ไคเนสที่ขึ้นอยู่กับไซคลิน 9

Q: ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ไคเนสที่ขึ้นอยู่กับไซคลิน 9

ไซคลิน-ดีเพนเดนต์ไคเนส 9 หรือ CDK9 เป็น ไคเนสที่ขึ้นอยู่กับไซคลิน ซึ่งเกี่ยวข้องกับ P- TEFb

Q: ปฏิสัมพันธ์

จากการศึกษาพบว่า CDK9 มี ปฏิกิริยา กับสารต่างๆ ดังนี้:

ซีดีเค9
โครงสร้างที่มีอยู่
พีดีบี	การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB
รายชื่อรหัส PDB
	3BLH , 3BLQ , 3BLR , 3LQ5 , 3MI9 , 3MIA , 3MY1 , 3TN8 , 3TNH , 3TNI , 4BCF , 4BCG , 4BCH , 4BCI , 4BCJ , 4EC8 , 4EC9 , 4IMY , 4OGR , 4OR5
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	CDK9 , C-2k, CDC2L4, CTK1, PITALRE, TAK, ไคเนสที่ขึ้นอยู่กับไซคลิน 9, ไคเนสที่ขึ้นอยู่กับไซคลิน 9
รหัสภายนอก	โอมิม : 603251 ; เอ็มจีไอ : 1328368 ; โฮโมโลยีน : 55566 ; GeneCards : CDK9 ; OMA : CDK9 - ออโธโลจี
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ )
คริส.	โครโมโซม 9 (มนุษย์)
จบ	127,790,792 bp
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ )
คริส.	โครโมโซม 2 (เมาส์)
จบ	32,603,088 bp
รูปแบบการแสดงออกของ RNA
	สูงสุดที่แสดงใน
	ท่อนำไข่ด้านขวา; รังไข่ซ้าย; รังไข่ข้างขวา; เส้นประสาทน่อง; ท่อนำไข่ซ้าย; เยื่อบุของกระเพาะอาหาร; ซีกขวาของสมองน้อย; ต่อมใต้สมองส่วนหน้า; ตัวมดลูก; คลองปากมดลูก;
	สูงสุดที่แสดงใน
	เม็ดเลือดขาวชนิดแกรนูโลไซต์; สโตรมาของไขกระดูก; ร่องหน้าผากส่วนบน; ต่อมไทมัส; เซลล์ต้นกำเนิดเม็ดเลือดในตับทารกในครรภ์; ข้อต่อกระดูกหน้าแข้งและกระดูกต้นขา; เปลือกสมองส่วนรับภาพหลัก; ชั้นหนังแท้; เอพิบลาสต์; ม้าม;
	ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม
	ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม
ออนโทโลยีของยีน
หน้าที่ระดับโมเลกุล	การจับนิวคลีโอไทด์; กิจกรรมทรานสเฟอเรส; กิจกรรมโปรตีนไคเนส; การจับกันของ 7SK snRNA; การจับตัวกระตุ้นการถอดรหัส; การจับกับ snRNA; การจับกับ ATP; การจับกับ DNA ที่จำเพาะต่อลำดับของโปรโมเตอร์หลักของ RNA polymerase II; การจับกับ DNA; การจับตัวของปัจจัยถอดรหัส; การจับโปรตีน; กิจกรรมของโปรตีนเซริน/ทรีโอนีนไคเนส; การจับโครมาติน; กิจกรรมไคเนส; กิจกรรมไคเนสโปรตีนเซริน/ทรีโอนีนที่ขึ้นอยู่กับไซคลิน; กิจกรรมไคเนสของ CTD เฮปตาเปปไทด์ซ้ำของ RNA โพลีเมอเรส II; การจับโปรตีนไคเนส; การจับไซคลิน; การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับของบริเวณควบคุมซิสของ RNA polymerase II;
ส่วนประกอบของเซลล์	ไซโตพลาซึม; นิวเคลียส; เมมเบรน; นิวคลีโอพลาสม์; คอมเพล็กซ์ปัจจัยการยืดตัวของการถอดรหัส; คอมเพล็กซ์ปัจจัยการยืดตัวของการถอดรหัสเชิงบวกของไซคลิน/CDK; องค์กร PML; โครโมโซม; เม็ดไรโบโปรตีนในไซโตพลาสซึม; คอมเพล็กซ์โฮโลเอนไซม์โปรตีนไคเนสที่ขึ้นอยู่กับไซคลิน;
กระบวนการทางชีวภาพ	การควบคุมเชิงบวกของการเจริญเติบโตของกล้ามเนื้อหัวใจ; การควบคุมเชิงบวกของการจับกับ 3'-UTR ของ mRNA; การควบคุมการแบ่งเซลล์กล้ามเนื้อ; การควบคุมเชิงลบของการเติมหมู่โพลีอะดีนีนใน mRNA; การซ่อมแซมดีเอ็นเอ; การตอบสนองของเซลล์ต่อสิ่งกระตุ้นไซโตไคน์; การควบคุมเชิงบวกของการถอดรหัสไวรัส; การประมวลผลฟอร์กการจำลองแบบ; การฟอสโฟรีเลชันของโปรตีน; การควบคุมการดัดแปลงฮิสโตน; การควบคุมวงจรการแบ่งเซลล์แบบไมโทซิส; การตอบสนองของเซลล์ต่อสิ่งกระตุ้นที่ทำให้เกิดความเสียหายต่อดีเอ็นเอ; การเริ่มต้นการถอดรหัสจากโปรโมเตอร์ของ RNA polymerase II; การควบคุมการซ่อมแซมดีเอ็นเอ; การควบคุมการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การเพิ่มจำนวนประชากรเซลล์; การถอดรหัสโดย RNA polymerase II; การฟอสโฟรีเลชัน; การควบคุมเชิงบวกของการยูบิควิตินไนเซชันของฮิสโตน H2B; การควบคุมการถอดรหัสในเชิงบวกโดย RNA polymerase II; การถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การถอดรหัส snRNA โดย RNA polymerase II; การยืดสายการถอดรหัสจากโปรโมเตอร์ของ RNA polymerase II; การฟอสโฟรีเลชันของโดเมนปลายซีของอาร์เอ็นเอพอลิเมอเรส II; การควบคุมเชิงบวกของการยืดตัวของการถอดรหัสจากโปรโมเตอร์ของ RNA polymerase II;
	แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก
	1025
	107951
	ENSG00000136807
	ENSMUSG00000009555
	พี50750
	Q99J95
	NM_001261
	NM_130860
	NP_001252 NP_001252.1
	NP_570930
	วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์	ดู/แก้ไขเมาส์

ไซคลิน-ดีเพนเดนต์ไคเนส 9หรือCDK9เป็นไคเนสที่ขึ้นอยู่กับไซคลินซึ่งเกี่ยวข้องกับP- TEFb

การทำงาน

โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้เป็นสมาชิกของ ตระกูล ไคเนสที่ขึ้นอยู่กับไซคลิน (CDK) สมาชิกในตระกูล CDK มีความคล้ายคลึงกับผลิตภัณฑ์ยีนของ S. cerevisiae cdc28 และ S. pombe cdc2 อย่างมาก และเป็นที่รู้จักกันว่าเป็นตัวควบคุมวงจรเซลล์ที่สำคัญ ไคเนสนี้พบว่าเป็นส่วนประกอบของคอมเพล็กซ์โปรตีนหลายชนิด TAK/P-TEFb ซึ่งเป็นปัจจัยการยืดตัวสำหรับการถอดรหัสที่กำกับโดย RNA polymerase II และทำหน้าที่โดยการฟอสโฟรีเลต โดเมน C-terminalของหน่วยย่อยที่ใหญ่ที่สุดของRNA polymerase IIโปรตีนนี้สร้างคอมเพล็กซ์กับและถูกควบคุมโดยหน่วยย่อยควบคุมของมันคือไซคลิน T หรือไซคลิน K พบว่าโปรตีน HIV-1 Tat มีปฏิสัมพันธ์กับโปรตีนนี้และไซคลิน T ซึ่งชี้ให้เห็นถึงความเป็นไปได้ที่โปรตีนนี้จะมีส่วนเกี่ยวข้องกับโรคเอดส์^{[ 5 ]}

นอกจากนี้ CDK9 ยังเป็นที่รู้จักว่าเชื่อมโยงกับโปรตีนอื่นๆ เช่นTRAF2และมีส่วนเกี่ยวข้องกับการสร้างความแตกต่างของกล้ามเนื้อโครงร่าง^{[ 6 ]}ในสภาพแวดล้อมของเซลล์ที่แข็งแรง กิจกรรมของเอนไซม์ของคอมเพล็กซ์ P-TEFb ที่เกิดขึ้นจะถูกควบคุมอย่างเข้มงวดและรักษาสมดุลไว้โดยการกักเก็บชั่วคราวโดยคอมเพล็กซ์ควบคุมเชิงลบ 7SK snRNP

สารยับยั้ง

สารยับยั้งโมเลกุลขนาดเล็กแบบดั้งเดิมของ CDK9 มักกำหนดเป้าหมายไปที่บริเวณจับ ATP ที่มีการอนุรักษ์สูงของไคเนส แต่การนำไปใช้ในทางคลินิกมักประสบปัญหาเรื่องความจำเพาะต่อไอโซฟอร์ม CDK อื่นๆ จากผลการจำลองการจับโมเลกุล พบว่าสารประกอบ Ligands-3, 5, 14 และ 16 จากสารประกอบเบนโซซูเบอรีนที่หลอมรวมกับไพโรโลน 17 ชนิด เป็นสารยับยั้งที่มีประสิทธิภาพและจำเพาะ โดยไม่มีปฏิกิริยาข้ามกับไอโซฟอร์ม CDK อื่นๆ

การวิเคราะห์การจำลอง MD และการศึกษา MM-PBSA เผยให้เห็นโปรไฟล์พลังงานการจับของสารประกอบที่เลือกทั้งหมด ลิแกนด์ที่เลือกมีประสิทธิภาพดีกว่ายาตัวทดลอง (Roscovitine) ลิแกนด์-5 และ 16 แสดงความจำเพาะต่อ CDK9 คาดว่าลิแกนด์เหล่านี้จะมีความเสี่ยงต่อผลข้างเคียงน้อยกว่าเนื่องจากมีต้นกำเนิดจากธรรมชาติ^{[ 7 ]}

ปฏิสัมพันธ์

จากการศึกษาพบว่า CDK9 มีปฏิกิริยากับสารต่างๆ ดังนี้:

ตัวรับแอนโดร^เจน [ ^{8 ]}
CDC34 ^{[ 9 ]}และ
CCNK , ^{[ 10 ]}
CCNT1 , ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 9 ]}^{[ 16 ]}^{[ 17 ]}
CCNT2 , ^{[ 11 ]}
MYBL2 , ^{[ 16 ]}
RELA , ^{[ 18 ]}
RB1 , ^{[ 19 ]}
SKP1A ^[⁹^]
SUPT5H , ^{[ 17 ]}และ
RNAP II . ^{[ 20 ]}

