ในปี พ.ศ. 2498 นายกรัฐมนตรีโมฮัมหมัด อาลี โบกราได้นำ โครงการ รวมหน่วยเดียว มาใช้ ซึ่งรวมสี่จังหวัดทางตะวันตกเข้าเป็นหน่วยเดียวเรียกว่าปากีสถานตะวันตก โดยพระราชบัญญัติจัดตั้งปากีสถานตะวันตก พ.ศ. 2498 ในขณะที่เบงกอลตะวันออกถูกเปลี่ยนชื่อเป็นปากีสถานตะวันออกโดยรัฐธรรมนูญของปากีสถาน พ.ศ. 2499 ^{[ 4 ]}

ปากีสถานยุติสถานะการปกครองตนเองและนำรัฐธรรมนูญแบบสาธารณรัฐ มาใช้ ในปี 1956 ซึ่งประกาศจัดตั้งสาธารณรัฐอิสลาม^{[ 5 ]} HS Suhrawardyผู้นำประชานิยมของปากีสถานตะวันออกได้รับการแต่งตั้งเป็นนายกรัฐมนตรีของปากีสถาน ทันทีที่เขาขึ้นเป็นนายกรัฐมนตรี Suhrawardy ได้ริเริ่มงานด้านกฎหมายเพื่อฟื้นฟูระบบการเลือกตั้งร่วม มีการต่อต้านและความไม่พอใจอย่างรุนแรงต่อระบบการเลือกตั้งร่วมในปากีสถานตะวันตก^{[ 6 ]}สันนิบาตมุสลิมได้นำเรื่องนี้ไปสู่สาธารณชนและเริ่มเรียกร้องให้มีการนำระบบการเลือกตั้งแยกต่างหากมาใช้ ในทางตรงกันข้ามกับปากีสถานตะวันตก ระบบการเลือกตั้งร่วมได้รับความนิยมอย่างมากในปากีสถานตะวันออก การต่อสู้กับสันนิบาตมุสลิมเพื่อจัดตั้งระบบการเลือกตั้งที่เหมาะสมทำให้เกิดปัญหาสำหรับรัฐบาลของเขา^{[ 7 ]}

ความพยายามในการรวมศูนย์เศรษฐกิจได้รับการต่อต้านอย่างมากในปากีสถานตะวันตก เมื่อชนชั้นสูงผู้ผูกขาดและชุมชนธุรกิจปฏิเสธที่จะปฏิบัติตามนโยบายของเขาอย่างโกรธเคือง ชุมชนธุรกิจในเมืองการาจีเริ่มการต่อสู้ทางการเมืองเพื่อทำลายความพยายามใดๆ ในการกระจายความช่วยเหลือทางการเงิน 10 ล้านดอลลาร์สหรัฐจากICA ให้แก่ปากีสถานตะวันออกส่วนใหญ่ และเพื่อจัดตั้งบริษัทเดินเรือแห่งชาติแบบรวมศูนย์ ในเมืองการเงินของปากีสถานตะวันตก เช่นการาจีลาฮอร์เควกตาและเปชาวาร์การนัดหยุดงานครั้งใหญ่หลายครั้งต่อต้านนโยบายเศรษฐกิจของสุห์ราวาร์ดีได้รับการสนับสนุนจากชุมชนธุรกิจชั้นนำและภาคเอกชน^{[ 8 ]} 

นอกจากนี้ เพื่อเบี่ยงเบนความสนใจจากโครงการ One Unit Program ที่เป็นข้อถกเถียง นายกรัฐมนตรีสุห์ราวาร์ดีพยายามยุติวิกฤตโดยการเรียกกลุ่มนักลงทุนขนาดเล็กมาจัดตั้งธุรกิจขนาดเล็กในประเทศ แม้จะมีโครงการริเริ่มมากมายและการระงับโครงการ NFC Award Program ตำแหน่งทางการเมืองและภาพลักษณ์ของสุห์ราวาร์ดีก็เสื่อมถอยลงใน 4 จังหวัดของปากีสถานตะวันตก ผู้นำชาตินิยมและนักเคลื่อนไหวของสันนิบาตมุสลิมหลายคนรู้สึกผิดหวังกับการระงับโครงการ NFC Award Program ที่รัฐธรรมนูญกำหนดไว้ นักวิจารณ์และผู้นำสันนิบาตมุสลิมสังเกตว่า ด้วยการระงับโครงการ NFC Award Program สุห์ราวาร์ดีพยายามจัดสรรเงินช่วยเหลือ เงินอุดหนุน และโอกาสทางการเงินให้แก่ปากีสถานตะวันออกมากกว่าปากีสถานตะวันตก รวมถึง 4 จังหวัดของปากีสถานตะวันตก ในช่วงท้ายของการดำรงตำแหน่งนายกรัฐมนตรี สุห์ราวาร์ดีพยายามขจัดความเหลื่อมล้ำทางเศรษฐกิจระหว่างภาคตะวันออกและตะวันตกของประเทศ แต่ก็ไม่เป็นผลสำเร็จ เขายังพยายามบรรเทาปัญหาการขาดแคลนอาหารในประเทศแต่ก็ไม่ประสบความสำเร็จเช่นกัน^{[ 9 ]}

สุห์ราวาร์ดีเสริมสร้างความสัมพันธ์กับสหรัฐอเมริกาโดยเสริมสร้างการเป็นสมาชิกของปากีสถานในองค์การสนธิสัญญาภาคกลางและองค์การสนธิสัญญาเอเชียตะวันออกเฉียงใต้สุห์ราวาร์ดียังส่งเสริมความสัมพันธ์กับสาธารณรัฐประชาชนจีนอีก ด้วย ^{[ 10 ]}

ในปี 1958 ประธานาธิบดีอิสกันดาร์ มิรซาประกาศใช้กฎอัยการศึก ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของการรัฐประหารโดยอายูบ ข่านผู้บัญชาการกองทัพปากีสถานหลังจากนั้นประมาณสองสัปดาห์ ความสัมพันธ์ระหว่างประธานาธิบดีมิรซากับกองทัพปากีสถานก็เสื่อมลง ทำให้พลเอกอายูบ ข่าน ปลดประธานาธิบดีมิรซาออกจากตำแหน่งและเนรเทศเขาไปยังสหราชอาณาจักรอย่างไม่เต็มใจ พลเอกอายูบ ข่าน ให้เหตุผลในการกระทำของเขาโดยปรากฏตัวทางวิทยุแห่งชาติประกาศว่า "กองทัพและประชาชนเรียกร้องให้ตัดขาดจากอดีตอย่างสิ้นเชิง..." กฎอัยการศึกยังคงดำเนินต่อไปจนถึงปี 1962 ในขณะที่จอมพลอายูบ ข่าน กวาดล้างนักการเมืองและข้าราชการจำนวนมากออกจากรัฐบาลและแทนที่ด้วยเจ้าหน้าที่ทหาร อายูบเรียกการปกครองของเขาว่า "การปฏิวัติเพื่อกำจัดความยุ่งเหยิงของการค้าตลาดมืดและการทุจริต" ข่านเข้ามาแทนที่มิรซาในตำแหน่งประธานาธิบดีและกลายเป็นผู้มีอำนาจ ในประเทศ เป็นเวลาสิบเอ็ดปี กฎอัยการศึกยังคงมีผลบังคับใช้จนถึงปี 1962 เมื่อรัฐบาลของจอมพลอายูบ ข่าน ได้แต่งตั้งคณะตุลาการรัฐธรรมนูญภายใต้การนำของประธานศาลสูงสุดแห่งปากีสถาน มูฮัมหมัด ชาฮาบุดดิน ซึ่งประกอบด้วยผู้พิพากษาอาวุโส 10 คน โดยแบ่งเป็น 5 คนจากปากีสถานตะวันออกและ 5 คนจากปากีสถานตะวันตก ในวันที่ 6 พฤษภาคม 1961 คณะตุลาการได้ส่งร่างรายงานไปยังประธานาธิบดีอายูบ ข่าน ซึ่งท่านได้พิจารณาร่างรายงานอย่างละเอียดถี่ถ้วนพร้อมทั้งปรึกษาหารือกับคณะรัฐมนตรี

ในเดือนมกราคม ค.ศ. 1962 คณะรัฐมนตรีได้อนุมัติร่างรัฐธรรมนูญฉบับใหม่ซึ่งประกาศใช้โดยประธานาธิบดีอายูบ ข่าน เมื่อวันที่ 1 มีนาคม ค.ศ. 1962 และมีผลบังคับใช้ในวันที่ 8 มิถุนายน ค.ศ. 1962 ภายใต้รัฐธรรมนูญปี 1962 ปากีสถานกลายเป็น สาธารณรัฐ แบบประธานาธิบดีการเลือกตั้งทั่วไปถูกยกเลิกและแทนที่ด้วยระบบที่เรียกว่า 'ประชาธิปไตยขั้นพื้นฐาน' ภายใต้ระบบนี้คณะผู้เลือกตั้งจะเป็นผู้รับผิดชอบในการเลือกประธานาธิบดีและสภาแห่งชาติ รัฐธรรมนูญปี 1962 ได้สร้างระบบผู้ว่าการในปากีสถานตะวันตกและตะวันออก แต่ละจังหวัดบริหารรัฐบาลผู้ว่าการจังหวัดของตนเองแยกต่างหาก รัฐธรรมนูญกำหนดการแบ่งอำนาจระหว่างรัฐบาลกลางและจังหวัดฟาติมา จินนาห์ ได้รับการสนับสนุนอย่างมากในปากีสถานตะวันออกระหว่างความพยายามที่จะโค่นล้มอายูบ ข่านใน การเลือกตั้งประธานาธิบดีปี 1965ซึ่งไม่ประสบความสำเร็จ

ดักกาได้รับการประกาศให้เป็นเมืองหลวงแห่งที่สองของปากีสถานในปี 1962 และได้รับการกำหนดให้เป็นเมืองหลวงด้านนิติบัญญัติ โดยหลุยส์ คาห์นได้รับมอบหมายให้ออกแบบอาคารรัฐสภาแห่งชาติประชากรของดักกาเพิ่มขึ้นในช่วงทศวรรษ 1960 มีการค้นพบแหล่งก๊าซธรรมชาติ 7 แห่งในจังหวัด อุตสาหกรรมปิโตรเลียมพัฒนาขึ้นเนื่องจากการก่อตั้งโรงกลั่นน้ำมันตะวันออกในเมืองท่าจิตตะกอง

ในปี พ.ศ. 2509 ผู้นำพรรคอวามีลีกเชค มูจิบูร ราห์มานประกาศการเคลื่อนไหวหกข้อในลาฮอร์การเคลื่อนไหวนี้เรียกร้องให้มีการปกครองตนเองในระดับจังหวัดมากขึ้นและการฟื้นฟูประชาธิปไตยในปากีสถาน มูจิบ-อูร์-ราห์มานถูกฟ้องร้องในข้อหากบฏในคดีสมคบคิดอากาตาราหลังจากเปิดตัวการเคลื่อนไหวหกข้อ เขาได้รับการปล่อยตัวในภายหลังในการลุกฮือปี พ.ศ. 2512 ในปากีสถานตะวันออกอายูบ ข่านลาออกในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2512 ด้านล่างนี้ประกอบด้วยประเด็นสำคัญหกข้อทางประวัติศาสตร์: ^{[ 11 ]}

