อ่าน 6 นาที
ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส
ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส ( EC 4.1.2.13 ) หรือเรียกสั้นๆ ว่า อัลโดเลส เป็น เอนไซม์ ที่เร่ง ปฏิกิริยาผันกลับได้ โดยจะแยกอั ลด อล ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต ออกเป็น ไตรโอส ฟอสเฟต...
ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส
| ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส อ็อกตาเมอร์ มนุษย์ | |||||||||
| ตัวระบุ | |||||||||
| หมายเลข EC | 4.1.2.13 | ||||||||
| หมายเลข CAS | 9024-52-6 | ||||||||
| ฐานข้อมูล | |||||||||
| อินท์เอ็นซ์ | มุมมองของ IntEnz | ||||||||
| เบรนด้า | เบรนด้าเข้าร่วม | ||||||||
| เอ็กซ์แพซี่ | มุมมองของ NiceZyme | ||||||||
| เคกก์ | รายการ KEGG | ||||||||
| เมตาไซค์ | วิถีการเผาผลาญ | ||||||||
| ไพรแอม | ประวัติโดยย่อ | ||||||||
| โครงสร้างPDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| ออนโทโลยีของยีน | อามิโก้ / ควิกโก้ | ||||||||
| |||||||||
| ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส คลาส-1 | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส จากตับกระต่าย | |||||||
| ตัวระบุ | |||||||
| เครื่องหมาย | ไกลโคไลติก | ||||||
| พีแฟม | PF00274 | ||||||
| อินเตอร์โปร | IPR000741 | ||||||
| โปรไซต์ | PDOC00143 | ||||||
| สโคป2 | 1ald / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| ซีดีดี | ซีดี00344 | ||||||
| |||||||
| ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส คลาส II | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
ฟรุกโตส-1,6-บิสฟอสเฟตอัลโดเลสคลาส II ในรูปสารประกอบเชิงซ้อนกับฟอสโฟไกลโคโลไฮดรอกซาเมต | |||||||
| ตัวระบุ | |||||||
| เครื่องหมาย | เอฟบีพีอัลโดเลส | ||||||
| พีแฟม | พีเอฟ01116 | ||||||
| ตระกูลพีแฟม | ซีแอล0036 | ||||||
| อินเตอร์โปร | IPR000771 | ||||||
| โปรไซต์ | PDOC00523 | ||||||
| สโคป2 | 1dos / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| ซีดีดี | ซีดี00453 | ||||||
| |||||||
ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส ( EC 4.1.2.13 ) หรือเรียกสั้นๆ ว่าอัลโดเลสเป็นเอนไซม์ที่เร่งปฏิกิริยาผันกลับได้โดยจะแยกอัลด อล ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟตออกเป็นไตรโอสฟอสเฟตไดไฮดรอกซีอะซีโตนฟอสเฟต (DHAP) และกลีเซอรัลดีไฮด์ 3-ฟอสเฟต (G3P) อัลโดเลสยังสามารถสร้าง DHAP จาก (3S,4R)-คีโตส 1-ฟอสเฟตอื่นๆเช่นฟรุกโตส 1-ฟอสเฟตและเซโดเฮปทูโลส 1,7-บิสฟอสเฟต กระบวนการสร้าง กลูโคสจากสารตั้งต้น (Gluconeogenesis ) และวัฏจักรแคลวินซึ่งเป็นวิถีการสร้างสาร (anabolic pathways ) ใช้ปฏิกิริยาผันกลับ ใน ขณะที่ กระบวนการสลายสาร (Glycolysis)ซึ่งเป็นวิถีการสลายสาร (catabolic pathway ) ใช้ปฏิกิริยาไปข้างหน้า อัลโดเลสแบ่งออกเป็นสองประเภทตามกลไกการทำงาน
