กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 16 นาที

อะโพลิโปโปรตีน บี

เปลี่ยนทางจากตัวย่อ

อะโพลิโปโปรตีน บี ( ApoB ) เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนAPOB การวัดระดับของโปรตีนนี้มักใช้เพื่อตรวจหาความเสี่ยงของโรคหลอดเลือด หัวใจ ตีบ

อะโพลิโปโปรตีน บี

เอพีโอบี
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่นAPOB , FLDB, LDLCQ4, apoB-100, apoB-48, อะโพลิโปโปรตีน บี, FCHL2
รหัสภายนอกโอมิม : 107730 ; เอ็มจีไอ : 88052 ; โฮโมโลยีน : 328 ; GeneCards : APOB ; OMA : APOB - ออโธโลจี
ออร์โธล็อก
สายพันธุ์มนุษย์หนู
เอนเทรซ
วงดนตรี
ยูนิโปรท
RefSeq (mRNA)

NM_000384

NM_009693

RefSeq (โปรตีน)

NP_000375

NP_033823

สถานที่ตั้ง (UCSC)Chr 2: 21 – 21.04 Mbบทที่ 12: 8.03 – 8.07 เมกะไบต์
การค้นหาใน PubMed[ 3 ][ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ดู/แก้ไขเมาส์

อะโพลิโปโปรตีน บี ( ApoB ) เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนAPOB การวัดระดับของโปรตีนนี้มักใช้เพื่อตรวจหาความเสี่ยงของโรคหลอดเลือด หัวใจ ตีบ[ 5 ] [ 6 ]

ไอโซฟอร์ม

โปรตีนนี้พบในพลาสมาในสองไอโซฟอร์ม หลัก คือ ApoB48 และ ApoB100 ไอโซฟอร์มแรกถูกสังเคราะห์โดยลำไส้เล็ก เท่านั้น ไอโซฟอร์ม ที่สองถูกสังเคราะห์โดยตับ[ 7 ] ApoB -100 เป็นโปรตีนที่ใหญ่ที่สุดในกลุ่มโปรตีน apoB ประกอบด้วยกรดอะมิโน 4563 ตัว รวมถึงเปปไทด์สัญญาณ 27 ตัว และโปรตีนที่สมบูรณ์ 4536 ตัว[ 7 ]ทั้งสองไอโซฟอร์มถูกเข้ารหัสโดยAPOBและโดย ทรานสคริปต์ mRNA เดียว ที่มีขนาดใหญ่กว่า 16 kb ApoB48 ถูกสร้างขึ้นเมื่อ มีการสร้าง รหัสหยุด (UAA) ที่ตำแหน่ง 2153 โดยการแก้ไข RNAดูเหมือนว่าจะมียีนสไปลซิงเฉพาะเนื้อเยื่อที่ออกฤทธิ์แบบทรานส์ซึ่งกำหนดว่าไอโซฟอร์มใดจะถูกผลิตขึ้นในที่สุดหรืออีกทางหนึ่ง มีหลักฐานบางอย่างที่แสดงว่า องค์ประกอบ ที่ออกฤทธิ์แบบซิสหลายพันคู่เบสขึ้นไปเป็นตัวกำหนดว่าไอโซฟอร์มใดจะถูกผลิต ขึ้น

จากการแก้ไข RNA ทำให้ ApoB48 และ ApoB100 มี ลำดับ ปลายด้าน N ที่เหมือนกัน แต่ ApoB48 ขาด บริเวณจับกับ ตัวรับ LDL ที่ปลายด้าน C ของ ApoB100 ApoB48 ได้รับชื่อนี้เพราะมันประกอบขึ้นเป็น 48% ของลำดับของ ApoB100 ApoB48 เป็นโปรตีนที่มีลักษณะเฉพาะในไคโลไมครอนจากลำไส้เล็ก หลังจากที่ไขมันส่วนใหญ่ในไคโลไมครอนถูกดูดซึมไปแล้ว ApoB48 จะกลับไปยังตับในรูปของส่วนที่เหลือของไคโลไมครอน ซึ่งจะถูกดูดซึมเข้าสู่เซลล์และย่อยสลายไป

