กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 20 นาที

เฮลิเคส

เฮลิเคส เป็น เอนไซม์ ประเภทหนึ่งที่มีความสำคัญต่อ สิ่งมีชีวิต ทุกชนิด หน้าที่หลักของพวกมันคือการแยก สารพันธุกรรม ของสิ่งมีชีวิต เฮลิเคสเป็น โปรตีนมอเตอร์ ที่เคลื่อนที่ ไปในทิศทาง...

เฮลิเคส

โครงสร้างของ เฮลิเคส RuvA จาก แบคทีเรีย E. coli (โปรดทราบว่าแกนเฮลิเคสในคอมเพล็กซ์ RuvAB คือ RuvB ไม่ใช่ RuvA และ RuvA เพียงอย่างเดียวไม่แสดงกิจกรรมเฮลิเคส)

เฮลิเคส เป็น เอนไซม์ประเภทหนึ่งที่มีความสำคัญต่อสิ่งมีชีวิต ทุกชนิด หน้าที่หลักของพวกมันคือการแยกสารพันธุกรรม ของสิ่งมีชีวิต เฮลิเคสเป็นโปรตีนมอเตอร์ที่เคลื่อนที่ไปในทิศทางตามเกลียวคู่ ของนิวคลีอิก โดยแยกสายกรดนิวคลีอิกสองสายที่จับคู่กัน (จึงเรียกว่าเฮลิเคส)โดยอาศัยพลังงานที่ได้จากการไฮโดรไลซิสของ ATP มีเฮลิเคสหลายชนิด ซึ่งแสดงถึงกระบวนการที่หลากหลายที่ต้องมีการเร่งปฏิกิริยาการแยกสาย ประมาณ 1% ของยีนยูคาริโอตเข้ารหัสสำหรับเฮลิเคส[ 1 ]

จีโนมของมนุษย์เข้ารหัสสำหรับเฮลิเคสที่ไม่ซ้ำกัน 95 ชนิด ได้แก่ เฮลิเคส RNA 64 ชนิด และเฮลิเคส DNA 31 ชนิด[ 2 ] กระบวนการในเซลล์หลายอย่าง เช่นการจำลองแบบ DNA การถอดรหัส การแปลการรวมตัวใหม่การซ่อมแซมDNAและการสร้างไรโบโซมเกี่ยวข้องกับการแยกสายกรดนิวคลีอิกซึ่งจำเป็นต้องใช้เฮลิเคส เฮลิเคสเฉพาะบางชนิดยังเกี่ยวข้องกับการตรวจจับกรดนิวคลีอิกของไวรัสในระหว่างการติดเชื้อและทำหน้าที่ทางภูมิคุ้มกันการกลายพันธุ์ทางพันธุกรรมที่ส่งผลต่อเฮลิเคสอาจส่งผลกระทบอย่างกว้างขวางต่อสิ่งมีชีวิต เนื่องจากความสำคัญของเฮลิเคสในกระบวนการทางชีววิทยาหลายอย่าง

การทำงาน

เฮลิเคส มักถูกใช้เพื่อแยกสายของดีเอ็นเอเกลียวคู่ หรือโมเลกุลอา ร์เอ็นเอที่เชื่อมต่อกันเองโดยใช้พลังงานจาก การไฮโดรไลซิส ของ ATPซึ่งเป็นกระบวนการที่มีลักษณะเฉพาะคือการแตกของพันธะไฮโดรเจนระหว่างเบสนิวคลีโอไทด์ที่เชื่อมต่อกันพวกมันยังทำหน้าที่กำจัดโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับกรดนิวคลีอิกและเร่งปฏิกิริยาการรวมตัวของดีเอ็นเอ แบบโฮโมโลจั ส[ 3 ]กระบวนการเมตาบอลิซึมของอาร์เอ็นเอ เช่น การแปล การถอดรหัสการสร้างไรโบโซม การตัดต่อ อาร์เอ็นเอ การขนส่งอาร์เอ็นเอการแก้ไขอาร์เอ็นเอและการย่อยสลายอาร์เอ็นเอ ล้วนได้รับการอำนวยความสะดวกโดยเฮลิเคส[ 3 ] เฮลิเคสเคลื่อนที่ทีละน้อยไปตาม สาย กรดนิวคลีอิก หนึ่ง สายของเกลียวคู่ โดยมีทิศทางและกระบวนการที่เฉพาะเจาะจงสำหรับเอนไซม์แต่ละชนิด

เฮลิเคสมีโครงสร้างและสถานะการรวมตัวเป็นโอลิโกเมอร์ ที่แตกต่างกัน ในขณะที่ เฮลิเคสชนิดDnaB คลายเกลียว DNA ในรูป เฮกซาเมอร์รูปวงแหวนเอนไซม์อื่นๆ แสดงให้เห็นว่าสามารถทำงานได้ในรูปโมโนเมอร์หรือไดเมอร์การศึกษาแสดงให้เห็นว่าเฮลิเคสอาจทำงานแบบพาสซีฟ โดยรอให้การคลายเกลียวเกิดขึ้นโดยไม่มีตัวเร่งปฏิกิริยา จากนั้นจึงเคลื่อนย้ายระหว่างสายที่แยกออกจากกัน[ 4 ]หรืออาจมีบทบาทเชิงรุกในการเร่งปฏิกิริยาการแยกสายโดยใช้พลังงานที่สร้างขึ้นจากการไฮโดรไลซิสของ ATP [ 5 ]ในกรณีหลัง เฮลิเคสจะทำงานได้เทียบเท่ากับมอเตอร์ที่ทำงานอยู่ โดยคลายเกลียวและเคลื่อนย้ายไปตามสารตั้งต้นโดยตรงอันเป็นผลมาจากกิจกรรม ATPase ของมัน[ 6 ]เฮลิเคสอาจประมวลผลได้เร็วกว่ามากในร่างกายมากกว่าในหลอดทดลองเนื่องจากมีโปรตีนเสริมที่ช่วยในการทำให้จุดเชื่อมต่อของส้อมไม่เสถียร[ 6 ]

เอนไซม์เฮลิเคส (รูปสามเหลี่ยมสีฟ้า) ทำหน้าที่แยกสายดีเอ็นเอที่พันกันออก เพื่อให้สายดีเอ็นเอลูกสามารถเกิดขึ้นได้
เอนไซม์เฮลิเคส (รูปสามเหลี่ยมสีฟ้า) ทำหน้าที่แยกสายดีเอ็นเอที่พันกันออก เพื่อให้สายดีเอ็นเอลูกสามารถก่อตัวขึ้นได้

อุปสรรคในการกระตุ้นการทำงานของเฮลิเคส

การทำงานของเอนไซม์เฮลิเคส เช่น การคลายเกลียวกรดนิวคลีอิก เกิดขึ้นจากการลดอุปสรรคการกระตุ้น ( ) ของการทำงานเฉพาะแต่ละอย่าง[ 7 ] [ 5 ] [ 8 ] [ 9 ]อุปสรรคการกระตุ้นเป็นผลมาจากปัจจัยต่างๆ และสามารถกำหนดได้โดย

ที่ไหน

  • = จำนวนคู่เบสที่คลายตัว (bps)
  • = พลังงานอิสระของการสร้างคู่เบส
  • = การลดลงของพลังงานอิสระเนื่องจากเฮลิเคส และ
  • = การลดลงของพลังงานอิสระเนื่องจากแรงดึงออก

