อ่าน 6 นาที
เส้นทางที่ไม่เกี่ยวข้องกับมีวาโลเนต
เส้นทางที่ไม่ใช้เมวาโลเนต —ซึ่งปรากฏอีกชื่อหนึ่งคือเส้นทางที่ไม่ขึ้นกับเมวาโลเนตและเส้นทาง2- C-เมทิล-D-อีริทริทอล 4-ฟอสเฟต/1-ดีออกซี-D- ไซลูโลส 5-ฟอสเฟต ( MEP/DOXP )
เส้นทางที่ไม่เกี่ยวข้องกับมีวาโลเนต
เส้นทางที่ไม่ใช้เมวาโลเนต —ซึ่งปรากฏอีกชื่อหนึ่งคือเส้นทางที่ไม่ขึ้นกับเมวาโลเนตและเส้นทาง2- C-เมทิล-D-อีริทริทอล 4-ฟอสเฟต/1-ดีออกซี-D- ไซลูโลส 5-ฟอสเฟต ( MEP/DOXP ) —เป็นเส้นทางเมตาบอลิซึมทางเลือกสำหรับการสังเคราะห์สารตั้งต้นไอโซพรีนอยด์ ได้แก่ไอโซเพนเทนิลไพโรฟอสเฟต (IPP) และไดเมทิลอัลลิลไพโรฟอสเฟต (DMAPP) [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]ชื่อที่นิยมใช้ในปัจจุบันสำหรับเส้นทางนี้คือเส้นทาง MEPเนื่องจากMEPเป็นเมตาบอไลต์ตัวแรกที่ถูกกำหนดไว้ในเส้นทางสู่ IPP
การสังเคราะห์สารตั้งต้นไอโซพรีนอยด์
วิถีเมวาโลเนต (วิถี MVA หรือ วิถี HMG-CoA reductase ) และวิถี MEP เป็นวิถีเมตาบอลิซึมสำหรับการสังเคราะห์สารตั้งต้นไอโซพรีนอยด์ ได้แก่ IPP และ DMAPP ในขณะที่พืชใช้ทั้งวิถี MVA และ MEP สิ่งมีชีวิตส่วนใหญ่ใช้เพียงวิถีเดียวในการสังเคราะห์สารตั้งต้นไอโซพรีนอยด์ ในเซลล์พืช การสังเคราะห์ IPP/DMAPP ผ่านวิถี MEP เกิดขึ้นใน ออร์แกเนลล์ พลาสติดในขณะที่การสังเคราะห์ผ่านวิถี MVA เกิดขึ้นในไซโตพลาสซึม[ 4 ]แบคทีเรียแกรมลบส่วนใหญ่ ไซยาโนแบคทีเรียที่สังเคราะห์แสงได้ และสาหร่ายสีเขียวใช้เฉพาะวิถี MEP เท่านั้น[ 5 ]แบคทีเรียที่ใช้วิถี MEP ได้แก่ เชื้อก่อโรคที่สำคัญ เช่นMycobacterium tuberculosis [ 6 ]
IPP และ DMAPP ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำหรับการสังเคราะห์ โมเลกุล ไอโซพรีนอยด์ (เทอร์พีนอยด์) ที่ ใช้ในกระบวนการที่หลากหลาย เช่นการพรีนิเลชันของโปรตีน การบำรุงรักษาเยื่อหุ้มเซลล์ การสังเคราะห์ฮอร์โมน การยึดเกาะของโปรตีน และN-ไกลโคซิเลชันในสิ่งมีชีวิตทั้งสามโดเมน ในสิ่งมีชีวิตที่สังเคราะห์แสง สารตั้งต้นที่ได้จาก MEP จะถูกนำไปใช้ในการสังเคราะห์รงควัตถุสังเคราะห์แสง เช่น แคโรทีนอยด์และโซ่ไฟโทลของคลอโรฟิลล์และรงควัตถุเก็บเกี่ยวแสง[ 5 ]
แบคทีเรีย เช่นEscherichia coli ได้รับการดัดแปลงพันธุกรรมให้แสดงออกร่วมกันของยีนสังเคราะห์ชีวภาพของทั้ง เส้นทาง MEP และMVA [ 7 ]การกระจายของฟลักซ์เมตาบอลิซึมระหว่างเส้นทาง MEP และ MVA สามารถศึกษาได้โดยใช้ไอโซโทปเมอร์กลูโคส13C [ 8 ]

ปฏิกิริยา
ปฏิกิริยาของเส้นทาง MEP มีดังต่อไปนี้ โดยส่วนใหญ่มาจาก Eisenreich และเพื่อนร่วมงาน ยกเว้นในกรณีที่ป้ายกำกับตัวหนาเป็นตัวย่อเฉพาะที่เพิ่มเติมเพื่อช่วยเชื่อมโยงตารางกับแผนผังด้านบน: [ 10 ] [ 9 ]
| สารตั้งต้น | เอนไซม์ | ผลิตภัณฑ์ | |
|---|---|---|---|
| ไพรูเวต ( Pyr ) และกลีเซอรัลดีไฮด์ 3-ฟอสเฟต ( G3P ) | เอนไซม์สังเคราะห์ DOXP (Dxs; DXP ) | 1-ดีออกซี-ดี-ไซลูโลส 5-ฟอสเฟต (DOXP; DXP ) | |