การทำงาน

อะโพลิโปโปรตีน บี (ApoB) เป็นอะ โพลิโปโปรตีนหลักของไคโลไมครอน , VLDL , Lp(a) , IDLและLDL (LDL—โดยทั่วไปรู้จักกันในชื่อ " คอเลสเตอรอล ไม่ดี " เมื่อกล่าวถึงโรคหัวใจและโรคหลอดเลือดโดยทั่วไป) ซึ่งมีหน้าที่ในการขนส่ง โมเลกุล ไขมัน ( ลิปิด ) รวมถึงคอเลสเตอรอลไปทั่วร่างกายไปยังเซลล์ ต่างๆ ในเนื้อเยื่อ ทั้งหมด แม้ว่าบทบาทหน้าที่ทั้งหมดของ ApoB ภายในอนุภาค LDL (และอนุภาคขนาดใหญ่กว่าทั้งหมด) ยังคงไม่ชัดเจนนัก แต่ก็เป็นโปรตีนหลักที่ทำหน้าที่จัดระเบียบ (ของเปลือกที่ซับซ้อนทั้งหมดที่ห่อหุ้ม/ขนส่งโมเลกุลไขมันอยู่ภายใน) ของอนุภาค และจำเป็นอย่างยิ่งสำหรับการก่อตัวของอนุภาคเหล่านี้ สิ่งที่ชัดเจนอีกอย่างคือ ApoB บนอนุภาค LDL ทำหน้าที่เป็นลิแกนด์สำหรับตัวรับ LDL ในเซลล์ต่างๆ ทั่วร่างกาย (กล่าวคือ ในทางที่ไม่เป็นทางการ ApoB บ่งชี้ว่าอนุภาคที่ขนส่งไขมันพร้อมที่จะเข้าสู่เซลล์ใดๆ ที่มีตัวรับ ApoB และส่งไขมัน ที่ ขนส่งอยู่ภายในเข้าไปในเซลล์เหล่านั้น)

บทบาทในระบบภูมิคุ้มกันโดยกำเนิด

ไลโปโปรตีนความหนาแน่นต่ำมากและไลโปโปรตีนความหนาแน่นต่ำขัดขวาง ระบบ การรับรู้จำนวนประชากรที่ควบคุมยีนที่จำเป็นสำหรับ การติดเชื้อ Staphylococcus aureus ที่รุกราน กลไกการต่อต้านเกี่ยวข้องกับการจับ ApoB กับ ฟีโรโมน ตัวกระตุ้นอัตโนมัติ ของ S.  aureus ป้องกันการส่งสัญญาณผ่านตัวรับ หนูที่ขาด ApoB จะไวต่อการติดเชื้อแบคทีเรียที่รุกรานมากขึ้น[ 8 ]

ความสำคัญทางคลินิก

มีหลักฐานมากมายที่แสดงว่าความเข้มข้นของ ApoB [ 9 ] [ 10 ]และโดยเฉพาะอย่างยิ่งการตรวจวิเคราะห์ NMR [ 11 ] (เฉพาะสำหรับความเข้มข้นของอนุภาค LDL) เป็นตัวบ่งชี้ที่ดีกว่าของสรีรวิทยาที่ขับเคลื่อนโรคหลอดเลือด/หัวใจ มากกว่าคอเลสเตอรอลรวมหรือ LDL-คอเลสเตอรอล (ซึ่งได้รับการส่งเสริมโดยNIH มานาน แล้วตั้งแต่ต้นทศวรรษ 1970) อย่างไรก็ตาม ด้วยเหตุผลหลักด้านต้นทุน/ความซับซ้อนในอดีต คอเลสเตอรอล และLDL-คอเลสเตอรอล ที่ประมาณค่า โดยการคำนวณยังคงเป็นการทดสอบไขมันที่ได้รับการส่งเสริมมากที่สุดสำหรับปัจจัยเสี่ยงของหลอดเลือดแดงแข็ง ApoB จะถูกวัดเป็นประจำโดยใช้การตรวจวิเคราะห์ทางภูมิคุ้มกัน เช่นELISAหรือเนเฟโลเมตรี วิธีการ NMRที่ได้รับการปรับปรุงและอัตโนมัติช่วยให้สามารถวัดความแตกต่างระหว่างอนุภาค ApoB ที่แตกต่างกันมากมายได้

โรคทางพันธุกรรม

ระดับ ApoB ที่สูงมีความเกี่ยวข้องกับโรคหัวใจ ภาวะไฮโปเบตาไลโปโปรตีนีเมียเป็นความผิดปกติทางพันธุกรรมที่อาจเกิดจากการกลายพันธุ์ในยีน ApoB, APOB [ 12 ] ภาวะอะเบตาไลโปโปรตีนีเมียเกิดจากการกลายพันธุ์ใน ยีน โปรตีนถ่ายโอนไตรกลีเซอไรด์ไมโครโซม , MTTP [ 13 ]

