อ่าน 9 นาที
มุมไดเฮดรัล
มุมไดเฮดรัล คือมุม ระหว่าง ระนาบหรือครึ่งระนาบสอง ระนาบที่ ตัดกัน เป็น มุมระนาบที่เกิดขึ้นบนระนาบที่สาม ซึ่งตั้งฉากกับ เส้น ตัดระหว่างระนาบทั้งสอง หรือ ขอบ ร่วม...
มุมไดเฮดรัล

| ประเภทของมุม |
|---|
| มุม 2 มิติ |
| คู่มุม 2 มิติ |
| มุมสามมิติ |
มุมไดเฮดรัลคือมุมระหว่างระนาบหรือครึ่งระนาบสองระนาบที่ตัดกันเป็นมุมระนาบที่เกิดขึ้นบนระนาบที่สาม ซึ่งตั้งฉากกับเส้นตัดระหว่างระนาบทั้งสอง หรือขอบ ร่วม ระหว่างครึ่งระนาบทั้งสอง ในมิติที่สูงกว่ามุมไดเฮดรัลแสดงถึงมุมระหว่างไฮเปอร์เพลน สองระนาบ ใน ทาง เคมี มุมไดเฮดรั ลคือมุมตามเข็มนาฬิการะหว่างครึ่งระนาบที่ผ่านกลุ่มอะตอมสามอะตอม สองกลุ่ม โดยมีอะตอมร่วมกันสองอะตอม
พื้นฐานทางคณิตศาสตร์
เมื่อระนาบตัดกันสองระนาบถูกอธิบายในแง่ของพิกัดคาร์ทีเซียนด้วยสมการสองสมการต่อไปนี้
มุมไดเฮดรัลระหว่างพวกมันคำนวณได้จากสูตร:
และเป็นไปตามเงื่อนไขสามารถสังเกตได้อย่างง่ายดายว่ามุมนั้นไม่ขึ้นอยู่กับ และ
อีกทางเลือกหนึ่ง ถ้าn Aและn Bเป็นเวกเตอร์ตั้งฉากกับระนาบ จะได้ว่า
โดยที่n A · n Bคือผลคูณดอทของเวกเตอร์ และ| n A | | n B |คือผลคูณของความยาวของเวกเตอร์ทั้งสอง[ 1 ]
ค่าสัมบูรณ์มีความจำเป็นในสูตรข้างต้น เนื่องจากระนาบจะไม่เปลี่ยนแปลงเมื่อเปลี่ยนเครื่องหมายสัมประสิทธิ์ทั้งหมดในสมการเดียว หรือเมื่อแทนที่เวกเตอร์ปกติหนึ่งตัวด้วยเวกเตอร์ตรงข้าม
อย่างไรก็ตามควรหลีกเลี่ยงค่าสัมบูรณ์ เมื่อพิจารณามุมไดเฮดรัลของ ระนาบครึ่งสองระนาบที่มีขอบเขตเป็นเส้นเดียวกัน ในกรณีนี้ ระนาบครึ่งสามารถอธิบายได้ด้วยจุดP ที่เป็นจุดตัด และเวกเตอร์สามตัว b₀, b₁ และ b₂ โดยที่ P + b₀, P + b₁และP + b₂เป็นของเส้นตัดระนาบครึ่งแรกและระนาบครึ่งที่สองตามลำดับมุมไดเฮด รั ลของระนาบครึ่งทั้งสองนี้กำหนดโดย
- ,
และตรงตามเงื่อนไขในกรณีนี้ การสลับระนาบครึ่งทั้งสองจะให้ผลลัพธ์เดียวกัน และการแทนที่ด้วย ก็ให้ผลลัพธ์เช่นเดียวกันในวิชาเคมี (ดูด้านล่าง) เรากำหนดมุมไดเฮดรัลโดยที่การแทนที่ด้วยจะเปลี่ยนเครื่องหมายของมุม ซึ่งอาจอยู่ระหว่าง −πและπ
ในฟิสิกส์พอลิเมอร์
ในบางสาขาวิทยาศาสตร์ เช่นฟิสิกส์พอลิเมอร์อาจพิจารณาโซ่ของจุดและการเชื่อมโยงระหว่างจุดที่ต่อเนื่องกัน หากจุดต่างๆ มีหมายเลขเรียงลำดับและตั้งอยู่ที่ตำแหน่งr 1 , r 2 , r 3เป็นต้น เวกเตอร์พันธะจะถูกกำหนดโดยu 1 = r 2 − r 1 , u 2 = r 3 − r 2และu i = r i+1 − r iโดยทั่วไป[ 2 ]นี่คือกรณีของโซ่จลนศาสตร์หรือกรดอะมิโนในโครงสร้างโปรตีนในกรณีเหล่านี้ มักจะสนใจระนาบครึ่งที่กำหนดโดยจุดสามจุดที่ต่อเนื่องกัน และมุมไดเฮดรัลระหว่างระนาบครึ่งสองระนาบที่ต่อเนื่องกันดังกล่าว ถ้าu 1 , u 2และu 3เป็นเวกเตอร์พันธะสามตัวที่ต่อเนื่องกัน จุดตัดของระนาบครึ่งจะมีทิศทาง ซึ่งช่วยให้สามารถกำหนดมุมไดเฮดรัลที่อยู่ในช่วง(− π , π ]ได้ มุมไดเฮดรัลนี้กำหนดโดย[ 3 ]
