จาโคบา
| จาโคบา | |
|---|---|
| แมงกะพรุนสกุล Jakobidสี่ชนิด แสดงร่องและแฟลเจลลา: Jakoba libera (มุมมองด้านท้อง), Stygiella incarcerata (มุมมองด้านท้อง), Reclinomonas americana (มุมมองด้านหลัง) และHistiona aroides (มุมมองด้านท้อง) | |
| การจำแนกทางวิทยาศาสตร์ | |
| โดเมน: | ยูคาริโอตา |
| กลุ่มสายพันธุ์ : | ดิสโคบา |
| ระดับ: | จาโคเบีย |
| คำสั่ง: | จาโคบิดา |
| ลำดับย่อย: | ฮิสติโอนิน่า |
| ตระกูล: | Jakobidae Patterson, 1990 |
| ประเภท: | จาโคบาแพตเตอร์สัน, 1990 |
| ชนิดต้นแบบ | |
| จาโคบา ลิเบรา (รูเนน, 1938) แพตเตอร์สัน, 1990 | |
| สายพันธุ์ | |
Jakobaเป็นสกุลในกลุ่มอนุกรมวิธาน Excavata [ 1 ] [ 2 ]และปัจจุบันมีเพียงชนิดเดียวที่ได้รับการอธิบาย คือ Jakoba liberaซึ่งอธิบายโดย Pattersonในปี 1990 [ 3 ]และตั้งชื่อเพื่อเป็นเกียรติแก่นักพฤกษศาสตร์ชาวดัตช์ (Algology, Myology และ Lichenology) Jakoba Ruinen [ 4 ] ( Jakoba incarcerata ที่เคยได้รับการอธิบายก่อนหน้านี้ ได้รับการเปลี่ยนชื่อเป็น Andalucia incarcerataและ Jakoba bahamensis / Jakoba bahamiensisยังไม่ได้รับการอธิบายอย่างเป็นทางการ) [ 5 ]

ลักษณะและคุณสมบัติ
จาโคบาเป็นซูแฟลเจลเลต ( จาโคบิด ) ขนาดเล็กที่กินแบคทีเรีย พบได้ในสภาพแวดล้อม ทางทะเล [ 6 ]และน้ำเค็มจัด[ 5 ]พวกมันเป็นเซลล์โทรฟิกที่ว่ายน้ำได้อย่างอิสระ มีแฟลเจลลา สองเส้น และมีความยาวระหว่างห้าถึงสิบไมโครเมตร เซลล์จะหมุนตามแกนตามยาวเพื่อให้สามารถว่ายน้ำเป็นเส้นตรงได้[ 6 ]เว้นแต่จะเกิดการเสียรูปและ "การบิดตัว" เนื่องจากการบีบอัดในเศษซาก ในระหว่างการกินอาหาร แบคทีเรียจะถูกกำจัดออกจากคอลัมน์น้ำโดยกระแสน้ำที่สร้างขึ้นโดยแฟลเจลลัม ด้านหลัง กระแสน้ำนี้ทำให้แบคทีเรียรวมตัวกันในร่อง[ 7 ]ทางด้านขวาของท้องเซลล์[ 6 ] ซึ่งช่วยในการกลืนกินและการสร้างถุงอาหาร[ 7 ]
โครงสร้างระดับจุลภาค
ส่วนประกอบของเซลล์สำหรับJakobaไม่ได้มีความพิเศษเฉพาะตัว พวกมันมีนิวเคลียส เพียงหนึ่งเดียว ที่อยู่ใกล้กับฐานของแฟลเจลลามีกอลจิบอดี้ เพียงหนึ่งเดียว และครีสตาของไมโทคอนเดรีย มีลักษณะแบนราบ ซึ่งบ่งชี้ถึงความสัมพันธ์กับแท็กซาแพลทิคริสเตตอื่นๆ ไมโท คอนเด รียของJakobaมีความน่าสนใจเป็นพิเศษในเชิงวิวัฒนาการเนื่องจากมีจีโนมไมโทคอนเดรี ยที่ คล้ายแบคทีเรีย อันเป็นเอกลักษณ์ พบว่าจีโนมไมโทคอนเดรี ยของพวกมัน มีจำนวนยีน ที่ทำงานได้มากกว่ากลุ่ม ยูคาริโอตอื่นๆ อย่างมาก และดูเหมือนว่าพวกมันจะยังคงรักษาเอนไซม์RNA โพลีเมอเรส ของยูแบคทีเรียดั้งเดิมไว้ ซึ่งถูกแทนที่ด้วยโพลีเมอเรสชนิดไวรัสในยูคาริโอตไมโทคอนเดรียอื่นๆ ทั้งหมด โดยรวมแล้วจีโนมไมโทคอนเดรียของจาโคบิดมีความซับซ้อนแบบดั้งเดิม เนื่องจากมีลักษณะคล้ายกับบรรพบุรุษโปรตีโอแบคทีเรียมากกว่าไมโทคอนเดรียอื่น ๆ [ 8 ]
