แบบจำลองเบย์เซียนของกายวิภาคศาสตร์เชิงคำนวณ
กายวิภาคศาสตร์เชิงคำนวณ (Computational anatomy หรือ CA)เป็นสาขาหนึ่งในด้านการถ่ายภาพทางการแพทย์ที่ มุ่งเน้นการศึกษาเกี่ยวกับรูปร่างและโครงสร้างทางกายวิภาคในระดับที่มองเห็นได้หรือระดับมหภาคสาขานี้มีการนิยามอย่างกว้างขวางและครอบคลุมพื้นฐานในด้านกายวิภาคศาสตร์คณิตศาสตร์ประยุกต์และคณิตศาสตร์บริสุทธิ์รวมถึงการถ่ายภาพทางการแพทย์ประสาทวิทยาฟิสิกส์ความน่าจะเป็นและสถิติโดยมุ่งเน้นที่โครงสร้างทางกายวิภาคที่ถูกถ่ายภาพ มากกว่าอุปกรณ์การถ่ายภาพทางการแพทย์ จุดสนใจหลักของสาขาย่อยกายวิภาคศาสตร์เชิงคำนวณในด้านการถ่ายภาพทางการแพทย์คือการแมปข้อมูลข้ามระบบพิกัดทางกายวิภาค ซึ่งส่วนใหญ่เป็นข้อมูลหนาแน่นที่วัดได้จากภาพถ่ายด้วยคลื่นแม่เหล็กไฟฟ้า (MRI) การนำแนวคิดเรื่องการไหลมาใช้ใน CA ซึ่งคล้ายกับสมการการเคลื่อนที่ที่ใช้ในพลศาสตร์ของไหล ใช้ประโยชน์จากแนวคิดที่ว่าพิกัดหนาแน่นในการวิเคราะห์ภาพเป็นไปตามสมการการเคลื่อนที่แบบลากรางจ์และแบบออยเลอร์ในแบบจำลองที่อิงตามการไหลของ Lagrangian และ Eulerian ของ diffeomorphism ข้อจำกัดจะเกี่ยวข้องกับคุณสมบัติทางโทโพโลยี เช่น เซตเปิดที่ได้รับการรักษาไว้ พิกัดที่ไม่ตัดกันหมายถึงความเป็นเอกลักษณ์และการมีอยู่ของการแมปผกผัน และเซตที่เชื่อมต่อกันยังคงเชื่อมต่อกัน การใช้วิธี diffeomorphic เติบโตอย่างรวดเร็วและครอบงำสาขาของวิธีการแมปหลังจากบทความต้นฉบับของ Christensen [ 1 ] โดยมีวิธีการที่รวดเร็วและสมมาตรให้ใช้งานได้[ 2 ] [ 3 ]
แบบจำลองทางสถิติหลัก

แบบจำลองทางสถิติหลักของกายวิภาคศาสตร์เชิงคำนวณในบริบทของการถ่ายภาพทางการแพทย์คือแบบจำลองแหล่งกำเนิด-ช่องสัญญาณของทฤษฎีแชนนอนโดยแหล่งกำเนิดคือแม่แบบภาพที่เปลี่ยนแปลงได้และเอาต์พุตของช่องสัญญาณคือเซ็นเซอร์รับภาพที่มีค่าที่สังเกตได้(ดูรูป) ความสำคัญของแบบจำลองแหล่งกำเนิด-ช่องสัญญาณคือการจำลองความแปรผันในโครงสร้างทางกายวิภาคแยกจากความแปรผันของเซ็นเซอร์รับภาพทางการแพทย์ทฤษฎีของเบย์สกำหนดว่าแบบจำลองนี้มีลักษณะเฉพาะโดยความน่าจะเป็นล่วงหน้าของแหล่งกำเนิดและความหนาแน่นแบบมีเงื่อนไขของค่าที่สังเกตได้
โดยมีเงื่อนไขว่า.
