ในช่วง 300 ปีแรกภายในจักรวรรดิโรมันคริสตจักรถูกกดขี่ข่มเหงและไม่สามารถถือครองหรือโอนทรัพย์สินได้^{[ 15 ]}กลุ่มผู้ศรัทธาในยุคแรกๆ ประชุมกันในห้องที่จัดไว้เพื่อจุดประสงค์นี้ในบ้านของผู้ศรัทธาที่ร่ำรวย และโบสถ์ที่มีชื่อเฉพาะ จำนวนหนึ่ง ซึ่งตั้งอยู่ชานเมืองโรมนั้นถือเป็นทรัพย์สินของบุคคล ไม่ใช่ขององค์กรใดๆ อย่างไรก็ตาม ทรัพย์สินที่สมาชิกแต่ละคนของคริสตจักรโรมันถือครองอยู่ไม่ว่าจะโดยชื่อหรือโดยแท้จริง มักจะได้รับการปฏิบัติเสมือนเป็นมรดกส่วนรวมที่ส่งต่อให้กับ "ทายาท" ที่ถูกต้องตามกฎหมายของทรัพย์สินนั้น ซึ่งมักจะเป็นผู้ช่วยบาทหลวงอาวุโสซึ่งเป็นผู้ช่วยของบิชอปท้องถิ่น มรดกส่วนรวมนี้มีมูลค่าค่อนข้างมาก เนื่องจากไม่เพียงแต่รวมถึงบ้านเรือน ฯลฯ ในโรมหรือบริเวณใกล้เคียงเท่านั้น แต่ยังรวมถึงที่ดิน เช่นlatifundiaทั้งหมดหรือบางส่วนทั่วอิตาลีและที่อื่นๆ ด้วย^{[ 16 ]}

กฎหมายของจักรพรรดิคอนสแตนตินมหาราชซึ่งประกาศใช้ในปี ค.ศ. 321 อนุญาตให้คริสตจักรครอบครองทรัพย์สินและคืนทรัพย์สินใดๆ ที่เคยถูกยึดไปก่อนหน้านี้ ในเมืองใหญ่ๆ ของจักรวรรดินี้ ทรัพย์สินที่ได้รับคืนน่าจะมีมูลค่าค่อนข้างมาก โดยเฉพาะทรัพย์สินของโรมัน^{[ 15 ]}พระราชวังลาเตรานถูกมอบให้แก่กองมรดก ซึ่งน่าจะเป็นเพราะจักรพรรดิคอนสแตนตินเอง^{[ 15 ]}

มีการบริจาคอื่นๆ ตามมา โดยส่วนใหญ่อยู่ในแผ่นดินใหญ่ของอิตาลี แต่ก็มีอยู่ในจังหวัดต่างๆ ของจักรวรรดิโรมันด้วย อย่างไรก็ตาม คริสตจักรโรมันถือครองที่ดินเหล่านี้ทั้งหมดในฐานะเจ้าของที่ดินส่วนตัว ไม่ใช่ในฐานะหน่วยงานอธิปไตย หลังจากการล่มสลายของจักรวรรดิโรมันตะวันตกสันตะปาปาพบว่าตนเองอยู่ในสถานะที่เปราะบางและอ่อนแอมากขึ้นเรื่อยