อ่าน 19 นาที
ไพริมิดีนไดเมอร์
ไพริมิดีนไดเมอร์ เป็น สารเคมี ที่เกิดจาก ปฏิกิริยาทางเคมีแสง ที่เกี่ยวข้องกับนิ วคลีโอเบสไพริมิดีน (P) สองตัว( ไทมีน ไซ โตซีน หรือ ยูราซิล ) ผ่านการสร้างพันธะโควาเลนต์ใหม่...
ไพริมิดีนไดเมอร์

ไพริมิดีนไดเมอร์เป็นสารเคมีที่เกิดจากปฏิกิริยาทางเคมีแสง ที่เกี่ยวข้องกับนิ วคลีโอเบสไพริมิดีน (P) สองตัว( ไทมีนไซโตซีนหรือยูราซิล ) ผ่านการสร้างพันธะโควาเลนต์ใหม่ การค้นพบไพริมิดีนไดเมอร์[ 1 ]เริ่มต้นจากการสังเกตว่ารังสีอัลตราไวโอเลต (UV)ทำให้เซลล์ไม่ทำงาน[ 2 ]ในช่วงหลายปีที่ผ่านมา การศึกษาเชิงทดลองและเชิงทฤษฎี ซึ่งส่วนใหญ่ดำเนินการกับ ระบบ DNAและRNA จำลอง ในสารละลาย ได้ให้ความกระจ่างเกี่ยวกับกระบวนการหลักที่อยู่เบื้องหลังการก่อตัวของพวกมัน[ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]ในขณะเดียวกัน ไดเมอร์ดังกล่าวก็ถูกตรวจพบในเซลล์ที่มีชีวิตและผิวหนัง[ 6 ] [ 7 ]และผลกระทบของพวกมันต่อกระบวนการทางชีวภาพได้รับการศึกษาอย่างละเอียด[ 8 ] [ 9 ]
มีการระบุไดเมอร์ไพริมิดีนหลักสี่ประเภท ได้แก่ ไดเมอร์ไพริมิดีนไซโคลบิวเทน (CPD หรือเรียกอีกอย่างว่า P<>P) [ 10 ] (6–4) ผลิตภัณฑ์แสงไพริมิดีน (64PP) [ 11 ]ไอโซเมอร์วาเลนซ์ Dewar ของพวกมัน[ 12 ]และผลิตภัณฑ์แสงสปอร์ (SP) [ 13 ]การเกิดไดเมอร์อาจเกิดขึ้นผ่านกลไกโดยตรง ซึ่งรังสี UV จะถูกดูดซับโดยไพริมิดีน หรือผ่านกระบวนการไวต่อแสงทางอ้อม ซึ่งต้องอาศัยการทำงานของโมเลกุลอื่นที่ดูดซับแสง[ 14 ]
การก่อตัวของไพริมิดีนไดเมอร์ภายในเกลียวคู่จะขัดขวางการจับคู่เบสแบบวัตสัน-คริกและทำให้โครงสร้างเฉพาะที่บิดเบี้ยว[ 15 ]ทำให้การส่งผ่านข้อมูลทางพันธุกรรมที่ถูกต้องลดลง หากปล่อยทิ้งไว้โดยไม่ได้รับการซ่อมแซม รอยโรคดังกล่าวสามารถทำให้เกิดข้อผิดพลาดในการถอดรหัสและการจำลองแบบ ซึ่งมีส่วนทำให้เกิดการกลายพันธุ์และการเกิดมะเร็ง [ 16 ] ไพ ริมิดีนไดเมอร์มีบทบาทสำคัญในการพัฒนาของมะเร็งผิวหนัง[ 17 ]
CPD สามารถเกิดการกลับคืนสภาพด้วยแสง ซึ่งเป็นกระบวนการที่สร้างนิวคลีโอเบสเดิมขึ้นมาใหม่[ 18 ] [ 19 ] ในเซลล์ที่มีชีวิต การซ่อมแซมเกิดขึ้นเป็นหลักผ่านการกระตุ้นด้วยแสงที่เกี่ยวข้องกับเอนไซม์โฟโตไลเอส[ 20 ] [ 21 ] หรือผ่านกลไกการซ่อมแซมโดยการตัดฐาน[ 22 ]
นอกเหนือจากความสำคัญทางชีววิทยาของไพริมิดีนไดเมอร์ในฐานะความเสียหายของ DNA แล้ว การเกิดไพริมิดีนไดเมอร์แบบย้อนกลับได้ยังดึงดูดความสนใจสำหรับการประยุกต์ใช้ในสาขาวิทยาศาสตร์วัสดุและนาโนเทคโนโลยี[ 23 ] [ 24 ]
เคมีแสง
ในบรรดาไดเมอร์ไพริมิดีนที่เกิดขึ้นระหว่างนิวคลีโอเบสที่เหมือนกันหรือต่างกัน ไดเมอร์ที่เกี่ยวข้องกับไทมีนสองตัวได้รับการศึกษาอย่างกว้างขวางที่สุดจากมุมมองทางเคมีแสง นอกเหนือจากการเกิดไดเมอร์ของนิวคลีโอเบสหลักแล้ว เคมีแสงของอะนาล็อกเอพิเจเนติกส์ เช่น 5-เมทิลไซโตซีน[ 25 ]ก็ได้รับการศึกษาเช่นกัน ในขณะที่กรดนิวคลีอิกสังเคราะห์เหมาะสมกว่าสำหรับการกำหนดลักษณะกระบวนการหลักที่อยู่เบื้องหลังการเกิดไดเมอร์ในสายเดี่ยว[ 26 ] [ 27 ] [ 28 ] [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ]สายคู่[ 32 ]และ ควอดรู เพล็กซ์กัวนีน[ 33 ] [ 34 ]การศึกษาหลายชิ้นได้ดำเนินการกับดีเอ็นเอจีโนมที่บริสุทธิ์แล้วเช่นกัน[ 35 ] [ 36 ]
การศึกษาทดลองที่อธิบายไว้ในส่วนนี้ดำเนินการโดยใช้กรดนิวคลีอิกในสารละลาย
กลไกโดยตรง
ตามกลไกโดยตรง โฟตอน UV จะถูกดูดซับโดยไพริมิดีน และปฏิกิริยาโฟโตเคมีจะดำเนินไปส่วนใหญ่จากสถานะกระตุ้นซิงเกล็ต สถานะเหล่านี้เป็นแบบรวม หมายความว่ามีการกระจายตัวอยู่ทั่วไพริมิดีนทั้งสอง[ 37 ] [ 38 ] นอกจากนี้ยังมีการรายงาน เส้นทางย่อยที่ดำเนินไปผ่านสถานะทริปเล็ตของไทมีน ซึ่งเกิดขึ้นจากการเปลี่ยนสถานะระหว่างระบบ สำหรับ CPD [ 31 ] [ 39 ]
ในกรณีของ 64PPs กระบวนการทางเคมีแสงโดยตรงนำไปสู่การก่อตัวของสารตัวกลางปฏิกิริยา ( ออกซีเทน ) [ 40 ]ซึ่งต่อมาเกิดปฏิกิริยามืดนำไปสู่ไดเมอร์ขั้นสุดท้าย[ 41 ] [ 42 ] ไอโซเมอร์วาเลนซ์ของดิวาร์[ 43 ]ได้รับจากการฉายรังสี 64PPs โดยโครงสร้างหลักมีบทบาทสำคัญในปฏิกิริยา[ 44 ] การศึกษาโดยสเปกโทรสโกปีการดูดกลืนแบบเวลาที่กำหนดเผยให้เห็นว่าในสายเดี่ยวของไทมีน CPDs ถูกสร้างขึ้นภายใน 1 พิโควินาที[ 28 ]ในขณะที่ปฏิกิริยาที่นำไปสู่ 64PPs จากออกซีเทนเสร็จสมบูรณ์ภายใน 4 มิลลิวินาที[ 45 ]

ผลผลิตควอนตัมของปฏิกิริยาไดเมอไรเซชัน (Φ) ซึ่งกำหนดเป็นจำนวนไดเมอร์ที่เกิดขึ้นต่อโฟตอนที่ถูกดูดซับ และการพึ่งพาความยาวคลื่นของการฉายรังสี เป็นหัวใจสำคัญของการวิจัยเหล่านี้ พารามิเตอร์เหล่านี้เชื่อมโยงโดยตรงกับธรรมชาติของสถานะกระตุ้นทางอิเล็กตรอนที่เกิดขึ้นเมื่อดูดซับโฟตอนและการผ่อนคลายของสถานะเหล่านั้น[ 46 ] [ 47 ]ในสายไทมีนเดี่ยว Φ CPDมีค่าคงที่ (0.05) ตลอดแถบการดูดซับหลัก ในทางตรงกันข้าม Φ 64PPลดลงอย่างต่อเนื่องเมื่อความยาวคลื่นเพิ่มขึ้น[ 30 ]ไม่พบ 64PP เมื่อฉายรังสี UVA ซึ่ง DNA แสดงการดูดซับที่อ่อนแอ ในขณะที่ CPD ยังคงถูกเหนี่ยวนำแม้ว่าจะมีประสิทธิภาพน้อยกว่า (Φ CPD = 7 × 10 −4 ) ที่สำคัญกว่านั้น การจับคู่เบสช่วยเพิ่มการก่อตัวของ CPD ภายใต้การฉายรังสี UVA โดย Φ CPD มีค่าสูงขึ้นถึง 7 เท่า ในขณะที่พบแนวโน้มตรงกันข้ามเมื่อฉายรังสี UVC [ 48 ]
การก่อตัวของไพริมิดีนไดเมอร์ชนิดต่างๆ ยังได้รับการวัดปริมาณสำหรับดีเอ็นเอจีโนมบริสุทธิ์ที่แยกออกมาซึ่งฉายรังสีที่ 254 นาโนเมตร CPD (Φ CPD รวม = 10 −3 ) มีปริมาณมากกว่า 64PP (Φ 64PP รวม = 3 × 10 −4 ) [ 49 ] การก่อตัวของ CPD ยังได้รับการรายงานสำหรับ โมเลกุลชีวภาพตามธรรมชาตินี้ที่ฉายรังสีด้วยแสง UVA [ 36 ]
กลไกทางอ้อม

ในกลไกทางอ้อม สถานะทริปเล็ตมีบทบาทสำคัญ โฟตอน โดยทั่วไปอยู่ในช่วง UVA จะถูกดูดซับโดยโฟโตเซนซิไทเซอร์ซึ่งสถานะทริปเล็ตจะถูกเติมเต็มผ่านการเปลี่ยนสถานะระหว่างระบบต่อมา พลังงานกระตุ้นทางอิเล็กตรอนจะถูกถ่ายโอนไปยังสถานะทริปเล็ตของไพริมิดีน ซึ่งจะกระตุ้นให้เกิดการไดเมอไรเซชัน ทั้ง CPD และ SP เกิดขึ้นผ่านเส้นทางนี้ ในทางตรงกันข้าม ไม่มีหลักฐานว่าการกระตุ้นด้วยแสงนำไปสู่การก่อตัวของ 64PP หรือไอโซเมอร์วาเลนซ์ของดิวาร์[ 50 ]
มีการทดสอบสารไวแสงหลากหลายชนิด เช่น เบนโซฟีโนน ฟทาลิไมด์ หรือฟลูออโรควิโนโลน เพื่อศึกษาข้อกำหนดสำหรับการไวแสง ในทางปฏิบัติ พลังงานทริปเล็ตของสารเหล่านี้ต้องสูงกว่าพลังงานทริปเล็ตของไพริมิดีน และผลผลิตควอนตัมสำหรับการข้ามระบบต้องสูงเพียงพอ นอกจากตัวแทนภายนอกแล้ว 64PPs ที่มีอยู่แล้วใน DNA ก็มีความสามารถในการไวแสงต่อการก่อตัวของ CPD ผ่านสถานะทริปเล็ตของไพริมิดีน[ 51 ]การไวแสงอาจเกิดขึ้นก่อนการเคลื่อนย้ายพลังงานทริปเล็ตภายในเกลียวคู่ มีรายงานระยะการเคลื่อนย้ายสูงสุดถึง 105 Å [ 52 ]
คุณสมบัติทางแสง
ไดเมอร์ของไซโคลบิวเทนไพริมิดีน (CPDs) ดูดซับที่ความยาวคลื่นสั้นกว่าไพริมิดีนโมโนเมอร์ที่สอดคล้องกันอย่างมีนัยสำคัญ ค่าการดูดซับสูงสุดซึ่งอยู่ต่ำกว่า 220 นาโนเมตร ยังไม่ได้รับการกำหนดอย่างแม่นยำ[ 53 ]ในทางตรงกันข้าม สเปกตรัมการดูดซับของ 64PPs มีการเลื่อนไปทางสีแดงอย่างมากเมื่อเทียบกับอะนาล็อกที่ไม่เสียหาย ในกรณีของไดนิวคลีโอไซด์โมโนฟอสเฟต ค่าการดูดซับสูงสุดอยู่ในช่วง 307–325 นาโนเมตร[ 54 ]การก่อตัวของไอโซเมอร์วาเลนซ์ของดิวาร์ทำให้เกิดการเลื่อนไปทางความยาวคลื่นสั้นลงของสเปกตรัมการดูดซับ ในขณะที่ยังคงรักษาหางการดูดซับที่อ่อนแอในบริเวณ UVA สเปกตรัมการดูดซับของผลิตภัณฑ์แสงของสปอร์ (SP) เกือบจะเหมือนกับของไพริมิดีนที่ไม่เสียหายในตอนเริ่มต้น[ 55 ]