ในทฤษฎีแม่แบบที่ปรับเปลี่ยนรูปทรงได้ ภาพจะเชื่อมโยงกับแม่แบบ โดยการปรับเปลี่ยนรูปทรงเป็นกลุ่มที่กระทำต่อแม่แบบ ดูการกระทำของกลุ่มในกายวิภาคศาสตร์เชิงคำนวณ สำหรับการกระทำของภาพความน่าจะเป็นล่วงหน้าของกลุ่มจะเหนี่ยวนำให้เกิดความน่าจะเป็นล่วงหน้าของภาพซึ่งเขียนเป็นความหนาแน่น ความน่าจะเป็นภายหลังแบบลอการิทึมจะมีรูปแบบดังนี้
แบบจำลองวงโคจรแบบสุ่มที่จะกล่าวถึงต่อไปนี้ ระบุวิธีการสร้างองค์ประกอบของกลุ่ม และด้วยเหตุนี้จึงสร้างการกระจายแบบสุ่มของวัตถุซึ่งก่อให้เกิดการแจกแจงแบบก่อนหน้า
แบบจำลองวงโคจรแบบสุ่มของกายวิภาคศาสตร์เชิงคำนวณ

แบบจำลองวงโคจรแบบสุ่ม ของกายวิภาคศาสตร์เชิงคำนวณปรากฏครั้งแรกใน[ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]โดยจำลองการเปลี่ยนแปลงพิกัดที่เกี่ยวข้องกับความสุ่มของกลุ่มที่กระทำต่อแม่แบบ ซึ่งเหนี่ยวนำให้เกิดความสุ่มบนแหล่งที่มาของภาพในวงโคจรทางกายวิภาคของรูปร่างและรูปแบบ และการสังเกตที่เกิดขึ้นผ่านอุปกรณ์การถ่ายภาพทางการแพทย์แบบจำลองวงโคจรแบบสุ่ม ดังกล่าว ซึ่งความสุ่มบนกลุ่มเหนี่ยวนำให้เกิดความสุ่มบนภาพ ได้รับการตรวจสอบสำหรับกลุ่มยูคลิดพิเศษสำหรับการจดจำวัตถุซึ่งองค์ประกอบของกลุ่ม คือกลุ่มยูคลิดพิเศษ[ 7 ]
สำหรับการศึกษาเกี่ยวกับรูปทรงที่เปลี่ยนแปลงได้ในกายวิภาคศาสตร์เชิงคำนวณ กลุ่มดิฟฟีโอเมอร์ฟิซึมมิติสูงที่ใช้ในกายวิภาคศาสตร์เชิงคำนวณนั้นถูกสร้างขึ้นผ่านการไหลที่ราบเรียบซึ่งสอดคล้องกับข้อกำหนดแบบลากรางจ์และแบบออยเลอร์ของสนามการไหลที่สอดคล้องกับสมการเชิงอนุพันธ์สามัญ :

| การไหลแบบลากรางเจียน |
โดยที่เวกเตอร์ฟิลด์บนเรียกว่า ความเร็ว แบบออยเลอร์ของอนุภาค ณ ตำแหน่งของการไหล เวกเตอร์ฟิลด์เป็นฟังก์ชันในปริภูมิฟังก์ชัน ซึ่งจำลองเป็น ปริภูมิ ฮิลเบิร์ต เรียบ โดยที่เวกเตอร์ฟิลด์มีอนุพันธ์ต่อเนื่อง 1 สำหรับการผกผันของการไหลจะกำหนดโดย
| การไหลของออยเลอร์ |
และเมทริกซ์จาโคเบียนสำหรับการไหลที่ กำหนดดังนี้
เพื่อให้มั่นใจถึงการไหลที่ราบรื่นของดิฟฟีโอเมอร์ฟิซึมที่มีอินเวอร์ส ฟิลด์เวกเตอร์จะต้องสามารถหาอนุพันธ์ได้ต่อเนื่องอย่างน้อย 1 ครั้งในปริภูมิ[ 8 ] [ 9 ]ซึ่งจำลองเป็นองค์ประกอบของปริภูมิฮิลเบิร์ต โดยใช้ ทฤษฎีบทการฝังตัว ของโซ โบเลฟ เพื่อให้แต่ละองค์ประกอบมีอนุพันธ์ที่สามารถหาปริพันธ์กำลังสองได้ 3 เท่า ดังนั้นจึงฝังตัวได้อย่างราบรื่นในฟังก์ชันที่สามารถหาอนุพันธ์ได้ต่อเนื่อง 1 ครั้ง[ 8 ] [ 9 ] กลุ่มดิฟฟีโอเมอร์ฟิซึมคือการไหลที่มีฟิลด์เวกเตอร์ที่สามารถหาปริพันธ์ได้อย่างสมบูรณ์ในบรรทัดฐานของโซโบเลฟ:
| กลุ่มดิฟฟีโอมอร์ฟิซึม |
โดยที่ตัวดำเนินการเชิงเส้นกำหนดบรรทัดฐานของ RKHS อินทิกรัลคำนวณโดยการอินทิเกรตแบบแยกส่วนเมื่อเป็นฟังก์ชันทั่วไปในปริภูมิคู่
เลขชี้กำลังแบบรีมันน์
ในแบบจำลองวงโคจรสุ่มของกายวิภาคศาสตร์เชิงคำนวณการไหลทั้งหมดจะลดลงเหลือเพียงเงื่อนไขเริ่มต้นซึ่งก่อให้เกิดพิกัดที่เข้ารหัสการแปลงแบบดิฟเฟอเรนเชียล จากเงื่อนไขเริ่มต้นการกำหนดตำแหน่งทางธรณีวิทยาโดยสัมพันธ์กับเมตริกแบบรีมันน์ของกายวิภาคศาสตร์เชิงคำนวณจะแก้ปัญหาการไหลของสมการออยเลอร์-ลากรองจ์ การแก้ปัญหาทางธรณีวิทยาจากเงื่อนไขเริ่มต้นเรียกว่ารีมันน์-เอกซ์โพเนนเชียล ซึ่งเป็นการแมปที่เอกลักษณ์ไปยังกลุ่ม
ฟังก์ชันเอกซ์โพเนนเชียลแบบรีมันน์สอดคล้องกับเงื่อนไขเริ่มต้น พลวัตของสนามเวกเตอร์
- สำหรับสมการคลาสสิกรูปทรงดิฟฟีโอเมอร์ฟิกโมเมนตัม, , แล้ว
- สำหรับสมการทั่วไปแล้ว,
แนวคิดนี้ขยายไปทั่วทั้งกลุ่ม ดัง แสดงในรูปที่แนบมา คือภาพแสดงวงโคจรแบบสุ่มรอบตัวอย่างแต่ละตัวซึ่งสร้างขึ้นโดยการสุ่มการไหลโดยการสร้าง เวกเตอร์สนาม สัมผัส เริ่มต้น ที่จุดเอกลักษณ์ แล้วจึงสร้างวัตถุ แบบ สุ่ม

ภาพทางด้านขวาแสดงวงโคจรแบบการ์ตูน ซึ่งเป็นการกระจายแบบสุ่มของแมนิโฟลด์ใต้เปลือกสมองที่สร้างขึ้นโดยการสุ่มฟิลด์เวกเตอร์ที่รองรับบนซับแมนิโฟลด์ แบบจำลองวงโคจรแบบสุ่มเหนี่ยวนำให้เกิดความรู้เบื้องต้นเกี่ยวกับรูปร่างและภาพโดยมีเงื่อนไขจากแอตลาสเฉพาะสำหรับสิ่งนี้แบบจำลองการสร้างจะสร้างสนามเฉลี่ยเป็นการเปลี่ยนแปลงแบบสุ่มในพิกัดของแม่แบบตาม โดยที่การเปลี่ยนแปลงพิกัดแบบดิฟฟีโอเมอร์ฟิกถูกสร้างขึ้นแบบสุ่มผ่านการไหลของจีโอเดสิก
