หน่วยนี้เริ่มต้นจากการเป็นกองบินทิ้งระเบิดที่ 44โดยทำการฝึกเครื่องบินทิ้งระเบิดขนาดกลางในสหรัฐอเมริกา ต่อมาได้ถูกส่งไปยังสมรภูมิยุโรปในช่วงฤดูร้อนปี 1943 แต่ก่อนที่จะเริ่มปฏิบัติการรบได้ ก็ได้รับการเปลี่ยนชื่อในเดือนพฤศจิกายนปี 1943 เป็นกองบินทิ้งระเบิดที่ 99และถูกจัดให้อยู่ในสังกัดกองบัญชาการทิ้งระเบิดที่ 9 ซึ่งเป็นหน่วยทิ้งระเบิดขนาดกลางของกองทัพอากาศที่ 9 ที่ได้รับการปรับปรุง ใหม่

หน่วยย่อยของกองบินที่ 99 ได้โจมตีสนามบินของข้าศึกในฝรั่งเศส เบลเยียม และเนเธอร์แลนด์ ระหว่างเดือนธันวาคม 1943 ถึงเดือนกุมภาพันธ์ 1944 เริ่มตั้งแต่เดือนมีนาคม 1944 พวกเขาได้ทิ้งระเบิดสะพานรถไฟและทางหลวง ถังน้ำมัน และฐานยิงขีปนาวุธ เพื่อเตรียมการสำหรับการบุกนอร์มังดี หน่วยย่อยของกองบินที่ 99 สนับสนุนการรุกของฝ่ายสัมพันธมิตรที่เมืองกาอองประเทศฝรั่งเศส และการทะลวงแนวป้องกันที่แซงต์-โลประเทศฝรั่งเศส ในเดือนกรกฎาคม 1944 ระหว่างเดือนตุลาคมถึงธันวาคม 1944 พวกเขาได้ทิ้งระเบิดสะพาน จุดตัดถนน และคลังอาวุธ เพื่อสนับสนุนการโจมตีแนวซีคฟรีดเมื่อวันที่ 16 ธันวาคม 1944 ในช่วงที่สภาพอากาศไม่เอื้ออำนวยต่อการบิน เยอรมันได้เปิดฉากการรุกครั้งใหญ่ที่รู้จักกันในชื่อยุทธการแห่งอาร์เดนส์ในป่าอาร์เดนส์ เมื่อสภาพอากาศดีขึ้น หน่วยของกองบินที่ 99 ได้ทิ้งระเบิดจุดส่งเสบียง ศูนย์สื่อสาร สะพาน สถานีรถไฟ ถนน และถังเก็บน้ำมัน^{[ 2 ]}

กองบินได้รับการเปิดใช้งานอีกครั้งในฐานะหน่วยสำรองภายใต้กองบัญชาการป้องกันภัยทางอากาศ (ADC) เมื่อวันที่ 26 มิถุนายน พ.ศ. 2490 ที่สนามบินบรูคส์ รัฐเท็กซัส (ต่อมาคือฐานทัพอากาศบรูคส์ ) ^{[ 2 ]} ในปี พ.ศ. 2491 เมื่อกองทัพอากาศปกติได้นำระบบการจัดองค์กรฐานทัพกองบิน มา ใช้กองบินนี้พร้อมกับกองบินสำรองหลายฐานทัพอื่นๆ ได้รับการกำหนดใหม่ให้เป็นกองพลอากาศ^{[ 2 ]} ในปีเดียวกันนั้นกองบัญชาการอากาศภาคพื้นทวีปได้เข้ามารับผิดชอบในการจัดการหน่วยสำรองและ หน่วย กองกำลังพิทักษ์ชาติทางอากาศจาก ADC ^{[ 3 ]}

กองบินที่ 44 ถูกยุบเมื่อกองบัญชาการกองทัพอากาศภาคพื้นทวีปปรับโครงสร้างใหม่ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2492 เพื่อตอบสนองต่อ งบประมาณด้านกลาโหมที่ลดลง ของประธานาธิบดีทรูแมนในปี พ.ศ. 2492 ซึ่งจำเป็นต้องลดจำนวนหน่วย (กลุ่ม – 48) ในกองทัพอากาศ^{[ 2 ] [ 4 ]}

ปฏิบัติการทิ้งระเบิดในยุโรปจนถึง วันสิ้นสุดสงครามโลก ครั้งที่สอง (VE Day)