หรือใช้ฟังก์ชันatan2ก็ได้
มุมไดเฮดรัลนี้ไม่ขึ้นอยู่กับทิศทางของโซ่ (ลำดับที่พิจารณาจุดต่างๆ) — การกลับลำดับนี้ทำได้โดยการแทนที่เวกเตอร์แต่ละตัวด้วยเวกเตอร์ตรงข้าม และสลับดัชนี 1 และ 3 การดำเนินการทั้งสองอย่างนี้ไม่เปลี่ยนแปลงค่าโคไซน์ แต่เปลี่ยนเครื่องหมายของค่าไซน์ ดังนั้น เมื่อรวมกันแล้วจึงไม่เปลี่ยนแปลงมุม
สูตรที่ง่ายกว่าสำหรับมุมไดเฮดรัลเดียวกันมีดังต่อไปนี้ (พิสูจน์ได้ด้านล่าง)
หรือเทียบเท่า
สามารถอนุมานได้จากสูตรก่อนหน้านี้โดยใช้ สูตร ผลคูณเวกเตอร์สี่ตัวและข้อเท็จจริงที่ว่าผลคูณสเกลาร์สามตัวจะเป็นศูนย์หากมีเวกเตอร์เดียวกันสองครั้ง:
จากนิยามของผลคูณไขว้หมายความว่าคือมุมในทิศทางตามเข็มนาฬิกาของอะตอมที่สี่เมื่อเทียบกับอะตอมแรก โดยมองตามแกนจากอะตอมที่สองไปยังอะตอมที่สาม กรณีพิเศษ (อาจกล่าวได้ว่าเป็นกรณีปกติ) คือ, และซึ่งเรียกว่าโครงสร้าง แบบทรานส์ , โกช+และโกช− ตามลำดับ
ในสเตอริโอเคมี
| ชื่อการกำหนดค่าตามมุมไดเฮดรัล | ซินเอ็น- บิวเทนใน โครงสร้าง แบบกอช− (−60°) การฉายภาพแบบนิวแมน | การฉายภาพขาตั้งเลื่อย ซิน เอ็น- บิวเทน |

มุมบิด (torsion angle ) ที่พบในสเตอริโอเคมีเป็นตัวอย่างเฉพาะของมุมไดเฮดรัล (dihedral angle) ที่อธิบายความสัมพันธ์ทางเรขาคณิตของสองส่วนของโมเลกุลที่เชื่อมต่อกันด้วยพันธะเคมี[ 4 ] [ 5 ] อะตอมสามอะตอมที่ไม่เรียงตัวกันในแนวเดียวกันของ โมเลกุลแต่ละชุดจะกำหนดระนาบครึ่งหนึ่ง ดังที่อธิบายไว้ข้างต้น เมื่อระนาบครึ่งหนึ่งสองระนาบตัดกัน (เช่น อะตอมสี่อะตอมที่เชื่อมต่อกันอย่างต่อเนื่อง) มุมระหว่างระนาบทั้งสองจะเป็นมุมไดเฮดรัล มุมไดเฮดรัลใช้เพื่อระบุโครงสร้างโมเลกุล [ 6 ] การ จัด เรียงสเตอริโอเคมีที่สอดคล้องกับมุมระหว่าง 0° และ ±90° เรียกว่าsyn (s) ส่วนการจัดเรียงที่สอดคล้องกับมุมระหว่าง ±90° และ 180° เรียกว่าanti (a) ในทำนองเดียวกัน การจัดเรียงที่สอดคล้องกับมุมระหว่าง 30° ถึง 150° หรือระหว่าง −30° ถึง −150° เรียกว่าclinal (c) และการจัดเรียงที่สอดคล้องกับมุมระหว่าง 0° ถึง ±30° หรือ ±150° ถึง 180° เรียกว่าperiplanar (p)
สามารถนำคำศัพท์ทั้งสองประเภทมาผสมผสานกันเพื่อกำหนดช่วงมุมได้สี่ช่วง ได้แก่ 0° ถึง ±30° ซินเพอริแพลนาร์ (sp); 30° ถึง 90° และ −30° ถึง −90° ซินคลินัล (sc); 90° ถึง 150° และ −90° ถึง −150° แอนติคลินัล (ac); ±150° ถึง 180° แอนติเพอริแพลนาร์ (ap) โครงสร้างซินเพอริแพลนาร์เรียกอีกอย่างว่าsynหรือcis ; แอนติเพอริแพลนาร์เรียกว่าantiหรือtrans ; และซินคลินัลเรียกว่า gaucheหรือskew
ตัวอย่างเช่น ในกรณีของn- บิวเทนสามารถระบุระนาบได้สองระนาบโดยพิจารณาจากอะตอมคาร์บอนกลางสองอะตอมและอะตอมคาร์บอนของหมู่เมทิลอะตอมใดอะตอมหนึ่ง คอนฟอร์เมชันแบบซิน (syn -conformation) ที่แสดงไว้ข้างต้น ซึ่งมีมุมไดเฮดรัล 60° นั้นมีเสถียรภาพน้อยกว่าคอน ฟอร์เมชัน แบบแอนติ (anti- conformation) ซึ่งมีมุมไดเฮดรัล 180°
สำหรับการใช้งานในระดับโมเลกุลขนาดใหญ่ แนะนำให้ใช้ สัญลักษณ์ T, C, G + , G − , A +และ A − (ap, sp, +sc, −sc, +ac และ −ac ตามลำดับ)
โปรตีน

แผนภาพRamachandran (หรือที่รู้จักกันในชื่อแผนภาพ Ramachandran หรือแผนภาพ [ φ , ψ ]) ซึ่งพัฒนาขึ้นครั้งแรกในปี พ.ศ. 2506 โดยGN Ramachandran , C. Ramakrishnan และ V. Sasisekharan [ 7 ]เป็นวิธีในการแสดงภาพบริเวณที่อนุญาตทางพลังงานสำหรับมุมไดเฮดรัลของกระดูกสันหลังψเทียบกับφของ กรด อะมิโนในโครงสร้างโปรตีน
ใน สายโซ่ โปรตีนจะมีการกำหนดมุมไดเฮดรัลสามมุม:
- ω (โอเมก้า) คือมุมในโซ่ C α − C' − N − C α ,
- φ (phi) คือมุมในโซ่ C' − N − C α − C'
- ψ (psi) คือมุมในสายโซ่ N − C α − C' − N (ซึ่งRamachandran เรียกว่า φ′ )
รูปทางด้านขวาแสดงตำแหน่งของมุมแต่ละมุมเหล่านี้ (แต่ไม่ได้แสดงวิธีการกำหนดมุมเหล่านี้อย่างถูกต้อง) [ 8 ]
โดยทั่วไปแล้ว ระนาบของพันธะเปปไทด์จะจำกัดให้ωเป็น 180° ( กรณี ทรานส์ ทั่วไป ) หรือ 0° ( กรณี ซิส ที่หายาก ) ระยะห่างระหว่างอะตอม Cα ในไอโซเมอร์ทรานส์และซิส อยู่ที่ประมาณ 3.8 และ 2.9 Å ตามลำดับ พันธะเปปไทด์ส่วนใหญ่ในโปรตีนเป็นแบบทรานส์แม้ว่าพันธะเปปไทด์กับไนโตรเจนของโพรลีนจะมีความชุกของซิส มากกว่า เมื่อเทียบกับคู่กรดอะมิโนอื่นๆ[ 9 ]
มุมไดเฮดรัลของโซ่ข้างถูกกำหนดด้วยχ n (chi- n ) [ 10 ]พวกมันมักจะรวมกลุ่มกันใกล้ 180°, 60° และ −60° ซึ่งเรียกว่าคอนฟอร์ เมชันแบบทรานส์ , กอช−และกอช+ความเสถียรของมุมไดเฮดรัลของโซ่ข้างบางค่าได้รับผลกระทบจากค่าφและψ [ 11 ] ตัวอย่างเช่น มีปฏิสัมพันธ์เชิงสเตอริกโดยตรงระหว่าง C γของโซ่ข้างใน โรตาเมอร์แบบ กอช+และไนโตรเจนของโครงสร้างหลักของเรซิเดิวถัดไปเมื่อψอยู่ใกล้ −60° [ 12 ]สิ่งนี้เห็นได้ชัดจากการกระจายทางสถิติใน ไลบรารีโรตาเมอ ร์ ที่ขึ้นอยู่กับโครงสร้างหลัก
มุมไดเฮดรัลได้รับการกำหนดโดยIUPACสำหรับโมเลกุลอื่นๆ ด้วย เช่นกรดนิวคลีอิก ( DNAและRNA ) และสำหรับพอลิแซ็กคาไรด์
ในทรงหลายเหลี่ยม