วงจรชีวิต
Jakobaสืบพันธุ์แบบไม่อาศัยเพศโดยการแบ่งตัวแบบไบนารีการสืบพันธุ์แบบอาศัยเพศหรือการสร้างซีสต์ยังไม่ได้รับการสังเกต[ 6 ]
ข้อมูลลำดับโมเลกุล
“จีโนมไมโทคอนเดรียแบบวงกลมของJakoba liberaสายพันธุ์ ATCC 50422 มีขนาด 96.6 กิโลเบสคู่ (kbp) การจัดลำดับใกล้เสร็จสมบูรณ์แล้ว ในปัจจุบันมีการระบุยีนได้ 77 ยีน โดยไม่มีอินทรอน บริเวณระหว่างยีนคิดเป็นประมาณ 30% ของจีโนมและประกอบด้วยกลุ่มของลำดับซ้ำแบบเรียงต่อกันซึ่งมีความยาวหน่วยประมาณ 20 เบสคู่ ยีนที่ถูกถอดรหัสพบได้ทั้งในสายดีเอ็นเอ ทั้งสองสาย รหัสพันธุกรรมมาตรฐานถูกใช้สำหรับการแปล รหัส ยีนที่ถูกเข้ารหัสรวมถึงยีนที่พบได้ทั่วไปในmtDNAรวมถึงยีนที่เข้ารหัสโปรตีน nad1,2,3,4,4L,5,6, cob, cox1,2,3 และ atp6,8,9 รวมถึงยีน rRNA หน่วยย่อยขนาดใหญ่ (rnl) และหน่วยย่อยขนาดเล็ก (rns) และ ยีน tRNA มากกว่า 22 ยีน นอกจากนี้ยังมีจำนวนยีนโปรตีนที่เป็นลักษณะเฉพาะของโปรติสต์ แต่ไม่พบใน mtDNA ของสัตว์หรือเชื้อรา ซึ่งรวมถึง nad7,9,11, atp1, rpl2,5,6,14,16 และ rps2-4,11-14,19 นอกจากนี้ mtDNA ของ J. libera ยังเข้ารหัส ORF ที่มีลักษณะเฉพาะอีกหลายตัวด้วย ” “ยีนไมโทคอนเดรียของ J. liberaหลายตัว นั้น หายากหรือไม่มีอยู่ในจีโนมไมโทคอนเดรียอื่นๆ แต่มีอยู่ในแบคทีเรีย ในบรรดายีนที่เข้ารหัสโดย mtDNAที่หายากหรือมีลักษณะเฉพาะเหล่านี้ได้แก่ dpo, rpoB,C, rrn5, rnpB, tufA, yejU-W และยีนโปรตีนไรโบโซมหลายตัว” “การเปรียบเทียบลำดับยีนในmtDNAของJ. libera …” แสดงให้เห็น “คลัสเตอร์ที่ปกติแล้วไม่พบในแบคทีเรียแต่เห็นได้ชัดว่าปรากฏขึ้นในระหว่างวิวัฒนาการของจีโนมไมโทคอนเดรียหลังจากที่โปรโตไมโทคอนเดรียแยกตัวออกจากสายพันธุ์แบคทีเรีย ตัวอย่างเช่น คลัสเตอร์ sdh3 ถึง nad5 (ประกอบด้วย 5 ยีน) atp8-[trn]-rps4-atp9 และ nad11-nad1-cox11-cox3-tufA” [ 9 ]
วัฒนธรรม
ปัจจุบันมีJakoba libera สามสายพันธุ์ ที่สามารถเพาะเลี้ยงได้ ไม่สามารถเพาะเลี้ยงแบบปลอดเชื้อได้แต่สามารถเพาะเลี้ยงได้ง่ายในอาหารเลี้ยงเชื้อขั้นต่ำโดยเติมแบคทีเรีย ( Klebsiella aerogenes ) [ 6 ]
สกุลที่คล้ายคลึงกัน
จาโกบิดส์ ( จาโกบิดะหรือจาโกเบีย )
- ฮิสติโอน่า : 2-3 ชนิด
- Reclinomonas : 1 สปีชีส์ [ 10 ]
Malawimonas : 1 ชนิดที่ได้รับการอธิบายแล้ว