คำว่าอัลโดเลสยังหมายถึง เอนไซม์ที่ทำปฏิกิริยาอัลดอล (สร้างอัลดอล ) หรือปฏิกิริยาย้อนกลับ (สลายอัลดอล) โดยทั่วไป เช่นไซอะลิกแอซิดอัล โดเลส ซึ่งสร้างกรดไซอะลิ ก ดูรายชื่ออัลโดเลสได้ที่นี่
กลไกและโครงสร้าง
โปรตีนคลาส I สร้างตัวกลางSchiff base ที่มีโปรตอน เชื่อมโยง ไลซีน ใน บริเวณออกฤทธิ์ที่มีการอนุรักษ์สูงกับ คาร์ บอนิล คาร์บอนของ DHAP นอกจากนี้ หมู่ไทโรซีนยังมีความสำคัญต่อกลไกนี้โดยทำหน้าที่เป็นตัวรับไฮโดรเจนที่เสถียร โปรตีนคลาส II ใช้กลไกที่แตกต่างออกไปซึ่งทำให้หมู่คาร์บอนิลมีขั้วด้วยแคตไอออน สอง วาเลนต์เช่นZn 2+โปรตีนEscherichia coli galactitol operon , gatY และ โปรตีน N-acetyl galactosamine operon, agaY ซึ่งเป็นtagatose-bisphosphate aldolaseเป็นโฮโมล็อกของ fructose-bisphosphate aldolase คลาส II พบว่า หมู่ฮิสติดีน สองหมู่ ในครึ่งแรกของลำดับของโฮโมล็อกเหล่านี้มีส่วนเกี่ยวข้องในการจับกับสังกะสี[ 1 ]
หน่วยย่อยโปรตีนของทั้งสองคลาสแต่ละตัวมีโดเมน α/βที่พับตัวเป็นโครงสร้าง TIM barrelซึ่งบรรจุบริเวณออกฤทธิ์ หน่วยย่อยหลายหน่วยจะประกอบกันเป็นโปรตีนที่สมบูรณ์ โปรตีนทั้งสองคลาสมีลำดับกรดอะมิโนที่เหมือนกันน้อย มาก
โดยส่วนใหญ่แล้ว โปรตีนคลาส I เท่านั้นที่พบในสัตว์พืชและสาหร่ายสีเขียว [ 2 ] โดยส่วนใหญ่แล้ว โปรตีนคลาส II เท่านั้นที่พบในเชื้อรา โปรตีน ทั้งสองคลาสนี้พบได้ทั่วไปในยูคาริโอต อื่นๆ และในแบคทีเรีย[ 3 ]โปรตีนทั้งสองคลาสนี้มักพบร่วมกันในสิ่งมีชีวิตชนิดเดียวกัน พืชและสาหร่ายมี อัลโดเล สในพลาสติดซึ่งบางครั้งอาจเป็นซากของเอนโดซิมไบโอซิสนอกเหนือจากอัลโดเลสในไซโตพลาสซึมตามปกติ อัลโดเลส/ฟอสฟาเทสฟรุกโตส-บิสฟอสเฟตแบบสองหน้าที่ ซึ่งมีกลไกคลาส I พบได้ทั่วไปในอาร์เคียและแบคทีเรียบางชนิด[ 4 ]บริเวณออกฤทธิ์ของอัลโดเลสในอาร์เคียนี้ยังอยู่ในโครงสร้าง TIM barrel ด้วย
ในกระบวนการสร้างกลูโคสและไกลโคไลซิส
กระบวนการสร้างกลูโคสจากสารที่ไม่ใช่คาร์โบไฮเดรต (Gluconeogenesis) และกระบวนการสลายกลูโคส (Glycolysis) มีปฏิกิริยาผันกลับได้ร่วมกัน 6 ขั้นตอน ในกระบวนการสร้างกลูโคสจากสารที่ไม่ใช่คาร์โบไฮเดรตนั้น กลีเซอรัลดีไฮด์-3-ฟอสเฟตจะถูกรีดิวซ์เป็นฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟตโดยใช้เอนไซม์อัลโดเลส ในกระบวนการสลายกลูโคสจากสารที่ไม่ใช่คาร์โบไฮเดรตนั้น ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟตจะถูกเปลี่ยนเป็นกลีเซอรัลดีไฮด์-3-ฟอสเฟตและไดไฮดรอกซีอะซีโตนฟอสเฟตโดยใช้เอนไซม์อัลโดเลส เอนไซม์อัลโดเลสที่ใช้ในกระบวนการสร้างกลูโคสจากสารที่ไม่ใช่คาร์โบไฮเดรตและกระบวนการสลายกลูโคสจากคาร์โบไฮเดรตนั้นเป็นโปรตีนที่อยู่ในไซโตพลาสซึม
โปรตีนคลาส I สามรูปแบบพบได้ในสัตว์ มีกระดูกสันหลังอัลโดเลส A แสดงออกอย่างเด่นชัดในกล้ามเนื้อและสมองอัลโดเลส Bในตับ ไต และในเซลล์ ลำไส้ และอัลโดเลส Cในสมอง อัลโดเลส A และ C มีส่วนเกี่ยวข้องหลักในกระบวนการไกลโคไลซิสในขณะที่อัลโดเลส B มีส่วนเกี่ยวข้องทั้งในกระบวนการไกลโคไลซิสและกลูโคเนโอเจเนซิส[ 5 ]ความบกพร่องบางอย่างในอัลโดเลส B ทำให้เกิดภาวะไม่ทนต่อฟรุกโตสทางพันธุกรรมการเผาผลาญฟรุกโตสอิสระในตับใช้ประโยชน์จากความสามารถของอัลโดเลส B ในการใช้ฟรุกโตส 1-ฟอสเฟตเป็นสารตั้งต้น[ 6 ]คาดว่าฟรุกโตส-บิสฟอสเฟตอัลโดเลส/ฟอสฟาเตสของอาร์เคียมีส่วนเกี่ยวข้องในกระบวนการกลูโคเนโอเจเนซิสเนื่องจากผลิตภัณฑ์ของมันคือฟรุกโตส 6-ฟอสเฟต[ 7 ]
ในวัฏจักรของคาลวิน
วัฏจักรแคลวินเป็น วิถี การตรึงคาร์บอนซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของการสังเคราะห์แสง ที่เปลี่ยนคาร์บอนไดออกไซด์และสารประกอบอื่นๆ ให้เป็นกลูโคส วัฏจักรแคลวินและกลูโคเนโอเจเนซิสมีปฏิกิริยาผันกลับได้สี่ขั้นตอนร่วมกัน ในทั้งสองวิถี3-ฟอสโฟกลีเซอเรต (3-PGA หรือ 3-PG) จะถูกรีดิวซ์เป็นฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต โดยมีเอนไซม์อัลโดเลสเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในปฏิกิริยาสุดท้าย ปฏิกิริยาที่ห้า ซึ่งถูกเร่งปฏิกิริยาในทั้งสองวิถีโดยฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสฟาเตสจะไฮโดรไลซ์ฟรุกโตส 1-6-บิสฟอสเฟตให้เป็นฟรุกโตส 6-ฟอสเฟตและฟอสเฟตอนินทรีย์ การลดลงของพลังงานอิสระ อย่างมาก ทำให้ปฏิกิริยานี้ผันกลับไม่ได้ ในวัฏจักรแคลวิน เอนไซม์อัลโดเลสยังเร่งปฏิกิริยาการผลิตเซโดเฮปทูโลส 1,7-บิสฟอสเฟตจาก DHAP และอีริโทรส 4-ฟอสเฟตด้วย ผลิตภัณฑ์หลักของวัฏจักรแคลวิน ได้แก่ ไตรโอสฟอสเฟต (TP) ซึ่งเป็นส่วนผสมของ DHAP และ G3P และฟรุกโตส 6-ฟอสเฟต ทั้งสองอย่างนี้จำเป็นต่อการสร้างRuBP ขึ้นใหม่ ด้วย เอนไซม์อัลโดเลสที่พืชและสาหร่ายใช้ในวัฏจักรแคลวินมักเป็นโปรตีนที่ถูกส่งไปยังพลาสติด ซึ่งถูกเข้ารหัสโดยยีนในนิวเคลียส
ปฏิกิริยา
เอนไซม์อัลโดเลสเป็นตัวเร่งปฏิกิริยา
- ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต ⇌ DHAP + G3P
และยัง
- เซโดเฮปทูโลส 1,7-บิสฟอสเฟต ⇌ ดีเอชเอพี + อิริโทรส 4-ฟอสเฟต
- ฟรุกโตส 1-ฟอสเฟต ⇌ DHAP + กลีเซอรัลดีไฮด์
เอนไซม์อัลโดเลสถูกนำมาใช้ในกระบวนการผันกลับของการสร้างกลูโคส/ไกลโคไลซิส
- 2( PEP + NADH + H + + ATP + H 2 O) ⇌ ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต + 2(NAD + + ADP + Pi )
