมือง ยีนที่เกี่ยวข้องกับการสร้างสเปิร์มการเคลื่อนที่ของสเปิร์ม และปฏิสัมพันธ์ระหว่างสเปิร์มกับไข่ในหนูในเมืองแสดงรูปแบบการควบคุมที่แตกต่างกันเมื่อเทียบกับหนูในชนบท^{[ 16 ]}ดังนั้น การแข่งขันของสเปิร์มที่รุนแรงขึ้นของประชากรหนูที่มีความหนาแน่นสูงในป่าในเมืองจึงผลักดันให้พวกมันพัฒนาสเปิร์มที่เร็วและมีประสิทธิภาพมากกว่าหนูในชนบท

สภาพแวดล้อมในเมืองเต็มไปด้วยเชื้อโรคชนิดใหม่และชนิดที่คุ้นเคยจำนวนมากที่ถูกนำเข้ามาโดยการขนส่ง การจราจร และการค้า^{[ 17 ]}การเกิดของเชื้อโรคที่เพิ่มขึ้นเป็นตัวขับเคลื่อนการคัดเลือกแบบมีทิศทาง ซึ่งตัวแปรทางพันธุกรรมที่ต้านทานการติดเชื้อได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้นจะได้รับการคัดเลือก ผลลัพธ์ของการคัดเลือกนี้สามารถเห็นได้จากความแตกต่างทางพันธุกรรมระหว่าง ประชากร P. leucopus ในเมืองและ ชนบทที่ตำแหน่งที่ควบคุมการตอบสนองภูมิคุ้มกันโดยกำเนิดและการอักเสบ นอกจากนี้ การศึกษายังพบหลักฐานของการคัดเลือกเชิงบวกที่กระทำต่อยีนที่ปรับเปลี่ยนการรับรู้เชื้อโรคในหนูในเมือง โปรตีนควบคุมภูมิคุ้มกันที่พบในลิมโฟไซต์ Tมีการแสดงออกมากเกินไปในหนูในเมืองเมื่อเทียบกับประชากรในชนบท^{[ 18 ]}ผลการค้นพบเหล่านี้ชี้ให้เห็นว่าระบบภูมิคุ้มกันของหนูเท้าขาว NYC อาจกำลังวิวัฒนาการเพื่อรับรู้และตอบสนองต่อเชื้อโรคได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้น ความแตกต่างระหว่างหนูเท้าขาวในชนบทและในเมืองมีความโดดเด่นเป็นพิเศษเนื่องจากการไหลของยีนที่ถูกขัดขวางระหว่างประชากรเหล่านี้ ซึ่งเกิดจากสิ่งกีดขวางทางภูมิทัศน์ ได้แก่ ถนน ทางหลวง และทางเท้า การตรวจสอบความแข็งแกร่งของระบบภูมิคุ้มกันในP. leucopusมีความสำคัญเป็นพิเศษ เนื่องจากพวกมันมักติดเชื้อจากเชื้อโรคอันตราย เช่นฮันตาไวรัสและBorrelia burgdorferi ^{[ 19 ]}