การดราฟท์ผู้เล่นใหม่สำหรับ MLS ปี 2006ซึ่งจัดขึ้นในวันที่ 17 พฤศจิกายน 2006 เป็นการดราฟท์ พิเศษ สำหรับทีมใหม่ใน MLS อย่าง โทรอนโต เอฟซีโดยโทรอนโต เอฟซี เลือกผู้เล่น 10 คนจากกลุ่มผู้เล่นของสโมสร MLS ในปัจจุบัน

• แต่ละทีมสามารถเลือกผู้เล่นได้เพียงคนเดียวเท่านั้น จากทั้งหมด 12 ทีมในลีก มีสองทีมที่ไม่มีผู้เล่นได้รับการคัดเลือก
• แต่ละทีมได้รับอนุญาตให้ปกป้องผู้เล่นได้ 11 คนจากรายชื่อผู้เล่น 28 คน โดย ผู้เล่นในโครงการ Generation adidasจะได้รับการคุ้มครองโดยอัตโนมัติ แต่ผู้เล่นที่จบจากโครงการและขึ้นสู่ทีมชุดใหญ่เมื่อสิ้นสุดฤดูกาล 2006 จะไม่ได้รับการคุ้มครอง
• แต่ละทีมสามารถปล่อยผู้เล่นระดับนานาชาติอาวุโสไว้โดยไม่มีการคุ้มครองได้เพียงคนเดียวเท่านั้น

หลังจากการดราฟท์ RSL ได้แลกสิทธิ์การเลือกตัวผู้เล่น บางส่วน (ประมาณ 125,000 ดอลลาร์สหรัฐ) กับโตรอนโตเพื่อแลกกับเจสัน ไครส์เฮสเมอร์และโอ'รูร์คถูกแลกตัวไปโคลัมบัสเพื่อแลกกับสิทธิ์การเลือกตัวผู้เล่นอีกส่วนหนึ่ง รีแกนถูกแลกตัวไปเรดบูลส์เพื่อแลกกับเอ็ดสัน บัดเดิ ล กองหน้า เซริ อุซ์ถูกแลกตัวพร้อมกับสิทธิ์การเลือกตัวผู้เล่นรอบที่ 2 ใน การ ดราฟท์ MLS ปี 2007 ของโตรอนโตไปดัลลัสเพื่อแลกกับ รอนนี่ โอ' ไบรอัน กองกลาง เนท จาคัวถูกแลกตัวไปลอสแอนเจลิส กาแล็กซีเพื่อแลกกับสิทธิ์การเลือกตัวผู้เล่นบางส่วน ต่อมาดียาเชนโกถูกส่งตัวกลับไปดีซีเพื่อแลกกับสิทธิ์การเลือกตัวผู้เล่นในอนาคต คอตส์เชาถูกปล่อยตัว และแคนเซลาถูกแลกตัวไปโคโลราโด ราปิดส์ในช่วงกลางฤดูกาล นากามูระถูกแลกตัวไปชีวาส ยูเอสเอเพื่อแลกกับสิทธิ์การเลือกตัวผู้เล่นรอบแรกในการดราฟท์ MLS ปี 2008ทำให้ไม่มีผู้เล่นจากดราฟท์ขยายทีมเหลืออยู่ในรายชื่อผู้เล่นของ TFC

แหล่งที่มา

• สโมสร Toronto FC เตรียมเสริมทัพด้วยผู้เล่น 10 คน ในวันที่ 17 พฤศจิกายน