YPEL3
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	YPEL3 , ยิปปี้ ไลค์ 3
รหัสภายนอก	โอมิม : 609724 ; เอ็มจีไอ : 1913340 ; โฮโมโลยีน : 116010 ; GeneCards : YPEL3 ; OMA : YPEL3 - ออโธโลจี
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ ) คริส. โครโมโซม 16 (มนุษย์) [ 1 ] วงดนตรี 16 หน้า 11.2 เริ่ม 30,092,314 bp [ 1 ] จบ 30,096,915 bp [ 1 ]
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ ) คริส. โครโมโซม 7 (เมาส์) [ 2 ] วงดนตรี 7|7 F3 เริ่ม 126,776,955 bp [ 2 ] จบ 126,780,514 bp [ 2 ]
รูปแบบการแสดงออกของ RNA บีจี มนุษย์ เมาส์ (ออร์โธล็อก) สูงสุดที่แสดงใน ซีกขวาของสมองน้อย พื้นที่บรอดแมน 9 กลีบหน้าผากด้านขวา เลือด เม็ดเลือดขาวชนิดแกรนูโลไซต์ เปลือกสมองส่วนหน้า ไจรัสซิงกูเลต คอร์เทกซ์ซิงกูเลตส่วนหน้า อะมิกดาล่า ปอดข้างขวา สูงสุดที่แสดงใน เม็ดเลือดขาวชนิดแกรนูโลไซต์ เปลือกสมองส่วนรับภาพหลัก ร่องหน้าผากส่วนบน คอร์เทกซ์เพอริไรนัล เอนโทไรนัลคอร์เทกซ์ เซลล์แกรนูลของเดนเตตไจรัสในฮิปโปแคมปัส ฟิลด์ CA3 เลือด ริมฝีปาก กล้ามเนื้อต้นขา ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม ไบโอ GPS ไม่มีข้อมูล
ออนโทโลยีของยีน หน้าที่ระดับโมเลกุล การจับไอออนโลหะ ส่วนประกอบของเซลล์ นิวเคลียส นิวคลีโอลัส กระบวนการทางชีวภาพ การควบคุมเชิงบวกของการชราภาพของเซลล์ แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก สายพันธุ์ มนุษย์ หนู เอนเทรซ 83719 66090 วงดนตรี ENSG00000090238 ENSMUSG00000042675 ยูนิโปรท พี61236 พี61237 RefSeq (mRNA) NM_001145524 NM_031477 NM_025347 NM_026875 RefSeq (โปรตีน) NP_001138996 NP_113665 NP_079623 NP_081151 NP_001366222 NP_001366223 NP_001366224 NP_001366225 NP_001366226 สถานที่ตั้ง (UCSC) Chr 16: 30.09 – 30.1 Mb Chr 7: 126.78 – 126.78 Mb การค้นหาใน PubMed [ 3 ] [ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ ดู/แก้ไขเมาส์

Yippee-like 3 (Drosophila) is a protein that in humans is encoded by the YPEL3 gene.^[5][6] YPEL3 has growth inhibitory effects in normal and tumor cell lines.^[7] One of five family members (YPEL1-5), YPEL3 was named in reference to its Drosophila melanogasterorthologue.^[6] Initially discovered in a gene expression profiling assay of p53 activated MCF7 cells,^[8] induction of YPEL3 has been shown to trigger permanent growth arrest or cellular senescence in certain human normal and tumor cell types.^[7]DNA methylation of a CpG island near the YPEL3 promoter as well as histone acetylation may represent possible epigenetic mechanisms leading to decreased gene expression in human tumors.^[7]

Human YPEL3 is located on the short arm of chromosome 16 (p1611.2) and covers 4.62kb from 30015754 to 30011130 on the reverse strand.^[6][9] The Drosophila Yippee protein was identified as a putative zinc finger motif containing protein exhibiting a high degree of conservation among the cysteines and histidines.^[10] Zinc fingers function as structural platforms for DNA binding.

YPEL3 was first identified as murine SUAP, named for small unstable apoptotic protein because of its apparent role in cellular growth inhibition via apoptosis when studied in myeloid precursor cell lines .^[11] SUAP later attained its current designation as YPEL3 (Yippee like three), after it was discovered to be one of five human genes possessing homology with the Drosophila Yippee protein.^[6]

โปรตีน Yippee ของ Drosophila ถูกค้นพบครั้งแรกในการคัดกรองปฏิสัมพันธ์ของยีสต์ โดยพบว่ามีปฏิสัมพันธ์ทางกายภาพกับHemolin ของ Hyalophora cecropia หลังจากการทดลองโคลนนิ่งและลำดับดีเอ็นเอในภายหลัง พบว่า Yippee เป็นยีนตระกูลโปรตีนที่มีการอนุรักษ์ไว้ใน สิ่งมีชีวิต ยูคาริโอต หลากหลายชนิด ตั้งแต่เชื้อราไปจนถึงมนุษย์^{[ 10 ]}เมื่อวิเคราะห์ใน ระดับ กรดอะมิโนพบว่า Yippee ของ Drosophila melanogaster และ YPEL1 มีความคล้ายคลึงกันในระดับสูง (76%) ในระหว่างการวิเคราะห์ลำดับของโครโมโซม 22 ของมนุษย์ในภายหลัง นักวิจัยได้ระบุยีนตระกูลYPEL1-YPEL5ซึ่งมีความคล้ายคลึงกันสูงกับยีนYippee ของ Drosophila ^{[ 6 ]}

บทบาทของ YPEL3 ในฐานะสารยับยั้งเนื้องอกชนิดใหม่และการมีส่วนร่วมในการเพิ่มจำนวนเซลล์ถูกค้นพบในระหว่างการทดลองเพื่อตรวจสอบการหยุดวงจรเซลล์ที่ขึ้นอยู่กับp53 ในขณะที่ตรวจสอบ โปรตีนยับยั้งเนื้องอก p53 การศึกษา ไมโครอาร์เรย์ที่กำหนดเป้าหมาย Hdmx และHdm2 ซึ่งเป็น ตัวควบคุมเชิงลบของ p53 ทั้งคู่ เผยให้เห็นว่า YPEL3 เป็นยีนที่อาจถูกควบคุมโดย p53 ในเซลล์มะเร็งเต้านมMCF7 ^{[ 8 ]}การตรวจสอบหน้าที่ของมันนำไปสู่การค้นพบว่า YPEL3 เป็นโปรตีนชนิดใหม่ที่มีกิจกรรมยับยั้งการเจริญเติบโตซึ่งเชื่อว่าเกิดจากการทำงานของวิถีการชราภาพของเซลล์^{[ 7 ]}

p53เป็นโปรตีนยับยั้งเนื้องอกที่เข้ารหัสโดยยีนTP53 ของมนุษย์ ซึ่งมีหน้าที่ป้องกันการเจริญเติบโตของเซลล์ที่ไม่ได้รับการควบคุม p53 สามารถถูกกระตุ้นได้เพื่อตอบสนองต่อความเครียดของเซลล์ที่หลากหลาย ทั้งที่ก่อให้เกิดมะเร็งและไม่ก่อให้เกิดมะเร็ง p53 ที่ถูกกระตุ้นซึ่งเป็นจุดตรวจสอบที่สำคัญในเส้นทางที่ซับซ้อน ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าสามารถจับกับDNAและควบคุมการถอดรหัสของยีนที่สามารถเป็นตัวกลางในกระบวนการเจริญเติบโตของเซลล์ที่หลากหลาย รวมถึงการซ่อมแซม DNAการหยุดการเจริญเติบโต การชราภาพของเซลล์และอะพอพโทซิส [ ^{12 ] ความ}สำคัญของ p53 ที่ทำงานได้อย่างสมบูรณ์ในการควบคุมวงจรของเซลล์นั้นเห็นได้ชัดเจนจากข้อเท็จจริงที่ว่ามะเร็งของมนุษย์ 55% แสดงให้เห็นถึงการกลายพันธุ์ของ p53 ^{[ 13 ]}

YPEL3 ถูกค้นพบว่าเป็นเป้าหมายที่เป็นไปได้ของ p53 หลังจากทำการคัดกรองยีนดังกล่าวในเซลล์มะเร็งเต้านมMCF7 หลังจากการลดระดับ RNAiของสารยับยั้ง p53 เชิงลบ^{[ 8 ]} ในทั้งเซลล์ปกติและเซลล์มะเร็งของมนุษย์ YPEL3 ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าเป็นยีนที่ถูกเหนี่ยวนำโดย p53 มีการระบุตำแหน่งการจับของ p53 ที่คาดการณ์ไว้ 2 ตำแหน่ง ตำแหน่งหนึ่งอยู่ห่างจากโปรโมเตอร์ YPEL3 ไปทาง 5' 1.3 กิโลเบส และอีกตำแหน่งหนึ่งอยู่เหนือโปรโมเตอร์ YPEL3 ^{[ 6 ]}

เนื่องจากเป็นส่วนหนึ่งของการตอบสนองของเส้นทาง p53 และบทบาทต่อต้านการแพร่กระจาย เซลล์ชราภาพจึงได้รับความสนใจเนื่องจากความสัมพันธ์ในการทำงานกับยีนยับยั้งเนื้องอก^{[ 14 ]}เซลล์ชราภาพมีลักษณะเฉพาะคือความสามารถในการแบ่งตัวที่จำกัดของเซลล์ปกติที่เพาะเลี้ยง และพบว่าถูกกระตุ้นโดยการกระตุ้นของยีนก่อมะเร็ง (เซลล์ชราภาพก่อนวัยอันควร) รวมถึงการหดตัวของเทโลเมียร์อันเป็นผลมาจากการจำลองดีเอ็นเอหลายรอบ (เซลล์ชราภาพจากการจำลอง) ^{[ 15 ]}ลักษณะเด่นที่ได้รับการยอมรับของเซลล์ชราภาพ ได้แก่ การย้อมสีเบต้ากาแลคโตซิเดสที่เกี่ยวข้องกับเซลล์ชราภาพ (SA) และการปรากฏของจุดเฮเทอโรโครมาตินที่เกี่ยวข้องกับเซลล์ชราภาพ (SAHF) ภายในนิวเคลียสของเซลล์ชราภาพ^{[ 16 ] [ 17 ]}

แม้ว่าการศึกษาในเซลล์ต้นกำเนิดไมอีลอยด์ของหนูจะบ่งชี้ว่า YPEL3 มีบทบาทในการเกิดอะพอพโทซิส แต่ YPEL3 ของมนุษย์กลับไม่แสดงการตอบสนองต่ออะพอพโทซิสโดยใช้ sub-G1 หรือการแตกตัวของโพลี ADP ไรโบสพอลิเมอเรสเป็นตัวบ่งชี้ที่ยอมรับได้ของการตายของเซลล์ตามโปรแกรม^{[ 11 ]} พบว่า YPEL3 กระตุ้นให้เกิดภาวะชราภาพก่อนวัยอันควรเมื่อศึกษาในไฟโบรบลาสต์ ของมนุษย์ IMR90 การศึกษาในเซลล์มะเร็งกระดูก U2OS และ เซลล์มะเร็งเต้านม MCF7ยังแสดงให้เห็นถึงการเพิ่มขึ้นของภาวะชราภาพของเซลล์เมื่อมีการเหนี่ยวนำ YPEL3 ^{[ 7 ]} นอกจากนี้ ยังมีหลักฐานเพิ่มเติมที่อาจบ่งชี้ถึงหน้าที่ของมัน โดยพบว่าการแสดงออกของ YPEL3 ลดลงในเซลล์มะเร็งรังไข่ ปอด และลำไส้ใหญ่^{[ 7 ] [ 18 ]}

เอพิเจเนติกส์คือการศึกษาการเปลี่ยนแปลงในกิจกรรมของยีนที่ไม่เกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงรหัสพันธุกรรมหรือดีเอ็นเอแต่เหนือจีโนม ขึ้น ไปจะมีเครื่องหมายเอพิเจเนติกส์ต่างๆ ซึ่งทำหน้าที่ให้คำแนะนำในการกระตุ้นหรือยับยั้งการทำงานของยีนในระดับต่างๆ การปิดหรือกระตุ้นการทำงานของยีนนี้ได้รับการยอมรับว่ามีบทบาทสำคัญในการสร้างความแตกต่างของเซลล์ที่เกิดขึ้นใหม่และในภาวะโรคต่างๆ ของมนุษย์ รวมถึงมะเร็งแตกต่างจากการกลายพันธุ์ ทางพันธุกรรม การเปลี่ยนแปลงทางเอพิเจเนติกส์ถือว่าสามารถย้อนกลับได้ แม้ว่าจะยังต้องการการศึกษาเพิ่มเติมก็ตาม

วิธีการปรับเปลี่ยนเอพิเจเนติกส์ทั่วไปสองวิธี ได้แก่การเมทิลเลชันของ DNAและการดัดแปลงฮิสโตน โดยเฉพาะอย่างยิ่ง การเมทิลเลชันมากเกินไปของเกาะ CpG (ช่วง DNA ที่อุดมไปด้วยกัวนีนและไซโตซีน) ใกล้กับโปรโมเตอร์ของยีนยับยั้งเนื้องอกได้รับการบันทึกไว้ในเซลล์มะเร็งบางชนิด ในกรณีของยีนยับยั้งเนื้องอกVHL (ที่เกี่ยวข้องกับโรค von Hippel–Lindau), p16 , hMLH1 และBRCA1 (ยีนที่เกี่ยวข้องกับความเสี่ยงต่อมะเร็งเต้านม) การเมทิลเลชันมากเกินไปของเกาะ CpG ได้รับการแสดงให้เห็นว่าเป็นวิธีการปิดใช้งานยีน^{[ 19 ]}

ทั้งการอะเซทิเลชันของฮิสโตนและการเมทิลเลชันของดีเอ็นเอได้รับการศึกษาในฐานะวิธีการทางเอพิเจเนติกส์ที่เป็นไปได้ในการควบคุมการแสดงออกของ YPEL3 เมื่อศึกษาในเซลล์มะเร็งรังไข่ Cp70 พบว่า การเมทิลเลชันมากเกินไปของ เกาะ CpG ที่อยู่เหนือโปรโมเตอร์ของ YPEL3 ทันที ส่งผลให้การแสดงออกของ YPEL3 ลดลง ^{[ 7 ]}การเมทิลเลชันมากเกินไปที่พบในโปรโมเตอร์ของยีนยับยั้งเนื้องอกนั้นมีความเฉพาะเจาะจงกับชนิดของมะเร็ง ทำให้สามารถระบุชนิดของเนื้องอกแต่ละชนิดได้ด้วยรูปแบบเฉพาะตัว^{[ 20 ]} การค้นพบดังกล่าวทำให้นักวิจัยหันมาศึกษาเครื่องหมายทางเอพิเจเนติกส์ในฐานะเครื่องมือวินิจฉัยที่มีศักยภาพ ปัจจัยพยากรณ์โรค และตัวบ่งชี้การตอบสนองต่อการรักษามะเร็งในมนุษย์ แม้ว่าจะต้องมีการศึกษาเพิ่มเติมต่อไป^{[ 19 ]}