• รัฐธรรมนูญควรบัญญัติให้มีการจัดตั้งสหพันธรัฐปากีสถานในความหมายที่แท้จริงโดยอิงตามมติลาฮอร์และรูปแบบการปกครองแบบรัฐสภา โดยมีอำนาจสูงสุดของฝ่ายนิติบัญญัติที่มาจากการเลือกตั้งโดยตรงบนพื้นฐานของสิทธิออกเสียงของผู้ใหญ่ทุกคน
• รัฐบาลกลางควรดูแลเพียงสองเรื่องเท่านั้น คือ การป้องกันประเทศและการต่างประเทศ ส่วนเรื่องอื่นๆ ที่เหลือควรเป็นอำนาจของรัฐต่างๆ ที่ประกอบกันเป็นสหพันธรัฐ
• ควรมีการนำสกุลเงินสองสกุลที่แยกจากกันแต่สามารถแลกเปลี่ยนกันได้อย่างเสรีมาใช้สำหรับสองภูมิภาค หรือหากไม่สามารถทำได้ ควรใช้สกุลเงินเดียวสำหรับทั้งประเทศ แต่ควรมีบทบัญญัติทางรัฐธรรมนูญที่มีประสิทธิภาพเพื่อป้องกันการไหลออกของเงินทุนจากปากีสถานตะวันออกไปยังปากีสถานตะวันตก นอกจากนี้ ควรจัดตั้งธนาคารกลางสำรองแยกต่างหาก และใช้นโยบายการคลังและนโยบายการเงินที่แยกต่างหากสำหรับปากีสถานตะวันออก
• อำนาจในการเก็บภาษีและจัดเก็บรายได้ควรเป็นของหน่วยงานระดับรัฐบาลกลาง และรัฐบาลกลางจะไม่มีอำนาจดังกล่าว รัฐบาลกลางจะมีสิทธิ์ได้รับส่วนแบ่งจากภาษีของรัฐเพื่อใช้จ่ายในส่วนของตนเอง
• ควรมีการแยกบัญชีรายได้จากเงินตราต่างประเทศของทั้งสองหน่วยงานออกเป็นสองบัญชี ความต้องการเงินตราต่างประเทศของรัฐบาลกลางควรได้รับการตอบสนองจากทั้งสองหน่วยงานอย่างเท่าเทียมกันหรือในอัตราส่วนที่กำหนดไว้ ผลิตภัณฑ์ภายในประเทศควรเคลื่อนย้ายได้โดยไม่เสียภาษีศุลกากรระหว่างสองหน่วยงาน และรัฐธรรมนูญควรให้อำนาจแก่หน่วยงานในการสร้างความเชื่อมโยงทางการค้ากับต่างประเทศ
• ปากีสถานตะวันออกควรมีกองกำลังทหารหรือกองกำลังกึ่งทหารแยกต่างหาก และกองบัญชาการกองทัพเรือควรตั้งอยู่ในปากีสถานตะวันออก

มูฮัมหมัด อายูบ ข่าน ถูกแทนที่โดยนายพลยาห์ยา ข่านซึ่งกลายเป็นหัวหน้าผู้บริหารกฎอัยการศึกข่านได้จัดการเลือกตั้งทั่วไปของปากีสถานในปี 1970 พายุไซโคลนโภลาในปี 1970เป็นหนึ่งในภัยพิบัติทางธรรมชาติที่ร้ายแรงที่สุดในศตวรรษที่ 20 พายุไซโคลนคร่าชีวิตผู้คนไปครึ่งล้านคน ผลกระทบที่ร้ายแรงของพายุไซโคลนทำให้เกิดความไม่พอใจอย่างมากต่อรัฐบาลกลาง หลังจากอยู่ภายใต้การปกครองของทหารมานานกว่าทศวรรษ ปากีสถานตะวันออกกลายเป็นแหล่งบ่มเพาะชาตินิยมเบงกาลีมีการเรียกร้องอย่างเปิดเผยให้ มีการ กำหนดตนเอง^{[ 12 ]}

เมื่อมีการจัดการเลือกตั้งทั่วไปของรัฐบาลกลาง พรรคอวามีลีกกลายเป็นพรรคที่ใหญ่ที่สุดเพียงพรรคเดียวในรัฐสภาปากีสถาน พรรคได้รับ 167 จาก 169 ที่นั่งในปากีสถานตะวันออก ทำให้ได้ที่นั่งเกินครึ่งทางที่ 150 ที่นั่งในสภาแห่งชาติปากีสถานที่ มี 300 ที่นั่ง ^{[ 13 ]}ในทางทฤษฎี สิ่งนี้ทำให้พรรคมีสิทธิ์จัดตั้งรัฐบาลภายใต้ ระบบ เวสต์มินสเตอร์แต่พรรคกลับไม่ได้รับที่นั่งแม้แต่ที่เดียวในปากีสถานตะวันตก ซึ่งพรรคประชาชนปากีสถานกลายเป็นพรรคที่ใหญ่ที่สุดเพียงพรรคเดียวด้วย 81 ที่นั่งคณะรัฐบาลทหารได้ชะลอการถ่ายโอนอำนาจและเจรจากับพรรคเป็นเวลานาน การเคลื่อนไหว ต่อต้านรัฐบาลได้ปะทุขึ้นทั่วปากีสถานตะวันออกเพื่อเรียกร้องให้มีการเรียกประชุมรัฐสภา มูจิบ-อูร์-ราห์มานประกาศการต่อสู้เพื่อเอกราชจากปากีสถานในระหว่างการกล่าวสุนทรพจน์เมื่อวันที่ 7 มีนาคม 1971 และเรียกร้องให้ประชาชนชาวเบงกาลีเคลื่อนไหวไม่ให้ความร่วมมือระหว่างวันที่ 7–26 มีนาคม ปากีสถานตะวันออกแทบจะอยู่ภายใต้การควบคุมของพรรคอวามีลีก ในวันสาธารณรัฐของปากีสถานเมื่อวันที่ 23 มีนาคม พ.ศ. 2514 ธงชาติบังกลาเทศ ผืนแรก ถูกชักขึ้นในบ้านเรือนของชาวปากีสถานตะวันออกหลายแห่ง กองทัพปากีสถานได้รับคำสั่งให้ปราบปรามการต่อต้านทันทีในวันที่ 26 มีนาคม โดยมีวัตถุประสงค์เพื่อปราบปรามการต่อต้าน ซึ่งปฏิบัติการเหล่านี้บางส่วนได้แก่ปฏิบัติการเสิร์ชไลท์^{[ 14 ]}และการสังหารหมู่ที่มหาวิทยาลัยธากาในปี พ.ศ. 2514 [ ^{15 ] [ 16 ] ซึ่ง}นำไปสู่การประกาศอิสรภาพของบังกลาเทศ^{[ 17 ]}

ในขณะที่สงครามปลดปล่อยบังกลาเทศและการฆ่าล้างเผ่าพันธุ์บังกลาเทศในปี 1971ดำเนินต่อไปอีกเก้าเดือน หน่วยทหารของปากีสถานตะวันออก เช่นกองทหารเบงกอลตะวันออกและกองทหารปากีสถานตะวันออกได้แปรพักตร์และก่อตั้งกองกำลังบังกลาเทศ ขึ้น รัฐบาลชั่วคราวของบังกลาเทศได้เป็นพันธมิตรกับอินเดียเพื่อนบ้าน ซึ่งเข้าแทรกแซงในช่วงสองสัปดาห์สุดท้ายของสงครามและทำให้กองบัญชาการภาคตะวันออกของปากีสถานยอมจำนน^{[ 18 ] [ 19 ]}

บทบาทของกองทัพปากีสถาน

เมื่ออายูบ ข่านถูกขับออกจากตำแหน่งในปี 1969 พลเอกยาห์ยา ข่านผู้บัญชาการกองทัพปากีสถานได้ขึ้นเป็นผู้ปกครองประเทศภายใต้กฎอัยการศึกคนที่สอง ทั้งภุตโตและมูจิบไม่ชอบพลเอกข่านอย่างมาก แต่ก็อดทนกับเขาและรัฐบาลของเขาอย่างใจเย็น เนื่องจากเขาสัญญาว่าจะจัดการเลือกตั้งในปี 1970 ในช่วงเวลานั้น กองทัพปากีสถานและรัฐบาลทหารส่วนกลางรับรู้ถึงกระแสชาตินิยมที่รุนแรงในปากีสถานตะวันออก ดังนั้น ข่านและรัฐบาลทหารของเขาจึงต้องการเบี่ยงเบนภัยคุกคามและความรุนแรงจากกลุ่มชาตินิยมต่อผู้ที่ไม่ใช่ชาวปากีสถานตะวันออกกองบัญชาการภาคตะวันออกอยู่ภายใต้แรงกดดันอย่างต่อเนื่องจากพรรคอวามีลีก และได้ร้องขอให้มีนายทหารประจำการเพื่อควบคุมกองบัญชาการภายใต้แรงกดดันอย่างมากเช่นนี้ นายทหาร ยศ สูง นายทหารชั้นประทวน และนายทหารระดับสูงหลายคนจากกองทัพปากีสถานต่างระมัดระวังอย่างมากเกี่ยวกับการแต่งตั้งของพวกเขาในปากีสถานตะวันออก และการมอบหมายให้ปกครองปากีสถานตะวันออกและการแต่งตั้งนายทหารถือเป็นเรื่องยากมากสำหรับกองบัญชาการทหารระดับสูงของปากีสถาน

ความสัมพันธ์ที่ตึงเครียดระหว่างปากีสถานตะวันออกและตะวันตกถึงจุดสูงสุดในปี 1970 เมื่อพรรคอวามีลีก ซึ่งเป็นพรรคการเมืองที่ใหญ่ที่สุดในปากีสถานตะวันออก นำโดยเชค มูจิบูร ราห์มาน (มูจิบ) ได้รับชัยชนะอย่างถล่มทลายในการเลือกตั้งระดับชาติในปากีสถานตะวันออก พรรคได้รับ 160 จาก 162 ที่นั่งที่จัดสรรให้กับปากีสถานตะวันออก และได้เสียงข้างมากใน 300 ที่นั่งในรัฐสภา ซึ่งทำให้พรรคอวามีลีกมีสิทธิตามรัฐธรรมนูญในการจัดตั้งรัฐบาลโดยไม่ต้องร่วมมือกับพรรคอื่นใด ข่านเชิญมูจิบไปที่ราวัลปินดีเพื่อเข้ารับตำแหน่ง และมีการเจรจาระหว่างรัฐบาลทหารและพรรคอวามีลีก บูโตะห์ตกใจกับผลการเลือกตั้งและขู่ สมาชิก พรรคประชาชน ของเขาว่า หากพวกเขาเข้าร่วมการประชุมเปิดสมัยประชุมสภาแห่งชาติเขาจะ "หักขา" สมาชิกพรรคคนใดก็ตามที่กล้าเข้าไปเข้าร่วมการประชุม อย่างไรก็ตาม ด้วยความกลัวการแบ่งแยกดินแดนของปากีสถานตะวันออก บุตโตจึงเรียกร้องให้มูจิบจัดตั้งรัฐบาลผสม หลังจากการประชุมลับที่ลาร์คานา มูจิบตกลงที่จะให้บุตโตดำรงตำแหน่งประธานาธิบดีโดยมีมูจิบเป็นนายกรัฐมนตรี พลเอกยาห์ยา ข่านและรัฐบาลทหารของเขาไม่ได้รับรู้ถึงพัฒนาการเหล่านี้ และภายใต้แรงกดดันจากรัฐบาลทหารของตนเอง จึงปฏิเสธที่จะอนุญาตให้มูจิบ-อูร์-ราห์มานเป็นนายกรัฐมนตรีของปากีสถาน เหตุการณ์นี้ยิ่งทำให้เกิดการประท้วงเรียกร้องเอกราชมากขึ้นในปากีสถานตะวันออก ตำรวจทหารจับกุมมูจิบและบุตโตและคุมขังพวกเขาไว้ในเรือนจำอาเดียลาในราวัลปินดี ข่าวนี้แพร่กระจายไปอย่างรวดเร็วทั้งในปากีสถานตะวันออกและตะวันตก และการต่อสู้เพื่อเอกราชก็เริ่มต้นขึ้นในปากีสถานตะวันออก^{[ 20 ]}

