Molecular modelling
การสร้างแบบจำลองระดับโมเลกุล
โรเซตต้าที่บ้าน
Berkeley Open Infrastructure for Network Computing projectsRosetta@homeเป็นโครงการคอมพิวเตอร์อาสาสมัคร ที่ทำการวิจัยเกี่ยวกับ การทำนายโครงสร้างโปรตีนบน แพลตฟอร์ม Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC)...
อ่าน 1 นาทีพลศาสตร์โมเลกุล
CS1 maint: DOI inactive as of December 2025พลศาสตร์โมเลกุล ( MD ) เป็น วิธี การจำลองด้วยคอมพิวเตอร์สำหรับการวิเคราะห์การเคลื่อนที่ทางกายภาพของอะตอมและโมเลกุลอะตอมและโมเลกุลจะได้รับอนุญาตให้มีปฏิสัมพันธ์กันในช่วงเวลาที่กำหนด...
ศักยภาพทางสถิติ
Bioinformaticsใน การทำนาย โครงสร้างโปรตีนศักยภาพทางสถิติหรือศักยภาพตามความรู้คือฟังก์ชันการให้คะแนนที่ได้มาจากการวิเคราะห์โครงสร้างโปรตีน ที่ทราบแล้ว ในฐานข้อมูลโปรตีน (Protein Data Bank หรือ...
อ่าน 1 นาทีการสร้างแบบจำลองโมเลกุล
Bioinformaticsการสร้างแบบจำลองโมเลกุลครอบคลุมวิธีการทั้งหมด ทั้งทางทฤษฎีและการคำนวณ ที่ใช้ใน การ สร้างแบบจำลองหรือเลียนแบบพฤติกรรมของโมเลกุลวิธีการเหล่านี้ใช้ในสาขาเคมีเชิงคำนวณการออกแบบยา
กลศาสตร์โมเลกุล
Computational chemistryในวิชาเคมีเชิงฟิสิกส์และกลศาสตร์คลาสสิกกลศาสตร์โมเลกุลเป็นวิธีการคำนวณที่ใช้ในการสร้างแบบจำลองระบบโมเลกุล โดยถือว่า การประมาณของบอร์น-ออปเพนไฮเมอร์นั้นใช้ได้
พื้นที่ผิวที่เข้าถึงได้
Computational chemistryพื้นที่ผิวที่เข้าถึงได้ (ASA) หรือพื้นที่ผิวที่ตัวทำละลายเข้าถึงได้ (SASA) คือพื้นที่ผิวของโมเลกุลชีวภาพ ที่ ตัวทำละลายสามารถเข้าถึงได้การวัด ASA มักจะอธิบายในหน่วยตารางอังสตรอม...
สีซีพีเค
CS1 maint: deprecated archival serviceในวิชาเคมีการระบายสีแบบ CPK (ย่อมาจากCorey – Pauling – Koltun ) เป็นวิธีการกำหนดสีที่นิยมใช้ในการแยกแยะอะตอมของธาตุเคมี ต่าง ๆ ในแบบจำลองโมเลกุล
ลิซิก้า
Chemistry softwareLiSiCA ( Ligand Similarity using Clique Algorithm ) เป็นซอฟต์แวร์คัดกรองเสมือนจริงแบบอิงตามลิ แกนด์ที่ค้นหาความคล้ายคลึงกันแบบ 2 มิติและ 3...
การเชื่อมต่อโมเลกุลขนาดใหญ่
Bioinformaticsการเชื่อมต่อโมเลกุลขนาดใหญ่เป็นการสร้างแบบจำลองเชิงคำนวณของโครงสร้างควอเทอร์นารีของสารประกอบที่เกิดจากโมเลกุลชีวภาพขนาดใหญ่ที่โต้ตอบกันตั้งแต่สองโมเลกุลขึ้น ไป สารประกอบ โปรตีน
อ่าน 1 นาทีท่าเรือ
Molecular modellingโปรแกรม UCSF DOCKถูกสร้างขึ้นในช่วงทศวรรษ 1980 โดย กลุ่มของ Irwin "Tack" Kuntzและเป็นโปรแกรมด็อกกิ้ง ตัวแรก DOCK ใช้ขั้นตอนวิธีทางเรขาคณิตเพื่อทำนายรูปแบบการจับของโมเลกุลขนาดเล็ก..
อ่าน 1 นาทีบิสกิต
Computational chemistry softwareBiskitเป็น แพ็กเกจซอฟต์แวร์โอ เพนซอร์สที่ช่วยอำนวยความสะดวกในการวิจัยด้านชีวสารสนเทศเชิงโครงสร้างและการสร้างแบบจำลองโมเลกุลเขียนด้วยภาษา Pythonและประกอบด้วย:
พับผ้าที่บ้าน
2000 softwareFolding@home ( FAHหรือF@h ) เป็น โครงการ คอมพิวเตอร์แบบกระจายศูนย์ ที่มี จุดมุ่งหมายเพื่อช่วยนักวิทยาศาสตร์พัฒนายารักษาโรคชนิดใหม่ ๆ
อ่าน 1 นาทีความท้าทายแห่งความฝัน
Applied machine learningDREAM Challenges ( Dialogue for Reverse Engineering Assessment and Methods ) เป็นโครงการริเริ่มที่ไม่แสวงหาผลกำไรเพื่อส่งเสริม การวิจัย...
อ่าน 1 นาทีเมทริกซ์ Z (เคมี)
Computational chemistryในวิชาเคมีเมทริกซ์ Zเป็นวิธีหนึ่งในการแสดงระบบที่สร้างขึ้นจากอะตอมเมทริกซ์ Z ยังเป็นที่รู้จักในชื่อการแสดงพิกัดภายใน โดยให้คำ
อ่าน 1 นาทีแบบจำลองโมเลกุล
Molecular modellingแบบจำลองโมเลกุลเป็นแบบจำลองทางกายภาพของระบบอะตอมที่แสดงถึงโมเลกุลและกระบวนการต่างๆ
กราฟิกโมเลกุล
Computer graphicsกราฟิกโมเลกุลเป็นสาขาวิชาและปรัชญาของการศึกษาโมเลกุลและคุณสมบัติของโมเลกุลผ่านการแสดงผลกราฟิก IUPACจำกัดคำจำกัดความไว้ที่การแสดงผลบน "อุปกรณ์แสดงผลกราฟิก" นับตั้งแต่ อะตอมของ
การละลายโดยปริยาย
Computational chemistryการละลายโดยปริยาย (บางครั้งเรียกว่าการละลายแบบต่อเนื่อง ) เป็นวิธีการแสดงตัวทำละลายเป็นตัวกลางต่อเนื่องแทนที่จะเป็นโมเลกุลตัวทำละลายแบบ "ชัดเจน" ซึ่งมักใช้ใน การจำลอง...
การเชื่อมต่อ (ระดับโมเลกุล)
Bioinformaticsในสาขาการสร้างแบบจำลองโมเลกุลการด็อกกิ้งเป็นวิธีการที่ทำนายทิศทางที่ต้องการของโมเลกุลหนึ่งกับโมเลกุลที่สองเมื่อลิแกนด์และเป้าหมายจับกันเพื่อสร้างคอมเพล็กซ์ ที่
แบบจำลองที่เติมเต็มพื้นที่
All pages needing factual verificationในวิชาเคมีแบบจำลองที่เติมเต็มพื้นที่หรือที่รู้จักกันในชื่อแบบจำลองคาล็อตต์เป็นแบบจำลองโมเลกุลสามมิติ (3D) ประเภทหนึ่ง
ฟังก์ชันการให้คะแนนสำหรับการเชื่อมต่อ
Bioinformaticsในสาขาเคมีเชิงคำนวณและการสร้างแบบจำลองโมเลกุลฟังก์ชันการให้คะแนนเป็นฟังก์ชันทางคณิตศาสตร์ที่ใช้ในการทำนายความสัมพันธ์ในการจับกัน...
อ่าน 1 นาทีเอ็มพีเอ็มซี
CS1 maint: multiple names: authors listMassively Parallel Monte Carlo ( MPMC ) เป็น แพ็กเก จวิธีการ Monte Carloที่ออกแบบมาเพื่อจำลองของเหลว อินเตอร์เฟซระดับโมเลกุล และ วัสดุ ระดับนาโน ที่มีฟังก์ชันการทำงานเป็นหลัก...
วิธีสนามปฏิกิริยา
CS1 maint: multiple names: authors listวิธีการสนามปฏิกิริยาถูกนำมาใช้ในการจำลองโมเลกุลเพื่อจำลองผลของปฏิสัมพันธ์ไดโพล-ไดโพลระยะไกลสำหรับการจำลองที่มีเงื่อนไขขอบเขตแบบคาบ รอบๆ โมเลกุลแต่ละตัวจะมี 'โพรง'
อ่าน 1 นาทีการสุ่มตัวอย่างแบบปรับตัวได้
Bioinformaticsการสุ่มตัวอย่างแบบปรับตัวได้ (Adaptive sampling)เป็นแนวทางการสุ่มตัวอย่างที่ใช้หลักการเชิงอนุมาน (heuristics)...
Ball-and-stick model
Molecular modellingIn chemistry, the ball-and-stick model is a molecular model of a chemical substance which displays both the three-dimensional position of the atoms and the bonds between them.