การตัดชิ้นเนื้อเพื่อตรวจวินิจฉัย (Shave biopsy) ทำได้โดยใช้ ใบมีด ผ่าตัด ขนาดเล็ก หรือใบมีดโกนโค้ง เทคนิคนี้ขึ้นอยู่กับทักษะของศัลยแพทย์เป็นอย่างมาก เพราะศัลยแพทย์บางคนสามารถตัดชิ้นเนื้อเล็กๆ ออกมาได้โดยมีรอยแผลน้อยที่สุดโดยใช้เครื่องมือใดเครื่องมือหนึ่งข้างต้น ในขณะที่บางคนอาจมีปัญหาในการยึดเครื่องมือให้แน่น โดยทั่วไปแล้ว ใบมีดโกนจะตัดเฉพาะส่วนที่ยื่นออกมาของเนื้องอกเล็กน้อย และทำให้ผิวหนังเรียบเนียนหลังจากการผ่าตัด การห้ามเลือดทำได้โดยใช้เครื่องจี้ไฟฟ้า อ่อน ๆสารละลายมอนเซลหรืออะลูมิเนียมคลอไรด์นี่เป็นวิธีการวินิจฉัยที่เหมาะสมที่สุดสำหรับมะเร็งเซลล์ฐาน (basal cell cancer ) นอกจากนี้ยังสามารถใช้ในการวินิจฉัย มะเร็งเซลล์สความัส (squamous cell carcinoma)และ มะเร็งผิวหนังระยะเริ่มต้น (melanoma-in-situ) ได้ เช่นกัน อย่างไรก็ตาม แพทย์ควรพิจารณาความเข้าใจเกี่ยวกับการเจริญเติบโตของมะเร็งสองชนิดหลังนี้ก่อนที่จะใช้วิธีการโกนชิ้นเนื้อเพื่อ ตรวจวินิจฉัย วิธีการเจาะหรือกรีดนั้นดีกว่าสำหรับมะเร็งสองชนิดหลัง เนื่องจากโอกาสที่จะเกิดผลลบเท็จนั้นน้อยกว่า (เช่น การวินิจฉัยมะเร็งเซลล์สความัสว่าเป็นภาวะผิวหนังอักเสบจากแสงแดดหรือ เศษ เคราติน ) การห้ามเลือดสำหรับเทคนิคการโกนอาจทำได้ยากหากใช้เพียงเครื่องจี้ไฟฟ้าเพียงอย่างเดียว การตัดชิ้นเนื้อแบบ "โกน" ขนาดเล็กมักจะกลายเป็นแผลไหม้ขนาดใหญ่เมื่อศัลยแพทย์พยายามควบคุมเลือดออกด้วยเครื่องจี้ไฟฟ้าเพียงอย่างเดียว การพันผ้ากดหรือสารเคมีห้ามเลือดสามารถช่วยในการห้ามเลือดในผู้ป่วยที่รับประทานยาต้านการแข็งตัวของเลือดได้

การเจาะชิ้นเนื้อด้วยใบมีดวงกลมขนาดตั้งแต่ 1  มม. ถึง 8  มม. ใบมีดซึ่งติดอยู่กับด้ามจับคล้ายดินสอจะถูกหมุนลงผ่านหนังกำพร้าและหนังแท้ และเข้าไปในไขมันใต้ผิวหนังทำให้ได้เนื้อเยื่อทรงกระบอก^{[ 1 ]}แผลที่เกิดจากการเจาะชิ้นเนื้อสามารถเย็บปิดได้ง่ายด้วยไหมเย็บ หนึ่งหรือสองเข็ม การเจาะชิ้นเนื้อบางครั้งอาจมีรูปร่างคล้ายวงรี แม้ว่าเราจะสามารถทำรูปร่างที่ต้องการได้ด้วยมีดผ่าตัดมาตรฐานก็ตาม การเจาะขนาด 1  มม. และ 1.5  มม. เหมาะสำหรับบริเวณที่ยากต่อการตกแต่งด้วยวิธีโกน การเจาะขนาด 1 มม. ทำให้มีเลือดออกน้อย และมักจะปล่อยให้แผลหายเองโดยไม่ต้องเย็บสำหรับการเจาะชิ้นเนื้อขนาดเล็กกว่า ข้อเสียของการเจาะขนาด 1  มม. คือบางครั้งเนื้อเยื่อที่ได้แทบมองไม่เห็นเนื่องจากมีขนาดเล็ก และ การเจาะชิ้นเนื้อขนาด 1.5 มม. จึงเป็นที่นิยมมากกว่าในกรณีส่วนใหญ่ ขนาดหัวเจาะที่ใช้กันทั่วไปในการวินิจฉัยโรคผิวหนังอักเสบส่วนใหญ่คือ หัวเจาะขนาด 3.5 หรือ 4 มม. ^{[ 2 ]}