ในบรรดาไดเมอร์ไพริมิดีนต่างๆ มีเพียง 64PPs เท่านั้นที่แสดงการเรืองแสงที่วัดได้ โดยมีค่าสูงสุดอยู่ที่ประมาณ 385–400 นาโนเมตร ผลผลิตควอนตัมที่สอดคล้องกันอยู่ในลำดับ 10 −2 [ 54 ] ซึ่งสูงกว่าการเรืองแสงโดยธรรมชาติของ DNA ที่ไม่เสียหายประมาณสองลำดับขนาด [ 56 ] ด้วยเหตุนี้จึงมีการเสนอแนะไว้แล้วในช่วงทศวรรษที่ 1970 ว่าการปล่อยแสงของพวกมันสามารถใช้เป็นตัวบ่งชี้ภายในสำหรับการวัดปริมาณความเสียหายของ DNA ที่เกิดจากรังสียูวี[ 57 ]ต่อมา วิธีการนี้ถูกเสนอเพื่อประเมินประสิทธิภาพของหลอดไฟฆ่าอสุจิ[ 58 ]อย่างไรก็ตาม จากการศึกษาเกี่ยวกับกระบวนการพื้นฐานที่เกิดขึ้นในเกลียวคู่โดยรังสียูวี การปล่อยแสงที่ประมาณ 400 นาโนเมตรนั้นไม่เหมาะสมสำหรับการประเมินความเสียหายของ DNA ในเชิงปริมาณ[ 59 ]
การกลับด้านด้วยแสง
การค้นพบการเกิดไดเมอร์ของไพริมิดีนมาพร้อมกับการสังเกตว่ารอยโรคเหล่านี้สามารถเกิดการย้อนกลับด้วยแสงได้ โดยสร้างฐานไพริมิดีนดั้งเดิมขึ้นมาใหม่[ 60 ]การย้อนกลับด้วยแสงนี้ ซึ่งเกิดขึ้นเมื่อฉายรังสีภายในแถบการดูดกลืนแสงของไดเมอร์ เป็นคุณสมบัติเฉพาะของ CPD ปฏิกิริยาดำเนินไปโดยมีผลผลิตควอนตัมสูงมาก ใกล้เคียงกับหนึ่ง[ 61 ] [ 62 ] ต่อมา มีการรายงานการย้อนกลับด้วยแสงของ CPD อีกประเภทหนึ่งในโอลิโกเมอร์ DNA เมื่อฉายรังสีเฉพาะนิวคลีโอเบสที่ไม่เสียหาย กลไกการซ่อมแซมตัวเองที่เรียกว่านี้เกิดจากการถ่ายโอนอิเล็กตรอนจาก ฐาน พิวรีน ที่อยู่ข้างเคียง ไปยังรอยโรค CPD [ 63 ] [ 64 ] [ 65 ]
ปัจจัยเชิงโครงสร้าง
การศึกษาวิจัยจำนวนมากได้ตรวจสอบว่าโครงสร้าง DNA มีอิทธิพลต่อการก่อตัวของไพริมิดีนไดเมอร์อย่างไร และในทางกลับกัน การมีอยู่ของรอยโรคเหล่านี้ทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างในกรดนิวคลีอิกอย่างไร ผลกระทบแรกเกิดจากปัจจัยเชิงโครงสร้างที่สร้างเงื่อนไขทางเรขาคณิตและอิเล็กทรอนิกส์ที่จำเป็นสำหรับการเกิดไดเมอร์[ 66 ] [ 67 ]ส่วนผลกระทบหลังมีผลกระทบทางชีววิทยาที่สำคัญ โดยเฉพาะอย่างยิ่งเกี่ยวกับการจดจำรอยโรคโดยเอนไซม์ซ่อมแซม DNA [ 68 ]