นายทหารระดับสูงในกองทัพปากีสถาน และซุลฟิการ์ อาลี บุตโต เริ่มกดดันพลเอกยาห์ยา ข่าน ให้ใช้กำลังทหารต่อต้านมูจิบและพรรคพวก ต่อมาบุตโตได้ตีตัวออกห่างจากยาห์ยา ข่าน หลังจากที่เขาถูกตำรวจทหารจับกุมพร้อมกับมูจิบ ไม่นานหลังจากนั้น ยาห์ยา ข่าน ได้เป็นประธานการประชุมระดับสูง ในระหว่างการประชุม ผู้บัญชาการระดับสูงของกองทัพปากีสถานได้แนะนำให้ใช้กำลังทหารอย่างรุนแรงและเป็นเอกฉันท์พลเรือเอกอาห์ซาน ผู้บริหารกฎอัยการศึกของปากีสถานตะวันออก และผู้ว่าการปากีสถานตะวันออก และพลอากาศตรีซาฟาร์ มาซูดผู้บัญชาการฐานทัพอากาศ แห่งเดียว ในดักกาเป็นเพียงนายทหารสามคนที่คัดค้านแผนการดังกล่าว เมื่อเห็นได้ชัดว่าการใช้กำลังทหารในปากีสถานตะวันออกเป็นสิ่งที่หลีกเลี่ยงไม่ได้ พลเรือเอกอาห์ซานจึงลาออกจากตำแหน่งผู้บริหารกฎอัยการศึกเพื่อประท้วง และบินกลับไปยังการาจีปากีสถานตะวันตก ในทันที ด้วยความท้อแท้และโดดเดี่ยว พลเรือเอกอาห์ซานจึงเกษียณอายุราชการจากกองทัพเรือก่อนกำหนดและไปตั้งรกรากอย่างเงียบๆ ในเมืองการาจี เมื่อปฏิบัติการเสิร์ชไลท์และปฏิบัติการบาริซาลเริ่มต้นขึ้น พลอากาศโทมาซูดได้เดินทางไปยังปากีสถานตะวันตก และแตกต่างจากพลเรือเอกอาห์ซานตรงที่เขาพยายามหยุดยั้งความรุนแรงในปากีสถานตะวันออก เมื่อเขาไม่ประสบความสำเร็จในการพยายามพบกับพลเอกยาห์ยา ข่าน มาซูดจึงลาออกจากตำแหน่งผู้บัญชาการฐานทัพอากาศดักกาและเกษียณอายุราชการจากกองทัพอากาศเช่นกัน

พลโท ซาฮิบซาดา ยาคูบ ข่าน ถูกส่งไปยังปากีสถานตะวันออกอย่างเร่งด่วน หลังจากรองพลเรือเอก อาห์ซาน ลาออก ซึ่งเป็นความเสียหายครั้งใหญ่ พลโท ยาคูบ เข้าควบคุมสถานการณ์ในจังหวัดนั้นเป็นการชั่วคราว และยังได้รับแต่งตั้งให้เป็นผู้บัญชาการกองทัพภาคตะวันออกด้วย พลโท ยาคูบ ได้ระดมกำลังทหารหลักทั้งหมดในปากีสถานตะวันออก

เชค มูจิบ-อูร์-ราห์มาน ประกาศเอกราชที่เมืองดักกา เมื่อวันที่ 26 มีนาคม 1971 ผู้นำคนสำคัญของพรรคอวามีลีกทั้งหมด รวมถึงผู้นำที่ได้รับการเลือกตั้งของสภาแห่งชาติและสภาจังหวัด ต่างพากันลี้ภัยไปยังประเทศอินเดียที่อยู่ใกล้เคียง และ มีการจัดตั้ง รัฐบาลพลัดถิ่นขึ้น โดยมีเชค มูจิบ-อูร์-ราห์มาน เป็นหัวหน้า ขณะที่เขาถูกคุมขังอยู่ในเรือนจำของปากีสถานซัยยิด นาซรูล อิสลามดำรงตำแหน่งประธานาธิบดีรักษาการ โดยมีทาจูดดิน อาห์เหม็ดเป็นนายกรัฐมนตรี รัฐบาลพลัดถิ่นได้สาบานตนเข้ารับตำแหน่งเมื่อวันที่ 17 เมษายน 1971 ที่เมืองมูจิบ นคร ภายในเขตคุชเทีย ดินแดนปากีสถานตะวันออก และจัดตั้งรัฐบาลอย่างเป็นทางการ พันเอก เอ็มโอจี ออสมานี ได้รับแต่งตั้งเป็นผู้บัญชาการทหารสูงสุดของกองกำลังปลดปล่อยและปากีสถานตะวันออกทั้งหมดถูกแบ่งออกเป็น 11 ภาค โดยมีผู้บัญชาการภาค 11 คนเป็นหัวหน้า ผู้บัญชาการภาคทั้งหมดเป็นนายทหารชาวเบงกาลีที่แปรพักตร์มาจากกองทัพปากีสถาน เหตุการณ์นี้เป็นจุดเริ่มต้น ของสงครามปลดปล่อยบังกลาเทศที่กินเวลานานเก้าเดือนซึ่งนักรบเพื่ออิสรภาพที่ ได้รับการสนับสนุนจาก ทหารอินเดีย 400,000 นายในเดือนธันวาคม 1971 ต้องเผชิญหน้ากับกองทัพปากีสถาน ที่มีกำลัง พลกว่า 365,000 นาย รวมทั้งกองกำลังกึ่งทหารและ กอง กำลังร่วมมือกับปากีสถาน นอกจากนี้ยังมีอาสาสมัครพลเรือนและตำรวจอีกประมาณ 25,000 คนที่ขาดแอุปกรณ์เข้าร่วมกับกองทัพปากีสถาน ทำให้เกิด สงครามกองโจร นองเลือด ในปากีสถานตะวันออก

