ไลโซแบคทีเรียเลส
Lysobacterales เป็นอันดับแบคทีเรียภายในGammaproteobacteriaพวกมันเป็นหนึ่งในกลุ่มแบคทีเรียก่อโรค พืช ที่ ใหญ่ที่สุด โดยมีสายพันธุ์ต่างๆ เช่นXanthomonas citri , Xanthomonas euvesicatoria , Xanthomonas oryzaeและXylella fastidiosa [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] แบคทีเรียเหล่านี้ส่งผลกระทบต่อพืชทางการเกษตรที่สำคัญ ได้แก่ มะเขือเทศ กล้วย ส้ม ข้าว และกาแฟ สายพันธุ์ในสกุลStenotrophomonasเป็นเชื้อก่อโรคฉวยโอกาสที่ดื้อยาหลายชนิดซึ่งเป็นสาเหตุของการติดเชื้อในโรงพยาบาลในผู้ป่วยที่มีภูมิคุ้มกันบกพร่อง[ 7 ] [ 8 ]
ลักษณะเฉพาะ
Lysobacterales เป็นแบคทีเรียแกรมลบมี เอนไซม์ คะตาเลสไม่สร้างสปอร์และ เป็น แบคทีเรีย ที่ต้องการออกซิเจน [ 9 ]สมาชิกในอันดับนี้มีรูปร่างเป็นแท่ง ตรงและ ไม่มีโปรส ทีคา ในขณะที่สมาชิกบางชนิดไม่เคลื่อนที่ แต่บางชนิดในอันดับนี้เคลื่อนที่ได้โดยใช้แฟลเจลลา Stenotrophomonas เป็นสกุลเดียวใน Lysobacterales ที่สามารถ ลดไนเตรตได้
อนุกรมวิธาน
Lysobacterales ประกอบด้วยสกุลที่มีชื่อถูกต้อง 28 สกุลในสองวงศ์ ได้แก่Lysobacteraceae และ Rhodanobacteraceae [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] Lysobacteraceaeประกอบด้วย13 สกุล ในขณะที่Rhodanobacteraceae ประกอบด้วย 14 สกุล สามารถแยกแยะวงศ์เหล่านี้ออกจากกัน ได้โดยอาศัยอินเดลลายเซ็นที่อนุรักษ์ไว้ในโปรตีนหลากหลายชนิด ซึ่งเป็นลักษณะเฉพาะของแต่ละวงศ์[ 11 ]อินเดลเหล่านี้สอดคล้องกับการวิเคราะห์ไฟโลจีโนมิกส์ที่เผยให้เห็นกลุ่มย่อยสองกลุ่มที่แตกต่างกัน ซึ่งดูเหมือนว่าจะมีวิวัฒนาการที่แตกต่างกัน
XanthomonadalesและXanthomonadaceaeเป็นชื่อพ้องของLysobacteralesและLysobacteraceaeตามลำดับ[ 11 ] [ 13 ]
ตำแหน่งทางวิวัฒนาการ
Lysobacterales เป็นกลุ่มแบคทีเรียที่แยกตัวออกมาในช่วงต้นๆ ภายในGammaproteobacteriaและมักใช้เป็นรากของแผนภูมิวิวัฒนาการที่สร้างขึ้นสำหรับคลาสนี้[ 14 ]จนกระทั่งเมื่อไม่นานมานี้ อันดับ Xanthomonadales ครอบคลุมวงศ์Xanthomonadaceae , Algiphilaceae , Solimonadaceae , NevskiaceaeและSinobacteraceaeอย่างไรก็ตาม ไม่ พบ ลายเซ็นโมเลกุลใดที่ครอบคลุมทุกวงศ์[ 11 ]สิ่งมีชีวิตเหล่านี้ได้รับการจัดเรียงทางอนุกรมวิธานใหม่ โดย Lysobacterales รวมLysobacteraceaeซึ่งต่อมาถูกแบ่งออกเป็นสองวงศ์ การแบ่งนี้เป็นไปตามCSIที่พบเฉพาะในสมาชิกทั้งหมดของอันดับ Lysobacterales ที่ได้รับการแก้ไข ซึ่งให้การสนับสนุนอนุกรมวิธานที่ยอมรับในปัจจุบัน สปีชีส์อื่นๆ ทั้งหมดถูกย้ายไปที่Nevskialesซึ่งไม่มี CSI ร่วมกับ Lysobacterales แต่ยังคงเป็นญาติใกล้ชิดกันภายในGammaproteobacteria [ 11 ] Cardiobacteriales , Chromatiales , Methylococcales , LegionellalesและThiotrichalesเป็นกลุ่มที่มีการแตกแขนงลึกซึ่งเป็นเพื่อนบ้านทางวิวัฒนาการของสมาชิก Lysobacterales และ Nevskiales [ 11 ] [ 14 ]กลุ่มNevskialesประกอบด้วยวงศ์เดียว ( Salinisphaeraceae ) และหกสกุล ได้แก่Alkanibacter , Fontimonas , Hydrocarboniphaga , Nevskia , SolimonasและSteroidobacter [ 11 ] Wohlfahrtiimonas chitiniclasticaและตัวอ่อน Ignatzschineria เป็นสองชนิดที่ได้รับการยอมรับในอดีต ว่าเป็นสมาชิกของวงศ์Xanthomonadaceaeอย่างไรก็ตาม พวกมันไม่ได้มีลักษณะ ร่วมกัน กับวงศ์หรือกับกลุ่ม Xanthomonodales [ 11 ]สปีชีส์เหล่านี้สร้างการแตกแขนงที่ลึกภายในGammaproteobacteria ที่อยู่ใกล้เคียง และเป็นกลุ่มโมโนฟิเลติกกับ สมาชิก Cardiobacterialesดังนั้น สปีชีส์เหล่านี้จึงถูกจัดประเภทเป็นincertae sedis ในปัจจุบัน
วิวัฒนาการ
อนุกรมวิธานที่ได้รับการยอมรับในปัจจุบันนั้นอิงตามศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ (NCBI) [ 10 ]