| ด็อกซ์พี ( DXP ) | DXP รีดักโตไอโซเมอเรส (Dxr, IspC; DXR ) | 2-C-เมทิลอีริทริทอล 4-ฟอสเฟต (MEP) | |
| MEP | 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase (YgbP, IspD; CMS ) | 4-ไดฟอสโฟไซทิดิล-2-ซี-เมทิลอีริทริทอล (CDP-ME) | |
| ซีดีพี-เอ็มอี | 4-ไดฟอสโฟไซทิดิล-2-ซี-เมทิล-ดี-อีริทริทอล ไคเนส (YchB, IspE; CMK ) | 4-ไดฟอสโฟไซทิดิล-2-ซี-เมทิล-ดี-อีริทริทอล 2-ฟอสเฟต (CDP-MEP) | |
| ซีดีพี-เอ็มอีพี | 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase ( YgbB , IspF; MCS ) | 2-C-เมทิล-D-อีริทริทอล 2,4-ไซโคลไดฟอสเฟต (MEcPP) | |
| เมซีพีพี | เอนไซม์ HMB-PP ซินเทส (GcpE, IspG; HDS ) | (E)-4-ไฮดรอกซี-3-เมทิล-บิวต์-2-เอนิลไพโรฟอสเฟต (HMB-PP) | |
| เอชเอ็มบี-พีพี | HMB-PP รีดักเตส (LytB, IspH; HDR ) | ไอโซเพนเทนิลไพโรฟอสเฟต (IPP) และไดเมทิลอัลลิลไพโรฟอสเฟต (DMAPP) |
การยับยั้งและการวิจัยเส้นทางอื่นๆ
DXS ซึ่งเป็นเอนไซม์ตัวแรกของวิถีทาง ถูกยับยั้งแบบป้อนกลับโดยผลิตภัณฑ์ IPP และ DMAPP DXS ทำงานในรูปของโฮโมไดเมอร์และกลไกที่แน่นอนของการยับยั้งเอนไซม์ยังคงเป็นที่ถกเถียงกันในวงการนี้ มีการเสนอว่า IPP/DMAPP แข่งขันกับโคแฟคเตอร์ TPP [ 11 ] การศึกษาล่าสุดชี้ให้เห็นว่า IPP/DMAPP กระตุ้นการแยกตัวเป็นโมโนเมอร์และการสลายตัวของเอนไซม์ในภายหลัง ผ่านการโต้ตอบกับไซต์การโต้ตอบของโมโนเมอ ร์ที่แตกต่างจากไซต์ที่ทำงานของเอนไซม์[ 12 ]
DXP reductoisomerase (หรือที่รู้จักกันในชื่อ: DXR, DOXP reductoisomerase, IspC, MEP synthase) เป็นเอนไซม์สำคัญในเส้นทาง MEP สามารถถูกยับยั้งได้ด้วยฟอสไมโดไมซิน ซึ่งเป็น ผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติ ซึ่งอยู่ระหว่างการศึกษาเพื่อใช้เป็นจุดเริ่มต้นในการพัฒนายาต้านแบคทีเรียหรือยาต้านมาลาเรีย[ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]
สารตัวกลางHMB-PPเป็นตัวกระตุ้นตามธรรมชาติของเซลล์ T Vγ9/Vδ2 ของมนุษย์ ซึ่งเป็นประชากรเซลล์ T γδ หลักในเลือดส่วนปลาย และเป็นเซลล์ที่ "มีบทบาทสำคัญในการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันต่อเชื้อก่อโรคจุลินทรีย์" [ 16 ]
- สารยับยั้ง IspH: วิถีการเผาผลาญที่ไม่ใช่เมวาโลเนต ซึ่งจำเป็นสำหรับแบคทีเรียส่วนใหญ่แต่ไม่มีในมนุษย์ ทำให้เป็นเป้าหมายที่เหมาะสมสำหรับการพัฒนายาปฏิชีวนะ วิถีนี้เรียกว่า เมทิล-ดี-อีริทริทอลฟอสเฟต (MEP) หรือวิถีที่ไม่ใช่เมวาโลเนต มีหน้าที่ในการสังเคราะห์ไอโซพรีนอยด์ ซึ่งเป็นโมเลกุลที่จำเป็นต่อการอยู่รอดของเซลล์ในแบคทีเรียก่อโรคส่วนใหญ่ และด้วยเหตุนี้จึงเป็นประโยชน์ต่อแบคทีเรียที่ดื้อต่อยาปฏิชีวนะส่วนใหญ่[ 17 ]
วิศวกรรมเมตาบอลิซึมของเส้นทาง MEP/ที่ไม่ใช่เมวาโลเนต
เส้นทาง MEP ได้รับการศึกษาและดัดแปลงอย่างกว้างขวางโดยใช้ Escherichia coliซึ่งเป็นจุลินทรีย์ที่ใช้กันทั่วไปในการวิจัยและการประยุกต์ใช้ในห้องปฏิบัติการ[ 18 ] IPP และ DMAPP ซึ่งเป็นผลิตภัณฑ์ของเส้นทาง MEP สามารถใช้เป็นสารตั้งต้นสำหรับการผลิตเทอร์พีนอยด์ต่างชนิดที่มีมูลค่าสูงสำหรับการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมยาและเคมี เมื่อมีการแสดงออกของ ยีน ต่างชนิดจากสิ่งมีชีวิตที่แตกต่างกัน การผลิตเทอร์พีนอยด์เช่นลิโมนีน บิซาโบลีนและไอโซพรีนสามารถทำได้ในจุลินทรีย์ชนิดต่างๆ[ 19 ] [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ]การศึกษาเกี่ยวกับการแสดงออกของยีนสังเคราะห์ทางชีวภาพต่างๆ ของเส้นทางนี้เผยให้เห็นว่าการแสดงออกของ Dxs และ Idi ซึ่งเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในขั้นตอนแรกและขั้นตอนสุดท้ายของเส้นทาง MEP สามารถเพิ่มผลผลิตของเทอร์พีนอยด์ที่ได้จาก MEP ได้อย่างมีนัยสำคัญ[ 19 ] [ 22 ] Dxs ซึ่งเป็นเอนไซม์ตัวแรกของเส้นทางแสดงถึงคอขวดสำหรับการไหลของคาร์บอนที่เข้าสู่เส้นทาง Idi ซึ่งแปลง IPP เป็น DMAPP และในทางกลับกัน ดูเหมือนจะมีความสำคัญในการจัดหาสารตั้งต้นที่จำเป็นเมื่อมีการนำแหล่งกักเก็บคาร์บอนต่างชนิดเข้ามาในสายพันธุ์ที่ได้รับการดัดแปลงทางพันธุกรรม งานด้านวิศวกรรมเมตาบอลิซึมจำนวนมากในเส้นทาง MEP ได้ดำเนินการในไซยาโนแบคทีเรียซึ่ง เป็นจุลินทรีย์ สังเคราะห์แสงที่สามารถดูดซับคาร์บอนไดออกไซด์จากบรรยากาศเข้าสู่เมตาบอไลต์ที่มีคาร์บอนหลากหลายชนิด รวมถึงเทอร์พีนอยด์[ 20 ] [ 19 ] [ 21 ] ดังนั้น สำหรับเทคโนโลยีชีวภาพไซยาโนแบคทีเรียจึงเป็นแพลตฟอร์มที่น่าสนใจสำหรับการผลิตสารประกอบที่มีมูลค่าสูงอย่างยั่งยืน
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เส้นทางที่ไม่เกี่ยวข้องกับมีวาโลเนต
เส้นทางที่ไม่ใช้เมวาโลเนต —ซึ่งปรากฏอีกชื่อหนึ่งคือเส้นทางที่ไม่ขึ้นกับเมวาโลเนตและเส้นทาง2- C-เมทิล-D-อีริทริทอล 4-ฟอสเฟต/1-ดีออกซี-D- ไซลูโลส 5-ฟอสเฟต ( MEP/DOXP )
การสังเคราะห์สารตั้งต้นไอโซพรีนอยด์
วิถี เมวาโลเนต (วิถี MVA หรือ วิถี HMG-CoA reductase ) และวิถี MEP เป็นวิถีเมตาบอลิซึมสำหรับการสังเคราะห์สารตั้งต้นไอโซพรีนอยด์ ได้แก่ IPP และ DMAPP ในขณะที่พืชใช้ทั้งวิถี MVA และ MEP สิ่งมีชีวิตส่วนใหญ่ใช้เพียงวิถีเดียวในการสังเคราะห์สารตั้งต้นไอโซพรีนอยด์...
ปฏิกิริยา
ปฏิกิริยาของเส้นทาง MEP มีดังต่อไปนี้ โดยส่วนใหญ่มาจาก Eisenreich และเพื่อนร่วมงาน ยกเว้นในกรณีที่ป้ายกำกับตัวหนาเป็นตัวย่อเฉพาะที่เพิ่มเติมเพื่อช่วยเชื่อมโยงตารางกับแผนผังด้านบน: [ 10 ] [ 9 ]
การยับยั้งและการวิจัยเส้นทางอื่นๆ
DXS ซึ่งเป็นเอนไซม์ตัวแรกของวิถีทาง ถูก ยับยั้งแบบป้อนกลับ โดยผลิตภัณฑ์ IPP และ DMAPP DXS ทำงานในรูปของโฮโม ไดเมอร์ และกลไกที่แน่นอนของการยับยั้งเอนไซม์ยังคงเป็นที่ถกเถียงกันในวงการนี้ มีการเสนอว่า IPP/DMAPP แข่งขันกับ โคแฟคเตอร์ TPP [ 11 ]...







