ตามจดหมายอามาร์นายาฟาเป็นเมืองขึ้นของเมกิดโด ในศตวรรษที่ 14 ก่อนคริสตกาล ^{[ 4 ]}

ได้รับการระบุว่าเป็นเมืองยาเฟียโบราณ^{[ 5 ]}ซึ่งกล่าวถึงในหนังสือโยชูวาว่าเป็นเมืองชายแดนที่เป็นของเซบูลุน^{[ 6 ]}

โจเซฟัสนักประวัติศาสตร์ชาวยิวในศตวรรษที่ 1 กล่าวถึงเมืองยาฟา (ยาฟา) ในชีวประวัติของฟลาวิอุส โจเซฟัส (§ 37 และ 45) และสงครามยิว (เล่ม 3 บทที่ 7 ข้อ 31) เขาบรรยายว่ายาฟาเป็นหมู่บ้านที่ใหญ่ที่สุดในกาลิลี^{[ 7 ]}ซึ่งเขาอาศัยอยู่ระยะหนึ่งและสร้างป้อมปราการขึ้นในปี ค.ศ. 66 โจเซฟัสยังให้รายละเอียดเกี่ยวกับการยึดครองหมู่บ้านในช่วงสงครามยิว-โรมันครั้งแรกโดยกองทัพโรมันภายใต้การนำของ ม. อุลปิอุส ทราเอียนัส และไททัสในฤดูใบไม้ผลิของปี ค.ศ. 67 ^{[ 8 ] [ 9 ]}

มีการค้นพบห้องที่แกะสลักจากหินสูงสามชั้นในหมู่บ้าน ซึ่งน่าจะเป็นยุ้งฉางเก่า^{[ 10 ]}วิกเตอร์ เกอรินบันทึกไว้ว่า เมื่อมีการขุดค้นห้องหนึ่งในปี 1869 ก็พบแจกันที่บรรจุเหรียญของจักรพรรดิโรมัน ประมาณสองร้อยเหรียญ ตามการสังเกตของเขา มีระบบใต้ดินสองระบบ ระบบหนึ่งได้อธิบายไว้ข้างต้นแล้ว และทั้งสองระบบได้รับความเสียหายอย่างมากนับตั้งแต่เขาไปเยี่ยมชมครั้งแรกในปี 1870 เขาไม่พบสิ่งใดของเมืองโบราณเลย นอกจากเศษเสา ห้าหรือหกชิ้น หินที่แตกหัก และบ่อน้ำ ประมาณสามสิบ แห่ง เมืองนี้เคยประกอบด้วยเนินเขาสามลูกที่อยู่ติดกัน^{[ 11 ]} มี การขุดค้นเหมืองหินซึ่งมีอายุย้อนไปถึงสมัยโรมันเช่นกัน เหมืองนี้ถูกใช้งานตั้งแต่ปลายศตวรรษที่ 1 ถึงกลางศตวรรษที่ 4 ^{[ 12 ]}

ซากของโบสถ์ยิวซึ่งวินเซนต์รายงานไว้ครั้งแรกในช่วงทศวรรษ 1920 ต่อมาซูเคอนิก ได้ขุดค้น ในปี 1950 ซึ่งเป็นการยืนยันการระบุสถานที่ การขุดค้นอาคารซึ่งมีความยาวประมาณ 19 เมตรและวางตัวในทิศตะวันออก-ตะวันตก เผยให้เห็นเพียงรายละเอียดบางส่วนของแผนผัง เท่านั้น ชิ้น ส่วนโมเสกที่ค้นพบระหว่างการขุดค้นชี้ให้เห็นถึงลวดลาย หลัก ซึ่งเป็นวงกลมขนาดใหญ่ที่มีจุดเล็กๆ 12 จุด คาดว่าอาจเป็นตัวแทนของจักรราศีหรือตามที่ซูเคอนิกเสนอ อาจเป็นตัวแทนของเผ่าอิสราเอลทั้งสิบสองเผ่าการค้นพบที่น่าสนใจอย่างหนึ่งจากโบสถ์ยิวคือ ชิ้นส่วนโมเสกภาษา อาราเมอิกจากพื้น ซึ่งแสดงตัวอักษรฮีบรู สามตัว (อาจหมายถึงตัวอักษรสุดท้ายของชื่อเอฟราอิม ) ถัดจากหัวของสัตว์ การค้นพบนี้มีอายุย้อนไปถึงศตวรรษที่ 3 ถึง 4 ^{[ 13 ]}

ประเพณีท้องถิ่นในยุคกลางกล่าวว่าเซเบดีและบุตรชายสองคนของเขาคืออัครสาวกเจมส์และยอห์นอาศัยอยู่ในยาฟา^{[ 14 ]}เนื่องจากมารินัส ซานูตุส เป็นคนแรกที่กล่าวถึงประเพณีนี้ จึงเป็นไปได้มากที่สุดว่าเป็นสิ่งประดิษฐ์ในยุคสงครามครูเสด^{[ 15 ]}

มีการขุดพบ ซากอาคารจาก ยุค มัมลุก พร้อมด้วย เศษเครื่องปั้นดินเผาจากยุคนั้น^{[ 16 ] [ 17 ]}

ในปี ค.ศ. 1517 หมู่บ้านนี้ถูกผนวกเข้ากับจักรวรรดิออตโตมันพร้อมกับปาเลสไตน์ส่วนที่เหลือ และในปี ค.ศ. 1596 ปรากฏในทะเบียนภาษี ของออตโตมัน ว่าอยู่ในนาฮิยา (“เขตย่อย”) ของทาบาริยาภายใต้ลิวา (“เขต”) ของซาฟัดโดยมีประชากร 14 ครัวเรือน มุสลิมชาวบ้านจ่ายภาษีอัตราคงที่ 25% สำหรับข้าวสาลี ข้าวบาร์เลย์ ไม้ผล แพะ และรังผึ้ง นอกเหนือจากรายได้อื่นๆ เป็นครั้งคราว รวมเป็นเงิน 2,200 อักเช^{[ 18 ] [ 19 ]}

แผนที่จากการรุกรานของนโปเลียนในปี 1799โดยปิแอร์ จาโคแตงแสดงให้เห็นสถานที่ซึ่งมีชื่อว่าอิอาฟฟา^{[ 20 ]}

ในปี พ.ศ. 2381 เอ็ดเวิร์ด โรบินสันบรรยายว่าเป็นหมู่บ้านเล็กๆ มีบ้าน 30 หลังและซากโบสถ์^{[ 15 ]}เขายังบันทึกเพิ่มเติมว่าเป็นหมู่บ้านของชาวมุสลิมและชาวคริสต์กรีกในเขตนาซาเร็ธ^{[ 21 ]}

เมื่อเกอรินมาเยือนในปี พ.ศ. 2318 เขาพบว่ามีประชากร 400 คน รวมทั้งชาวละติน ชาว กรีกออร์โธดอกซ์และชาวมุสลิม นอกจากนี้ยังมีโรงเรียนโปรเตสแตนต์ในหมู่บ้านด้วย^{[ 22 ]}

ในปี พ.ศ. 2424 การสำรวจปาเลสไตน์ตะวันตก (SWP)ของPEFอธิบายว่าเป็น "หมู่บ้านขนาดปานกลางที่ตั้งอยู่บนเนินเขาที่ทอดยาวจากนาซาเร็ธลงไปยังเจบาตา มีบ่อน้ำอยู่ทางด้านทิศเหนือและอีกบ่อน้ำหนึ่งอยู่ในหุบเขาทางทิศตะวันออกเฉียงเหนือ" ^{[ 23 ]}

รายชื่อประชากรจากราวปี พ.ศ. 2430 แสดงให้เห็นว่ายาฟามีประชากรประมาณ 900 คน ครึ่งหนึ่งเป็นมุสลิม อีกครึ่งหนึ่งเป็นคริสเตียน^{[ 24 ]}

จาก การสำรวจสำมะโนประชากรปาเลสไตน์ใน ปี 1922 ซึ่งดำเนินการโดยหน่วยงานภายใต้การปกครองของอังกฤษ เมืองยาฟามีประชากรทั้งหมด 615 คน ประกอบด้วยชาวมุสลิม 215 คน และชาวคริสต์ 400 คน^{[ 25 ]}ในจำนวนชาวคริสต์นั้น มีออร์โธดอกซ์ 168 คน คาทอลิก 112 คน กรีกคาทอลิก ( เมลไคต์ ) 108 คน และแองกลิกัน 12 คน^{[ 26 ]}ประชากรเพิ่มขึ้นใน การสำรวจสำมะโนประชากรปี 1931เมื่อเมืองยาฟา (รวมถึงอาราบ เอล กาซซาลิน ) มีประชากร 833 คน ประกอบด้วยชาวมุสลิม 456 คน และชาวคริสต์ 377 คน ในบ้านทั้งหมด 213 หลัง^{[ 27 ]}

จากสถิติในปี พ.ศ. 2488ประชากรของเมืองยาฟามีจำนวน 1,070 คน ประกอบด้วยชาวมุสลิม 580 คน และชาวคริสต์ 490 คน^{[ 28 ]}โดยมีพื้นที่ทั้งหมด 17,809 ดูนัมตามการสำรวจที่ดินและประชากรอย่างเป็นทางการ^{[ 29 ]}ในจำนวนนี้ 710 ดูนัมเป็นพื้นที่เพาะปลูกและพื้นที่ชลประทาน 12,701 ดูนัมใช้สำหรับปลูกธัญพืช^{[ 30 ]}ขณะที่ 149 ดูนัมเป็นพื้นที่ก่อสร้าง (ในเมือง) ^{[ 31 ]}

ในปี พ.ศ. 2464 มีการพบ ทับหลัง ของโบสถ์ยิว ที่นั่น และในปี พ.ศ. 2493 มีการขุดค้นส่วนหนึ่งของโบสถ์ยิวที่ปูด้วยโมเสกใกล้กับโบสถ์กรีกออร์โธดอกซ์^{[ 32 ]}

ในปี พ.ศ. 2491 เมืองยาฟาถูกกองทัพอิสราเอลยึดครองระหว่างปฏิบัติการเดเคลซึ่งเริ่มขึ้นในเดือนกรกฎาคม^{[ 33 ]}ประชากรที่เหลือถูกประกาศใช้กฎอัยการศึกซึ่งยังคงมีผลบังคับใช้จนถึงปี พ.ศ. 2509

ประชากรส่วนใหญ่ของยาฟาในปัจจุบันเป็นลูกหลานของชาวปาเลสไตน์อาหรับที่พลัดถิ่นจากหมู่บ้านมาอาลุล ที่อยู่ใกล้เคียง ซึ่งถูกทิ้งร้างในช่วงสงครามอาหรับ-อิสราเอลในปี 1948ผู้คนจากมาอาลุลเข้าร่วมการเลือกตั้งท้องถิ่นในยาฟาภายใต้ชื่อ "พรรคผู้ลี้ภัยมาอาลุล" โดยมีนโยบายที่มุ่งเน้นประเด็นที่น่าสนใจหรือเป็นที่กังวลของประชาชนในวงกว้าง เพื่อดึงดูดการสนับสนุนทางการเมืองจากพรรคการเมืองท้องถิ่น^{[ 34 ]}