Gröber เป็นผู้สนับสนุนการขึ้นสู่อำนาจของอดอล์ฟ ฮิตเลอร์ ตั้งแต่แรกเริ่ม เขากลายเป็นสมาชิกสนับสนุนของSchutzstaffelในปี 1933 ^{[ 3 ]} รับเอา วาทกรรมต่อต้านชาวยิวของระบอบการปกครอง^{[ 4 ]}และเสนอข้อโต้แย้งเพียงเล็กน้อยและไร้ผลต่อนโยบายที่ไร้มนุษยธรรม เช่นการทำหมันโดยบังคับหรือการฆาตกรรมคนพิการ ด้วยวิธีการยู จีนิกส์ ใน Aktion T4ในช่วงเริ่มต้นของสงครามเขาแสดงความหวังว่า "การต่อสู้เพื่อกำจัดลัทธิคอมมิวนิสต์ที่ไร้พระเจ้า [จะเป็น] โหดเหี้ยม" ^{[ 5 ] [ 6 ]}

ในเดือนเมษายน พ.ศ. 2476 Gröber แสดงความคิดเห็นว่าการต่อต้านระบอบนาซีเป็นความโง่เขลาของ " ผู้พลีชีพแห่งความโง่เขลา " (" Märtyrer der Dummheit ") ^{[ 7 ]} ดังนั้น Gröber จึงเขียนคำตักเตือนลงวันที่ 8 พฤศจิกายน พ.ศ. 2476 ในหัวข้อการลงคะแนนเสียงและการลงประชามติเกี่ยวกับการถอนตัวของเยอรมนีจากสันนิบาตชาติ ว่าเป็นหน้าที่ต่อปิตุภูมิที่จะต้องแสดงความเป็นเอกฉันท์กับเพื่อนร่วมชาติ นโยบายความร่วมมือของเขาทำให้ Gröber ได้รับฉายาว่า Der braune Bischof (บิชอปสีน้ำตาล) ในหมู่ประชาชนดังนั้น ในช่วงที่รัฐบาลระดับจังหวัดอยู่ภายใต้การควบคุมของรัฐบาลกลางนาซี เขาได้ส่งโทรเลขแสดงความยินดีไปยังโรเบิร์ต ไฮน์ริช วากเนอร์ นักการเมืองพรรคนาซีที่ได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้ว่าการในบาเดนโดยมีข้อความดังนี้: "ในภารกิจอันยิ่งใหญ่ที่อยู่เบื้องหน้าท่าน ข้าพเจ้าขอวางตัวเป็นผู้นำทางศาสนาคาทอลิกในบาเดนอย่างไม่ลังเล และจะอยู่เคียงข้างท่าน" ในการประชุมสังฆมณฑลที่ไฟรบูร์ก ระหว่างวันที่ 25-28 เมษายน 1933 เขาได้ให้คำแนะนำแก่คณะสงฆ์ในสังฆมณฑลว่า "อย่าก่อการยั่วยุ และอย่าพลีชีพโดยเปล่าประโยชน์"

ในการเจรจาเพื่อสรุปสนธิสัญญาระหว่างเยอรมนีและนครวาติกัน แม้แต่สภาบิชอปเยอรมันก็ถูกกีดกันออกไปจนกระทั่งก่อนการลงนามข้อตกลงไม่นาน แต่โกรเบอร์ได้รับข้อมูลเตรียมการสำหรับการเจรจาผ่านทางเพื่อนของเขา ประธานพรรคกลาง มงส์ญอร์ลุดวิก คาสส์ เขาจึงกระตือรือร้นที่จะส่งเสริมกระบวนการนี้และทำให้ตัวเองโดดเดี่ยวจากบิชอปคนอื่นๆ ในวันที่ 3 มิถุนายน 1933 จดหมายอภิบาลร่วมจากสภาบิชอปเยอรมันปรากฏขึ้น ซึ่งบิชอปได้มอบหมายให้โกรเบอร์เป็นผู้ร่าง จดหมายดังกล่าวระบุว่า หากรัฐเคารพสิทธิและข้อกำหนดบางประการของศาสนจักร ศาสนจักรก็จะยินดีและขอบคุณอย่างยิ่งสำหรับสถานการณ์ใหม่นี้

ในเดือนสิงหาคม ค.ศ. 1933 อัครสังฆมณฑลไฟรบูร์กได้ตีพิมพ์ในหนังสือพิมพ์ทางการ ซึ่งอยู่ภายใต้ความรับผิดชอบของโกรเบอร์ คำสั่งของกระทรวงวัฒนธรรมและการศึกษาแห่งบาเดิน เกี่ยวกับการแสดงความเคารพแบบฮิตเลอร์ในการสอนศาสนา และด้วยเหตุนี้จึงเป็นการรับรองพฤติกรรมนี้อย่างเป็นทางการ ซึ่งนำไปสู่ความไม่พอใจอย่างมากในหมู่ผู้ศรัทธาของสังฆมณฑล ในวันที่ 10 ตุลาคม ค.ศ. 1933 ในงานคาทอลิกขนาดใหญ่ในคาร์ลสรูห์ โกรเบอร์ได้กล่าวขอบคุณ "คนของรัฐบาล" อย่างชัดเจนสำหรับการปรากฏตัวของพวกเขาว่า "ผมจะไม่เปิดเผยความลับใดๆ หากผมอธิบายว่า ในช่วงไม่กี่เดือนที่ผ่านมา การติดต่อระหว่างรัฐบาลคริสตจักรในไฟรบูร์กกับรัฐบาลในคาร์ลสรูห์ดำเนินไปในทางที่เป็นมิตรที่สุด ผมเชื่อว่าผมจะไม่เปิดเผยความลับใดๆ ไม่ว่าจะเป็นต่อคุณหรือต่อชาวเยอรมัน หากผมบอกว่าผมสนับสนุนรัฐบาลใหม่และไรช์ ใหม่โดยไม่มีเงื่อนไข "

รัฐมนตรีว่าการกระทรวงมหาดไทยแห่งบาเดิน พฟลอเมอร์ ได้ปฏิบัติตามคำมั่นสัญญาความร่วมมือที่โกรเบอร์ให้ไว้ และส่งคำสั่งต่อไปนี้ไปยังสำนักงานใหญ่ตำรวจเมื่อวันที่ 13 พฤศจิกายน 1933 ว่า "ต่อไปนี้จะไม่อนุญาตให้ใช้มาตรการรุนแรงต่อพระสงฆ์คาทอลิกนอกเหนือจากกรอบของกฎหมายทั่วไป" ในช่วงปลายปี 1933 โกรเบอร์ได้ร้องเรียนในจดหมายถึงพระคาร์ดินัลเลขาธิการแห่งรัฐ ยูจีนิโอ ปาเชลลี เกี่ยวกับพระสงฆ์ที่วิพากษ์วิจารณ์ระบอบการปกครอง ซึ่งถูกนำตัวไป "ควบคุมตัวเพื่อความปลอดภัย" (Schutzhaft)ว่าไม่ใช่เรื่องง่ายเสมอไปที่จะได้รับความระมัดระวังและการไตร่ตรองอย่างชาญฉลาดจากพระสงฆ์ ซึ่งภายใต้การประเมินสถานการณ์พื้นฐานอย่างครบถ้วน จะช่วยปกป้องพระสงฆ์แต่ละรูปจากความไม่สะดวกต่างๆ ได้

ในช่วงเวลานี้เองที่เขาตัดสินใจร่วมกับชายอีกไม่กี่คนในมหาวิหารให้เข้าร่วมเป็น "สมาชิกสนับสนุน" ของSSเขาโต้แย้งถึง "สิทธิของชาติในการรักษาต้นกำเนิดทางเชื้อชาติของชาติให้บริสุทธิ์และทำทุกสิ่งที่จำเป็นเพื่อรับประกันเป้าหมายนี้" ^{[ 3 ]}

หลังสงคราม โกรเบอร์อธิบายเรื่องนี้โดยกล่าวว่า ในเวลานั้น หน่วยเอสเอสในไฟรบูร์กถือเป็นองค์กรที่เหมาะสมที่สุดของพรรค

ในปี พ.ศ. 2484 Gröber ในขณะที่สนับสนุนความพยายามช่วยเหลือชาวยิวที่ถูกกดขี่ข่มเหง ได้เขียนจดหมายอภิบาลว่า สภาพที่น่าเศร้าของชาวยิวเป็นผลมาจากคำสาปที่พวกเขานำมาสู่ตนเองเมื่อพวกเขาฆ่าพระคริสต์ Anton Rauscher กล่าวว่าเทววิทยาคาทอลิกในยุคนั้นสะท้อนให้เห็นถึง "มุมมองเกี่ยวกับชาวยิวที่กระตุ้นให้เกิดการต่อต้านชาวยิวในด้านหนึ่ง ในขณะที่อีกด้านหนึ่งบั่นทอนความสามารถในการต่อต้านมัน" ^{[ 8 ]}

ในวันศุกร์ศักดิ์สิทธิ์ปี 1941 เขาได้เทศนาโดยใช้ถ้อยคำที่ใกล้เคียงกับ ถ้อยคำ ต่อต้านชาวยิวของพวกนาซีอย่างมาก:

“แรงผลักดันสำคัญเบื้องหลังอำนาจทางกฎหมายของชาวยิวคือการประจบประแจงอย่างก้าวร้าวและการทรยศหักหลังอันชั่วร้ายของพวกฟาริสี พวกเขาเปิดเผยตัวตนที่แท้จริงออกมามากกว่าที่เคยว่าเป็นศัตรูตัวฉกาจของพระคริสต์ ศัตรูที่ร้ายกาจ... ดวงตาของพวกเขาถูกปิดบังด้วยอคติและถูกบดบังด้วยความโลภในอำนาจทางโลกของชาวยิว” ส่วน “ประชาชน” หรือในคำพูดของท่านอาร์คบิชอปคือ “ฝูงชนชาวยิวที่ลังเล” นั้น ท่านกล่าวว่า “การปฏิบัติการลับของพวกฟาริสีได้ปลุกสัญชาตญาณดิบในหมู่พวกเขาด้วยการโกหกและการใส่ร้าย และมันก็กระหายความตื่นเต้นอันน่าสยดสยองและเลือดเนื้อ”

เกี่ยวกับยูดาส: "คนชั่วช้าสารเลวคนนี้...นั่งประจบประแจงในพิธีศีลมหาสนิท...ซึ่งซาตานได้เข้าสิงเขา...และทำให้เขาเป็นผู้นำของบรรดาผู้รับใช้ของยูดาสในยุคปัจจุบัน...ตามแบบฉบับของชาวยิว เขาต่อรองกับมหาปุโรหิต...พระองค์ [พระคริสต์] ถูกทรยศด้วยสัญลักษณ์แห่งความรักที่ล้นเหลือ ด้วยจูบอันเร่าร้อนจากริมฝีปากสกปรกของยูดาส"

สุดท้าย ณ ฉากของEcce Homo : "ความเห็นอกเห็นใจทั้งหมดของชาวยิวถูกซ่อนไว้ภายใต้ความโหดร้ายป่าเถื่อน สัตว์ร้ายได้กลิ่นเลือดมนุษย์และต้องการดับกระหายที่ลุกโชนด้วยเลือดนั้น.... ในขณะเดียวกัน คำสาปแช่งตนเองที่บ้าคลั่งแต่เป็นความจริงของชาวยิวก็กรีดร้องว่า: เลือดของเขาจงตกอยู่กับเราและลูกหลานของเรา! คำสาปแช่งได้สำเร็จอย่างน่าสยดสยอง จนถึงทุกวันนี้..." ^{[ 9 ]}

เมื่อวันที่ 15 กรกฎาคม พ.ศ. 2481 หนังสือพิมพ์คาทอลิกเฮรัลด์ของอังกฤษรายงานว่าโกรเบอร์ได้เผยแพร่ "เอกสารที่น่าทึ่ง...ซึ่งแสดงให้เห็นภาพสถานการณ์ทางศาสนาในเยอรมนีหลังจากการปกครองของนาซีเป็นเวลาห้าปี" เอกสารดังกล่าวประท้วงการกดขี่ข่มเหงทางศาสนาต่อชาวคาทอลิกในเยอรมนี โดยให้รายละเอียดเกี่ยวกับการโจมตีนักบวช การแทรกแซงการปฏิบัติศาสนาและการดำเนินงานขององค์กรสวัสดิการ การยึดทรัพย์สินของโบสถ์ ข้อจำกัดในการเผยแพร่พระกิตติคุณ และการปราบปรามสื่อคาทอลิกและการศึกษาคาทอลิก^{[ 10 ]}

หลังจากเริ่มมีการสังหารผู้พิการทางจิตและร่างกายอย่างเป็นระบบ ซึ่งเรียกว่าการุณยฆาตเขาได้ประท้วงในจดหมายถึงรัฐมนตรีว่าการกระทรวงมหาดไทยแห่งบาเดน พฟลอเมอร์ และเป็นบิชอปชาวเยอรมันคนแรกที่ทำเช่นนั้นเป็นลายลักษณ์อักษร ตามที่ชวาลบัคกล่าว^{[ 11 ]}เมื่อวันที่ 1 สิงหาคม พ.ศ. 2483 โกรเบอร์เขียนจดหมายถึงหัวหน้าสำนักนายกรัฐมนตรีแห่งไรช์ และเตือนว่าการฆาตกรรมจะทำลายชื่อเสียงของเยอรมนี เขาเสนอที่จะจ่ายค่าใช้จ่ายทั้งหมดที่รัฐต้องเสียไปสำหรับ "การดูแลผู้ป่วยทางจิตที่ตั้งใจจะตาย" ^{[ 12 ]}อย่างไรก็ตาม เขาไม่ได้ดำเนินการใดๆ ที่อาจได้ผล โดยปล่อยให้เคลเมนส์ ออกัสต์ กราฟ ฟอน กาเลนบิชอปแห่งมึนสเตอร์เป็นผู้คัดค้านการฆาตกรรมเหล่านี้อย่างเปิดเผยโดยเสี่ยงอันตรายต่อตนเองอย่างมาก

โกรเบอร์โอบแขนปกป้องเกอร์ทรูด ลัคเนอ ร์ ผู้ทำงานต่อต้านชาวเยอรมันลัคเนอร์ได้จัดตั้ง "สำนักงานบรรเทาทุกข์ทางศาสนาในสงคราม" ( Kirchliche Kriegshilfsstelle ) โดยได้รับการสนับสนุนจากโกรเบอร์ ภายใต้การดูแลของหน่วยงานช่วยเหลือคาทอลิก Caritas สำนักงานนี้กลายเป็นเครื่องมือที่ชาวคาทอลิกในไฟรบูร์กใช้ช่วยเหลือ "ผู้ที่ไม่ใช่ชาวอารยัน" ที่ถูกกดขี่ทางเชื้อชาติ (ทั้งชาวยิวและชาวคริสต์) ^{[ 13 ]}ลัคเนอร์ขับเคลื่อนความพยายามบรรเทาทุกข์นี้ โดยใช้เงินทุนที่ได้รับจากอาร์คบิชอปเพื่อลักลอบนำชาวยิวไปยังสวิตเซอร์แลนด์และสื่อสารสภาพความเป็นอยู่ของชาวยิวให้โลกภายนอกรับรู้ เธอตรวจสอบชะตากรรมของชาวยิวที่ถูกขนส่งไปยังตะวันออกด้วยตนเอง และสามารถได้รับข้อมูลเกี่ยวกับนักโทษในค่ายกักกัน และจัดหาเสื้อผ้า อาหาร และเงินสำหรับแรงงานบังคับและเชลยศึก^{[ 14 ]}ลัคเนอร์ถูกเกสตาโปจับกุมในเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2486 และถูกคุมขังที่ค่ายกักกันราเวนส์บรุค^{[ 13 ]}

กลุ่ม Kreisau Circleก่อตั้งขึ้นราวปี 1937 โดยเป็นหนึ่งในกลุ่มต่อต้านลับของเยอรมนีไม่กี่กลุ่มที่ปฏิบัติการอยู่ภายในนาซีเยอรมนี^{[ 15 ] [ 16 ] แม้ว่าจะมีหลายนิกาย แต่ก็มีแนวทางที่เน้น ศาสนา}คริสต์อย่างมาก มุมมองของพวกเขามีรากฐานมาจากทั้งประเพณีโรแมนติกและอุดมคติของเยอรมัน และหลักคำสอนของคาทอลิกเรื่องกฎธรรมชาติ [ ^{17 ]}สมาชิกหลักของกลุ่มประกอบด้วยบาทหลวงเยซูอิตAugustin Rösch , Alfred DelpและLothar König [ ^{16 ] König}ทำหน้าที่เป็นตัวกลางระหว่างกลุ่มกับ Conrad Grober ^{[ 18 ]}

ในทางกลับกัน เขายังคงถูกตำหนิมาจนถึงทุกวันนี้ด้วยเหตุผลที่ว่าเขาไม่ได้ให้การสนับสนุนอย่างเพียงพอแก่บิชอปผู้ช่วย โยฮันเนส บาปติสตา สโปรลล์ซึ่งถูกขับไล่ออกจากสังฆมณฑลรอทเทนเบิร์กตั้งแต่ปี 1938

โกรเบอร์เขียนจดหมายฉบับหนึ่งซึ่งยังคงเป็นที่ถกเถียงกันอยู่จนถึงทุกวันนี้ ถึง โรลันด์ ไฟรส์เลอร์ประธานศาลประชาชน ( Volksgerichtshof ) ผู้ซึ่งตัดสินประหารชีวิตแม็กซ์ โจเซฟ เมทซ์เกอร์ บาทหลวงในสังฆมณฑลของเขา:

ท่านประธานศาลประชาชนผู้ทรงเกียรติ!

ขณะนี้ ข้าพเจ้าได้รับข่าวเกี่ยวกับการดำเนินคดีที่นำไปสู่โทษประหารชีวิตของบาทหลวงประจำสังฆมณฑลของข้าพเจ้า ดร. แม็กซ์ เมทซ์เกอร์ ข้าพเจ้าเสียใจอย่างสุดซึ้งต่อความผิดที่ท่านได้กระทำ หากข้าพเจ้าได้บรรยายท่านว่าเป็นผู้มีอุดมคติในข้อความที่ส่งถึงทนายความ ดร. ดิกซ์ นั้น ข้าพเจ้าไม่ทราบมาก่อนว่าท่านได้กระทำความผิดทางอาญา ข้าพเจ้าคิดว่าเป็นเรื่องสำคัญที่จะต้องแจ้งให้ท่านทราบ เพราะข้าพเจ้าไม่เห็นด้วยอย่างยิ่งที่จะจัดให้การกระทำของท่านอยู่ในขอบเขตของอุดมคติอย่างที่ข้าพเจ้าได้บรรยายไว้

ในขณะที่งานวิจัยบางส่วนมองว่าจดหมายฉบับนี้เป็นวิธีการสุดท้ายที่ใช้เป็นมาตรการทางยุทธวิธีเพื่อขอให้เปลี่ยนโทษประหารชีวิตเป็นจำคุก งานวิจัยอีกส่วนหนึ่งกลับมองว่าเป็นการถอยห่างอย่างขี้ขลาดจากชายที่ถูกตัดสินประหารชีวิตโดยไม่มีเหตุผลอันสมควร อย่างไรก็ตาม จำเป็นต้อง มีการวิเคราะห์แหล่งข้อมูลอย่างละเอียดถี่ถ้วน เพราะเอกสารอื่นๆ จากยุคนั้นแสดงให้เห็นว่า Gröber ได้ดำเนินการเพื่อขอให้ลดโทษจริง ดังนั้นจึงเห็นได้ชัดว่า Gröber เชื่อว่าการยอมรับเหตุผลในการตัดสินเท่านั้นที่จะทำให้เขามีโอกาสประสบความสำเร็จแม้เพียงเล็กน้อยต่อ Freisler

เมื่อวันที่ 12 พฤศจิกายน โกรเบอร์ได้แจ้งคำพิพากษาลงโทษเมทซ์เกอร์แก่คณะสงฆ์ในสังฆมณฑลของเขา โดยมีถ้อยคำสำคัญหลายประการ รวมถึงข้อความต่อไปนี้:

กรณีอันน่าเศร้านี้ควรเป็นบทเรียนสำคัญสำหรับเรา ว่าเราควรละเว้นอย่างระมัดระวังจากทุกสิ่งทุกอย่างที่อาจทำร้ายปิตุภูมิของเราในยามยากลำบากนี้ และอาจทำร้ายตัวเราเองด้วย เราควรให้เกียรติด้วยความกตัญญูและด้วยการอธิษฐานต่อการเสียสละและความสำเร็จอันยิ่งใหญ่ของทหารของเราในสนามรบ เสริมสร้างความกล้าหาญของผู้ศรัทธาของเราในบ้านเกิด [...] พิจารณาถึงหายนะอันน่าสะพรึงกลัวของสงครามที่พ่ายแพ้ซึ่งมีผลลัพธ์แบบบอลเชวิก และขอพรจากพระเจ้าทุกวัน... เพื่อปกป้องบ้านเกิดของเราและประทานพรให้มีสันติภาพอันทรงเกียรติทั้งภายในและภายนอก

อย่างไรก็ตาม ความขัดแย้งอันขมขื่นจากยุคนาซียังคงอยู่: โกรเบอร์พยายามปิดบังเหตุการณ์ที่จัดขึ้นสำหรับ "บาทหลวงค่ายกักกัน" ซึ่งริเริ่มโดยบาทหลวงวิลเฮล์ม เคอห์เลอร์และริชาร์ด ชไนเดอร์ผู้ซึ่งเป็นบาทหลวงประจำสังฆมณฑลคนแรกที่ถูกนำตัวไปยังค่ายกักกันดาเคาในปี 1940 แม้ว่าบาทหลวง 5 ใน 16 คนจากสังฆมณฑลของโกรเบอร์ที่ถูกคุมขังในค่ายจะถูกฆาตกรรมก็ตาม

บรรดา "บาทหลวงจากค่ายกักกัน" เช่นเดียวกับบาทหลวงแห่งสังฆมณฑลมึนสเตอร์ที่ได้รับการยกย่องอย่างเป็นทางการในพิธีทางศาสนาโดยบิชอปแห่งมึนสเตอร์ ต้องการรำลึกถึงเพื่อนร่วมคณะที่เสียชีวิตและเน้นย้ำต่อจิตสำนึกของสาธารณชนว่า การเสีย ชีวิตของพวกเขาไม่ควร สูญเปล่าบาทหลวงเหล่านั้นได้แสดงความตำหนิที่เกิดขึ้นกับพวกเขาในมติว่า "เรารู้สึกเสียใจแม้กระทั่งตอนนี้ที่เรายังต้องได้ยินจากคณะสงฆ์ว่าเราเป็นเพียงความโง่เขลาของเราเองที่ต้องโทษ ว่าเราเป็นเหยื่อของเกสตาโปเราพบว่าเป็นการยากที่จะหลีกเลี่ยงความรู้สึกที่ว่า บาทหลวงที่ได้รับความโปรดปรานจากฝ่ายบริหารของศาสนจักรมากกว่า คือบาทหลวงที่ติดต่อกับตำรวจลับของรัฐ น้อยกว่า "