ในการตัดชิ้นเนื้อเพื่อตรวจวินิจฉัย (Incisional biopsy) จะทำการตัดผ่านชั้นหนัง แท้ทั้งหมด ลงไปจนถึงชั้นไขมันใต้ผิวหนัง ส่วนการตัดชิ้นเนื้อแบบเจาะ (Punch biopsy) นั้นโดยพื้นฐานแล้วก็คือการตัดชิ้นเนื้อแบบเดียวกัน เพียงแต่เป็นการตัดเป็นทรงกลมแทนที่จะเป็นรูปวงรีเหมือนกับการตัดชิ้นเนื้อแบบอื่นๆ ที่ทำด้วยมีดผ่าตัด การตัดชิ้นเนื้อแบบผ่าตัดสามารถรวมถึงรอยโรคทั้งหมด (ตัดออกทั้งหมด) บางส่วนของรอยโรค หรือบางส่วนของผิวหนังที่ได้รับผลกระทบรวมกับส่วนหนึ่งของผิวหนังปกติ (เพื่อแสดงรอยต่อระหว่างผิวหนังปกติและผิวหนังที่ผิดปกติ) การตัดชิ้นเนื้อแบบผ่าตัดมักให้ผลการวินิจฉัยที่ดีกว่าสำหรับโรคผิวหนังชั้นลึก และสามารถเก็บเนื้อเยื่อใต้ผิวหนังได้มากกว่าการตัดชิ้นเนื้อแบบเจาะ การตัดชิ้นเนื้อแบบผ่าตัดลึกที่ยาวและบางนั้นดีเยี่ยมสำหรับบริเวณขา เพราะช่วยให้สามารถเก็บเนื้อเยื่อได้มากโดยมีแรงตึงบนแผลผ่าตัดน้อยที่สุด ข้อดีของการตัดชิ้นเนื้อแบบผ่าตัดเหนือกว่าวิธีการเจาะคือ สามารถห้ามเลือดได้ง่ายกว่าเนื่องจากมองเห็นได้ชัดเจนกว่า ความผิดปกติแบบ "หูสุนัข" นั้นพบได้น้อยในการตัดชิ้นเนื้อแบบผ่าตัดที่มีความยาวอย่างน้อยสองเท่าของความกว้าง

การตัดชิ้นเนื้อออกทั้งหมด (Excisional biopsy) โดยพื้นฐานแล้วเหมือนกับการตัดชิ้นเนื้อออกบางส่วน (Incisional biopsy) เพียงแต่ว่าการตัดชิ้นเนื้อจะรวมถึงรอยโรคหรือเนื้องอกทั้งหมดด้วย วิธีนี้เป็นวิธีการวินิจฉัยมะเร็งผิวหนังชนิดเมลาโนมาขนาดเล็กที่ดีที่สุด (เมื่อทำการตัดออกทั้งหมด) โดยหลักการแล้ว ควรส่งชิ้นเนื้อเมลาโนมาทั้งหมดไปตรวจวินิจฉัยหากสามารถทำได้อย่างปลอดภัยและไม่ทำให้เสียความสวยงาม การตัดชิ้น เนื้อออก ทั้งหมด มักทำด้วยขอบการผ่าตัด ที่แคบ เพื่อให้แน่ใจว่าได้ตรวจดูความหนาที่ลึกที่สุดของเมลาโนมาก่อนที่จะตัดสินใจพยากรณ์โรค อย่างไรก็ตาม เนื่องจาก เมลาโนมาในระยะเริ่มแรก (melanoma -in-situs) มักมีขนาดใหญ่และอยู่บนใบหน้า แพทย์จึงมักเลือกที่จะทำการตัดชิ้นเนื้อขนาดเล็กหลายๆ ชิ้นก่อนที่จะตัดสินใจตัดชิ้นเนื้อขนาดใหญ่เพื่อการวินิจฉัยเพียงอย่างเดียว หลายคนชอบวิธีการตัดชิ้นเนื้อขนาดเล็กเพื่อการวินิจฉัยเบื้องต้นก่อนที่จะทำการตัดชิ้นเนื้อออกทั้งหมด การตัดชิ้นเนื้อขนาดเล็กครั้งแรกของเมลาโนมาอาจระบุว่า "เซลล์ผิดปกติอย่างรุนแรง แนะนำให้ตัดออกในวงกว้างขึ้น" ณ จุดนี้ แพทย์สามารถมั่นใจได้ว่าสามารถทำการตัดชิ้นเนื้อออกทั้งหมดได้โดยไม่เสี่ยงต่อการวินิจฉัย ผิดพลาด ( false positive )