ปัจจัยต่างๆ เช่นความเข้มข้นของไอออนเป็นที่ทราบกันดีว่าส่งผลต่อโครงสร้างของเกลียวคู่ จึงทำให้ผลผลิตควอนตัมของการเกิดไดเมอร์เปลี่ยนแปลงไป[ 69 ]ในทำนองเดียวกัน การมีหมู่เมทิลเพียงหมู่เดียวที่ตำแหน่งไพริมิดีนสามารถทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างที่ปรับเปลี่ยนผลผลิตควอนตัมได้ ตัวอย่างที่น่าสนใจคือลำดับ TCG ที่ไซโตซีนถูกแทนที่ด้วย5-เมทิลไซโตซีน [ 70 ] [ 71 ] ตำแหน่งเหล่านี้มีความเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับจุดกลายพันธุ์ในเนื้องอกผิวหนัง[ 72 ] [ 73 ] [ 74 ]
โครงสร้างทุติยภูมิของกรดนิวคลีอิกยังเป็นตัวกำหนดไอโซเมอร์เฉพาะของไดเมอร์ที่เหนี่ยวนำโดยรังสียูวี ในดีเอ็นเอสายคู่จีโนมโดยทั่วไปจะพบ CPD แบบcis-syn เท่านั้น อย่างไรก็ตาม เมื่อเกิดการเสียสภาพ ไอโซเมอร์แบบ cis-transจะปรากฏขึ้น[ 75 ]นอกจากนี้ ในขณะที่การเกิดไดเมอร์ในดีเอ็นเอรูปแบบ B มักเกี่ยวข้องกับไพริมิดีนที่อยู่ติดกันบนสายเดียวกัน ไดเมอร์ระหว่างสายได้รับการตรวจพบภายใต้เงื่อนไขเฉพาะ เช่น pH ต่ำ[ 76 ]ในดีเอ็นเอรูปแบบ A [ 77 ]หรือภายในควอดรูเพล็กซ์กัวนีนกัวนีน[ 78 ]
เทคนิคการทดลองต่างๆ—รวมถึง การวิเคราะห์ผลึก ด้วยรังสีเอกซ์[ 79 ] [ 80 ]สเปกโทรสโกปี NMR [ 81 ] [ 82 ]สเปกโทรสโก ปีเชิงแสง [ 83 ]และกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบไครโอ[ 84 ] ควบคู่ไปกับวิธีการคำนวณ[ 85 ] [ 86 ]ได้ถูกนำมาใช้เพื่อศึกษาผลกระทบของไพริมิดีนไดเมอร์ต่อโครงสร้างโดยรวม การวิจัยเหล่านี้ครอบคลุมถึงกรดนิวคลีอิกแบบจำลองที่แยกออกมา ดีเอ็นเอจีโนมนิวคลีโอโซมและสารประกอบเชิงซ้อนกับเอนไซม์ซ่อมแซม การบิดเบี้ยวของโครงสร้างที่รายงาน ได้แก่ การโค้งงอ การคลายตัว การ "พลิกออก" ของนิวคลีโอเบสที่ไม่มีคู่ตรงข้ามกับรอยโรค รวมถึงการดัดแปลงการเคลื่อนไหวของโครงสร้างในระดับท้องถิ่น ขอบเขตของการเปลี่ยนแปลงเหล่านี้ขึ้นอยู่กับชนิดของไดเมอร์ ลำดับเบส และโครงสร้างดีเอ็นเอเริ่มต้น โดยรวมแล้ว การบิดเบือนเหล่านี้มีส่วนทำให้ค่าไฮโปโครมิซิตี้ที่สังเกตได้ในสเปกตรัมการดูดกลืนแสงของเกลียวคู่ลดลง[ 87 ]
ผลกระทบทางชีวภาพ
การกลายพันธุ์