การกลายพันธุ์ในยีนAPOB100อาจทำให้เกิดภาวะไขมันในเลือดสูงในครอบครัว ได้เช่นกัน [ 14 ]ซึ่งเป็นรูปแบบทางพันธุกรรม (ลักษณะเด่นของออโตโซม) ของความผิดปกติทางเมตาบอลิซึม ของไขมัน ในเลือดสูง

บทบาทในภาวะดื้อต่ออินซูลิน

การผลิตอะโพลิโปโปรตีนบีมากเกินไปอาจส่งผลให้เกิดความเครียดของเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม ที่เกิดจากไขมัน และภาวะดื้อต่ออินซูลินในตับ[ 15 ]

บทบาทในไลโปโปรตีนและภาวะหลอดเลือดแดงแข็ง

ApoB100 พบในไลโปโปรตีนที่มาจากตับ ( VLDL , IDL , LDL [ 16 ] ) ที่สำคัญคือ มีโมเลกุล ApoB100 หนึ่งโมเลกุลต่อไลโปโปรตีนที่มาจากตับหนึ่งโมเลกุล ดังนั้น การใช้ข้อเท็จจริงนี้ เราสามารถหาปริมาณอนุภาคไลโปโปรตีนได้โดยการสังเกตความเข้มข้นรวมของ ApoB100 ในการไหลเวียน เนื่องจากมี ApoB100 เพียงหนึ่งโมเลกุลต่ออนุภาค จำนวนอนุภาคจึงสะท้อนโดยความเข้มข้นของ ApoB100 เทคนิคเดียวกันนี้สามารถนำไปใช้กับไลโปโปรตีนแต่ละประเภท (เช่น LDL) และทำให้สามารถนับจำนวนได้เช่นกัน

เป็นที่ทราบกันดีว่าระดับ ApoB100 มีความสัมพันธ์กับโรคหลอดเลือดหัวใจและเป็นตัวบ่งชี้ที่ดีกว่าความเข้มข้นของ LDL-C มาก[ 17 ] [ 18 ] [ 19 ]เหตุผล: LDL-C ไม่สะท้อนความเข้มข้นของอนุภาคที่แท้จริง และคอเลสเตอรอลไม่สามารถละลายหรือเคลื่อนที่ (ในน้ำ) ได้หากไม่มีอนุภาคพาหะ วิธีง่ายๆ ในการทำความเข้าใจข้อสังเกตนี้คือข้อเท็จจริงที่ว่า ApoB100 หนึ่งตัวต่ออนุภาค สะท้อนความเข้มข้นของอนุภาคไลโปโปรตีนที่แท้จริง (โดยไม่ขึ้นอยู่กับปริมาณคอเลสเตอรอลหรือไขมันอื่นๆ) ด้วยวิธีนี้ เราสามารถเข้าใจได้ว่าจำนวนอนุภาคไลโปโปรตีนที่มี ApoB100 ซึ่งสามารถนำไขมันเข้าสู่ผนังหลอดเลือดแดงได้นั้น เป็นตัวกำหนดที่สำคัญและเป็นตัวขับเคลื่อนของภาวะหลอดเลือดแดงแข็งและโรคหัวใจ

วิธีหนึ่งที่จะอธิบายเรื่องข้างต้นได้คือ การพิจารณาว่าอนุภาคไลโปโปรตีนจำนวนมาก โดยเฉพาะอย่างยิ่งอนุภาค LDL จำนวนมาก จะนำไปสู่การแข่งขันที่ตัวรับ ApoB100 (เช่น ตัวรับ LDL) ของเซลล์ส่วนปลาย เนื่องจากการแข่งขันดังกล่าวจะทำให้ระยะเวลาที่อนุภาค LDL อยู่ในระบบไหลเวียนโลหิตนานขึ้น จึงอาจนำไปสู่โอกาสที่อนุภาคเหล่านั้นจะเกิดปฏิกิริยาออกซิเดชันและ/หรือการดัดแปลงทางเคมีอื่นๆ มากขึ้น การดัดแปลงดังกล่าวอาจลดความสามารถของอนุภาคในการถูกกำจัดโดยตัวรับ LDL แบบดั้งเดิม และ/หรือเพิ่มความสามารถในการโต้ตอบกับตัวรับที่เรียกว่า "ตัวเก็บกวาด" ผลลัพธ์สุทธิคือการเบี่ยงเบนอนุภาค LDL ไปยังตัวรับเก็บกวาดเหล่านี้ ตัวรับเก็บกวาดมักพบในแมโครฟาจโดยแมโครฟาจที่เต็มไปด้วยคอเลสเตอรอลเป็นที่รู้จักกันดีในชื่อ " เซลล์โฟม " เซลล์โฟมเป็นลักษณะเฉพาะของรอยโรคหลอดเลือดแดงแข็ง นอกจากกลไกที่เป็นไปได้ของการสร้างเซลล์โฟมแล้ว การเพิ่มขึ้นของระดับอนุภาค LDL ที่ได้รับการดัดแปลงทางเคมีอาจนำไปสู่การเพิ่มขึ้นของ ความเสียหายต่อเยื่อบุหลอดเลือดได้เช่นกันปรากฏการณ์นี้เกิดขึ้นเนื่องจาก LDL ที่ถูกดัดแปลงมีฤทธิ์เป็นพิษต่อเยื่อบุหลอดเลือด รวมถึงความสามารถในการดึงดูดเซลล์ภูมิคุ้มกันและกระตุ้นการทำงานของเกล็ดเลือด

การศึกษา INTERHEART พบว่าอัตราส่วน ApoB100 / ApoA1 มีประสิทธิภาพมากกว่าในการทำนายความเสี่ยงต่อการเกิดโรคหัวใจวายในผู้ป่วยที่มีภาวะกล้ามเนื้อหัวใจขาดเลือดเฉียบพลัน เมื่อเทียบกับการวัดค่า ApoB100 หรือ ApoA1 เพียงอย่างเดียว[ 20 ] ( ApoA1เป็นโปรตีน HDL หลัก[ 21 ] ) ในประชากรทั่วไปยังไม่ชัดเจน แม้ว่าในการศึกษาล่าสุด ApoB จะเป็นตัวบ่งชี้ความเสี่ยงที่แข็งแกร่งที่สุดสำหรับเหตุการณ์เกี่ยวกับหลอดเลือดหัวใจ[ 22 ]

แนะนำให้รับประทาน อาหารเมดิเตอร์เรเนียนเพื่อลดระดับอะโพลิโปโปรตีนบี[ 23 ]

การศึกษาในหนู

หนูถูกใช้เป็นแบบจำลองสิ่งมีชีวิตในการศึกษา ApoB เนื่องจากพวกมันแสดงโปรตีนที่เทียบเท่ากันที่เรียกว่า ApoB ของหนู (mApoB) หนูที่แสดง mApoB มากเกินไปจะมีระดับ LDL เพิ่มขึ้นและระดับHDLลด ลง [ 24 ]หนูที่มีสำเนาของยีน mApoB ที่ใช้งานได้เพียงหนึ่งสำเนาจะแสดงผลตรงกันข้าม คือต้านทานต่อภาวะคอเลสเตอรอลสูงหนูที่ไม่มีสำเนาของยีนที่ใช้งานได้จะไม่สามารถมีชีวิตอยู่ได้[ 25 ]

ปฏิสัมพันธ์

มีการแสดงให้เห็นว่า ApoB มีปฏิสัมพันธ์กับ apo ( a) [ 26 ] PPIB [ 27 ]ตัวรับแคลซิโทนิน [ 27 ] [ 28 ] และ HSP90B1 [ 27 ] [ 28 ] เชื่อ กันว่า การมีปฏิสัมพันธ์ของ ApoB กับโปรตีโอไกลแคนคอลลาเจนและไฟโบรเนกตินทำให้เกิดภาวะหลอดเลือดแดงแข็ง[ 29 ] [ 30 ]

แผนที่เส้นทางแบบโต้ตอบ

คลิกที่ยีน โปรตีน และเมตาบอไลต์ด้านล่างเพื่อเชื่อมโยงไปยังบทความที่เกี่ยวข้อง[ § 1 ]

[[ไฟล์:
สแตติน_เส้นทาง_WP430go to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to article
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
สแตติน_เส้นทาง_WP430go to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to article
]]
แก้ไขเส้นทางของสแตติน
  1. แผนผังเส้นทางแบบโต้ตอบสามารถแก้ไขได้ที่ WikiPathways: " Statin_Pathway_WP430 "

ระเบียบข้อบังคับ

การแสดงออกของAPOBถูกควบคุมโดยองค์ประกอบควบคุมซิสในAPOB 5′ UTRและ 3′ UTR [ 31 ]

การแก้ไขอาร์เอ็นเอ

mRNA ที่เข้ารหัสโปรตีนนี้อยู่ภายใต้การแก้ไข RNA เฉพาะตำแหน่ง จากไซทิดีนเป็นยูริดีน (C เป็น U) ApoB100 และ ApoB48 ถูกเข้ารหัสโดยยีนเดียวกัน อย่างไรก็ตาม ความแตกต่างในโปรตีนที่แปลแล้วไม่ได้เกิดจากการสไปลซิงแบบทางเลือก แต่เกิดจากเหตุการณ์การแก้ไข RNA เฉพาะเนื้อเยื่อ การแก้ไข mRNA ของ ApoB เป็นตัวอย่างแรกของการแก้ไขที่พบในสัตว์มีกระดูกสันหลัง[ 32 ] การแก้ไข mRNA ของ ApoB เกิดขึ้นในสัตว์ เลี้ยงลูกด้วยนมที่มีรกทั้งหมด[ 33 ] การ แก้ไขเกิดขึ้นหลังการถอดรหัส เนื่องจากพอลินิวคลี โอไทด์ที่เกิดขึ้นใหม่ไม่มีนิวคลีโอไซด์ที่ได้รับการแก้ไข[ 34 ]

พิมพ์

การแก้ไข mRNA ของ ApoB จาก C เป็น U ต้องใช้คอมเพล็กซ์การแก้ไขหรือโฮโลเอนไซม์ (เอดิโทโซม) ซึ่งประกอบด้วยเอนไซม์แก้ไข mRNA ของ Apolipoprotein B, โพลีเปปไทด์เร่งปฏิกิริยา 1 (ApoBEC-1) รวมถึงปัจจัยเสริมอื่นๆ ApoBEC-1 เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนAPOBEC1 [ 35 ]เป็นสมาชิกของ ตระกูล ไซทิดีนดีอะมีเนส ApoBEC-1 เพียงอย่างเดียวไม่เพียงพอสำหรับการแก้ไข mRNA ของ ApoB [ 36 ]และต้องใช้ปัจจัยเสริมอย่างน้อยหนึ่งอย่าง คือปัจจัยเสริม APOBEC1 (A1CF) [ 37 ]เพื่อให้การแก้ไขเกิดขึ้น A1CF ประกอบด้วยส่วนที่ซ้ำกัน 3 ส่วน ทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยที่จับกับ RNA และนำทาง ApoBEC-1 ไปยัง mRNA ของ ApoB ที่อยู่ด้านล่างของไซทิดีนที่ได้รับการแก้ไข[ 38 ]ปัจจัยเสริมอื่นๆ เป็นที่ทราบกันว่าเป็นส่วนหนึ่งของโฮโลเอนไซม์ โปรตีนเหล่านี้บางส่วนได้รับการระบุแล้ว ได้แก่ โปรตีนที่จับกับ CUG 2 ( CUGBP2 ) [ 39 ] SYNCRIP (โปรตีนที่จับกับ RNA ที่อุดมไปด้วยไกลซีน-อาร์จินีน-ไทโรซีน, GRY-RBP) [ 40 ] ไรโบ นิวคลีโอโปรตีนนิวเคลียร์เฮเทอโรจีนัส (hnRNP)-C1 ( HNRNPC ) [ 41 ]โปรตีนที่จับกับ ApoBEC-1 ABBP1 ( HNRNPAB ), ABBP2 [ 42 ]โปรตีนที่จับกับตัวควบคุมการตัดต่อแบบ KH ( KHSRP ), Bcl-2-associated athanogene 4 ( BAG4 ) [ 43 ]และปัจจัยเสริม (AUX)240 [ 44 ]โปรตีนเหล่านี้ทั้งหมดได้รับการระบุโดยใช้การทดสอบการตรวจจับและได้รับการพิสูจน์แล้วว่ามีปฏิสัมพันธ์กับ ApoBEC-1, A1CF หรือ ApoB RNA หน้าที่ของโปรตีนเสริมเหล่านี้ในคอมเพล็กซ์การแก้ไขยังไม่เป็นที่ทราบ นอกจากการแก้ไข mRNA ของ ApoB แล้ว เอดิตโซม ApoBEC-1 ยังแก้ไข mRNA ของNF1ด้วย การแก้ไข mRNA ของ ApoB mRNA เป็นตัวอย่างที่ชัดเจนที่สุดของการแก้ไข RNA ประเภท C เป็น U ในมนุษย์