การประมาณค่า MAP ในแบบจำลองวงโคจรแบบหลายแอตลาส
แบบจำลองวงโคจรแบบสุ่มเหนี่ยวนำให้เกิดความน่าจะเป็นล่วงหน้าของรูปร่างและภาพโดยมีเงื่อนไขอยู่ที่แผนที่เฉพาะสำหรับสิ่งนี้ แบบจำลองเชิงกำเนิดจะสร้างสนามเฉลี่ยเป็นการเปลี่ยนแปลงแบบสุ่มในพิกัดของแม่แบบตาม โดยที่การเปลี่ยนแปลงแบบดิฟฟีโอเมอร์ฟิกในพิกัดถูกสร้างขึ้นแบบสุ่มผ่านการไหลของจีโอเดสิก ความน่าจะเป็นล่วงหน้าของการแปลงแบบสุ่มบนเหนี่ยวนำโดยการไหลโดยที่ถูกสร้างขึ้นเป็นความน่าจะเป็นล่วงหน้าของสนามสุ่มแบบเกาส์เซียนความหนาแน่นของตัวแปรสังเกตแบบสุ่มที่เอาต์พุตของเซ็นเซอร์กำหนดโดย
การประมาณค่าความน่าจะเป็นสูงสุดภายหลัง ( Maximum a posteriori estimation : MAP) เป็นหัวใจสำคัญของทฤษฎีทางสถิติ สมัยใหม่ พารามิเตอร์ที่สนใจมีหลายรูปแบบ ได้แก่ (i) ประเภทของโรค เช่น โรค ความเสื่อมของระบบประสาทหรือ โรค พัฒนาการของระบบประสาท (ii) ประเภทของโครงสร้าง เช่น โครงสร้างของเปลือกสมองหรือใต้เปลือกสมองในปัญหาที่เกี่ยวข้องกับการแบ่งส่วนภาพ และ (iii) การสร้างแม่แบบขึ้นใหม่จากประชากร เมื่อกำหนดภาพที่สังเกตได้การประมาณค่า MAP จะเพิ่มค่าความน่าจะเป็นภายหลังให้สูงสุด:
สิ่งนี้ต้องอาศัยการคำนวณความน่าจะเป็นแบบมีเงื่อนไขแบบจำลองวงโคจรแผนที่หลายชุดจะสุ่มค่าเหนือชุดแผนที่ที่นับได้ แบบจำลองบนภาพในวงโคจรมีรูปแบบเป็นการกระจายแบบผสมหลายโหมด
แบบจำลองเกาส์เซียนแบบมีเงื่อนไขได้รับการศึกษาอย่างกว้างขวางสำหรับการจับคู่ที่ไม่แม่นยำในภาพที่มีความหนาแน่นสูง และสำหรับการจับคู่จุดสังเกต
การจับคู่ภาพแบบหนาแน่น
แบบจำลองเป็นสนามสุ่มแบบเกาส์เซียนที่มีเงื่อนไข โดยมีค่าเฉลี่ยเป็นเงื่อนไข สำหรับความแปรปรวนแบบเอกรูป พจน์ความคลาดเคลื่อนของจุดปลายจะทำหน้าที่เหมือนลอการิทึมแบบมีเงื่อนไข (ซึ่งเป็นฟังก์ชันของค่าเฉลี่ยเท่านั้น) ทำให้ได้พจน์ของจุดปลายดังนี้:
| เกาส์เซียนแบบมีเงื่อนไข |
การจับคู่แลนด์มาร์ค