การกลายพันธุ์ ซึ่งเป็นกระบวนการของการเกิดการกลายพันธุ์ ได้รับอิทธิพลอย่างมากจาก พอ ลิเมอเรสที่ เคลื่อนที่ผ่านรอยโรค ซึ่งมักจะทำให้เกิดการกลายพันธุ์ที่ตำแหน่งของไพริมิดีนไดเมอร์[ 88 ]กระบวนการนี้เกิดขึ้นในโปรคาริโอตผ่านการตอบสนอง SOSต่อการกลายพันธุ์ และในยูคาริโอตผ่านวิธีการอื่นๆ เนื่องจากไทมีน-ไทมีน CPD เป็นรอยโรคที่พบบ่อยที่สุดที่เกิดจากรังสียูวี พอลิเมอเรสที่เคลื่อนที่ผ่านรอยโรคจึงมีแนวโน้มที่จะรวมอะดีนีนตรงข้ามกับไดเมอร์เหล่านี้ ส่งผลให้เกิดการจำลองแบบที่แม่นยำ อย่างไรก็ตาม ไซโตซีนที่เป็นส่วนหนึ่งของ CPD นั้นไวต่อการดีอะมิเนชันทำให้เกิดการเปลี่ยนจากไซโตซีนเป็นไทมีน และมีส่วนทำให้เกิดกระบวนการกลายพันธุ์[ 89 ]
การซ่อมแซมดีเอ็นเอ

ไพริมิดีนไดเมอร์ทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างเฉพาะที่ในโครงสร้าง DNAซึ่งช่วยให้เอนไซม์ซ่อมแซมสามารถจดจำความเสียหายได้[ 90 ]ในสิ่งมีชีวิตส่วนใหญ่ (ยกเว้นสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมที่มีรกเช่น มนุษย์) สามารถซ่อมแซมได้โดยการกระตุ้นด้วยแสง [ 91 ] การกระตุ้นด้วยแสงเป็นกระบวนการซ่อมแซมที่ เอนไซม์ โฟโตไลเอสย้อนกลับ CPD โดยใช้ ปฏิกิริยา เคมีแสงนอกจากนี้ โฟโตไลเอสบางชนิดยังสามารถซ่อมแซมโฟโตโปรดักต์ 6-4 ของความเสียหายของ DNA ที่เกิดจากรังสียูวีได้อีกด้วย เอนไซม์โฟโตไลเอสใช้ฟลาวินอะดีนีนไดนิวคลีโอไทด์ (FAD)เป็นโคแฟคเตอร์ในกระบวนการซ่อมแซม[ 92 ]
ปริมาณรังสี UV ที่ลดจำนวนเซลล์ยีสต์สายพันธุ์ป่าลงเหลือ 37% (โดยสมมติว่ามีการกระจายแบบปัวซงของการโจมตี) เท่ากับปริมาณรังสี UV ที่ทำให้เกิดการโจมตีที่ทำให้เซลล์ตายโดยเฉลี่ย 1 ครั้งต่อเซลล์ในประชากร[ 93 ]จำนวนไพริมิดีนไดเมอร์ที่ถูกเหนี่ยวนำต่อจีโนมแฮพลอย ด์ที่ปริมาณรังสีนี้วัดได้ 27,000 [ 93 ] สายพันธุ์ยีสต์กลายพันธุ์ที่บกพร่องในเส้นทาง การซ่อมแซมไพริมิดีนไดเมอร์ที่รู้จักกัน 3 เส้นทางก็ได้รับการทดสอบความไวต่อรังสี UV เช่นกัน ในกรณีนี้ ไพริมิดีนไดเมอร์ที่ไม่ได้รับการซ่อมแซมเพียงหนึ่งถึง 2 ตัวต่อจีโนม แฮพลอยด์เท่านั้น ที่ทำให้เซลล์ตายได้[ 93 ]ผลการค้นพบเหล่านี้จึงบ่งชี้ว่าการซ่อมแซมไทมีนไดเมอร์ในยีสต์สายพันธุ์ป่ามีประสิทธิภาพสูง[ 94 ]
การซ่อมแซมโดยการตัดนิวคลีโอไทด์ (NER) ซึ่งบางครั้งเรียกว่า "การกระตุ้นการทำงานในที่มืด" เป็นกลไกทั่วไปในการซ่อมแซมความเสียหาย และเป็นรูปแบบการซ่อมแซม DNA ที่พบบ่อยที่สุดสำหรับไพริมิดีนไดเมอร์ในมนุษย์ กระบวนการนี้ทำงานโดยใช้กลไกของเซลล์เพื่อค้นหานิวคลีโอไทด์ที่เกิดไดเมอร์และตัดความเสียหายออก เมื่อ CPD ถูกกำจัดออกไปแล้ว จะมีช่องว่างในสาย DNA ที่ต้องเติมเต็ม กลไกของ DNA ใช้ สาย DNA ที่ ไม่เสียหาย เป็นแม่แบบในการสังเคราะห์นิวคลีโอไทด์ที่ตรงกัน และเติมเต็มช่องว่างบนสายที่เสียหายในที่สุด[ 95 ]