ที่ตั้ง

แม้ว่าจะเป็นทรานสคริปต์ที่มีความยาว 14,000 หน่วยย่อย แต่ไซทิดีนเพียงตัวเดียวก็ถูกกำหนดเป้าหมายสำหรับการแก้ไข ภายใน mRNA ของ ApoB พบลำดับที่ประกอบด้วยนิวคลีโอไทด์ 26 ตัวที่จำเป็นสำหรับการแก้ไข ซึ่งเรียกว่าโมทีฟการแก้ไข นิวคลีโอไทด์เหล่านี้ (6662–6687) ถูกกำหนดให้มีความสำคัญโดยการทดลองการกลายพันธุ์เฉพาะจุด[ 45 ]ส่วนของลำดับนี้ที่มีความยาว 11 นิวคลีโอไทด์ ซึ่งอยู่ห่างจากตำแหน่งการแก้ไขไปทางปลายน้ำ 4–5 นิวคลีโอไทด์ เป็นบริเวณสำคัญที่เรียกว่าลำดับการยึด[ 46 ]พบบริเวณที่เรียกว่าองค์ประกอบตัวเว้นวรรคที่อยู่ระหว่างนิวคลีโอไซด์ที่แก้ไขกับลำดับการยึดนี้ 2–8 นิวคลีโอไทด์[ 47 ]นอกจากนี้ยังมีลำดับควบคุมอยู่ทางด้าน 3′ ของตำแหน่งการแก้ไขด้วย เชื่อกันว่าบริเวณออกฤทธิ์ของ ApoBEC-1 ซึ่งเป็นส่วนประกอบเร่งปฏิกิริยาของเอนไซม์โฮโลเอนไซม์สำหรับการแก้ไข จะจับกับบริเวณที่อุดมไปด้วย AU ของลำดับการยึดเกาะ โดยอาศัย ACF ในการจับคอมเพล็กซ์กับ mRNA [ 48 ] หมู่ไซทิดีนที่ถูกแก้ไขจะอยู่ที่นิวคลีโอไทด์ 6666 ซึ่งอยู่ในเอ็กซอน 26 ของยีน การแก้ไขที่ตำแหน่งนี้ส่งผลให้เกิดการเปลี่ยนแปลงโคดอนจากโคดอนกลูตามีน (CAA) ไปเป็นโคดอนหยุด (UAA) ที่อยู่ในเฟรมเดียวกัน[ 32 ] การสร้างแบบจำลองด้วยคอมพิวเตอร์ตรวจพบว่าการแก้ไขจะเกิดขึ้นได้ก็ต่อเมื่อไซทิดีนที่ถูกแก้ไขอยู่ในลูป[ 46 ]การเลือกไซทิดีนที่ถูกแก้ไขยังขึ้นอยู่กับโครงสร้างทุติยภูมิของ RNA โดยรอบเป็นอย่างมาก นอกจากนี้ยังมีข้อบ่งชี้บางประการว่าบริเวณลูปนี้เกิดขึ้นระหว่างลำดับการยึดเกาะและบริเวณควบคุม 3′ ของ mRNA ของ ApoB [ 49 ]โครงสร้างทุติยภูมิที่คาดการณ์ไว้ซึ่งเกิดจาก mRNA ของ ApoB เชื่อกันว่าจะช่วยให้เกิดการสัมผัสระหว่างสารตกค้างที่จะได้รับการแก้ไขกับตำแหน่งที่ใช้งานของ APOBEC1 รวมถึงการจับกับ ACF และปัจจัยเสริมอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับเอดิโทโซม

ระเบียบข้อบังคับ

การแก้ไข mRNA ของ ApoB ในมนุษย์นั้นถูกควบคุมโดยเนื้อเยื่อ โดย ApoB48 เป็นโปรตีน ApoB หลักของลำไส้เล็กในมนุษย์ พบในปริมาณที่น้อยกว่าในลำไส้ใหญ่ ไต และกระเพาะอาหาร พร้อมกับเวอร์ชันที่ไม่ได้รับการแก้ไข[ 50 ] การแก้ไขยังถูกควบคุมโดยการพัฒนา โดยเวอร์ชันที่ไม่ได้รับการแก้ไขจะถูกแปลเฉพาะในช่วงต้นของการพัฒนา แต่รูปแบบที่ได้รับการแก้ไขจะเพิ่มขึ้นในระหว่างการพัฒนาในเนื้อเยื่อที่สามารถเกิดการแก้ไขได้[ 51 ] [ 52 ] ระดับการแก้ไขของ mRNA ของ ApoB แสดงให้เห็นว่าแตกต่างกันไปตามการเปลี่ยนแปลงของอาหาร การสัมผัสกับแอลกอฮอล์ และระดับฮอร์โมน[ 53 ] [ 54 ] [ 55 ]

การอนุรักษ์

การแก้ไข mRNA ของ ApoB เกิดขึ้นในหนูและหนูแรตเช่นกัน ในทางตรงกันข้ามกับมนุษย์ การแก้ไขเกิดขึ้นในตับของหนูและหนูแรตด้วยความถี่สูงถึง 65% [ 56 ]ไม่พบในนกหรือสัตว์ชนิดที่เล็กกว่า[ 57 ]

ผลที่ตามมา

โครงสร้าง

การแก้ไขส่งผลให้เกิดการเปลี่ยนแปลงของโคดอน ทำให้เกิดโคดอนหยุดในเฟรม ส่งผลให้เกิดการแปลโปรตีนที่สั้นลง คือ ApoB48 โคดอนหยุดนี้ส่งผลให้เกิดการแปลโปรตีนที่ขาดปลายคาร์บอกซิล ซึ่งมีโดเมนการจับ LDLR ของโปรตีน โปรตีน ApoB100 ที่สมบูรณ์ ซึ่งมีกรดอะมิโนเกือบ 4500 ตัว พบได้ใน VLDL และ LDL เนื่องจากหลายส่วนของ ApoB100 อยู่ใน สภาวะ แอมฟิพาติกโครงสร้างของบางโดเมนจึงขึ้นอยู่กับสภาวะของไขมัน อย่างไรก็ตาม เป็นที่ทราบกันดีว่ามันมีการพับโดยรวมเหมือนกับ LDL โดยมีโดเมนหลักห้าโดเมน เมื่อเร็วๆ นี้ โครงสร้างแรกของ LDL ที่อุณหภูมิร่างกายมนุษย์ในสภาวะปกติถูกค้นพบโดยใช้กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบไครโอที่ความละเอียด 16 อังสตรอม[ 58 ]การพับโดยรวมของ ApoB-100 ได้รับการยืนยันแล้ว และความไม่สม่เสมอในโครงสร้างเฉพาะที่ของโดเมนบางส่วนได้รับการทำแผนที่แล้ว

การทำงาน

การแก้ไขถูกจำกัดเฉพาะทรานสคริปต์ที่แสดงออกในลำไส้เล็กโปรตีนเวอร์ชันที่สั้นกว่านี้มีหน้าที่เฉพาะในลำไส้เล็ก หน้าที่หลักของ ApoB100 ที่แสดงออกใน ตับ แบบเต็มความยาว คือเป็นลิแกนด์สำหรับการกระตุ้น LDL-R อย่างไรก็ตาม การแก้ไขส่งผลให้โปรตีนขาดบริเวณการจับ LDL-R นี้ ซึ่งเปลี่ยนแปลงหน้าที่ของโปรตีนและโปรตีน ApoB48 ที่สั้นกว่า มีหน้าที่เฉพาะที่เกี่ยวข้องกับลำไส้เล็ก ApoB48 เหมือนกับ 48% ของปลายอะมิโนของ ApoB100 [ 59 ]หน้าที่ของไอโซฟอร์มนี้คือการดูดซึมไขมันของลำไส้เล็กและเกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ การประกอบ และการหลั่งไคโลไมครอน ไคโลไมครอนเหล่านี้ทำหน้าที่ขนส่งไขมันจากอาหารไปยังเนื้อเยื่อ ในขณะที่ไคโลไมครอนที่เหลืออยู่ พร้อมกับไขมันตกค้างที่เกี่ยวข้อง จะถูกดูดซึมโดยตับภายใน 2-3 ชั่วโมง ผ่านการทำงานร่วมกันของอะโพลิโปโปรตีนอี (ApoE) กับตัวรับไลโปโปรตีน ApoE เป็นโปรตีน ApoB ที่เด่นในลำไส้เล็กของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมส่วนใหญ่ มันเป็นโปรตีนสำคัญในวิถีการเผาผลาญไลโปโปรตีนจากภายนอก โปรตีนในลำไส้ที่มี ApoB48 จะถูกเผาผลาญเป็นอนุภาคไคโลไมครอนที่เหลืออยู่ ซึ่งจะถูกดูดซึมโดยตัวรับที่เหลืออยู่