กองทัพปากีสถานไม่สามารถรับมือกับภัยคุกคามดังกล่าวได้ เนื่องจากขาดข้อมูลข่าวกรองและขวัญกำลังใจต่ำ จึงปฏิบัติการได้ไม่ดีและขาดประสบการณ์ในยุทธวิธีแบบกองโจร กองทัพปากีสถานและกำลังพลจึงพ่ายแพ้ต่อกองกำลังปลดปล่อยบังกลาเทศ ในเดือนเมษายน พ.ศ. 2514 พลโท ติกกา ข่าน ได้รับตำแหน่งผู้บัญชาการกองทัพต่อจากพลเอก ยาคูบ ข่าน พลเอก ติกกา ข่าน นำทัพในการรณรงค์ที่ใช้ความรุนแรงและสังหารหมู่ในภูมิภาค เขาถูกกล่าวหาว่าสังหารชาวเบงกาลีหลายแสนคนในปากีสถานตะวันออก ส่วนใหญ่เป็นพลเรือนและผู้ที่ไม่มีอาวุธ จากบทบาทของเขา พลเอก ติกกา ข่าน ได้รับฉายาว่า "เพชฌฆาตแห่งเบงกาล" พลเอก ข่าน เผชิญกับปฏิกิริยาจากนานาชาติต่อต้านปากีสถาน ดังนั้น พลเอก ติกกา จึงถูกปลดออกจากตำแหน่งผู้บัญชาการแนวรบด้านตะวันออก เขาได้แต่งตั้งรัฐบาลพลเรือนภายใต้การนำของ อับดุล โมตาเล็บ มาลิก เมื่อวันที่ 31 สิงหาคม พ.ศ. 2514 ซึ่งพิสูจน์แล้วว่าไม่มีประสิทธิภาพ อย่างไรก็ตาม ในระหว่างการประชุม เนื่องจากไม่มีนายทหารระดับสูงคนใดเต็มใจที่จะรับตำแหน่งผู้บัญชาการกองทัพปากีสถานตะวันออก พลโท อามีร์อับดุลลาห์ ข่าน เนียซีจึงอาสารับตำแหน่งดังกล่าว ด้วยความที่ขาดประสบการณ์และภารกิจนี้มีขนาดใหญ่มาก รัฐบาลจึงส่งพลเรือตรีโมฮัมหมัด ชาริฟฟ์ไปเป็นผู้บัญชาการกองทัพเรือภาคตะวันออก (ปากีสถาน) พลเรือตรี ชาริฟฟ์ ทำหน้าที่เป็นรองผู้บัญชาการของพลโท เนียซี ในการปฏิบัติการร่วมทางทหาร อย่างไรก็ตาม พลโท เนียซี พิสูจน์แล้วว่าเป็นผู้ปกครองที่ล้มเหลวและไร้ประสิทธิภาพ ดังนั้นพลโท เนียซีและพลอากาศตรีอินามุล ฮาค ข่านผู้บัญชาการฐานทัพอากาศดักกา จึงล้มเหลวในการปฏิบัติการใดๆ ในปากีสถานตะวันออกเพื่อต่อต้านอินเดียหรือพันธมิตร ยกเว้นพลเรือตรี ชาริฟฟ์ ที่ยังคงกดดันกองทัพเรืออินเดียจนกระทั่งสิ้นสุดความขัดแย้ง แผนการอันมีประสิทธิภาพของพลเรือตรี ชาริฟฟ์ ทำให้กองทัพเรืออินเดียแทบเป็นไปไม่ได้ที่จะยกพลขึ้นบกในปากีสถานตะวันออก และกองทัพเรือปากีสถานก็ยังคงต่อต้านอยู่ กองทัพบกอินเดียได้เข้าสู่ปากีสถานตะวันออกจากทั้งสามทิศทางของจังหวัด จากนั้นกองทัพเรืออินเดียจึงตัดสินใจรออยู่ใกล้กับอ่าวเบงกอลจนกว่ากองทัพบกจะขึ้นฝั่ง

กองทัพอากาศอินเดียได้ทำลายขีดความสามารถของกองทัพอากาศปากีสถานในปากีสถานตะวันออก พลอากาศตรีอินามุล ฮาค ข่าน ผู้ บัญชาการฐานทัพอากาศดักกา ไม่สามารถต่อต้านการกระทำของกองทัพอากาศอินเดียได้อย่างจริงจัง ในช่วงเวลาส่วนใหญ่ของสงคราม กองทัพอากาศอินเดียมีอำนาจเหนือกว่าอย่างสมบูรณ์ในน่านฟ้าเหนือปากีสถานตะวันออก

เมื่อวันที่ 16 ธันวาคม พ.ศ. 2514 กองทัพปากีสถานยอมจำนนต่อกองกำลังปลดปล่อยร่วมของมุกติบาฮินีและกองทัพอินเดีย ซึ่งนำโดยพลโทจาจิต ซิงห์ อโรราผู้บัญชาการทหารสูงสุดประจำภาคตะวันออกของกองทัพอินเดีย พลโท เอ.เอ.เค. เนียซี ผู้บัญชาการกองทัพภาคตะวันออก คนสุดท้าย ได้ลงนามในเอกสารยอมจำนนเมื่อเวลาประมาณ 16:31 น. มีกำลังพลกว่า 93,000 นาย รวมถึงพลโท เนียซี และพลเรือเอก ชาริฟฟ์ ถูกจับเป็นเชลยศึก