ปัจจัยที่ส่งผลต่อความสูงของกำแพงการกระตุ้น ได้แก่ ลำดับกรดนิวคลีอิกเฉพาะของโมเลกุลที่เกี่ยวข้อง จำนวนคู่เบสที่เกี่ยวข้อง แรงตึงที่มีอยู่บนส้อมการจำลองแบบ และแรงที่ไม่เสถียร[ 7 ] [ 5 ] [ 8 ] [ 9 ]

เฮลิเคสแบบแอคทีฟและพาสซีฟ

ขนาดของอุปสรรคการกระตุ้นที่เฮลิเคสต้องเอาชนะนั้นมีส่วนในการกำหนดประเภทของเฮลิเคสว่าเป็นเฮลิเคสแบบแอคทีฟหรือแบบพาสซีฟ ในเฮลิเคสแบบพาสซีฟ จะมีอุปสรรคการกระตุ้นที่สำคัญอยู่ (กำหนดโดย โดยที่คือค่าคงที่ของโบลต์ซมันน์และคืออุณหภูมิของระบบ) เนื่องจากอุปสรรคการกระตุ้นที่สำคัญนี้ ความคืบหน้าของการคลายเกลียวจึงได้รับผลกระทบอย่างมากจากลำดับของกรดนิวคลีอิกภายในโมเลกุลที่จะคลายเกลียว และการมีอยู่ของแรงที่ไม่เสถียรที่กระทำต่อฟอร์กการจำลองแบบ[ 7 ] [ 5 ] [ 8 ] [ 9 ]การรวมกันของกรดนิวคลีอิกบางอย่างจะลดอัตราการคลายเกลียว (เช่นกัวนีนและไซโตซีน ) ในขณะที่แรงที่ไม่เสถียรต่างๆ สามารถเพิ่มอัตราการคลายเกลียวได้[ 5 ] [ 8 ] [ 9 ]ในระบบแบบพาสซีฟ อัตราการคลายเกลียว ( ) จะน้อยกว่าอัตราการเคลื่อนย้าย ( ) (การเคลื่อนย้ายไปตามกรดนิวคลีอิกสายเดี่ยว, ssNA) เนื่องจากการพึ่งพาการคลายเกลียวชั่วคราวของคู่เบสที่จุดแยกการจำลองแบบเพื่อกำหนดอัตราการคลายเกลียว[ 7 ] [ 5 ] [ 8 ] [ 9 ]

ในเฮลิเคสที่ทำงานอยู่ระบบจะขาดอุปสรรคสำคัญ เนื่องจากเฮลิเคสสามารถทำให้กรดนิวคลีอิกไม่เสถียร คลายเกลียวคู่ในอัตราคงที่ โดยไม่คำนึงถึงลำดับของกรดนิวคลีอิก ในเฮลิเคสที่ทำงานอยู่จะใกล้เคียงกับเนื่องจากความสามารถของเฮลิเคสที่ทำงานอยู่ในการทำให้จุดแยกการจำลองแบบไม่เสถียรโดยตรงเพื่อส่งเสริมการคลายเกลียว[ 7 ] [ 5 ] [ 8 ] [ 9 ]

เฮลิเคสที่ทำงานอยู่แสดงพฤติกรรมที่คล้ายคลึงกันเมื่อทำงานกับกรดนิวคลีอิกแบบสองสาย (dsNA) หรือแบบสายเดียว (ssNA) ในแง่ของอัตราการคลายเกลียวและอัตราการเคลื่อนย้าย ซึ่งในทั้งสองระบบจะมีค่าใกล้เคียงกัน

เฮลิเคสทั้งสองประเภทนี้ยังสามารถจำลองเป็นกลไกได้อีกด้วย ในแบบจำลองดังกล่าว เฮลิเคสแบบพาสซีฟจะถูกมองว่าเป็นกลไกแบบบราวน์ที่ขับเคลื่อนด้วยความผันผวนของอุณหภูมิและเกรเดียนต์แอนไอโซโทรปิกที่เกิดขึ้นตามโครงสร้าง DNA ในทางตรงกันข้าม เฮลิเคสแบบแอคทีฟจะถูกมองว่าเป็นมอเตอร์แบบสเต็ปปิ้ง หรือที่รู้จักกันในชื่อมอเตอร์แบบพาวเวอร์สโตรก โดยใช้กลไกแบบ "หนอนคืบ" หรือกลไกแบบ "เดิน" แบบมือต่อมือเพื่อเคลื่อนที่ไปข้างหน้า[ 10 ]ขึ้นอยู่กับสิ่งมีชีวิต การเคลื่อนที่ผ่านเกลียวดังกล่าวสามารถเกิดขึ้นได้ที่ความเร็วในการหมุนในช่วง 5,000 [ 11 ]ถึง 10,000 [ 12 ] รอบต่อนาที

ประวัติของดีเอ็นเอเฮลิเคส

ดีเอ็นเอเฮลิเคสถูกค้นพบในE. coliในปี 1976 เฮลิเคสนี้ถูกอธิบายว่าเป็น "เอนไซม์คลายเกลียวดีเอ็นเอ" ซึ่ง "พบว่าทำให้ดีเอ็นเอคู่คลายตัวในปฏิกิริยาที่ขึ้นอยู่กับ ATP โดยไม่เกิดการย่อยสลายที่ตรวจพบได้" [ 13 ]ดีเอ็นเอเฮลิเคสยูคาริโอตตัวแรกที่ถูกค้นพบคือในปี 1978 ในต้นลิลลี่[ 14 ]ตั้งแต่นั้นมา ดีเอ็นเอเฮลิเคสก็ถูกค้นพบและแยกได้ในแบคทีเรีย ไวรัส ยีสต์ แมลงวัน และยูคาริโอตชั้นสูงอื่นๆ[ 15 ]จนถึงปัจจุบัน มีการแยกเฮลิเคสที่แตกต่างกันอย่างน้อย 14 ชนิดจากสิ่งมีชีวิตเซลล์เดียว 6 ชนิดจากแบคทีริโอเฟจ 12 ชนิดจากไวรัส 15 ชนิดจากยีสต์ 8 ชนิดจากพืช 11 ชนิดจากต่อมไทมัสของลูกวัว และประมาณ 25 ชนิดจากเซลล์มนุษย์[ 16 ]ด้านล่างนี้คือประวัติการค้นพบเฮลิเคส:

  • พ.ศ. 2519 – การค้นพบและการแยกDNA helicase ที่มีพื้นฐานมาจากE. coli [ 13 ]
  • พ.ศ. 2521 – การค้นพบเฮลิเคส DNA ยูคาริโอตตัวแรกที่แยกได้จากต้นลิลลี่[ 14 ]
  • 1982 – "โปรตีนยีน T4 41" เป็นเฮลิเคส DNA ของแบคทีริโอเฟจตัวแรกที่ได้รับการรายงาน[ 15 ]
  • พ.ศ. 2528 – เฮลิเคส DNA ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมตัวแรกที่แยกได้จากต่อมไทมัสของลูกวัว[ 17 ]
  • พ.ศ. 2529 – แอนติเจนเนื้องอกขนาดใหญ่ SV40 ได้รับการรายงานว่าเป็นเฮลิเคสของไวรัส (โปรตีนไวรัสตัวแรกที่ได้รับการรายงานว่าทำหน้าที่เป็นเฮลิเคสของ DNA) [ 18 ]
  • พ.ศ. 2529 – ATPaseIII ซึ่งเป็นโปรตีนของยีสต์ ถูกกำหนดให้เป็น DNA helicase [ 19 ]
  • ปี 1988 – การค้นพบโดเมนกรดอะมิโนที่อนุรักษ์ไว้เจ็ดโดเมน ซึ่งระบุว่าเป็นโมทีฟของเฮลิเคส
  • พ.ศ. 2532 – การกำหนดตระกูลเฮลิเคส DNA กลุ่มที่ 1 และกลุ่มที่ 2 [ 20 ]
  • พ.ศ. 2532 – การระบุตระกูลเฮลิเคส DEAD box [ 21 ]
  • พ.ศ. 2533 – การแยกเฮลิเคส DNA ของมนุษย์[ 22 ]
  • พ.ศ. 2535 – การแยกเฮลิเคสดีเอ็นเอไมโทคอนเดรียตัวแรกที่มีรายงาน (จากสมองวัว) [ 23 ]
  • พ.ศ. 2539 – รายงานการค้นพบเฮลิเคส DNA คลอโรพลาสต์บริสุทธิ์ตัวแรกจากถั่วลันเตา[ 24 ]
  • 2002 – การแยกและลักษณะเฉพาะของเฮลิเคส DNA ของปรสิตมาลาเรียที่ออกฤทธิ์ทางชีวเคมีตัวแรก – Plasmodium cynomolgi [ 25 ]

ลักษณะโครงสร้าง

หน้าที่ทั่วไปของเฮลิเคสเกิดจากข้อเท็จจริงที่ว่าพวกมันแสดงความคล้ายคลึงกันในลำดับกรดอะมิโน ในระดับหนึ่ง พวกมันทั้งหมดมีลำดับโมทีฟที่อยู่ภายในโครงสร้างหลักซึ่งเกี่ยวข้องกับ การจับกับ ATP การไฮโดรไลซิส ATP และการเคลื่อนย้ายไปตามสารตั้งต้นกรดนิวคลีอิกส่วนที่แปรผันของ ลำดับ กรดอะมิโนนั้นเกี่ยวข้องกับคุณสมบัติเฉพาะของเฮลิเคสแต่ละชนิด

การมีอยู่ของลวดลายเฮลิเคสเหล่านี้ทำให้สามารถระบุได้ว่าโปรตีนนั้นมีกิจกรรมเฮลิเคส แต่ไม่ได้ยืนยันว่าโปรตีนนั้นเป็นเฮลิเคสที่ทำงานได้จริงเสมอไป อย่างไรก็ตาม ลวดลายที่อนุรักษ์ไว้นั้นสนับสนุนความคล้ายคลึงกันทางวิวัฒนาการระหว่างเอนไซม์ต่างๆ โดยอาศัยลวดลายเฮลิเคสเหล่านี้ จึงได้มีการจำแนกกลุ่มเฮลิเคสขนาดใหญ่หลายกลุ่ม

ซูเปอร์แฟมิลี

เฮลิเคสถูกจัดกลุ่มเป็น 6 กลุ่ม (ซูเปอร์แฟมิลี) โดยพิจารณาจากลำดับโมทีฟที่ใช้ร่วมกัน[ 26 ]เฮลิเคสที่ไม่สร้างโครงสร้างวงแหวนอยู่ในซูเปอร์แฟมิลี 1 และ 2 และเฮลิเคสที่สร้างวงแหวนเป็นส่วนหนึ่งของซูเปอร์แฟมิลี 3 ถึง 6 [ 27 ]เฮลิเคสยังถูกจัดประเภทเป็น α หรือ β ขึ้นอยู่กับว่ามันทำงานกับDNA สายเดี่ยวหรือสายคู่ เฮลิเคส α ทำงานกับ DNAสายเดี่ยว และเฮลิเคส β ทำงานกับ DNAสายคู่พวกมันยังถูกจัดประเภทตามขั้วการเคลื่อนย้าย หากการเคลื่อนย้ายเกิดขึ้นในทิศทาง 3'-5' เฮลิเคสจะเป็นประเภท A หากการเคลื่อนย้ายเกิดขึ้นในทิศทาง 5'-3' จะเป็นประเภท B [ 26 ]

  • ซูเปอร์แฟมิลี 1 (SF1) : ซูเปอร์แฟมิลีนี้สามารถแบ่งย่อยออกเป็นเฮลิเคส SF1A และ SF1B ได้อีก[ 26 ]ในกลุ่มนี้ เฮลิเคสสามารถมีขั้วการเคลื่อนย้ายแบบ 3'-5' (ซับแฟมิลี SF1A) หรือ 5'-3' (ซับแฟมิลี SF1B) ก็ได้[ 26 ] [ 28 ]เฮลิเคส SF1A ที่เป็นที่รู้จักมากที่สุดคือ Rep และUvrDใน แบคทีเรีย แกรมลบและเฮลิเคส PcrA จากแบคทีเรียแกรมบวก[ 26 ]เฮลิเคสที่เป็นที่รู้จักมากที่สุดในกลุ่ม SF1B คือ เฮลิเคส RecD และ Dda [ 26 ]พวกมันมีแกนพับแบบ RecA [ 27 ]
  • ซูเปอร์แฟมิลี 2 (SF2) : นี่คือกลุ่มเฮลิเคสที่ใหญ่ที่สุดซึ่งเกี่ยวข้องกับกระบวนการต่างๆ ในเซลล์[ 26 ] [ 2 ]มีลักษณะเฉพาะคือการมีโมทีฟที่อนุรักษ์ไว้ 9 แบบ ได้แก่ Q, I, Ia, Ib และ II ถึง VI [ 2 ]กลุ่มนี้ส่วนใหญ่ประกอบด้วยเฮลิเคส RNA แบบ DEAD-box [ 27 ]เฮลิเคสอื่นๆ ที่รวมอยู่ใน SF2 ได้แก่ ตระกูล RecQ-like และเอนไซม์ Snf2-like [ 26 ]เฮลิเคสส่วนใหญ่ใน SF2 เป็นประเภท A โดยมีข้อยกเว้นบางประการ เช่น ตระกูล XPD [ 26 ]พวกมันมีแกนพับแบบ RecA-like [ 27 ]
  • ซูเปอร์แฟมิลี 3 (SF3) : ซูเปอร์แฟมิลี 3 ประกอบด้วยเฮลิเคส AAA+ ที่เข้ารหัสโดยไวรัส DNA ขนาดเล็กเป็นหลัก และไวรัส DNA นิวเคลียสไซโตพลาสมิกขนาดใหญ่บางชนิด[ 29 ] [ 30 ]พวกมันมีทิศทางการเคลื่อนย้าย 3'-5' ซึ่งหมายความว่าพวกมันทั้งหมดเป็นเฮลิเคสประเภท A [ 26 ]เฮลิเคส SF3 ที่เป็นที่รู้จักมากที่สุดคือเฮลิเคส E1 ของไวรัสพาพิลโลมา[ 26 ]
  • ซูเปอร์แฟมิลี 4 (SF4) : เฮลิเคสในแฟมิลี SF4 ทั้งหมดมีขั้วแบบ B (5'-3') พวกมันมีโครงสร้างแบบ RecA [ 26 ]เฮลิเคส SF4 ที่ได้รับการศึกษามากที่สุดคือ gp4 จากแบคทีริโอเฟจ T7 [ 26 ]
  • ซูเปอร์แฟมิลี 5 (SF5) : โปรตีน Rhoประกอบเป็นกลุ่ม SF5 พวกมันมีโครงสร้างแบบ RecA [ 26 ]
  • ซูเปอร์แฟมิลี 6 (SF6) : ประกอบด้วยแกน AAA+ ที่ไม่ได้รวมอยู่ในการจัดประเภท SF3 [ 26 ]โปรตีนบางชนิดในกลุ่ม SF6 ได้แก่ การบำรุงรักษาโครโมโซมขนาดเล็กMCM , RuvB, RuvA และ RuvC [ 26 ]