โรค Xeroderma pigmentosum (XP) เป็นโรคทางพันธุกรรมที่หายากในมนุษย์ ซึ่งเกิดจากความเสียหายของยีนที่เข้ารหัสโปรตีน NER จากรังสียูวี ส่งผลให้เซลล์ไม่สามารถต่อสู้กับไพริมิดีนไดเมอร์ที่เกิดขึ้นได้ บุคคลที่เป็นโรค XP ยังมีความเสี่ยงต่อโรคมะเร็งสูงกว่าคนทั่วไปมาก โดยมีความเสี่ยงที่จะเป็นมะเร็งผิวหนังสูงกว่าประชากรทั่วไปถึง 5,000 เท่า[ 96 ]ลักษณะและอาการทั่วไปของ XP ได้แก่ การเปลี่ยนสีผิวและการเกิดเนื้องอกหลายก้อนเนื่องจากการสัมผัสกับรังสียูวี[ 97 ]
สิ่งมีชีวิตบางชนิดมีวิธีการซ่อมแซมแบบอื่น:
- เอนไซม์โฟโตโปรดักต์ไลเอสของสปอร์พบได้ในแบคทีเรียที่สร้างสปอร์ เอนไซม์นี้จะย้อนกลับไดเมอร์ของไทมีนไปสู่สถานะเดิม[ 98 ]
- เอนไซม์ดีออกซีไรโบไพริมิดีนเอนโดนิวคลีโอซิเดสพบในแบคทีริโอเฟจ T4เป็น เอนไซม์ ซ่อมแซมเบสที่จำเพาะต่อไพริมิดีนไดเมอร์ และสามารถตัดเปิดบริเวณ APได้
กลไกการซ่อมแซมอีกประเภทหนึ่งที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้ในมนุษย์และสัตว์ที่ไม่ใช่สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมอื่นๆ คือการสังเคราะห์แบบข้ามรอยโรคโดยทั่วไป รอยโรคที่เกี่ยวข้องกับไพริมิดีนไดเมอร์จะขัดขวางกลไกของเซลล์ไม่ให้สังเคราะห์ผ่านบริเวณที่เสียหาย อย่างไรก็ตาม ในการสังเคราะห์แบบข้ามรอยโรค โพลีเมอเรสแบบข้ามรอยโรคสามารถจำลองผ่าน CPD ได้ ทำให้ทั้งกลไกการจำลองและการถอดรหัสสามารถดำเนินต่อไปได้ผ่านรอยโรค โพลีเมอเรส DNA แบบข้ามรอยโรคเฉพาะตัวหนึ่ง คือDNA โพลีเมอเรส ηนั้นมีปริมาณน้อยในบุคคลที่เป็นโรคXeroderma pigmentosum [ 99 ]
การประยุกต์ใช้เทคโนโลยี
นอกเหนือจากบทบาทในการทำให้เกิดรอยโรคจากแสงในดีเอ็นเอแล้ว ไดเมอร์ของไพริมิดีนยังได้รับการศึกษาในฐานะโครงสร้างทางเคมีแสงที่มีฟังก์ชันการทำงานในวัสดุที่ได้รับการออกแบบทางวิศวกรรม ในระบบดังกล่าว การสร้างและการแตกตัวของไดเมอร์ที่ควบคุมได้ถูกนำมาใช้เพื่อปรับเปลี่ยนคุณสมบัติของวัสดุด้วยความละเอียดเชิงพื้นที่
ในช่วงปลายศตวรรษที่ 20 พบว่าหมู่ไทมีนที่รวมอยู่ในฟิล์มพอลิเมอร์สามารถเกิดปฏิกิริยาโฟโตไดเมอไรเซชันแบบย้อนกลับได้เมื่อได้รับรังสี UV [ 100 ] [ 101 ]การศึกษาเหล่านี้ได้กำหนดให้โฟโตไดเมอไรเซชันของไพริมิดีนเป็น กลไก การเชื่อมโยงในพอลิเมอร์ที่ตอบสนองต่อแสงและวัสดุบันทึกแสง