รูปทรงหลายเหลี่ยมทุกรูปจะมีมุมไดเฮดรัลที่ขอบทุกด้าน ซึ่งอธิบายความสัมพันธ์ของหน้าสองด้านที่ใช้ขอบร่วมกัน มุมไดเฮดรัลนี้เรียกอีกอย่างว่ามุมหน้าซึ่งวัดจากมุมภายในเทียบกับรูปทรงหลายเหลี่ยม มุม 0° หมายความว่าเวกเตอร์ปกติของหน้าขนาน กัน ในทิศทางตรงกันข้ามและหน้าทั้งสองทับซ้อนกัน ซึ่งหมายความว่าเป็นส่วนหนึ่งของ รูปทรง หลายเหลี่ยมที่เสื่อมสภาพมุม 180° หมายความว่าหน้าทั้งสองขนานกัน เช่นเดียวกับการปูพื้นมุมที่มากกว่า 180° จะปรากฏบนส่วนเว้าของรูปทรงหลายเหลี่ยม
มุมไดเฮดรัลทุกมุมในทรงหลายเหลี่ยมที่เป็นไอโซทอกซอลและ/หรือไอโซเฮดรัลจะมีค่าเท่ากัน ซึ่งรวมถึงทรงหลายเหลี่ยมเพลโต 5 ทรง, ทรง หลายเหลี่ยมคาตาลัน 13 ทรง, ทรงหลายเหลี่ยมเคปเลอร์-ปวงโซต์ 4 ทรง, ทรงหลายเหลี่ยมกึ่งปกติแบบนูน 2 ทรงและตระกูลอนันต์ของไบพีระมิดและทรง สี่เหลี่ยมคางหมู 2 ตระกูล
กฎของโคไซน์สำหรับมุมไดเฮดรัล
กำหนดให้หน้า 3 หน้าของทรงหลายเหลี่ยมซึ่งมาบรรจบกันที่จุดยอดร่วม P และมีขอบ AP, BP และ CP ค่าโคไซน์ของมุมไดเฮดรัลระหว่างหน้าที่มี APC และ BPC คือ: [ 13 ]
สิ่งนี้สามารถอนุมานได้จากกฎโคไซน์ทรงกลมแต่ยังสามารถหาได้ด้วยวิธีอื่นอีกด้วย[ 14 ]
มิติที่สูงกว่า
ใน ปริภูมิยูคลิดมิติ mมุมไดเฮดรัลระหว่างระนาบไฮเปอร์สอง ระนาบ ที่กำหนดโดยสมการ สำหรับเวกเตอร์n A , n B , x ∈ R mและค่าคงที่c Aและc Bจะกำหนดโดย
ดูเพิ่มเติม
ลิงก์ภายนอก
- มุมไดเฮดรัลในการทำงานไม้ จาก Tips.FM
- การวิเคราะห์รูปทรงหลายเหลี่ยมปกติทั้ง 5 รูปทำให้ได้วิธีการหาค่าที่แน่นอนเหล่านี้ทีละขั้นตอน
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ มุมไดเฮดรัล
มุมไดเฮดรัล คือมุม ระหว่าง ระนาบหรือครึ่งระนาบสอง ระนาบที่ ตัดกัน เป็น มุมระนาบที่เกิดขึ้นบนระนาบที่สาม ซึ่งตั้งฉากกับ เส้น ตัดระหว่างระนาบทั้งสอง หรือ ขอบ ร่วม...
พื้นฐานทางคณิตศาสตร์
เมื่อระนาบตัดกันสองระนาบถูกอธิบายในแง่ของ พิกัดคาร์ทีเซียน ด้วยสมการสองสมการต่อไปนี้
ในฟิสิกส์พอลิเมอร์
ในบางสาขาวิทยาศาสตร์ เช่น ฟิสิกส์พอลิเมอร์ อาจพิจารณาโซ่ของจุดและการเชื่อมโยงระหว่างจุดที่ต่อเนื่องกัน หากจุดต่างๆ มีหมายเลขเรียงลำดับและตั้งอยู่ที่ตำแหน่ง r 1 , r 2 , r 3 เป็นต้น เวกเตอร์พันธะจะถูกกำหนดโดย u 1 = r 2 − r 1 , u 2 = r 3 − r 2 และ u i = r i+1 −...
ในสเตอริโอเคมี
มุม บิด (torsion angle ) ที่พบใน สเตอริโอเคมี เป็นตัวอย่างเฉพาะของมุมไดเฮดรัล (dihedral angle) ที่อธิบายความสัมพันธ์ทางเรขาคณิตของสองส่วนของโมเลกุลที่เชื่อมต่อกันด้วยพันธะ เคมี [ 4 ] [ 5 ] อะตอมสามอะตอมที่ไม่เรียงตัวกันในแนวเดียวกันของ โมเลกุล...