แบบจำลองเป็นแบบเกาส์เซียนแบบมีเงื่อนไข โดยมีค่าเฉลี่ยเป็นฟิลด์และความแปรปรวนของสัญญาณรบกวนคงที่ ซึ่งไม่ขึ้นอยู่กับจุดสังเกต ค่าลอการิทึมแบบมีเงื่อนไข (ซึ่งเป็นฟังก์ชันของค่าเฉลี่ยเป็นฟิลด์เท่านั้น) สามารถมองได้ว่าเป็นพจน์ปลายทาง:
การแบ่งส่วน MAP โดยอิงตามแผนที่กายวิภาคหลายชุด
แบบจำลองวงโคจรแบบสุ่มสำหรับแอตลาสหลายชุดจำลองวงโคจรของรูปร่างเป็นผลรวมของวงโคจรทางกายวิภาคหลายวงที่สร้างขึ้นจากการกระทำร่วมกันของดิฟฟีโอเมอร์ฟิซึมโดยแต่ละแอตลาสมีแม่แบบและขอบเขตการแบ่งส่วนที่กำหนดไว้ล่วงหน้าโดยรวมการแบ่งส่วนเข้ากับโครงสร้างทางกายวิภาคของพิกัด MRI คู่ต่างๆ จะถูกจัดทำดัชนีบนโครงข่ายว็อกเซลด้วยภาพ MRI และการติดฉลากอย่างหนาแน่นของพิกัดว็อกเซลทุกตัว การติดฉลากทางกายวิภาคของโครงสร้างที่แบ่งส่วนนั้นเป็นการกำหนดขอบเขตด้วยตนเองโดยนักประสาทกายวิภาคศาสตร์
ปัญหาการแบ่งส่วนแบบเบย์ส[ 10 ]ได้รับการวัดด้วยสนามเฉลี่ยและการแบ่งส่วน การติดฉลากทางกายวิภาคจะต้องได้รับการประมาณสำหรับภาพ MRI ที่วัดได้ สนามเฉลี่ยของภาพที่สังเกตได้นั้นถูกจำลองเป็นการเปลี่ยนแปลงแบบสุ่มจากแม่แบบหนึ่งซึ่งถูกเลือกแบบสุ่มเช่นกันการแปลงแบบดิฟเฟอเรนเชียลที่เหมาะสมที่สุดจะถูกซ่อนไว้และกระทำบนพื้นที่พื้นหลังของพิกัดของภาพแม่แบบที่เลือกแบบสุ่มเมื่อมีแอตลาสเดียวแบบจำลองความน่าจะเป็นสำหรับการอนุมานจะถูกกำหนดโดยความน่าจะเป็นร่วมเมื่อมีแอตลาสหลายอัน การรวมฟังก์ชันความน่าจะเป็นจะให้แบบจำลองผสมหลายรูปแบบด้วยการเฉลี่ยก่อนหน้าเหนือแบบจำลอง
ตัวประมาณค่า MAP ของการแบ่งส่วน คือค่าสูงสุด ที่กำหนดให้ซึ่งเกี่ยวข้องกับการผสมกันของแอตลาสทั้งหมด
ปริมาณดังกล่าวคำนวณโดยการรวมความน่าจะเป็นจากแผนที่กายวิภาคที่ปรับเปลี่ยนได้หลายชุด โดยที่คือความน่าจะเป็นเบื้องต้นที่ภาพที่สังเกตได้นั้นพัฒนามาจากภาพแม่แบบเฉพาะ
การแบ่งส่วน MAP สามารถแก้ไขได้แบบวนซ้ำโดยใช้อัลกอริธึมความคาดหวัง-การทำให้สูงสุด
การประมาณค่า MAP ของแม่แบบปริมาตรจากประชากรและอัลกอริธึม EM