• กองทัพอากาศที่สอง 1 มีนาคม 1943
• กองทัพอากาศที่แปดประมาณวันที่ 28 กรกฎาคม 1943
• กองบัญชาการสนับสนุนทางอากาศที่ 8ประมาณวันที่ 28 กันยายน 1943
• กองบัญชาการเครื่องบินทิ้งระเบิดที่ 9 (ต่อมาคือ กองบินทิ้งระเบิดที่ 9 กองบินที่ 9) ประมาณเดือนพฤศจิกายน 1943 ถึง 16 กันยายน 1945
• กองกำลังสนับสนุนกองทัพบกณ ท่าเรือขึ้นเรือ 17 กันยายน 1945 – 4 ตุลาคม 1945
• กองทัพอากาศที่สิบ 26 มิถุนายน 1947
• กองทัพอากาศที่สิบสี่ , 1 กรกฎาคม 2491
• กองทัพอากาศที่สิบสอง 12 มกราคม พ.ศ. 2492 – 27 มิถุนายน พ.ศ. 2492 ^{[ 2 ]}

• กองทัพอากาศที่เก้า

กองบินทิ้งระเบิดที่ 322 : 16 ตุลาคม 1943 – 15 กันยายน 1945 (เครื่องบินทิ้งระเบิด B-26 มารอเดอร์)

กองบินทิ้งระเบิดที่ 344 : ประมาณ 28 กุมภาพันธ์ 1944 – ประมาณ 30 เมษายน 1945

กองบินทิ้งระเบิดที่ 386 : 16 ตุลาคม 1943 – 27 กรกฎาคม 1945 (เครื่องบินทิ้งระเบิด B-26 มารอเดอร์)

กองบินทิ้งระเบิดที่ 391 : 25 มกราคม 1944 – 27 กรกฎาคม 1945 (เครื่องบินทิ้งระเบิด B-26 มารอเดอร์)

• กองบินทิ้งระเบิดที่ 394 : ประมาณ 22 มกราคม 1945 – 30 พฤศจิกายน 1945
• กองทัพอากาศสำรองแห่งสหรัฐอเมริกา

กองบินทิ้งระเบิดที่ 312 : 30 กรกฎาคม 1947 – 27 มิถุนายน 1949

กองบินทิ้งระเบิดที่ 401 : 1947–1949

กองบินทิ้งระเบิดที่ 447 : 1947–1949

• ฐานทัพอากาศซอลท์เลคซิตี้ รัฐยูทาห์ 1 มีนาคม 1943
• บิ๊กส์ฟิลด์รัฐเท็กซัส 14 พฤษภาคม 1943 – 4 กรกฎาคม 1943
• ฐานทัพอากาศอัลเดอร์มาสตัน (AAF-467) สหราชอาณาจักร 28 กรกฎาคม 1943
• ฐานทัพอากาศเกรตดันโมว์ (AAF-164) สหราชอาณาจักร 12 พฤศจิกายน 1943
• สนามบินโบมงต์-ซูร์-อัวส์ (A-60), 25 กันยายน 1944
• Tirlemont ( Tienen ) เบลเยียม 27 เมษายน พ.ศ. 2488
• สนามบินนามูร์ประเทศเบลเยียม 1 กรกฎาคม 1945 – ประมาณ 8 สิงหาคม 1945
• ค่ายไมล์ส สแตนดิช รัฐแมสซาชูเซตส์ 3 ตุลาคม 1945 – 4 ตุลาคม 1945
• Brooks Field (ต่อมาคือBrooks Air Force Base , Texas, 26 มิถุนายน พ.ศ. 2490 – 27 มิถุนายน พ.ศ. 2492 ^{[ 2 ]}

• เครื่องบิน Martin B-26 Marauderปี 1943–1945
• เครื่องบิน Douglas A-26 Invaderปี 1944–1945
• เครื่องบินโบอิ้ง บี-29 ซูเปอร์ฟอร์เทรสพ.ศ. 2491–2492 ^{[ 2 ]}

หน่วยงานนี้ได้รับเครื่องหมายเชิดชูเกียรติการบริการองค์กร ดังต่อไปนี้ :

• สงครามโลกครั้งที่สอง: สมรภูมิยุโรป แอฟริกา ตะวันออกกลาง (EAME) ^{[ 2 ]}

• ไม่ทราบชื่อผู้เสียชีวิต 1 มีนาคม 1943 – 11 พฤศจิกายน 1943
• พลตรี เฮอร์เบิร์ต บี. แทตเชอร์ , 12 พฤศจิกายน 1943
• พันเอก เรจินัลด์ เอฟซี แวนซ์, 7 พฤศจิกายน 1944
• พันตรี ชาร์ลส์ เอฟ. ซัลเตอร์, 1 กรกฎาคม 1945
• พันโท วิลเลียม ดับเบิลยู. ไบรเออร์, 13 กรกฎาคม 1945
• พลตรี ริชาร์ด ซี. แซนเดอร์ส 12 สิงหาคม 1945 – ประมาณ 4 ตุลาคม 1945
• ไม่ทราบวันที่ 26 มิถุนายน พ.ศ. 2490 – 27 มิถุนายน พ.ศ. 2492 ^{[ 2 ]}