เอนไซม์อัลโดเลสยังถูกใช้ในส่วนของวัฏจักรแคลวินที่ใช้ร่วมกับกระบวนการสร้างกลูโคสใหม่ โดยมีการไฮโดรไลซิสของฟอสเฟตแบบไม่ผันกลับได้ในตอนท้าย ซึ่งเร่งปฏิกิริยาโดยเอนไซม์ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสฟาเตส
- 2( 3-PG + NADPH + H + + ATP + H 2 O) ⇌ ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต + 2(NADP + + ADP + Pi )
- ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต + H₂O →ฟรุกโตส 6-ฟอสเฟต + Pi
ในกระบวนการสร้างกลูโคสจากสารที่ไม่ใช่คาร์โบไฮเดรต (gluconeogenesis) 3-PG ถูกผลิตขึ้นโดยเอนไซม์อีโนเลสและฟอสโฟกลีเซอเรตมิวเทสที่ทำงานร่วมกันเป็นลำดับ
- PEP + H₂O ⇌ 2-PG ⇌ 3-PG
ในวัฏจักรแคลวิน 3-PG ถูกผลิตขึ้นโดยRuBisCO
- RuBP + CO 2 + H 2 O → 2(3-PG)
G3P ถูกสร้างขึ้นโดยเอนไซม์ฟอสโฟกลีเซอเรตไคเนสที่ทำงานต่อเนื่องกับ เอนไซม์กลีเซอรัลดี ไฮด์-3- ฟอสเฟตดีไฮโดรจีเนส (GAPDH) ในกระบวนการสร้างกลูโคส และทำงานต่อเนื่องกับเอนไซม์กลีเซอรัลดีไฮด์-3-ฟอสเฟตดีไฮโดรจีเนส (NADP+) (ที่ทำหน้าที่เติมหมู่ฟอสเฟต)ในวัฏจักรแคลวิน
- 3-PG + ATP ⇌ 1,3-บิสฟอสโฟกลีเซอเรต + ADP
- 1,3-บิสฟอสโฟกลีเซอเรต + NAD(P)H + H + ⇌ G3P + P i + NAD(P) +
ไตรโอส-ฟอสเฟต ไอโซเมอเรสรักษาสมดุลของ DHAP และ G3P ให้อยู่ในระดับใกล้เคียงกัน ทำให้เกิดสารผสมที่เรียกว่า ไตรโอส ฟอสเฟต (TP)
- G3P ⇌ DHAP
ดังนั้นทั้ง DHAP และ G3P จึงพร้อมให้เอนไซม์อัลโดเลสใช้งานได้
อสังหาริมทรัพย์ที่รับงานนอกเวลา
นอกจากนี้ Aldolase ยังมีส่วนเกี่ยวข้องกับ "การทำงานนอกเวลา" หรือหน้าที่ที่ไม่ใช่การเร่งปฏิกิริยาหลายอย่าง โดยอาศัยความสัมพันธ์ในการจับกับโปรตีนอื่นๆ หลายชนิด ได้แก่F-actin , α-tubulin , light chain dynein , WASP , Band 3 anion exchanger, phospholipase D ( PLD2 ), glucose transporter GLUT4 , inositol trisphosphate , V-ATPaseและ ARNO ( ปัจจัยแลกเปลี่ยนนิวคลีโอไทด์กัวนี น ของARF6 ) เชื่อกันว่าความสัมพันธ์เหล่านี้ส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับโครงสร้างของเซลล์ อย่างไรก็ตาม มีการสำรวจถึงการมีส่วนร่วมในเอนโดไซโทซิส การบุกรุกของปรสิต การจัดเรียงโครงร่างเซลล์ใหม่ การเคลื่อนที่ของเซลล์ การขนส่งและการรีไซเคิลโปรตีนเยื่อหุ้มเซลล์ การส่งสัญญาณ และการแบ่งส่วนของเนื้อเยื่อ[ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]
อ่านเพิ่มเติม
- Berry A, Marshall KE (กุมภาพันธ์ 1993). "การระบุลิแกนด์ที่จับกับสังกะสีในฟรุกโตส-1,6-บิสฟอสเฟตอัลโดเลสคลาส II ของ Escherichia coli" FEBS Lett . 318 ( 1): 11– 6. Bibcode : 1993FEBSL.318...11B . doi : 10.1016/0014-5793(93)81317-S . PMID 8436219. S2CID 7682431 .
- Freemont PS, Dunbar B, Fothergill-Gilmore LA (กุมภาพันธ์ 1988). "ลำดับกรดอะมิโนที่สมบูรณ์ของฟรุกโตส-บิสฟอสเฟตอัลโดเลสของกล้ามเนื้อโครงร่างมนุษย์" . Biochem. J . 249 (3): 779– 88. doi : 10.1042/bj2490779 . PMC 1148774 . PMID 3355497 .
- กัลคิน เอ, ลี ซี, ลี แอล, คูลาโควา แอล, ปาล แอลอาร์, ดูนาเวย์-มาเรียโน ดี, เฮิร์ซเบิร์ก โอ (2009) "ข้อมูลเชิงลึกเชิงโครงสร้างเกี่ยวกับการจับตัวของสารตั้งต้นและการเลือกสเตอริโอของไกอาร์เดียฟรุกโตส-1,6-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส " ชีวเคมี . 48 (14): 3186– 96. ดอย : 10.1021/bi9001166 . PMC2666783 . PMID19236002 .
- Marsh JJ, Lebherz HG (มีนาคม 1992). "ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟตอัลโดเลส: ประวัติวิวัฒนาการ". Trends Biochem. Sci . 17 (3): 110– 3. doi : 10.1016/0968-0004(92)90247-7 . PMID 1412694 .
- Perham RN (เมษายน 1990). "ฟรุกโตส-1,6-บิสฟอสเฟตอัลโดเลส: ปฏิกิริยาเดียวกัน แต่เอนไซม์ต่างกัน" Biochem. Soc. Trans . 18 (2): 185– 7. doi : 10.1042/bst0180185 . PMID 2199259 .
ลิงก์ภายนอก
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส
ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส ( EC 4.1.2.13 ) หรือเรียกสั้นๆ ว่า อัลโดเลส เป็น เอนไซม์ ที่เร่ง ปฏิกิริยาผันกลับได้ โดยจะแยกอั ลด อล ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต ออกเป็น ไตรโอส ฟอสเฟต...
กลไกและโครงสร้าง
โปรตีนคลาส I สร้าง ตัวกลาง Schiff base ที่มีโปรตอน เชื่อมโยง ไลซีน ใน บริเวณออกฤทธิ์ ที่มีการอนุรักษ์สูงกับ คาร์ บอนิล คาร์บอนของ DHAP นอกจากนี้ หมู่ไทโรซีนยังมีความสำคัญต่อกลไกนี้โดยทำหน้าที่เป็นตัวรับไฮโดรเจนที่เสถียร โปรตีนคลาส II...
ในกระบวนการสร้างกลูโคสและไกลโคไลซิส
กระบวนการสร้างกลูโคสจากสารที่ไม่ใช่คาร์โบไฮเดรต (Gluconeogenesis) และกระบวนการสลายกลูโคส (Glycolysis) มีปฏิกิริยาผันกลับได้ร่วมกัน 6 ขั้นตอน ในกระบวนการสร้างกลูโคสจากสารที่ไม่ใช่คาร์โบไฮเดรตนั้น กลีเซอรัลดีไฮด์-3-ฟอสเฟตจะถูกรีดิวซ์เป็นฟรุกโตส...
ในวัฏจักรของคาลวิน
วัฏจักร แคลวิน เป็น วิถี การตรึงคาร์บอน ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของการสังเคราะห์แสง ที่เปลี่ยนคาร์บอนไดออกไซด์และสารประกอบอื่นๆ ให้เป็นกลูโคส วัฏจักรแคลวินและ กลูโคเนโอเจเนซิส มีปฏิกิริยาผันกลับได้สี่ขั้นตอนร่วมกัน ในทั้งสองวิถี 3-ฟอสโฟกลีเซอเรต (3-PGA หรือ 3-PG)...