เฮลิเคสทั้งหมดเป็นสมาชิกของ กลุ่มที่มี P-loop หรือWalker motif อยู่

ความผิดปกติและโรคของเฮลิเคส

การกลายพันธุ์ของเฮลิเคส ATRX

ยีนATRXเข้ารหัสเฮลิเคสที่ขึ้นอยู่กับ ATP ชื่อ ATRX (หรือที่รู้จักกันในชื่อ XH2 และ XNP) ในกลุ่มย่อย SNF2 ซึ่งเชื่อว่ามีหน้าที่รับผิดชอบในการปรับโครงสร้างโครมาติน การควบคุมยีน และการเมทิลเลชั่นของ DNA [ 31 ] [ 32 ] [ 33 ] [ 34 ]หน้าที่เหล่านี้ช่วยป้องกันอะพอพโทซิส ส่งผลให้ขนาดของคอร์เทกซ์ถูกควบคุม รวมถึงมีส่วนช่วยในการอยู่รอดของโครงสร้างฮิปโปแคมปัสและคอร์เทกซ์ ซึ่งส่งผลต่อความจำและการเรียนรู้[ 31 ]เฮลิเคสนี้ตั้งอยู่บนโครโมโซม X (Xq13.1-q21.1) ในเฮเทอโรโครมาตินรอบเซนโทรเมียร์และจับกับโปรตีนเฮเทอโรโครมาติน 1 [ 31 ] [ 33 ] การศึกษาแสดงให้เห็นว่า ATRX มีบทบาทในการเมทิลเลชั่ของ rDNA และมีความสำคัญต่อการพัฒนาของตัวอ่อน[ 35 ]พบการกลายพันธุ์ทั่วทั้ง โปรตีน ATRXโดยกว่า 90% อยู่ในโดเมนนิ้วสังกะสีและเฮลิเคส[ 36 ]การกลายพันธุ์ของ ATRX อาจส่งผลให้เกิดภาวะปัญญาอ่อนจากโรคธาลัสซีเมียอัลฟาที่เชื่อมโยงกับโครโมโซม X ( กลุ่มอาการ ATR-X ) [ 31 ]

การกลายพันธุ์หลายประเภทที่พบใน ATRX พบว่ามีความเกี่ยวข้องกับ ATR-X รวมถึงการกลายพันธุ์แบบ missense ของเบสเดี่ยวที่พบได้บ่อยที่สุด ตลอดจนการกลายพันธุ์แบบ nonsense, frameshift และ deletion [ 34 ]ลักษณะของ ATR-X ได้แก่ ภาวะศีรษะเล็ก ความผิดปกติของโครงกระดูกและใบหน้า ความบกพร่องทางสติปัญญา ความผิดปกติของอวัยวะเพศ อาการชัก การใช้และทักษะทางภาษาที่จำกัด และโรคธาลัสซีเมียอัลฟา[ 31 ] [ 35 ] [ 32 ]ฟีโนไทป์ที่พบใน ATR-X บ่งชี้ว่าการกลายพันธุ์ของยีน ATRX ทำให้เกิดการลดการแสดงออกของยีน เช่น ยีนอัลฟาโกลบิน[ 32 ]ยังไม่เป็นที่ทราบแน่ชัดว่าอะไรเป็นสาเหตุของการแสดงออกของลักษณะต่างๆ ของ ATR-X ในผู้ป่วยแต่ละราย[ 35 ]

การกลายพันธุ์แบบจุดของเฮลิเคส XPD

XPD (Xeroderma pigmentosum factor D หรือที่รู้จักกันในชื่อโปรตีน ERCC2) เป็นเฮลิเคสที่ขึ้นอยู่กับ ATP ใน Superfamily II ที่มีโดเมนคลัสเตอร์เหล็ก-กำมะถันแบบ 5'-3' [ 26 ] [ 37 ]การกลายพันธุ์แบบจุดที่ถ่ายทอดทางพันธุกรรมในเฮลิเคส XPD พบว่าเกี่ยวข้องกับความผิดปกติของการแก่ก่อนวัย เช่นกลุ่มอาการค็อกเคน (CS) และโรคผมบาง (TTD) [ 38 ]กลุ่มอาการค็อกเคนและโรคผมบางเป็นความผิดปกติทางพัฒนาการที่เกี่ยวข้องกับความไวต่อแสงยูวีและการแก่ก่อนวัย และกลุ่มอาการค็อกเคนแสดงให้เห็นถึงความพิการทางสติปัญญาอย่างรุนแรงตั้งแต่แรกเกิด[ 38 ]การกลายพันธุ์ของเฮลิเคส XPD ยังเกี่ยวข้องกับโรคผิวหนังแห้ง (XP) ซึ่งเป็นโรคที่มีลักษณะเฉพาะคือความไวต่อแสงยูวีและส่งผลให้การเกิดมะเร็งผิวหนังเพิ่มขึ้นหลายพันเท่า[ 38 ]

XPD เป็นส่วนประกอบสำคัญของ คอมเพล็กซ์ TFIIHซึ่งเป็นปัจจัยการถอดรหัสและการซ่อมแซมในเซลล์[ 38 ] [ 39 ] [ 40 ] [ 41 ] [ 42 ]ในฐานะส่วนหนึ่งของคอมเพล็กซ์นี้ มันช่วยอำนวยความสะดวกในการซ่อมแซมการตัดนิวคลีโอไทด์โดยการคลายเกลียว DNA [ 38 ] TFIIH ช่วยในการซ่อมแซม DNA ที่เสียหาย เช่น ความเสียหายจากแสงแดด[ 38 ] [ 39 ] [ 40 ] [ 41 ] [ 42 ]การกลายพันธุ์ในเฮลิเคส XPD ที่ช่วยสร้างคอมเพล็กซ์นี้และมีส่วนช่วยในการทำงานของมัน ทำให้เกิดความไวต่อแสงแดดที่พบในโรคทั้งสามชนิด รวมถึงความเสี่ยงที่เพิ่มขึ้นของโรคมะเร็งที่พบใน XP และการแก่ก่อนวัยที่พบใน trichothiodystrophy และ Cockayne syndrome [ 38 ]

การกลายพันธุ์ของเฮลิเคส XPD ที่นำไปสู่โรค trichothiodystrophy พบได้ทั่วทั้งโปรตีนในตำแหน่งต่างๆ ที่เกี่ยวข้องกับการโต้ตอบระหว่างโปรตีน[ 38 ]การกลายพันธุ์นี้ส่งผลให้โปรตีนไม่เสถียรเนื่องจากไม่สามารถสร้างปฏิสัมพันธ์ที่ทำให้เสถียรกับโปรตีนอื่นๆ ณ จุดที่เกิดการกลายพันธุ์ได้[ 38 ]ซึ่งในทางกลับกันจะทำให้คอมเพล็กซ์ TFIIH ทั้งหมดไม่เสถียร ส่งผลให้เกิดความบกพร่องในกลไกการถอดรหัสและการซ่อมแซมของเซลล์[ 38 ]

มีการเสนอแนะว่าการกลายพันธุ์ของเฮลิเคส XPD ที่นำไปสู่โรคค็อกเคนอาจเป็นผลมาจากการกลายพันธุ์ภายใน XPD ซึ่งทำให้โปรตีนแข็งตัวและไม่สามารถเปลี่ยนจากหน้าที่ซ่อมแซมไปเป็นหน้าที่การถอดรหัสได้เนื่องจาก "การล็อก" ในโหมดซ่อมแซม[ 38 ]ซึ่งอาจทำให้เฮลิเคสตัดส่วนของ DNA ที่มีไว้สำหรับการถอดรหัส[ 38 ]แม้ว่าหลักฐานในปัจจุบันจะชี้ให้เห็นถึงข้อบกพร่องในเฮลิเคส XPD ที่ส่งผลให้โปรตีนสูญเสียความยืดหยุ่นในกรณีของโรคค็อกเคน แต่ก็ยังไม่ชัดเจนว่าโครงสร้างโปรตีนนี้ทำให้เกิดอาการที่อธิบายไว้ในโรคค็อกเคนได้อย่างไร[ 38 ]

ในโรค xeroderma pigmentosa การกลายพันธุ์ของเฮลิเคส XPD เกิดขึ้นที่ตำแหน่งการจับ ATP หรือ DNA [ 38 ]ส่งผลให้เฮลิเคสที่มีโครงสร้างและฟังก์ชันการทำงานสามารถอำนวยความสะดวกในการถอดรหัสได้ แต่กลับยับยั้งการทำงานในการคลายเกลียว DNA และการซ่อมแซม DNA [ 38 ]การที่เซลล์ขาดความสามารถในการซ่อมแซมการกลายพันธุ์ เช่น การกลายพันธุ์ที่เกิดจากความเสียหายจากแสงแดด เป็นสาเหตุของอัตราการเกิดมะเร็งสูงในผู้ป่วยโรค xeroderma pigmentosa

การกลายพันธุ์ของตระกูล RecQ

เฮลิเคส RecQ

เฮลิเคส RecQ (3'-5') จัดอยู่ในกลุ่มเฮลิเคส Superfamily II ซึ่งช่วยรักษาเสถียรภาพของจีโนมและยับยั้งการเกิดการรวมตัวใหม่ที่ไม่เหมาะสม[ 43 ] [ 44 ]การขาดและ/หรือการกลายพันธุ์ในเฮลิเคสตระกูล RecQ ทำให้เกิดการรวมตัวทางพันธุกรรมที่ผิดปกติและ/หรือการจำลองดีเอ็นเอ ซึ่งนำไปสู่ความไม่เสถียรของโครโมโซมและความสามารถในการเพิ่มจำนวนโดยรวมลดลง[ 43 ]การกลายพันธุ์ในเฮลิเคสตระกูล RecQ ได้แก่ BLM, RECQL4และ WRN ซึ่งมีบทบาทในการควบคุมการรวมตัวแบบโฮโมโลจัส ได้แสดงให้เห็นว่าส่งผลให้เกิดโรคทางพันธุกรรมแบบออโตโซมัลรีเซส ซีฟ ได้แก่ กลุ่มอาการบลูม (BS), กลุ่มอาการรอธมันด์-ทอมสัน (RTS) และกลุ่มอาการเวอร์เนอร์ (WS) ตามลำดับ[ 44 ] [ 45 ]

กลุ่มอาการบลูมมีลักษณะเฉพาะคือมีแนวโน้มที่จะเป็นมะเร็งตั้งแต่อายุยังน้อย โดยมีอายุเฉลี่ยที่เริ่มเป็นโรคคือ 24 ปี[ 44 ] [ 46 ]เซลล์ของผู้ป่วยกลุ่มอาการบลูมแสดงให้เห็นความถี่สูงของการแลกเปลี่ยนระหว่างโครมาทิดคู่ (SCEs) และความเสียหายของโครโมโซมมากเกินไป[ 47 ]มีหลักฐานที่บ่งชี้ว่า BLM มีบทบาทในการกู้คืนการจำลองดีเอ็นเอที่หยุดชะงักที่จุดแยกการจำลอง[ 47 ]

กลุ่มอาการเวอร์เนอร์เป็นความผิดปกติของการแก่ก่อนวัย โดยมีอาการต่างๆ เช่น การเกิดหลอดเลือดแดงแข็งและโรคกระดูกพรุนในระยะเริ่มต้น รวมถึงโรคอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับอายุ การเกิดมะเร็งซาร์โคมาในอัตราสูง และมักเสียชีวิตจากกล้ามเนื้อหัวใจตายหรือมะเร็งในช่วงอายุ 40-60 ปี[ 44 ] [ 48 ]เซลล์ของผู้ป่วยกลุ่มอาการเวอร์เนอร์มีอายุขัยในการสืบพันธุ์ลดลง โดยมีการแตกหักและการย้ายตำแหน่งของโครโมโซม รวมถึงการลบส่วนประกอบของโครโมโซมจำนวนมาก ทำให้เกิดความไม่เสถียรของจีโนม[ 48 ]

