กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 6 นาที

ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส

ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส ( EC 4.1.2.13 ) หรือเรียกสั้นๆ ว่า อัลโดเลส เป็น เอนไซม์ ที่เร่ง ปฏิกิริยาผันกลับได้ โดยจะแยกอั ลด อล ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต ออกเป็น ไตรโอส ฟอสเฟต...

ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส

ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส
ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส อ็อกตาเมอร์ มนุษย์
ตัวระบุ
หมายเลข EC4.1.2.13
หมายเลข CAS9024-52-6
ฐานข้อมูล
อินท์เอ็นซ์มุมมองของ IntEnz
เบรนด้าเบรนด้าเข้าร่วม
เอ็กซ์แพซี่มุมมองของ NiceZyme
เคกก์รายการ KEGG
เมตาไซค์วิถีการเผาผลาญ
ไพรแอมประวัติโดยย่อ
โครงสร้างPDBRCSB PDB PDBe PDBsum
ออนโทโลยีของยีนอามิโก้ / ควิกโก้
ค้นหา
พีเอ็มซีบทความ
พับเมดบทความ
เอ็นซีบีไอโปรตีน
ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส คลาส-1
ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส จากตับกระต่าย
ตัวระบุ
เครื่องหมายไกลโคไลติก
พีแฟมPF00274
อินเตอร์โปรIPR000741
โปรไซต์PDOC00143
สโคป21ald / SCOPe / SUPFAM
ซีดีดีซีดี00344
โครงสร้างโปรตีนที่มีอยู่:
พีดีบี  IPR000741 PF00274 ( ECOD ; PDBsum )  
อัลฟาโฟลด์
  • IPR000741
  • PF00274
ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส คลาส II
ฟรุกโตส-1,6-บิสฟอสเฟตอัลโดเลสคลาส II ในรูปสารประกอบเชิงซ้อนกับฟอสโฟไกลโคโลไฮดรอกซาเมต
ตัวระบุ
เครื่องหมายเอฟบีพีอัลโดเลส
พีแฟมพีเอฟ01116
ตระกูลพีแฟมซีแอล0036
อินเตอร์โปรIPR000771
โปรไซต์PDOC00523
สโคป21dos / SCOPe / SUPFAM
ซีดีดีซีดี00453
โครงสร้างโปรตีนที่มีอยู่:
พีดีบี  IPR000771 PF01116 ( ECOD ; PDBsum )  
อัลฟาโฟลด์
  • IPR000771
  • พีเอฟ01116

ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส ( EC 4.1.2.13 ) หรือเรียกสั้นๆ ว่าอัลโดเลสเป็นเอนไซม์ที่เร่งปฏิกิริยาผันกลับได้โดยจะแยกอัลด อล ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟตออกเป็นไตรโอสฟอสเฟตไดไฮดรอกซีอะซีโตนฟอสเฟต (DHAP) และกลีเซอรัลดีไฮด์ 3-ฟอสเฟต (G3P) อัลโดเลสยังสามารถสร้าง DHAP จาก (3S,4R)-คีโตส 1-ฟอสเฟตอื่นๆเช่นรุกโตส 1-ฟอสเฟตและเซโดเฮปทูโลส 1,7-บิสฟอสเฟต กระบวนการสร้าง กลูโคสจากสารตั้งต้น (Gluconeogenesis ) และวัฏจักรแคลวินซึ่งเป็นวิถีการสร้างสาร (anabolic pathways ) ใช้ปฏิกิริยาผันกลับ ใน ขณะที่ กระบวนการสลายสาร (Glycolysis)ซึ่งเป็นวิถีการสลายสาร (catabolic pathway ) ใช้ปฏิกิริยาไปข้างหน้า อัลโดเลสแบ่งออกเป็นสองประเภทตามกลไกการทำงาน

คำว่าอัลโดเลสยังหมายถึง เอนไซม์ที่ทำปฏิกิริยาอัลดอล (สร้างอัลดอล ) หรือปฏิกิริยาย้อนกลับ (สลายอัลดอล) โดยทั่วไป เช่นไซอะลิกแอซิดอัล โดเลส ซึ่งสร้างกรดไซอะลิ ก ดูรายชื่ออัลโดเลสได้ที่นี่

กลไกและโครงสร้าง

โปรตีนคลาส I สร้างตัวกลางSchiff base ที่มีโปรตอน เชื่อมโยง ไลซีน ใน บริเวณออกฤทธิ์ที่มีการอนุรักษ์สูงกับ คาร์ บอนิล คาร์บอนของ DHAP นอกจากนี้ หมู่ไทโรซีนยังมีความสำคัญต่อกลไกนี้โดยทำหน้าที่เป็นตัวรับไฮโดรเจนที่เสถียร โปรตีนคลาส II ใช้กลไกที่แตกต่างออกไปซึ่งทำให้หมู่คาร์บอนิลมีขั้วด้วยแคตไอออน สอง วาเลนต์เช่นZn 2+โปรตีนEscherichia coli galactitol operon , gatY และ โปรตีน N-acetyl galactosamine operon, agaY ซึ่งเป็นtagatose-bisphosphate aldolaseเป็นโฮโมล็อกของ fructose-bisphosphate aldolase คลาส II พบว่า หมู่ฮิสติดีน สองหมู่ ในครึ่งแรกของลำดับของโฮโมล็อกเหล่านี้มีส่วนเกี่ยวข้องในการจับกับสังกะสี[ 1 ]

หน่วยย่อยโปรตีนของทั้งสองคลาสแต่ละตัวมีโดเมน α/βที่พับตัวเป็นโครงสร้าง TIM barrelซึ่งบรรจุบริเวณออกฤทธิ์ หน่วยย่อยหลายหน่วยจะประกอบกันเป็นโปรตีนที่สมบูรณ์ โปรตีนทั้งสองคลาสมีลำดับกรดอะมิโนที่เหมือนกันน้อย มาก

โดยส่วนใหญ่แล้ว โปรตีนคลาส I เท่านั้นที่พบในสัตว์พืชและสาหร่ายสีเขียว [ 2 ] โดยส่วนใหญ่แล้ว โปรตีนคลาส II เท่านั้นที่พบในเชื้อรา โปรตีน ทั้งสองคลาสนี้พบได้ทั่วไปในยูคาริโอต อื่นๆ และในแบคทีเรีย[ 3 ]โปรตีนทั้งสองคลาสนี้มักพบร่วมกันในสิ่งมีชีวิตชนิดเดียวกัน พืชและสาหร่ายมี อัลโดเล สในพลาสติดซึ่งบางครั้งอาจเป็นซากของเอนโดซิมไบโอซิสนอกเหนือจากอัลโดเลสในไซโตพลาสซึมตามปกติ อัลโดเลส/ฟอสฟาเทสฟรุกโตส-บิสฟอสเฟตแบบสองหน้าที่ ซึ่งมีกลไกคลาส I พบได้ทั่วไปในอาร์เคียและแบคทีเรียบางชนิด[ 4 ]บริเวณออกฤทธิ์ของอัลโดเลสในอาร์เคียนี้ยังอยู่ในโครงสร้าง TIM barrel ด้วย

ในกระบวนการสร้างกลูโคสและไกลโคไลซิส

กระบวนการสร้างกลูโคสจากสารที่ไม่ใช่คาร์โบไฮเดรต (Gluconeogenesis) และกระบวนการสลายกลูโคส (Glycolysis) มีปฏิกิริยาผันกลับได้ร่วมกัน 6 ขั้นตอน ในกระบวนการสร้างกลูโคสจากสารที่ไม่ใช่คาร์โบไฮเดรตนั้น กลีเซอรัลดีไฮด์-3-ฟอสเฟตจะถูกรีดิวซ์เป็นฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟตโดยใช้เอนไซม์อัลโดเลส ในกระบวนการสลายกลูโคสจากสารที่ไม่ใช่คาร์โบไฮเดรตนั้น ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟตจะถูกเปลี่ยนเป็นกลีเซอรัลดีไฮด์-3-ฟอสเฟตและไดไฮดรอกซีอะซีโตนฟอสเฟตโดยใช้เอนไซม์อัลโดเลส เอนไซม์อัลโดเลสที่ใช้ในกระบวนการสร้างกลูโคสจากสารที่ไม่ใช่คาร์โบไฮเดรตและกระบวนการสลายกลูโคสจากคาร์โบไฮเดรตนั้นเป็นโปรตีนที่อยู่ในไซโตพลาสซึม