อ่านเพิ่มเติม

Jeang KT (1998). "Tat, Tat-associated kinase และการถอดรหัส". J. Biomed. Sci . 5 (1): 24– 7. doi : 10.1007/BF02253352 . PMID 9570510 .
Yankulov K, Bentley D (1998). "การควบคุมการถอดรหัส: ปัจจัยร่วม Tat และการยืดตัวของการถอดรหัส" . Curr. Biol . 8 (13): R447–9. Bibcode : 1998CBio....8.R447Y . doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . PMID 9651670 . S2CID 15480646 .
Romano G, Kasten M, De Falco G และคณะ (2000). "หน้าที่ควบคุมของ Cdk9 และ cyclin T1 ในการแสดงออกของยีนในเส้นทางการกระตุ้นการถอดรหัสของ HIV tat" J. Cell. Biochem . 75 (3): 357– 68. doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID - JCB1>3.0.CO;2-K . PMID 10536359. S2CID 43685090 .
Marcello A, Zoppé M, Giacca M (2002). "โหมดการควบคุมการถอดรหัสหลายรูปแบบโดยทรานส์แอคติเวเตอร์ Tat ของ HIV-1" . IUBMB Life . 51 (3): 175– 81. doi : 10.1080/152165401753544241 . PMID 11547919 . S2CID 10931640 .
Huigen MC, Kamp W, Nottet HS (2004). "ผลหลายประการของโปรตีนทรานส์แอคติเวเตอร์ของ HIV-1 ต่อการเกิดโรคติดเชื้อ HIV-1" Eur. J. Clin. Invest . 34 (1): 57– 66. doi : 10.1111/j.1365-2362.2004.01282.x . PMID 14984439 . S2CID 29713968 .
Rice AP, Herrmann CH (2004). "การควบคุม TAK/P-TEFb ในเซลล์เม็ดเลือดขาวชนิด CD4+ T และแมโครฟาจ" Curr. HIV Res . 1 (4): 395– 404. doi : 10.2174/1570162033485159 . PMID 15049426 .
Minghetti L, Visentin S, Patrizio M และคณะ (2004). "การกระทำหลายประการของโปรตีน Tat ของไวรัสภูมิคุ้มกันบกพร่องในมนุษย์ชนิดที่ 1 ต่อการทำงานของเซลล์ไมโครเกลีย" Neurochem . Res . 29 (5): 965–78 . doi : 10.1023/B:NERE.0000021241.90133.89 . PMID 15139295. S2CID 25323034 .
Liou LY, Herrmann CH, Rice AP (2005). "การติดเชื้อ HIV-1 และการควบคุมการทำงานของ Tat ในแมคโครฟาจ" Int. J. Biochem. Cell Biol . 36 (9): 1767– 75. doi : 10.1016/j.biocel.2004.02.018 . PMID 15183343 .
Pugliese A, Vidotto V, Beltramo T และคณะ (2005). "บทวิจารณ์เกี่ยวกับผลทางชีวภาพของโปรตีน HIV-1 Tat" Cell Biochem. Funct . 23 (4): 223– 7. doi : 10.1002 / cbf.1147 . PMID 15473004. S2CID 8408278 .
Bannwarth S, Gatignol A (2005). "HIV-1 TAR RNA: เป้าหมายของปฏิสัมพันธ์ระดับโมเลกุลระหว่างไวรัสและโฮสต์" Curr. HIV Res . 3 (1): 61– 71. doi : 10.2174/1570162052772924 . PMID 15638724 .
Gibellini D, Vitone F, Schiavone P, Re MC (2005). "โปรตีน tat ของ HIV-1 และการแพร่กระจายและการอยู่รอดของเซลล์: บทวิจารณ์โดยย่อ" New Microbiol . 28 (2): 95– 109. PMID 16035254 .
Peruzzi F (2006). "หน้าที่หลายประการของ HIV-1 Tat: การแพร่กระจายเทียบกับการตายของเซลล์" . Front. Biosci . 11 : 708– 17. doi : 10.2741/1829 . PMID 16146763 .

ดูเพิ่มเติม

เอนิโตซิคลิบ

ลิงก์ภายนอก

Cyclin-Dependent+Kinase+9 ที่ หัวข้อทางการ แพทย์ (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
ไคเนสที่ขึ้นอยู่กับไซคลินของ แมลงหวี่9 - The Interactive Fly
ตำแหน่งของยีน CDK9 ในมนุษย์บน UCSC Genome Browser
รายละเอียดเกี่ยวกับยีน CDK9ในมนุษย์ สามารถดูได้ที่ UCSC Genome Browser

บทความเกี่ยวกับเอนไซม์EC 2.7 นี้ ยัง ไม่สมบูรณ์คุณสามารถช่วยวิกิพีเดียได้โดยการเพิ่มข้อมูลที่ขาดหายไป

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

เจน

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]