ดูเพิ่มเติม

อ่านเพิ่มเติม

  • Mahley RW, Innerarity TL, Rall SC, Weisgraber KH (1985). "ไลโปโปรตีนในพลาสมา: โครงสร้างและหน้าที่ของอะโปไลโปโปรตีน" . J. Lipid Res . 25 (12): 1277– 1294. doi : 10.1016/S0022-2275(20)34443-6 . PMID 6099394 . 
  • อิทาคุระ เอช, มัตสึโมโตะ เอ (1995) "[อะโพลิโปโปรตีน บี]". นิปปอน รินโช . 52 (12): 3113– 3118. PMID 7853698 . 
  • Chumakova OS, Zateĭshchikov DA, Sidorenko BA (2006). "[Apolipoprotein B: โครงสร้าง หน้าที่ ความหลากหลายทางพันธุกรรม และความสัมพันธ์กับหลอดเลือดแดงแข็ง]". Kardiologiia . 45 (6): 43– 55. PMID 16007035 . 
  • Ye J (2007). "การพึ่งพาเส้นทางการเผาผลาญคอเลสเตอรอลของโฮสต์สำหรับวงจรชีวิตของไวรัสตับอักเสบซี" PLOS Pathog 3 ( 8) e108. doi : 10.1371/journal.ppat.0030108 . PMC 1959368 . PMID 17784784 .  
  • ฐานข้อมูลการแก้ไข RNA (DARNED )
  • การวิจัยประยุกต์เกี่ยวกับอะโพลิโปโปรตีน-บี
  • หน้าแสดงตำแหน่งจีโนม APOBของมนุษย์และ รายละเอียดเกี่ยวกับยีน APOBในUCSC Genome Browser
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Apolipoprotein_B&oldid=1358285494 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ อะโพลิโปโปรตีน บี

อะโพลิโปโปรตีน บี ( ApoB ) เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนAPOB การวัดระดับของโปรตีนนี้มักใช้เพื่อตรวจหาความเสี่ยงของโรคหลอดเลือด หัวใจ ตีบ

ไอโซฟอร์ม

โปรตีน นี้พบใน พลาสมา ในสอง ไอโซฟอร์ม หลัก คือ ApoB48 และ ApoB100 ไอโซฟอร์มแรกถูกสังเคราะห์โดย ลำไส้เล็ก เท่านั้น ไอโซฟอร์ม ที่สองถูกสังเคราะห์โดยตับ [ 7 ] ApoB -100 เป็นโปรตีนที่ใหญ่ที่สุดในกลุ่มโปรตีน apoB ประกอบด้วยกรดอะมิโน 4563 ตัว รวมถึงเปปไทด์สัญญาณ 27...

การทำงาน

อะโพลิโปโปรตีน บี (ApoB) เป็นอะ โพลิโปโปรตีน หลักของ ไคโลไมครอน , VLDL , Lp(a) , IDL และ LDL (LDL—โดยทั่วไปรู้จักกันในชื่อ " คอเลสเตอรอล ไม่ดี " เมื่อกล่าวถึง โรคหัวใจ และ โรคหลอดเลือด โดยทั่วไป) ซึ่งมีหน้าที่ในการขนส่ง โมเลกุล ไขมัน ( ลิปิด ) รวมถึง...

บทบาทในระบบภูมิคุ้มกันโดยกำเนิด

ไลโปโปรตีนความหนาแน่นต่ำมาก และ ไลโปโปรตีนความหนาแน่นต่ำ ขัดขวาง ระบบ การรับรู้จำนวนประชากร ที่ควบคุมยีนที่จำเป็นสำหรับ การติดเชื้อ Staphylococcus aureus ที่รุกราน กลไกการต่อต้านเกี่ยวข้องกับการจับ ApoB กับ ฟีโรโมน ตัวกระตุ้นอัตโนมัติ ของ S.