หลังจากเกิดสงครามกลางเมืองอเมริกากองทัพเรือของสมาพันธรัฐได้ซื้อเรือจำนวนหนึ่งเพื่อใช้ในทางการทหาร หนึ่งในนั้นคือเรือLizzie Simmons [ ^{6 ] ซึ่ง}ซื้อเมื่อวันที่ 12 ตุลาคม พ.ศ. 2404 ขณะอยู่ที่นิวออร์ลีนส์^{[ 1 ]} ในช่วงเดือนมกราคมและกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2405 เรือลำนี้ได้ผ่านกระบวนการดัดแปลงเป็นเรือปืน^{[ 3 ]}งานดัดแปลงใช้ไม้สนเกือบ 80,000 ฟุตบอร์ด โดยมีไม้ไซเปรสประมาณ 800 ฟุตบอร์ด และไม้โอ๊กอีก 800 ฟุตบอร์ด^{[ 7 ]} ฝ่ายสมาพันธรัฐได้ติดตั้งปืนใหญ่เจ็ดกระบอกให้กับเรือลำนี้ รวมถึงปืนลำกล้องเรียบขนาด 8 นิ้ว (20 ซม.)รุ่นคล้ายกับปืน Paixhansและ^{[ 5 ]}ปืนไรเฟิลขนาด 32 ปอนด์ (14.5 กิโลกรัม) สองกระบอก เรือลำนี้ ได้รับการเปลี่ยนชื่อเป็นPontchartrainและเข้ารับราชการในกองทัพฝ่ายใต้ในเดือนมีนาคม^{[ 1 ]}และอยู่ภายใต้การบังคับบัญชาของร้อยโทJohn W. Dunningtonซึ่งเคยประจำการบนเรือปืนCSS McRaeและCSS Tuscarora มาก่อน ^{[ 5 ]} หลังจากเข้ารับราชการแล้ว เรือลำนี้ถูกส่งขึ้นไปตามแม่น้ำมิสซิสซิปปีเพื่อสนับสนุนการป้องกันของฝ่ายใต้ที่เมืองโคลัมบัส รัฐเคนตักกี้^{[ 8 ]} 

เมื่อวันที่ 6 มีนาคม กองทหาร ฝ่ายสหภาพเข้ายึดครองพอยต์เพลแซนต์ รัฐมิสซูรีเพื่อพยายามตัดขาดกองกำลังป้องกันของฝ่ายสัมพันธมิตรที่เมืองนิวมาดริด รัฐมิสซูรีเรือ ปอนต์ชาร์เทรนและเรือปืนCSS General Polkถูกส่งไปตรวจสอบการเคลื่อนไหว หลังจากเข้าใกล้ชายฝั่งมากเกินไป เรือ ปอนต์ชาร์เทรนก็ถูกยิงด้วย ปืน คาบศิลาทำให้มีผู้เสียชีวิตหรือบาดเจ็บหลายคนบนเรือ เรือของฝ่ายสัมพันธมิตรทั้งสองลำยิงใส่ตำแหน่งของฝ่ายสหภาพและทำการโจมตีอีกหลายครั้งในช่วงสามวันถัดมา แต่ไม่สามารถขับไล่กองกำลังฝ่ายสหภาพได้^{[ 9 ]} หนึ่งสัปดาห์ต่อมา กองทหารฝ่ายสหภาพได้แสดงกำลังต่อต้านการป้องกันของฝ่ายสัมพันธมิตรที่เมืองนิวมาดริด และเรือปอนต์ชาร์เทรนได้เข้าร่วมกับป้อมปราการบนบกของฝ่ายสัมพันธมิตรในการยิงใส่กองทหารฝ่ายสหภาพ^{[ 10 ]} ฝ่ายสัมพันธมิตรตัดสินใจละทิ้งเมืองนิวมาดริด ในคืนนั้นเรือ Pontchartrainพร้อมด้วยเรือ McRaeเรือปืนCSS Ivyและเรือขนส่งอีกหลายลำ ได้นำทหารฝ่ายสัมพันธมิตร เสบียง และอาวุธจากป้อมแห่งหนึ่งที่ป้องกันเมืองนิวมาดริด ล่องแม่น้ำลงไปที่เมืองทิปตันวิลล์ รัฐเทนเนสซีผ่านตำแหน่งของฝ่ายสหภาพที่พอยต์เพลแซนต์ เรือ Pontchartrainมีหน้าที่ขนส่งกระสุนปืนใหญ่และทหารระหว่างการถอนกำลัง^{[ 11 ]}

เนื่องจากกองกำลังฝ่ายสัมพันธมิตรยังคงยึดครองเกาะหมายเลขสิบไว้ได้ กองกำลังฝ่ายสหภาพจึงได้ตั้งตำแหน่งปืนใหญ่ข้ามแม่น้ำมิสซิสซิปปีจากทิปตันวิลล์ โดยหวังว่าจะตัดเส้นทางส่งเสบียงเพียงเส้นเดียวไปยังเกาะหมายเลขสิบ ในวันที่ 18 มีนาคม ปืนใหญ่ของฝ่ายสหภาพที่ตำแหน่งใหม่ได้เปิดฉากยิงใส่เรือขนส่งของฝ่ายสัมพันธมิตรบางลำ เรือ Pontchartrain , Maurepas , General PolkและMcRaeถูกส่งลงไปตามแม่น้ำ ในระหว่างการปะทะกัน เรือMaurepasและGeneral Polkได้รับความเสียหาย และเรือของฝ่ายสัมพันธมิตรได้ถอนตัวลงไปตามแม่น้ำ แม้ว่าปืนใหญ่ของฝ่ายสหภาพจะถอนตัวไปชั่วคราว แต่ต่อมาพวกเขาก็กลับมาและพร้อมกับตำแหน่งที่ Point Pleasant ทำให้การส่งเสบียงทางแม่น้ำไปยังเกาะหมายเลขสิบเป็นไปได้ยาก^{[ 12 ]} ในต้นเดือนเมษายน เรือรบหุ้มเกราะของฝ่ายสหภาพสองลำแล่นลงไปตามแม่น้ำผ่านเกาะหมายเลขสิบ ตัดขาดกองกำลังฝ่ายสัมพันธมิตร ซึ่งพยายามถอนตัวแต่ถูกจับได้และถูกบังคับให้ยอมจำนน^{[ 13 ]}

เรือของฝ่ายสัมพันธมิตรถอนตัวไปยังป้อมพิลโลว์และหลังจากทราบว่ามีเรือของฝ่ายสหภาพอยู่ในบริเวณนั้น ก็ได้ออกโจมตี แต่ก็ถอนตัวอย่างรวดเร็วเมื่อทราบว่ากองเรือของฝ่ายสหภาพนั้นแข็งแกร่งและเตรียมพร้อม หลังจากนั้น^{[ 14 ]}เรือปอนต์ชาร์เทรนและมอเรปาสถูกย้ายไปประจำการที่แม่น้ำอาร์คันซอและแม่น้ำไวท์^{[ 3 ]} ปืนใหญ่ลำกล้องเกลียวขนาด 32 ปอนด์สองกระบอกถูกส่งจากปอนต์ชาร์เทรนไปยังเซนต์ชาร์ลส์ รัฐอาร์คันซอ [ ^{15 ] ใน}วันที่ 8 มิถุนายน เพื่อติดตั้งในป้อมปราการที่นั่น^{[ 3 ]}บนแม่น้ำไวท์ ตามที่นักประวัติศาสตร์เอ็ด แบร์สกล่าว เรือ ปอนต์ชาร์เทรนถูกส่งขึ้นไปตามแม่น้ำอาร์คันซอไปยังลิตเติลร็อกดังนั้นปืนจึงต้องถูกขนส่งทั้งทางรถไฟและทางน้ำเพื่อให้ไปถึงเซนต์ชาร์ลส์^{[ 16 ]}นีล ชาเตอแล็ง นักประวัติศาสตร์กองทัพเรือระบุว่า พอนต์ชา ร์เทรนเดินทางขึ้นไปตามแม่น้ำไวท์ก่อน ขนปืนใหญ่ลงที่เซนต์ชาร์ลส์ แล้วจึงเดินทางขึ้นไปตามแม่น้ำอาร์คันซอไปยังลิตเติลร็อก^{[ 17 ]}ดันนิงตันและลูกน้องบางส่วนอยู่ที่เซนต์ชาร์ลส์เพื่อประจำการปืนใหญ่ และอยู่ในเหตุการณ์เมื่อวันที่ 17 มิถุนายน เมื่อกองทัพสหภาพเข้ายึดตำแหน่งในยุทธการที่เซนต์ชาร์ลส์แม้ว่าดันนิงตันและลูกน้องจะสามารถหลบหนีการถูกจับกุมได้^{[ 3 ]}

ดันนิงตันนำลูกเรือที่เหลือเดินเท้ากลับไปยังปอนต์ชาร์เทรนจากนั้นจึงนำเรือล่องแม่น้ำอาร์คันซอไปยังป้อมฮินด์แมน [ ^{18 ] ปืน} ใหญ่ของเรือถูกขนลง และลูกเรือ 35 นายยังคงอยู่ประจำการ^{[ 19 ]}พร้อมกับดันนิงตัน^{[ 3 ]} จากนั้น ปอนต์ชาร์เทรนก็ล่องกลับขึ้นไปตามแม่น้ำไปยังลิตเติลร็อก^{[ 20 ]}ซึ่งฝ่ายสัมพันธมิตรเริ่มกระบวนการดัดแปลงเรือให้เป็นเรือพุ่งชนและเริ่มเสริมเกราะด้วยไม้และเหล็ก ดันนิงตันและลูกเรือถูกจับตัวในกลางเดือนมกราคม พ.ศ. 2406 ในยุทธการอาร์คันซอโพสต์ [ ^{3 ] ปอน}ต์ชาร์เทรนยังคงไม่ได้ใช้งานจนถึงฤดูร้อน^{[ 4 ]}ปอนต์ชาร์เทรน เป็นเรือรบฝ่ายสัมพันธมิตรเพียงลำเดียวที่ยังคงอยู่ในอาร์คันซอ^{[ 21 ]} ซึ่งเป็นสิ่งที่น่าเป็นห่วงสำหรับกองกำลังทางเรือของฝ่ายสหภาพ ในเดือนกุมภาพันธ์ มีการเสนอให้โจมตีขึ้นไปตามแม่น้ำอาร์คันซอเพื่อทำลายเรือปืน แต่ก็ไม่เคยเกิดขึ้น มีข่าวลือแพร่กระจายในเดือนเมษายนว่าเรือ Pontchartrainกำลังเตรียมโจมตี แต่ก็ไม่ได้เกิดขึ้นเช่นกัน^{[ 3 ]} นักประวัติศาสตร์ Mark K. Christ แนะนำว่าการเคลื่อนไหวทั้งสองครั้งไม่ได้เกิดขึ้นเนื่องจากระดับน้ำในแม่น้ำต่ำ^{[ 22 ]} รายงานข่าวกรองของฝ่ายสหภาพที่ไม่ได้รับการตรวจสอบจากเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2406 ระบุว่า เรือ Pontchartrainมีความสามารถในการติดตั้งปืนใหญ่เจ็ดกระบอก ซึ่งไม่มีอยู่จริง และมีการเพิ่มเกราะเหล็กเพื่อป้องกันเครื่องยนต์^{[ 7 ]}ในเดือนกันยายน ขณะที่กองกำลังฝ่ายสหภาพกำลังจะยึด Little Rockฝ่ายสัมพันธมิตรได้เผาเรือPontchartrain ^{[ 23 ]} Christ ระบุว่าเรือถูกเผาในวันที่ 10 กันยายน^{[ 3 ]}ในขณะที่นักประวัติศาสตร์กองทัพเรือ W. Craig Gaines ระบุว่าการเผาเกิดขึ้นในวันที่ 9 กันยายน^{[ 15 ]} มีการสร้างเครื่องหมายอนุสรณ์ขึ้น ณ จุดที่เรือถูกเผา^{[ 24 ]}