งานวิจัยต่อมาแสดงให้เห็นว่าการก่อตัวของไพริมิดีนไดเมอร์สามารถทำได้ในฟิล์มแข็งที่เคลือบอยู่บนพื้นผิวควอตซ์ผ่านกลไกทางอ้อมที่ไวต่อแสง[ 102 ] การสร้างไทมีนไดเมอร์เฉพาะตำแหน่งยังถูกนำไปใช้ในนาโนเทคโนโลยีดีเอ็นเอ ตัวอย่างเช่น การก่อตัวของไซโคลบิวเทนไพริมิดีนไดเมอร์ระหว่างตำแหน่งไทมีดีนที่กำหนดไว้ล่วงหน้าในโครงสร้างนาโนดีเอ็นเอจะเพิ่มความแข็งแกร่งและความเสถียรของโครงสร้าง ทำให้การจัดการและการถ่ายโอนในสภาพแวดล้อมที่เป็นน้ำทำได้ง่ายขึ้น[ 24 ]นักวิจัยคนอื่นๆ ใช้กระบวนการนี้เพื่อสร้างระบบแอมฟิฟิลิกที่สามารถเปลี่ยนสถานะด้วยแสงได้[ 103 ]
ในช่วงทศวรรษ 2020 การเกิดโฟโตไดเมอไรเซชันของไทมีนแบบย้อนกลับได้ในโคพอลิเมอ ร์แบบกราฟต์ ถูกนำมาใช้ในการพัฒนาสารเคลือบที่ซ่อมแซมตัวเองได้ รวมถึงวัสดุที่มุ่งเน้นการใช้งานด้านเซลล์แสงอาทิตย์[ 104 ]ประสิทธิภาพของการซ่อมแซมด้วยแสงในเมมเบ รน และสารเคลือบแข็งได้รับการปรับปรุงให้ดียิ่งขึ้นไปอีกโดยการผสมผสานสารไวแสงที่ส่งเสริมการก่อตัวของไดเมอร์และการย้อนกลับด้วยแสง[ 105 ]
ดูเพิ่มเติม
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ไพริมิดีนไดเมอร์
ไพริมิดีนไดเมอร์ เป็น สารเคมี ที่เกิดจาก ปฏิกิริยาทางเคมีแสง ที่เกี่ยวข้องกับนิ วคลีโอเบสไพริมิดีน (P) สองตัว( ไทมีน ไซ โตซีน หรือ ยูราซิล ) ผ่านการสร้างพันธะโควาเลนต์ใหม่...
เคมีแสง
ในบรรดาไดเมอร์ไพริมิดีนที่เกิดขึ้นระหว่างนิวคลีโอเบสที่เหมือนกันหรือต่างกัน ไดเมอร์ที่เกี่ยวข้องกับไทมีนสองตัวได้รับการศึกษาอย่างกว้างขวางที่สุดจากมุมมองทางเคมีแสง นอกเหนือจากการเกิดไดเมอร์ของนิวคลีโอเบสหลักแล้ว เคมีแสงของ อะนาล็อกเอพิเจเนติ กส์ เช่น...
กลไกโดยตรง
ตามกลไกโดยตรง โฟตอน UV จะถูกดูดซับโดยไพริมิดีน และปฏิกิริยาโฟโตเคมีจะดำเนินไปส่วนใหญ่จากสถานะกระตุ้นซิงเกล็ต สถานะเหล่านี้เป็นแบบรวม หมายความว่ามีการกระจายตัวอยู่ทั่วไพริมิดีนทั้งสอง [ 37 ] [ 38 ] นอกจากนี้ยังมีการรายงาน เส้นทางย่อยที่ดำเนินไปผ่าน สถานะ...
กลไกทางอ้อม
ในกลไกทางอ้อม สถานะทริปเล็ตมีบทบาทสำคัญ โฟตอน โดยทั่วไปอยู่ในช่วง UVA จะถูกดูดซับโดยโฟโตเซนซิไทเซอร์ซึ่งสถานะทริปเล็ตจะถูกเติมเต็มผ่าน การเปลี่ยนสถานะระหว่างระบบ ต่อมา พลังงานกระตุ้นทางอิเล็กตรอนจะถูกถ่ายโอนไปยังสถานะทริปเล็ตของไพริมิดีน...