อ่าน 8 นาที
caBIG
โครงการเครือข่ายข้อมูลชีวการแพทย์มะเร็ง ( caBIG ) เป็นโครงการของรัฐบาลสหรัฐฯ
caBIG
| caGrid | |
|---|---|
| นักพัฒนา | ศูนย์สารสนเทศชีวการแพทย์และเทคโนโลยีสารสนเทศ (CBIIT) ของ NCI , มูลนิธิวิจัยมหาวิทยาลัยโอไฮโอสเตท , มหาวิทยาลัยชิคาโก - ห้องปฏิบัติการแห่งชาติอาร์กอน , มหาวิทยาลัยดุ๊ก , Booz Allen Hamilton , SemanticBits LLC, Ekagra Software Technologies |
| พิมพ์ | การประมวลผลแบบกริด , บริการเว็บ |
| ใบอนุญาต | BSD 3-Clause |
| เว็บไซต์ | cagrid.org |
โครงการเครือข่ายข้อมูลชีวการแพทย์มะเร็ง ( caBIG ) เป็นโครงการของรัฐบาลสหรัฐฯ เพื่อพัฒนาเครือข่ายข้อมูลแบบเปิดแหล่งที่มา และเข้าถึงได้โดยเสรี เรียกว่า caGridสำหรับการแลกเปลี่ยนข้อมูลอย่างปลอดภัยเกี่ยวกับการวิจัยมะเร็ง โครงการนี้พัฒนาโดยสถาบันมะเร็งแห่งชาติ (ส่วนหนึ่งของสถาบันสุขภาพแห่งชาติ ) และดูแลโดยศูนย์ข้อมูลชีวการแพทย์และเทคโนโลยีสารสนเทศ (CBIIT) และบริหารจัดการโดยBooz Allen Hamiltonในปี 2011 รายงานเกี่ยวกับ caBIG ได้ตั้งคำถามสำคัญเกี่ยวกับประสิทธิภาพและการกำกับดูแล และงบประมาณและขอบเขตของโครงการถูกตัดลดลงอย่างมาก ในเดือนพฤษภาคม 2012 โครงการข้อมูลมะเร็งแห่งชาติ (NCIP) ถูกสร้างขึ้นเพื่อเป็นโครงการสืบทอดต่อจาก caBIG
ประวัติศาสตร์
สถาบันมะเร็งแห่งชาติ (NCI) ของสหรัฐอเมริกาให้ทุนสนับสนุนโครงการโครงข่ายข้อมูลชีวการแพทย์มะเร็ง (caBIG) ในฤดูใบไม้ผลิปี 2547 โดยมี Kenneth Buetow เป็นหัวหน้า[ 1 ] เป้าหมายคือการเชื่อมต่อนักวิจัยมะเร็งชีวการแพทย์ของสหรัฐฯ โดยใช้เทคโนโลยีที่เรียกว่าการประมวลผลแบบกริดโครงการนี้ซึ่งนำโดยศูนย์ชีวสารสนเทศและเทคโนโลยีสารสนเทศ (CBIIT) เริ่มต้นด้วยระยะนำร่อง 3 ปี ระยะนำร่องสิ้นสุดลงในเดือนมีนาคม 2550 และมีการประกาศการทดลอง[ 2 ] Buetow ส่งเสริมโครงการนี้ในปี 2551 [ 1 ] [ 3 ]
นอกเหนือจาก caGrid ซึ่งเป็นโครงสร้างพื้นฐานสำหรับการแบ่งปันข้อมูลระหว่างองค์กรแล้ว caBIG ยังได้พัฒนาเครื่องมือซอฟต์แวร์ นโยบายการแบ่งปันข้อมูล และมาตรฐานและคำศัพท์ทั่วไปเพื่ออำนวยความสะดวกในการแบ่งปันข้อมูลอีกด้วย
เครื่องมือซอฟต์แวร์เป้าหมาย:
- การรวบรวม การวิเคราะห์ และการจัดการข้อมูลการวิจัยพื้นฐาน
- การจัดการ การทดลองทางคลินิกตั้งแต่การลงทะเบียนผู้ป่วยไปจนถึงการรายงานและการวิเคราะห์เหตุการณ์ไม่พึงประสงค์
- การรวบรวม การใส่คำอธิบายประกอบ การแบ่งปัน และการจัดเก็บข้อมูลภาพทางการแพทย์
- การจัดการตัวอย่างทางชีวภาพ
caBIG มุ่งมั่นที่จะจัดหาเทคโนโลยีพื้นฐานสำหรับแนวทางการแพทย์ชีวภาพที่เรียกว่า “ระบบการดูแลสุขภาพแบบเรียนรู้” [ 4 ]ซึ่งอาศัยการแลกเปลี่ยนข้อมูลอย่างรวดเร็วระหว่างทุกภาคส่วนของการวิจัยและการดูแล เพื่อให้นักวิจัยและแพทย์สามารถร่วมกันตรวจสอบและนำผลการค้นพบล่าสุดมาใช้ในงานของตนได้อย่างถูกต้อง เป้าหมายสูงสุดคือการเร่งกระบวนการวิจัยทางการแพทย์ชีวภาพ นอกจากนี้ยังได้รับการส่งเสริมสำหรับสิ่งที่มักเรียกว่าการแพทย์เฉพาะบุคคลเทคโนโลยี caBIG ถูกนำมาใช้ในการทดลองทางคลินิก แบบปรับเปลี่ยนได้ เช่น การตรวจสอบการศึกษาต่อเนื่องเพื่อทำนายการตอบสนองต่อการรักษาด้วยการถ่ายภาพและการวิเคราะห์โมเลกุล 2 (I-SPY2) ซึ่งออกแบบมาเพื่อใช้ตัวบ่งชี้ ทางชีวภาพในการกำหนดการรักษาที่เหมาะสมสำหรับผู้หญิงที่เป็นมะเร็งเต้านม ระยะ ลุกลาม[ 5 ]
เทคโนโลยีสารสนเทศด้านสุขภาพ
เทคโนโลยีสารสนเทศด้านสุขภาพ (HIT) ได้รับการส่งเสริมเพื่อการจัดการและการแลกเปลี่ยนข้อมูลทางการแพทย์อย่างปลอดภัยระหว่างนักวิจัย ผู้ให้บริการด้านสุขภาพ และผู้บริโภค โครงการริเริ่มด้าน HIT ที่กล่าวถึง caBIG ได้แก่: สถาบันมะเร็งแห่งชาติ (NCI) และสมาคมมะเร็งวิทยาคลินิกแห่งอเมริกา (American Society of Clinical Oncology ) ได้ริเริ่มความร่วมมือเพื่อสร้าง ระบบ บันทึกสุขภาพอิเล็กทรอนิกส์ เฉพาะทางด้านมะเร็งวิทยา โดยใช้มาตรฐาน caBIG เพื่อความสามารถในการทำงานร่วมกัน และจะช่วยให้แพทย์ผู้เชี่ยวชาญด้านมะเร็งสามารถจัดการข้อมูลผู้ป่วยในรูปแบบอิเล็กทรอนิกส์ที่บันทึกประเด็นการรักษาเฉพาะทางที่เกี่ยวข้องกับมะเร็งได้อย่างแม่นยำ เครือข่าย ข้อมูลสุขภาพแห่งชาติ (Nationwide Health Information Network)เป็นโครงการริเริ่มเพื่อแบ่งปันข้อมูลทางคลินิกของผู้ป่วยจากแหล่งข้อมูลที่อยู่กระจัดกระจายทางภูมิศาสตร์ และสร้างระบบแลกเปลี่ยนข้อมูลสุขภาพ ระดับชาติที่เชื่อมโยงกันทางอิเล็กทรอนิกส์ อาจมีความเกี่ยวข้องบางอย่าง
ความร่วมมือ
กลุ่มความร่วมมือด้านสุขภาพ caBIG ก่อตั้งขึ้นในปี 2551 เพื่อส่งเสริมการแพทย์เฉพาะบุคคล แต่ได้ยุบเลิกไปในปี 2555 [ 6 ] ในเดือนกรกฎาคม 2552 caBIG ได้ประกาศความร่วมมือกับมูลนิธิวิจัยดร. ซูซาน เลิฟเพื่อสร้างกลุ่มผู้หญิงออนไลน์ที่ยินดีเข้าร่วมการทดลองทางคลินิก[ 7 ]กลุ่มนี้มีชื่อว่า Army of Women โดยมีเป้าหมายที่จะมีสมาชิกในฐานข้อมูลหนึ่งล้านคน ภายในเดือนธันวาคม 2552 เว็บไซต์นี้ได้ "เปิดตัว" และมีผู้หญิงและผู้ชายประมาณ 30,000 คนลงทะเบียนภายในปี 2553 [ 8 ]
โครงการ Cancer Genome Atlasมีเป้าหมายที่จะจำแนกลักษณะของเนื้องอกมากกว่า 10,000 ชิ้น ครอบคลุมมะเร็งอย่างน้อย 20 ชนิดภายในปี 2015 caBIG ให้บริการการเชื่อมต่อ มาตรฐานข้อมูล และเครื่องมือในการรวบรวม จัดระเบียบ แบ่งปัน และวิเคราะห์ข้อมูลการวิจัยที่หลากหลายในฐานข้อมูล ตั้งแต่ปี 2007 NCI ได้ทำงานร่วมกับสถาบันวิจัยมะเร็งแห่งชาติ ของสหราชอาณาจักร (NCRI) ทั้งสององค์กรได้แบ่งปันเทคโนโลยีสำหรับการวิจัยร่วมกันและการแลกเปลี่ยนข้อมูลการวิจัยอย่างปลอดภัยโดยใช้ caGrid และพอร์ทัลเว็บ NCRI Oncology Information Exchange (ONIX) ซึ่งประกาศในเดือนสิงหาคม 2009 [ 9 ] ONIX ปิดตัวลงในเดือนมีนาคม 2012 [ 10 ] สถาบันมะเร็ง Dukeใช้เครื่องมือการทดลองทางคลินิกของ caBIG ในการทำงานร่วมกับโรงพยาบาลมะเร็งปักกิ่งแห่งมหาวิทยาลัยปักกิ่ง[ 11 ]
การดำเนินการ
โครงการนี้มีจุดประสงค์เพื่อเชื่อมต่อศูนย์มะเร็งที่ได้รับการรับรองจาก NCI จำนวน 65 แห่ง เพื่อให้สามารถทำการวิจัยร่วมกันได้ สถาบันที่เข้าร่วมสามารถ "นำไปใช้" เครื่องมือ caBIG เพื่อแบ่งปันข้อมูลโดยตรงผ่าน caGrid หรือ "ปรับปรุง" ซอฟต์แวร์เชิงพาณิชย์หรือซอฟต์แวร์ที่พัฒนาขึ้นเองภายในองค์กรให้เข้ากันได้กับ caBIG โปรแกรม caBIG ได้พัฒนาชุดพัฒนาซอฟต์แวร์ (SDK) สำหรับเครื่องมือซอฟต์แวร์ที่สามารถทำงานร่วมกันได้ และคำแนะนำเกี่ยวกับกระบวนการปรับปรุงเครื่องมือที่มีอยู่หรือการพัฒนาแอปพลิเคชันให้เข้ากันได้กับ caBIG
โปรแกรมเครือข่ายสนับสนุนองค์กรประกอบด้วยความเชี่ยวชาญเฉพาะด้านและผู้ให้บริการสนับสนุน ซึ่งเป็นองค์กรภายนอกที่ให้ความช่วยเหลือตามสัญญา[ 12 ] เว็บพอร์ทัลที่ใช้ ซอฟต์แวร์ Liferayมีให้บริการตั้งแต่ปี 2008 ถึง 2013 [ 13 ]
โอเพนซอร์ส
นับตั้งแต่ปี 2004 โครงการ caBIG ได้ใช้ ชุมชน โอเพนซอร์สโดยดัดแปลงมาจากความร่วมมือระหว่างภาครัฐและเอกชนอื่นๆ โครงการ caBIG ผลิตซอฟต์แวร์ภายใต้สัญญาจ้างกับทีมพัฒนาซอฟต์แวร์ ซึ่งส่วนใหญ่อยู่ในแวดวงวิจัยเชิงพาณิชย์
โดยทั่วไปแล้ว ซอฟต์แวร์ที่พัฒนาภายใต้สัญญาของรัฐบาลสหรัฐฯ ถือเป็นทรัพย์สินของรัฐบาลสหรัฐฯ และผู้เสียภาษีชาวสหรัฐฯ ทั้งนี้ ขึ้นอยู่กับเงื่อนไขในสัญญาเฉพาะนั้นๆ ซอฟต์แวร์เหล่านั้นอาจเข้าถึงได้เฉพาะเมื่อมีการร้องขอภายใต้พระราชบัญญัติเสรีภาพในการเข้าถึงข้อมูล (FOIA) เท่านั้น และระยะเวลาในการตอบสนองต่อคำขอเหล่านั้นอาจทำให้ผู้ร้องขอไม่สามารถได้รับประโยชน์ใดๆ จากซอฟต์แวร์ที่เผยแพร่ภายใต้คำขอ FOIA ได้เลย
โครงการ caBIG ได้รวบรวมซอฟต์แวร์ caBIG ทั้งหมดไว้ในที่เก็บซอฟต์แวร์ที่สามารถดาวน์โหลดได้ฟรี ซอฟต์แวร์โอเพนซอร์สหมายความว่าทุกคนสามารถแก้ไขซอฟต์แวร์ที่ดาวน์โหลดได้ อย่างไรก็ตาม เงื่อนไขการอนุญาตใช้งานซอฟต์แวร์ที่ดาวน์โหลดมานั้นมีความยืดหยุ่นมากกว่าซอฟต์แวร์ทั่วไป บุคคลหรือองค์กรสามารถส่งโค้ดที่แก้ไขแล้วกลับไปยังโครงการ caBIG ได้ แต่ไม่จำเป็นต้องทำเช่นนั้น ในทำนองเดียวกัน การแก้ไขต่างๆ สามารถเผยแพร่เป็นโอเพนซอร์สได้ แต่ไม่จำเป็นต้องทำ เงื่อนไขการอนุญาตใช้งานของ caBIG ยังอนุญาตให้ใช้แอปพลิเคชันและส่วนประกอบของ caBIG ร่วมกับการเพิ่มเติมและการแก้ไข เพื่อเผยแพร่เป็นผลิตภัณฑ์เชิงพาณิชย์ แง่มุมเหล่านี้ของโครงการ caBIG ส่งเสริมการนำเทคโนโลยี caBIG ไปใช้ในเชิงพาณิชย์อย่างแท้จริง
ผลลัพธ์
ในปี 2551 GlaxoSmithKlineประกาศว่าจะแบ่งปันข้อมูลจีโนมของเซลล์มะเร็งกับ caBIG [ 14 ] บริษัทเอกชนบางแห่งอ้างว่าได้รับประโยชน์จากเทคโนโลยี caBIG ในปี 2553 [ 15 ]
เว็บไซต์ชุมชน caGrid ถูกสร้างขึ้นในปี 2007 [ 16 ] ซอฟต์แวร์หลักเวอร์ชัน 1.x ถูกเพิ่มเข้าไปใน โครงการ GitHubในช่วงกลางปี 2013 ภายใต้ใบอนุญาตBSD 3-Clause [ 17 ] โดยใช้ Globus Toolkit เวอร์ชัน 4.03 และ ระบบ เวิร์กเบนช์ Tavernaเพื่อจัดการเวิร์กโฟลว์และภาษาการดำเนินการกระบวนการทางธุรกิจ[ 17 ] [ 18 ] [ 19 ] ซอฟต์แวร์ชื่อ Introduce ได้รับการพัฒนาขึ้นราวปี 2006 [ 20 ] ผู้มี ส่วน ร่วม ได้แก่ศูนย์วิทยาศาสตร์ทางคลินิกและการแปลผลของมหาวิทยาลัยโอไฮโอสเตทมหาวิทยาลัยดุ๊กมหาวิทยาลัยชิคาโก - ห้องปฏิบัติการแห่งชาติอาร์กอนและบริษัทเอกชนBooz Allen Hamilton , Ekagra Software Technologies และ Semantic Bits [ 16 ]
การวิจารณ์
ในปี 2551 บางคนตั้งคำถามว่าโครงการนี้เป็นประโยชน์ต่อบริษัทยาขนาดใหญ่หรือไม่[ 21 ] ในปี 2554 โครงการนี้ใช้เงินไปประมาณ 350 ล้านดอลลาร์สหรัฐ[ 22 ]แม้ว่าเป้าหมายจะถือว่าน่ายกย่อง แต่ซอฟต์แวร์ส่วนใหญ่กลับถูกนำไปใช้อย่างไม่สม่ำเสมอหลังจากที่ได้รับการพัฒนาด้วยค่าใช้จ่ายสูงเพื่อแข่งขันกับผลิตภัณฑ์เชิงพาณิชย์ ในเดือนมีนาคม 2554 การประเมินของคณะทำงาน NCI สรุปว่า caBIG "...ขยายออกไปไกลเกินกว่าเป้าหมายเหล่านั้นเพื่อนำซอฟต์แวร์ที่ซับซ้อนและทะเยอทะยานเกินไปของเครื่องมือภายใต้ตราสินค้า NCI มาใช้ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในด้านระบบการจัดการการทดลองทางคลินิก (CTMS) ซึ่งสิ่งเหล่านี้สร้างแรงดึงดูดที่จำกัดในชุมชนมะเร็ง แข่งขันกับผู้จำหน่ายเชิงพาณิชย์ที่มีอยู่ และสร้างภาระผูกพันในการบำรุงรักษาและการสนับสนุนระยะยาวที่ไม่สามารถรับมือได้ทางการเงินสำหรับ NCI" [ 2 ]ในปี 2555 NCI ได้ประกาศโครงการใหม่คือ โครงการสารสนเทศมะเร็งแห่งชาติ (NCIP) ซึ่งเป็นโครงการต่อจาก caBIG [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ]
caGrid
| caGrid | |
|---|---|
| นักพัฒนา | ศูนย์สารสนเทศชีวการแพทย์และเทคโนโลยีสารสนเทศ (CBIIT) ของ NCI , มูลนิธิวิจัยมหาวิทยาลัยโอไฮโอสเตท , มหาวิทยาลัยชิคาโก - ห้องปฏิบัติการแห่งชาติอาร์กอน , มหาวิทยาลัยดุ๊ก , Booz Allen Hamilton , SemanticBits LLC, Ekagra Software Technologies |
| ระบบปฏิบัติการ | ข้ามแพลตฟอร์ม |
| พิมพ์ | การประมวลผลแบบกริด , บริการเว็บ |
| ใบอนุญาต | BSD 3-Clause |
| เว็บไซต์ | cagrid.org |
เครือ ข่ายคอมพิวเตอร์และซอฟต์แวร์ caGrid สนับสนุนโครงการ Cancer Biomedical Informatics Grid (caBIG) ของสถาบันมะเร็งแห่งชาติ สังกัดสถาบันสุขภาพแห่งชาติของ สหรัฐอเมริกา
caBIG เป็นโครงสร้างพื้นฐานสารสนเทศเสมือนจริงแบบสมัครใจที่เชื่อมโยงข้อมูล เครื่องมือวิจัย นักวิทยาศาสตร์ และองค์กรต่างๆ เข้าด้วยกัน
ในปี 2013 โครงการสารสนเทศมะเร็งแห่งชาติ (NCIP) ได้เผยแพร่ caGrid อีกครั้งภายใต้ใบอนุญาต BSD 3-Clauseและย้ายที่เก็บซอร์สโค้ดไปยัง GitHub
caGrid ใช้ Globus Toolkit เวอร์ชัน 4.03 ซึ่งผลิตโดย Globus Alliance
การบริหารโครงการ
โครงการ caGrid และเงินทุนส่วนใหญ่ได้รับการบริหารจัดการโดยBooz Allen Hamilton
พอร์ทัล
caGrid Portal เป็นแอปพลิเคชันบนเว็บที่สร้างขึ้นบนLiferayซึ่งช่วยให้ผู้ใช้สามารถค้นหาและโต้ตอบกับบริการต่างๆ ที่มีอยู่บนโครงสร้างพื้นฐานของ caGrid ได้ Portal ทำหน้าที่เป็นเครื่องมือแสดงภาพหลักสำหรับมิดเดิลแวร์ ของ caGrid นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นแหล่งข้อมูลของ caBIG อีกด้วย ผ่านทาง caGrid Portal ผู้ใช้สามารถเข้าถึงข้อมูลเกี่ยวกับผู้เข้าร่วม caBIG จุดติดต่อ (POC) ของ caGrid และข่าวสารและกิจกรรมที่เกี่ยวข้องกับ caGrid ได้
ขั้นตอนการทำงาน
เวิร์กโฟลว์ของ caGrid ใช้:
ผู้มีส่วนร่วม
- โครงการ NCI CBIIT
- บูซ อัลเลน แฮมิลตัน
- มหาวิทยาลัยโอไฮโอสเตท
- มหาวิทยาลัยชิคาโก , ห้องปฏิบัติการแห่งชาติอาร์กอน
- มหาวิทยาลัยดุ๊ก
- บริษัท เซแมนติกบิตส์ จำกัด
- บริษัท เอคากรา ซอฟต์แวร์ เทคโนโลยีส์
การวิจารณ์
ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2554 NCI ได้เผยแพร่การทบทวนอย่างละเอียดเกี่ยวกับ CaBIG ซึ่งเป็นโครงการ NCI CBIIT ที่ให้ทุนสนับสนุนการพัฒนาซอฟต์แวร์ caGrid (ดู[1] , [2] ) ซึ่งรวมถึงรายการปัญหามากมายของโครงการ และแนะนำให้ยุติโครงการพัฒนาซอฟต์แวร์ส่วนใหญ่
อ่านเพิ่มเติม
- Abernethy AP, Coeytauz R, Rowe K, Wheeler JL, Lyerly HK . การเก็บรวบรวมข้อมูลที่ผู้ป่วยรายงานทางอิเล็กทรอนิกส์เป็นรากฐานของระบบการดูแลสุขภาพแบบเรียนรู้ JCO. 2009;27:6522.
- Buetow KH. caBIG: การพิสูจน์แนวคิดสำหรับการดูแลมะเร็งแบบเฉพาะบุคคล JCO. 2009:27 Suppl 15S:e20712.
- Holford ME, Rajeevan H, Zhao H, Kidd KK, Cheung KH (2009). "การบูรณาการเส้นทางการเกิดมะเร็งและข้อมูลความถี่ของอัลลีลบนเว็บเชิงความหมาย" Cancer Informatics . 8 : 19– 30. doi : 10.4137/CIN.S1006 . PMC 2664696 . PMID 19458791 .
- Huang T, Shenoy PJ, Sinha R, Graiser M, Bumpers KW, Flowers CR (2009). "การพัฒนาระบบฐานข้อมูลสถาปัตยกรรมองค์กรมะเร็งต่อมน้ำเหลือง: ระบบที่สอดคล้องกับมาตรฐาน caBIG ระดับ Silver" Cancer Informatics . 8 : 45– 64. doi : 10.4137/CIN.S940 . PMC 2675136 . PMID 19492074 .
- Kunz I, Lin MC, Frey L (2009). "การแมปและการนำเมตาเดตาไปใช้ซ้ำใน caBIG" . BMC Bioinformatics . 10 (Suppl 2): S4. doi : 10.1186/1471-2105-10-S2-S4 . PMC 2646244 . PMID 19208192 .
- Ohmann C, Kuchinke W (2009). "การพัฒนาในอนาคตของสารสนเทศทางการแพทย์จากมุมมองของการวิจัยทางคลินิกแบบเครือข่าย ความสามารถในการทำงานร่วมกันและการบูรณาการ"วิธีการสารสนเทศทางการแพทย์ 48 ( 1): 45– 54. doi : 10.3414/me9137 . PMID 19151883 . S2CID 23089030 .
{{cite journal}}: CS1 maint: บริการเก็บถาวรที่เลิกใช้แล้ว ( ลิงก์ ) - Phan JH, Moffitt RA, Stokes TH และคณะ (มิถุนายน 2552) "การบรรจบกันของไบโอมาร์กเกอร์ ชีวสารสนเทศ และนาโนเทคโนโลยีเพื่อการรักษาโรคมะเร็งเฉพาะบุคคล"แนวโน้มในเทคโนโลยีชีวภาพ 27 ( 6): 350– 8. doi : 10.1016/j.tibtech.2009.02.010 . PMC 3779321 . PMID 19409634 .
- Staes CJ, Xu W, LeFevre SD และคณะ (2009). "กรณีศึกษาการใช้สถาปัตยกรรมกริดสำหรับสารสนเทศสาธารณสุขของรัฐ: มุมมองจากยูทาห์" BMC Medical Informatics and Decision Making 9 : 32. doi : 10.1186/1472-6947-9-32 . PMC 2707374 . PMID 19545428 .
- Peter A. Covitz; Frank Hartel; Carl Schaefer; Sherri De Coronado; Gilberto Fragoso; Himanso Sahni; Scott Gustafson & Kenneth H. Buetow (23 เมษายน 2546). "caCORE: โครงสร้างพื้นฐานทั่วไปสำหรับสารสนเทศมะเร็ง" Bioinformatics . 19 (18): 2404– 2412. doi : 10.1093/bioinformatics/btg335 . PMID 14668224 .
- “เทคโนโลยีสารสนเทศด้านสุขภาพกลายเป็นเรื่องส่วนตัว” InformationWeek (13 พฤศจิกายน 2552)
- “ข้อมูลสุขภาพดิบ” เก็บถาวรเมื่อ 2010-12-26 ที่Wayback Machineฝ่ายไอทีด้านสุขภาพของรัฐบาล (11/6/09)
- “NCI จะเปิดเครือข่ายงานวิจัยให้แก่ 'กองทัพ' ผู้ป่วยมะเร็ง” เก็บถาวรเมื่อ 2010-11-26 ที่Wayback Machineฝ่ายเทคโนโลยีสารสนเทศด้านสุขภาพของรัฐบาล (10/9/09)
- “GridBriefing: อนาคตของการดูแลสุขภาพ - eHealth และ Grid Computing” GridTalk (9/09)
- “การทำงานร่วมกันและความยั่งยืนเป็นหัวใจสำคัญของ caBIG ในโอกาสครบรอบ 5 ปี” GenomeWeb/BioInform (7/09)
- “การแบ่งปันความมั่งคั่งของข้อมูล” Scientific American (5/09)
- “งานวิจัยเชิงแปลผลผลักดันความต้องการไบโอแบงก์เสมือนจริงที่สร้างขึ้นบนเครื่องมือ caBIG” GenomeWeb/BioInfom (3 เมษายน 2552)
- "caGrid" . เก็บถาวรจากต้นฉบับเมื่อ 2012-02-05 . เรียกดูเมื่อ2016-11-22 .
- "caGrid 1.0: โครงสร้างพื้นฐานกริดระดับองค์กรสำหรับการวิจัยทางการแพทย์ชีวภาพ "
- "การเปิดใช้งานการจัดหาและการจัดการโครงสร้างพื้นฐานความเชื่อถือของโครงข่ายแบบรวมศูนย์ "
- "ขอแนะนำ: ชุดเครื่องมือโอเพนซอร์สสำหรับการพัฒนาบริการกริดที่มีการกำหนดประเภทข้อมูลอย่างเข้มงวดอย่างรวดเร็ว "
- "caGrid: การออกแบบและการนำสถาปัตยกรรมหลักของโครงข่ายสารสนเทศชีวการแพทย์สำหรับโรคมะเร็งไปใช้ "
- Tan, Wei; Foster, Ian; Madduri, Ravi (2008). "การผสานพลังของ Taverna และ caGrid: เวิร์กโฟลว์ทางวิทยาศาสตร์ที่ช่วยให้การทำงานร่วมกันในระดับเว็บเป็นไปได้" IEEE Internet Computing . 12 (6): 61– 68. doi : 10.1109/MIC.2008.120 . S2CID 2690862 .
ลิงก์ภายนอก
- เว็บไซต์สำหรับผู้บริโภค/ผู้ใช้งานของ caBIG (ไม่เน้นด้านเทคนิค)
- เว็บไซต์ชุมชน caBIG (ด้านเทคนิค)
- วิกิ caGrid
- โปรเจ็กต์ caGrid gforge
- caGrid Portal
ส่วนประกอบ
- ขอแนะนำ Toolkit ซึ่งเป็น โครงการบ่มเพาะของ Globus เช่นกัน
- บริการข้อมูล
- เมตาเดตา
- ความปลอดภัย
- บริการมอบอำนาจการรับรอง (CDS)
- ดอเรียน
- การ์ดส์
- กริดกรุ๊ปเปอร์
- บริการความไว้วางใจด้านโครงข่ายไฟฟ้า (GTS)
- WebSSO - ส่วนประกอบ การเข้าสู่ระบบครั้งเดียวบนเว็บ (Web Single Sign-on)ที่ใช้JASIG CAS
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ caBIG
โครงการเครือข่ายข้อมูลชีวการแพทย์มะเร็ง ( caBIG ) เป็นโครงการของรัฐบาลสหรัฐฯ
ประวัติศาสตร์
สถาบันมะเร็งแห่งชาติ (NCI) ของสหรัฐอเมริกาให้ทุนสนับสนุนโครงการโครงข่ายข้อมูลชีวการแพทย์มะเร็ง (caBIG) ในฤดูใบไม้ผลิปี 2547 โดยมี Kenneth Buetow เป็นหัวหน้า [ 1 ] เป้าหมายคือการเชื่อมต่อนักวิจัยมะเร็งชีวการแพทย์ของสหรัฐฯ
เทคโนโลยีสารสนเทศด้านสุขภาพ
เทคโนโลยีสารสนเทศด้านสุขภาพ (HIT) ได้รับการส่งเสริมเพื่อการจัดการและการแลกเปลี่ยนข้อมูลทางการแพทย์อย่างปลอดภัยระหว่างนักวิจัย ผู้ให้บริการด้านสุขภาพ และผู้บริโภค โครงการริเริ่มด้าน HIT ที่กล่าวถึง caBIG ได้แก่: สถาบันมะเร็งแห่งชาติ (NCI) และ...
ความร่วมมือ
กลุ่มความร่วมมือด้านสุขภาพ caBIG ก่อตั้งขึ้นในปี 2551 เพื่อส่งเสริมการแพทย์เฉพาะบุคคล แต่ได้ยุบเลิกไปในปี 2555 [ 6 ] ในเดือนกรกฎาคม 2552 caBIG ได้ประกาศความร่วมมือกับมูลนิธิวิจัยดร.