เมื่อวันที่ 16 ธันวาคม พ.ศ. 2514 ดินแดนปากีสถานตะวันออกถูกส่งมอบให้กับกองทัพอินเดียภายใต้ข้อตกลงยอมจำนนจากปากีสถานตะวันตก และในข้อตกลงซิมลา ดินแดน ดัง กล่าวได้กลายเป็นรัฐเอกราชใหม่ชื่อบังกลาเทศกองบัญชาการภาคตะวันออก สถาบันพลเรือน และกองกำลังกึ่งทหารถูกยุบเลิกในเดือนต่อมา

ปากีสถานตะวันออกได้รับสืบทอด 17 เขตจากเบงกอลของอังกฤษ

ในปี 1960 พื้นที่ Lower Tippera ได้เปลี่ยนชื่อเป็น Comilla

ในปี 1969 ได้มีการจัดตั้งเขตปกครองใหม่ 2 เขต โดยแยกเมืองตังไกลออกจากเมืองไมเมนซิงห์ และแยกเมืองปาตูอาคาลีออกจากเมืองบาเคอร์กันจ์

เขตต่างๆ ของปากีสถานตะวันออกแสดงไว้ดังต่อไปนี้

แม้ว่าปากีสถานตะวันออกจะมีประชากรมากกว่า แต่ปากีสถานตะวันตกกลับมีอำนาจทางการเมืองเหนือกว่าและได้รับเงินจากงบประมาณส่วนกลางมากกว่า จากข้อมูลของธนาคารโลกพบว่ามีการเลือกปฏิบัติทางเศรษฐกิจต่อปากีสถานตะวันออกอย่างมาก รวมถึงการใช้จ่ายของรัฐบาลที่สูงกว่าในปากีสถานตะวันตก การโอนเงินจากตะวันออกไปตะวันตก และการใช้เงินสำรองระหว่างประเทศส่วนเกินของตะวันออกเพื่อเป็นทุนในการนำเข้าของตะวันตก

การเลือกปฏิบัติเกิดขึ้นแม้ว่าปากีสถานตะวันออกจะเป็นแหล่งส่งออกที่สำคัญของปากีสถานก็ตาม

อัตราการเติบโตของผลิตภัณฑ์มวลรวมภายในประเทศต่อหัวต่อปีอยู่ที่ 4.4% ในปากีสถานตะวันตก เทียบกับ 2.6% ในปากีสถานตะวันออก ระหว่างปี 1960 ถึง 1965 นักการเมืองชาวเบงกาลีผลักดันให้มีการปกครองตนเองมากขึ้น โดยให้เหตุผลว่ารายได้จากการส่งออกส่วนใหญ่ของปากีสถานมาจากการส่งออกปอและชาของเบงกาลีในปากีสถานตะวันออก จนถึงปี 1960 ประมาณ 70% ของรายได้จากการส่งออกของปากีสถานมาจากปากีสถานตะวันออก แม้ว่าเปอร์เซ็นต์นี้จะลดลงเมื่อความต้องการปอในตลาดโลกลดลง ในช่วงกลางทศวรรษ 1960 ปากีสถานตะวันออกมีสัดส่วนน้อยกว่า 60% ของรายได้จากการส่งออกของประเทศ และเมื่อบังกลาเทศได้รับเอกราชในปี 1971 เปอร์เซ็นต์นี้ลดลงต่ำกว่า 50% ในปี 1966 มูจิบเรียกร้องให้มีการเปิดบัญชีแลกเปลี่ยนเงินตราต่างประเทศแยกต่างหาก และเปิดสำนักงานการค้าแยกต่างหากในต่างประเทศ ในช่วงกลางทศวรรษ 1960 ปากีสถานตะวันตกได้รับประโยชน์จาก "ทศวรรษแห่งความก้าวหน้า" ของอายูบ ด้วยความสำเร็จของการปฏิวัติเขียวในการปลูกข้าวสาลีและการขยายตลาดสิ่งทอของปากีสถานตะวันตก ในขณะที่มาตรฐานการครองชีพของปากีสถานตะวันออกยังคงอยู่ในระดับต่ำอย่างน่าใจหาย ชาวเบงกาลีก็ไม่พอใจที่ปากีสถานตะวันตก ซึ่งเป็นที่ตั้งของรัฐบาลแห่งชาติ ได้รับความช่วยเหลือจากต่างประเทศมากกว่า อย่างไรก็ตาม ปากีสถานตะวันออกก็ได้รับประโยชน์จากการพัฒนาอุตสาหกรรมและการพัฒนาประเทศเช่นกัน ซึ่งเห็นได้จากเขื่อนกัปไตในเขตเทือกเขาจิตตะกองเป็นต้น

นักเศรษฐศาสตร์ในปากีสถานตะวันออกได้โต้แย้งทฤษฎี "สองเศรษฐกิจ" ภายในปากีสถานเอง ซึ่งมีพื้นฐานมาจากทฤษฎีสองชาติกับอินเดีย ทฤษฎีสองเศรษฐกิจที่ว่านี้ระบุว่าปากีสถานตะวันออกและตะวันตกมีลักษณะทางเศรษฐกิจที่แตกต่างกัน ซึ่งไม่ควรถูกควบคุมโดยรัฐบาลกลางในอิสลามาบัด^{[ 22 ]}

As per the 1951 census, East Pakistan had a population of 44,251,826 people, of which 76.9% (~34,029,654) followed Islam, 22.0% (~9,735,402) people followed Hinduism and 1.1% (~486,770) people followed other religions: Buddhism, Christianity and Animism.^[1] According to the 1961 census, Muslims made up 80.4% of the population, Hindus were 18.4%, and the remaining 1.2% belonged to other religions, mainly Christianity and Buddhism.^[24][25]