โปรตีนคลาส I สามรูปแบบพบได้ในสัตว์ มีกระดูกสันหลังอัลโดเลส A แสดงออกอย่างเด่นชัดในกล้ามเนื้อและสมองอัลโดเลส Bในตับ ไต และในเซลล์ ลำไส้ และอัลโดเลส Cในสมอง อัลโดเลส A และ C มีส่วนเกี่ยวข้องหลักในกระบวนการไกลโคไลซิสในขณะที่อัลโดเลส B มีส่วนเกี่ยวข้องทั้งในกระบวนการไกลโคไลซิสและกลูโคเนโอเจเนซิส[ 5 ]ความบกพร่องบางอย่างในอัลโดเลส B ทำให้เกิดภาวะไม่ทนต่อฟรุกโตสทางพันธุกรรมการเผาผลาญฟรุกโตสอิสระในตับใช้ประโยชน์จากความสามารถของอัลโดเลส B ในการใช้ฟรุกโตส 1-ฟอสเฟตเป็นสารตั้งต้น[ 6 ]คาดว่าฟรุกโตส-บิสฟอสเฟตอัลโดเลส/ฟอสฟาเตสของอาร์เคียมีส่วนเกี่ยวข้องในกระบวนการกลูโคเนโอเจเนซิสเนื่องจากผลิตภัณฑ์ของมันคือฟรุกโตส 6-ฟอสเฟต[ 7 ]

ในวัฏจักรของคาลวิน

วัฏจักรแคลวินเป็น วิถี การตรึงคาร์บอนซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของการสังเคราะห์แสง ที่เปลี่ยนคาร์บอนไดออกไซด์และสารประกอบอื่นๆ ให้เป็นกลูโคส วัฏจักรแคลวินและกลูโคเนโอเจเนซิสมีปฏิกิริยาผันกลับได้สี่ขั้นตอนร่วมกัน ในทั้งสองวิถี3-ฟอสโฟกลีเซอเรต (3-PGA หรือ 3-PG) จะถูกรีดิวซ์เป็นฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต โดยมีเอนไซม์อัลโดเลสเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในปฏิกิริยาสุดท้าย ปฏิกิริยาที่ห้า ซึ่งถูกเร่งปฏิกิริยาในทั้งสองวิถีโดยฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสฟาเตสจะไฮโดรไลซ์ฟรุกโตส 1-6-บิสฟอสเฟตให้เป็นฟรุกโตส 6-ฟอสเฟตและฟอสเฟตอนินทรีย์ การลดลงของพลังงานอิสระ อย่างมาก ทำให้ปฏิกิริยานี้ผันกลับไม่ได้ ในวัฏจักรแคลวิน เอนไซม์อัลโดเลสยังเร่งปฏิกิริยาการผลิตเซโดเฮปทูโลส 1,7-บิสฟอสเฟตจาก DHAP และอีริโทรส 4-ฟอสเฟตด้วย ผลิตภัณฑ์หลักของวัฏจักรแคลวิน ได้แก่ ไตรโอสฟอสเฟต (TP) ซึ่งเป็นส่วนผสมของ DHAP และ G3P และฟรุกโตส 6-ฟอสเฟต ทั้งสองอย่างนี้จำเป็นต่อการสร้างRuBP ขึ้นใหม่ ด้วย เอนไซม์อัลโดเลสที่พืชและสาหร่ายใช้ในวัฏจักรแคลวินมักเป็นโปรตีนที่ถูกส่งไปยังพลาสติด ซึ่งถูกเข้ารหัสโดยยีนในนิวเคลียส

ปฏิกิริยา

เอนไซม์อัลโดเลสเป็นตัวเร่งปฏิกิริยา

ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต ⇌ DHAP + G3P

และยัง

เซโดเฮปทูโลส 1,7-บิสฟอสเฟต ⇌ ดีเอชเอพี + อิริโทรส 4-ฟอสเฟต
ฟรุกโตส 1-ฟอสเฟต ⇌ DHAP + กลีเซอรัลดีไฮด์

เอนไซม์อัลโดเลสถูกนำมาใช้ในกระบวนการผันกลับของการสร้างกลูโคส/ไกลโคไลซิส

2( PEP + NADH + H + + ATP + H 2 O) ⇌ ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต + 2(NAD + + ADP + Pi )

เอนไซม์อัลโดเลสยังถูกใช้ในส่วนของวัฏจักรแคลวินที่ใช้ร่วมกับกระบวนการสร้างกลูโคสใหม่ โดยมีการไฮโดรไลซิสของฟอสเฟตแบบไม่ผันกลับได้ในตอนท้าย ซึ่งเร่งปฏิกิริยาโดยเอนไซม์ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสฟาเตส

2( 3-PG + NADPH + H + + ATP + H 2 O) ⇌ ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต + 2(NADP + + ADP + Pi )
ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต + H₂O ฟรุกโตส 6-ฟอสเฟต + Pi

ในกระบวนการสร้างกลูโคสจากสารที่ไม่ใช่คาร์โบไฮเดรต (gluconeogenesis) 3-PG ถูกผลิตขึ้นโดยเอนไซม์อีโนเลสและฟอสโฟกลีเซอเรตมิวเทสที่ทำงานร่วมกันเป็นลำดับ

PEP + H₂O 2-PG ⇌ 3-PG

ในวัฏจักรแคลวิน 3-PG ถูกผลิตขึ้นโดยRuBisCO

RuBP + CO 2 + H 2 O → 2(3-PG)

G3P ถูกสร้างขึ้นโดยเอนไซม์ฟอสโฟกลีเซอเรตไคเนสที่ทำงานต่อเนื่องกับ เอนไซม์กลีเซอรัลดี ไฮด์-3- ฟอสเฟตดีไฮโดรจีเนส (GAPDH) ในกระบวนการสร้างกลูโคส และทำงานต่อเนื่องกับเอนไซม์กลีเซอรัลดีไฮด์-3-ฟอสเฟตดีไฮโดรจีเนส (NADP+) (ที่ทำหน้าที่เติมหมู่ฟอสเฟต)ในวัฏจักรแคลวิน

3-PG + ATP ⇌ 1,3-บิสฟอสโฟกลีเซอเรต + ADP
1,3-บิสฟอสโฟกลีเซอเรต + NAD(P)H + H + ⇌ G3P + P i + NAD(P) +

ไตรโอส-ฟอสเฟต ไอโซเมอเรสรักษาสมดุลของ DHAP และ G3P ให้อยู่ในระดับใกล้เคียงกัน ทำให้เกิดสารผสมที่เรียกว่า ไตรโอส ฟอสเฟต (TP)

G3P ⇌ DHAP

ดังนั้นทั้ง DHAP และ G3P จึงพร้อมให้เอนไซม์อัลโดเลสใช้งานได้

อสังหาริมทรัพย์ที่รับงานนอกเวลา

นอกจากนี้ Aldolase ยังมีส่วนเกี่ยวข้องกับ "การทำงานนอกเวลา" หรือหน้าที่ที่ไม่ใช่การเร่งปฏิกิริยาหลายอย่าง โดยอาศัยความสัมพันธ์ในการจับกับโปรตีนอื่นๆ หลายชนิด ได้แก่F-actin , α-tubulin , light chain dynein , WASP , Band 3 anion exchanger, phospholipase D ( PLD2 ), glucose transporter GLUT4 , inositol trisphosphate , V-ATPaseและ ARNO ( ปัจจัยแลกเปลี่ยนนิวคลีโอไทด์กัวนี น ของARF6 ) เชื่อกันว่าความสัมพันธ์เหล่านี้ส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับโครงสร้างของเซลล์ อย่างไรก็ตาม มีการสำรวจถึงการมีส่วนร่วมในเอนโดไซโทซิส การบุกรุกของปรสิต การจัดเรียงโครงร่างเซลล์ใหม่ การเคลื่อนที่ของเซลล์ การขนส่งและการรีไซเคิลโปรตีนเยื่อหุ้มเซลล์ การส่งสัญญาณ และการแบ่งส่วนของเนื้อเยื่อ[ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]