การสร้างแม่แบบจากข้อมูลเชิงประจักษ์จากประชากรเป็นกระบวนการพื้นฐานที่พบได้ทั่วไปในสาขาวิชานี้ มีวิธีการหลายวิธีที่ใช้สถิติแบบเบย์เซียนสำหรับซับแมนิโฟลด์และปริมาตรภาพหนาแน่น สำหรับกรณีปริมาตรภาพหนาแน่น เมื่อกำหนดตัวแปรที่สังเกตได้ปัญหาคือการประมาณแม่แบบในวงโคจรของภาพหนาแน่น ขั้นตอนของ Ma ใช้ไฮเปอร์แม่แบบเริ่มต้นเป็นจุดเริ่มต้น และสร้างแบบจำลองแม่แบบในวงโคจรภายใต้การแปลงแบบดิฟเฟอเรนเชียลที่ไม่ทราบค่าซึ่งต้องประมาณค่าโดยพารามิเตอร์ที่ต้องประมาณค่าคือพิกัดลอการิทึม ซึ่งกำหนดการแม ป แบบจีโอเดสิกของไฮเปอร์แม่แบบ
ในแบบจำลองวงโคจรสุ่มแบบเบย์เซียนของกายวิภาคศาสตร์เชิงคำนวณ ภาพ MRI ที่สังเกตได้จะถูกจำลองเป็นสนามสุ่มแบบเกาส์เซียนแบบมีเงื่อนไข โดยมีสนามเฉลี่ยและมีการแปลงแม่แบบแบบสุ่มที่ไม่ทราบค่า ปัญหาการประมาณค่า MAP คือการประมาณค่าแม่แบบที่ไม่ทราบค่าโดยพิจารณาจากภาพ MRI ที่สังเกตได้
วิธีการของ Ma สำหรับการสร้างภาพความหนาแน่นสูงนั้นใช้ไฮเปอร์เทมเพลตเริ่มต้นเป็นจุดเริ่มต้น และจำลองเทมเพลตในวงโคจรภายใต้การแปลงแบบดิฟเฟอเรนเชียลที่ไม่ทราบค่า ตัวแปรที่สังเกตได้จะถูกจำลองเป็นฟิลด์สุ่มแบบมีเงื่อนไข ซึ่งเป็นฟิลด์สุ่มแบบเกาส์เซียนแบบมีเงื่อนไขที่มีฟิลด์ค่าเฉลี่ย ตัวแปรที่ไม่ทราบค่าที่ต้องประมาณค่าอย่างชัดเจนโดย MAP คือการแมปของไฮเปอร์เทมเพลตโดยการแมปอื่นๆ จะถูกพิจารณาว่าเป็นตัวแปรที่ไม่พึงประสงค์หรือตัวแปรที่ซ่อนอยู่ ซึ่งจะถูกตัดออกไปโดยใช้วิธีการของเบย์ส กระบวนการนี้สำเร็จได้โดยใช้ อัลกอริธึ ม การคาดการณ์และการทำให้สูงสุด
แบบจำลองวงโคจรถูกนำมาใช้โดยการเชื่อมโยงการไหลที่ไม่ทราบค่าที่จะประมาณเข้ากับพิกัดลอการิทึมผ่านลอการิทึมจีโอเดสิกแบบรีมันน์และเลขชี้กำลังสำหรับกายวิภาคเชิงคำนวณของสนามเวกเตอร์เริ่มต้นในปริภูมิสัมผัสที่เอกลักษณ์เพื่อให้ด้วยการแมปของไฮเปอร์เทมเพลต ปัญหาการประมาณค่า MAP จึงกลายเป็น
อัลกอริทึม EM ใช้พิกัดสนามเวกเตอร์ซึ่งเป็นพารามิเตอร์ของการแมปเป็นข้อมูลที่สมบูรณ์และคำนวณค่าคาดหวังแบบมีเงื่อนไขซ้ำๆ กัน
- คำนวณเทมเพลตใหม่ที่เพิ่มค่าฟังก์ชัน Q ให้สูงสุด โดยกำหนดค่า
- คำนวณค่าประมาณฐานนิยมสำหรับค่าคาดหวัง โดยปรับปรุงค่าคาดหวังสำหรับค่าฐานนิยม: