ไวโรฟาไวริเซทส์
ไวโรเฟจสปุตนิก
การจำแนกประเภทไวรัส
(ไม่จัดอันดับ):	ไวรัส
อาณาจักร:	วาริดนาเวียเรีย
อาณาจักร:	แบมฟอร์ดไวเร
ไฟลัม:	พรีพลาสมิวิริโคตา
ไฟลัมย่อย:	โพลิซูวิริโคตินา
ระดับ:	ไวโรฟาไวริเซทส์
กลุ่มย่อย
ดูข้อความ

ไวโรเฟจเป็นไวรัสดีเอ็นเอสายคู่ขนาดเล็กที่ต้องอาศัยการติดเชื้อร่วมกับไวรัสอื่น โดยทั่วไปไวรัสที่ติดเชื้อร่วมมักเป็นไวรัสขนาดใหญ่ไวโรเฟจอาศัยโรงงานจำลองไวรัสของไวรัสขนาดใหญ่ที่ติดเชื้อร่วมเพื่อการจำลองตัวเอง ลักษณะอย่างหนึ่งของไวโรเฟจคือพวกมันมี ความสัมพันธ์ แบบปรสิตกับไวรัสที่ติดเชื้อร่วม การพึ่งพาไวรัสขนาดใหญ่ในการจำลองบางครั้งส่งผลให้ความรุนแรงของไวรัสขนาดใหญ่ลดลง จีโนมของไวโรเฟจจำนวนมากถูกฝังอยู่ ในจีโนมของ ยูคาริโอตเซลล์เดียวและพวกมันจะกลับมาทำงานอีกครั้งเมื่อติดเชื้อไวรัสขนาดใหญ่ จึงทำให้เกิดการป้องกันไวรัสแบบเหนี่ยวนำได้^{[ 2 ]} ไวโรเฟจอาจช่วยปรับปรุงการฟื้นตัวและการ อยู่รอดของสิ่งมีชีวิตที่เป็นโฮสต์ ไวโรเฟจที่รู้จักส่วนใหญ่จัดอยู่ในชั้นVirophaviricetesและเกี่ยวข้องกับไวรัสขนาดใหญ่ในวงศ์Mimiviridaeไวโรฟาจมีความเกี่ยวข้องกับไวรัสโฮสต์อื่นๆ หลายชนิด รวมถึงไวรัสฝีดาษ แมลง ด้วย^{[ 3 ]}

ไวโรเฟจตัวแรกถูกค้นพบในหอระบายความร้อนในปารีสในปี 2551 โดยถูกค้นพบพร้อมกับไวรัสยักษ์ที่ติดเชื้อร่วมกัน คือAcanthamoeba castellanii mamavirus (ACMV) ไวโรเฟจนี้ได้รับการตั้งชื่อว่า สปุต นิก (Sputnik)และการจำลองตัวเองของมันขึ้นอยู่กับการติดเชื้อร่วมกันของ ACMV และกลไกการจำลองตัวเองในไซโตพลาสซึมของ ACMV อย่างสมบูรณ์ สปุตนิกยังถูกค้นพบว่ามีผลยับยั้ง ACMV และช่วยเพิ่มอัตราการรอดชีวิตของโฮสต์ ไวโรเฟจอื่นๆ ที่ได้รับการระบุลักษณะ ได้แก่ สปุตนิก 2, สปุตนิก 3, ซามิลอน (Zamilon)และมาไวรัส (Mavirus ) ^{[ 4 ] [ 2 ] [ 5 ] [ 6 ]}

ไวโรเฟจส่วนใหญ่เหล่านี้ถูกค้นพบโดยการวิเคราะห์ ชุดข้อมูล เมตาจีโนมิก ในการวิเคราะห์เมตาจีโนมิก ลำดับดีเอ็นเอจะถูกประมวลผลผ่านอัลกอริทึมทางชีวสารสนเทศ หลายตัว ซึ่งจะดึงรูปแบบและลักษณะสำคัญบางอย่างออกมา ในชุดข้อมูลเหล่านี้มีไวรัสขนาดใหญ่และไวโรเฟจ พวกมันถูกแยกออกจากกันโดยการมองหาลำดับที่มีความยาวประมาณ 17 ถึง 20 กิโลเบสซึ่งมีความคล้ายคลึงกับไวโรเฟจที่ได้รับการจัดลำดับแล้ว ไวโรเฟจเหล่านี้อาจมีจีโนมดีเอ็นเอแบบเส้นตรงหรือแบบวงกลมสองสาย^{[ 7 ]}ไวโรเฟจที่รู้จักในวัฒนธรรมมี อนุภาค แคปซิด ทรงสิบสองหน้าที่ มีขนาดความยาวประมาณ 40 ถึง 80 นาโนเมตร^{[ 8 ]}และอนุภาคไวโรเฟจมีขนาดเล็กมากจน ต้องใช้ กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนในการมองเห็น การวิเคราะห์ตามลำดับจีโนมเมตาจีโนมิกส์ถูกนำมาใช้เพื่อทำนายจีโนมไวโรเฟจที่สมบูรณ์และไม่สมบูรณ์ประมาณ 57 จีโนม^{[ 9 ]}และในเดือนธันวาคม 2019 ได้ระบุจีโนมคุณภาพสูง (สมบูรณ์หรือเกือบสมบูรณ์) จำนวน 328 จีโนมจากแหล่งที่อยู่อาศัยที่หลากหลาย รวมถึงลำไส้ของมนุษย์ไรโซสเฟียร์ของพืชและใต้พื้นดิน จากกลุ่มอนุกรมวิธานที่แตกต่างกัน 27 กลุ่ม^{[ 10 ]} 

ไวโรเฟจจำเป็นต้องมีไวรัสร่วมติดเชื้อเพื่อที่จะจำลองตัวเองได้ ไวโรเฟจไม่มีเอนไซม์ที่จำเป็นในการจำลองตัวเอง ไวโรเฟจใช้กลไกการจำลองของไวรัสขนาดใหญ่เพื่อจำลองจีโนมของตัวเองและดำรงอยู่ต่อไป ช่วงโฮสต์ของไวโรเฟจรวมถึงไวรัสขนาดใหญ่ที่มีจีโนม DNA สองสาย ไวโรเฟจใช้กลไกการถอดรหัสของไวรัสขนาดใหญ่เหล่านี้ในการจำลองตัวเองแทนที่จะใช้กลไกการถอดรหัสของโฮสต์ ตัวอย่างเช่น การค้นพบไวโรเฟจที่เกี่ยวข้องกับไวรัสแซมบ้าทำให้ความเข้มข้นของไวรัสในโฮสต์ลดลงในขณะที่ไวโรเฟจกำลังจำลองตัวเองโดยใช้ไวรัสขนาดใหญ่ อะมีบาที่เป็นโฮสต์ยังแสดงให้เห็นถึงการฟื้นตัวบางส่วนจากการติดเชื้อไวรัสแซมบ้า^{[ 7 ]}

ไวโรเฟจมี จีโนม DNA สองสายขนาดเล็กที่มีรูปร่างเป็นวงกลมหรือเป็นเส้นตรง ขนาดของจีโนมเหล่านี้อาจแตกต่างกันไปขึ้นอยู่กับไวรัสยักษ์ที่มันติดเชื้อ ไวโรเฟจส่วนใหญ่มีจีโนมขนาดประมาณ 17–30  กิโลเบสแพร์ (kbp) ^{[ 8 ] [ 9 ]}จีโนมของพวกมันได้รับการปกป้องโดยแคปซิด  ทรงยี่สิบหน้าซึ่งมี ความยาวประมาณ 40–80 นาโนเมตร ^{[ 8 ]}ในทางตรงกันข้าม ไวรัสยักษ์ที่ติดเชื้อร่วมกันอาจมีจีโนมขนาดใหญ่ถึง 1–2 เมกะเบสแพร์ ( Mbp ) ^{[ 7 ]}จีโนมที่ใหญ่ที่สุดบางส่วนของไวโรเฟจมีขนาดใกล้เคียงกับขนาดจีโนมของ อะดี โนไวรัส^{[ 8 ]} 

ไวโรเฟจทั้งหมดที่รู้จักในปัจจุบันมีสี่จีนหลัก ได้แก่ โปรตีนแคปซิดหลักและรองเฉพาะไวโรเฟจ(MCP และ mCP) PRO ( ซิสเทอีนโปรตีเอส ) และATPase สำหรับบรรจุ DNA แคปซิดทั้งสองชนิดพบได้เกือบทั่วไปในบล็อกที่อนุรักษ์ไว้^{[ 10 ]} MCP มี โดเมน พับแบบม้วนเจลลี่ แนวตั้งสอง โดเมนซึ่งเป็นลักษณะเฉพาะของBamfordviraeในขณะที่ mCP (เพนตัน) มีโดเมนพับแบบม้วนเจลลี่ปกติ^{[ 11 ]}

ไวโรเฟจประกอบเป็นชั้นไวโรฟาไวริเซเตสชื่อของชั้นนี้ประกอบด้วยViropha-ซึ่งมาจาก "ไวโรเฟจ" และ-viricetesซึ่งเป็นคำต่อท้ายที่ใช้สำหรับชั้นไวรัส ชั้นนี้เรียกว่าMaveriviricetesตั้งแต่ปี 2019 ถึง 2024 และเปลี่ยนชื่อในปี 2025 ^{[ 12 ]}ไวโรฟาไวริเซเตสมีสี่อันดับ ซึ่งสามอันดับเป็นแบบโมโนไทป์ลงไปจนถึงกลุ่มอนุกรมวิธานที่ต่ำกว่า อนุกรมวิธานนี้แสดงไว้ต่อไปนี้^{[ 13 ] [ 14 ]}

• กลุ่ม: ไวโรฟาไวริเซทส์
  • ลำดับ: Divpevirales
    • วงศ์: รูวิโรวิริเด (Ruviroviridae)
      • สกุล: โอวิรูไวรัส
  • ลำดับ: Lavidavirales
    • วงศ์: Maviroviridae
      • สกุล: มาไวรัส
  • ลำดับ: Mividavirales
    • วงศ์: สปุตนิวิโรวิริเด
      • สกุล: สปุตนิกไวรัส
  • Order: Priklausovirales

นอกจากนี้ จีโนมไวโรเฟจที่ระบุจากเมตาจีโนมยังถูกจัดกลุ่มร่วมกับไวโรเฟจที่แยกได้เป็น 27 กลุ่มที่แตกต่างกัน โดยมีความยาวจีโนม เนื้อหายีน และการกระจายถิ่นที่อยู่ที่สอดคล้องกัน^{[ 10 ]}นอกจากนี้ยังมีการรายงานลำดับไวโรเฟจที่แตกหักบางส่วนในเมตาจีโนมLoki's Castle อีกด้วย ^{[ 15 ]}

• ไวโรฟาจทะเลสาบอินทรีย์