อ่านเพิ่มเติม

  • Berry A, Marshall KE (กุมภาพันธ์ 1993). "การระบุลิแกนด์ที่จับกับสังกะสีในฟรุกโตส-1,6-บิสฟอสเฟตอัลโดเลสคลาส II ของ Escherichia coli" FEBS Lett . 318 ( 1): 11– 6. Bibcode : 1993FEBSL.318...11B . doi : 10.1016/0014-5793(93)81317-S . PMID  8436219. S2CID  7682431 .
  • Freemont PS, Dunbar B, Fothergill-Gilmore LA (กุมภาพันธ์ 1988). "ลำดับกรดอะมิโนที่สมบูรณ์ของฟรุกโตส-บิสฟอสเฟตอัลโดเลสของกล้ามเนื้อโครงร่างมนุษย์" . Biochem. J . 249 (3): 779– 88. doi : 10.1042/bj2490779 . PMC  1148774 . PMID  3355497 .
  • กัลคิน เอ, ลี ซี, ลี แอล, คูลาโควา แอล, ปาล แอลอาร์, ดูนาเวย์-มาเรียโน ดี, เฮิร์ซเบิร์ก โอ (2009) "ข้อมูลเชิงลึกเชิงโครงสร้างเกี่ยวกับการจับตัวของสารตั้งต้นและการเลือกสเตอริโอของไกอาร์เดียฟรุกโตส-1,6-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส " ชีวเคมี . 48 (14): 3186– 96. ดอย : 10.1021/bi9001166 . PMC2666783  . PMID19236002  .​
  • Marsh JJ, Lebherz HG (มีนาคม 1992). "ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟตอัลโดเลส: ประวัติวิวัฒนาการ". Trends Biochem. Sci . 17 (3): 110– 3. doi : 10.1016/0968-0004(92)90247-7 . PMID  1412694 .
  • Perham RN (เมษายน 1990). "ฟรุกโตส-1,6-บิสฟอสเฟตอัลโดเลส: ปฏิกิริยาเดียวกัน แต่เอนไซม์ต่างกัน" Biochem. Soc. Trans . 18 (2): 185– 7. doi : 10.1042/bst0180185 . PMID  2199259 .
  • โลโก้ Wikimedia Commonsสื่อที่เกี่ยวข้องกับฟรุกโตส-บิสฟอสเฟตอัลโดเลสในวิกิมีเดียคอมมอนส์
  • ห้องปฏิบัติการโทลาน มหาวิทยาลัยบอสตัน
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Fructose-bisphosphate_aldolase&oldid=1312853884 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส

ฟรุกโตส-บิสฟอสเฟต อัลโดเลส ( EC 4.1.2.13 ) หรือเรียกสั้นๆ ว่า อัลโดเลส เป็น เอนไซม์ ที่เร่ง ปฏิกิริยาผันกลับได้ โดยจะแยกอั ลด อล ฟรุกโตส 1,6-บิสฟอสเฟต ออกเป็น ไตรโอส ฟอสเฟต...

กลไกและโครงสร้าง

โปรตีนคลาส I สร้าง ตัวกลาง Schiff base ที่มีโปรตอน เชื่อมโยง ไลซีน ใน บริเวณออกฤทธิ์ ที่มีการอนุรักษ์สูงกับ คาร์ บอนิล คาร์บอนของ DHAP นอกจากนี้ หมู่ไทโรซีนยังมีความสำคัญต่อกลไกนี้โดยทำหน้าที่เป็นตัวรับไฮโดรเจนที่เสถียร โปรตีนคลาส II...

ในกระบวนการสร้างกลูโคสและไกลโคไลซิส

กระบวนการสร้างกลูโคสจากสารที่ไม่ใช่คาร์โบไฮเดรต (Gluconeogenesis) และกระบวนการสลายกลูโคส (Glycolysis) มีปฏิกิริยาผันกลับได้ร่วมกัน 6 ขั้นตอน ในกระบวนการสร้างกลูโคสจากสารที่ไม่ใช่คาร์โบไฮเดรตนั้น กลีเซอรัลดีไฮด์-3-ฟอสเฟตจะถูกรีดิวซ์เป็นฟรุกโตส...

ในวัฏจักรของคาลวิน

วัฏจักร แคลวิน เป็น วิถี การตรึงคาร์บอน ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของการสังเคราะห์แสง ที่เปลี่ยนคาร์บอนไดออกไซด์และสารประกอบอื่นๆ ให้เป็นกลูโคส วัฏจักรแคลวินและ กลูโคเนโอเจเนซิส มีปฏิกิริยาผันกลับได้สี่ขั้นตอนร่วมกัน ในทั้งสองวิถี 3-ฟอสโฟกลีเซอเรต (3-PGA หรือ 3-PG)...