กลุ่มอาการ Rothmund-Thomson หรือที่รู้จักกันในชื่อpoikiloderma congenitaleมีลักษณะเฉพาะคือ การแก่ก่อนวัย ความผิดปกติของผิวหนังและโครงกระดูก ผื่นผิวหนังเป็นปุ่ม ต้อกระจกในวัยเด็ก และความเสี่ยงต่อโรคมะเร็ง เช่น มะเร็งกระดูก[ 44 ] [ 49 ]พบการจัดเรียงโครโมโซมใหม่ที่ทำให้เกิดความไม่เสถียรของจีโนมในเซลล์ของผู้ป่วยกลุ่มอาการ Rothmund-Thomson RecQ เป็นกลุ่มของเอนไซม์ DNA helicase ที่พบในสิ่งมีชีวิตต่างๆ รวมถึงแบคทีเรีย อาร์เคีย และยูคาริโอต (เช่น มนุษย์) เอนไซม์เหล่านี้มีบทบาทสำคัญในกระบวนการเผาผลาญ DNA ระหว่างการจำลองแบบ DNA การรวมตัวใหม่ และการซ่อมแซม DNA มีโปรตีน RecQ helicase ที่รู้จักกัน 5 ชนิดในมนุษย์ ได้แก่ RecQ1, BLM, WRN, RecQ4 และ RecQ5 การกลายพันธุ์ในยีนบางส่วนเหล่านี้เกี่ยวข้องกับความผิดปกติทางพันธุกรรม ตัวอย่างเช่น การกลายพันธุ์ในยีน BLM ทำให้เกิดโรค Bloom ซึ่งมีลักษณะเฉพาะคือความเสี่ยงต่อโรคมะเร็งที่เพิ่มขึ้นและปัญหาสุขภาพอื่นๆ[ 50 ]การกลายพันธุ์ในยีน WRN นำไปสู่โรค Werner ซึ่งเป็นภาวะที่มีลักษณะเฉพาะคือการแก่ก่อนวัยและความเสี่ยงต่อโรคที่เกี่ยวข้องกับอายุที่เพิ่มขึ้น เฮลิเคส RecQ มีความสำคัญต่อการรักษาเสถียรภาพและความสมบูรณ์ของจีโนม ช่วยป้องกันการสะสมของความผิดปกติทางพันธุกรรมที่อาจนำไปสู่โรคต่างๆ เช่น มะเร็ง ความสมบูรณ์ของจีโนมขึ้นอยู่กับตระกูลเฮลิเคส DNA RecQ ซึ่งรวมถึงกระบวนการซ่อมแซม DNA การรวมตัวใหม่ การจำลองแบบ และการถอดรหัส ความไม่เสถียรของจีโนมและการแก่ก่อนวัยเป็นภาวะที่เกิดขึ้นจากการกลายพันธุ์ในเฮลิเคส RecQ ของมนุษย์[ 51 ]เฮลิเคส RecQ Sgs1 หายไปในเซลล์ยีสต์ ทำให้เซลล์ยีสต์เป็นแบบจำลองที่มีประโยชน์สำหรับการทำความเข้าใจความผิดปกติของเซลล์มนุษย์และหน้าที่ของเฮลิเคส RecQ [ 52 ]สมาชิกในตระกูลเฮลิเคส RecQ คือ RECQ1 เกี่ยวข้องกับความผิดปกติของมะเร็งทางพันธุกรรมที่ไม่พบบ่อยจำนวนเล็กน้อยในบุคคล เอนไซม์ดีเอ็นเอเฮลิเคสมีส่วนร่วมในกระบวนการถอดรหัสพันธุกรรม วงจรเซลล์ และการซ่อมแซมดีเอ็นเอ จากการวิจัยล่าสุดพบว่า การกลายพันธุ์แบบมิสเซนส์ในยีน RECQ1 อาจมีบทบาทในการพัฒนาของมะเร็งเต้านมในครอบครัว เอนไซม์ดีเอ็นเอเฮลิเคสมักถูกดึงดูดไปยังบริเวณที่มีความเสียหายของดีเอ็นเอ และมีความสำคัญต่อการจำลองแบบดีเอ็นเอ การรวมตัวใหม่ การซ่อมแซม และการถอดรหัสพันธุกรรมของเซลล์ การควบคุมกระบวนการระดับโมเลกุลของเอนไซม์เหล่านี้ด้วยสารเคมีสามารถเปลี่ยนแปลงอัตราการแบ่งตัวของเซลล์มะเร็ง ตลอดจนประสิทธิภาพของกระบวนการต่างๆ และภาวะสมดุลของเซลล์ การดักจับเอนไซม์ดีเอ็นเอเฮลิเคส ซึ่งเป็นโปรตีนเมตาบอลิซึมของดีเอ็นเอชนิดหนึ่ง ด้วยโมเลกุลขนาดเล็ก อาจส่งผลเสียต่อเซลล์มะเร็งที่เพิ่มจำนวนอย่างรวดเร็ว ซึ่งอาจมีประสิทธิภาพในการรักษามะเร็ง

ในระหว่างไมโอซิสการแตกของสายดีเอ็นเอคู่และความเสียหายของดีเอ็นเอ อื่นๆ ในโครมาทิดจะได้รับการซ่อมแซมโดยการรวมตัวกันแบบโฮโมโลกัสโดยใช้โครมาทิดพี่น้องหรือโครมาทิดที่ไม่ใช่พี่น้องที่เป็นโฮโมโลกัสเป็นแม่แบบ การซ่อมแซมนี้อาจส่งผลให้เกิดการไขว้กัน (CO) หรือที่พบได้บ่อยกว่าคือการรวมตัวกันแบบไม่ไขว้กัน (NCO) ในยีสต์Schizosaccharomyces pombeเฮลิเคสดีเอ็นเอตระกูลFANCM ชื่อ FmI1 จะควบคุมการสร้างการรวมตัวกันแบบ NCO ในระหว่างไมโอซิส [ 53 ] เฮลิเคสชนิด RecQ ชื่อ Rqh1 ก็ควบคุมการรวมตัวกันแบบไมโอซิสแบบ NCO เช่นกัน[ 54 ] เฮลิเคสเหล่านี้ ด้วยความสามารถในการคลาย ตัวกลาง D-loop จึงส่งเสริมการรวมตัวกันแบบ NCO โดยกระบวนการเชื่อมต่อสายที่ขึ้นอยู่กับการสังเคราะห์

ในพืชArabidopsis thalianaเฮลิเคส FANCM ส่งเสริม NCO และต่อต้านการก่อตัวของรีคอมบิแนนท์ CO [ 55 ] เฮลิเคสอีกตัวหนึ่งคือ RECQ4A/B ก็ลด CO ลงอย่างอิสระเช่นกัน มีการเสนอแนะว่า CO ถูกจำกัดเนื่องจากต้นทุนระยะยาวของการรวมตัวของ CO นั่นคือ การทำลายชุดยีนที่เอื้ออำนวยของอัลลีลที่สร้างขึ้นโดยการคัดเลือกตามธรรมชาติ ในอดีต [ 55 ]

อาร์เอ็นเอ เฮลิเคส

เฮลิเคส RNA DEAD-box ของมนุษย์
เอ
ภาพนี้แสดงถึงลำดับโปรโมเตอร์และโดเมนเสริมต่างๆ ที่ช่วยในการคลายเกลียว RNA (การแยกสายเฉพาะที่) บริเวณสีแดงคือโดเมนที่จับกับ ATP และบริเวณสีเหลืองคือโดเมนที่ทำปฏิกิริยากับ RNA นอกจากนี้ยังมีลำดับเฉพาะที่เรียกว่าโปรตีน DEAD box ซึ่งช่วยเร่งปฏิกิริยาที่ ATP ไม่จำเป็นต้องถูกไฮโดรไลซ์โดยตรง ตราบใดที่มันจับกับโดเมนบนสาย RNA

RNA helicase มีความสำคัญต่อกระบวนการเผาผลาญ RNA ส่วนใหญ่ เช่น การสร้างไร โบโซมการตัดต่อ pre-mRNA และ การเริ่มต้น การแปลนอกจากนี้ยังมีบทบาทสำคัญในการตรวจจับ RNA ของไวรัส[ 56 ] RNA helicase มีส่วนเกี่ยวข้องในการตอบสนองภูมิคุ้มกันต้านไวรัส เนื่องจากสามารถระบุ RNA แปลกปลอมในสัตว์มีกระดูกสันหลังได้ ประมาณ 80% ของไวรัสทั้งหมดเป็นไวรัส RNA และมี RNA helicase ของตัวเอง[ 57 ] RNA helicase ที่บกพร่องมีความเชื่อมโยงกับโรคมะเร็ง โรคติดเชื้อ และความผิดปกติทางระบบประสาทเสื่อม [ 56 ]ความผิดปกติทางระบบประสาทบางอย่างที่เกี่ยวข้องกับ RNA helicase ที่บกพร่อง ได้แก่ โรคกล้ามเนื้ออ่อนแรง( amyotrophic lateral sclerosis) โรคกล้ามเนื้อฝ่อไขสันหลัง (spinal muscular atrophy ) โรคสมองน้อยเสื่อมชนิดที่ 2 (spinocerebellar ataxia type-2 ) โรคอัลไซเมอร์และกลุ่มอาการข้อหดเกร็งแต่กำเนิดที่ร้ายแรง[ 57 ]