การประมวล ผลพยาธิวิทยาโดยรวมของการตัดผิวหนัง^{[ 3 ]}

	ขนาดของรอยโรค
	<4  มม.	4 – 8  มม.	9 – 15  มม.
ลักษณะที่ดูไม่เป็นอันตราย
สงสัยว่าเป็นมะเร็ง

ในตารางด้านบน ภาพด้านบนแต่ละภาพแสดงเส้นที่แนะนำสำหรับการตัดชิ้นส่วนเพื่อส่งไปประมวลผลเพิ่มเติม ภาพด้านล่างแสดงด้านใดของชิ้นส่วนที่ควรนำไปทำไมโครโทมี เส้นประในที่นี้หมายความว่าสามารถใช้ได้ทั้งสองด้าน ตัวอย่างทั้งหมดอาจถูกตัดและส่งหากมีความเสี่ยงต่อมะเร็งสูง^{[ 3 ]}มิฉะนั้นส่วนที่เหลืออาจถูกเก็บไว้ในสารตรึงในกรณีที่การตรวจด้วยกล้องจุลทรรศน์บ่งชี้ว่าจำเป็นต้องเก็บตัวอย่างเพิ่มเติม

การขูดเนื้อเยื่อเพื่อตรวจวินิจฉัย สามารถทำได้ที่ผิวของเนื้องอกหรือรอยโรคขนาดเล็กบนผิวหนัง โดยใช้ยาชาเฉพาะที่ เพียงเล็กน้อยหรือไม่ใช้เลย โดยใช้ ใบ มีดขูด แบบกลม การวินิจฉัยมะเร็งเซลล์ฐานอาจทำได้โดยมีข้อจำกัดบางประการ เนื่องจากรูปร่างของเนื้องอกมักถูกรบกวน แพทย์ผู้ตรวจวินิจฉัยต้องได้รับแจ้งเกี่ยวกับชนิดของยาชาที่ใช้ เนื่องจากยาชาเฉพาะที่อาจทำให้เกิดความผิดปกติในเซลล์ผิวหนังได้ ไนโตรเจนเหลวหรือการรักษาด้วยความเย็นจัดสามารถใช้เป็นยาชาเฉพาะที่ได้ อย่างไรก็ตาม ความผิดปกติที่เกิดจากการแช่แข็งอาจเป็นอุปสรรคอย่างมากต่อการวินิจฉัยมะเร็งผิวหนังชนิดร้ายแรง

การเจาะดูดเนื้อเยื่อด้วยเข็ม (Needle aspiration biopsy)ทำได้โดยการใช้มือแทงเข็มเข้าไปอย่างรวดเร็ว และใช้แรงดูดจากกระบอกฉีดยาอย่างรวดเร็วเช่นกัน วิธีนี้ใช้ในการวินิจฉัยเนื้องอกที่อยู่ลึกในผิวหนังหรือต่อมน้ำเหลืองใต้ผิวหนัง เนื้อเยื่อที่ดูดออกมาจะถูกนำไปวางบนสไลด์แก้ว และสามารถวินิจฉัยได้ทันทีด้วยการย้อมสีที่เหมาะสม หรือส่งไปตรวจที่ห้องปฏิบัติการเพื่อวินิจฉัยขั้นสุดท้าย การเจาะดูดเนื้อเยื่อด้วยเข็มขนาดเล็กสามารถทำได้โดยใช้ เข็ม ขนาด เล็ก และกระบอกฉีดยาขนาดเล็ก (1 ซีซี) ที่สามารถสร้างแรงดูดเปลี่ยนแปลงได้อย่างรวดเร็ว การเจาะดูดเนื้อเยื่อด้วยเข็มขนาดเล็กสามารถใช้แยกแยะความแตกต่างระหว่างถุงน้ำกับเนื้องอกไขมันได้ทั้งศัลยแพทย์และพยาธิแพทย์ต้องคุ้นเคยกับวิธีการเก็บ การตรึง และการอ่านสไลด์ ศูนย์หลายแห่งมีทีมงานเฉพาะที่ใช้ในการเก็บตัวอย่างเนื้อเยื่อด้วยเข็มขนาดเล็ก