Since its unification with Pakistan, the East Pakistan Army had consisted of only 1 infantry brigade made up of two battalions, the 1st East Bengal Regiment and the 1/14 or 3/8 Punjab Regiment in 1948. These two battalions fielded only five rifle companies between them (an infantry battalion normally had five companies).^[26] This weak brigade was under the command of Brigadier Ayub Khan (acting Major-General – GOC of 14th Army Division), together with the East Pakistan Rifles, which was tasked with defending East Pakistan during the Indo-Pakistani War of 1947.^[27] The East Pakistan Army had barely 150,000 troops (50,000-70,000 regular soldiers) at its peak despite needing at least 250,000 personals to act strongly in any major armed conflict.^[28][29]The military was composed with estimated 6,000 personals from East Bengal Regiment divided in six battalions. The paramilitary East Pakistan Rifles (EPR) was built with around 12,000-15,000 personals on duty.^[30][31] However, during the 1971 civil war, East Pakistan Civil Armed Force (EPCAF) was created to replace EPR and it had 23,000-25,000 personals where it was divided into at least seventeen wings. EPCAF also had additional 17 planes.^[32]

กองทัพ อากาศ ปากีสถาน (PAF ) นาวิกโยธินและกองทัพเรือมีบทบาทน้อยมากในภูมิภาคนี้ มีเพียงฝูงบินรบของ PAF เพียงฝูงเดียว คือฝูงบินที่ 14 Tail Choppersที่ปฏิบัติการอยู่ในปากีสถานตะวันออก^{[ 33 ]}ฝูงบินรบนี้อยู่ภายใต้การบังคับบัญชาของหัวหน้าฝูงบินปาร์ไวซ์ เมห์ดี คูเรชีซึ่งต่อมาได้เป็นนายพลสี่ดาว กองทัพบกยังมีเครื่องบินรบ เพียง 15 ลำ พร้อมกับเครื่องบิน 17 ลำของ EPCAF เพื่อขัดขวางการตอบโต้ใดๆ ของอินเดียในช่วงสงครามปี 1965และสงครามปี 1971 [ ^{34 ] [ 32 ] บุคลากร}ทางทหารของปากีสถานตะวันออกได้รับการฝึกฝนด้านการดำน้ำต่อสู้ การทำลายล้าง และยุทธวิธีแบบกองโจร/ต่อต้านกองโจรโดยที่ปรึกษาจากหน่วยปฏิบัติการพิเศษ (กองทัพเรือ)ซึ่งมีหน้าที่ในการรวบรวมและจัดการข้อมูลข่าวกรองด้วย กองทัพเรือปากีสถานตะวันออกมีเรือพิฆาตรบประจำการเพียง 1 ลำ คือPNS Sylhet พร้อมด้วยเรือดำน้ำ 1 ลำ คือPNS Ghazi (ซึ่งถูกส่งไปประจำการทางตะวันตกหลายครั้ง) และเรือปืน 4 ลำ ซึ่งไม่เพียงพอต่อการปฏิบัติงานในน้ำลึก^{[ 35 ]}ปฏิบัติการพิเศษร่วมได้รับการจัดการและดำเนินการโดยหน่วยปฏิบัติการพิเศษทางทะเล (SSG(N)) ซึ่งได้รับการช่วยเหลือจากกองทัพบก กองทัพอากาศ และหน่วยนาวิกโยธิน นาวิกโยธินทั้งหมดถูกส่งไปประจำการในปากีสถานตะวันออก โดยเริ่มแรกได้รับมอบหมายให้ดำเนินการฝึกซ้อมและปฏิบัติการรบใน พื้นที่ แม่น้ำและบริเวณชายฝั่งใกล้ชายฝั่ง หน่วยข่าวกรองทางทะเล ขนาดเล็ก (ในขณะที่สำนักงานใหญ่ บุคลากร สิ่งอำนวยความสะดวก และคำสั่งต่างๆ ได้รับการประสานงานจากทางตะวันตก) มีบทบาทสำคัญในการกำกับการปฏิบัติภารกิจพิเศษและภารกิจลาดตระเวน และการรวบรวมข่าวกรองยังได้รับมอบหมายให้ดำเนินการที่เหมาะสมเพื่อชะลอภัยคุกคามจากอินเดีย กองกำลังติดอาวุธของปากีสถานตะวันออกยังประกอบด้วยองค์กรกึ่งทหารRazakarsจากหน่วยข่าวกรองของกองปฏิบัติการลับ (CAD) ของ ISI ^{[ 36 ] [ 37 ]}

แม้จะมีการเลือกปฏิบัติทางเชื้อชาติโดยกองทัพปากีสถานซึ่งให้ชาวเบงกาลี มีจำนวนน้อย ในกองทัพปากีสถานโดยอ้างความเหนือกว่าทางเชื้อชาติ แต่ เจ้าหน้าที่ ชาวเบงกาลี จำนวนมาก ก็ยังได้รับการยกย่องและได้รับรางวัลสำหรับการรับใช้สาธารณรัฐปากีสถาน [ ^{38 ] เจ้าหน้าที่}ทหารที่มีชื่อเสียง เช่นMAG Osmani (ได้รับTamgha-e-Jang สงครามปี 1965 , Tamgha-e-Jamhuria , Pakistan Tamgha ), Ziaur Rahman (ได้รับHilal-i-Jur'at ), Saiful Azam (ได้รับSitara-e-Jurat ), Mohammad Ishfaqul Mazid , Shafaat Jamil , Khaled Mosharraf , Mahmudur Rahman Majumdar , Sayed Farooq-ur-Rahman , Mohammad Ziauddin (เจ้าหน้าที่ )

• นาโชล อัพไรส์

• การกบฏโรฮิงญาครั้งแรก

• การปะทะกันบริเวณชายแดนปากีสถาน-อินเดีย ปี 1958
• สงครามอินเดีย-ปากีสถาน ค.ศ. 1965
• การลุกฮือครั้งใหญ่ในปากีสถานตะวันออก ปี 1969
• สงครามปลดปล่อยบังกลาเทศ