อ่าน 3 นาที
อะมิเดส
ใน ทาง เอนไซม์วิทยา อะ มิเดส ( EC 3.5.1.4 , อะซิลอะ มิเดส, อะซิลเลส (คำที่ทำให้เข้าใจผิด ) , อะ มิโดไฮโดรเลส (คำที่ไม่ชัดเจน) , ดีอะมิเนส (คำ ที่ ไม่ชัดเจน), แฟตตี้อะซิลอะมิเดส ,...
อะมิเดส
| อะมิเดส | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ตัวระบุ | |||||||||
| หมายเลข EC | 3.5.1.4 | ||||||||
| หมายเลข CAS | 9012-56-0 | ||||||||
| ฐานข้อมูล | |||||||||
| อินท์เอ็นซ์ | มุมมองของ IntEnz | ||||||||
| เบรนด้า | เบรนด้าเข้าร่วม | ||||||||
| เอ็กซ์แพซี่ | มุมมองของ NiceZyme | ||||||||
| เคกก์ | รายการ KEGG | ||||||||
| เมตาไซค์ | วิถีการเผาผลาญ | ||||||||
| ไพรแอม | ประวัติโดยย่อ | ||||||||
| โครงสร้างPDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| ออนโทโลยีของยีน | อามิโก้ / ควิกโก้ | ||||||||
| |||||||||
| อะมิเดส | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
โครงสร้างเอกซ์เรย์ของเอนไซม์เปปไทด์อะมิเดสจากStenotrophomonas maltophiliaที่ความละเอียด 1.4 Å | |||||||
| ตัวระบุ | |||||||
| เครื่องหมาย | อะมิเดส | ||||||
| พีแฟม | PF01425 | ||||||
| อินเตอร์โปร | IPR000120 | ||||||
| โปรไซต์ | PDOC00494 | ||||||
| สโคป2 | 1ocm / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| ซูเปอร์แฟมิลี OPM | 55 | ||||||
| โปรตีน OPM | 1 ม.5 | ||||||
| เมมเบรน | 325 | ||||||
| |||||||
ใน ทาง เอนไซม์วิทยาอะมิเดส ( EC 3.5.1.4 , อะซิลอะมิเดส, อะซิลเลส (คำที่ทำให้เข้าใจผิด ) ,อะ มิโดไฮโดรเลส (คำที่ไม่ชัดเจน) , ดีอะมิเนส (คำ ที่ ไม่ชัดเจน), แฟตตี้อะซิลอะมิเดส , เอ็น-อะเซ ทิลอะมิโนไฮโดรเลส (คำที่ไม่ชัดเจน) )คือเอนไซม์ที่เร่งปฏิกิริยา ไฮโดร ไลซิสของอะไมด์ ดังนั้นสารตั้งต้น สองชนิด ของเอนไซม์นี้คือ อะไมด์และH₂O ในขณะที่ ผลิตภัณฑ์สองชนิดของเอนไซม์นี้คือ โมโนคาร์บอกซิเลตและNH₃
เอนไซม์นี้อยู่ในกลุ่มไฮโดรเลสชื่อทางระบบของเอนไซม์กลุ่มนี้คือ อะซิ ลอะไมด์ อะมิโดไฮโดรเล ส ชื่ออื่นๆ ที่ใช้กันทั่วไป ได้แก่อะซิลอะมิ เด ส อะซิ ลเล ส อะมิโดไฮโดรเล ส ดีอะมิเนส แฟตตี อะซิลอะมิเดสและเอ็น-อะเซทิล อะมิโนไฮโดรเลส เอนไซม์นี้มีส่วนร่วมใน กระบวนการเมตาบอลิซึม 6 กระบวนการ ได้แก่วัฏจักรยูเรียและเมตาบอลิซึมของหมู่เอมีนเม ตาบอลิซึม ของ ฟีนิลอะลานี น เมตาบอลิซึม ของ ทริปโตเฟน เมตาบอลิซึมของกรดไซยาโนอะมิโนการย่อยสลายเบนโซเอตผ่านการเชื่อมต่อโคเอและการย่อยสลายสไตรีน
อะมิเดสประกอบด้วย ลำดับ กรดอะมิโนที่อนุรักษ์ไว้ประมาณ 130 ตัว ซึ่งรู้จักกันในชื่อ ลำดับ AS เอนไซม์เหล่านี้แพร่หลาย พบได้ทั้งในโปรคาริโอตและยูคาริโอต เอนไซม์ AS ทำหน้าที่เร่งปฏิกิริยา ไฮโดรไลซิ สของพันธะอะไมด์ (CO-NH2 )แม้ว่าตระกูลนี้จะมีความแตกต่างกันอย่างมากในแง่ของ ความจำเพาะ ของสารตั้งต้นและหน้าที่ อย่างไรก็ตาม เอนไซม์เหล่านี้ยังคงรักษารูปแบบโครงสร้างอัลฟา/เบตา/อัลฟาหลักไว้ โดยที่ลักษณะทางโครงสร้างของครึ่งปลาย N และ C คล้ายคลึงกัน เอนไซม์ AS มีลักษณะเฉพาะคือมีบริเวณปลาย C ที่อนุรักษ์ไว้สูง อุดมไปด้วยกรด อะมิโนซีรีนและไกลซีน แต่ไม่มีกรดแอสปาร์ติกและฮิสติดีนดังนั้นจึงแตกต่างจาก ซีรีนไฮ โดรเล สแบบคลาสสิก เอนไซม์เหล่านี้มีไตรแอดเร่งปฏิกิริยา Ser-Ser-Lys ที่เป็นเอกลักษณ์และ อนุรักษ์ไว้ สูง ใช้สำหรับการไฮโดรไลซิสอะไมด์ แม้ว่ากลไกการเร่งปฏิกิริยาสำหรับ การสร้าง ตัวกลาง อะซิล-เอนไซม์ อาจแตกต่างกันไปในแต่ละเอนไซม์[ 1 ]
ตัวอย่างของเอนไซม์ที่มีลายเซ็น AS ได้แก่:
- เปปไทด์อะมิเดส (Pam) [ 1 ]ซึ่งเร่งปฏิกิริยาไฮโดรไลซิสของพันธะอะไมด์ปลาย C ของเปปไทด์
- ไฮ โดรเลสของกรดไขมัน อะไมด์ [ 2 ]ซึ่งไฮโดรไลซ์ สารตั้งต้น ของกรดไขมันอะไมด์ (เช่น แคนนาบินอยด์อนันดาไมด์และโอเลอะไมด์ที่ทำให้เกิดการนอนหลับ) จึงควบคุมระดับและระยะเวลาของการส่งสัญญาณที่เกิด จาก ตัวส่งสัญญาณไขมันประเภทต่างๆ นี้
- Malonamidase E2 [ 3 ]ซึ่งเร่งปฏิกิริยาไฮโดรไลซิสของมาโลนาเมตเป็นมาโลเนตและแอมโมเนีย และมีส่วนเกี่ยวข้องในการขนส่งไนโตรเจนที่ตรึงไว้จากแบคทีรอยด์ไปยังเซลล์พืช ในการเผาผลาญไนโตรเจนแบบพึ่งพาอาศัยกัน
- หน่วยย่อย A ของ Glu-tRNA(Gln) amidotransferase [ 4 ]เอนไซม์เฮเทอโรไตรเมอริกที่เร่งปฏิกิริยาการสร้าง Gln-tRNA(Gln) โดยการทรานส์อะมิเดชันของ Glu-tRNA(Gln) ที่มีอะซิลเลชันผิดพลาดผ่านอะมิโดไลซิสของกลูตามีน
การศึกษาโครงสร้าง
ณ ปลายปี 2018 มีการไขปริศนา โครงสร้าง ได้ 162 โครงสร้าง สำหรับตระกูลนี้ ซึ่งสามารถเข้าถึงได้ที่Pfam Archived 2021-09-18 บนWayback Machine
อ่านเพิ่มเติม
- Bray HG, James SP, Raffan IM, Ryman BE, Thorpe WV (1949). "ชะตากรรมของกรดอินทรีย์และอะไมด์บางชนิดในกระต่าย 7. อะไมเดสจากตับกระต่าย" . Biochem. J . 44 (5): 618– 625. doi : 10.1042/bj0440618 . PMC 1274617 .
- Bray HG, James SP, Thorpe WV, Wasdell MR (1950). "ชะตากรรมของกรดอินทรีย์และเอไมด์บางชนิดในกระต่าย 11 ข้อสังเกตเพิ่มเติมเกี่ยวกับการไฮโดรไลซิสของเอไมด์โดยสารสกัดจากเนื้อเยื่อ" . Biochem. J . 47 (3): 294– 299. doi : 10.1042/bj0470294 . PMC 1275209 . PMID 14800883 .
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ อะมิเดส
ใน ทาง เอนไซม์วิทยา อะ มิเดส ( EC 3.5.1.4 , อะซิลอะ มิเดส, อะซิลเลส (คำที่ทำให้เข้าใจผิด ) , อะ มิโดไฮโดรเลส (คำที่ไม่ชัดเจน) , ดีอะมิเนส (คำ ที่ ไม่ชัดเจน), แฟตตี้อะซิลอะมิเดส ,...
การศึกษาโครงสร้าง
ณ ปลายปี 2018 มีการไขปริศนา โครงสร้าง ได้ 162 โครงสร้าง สำหรับตระกูลนี้ ซึ่งสามารถเข้าถึงได้ที่Pfam Archived 2021-09-18 บนWayback Machine
อ่านเพิ่มเติม
Bray HG, James SP, Raffan IM, Ryman BE, Thorpe WV (1949). "ชะตากรรมของกรดอินทรีย์และอะไมด์บางชนิดในกระต่าย 7. อะไมเดสจากตับกระต่าย" . Biochem. J . 44 (5): 618– 625. doi : 10.1042/bj0440618 . PMC 1274617 . Bray HG, James SP, Thorpe WV, Wasdell MR (1950).