กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 3 นาที

ไม่มีชื่อบทความ

ลวดลาย ST เป็นลักษณะที่พบได้ทั่วไปใน โปรตีน และ โพลีเปปไทด์ ประกอบด้วยกรด อะมิโน 4 หรือ 5 ตัว โดยมี ซีรีน หรือ ทรีโอนีน เป็นกรดอะมิโนตัวแรก (กรดอะมิโน i ) [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]...

ลวดลาย ST

ลวดลายSTเป็นลักษณะที่พบได้ทั่วไปในโปรตีนและโพลีเปปไทด์ประกอบด้วยกรดอะมิโน 4 หรือ 5 ตัว โดยมี ซีรีนหรือทรีโอนีนเป็นกรดอะมิโนตัวแรก (กรดอะมิโนi ) [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]ถูกกำหนดโดยพันธะไฮโดรเจน ภายใน 2 พันธะ พันธะหนึ่งอยู่ระหว่างออกซิเจนของหมู่ข้างเคียงของกรดอะมิโนiและ NH ของสายหลักของกรดอะมิโนi  +  2 หรือi  +  3 อีกพันธะหนึ่งอยู่ระหว่างออกซิเจนของสายหลักของกรดอะมิโนiและ NH ของสายหลักของกรดอะมิโนi  +  3 หรือi  +  4 มีเว็บไซต์ 2 แห่งที่ใช้สำหรับค้นหาและตรวจสอบลวดลาย ST ในโปรตีน ได้แก่ Motivated Proteins: [ 4 ] [ 5 ]และ PDBeMotif [ 6 ] [ 7 ]

โครงสร้าง ST motif คือ เพนตาเปปไทด์ที่มีซีรีนที่ปลาย N-terminus สร้างพันธะไฮโดรเจน สองพันธะ กับอะตอมของสายหลักของเรซิเดิวส์ถัดไป คาร์บอนสีเทา ออกซิเจนสีแดง และไนโตรเจนสีน้ำเงิน ละเว้นอะตอมไฮโดรเจน พันธะไฮโดรเจนระหว่างสายหลักกับสายหลักแสดงด้วยสีแดง และพันธะไฮโดรเจนระหว่างหมู่ข้างเคียงกับสายหลัก (ซึ่งก่อให้เกิดโครงสร้างST turn ด้วย ) แสดงด้วยเส้นประสีเทา

เมื่อพันธะไฮโดรเจนหนึ่งพันธะอยู่ระหว่างออกซิเจนของสายหลักของกรดอะมิโนiและ NH ของสายข้างของกรดอะมิโนi  +  3 โครงสร้างนั้นจะมีลักษณะเป็นเบต้าเทิร์นเมื่อพันธะไฮโดรเจนหนึ่งพันธะอยู่ระหว่างออกซิเจนของสายข้างของกรดอะมิโนiและ NH ของสายหลักของกรดอะมิโนi  +  2 โครงสร้างนั้นจะมีลักษณะเป็นST เทิร์

เช่นเดียวกับST turnsสัดส่วนที่สำคัญของโมทีฟ ST เกิดขึ้นที่ปลาย Nของอัลฟาเฮลิกซ์โดยมีซีรีนหรือทรีโอนีนเป็น สารตกค้าง N capดังนั้นจึงมักถูกอธิบายว่าเป็นคุณลักษณะการปิดปลายเฮลิกซ์[ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]

ลวดลายที่เกี่ยวข้องอีกอย่างหนึ่งคือลวดลาย asxซึ่งมีแอสปาร์เทตหรือแอสปาราจีนเป็นกรดอะมิโนตัวแรก

ทรีโอนีนสองตัวที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้อย่างดี ที่ ปลาย N-terminus α-helical ปรากฏเป็นโมทีฟ ST และเป็นส่วนหนึ่งของ ไซต์การจับ นิวคลีโอไทด์ ที่เป็นลักษณะเฉพาะของ เฮลิเคส DNA และ RNA ประเภทSF1 และ SF2 [ 12 ]

มีการเสนอแนะว่าลำดับ SPXX หรือ STXX มักพบที่ไซต์การจับกับ DNA และยังได้รับการยอมรับว่าเป็นสารตั้งต้นโดยโปรตีนไคเนส บางชนิด การศึกษาโครงสร้างของโพลีเปปไทด์แสดงให้เห็นว่าเตตระเปปไทด์ดังกล่าวสามารถใช้รูปแบบพันธะไฮโดรเจนของโมทีฟ ST ได้[ 13 ] [ 14 ]

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ไม่มีชื่อบทความ

ลวดลาย ST เป็นลักษณะที่พบได้ทั่วไปใน โปรตีน และ โพลีเปปไทด์ ประกอบด้วยกรด อะมิโน 4 หรือ 5 ตัว โดยมี ซีรีน หรือ ทรีโอนีน เป็นกรดอะมิโนตัวแรก (กรดอะมิโน i ) [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]...