เฮลิเคส RNA และเฮลิเคส DNA สามารถพบได้ร่วมกันในซูเปอร์แฟมิลีเฮลิเคสทั้งหมด ยกเว้น SF6 [ 58 ] [ 59 ]เฮลิเคส RNA ของยูคาริโอตทั้งหมดที่ได้รับการระบุจนถึงปัจจุบันเป็นเฮลิเคสที่ไม่สร้างวงแหวนและเป็นส่วนหนึ่งของ SF1 และ SF2 ในทางกลับกัน เฮลิเคส RNA ที่สร้างวงแหวนได้ถูกพบในแบคทีเรียและไวรัส[ 56 ]อย่างไรก็ตาม เฮลิเคส RNA ทั้งหมดไม่ได้แสดงกิจกรรมเฮลิเคสตามที่กำหนดโดยหน้าที่ของเอนไซม์ เช่น โปรตีนในตระกูล Swi/Snf แม้ว่าโปรตีนเหล่านี้จะมีโมทีฟเฮลิเคสทั่วไป ไฮโดรไลซ์ ATP ในลักษณะที่ขึ้นอยู่กับกรดนิวคลีอิก และสร้างขึ้นรอบแกนเฮลิเคส แต่โดยทั่วไปแล้วจะไม่พบกิจกรรมการคลายเกลียว[ 60 ]

เฮลิเคส RNA ที่แสดงกิจกรรมการคลายเกลียวได้รับการจำแนกลักษณะโดยกลไกอย่างน้อยสองแบบที่แตกต่างกัน ได้แก่ การคลายเกลียวคู่แบบแคนอนิกและการแยกสายเฉพาะที่ การคลายเกลียวคู่แบบแคนอนิกคือการแยกสายคู่ทีละขั้นตอนตามทิศทาง ดังที่อธิบายไว้ข้างต้นสำหรับการคลายเกลียว DNA อย่างไรก็ตาม การแยกสายเฉพาะที่เกิดขึ้นโดยกระบวนการที่เอนไซม์เฮลิเคสถูกโหลดที่ตำแหน่งใดก็ได้ตามแนวคู่ โดยปกติแล้วจะได้รับความช่วยเหลือจากบริเวณสายเดี่ยวของ RNA และการโหลดเอนไซม์จะมาพร้อมกับการจับกับ ATP [ 61 ]เมื่อเฮลิเคสและ ATP จับกันแล้ว การแยกสายเฉพาะที่เกิดขึ้น ซึ่งต้องอาศัยการจับกับ ATP แต่ไม่จำเป็นต้องเป็นกระบวนการไฮโดรไลซิสของ ATP จริงๆ[ 62 ]เมื่อมีเบสคู่น้อยลง คู่ก็จะแยกตัวออกโดยไม่ต้องอาศัยความช่วยเหลือเพิ่มเติมจากเอนไซม์ โหมดการคลายเกลียวนี้ถูกใช้โดย เฮลิ เคสกล่อง DEAD/DEAH [ 63 ]

ปัจจุบัน ฐานข้อมูล RNA helicase [ 64 ]มีให้บริการทางออนไลน์ซึ่งประกอบด้วยรายการ RNA helicase ที่ครอบคลุมพร้อมข้อมูลต่างๆ เช่น ลำดับ โครงสร้าง และหน้าที่ทางชีวเคมีและเซลล์[ 56 ]

เครื่องมือวินิจฉัยสำหรับการวัดเฮลิเคส

การวัดและติดตามกิจกรรมของเฮลิเคส

มีการใช้วิธีการต่างๆ เพื่อวัดกิจกรรมของเฮลิเคสในหลอดทดลองวิธีการเหล่านี้มีตั้งแต่การทดสอบเชิงคุณภาพ (การทดสอบที่มักให้ผลลัพธ์ที่ไม่เกี่ยวข้องกับค่าหรือการวัด) ไปจนถึงเชิงปริมาณ (การทดสอบที่มีผลลัพธ์เป็นตัวเลขที่สามารถนำไปใช้ในการวิเคราะห์ทางสถิติและเชิงตัวเลข) ในปี พ.ศ. 2525–2526 ได้มีการพัฒนาการทดสอบทางชีวเคมีโดยตรงครั้งแรกเพื่อวัดกิจกรรมของเฮลิเคส[ 15 ] [ 65 ]วิธีนี้เรียกว่า "การทดสอบการแทนที่สาย"

  • การทดสอบการแทนที่สายดีเอ็นเอเกี่ยวข้องกับการติดฉลากกัมมันตรังสีให้กับดีเอ็นเอสายคู่ หลังจากทำการบำบัดด้วยเฮลิเคสแล้ว ดีเอ็นเอสายเดี่ยวจะถูกตรวจพบว่าแยกออกจากดีเอ็นเอสายคู่ด้วยการแยกด้วย เจลอิเล็ก โทรโฟเรซิส แบบไม่ ทำให้เสียสภาพ หลังจากตรวจพบดีเอ็นเอสายเดี่ยวแล้ว ปริมาณของสารกัมมันตรังสีที่ติดอยู่บนดีเอ็นเอสายเดี่ยวจะถูกวัดปริมาณเพื่อให้ได้ค่าตัวเลขของปริมาณการคลายตัวของดีเอ็นเอสายคู่
    การทดสอบการแทนที่สายดีเอ็นเอเป็นที่ยอมรับสำหรับการวิเคราะห์เชิงคุณภาพ แต่เนื่องจากไม่สามารถแสดงผลลัพธ์ได้มากกว่าหนึ่งช่วงเวลา ใช้เวลานาน และต้องพึ่งพาสารกัมมันตรังสีในการติดฉลาก จึงมีความจำเป็นต้องพัฒนาวิธีการวินิจฉัยที่สามารถตรวจสอบกิจกรรมของเฮลิเคสแบบเรียลไทม์ได้

ต่อมาได้มีการพัฒนาวิธีการอื่นๆ ที่รวมเอาบางส่วนหรือทั้งหมดของสิ่งต่อไปนี้: กลไกที่มีปริมาณงานสูง การใช้การติดฉลากนิวคลีโอไทด์ที่ไม่ใช่กัมมันตรังสี เวลาปฏิกิริยาที่เร็วขึ้น/การใช้เวลาน้อยลง การตรวจสอบกิจกรรมของเฮลิเคสแบบเรียลไทม์ (โดยใช้การวัดจลนศาสตร์แทนการวิเคราะห์จุดสิ้นสุด/จุดเดียว) วิธีการเหล่านี้รวมถึง: "วิธีการดับการไหลอย่างรวดเร็ว การทดสอบแบบใช้ฟลูออเรสเซนซ์ การทดสอบการกรอง การทดสอบความใกล้เคียงของการเรืองแสงการทดสอบการถ่ายโอนพลังงานเรโซแนนซ์ฟลูออเรสเซน ซ์ แบบเวลาที่กำหนดการทดสอบที่ใช้เทคโนโลยีแฟลชเพลท การทดสอบการดับฟลูออเรสเซนซ์แบบเวลาที่กำหนดที่เป็นเนื้อเดียวกัน และการทดสอบเฮลิเคสแบบอิเล็กโทรเคมีลูมิเนสเซนซ์" [ 16 ]ด้วยการใช้สมการทางคณิตศาสตร์เฉพาะทาง การทดสอบเหล่านี้บางส่วนสามารถนำมาใช้เพื่อกำหนดจำนวนนิวคลีโอไทด์ที่จับคู่เบสที่เฮลิเคสสามารถทำลายได้ต่อการไฮโดรไลซิสของโมเลกุล ATP 1 โมเลกุล[ 66 ]

ชุดตรวจวินิจฉัยที่วางจำหน่ายในเชิงพาณิชย์ก็มีเช่นกัน ชุดตรวจวินิจฉัย "Trupoint" จากบริษัท PerkinElmer , Inc. เป็นชุดตรวจที่ใช้การวัดการดับแสงฟลูออเรสเซนต์แบบเวลาจำเพาะ โดยใช้เทคโนโลยี "SignalClimb" ของ PerkinElmer ซึ่งอาศัยฉลากสองชนิดที่จับกันในระยะใกล้แต่คนละสายดีเอ็นเอ ฉลากชนิดหนึ่งคือสารคีเลตแลนทานัมเรืองแสง ซึ่งทำหน้าที่เป็นฉลากที่ถูกตรวจสอบโดยเครื่องอ่านเพลท 96/384 หลุมที่เหมาะสม ส่วนอีกฉลากหนึ่งคือโมเลกุลตัวดับแสงอินทรีย์ หลักการของชุดตรวจนี้คือการ "ดับแสง" หรือยับยั้งสัญญาณของสารคีเลตแลนทานัมโดยโมเลกุลตัวดับแสงอินทรีย์เมื่อทั้งสองอยู่ใกล้กัน – เช่นเดียวกับเมื่อดีเอ็นเอแบบคู่สายอยู่ในสภาวะปกติ เมื่อเกิดกิจกรรมของเฮลิเคสบนดีเอ็นเอแบบคู่สาย ฉลากตัวดับแสงและฉลากแลนทานัมจะแยกออกจากกันเมื่อดีเอ็นเอคลายตัว การสูญเสียความใกล้ชิดนี้ทำให้ความสามารถของตัวดับแสงในการยับยั้งสัญญาณแลนทานิดลดลง ส่งผลให้ฟลูออเรสเซนส์เพิ่มขึ้นที่สามารถตรวจจับได้ ซึ่งเป็นตัวแทนของปริมาณ DNA ที่คลายตัว และสามารถใช้เป็นการวัดเชิงปริมาณของกิจกรรมเฮลิเคสได้ การดำเนินการและการใช้เทคนิคการถ่ายภาพฟลูออเรสเซนส์ระดับโมเลกุลเดี่ยว โดยเน้นที่วิธีการที่รวมถึงการดักจับด้วยแสงร่วมกับการถ่ายภาพแบบเอพิฟลูออเรสเซนส์ และการตรึงบนพื้นผิวร่วมกับการแสดงภาพฟลูออเรสเซนส์แบบสะท้อนภายในทั้งหมด เมื่อรวมกับเซลล์ไหลแบบไมโครแชนเนลและการควบคุมไมโครฟลูอิดิก ทำให้สามารถถ่ายภาพและติดตามโมเลกุลโปรตีนและ DNA ที่ติดฉลากฟลูออเรสเซนส์แต่ละตัวได้ ทำให้สามารถวัดการคลายตัวและการเคลื่อนย้ายของ DNA ที่ความละเอียดระดับโมเลกุลเดี่ยวได้[ 67 ]

การกำหนดขั้วของเฮลิเคส

ขั้วของเฮลิเคส ซึ่งถือได้ว่าเป็น "ทิศทาง" นั้น ถูกกำหนดให้เป็นทิศทาง (ระบุเป็น 5'→3' หรือ 3'→5') ของการเคลื่อนที่ของเฮลิเคสบนสายเดี่ยว DNA/RNA ที่มันเคลื่อนที่ไป การกำหนดขั้วนี้มีความสำคัญ เช่น ในการกำหนดว่าเฮลิเคสที่ทดสอบนั้นยึดติดกับสายนำของ DNA หรือสายตามของ DNA หรือไม่ ในการกำหนดลักษณะเฉพาะของเฮลิเคสนี้ จะใช้ DNA ที่เป็นเกลียวคู่บางส่วนเป็นสารตั้งต้น ซึ่งมีบริเวณ DNA สายเดี่ยวตรงกลางที่มีบริเวณ DNA เกลียวคู่ที่มีความยาวต่างกัน (บริเวณสั้นๆ หนึ่งบริเวณที่วิ่งจาก 5'→3' และบริเวณที่ยาวกว่าหนึ่งบริเวณที่วิ่งจาก 3'→5') อยู่ทั้งสองด้านของบริเวณนี้[ 68 ]เมื่อเฮลิเคสถูกเพิ่มเข้าไปในบริเวณสายเดี่ยวตรงกลางนั้น ขั้วจะถูกกำหนดโดยการกำหนดลักษณะเฉพาะบน DNA สายเดี่ยวที่เกิดขึ้นใหม่

ดูเพิ่มเติม

  • DNA+Helicases ที่ หัวข้อทางการ แพทย์ (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
  • RNA+Helicases ในฐานข้อมูล Medical Subject Headings (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Helicase&oldid=1340085986 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เฮลิเคส

เฮลิเคส เป็น เอนไซม์ ประเภทหนึ่งที่มีความสำคัญต่อ สิ่งมีชีวิต ทุกชนิด หน้าที่หลักของพวกมันคือการแยก สารพันธุกรรม ของสิ่งมีชีวิต เฮลิเคสเป็น โปรตีนมอเตอร์ ที่เคลื่อนที่ ไปในทิศทาง...

การทำงาน

เฮลิเคส มักถูกใช้เพื่อแยกสายของ ดีเอ็นเอ เกลียวคู่ หรือโมเลกุลอา ร์เอ็นเอ ที่เชื่อมต่อกันเองโดยใช้พลังงานจาก การไฮโดรไลซิส ของ ATP ซึ่งเป็นกระบวนการที่มีลักษณะเฉพาะคือการแตกของ พันธะไฮโดรเจน ระหว่าง เบสนิวคลีโอไทด์ที่เชื่อมต่อกัน...

อุปสรรคในการกระตุ้นการทำงานของเฮลิเคส

การทำงานของเอนไซม์เฮลิเคส เช่น การคลายเกลียวกรดนิวคลีอิก เกิดขึ้นจากการลดอุปสรรคการกระตุ้น ( ) ของการทำงานเฉพาะแต่ละอย่าง [ 7 ] [ 5 ] [ 8 ] [ 9 ] อุปสรรคการกระตุ้นเป็นผลมาจากปัจจัยต่างๆ และสามารถกำหนดได้โดย บี {\displaystyle B}

เฮลิเคสแบบแอคทีฟและพาสซีฟ

ขนาดของอุปสรรคการกระตุ้นที่เฮลิเคสต้องเอาชนะนั้นมีส่วนในการกำหนดประเภทของเฮลิเคสว่าเป็นเฮลิเคสแบบแอคทีฟหรือแบบพาสซีฟ ในเฮลิเคสแบบพาสซีฟ จะมีอุปสรรคการกระตุ้นที่สำคัญอยู่ (กำหนดโดย โดยที่คือ ค่าคงที่ของโบลต์ซมันน์ และคืออุณหภูมิของระบบ)...