การตัด ชิ้นเนื้อแบบจานรอง (saucerization biopsy) เรียกอีกอย่างว่า การตัดชิ้นเนื้อแบบ "ตัก" (scoop), "หยัก" (scallop) หรือ "โกน" (shave) ^{[ 4 ]}หรือการตัดแบบ "โกน" (shave) ในช่วง 10 ปีที่ผ่านมา มีแนวโน้มในด้านผิวหนังที่สนับสนุนการตัดแบบโกนลึกของรอยโรคที่มีเม็ดสี^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}ผู้เขียนได้ตีพิมพ์ผลลัพธ์ของวิธีการนี้และสนับสนุนว่าดีกว่าการตัดแบบมาตรฐานและใช้เวลาน้อยกว่า ข้อดีทางเศรษฐกิจเพิ่มเติมคือศัลยแพทย์หลายคนเรียกเก็บค่าบริการสำหรับขั้นตอนนี้ในฐานะการตัดออก แทนที่จะเป็นการตัดชิ้นเนื้อแบบโกน ซึ่งช่วยประหยัดเวลาในการห้ามเลือด เครื่องมือ และค่าใช้จ่ายในการเย็บแผล ข้อเสียที่สำคัญซึ่งพบเห็นได้ในอีกหลายปีต่อมาคือรอยแผลเป็นหยักจำนวนมาก และการปรากฏของรอยโรคที่เรียกว่า " ไฝเมลาโนไซต์ที่กลับมาเป็นซ้ำ " การผ่าตัดแบบ "โกน" หลายครั้งไม่ได้เจาะทะลุชั้นหนังแท้หรือไขมันใต้ผิวหนังมากพอที่จะครอบคลุมรอยโรคเมลาโนไซต์ทั้งหมด และเมลาโนไซต์ที่เหลืออยู่จะงอกใหม่ในแผลเป็น การรวมกันของรอยแผลเป็น การอักเสบ เส้นเลือด และเส้นสีที่ผิดปกติที่พบในไฝที่กลับมาเป็นซ้ำเหล่านี้ อาจส่งผลให้ลักษณะทางผิวหนังของมะเร็งผิวหนังปรากฏให้เห็น^{[ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]}เมื่อแพทย์คนที่สองตรวจคนไข้ในภายหลัง เขาหรือเธอไม่มีทางเลือกอื่นนอกจากแนะนำให้ทำการผ่าตัดแผลเป็นซ้ำ หากไม่มีรายงานทางพยาธิวิทยาฉบับเดิม ก็เป็นไปไม่ได้ที่จะแยกแยะไฝที่กลับมาเป็นซ้ำออกจาก ไฝ ที่มีความผิดปกติ อย่างรุนแรง หรือมะเร็งผิวหนัง เนื่องจากขั้นตอนดังกล่าวมีการปฏิบัติกันอย่างแพร่หลาย จึงไม่ใช่เรื่องแปลกที่จะเห็นคนไข้ที่มีแผลเป็นรูปคลื่นหลายสิบแผล โดยมีมากถึง 20% ที่แสดงเม็ดสีที่เหลืออยู่ ปัญหาประการที่สองของการผ่าตัดเอาเนื้อเยื่อไขมันออกอย่างล้ำลึกคือการยื่น ของไขมัน ใต้ผิวหนังการ เกิดภาวะผิวหนังบางผิดปกติจากการผ่าตัด และ การเกิดแผลเป็น นูนเนื่องจากวิธีการผ่าตัดเอาเนื้อเยื่อไขมันออกอย่างล้ำลึกนั้นจะกำจัดชั้นหนังแท้ทั้งหมดหรือลดความหนาของชั้นหนังแท้ลงอย่างมาก ทำให้ไขมันใต้ผิวหนังสามารถยื่นออกมาหรือทำให้ผิวหนังย่นในลักษณะที่ไม่สวยงาม ในบริเวณที่เกิดการเสียดสีได้ง่าย อาจทำให้เกิดอาการปวด คัน หรือเกิดแผลเป็นนูนได้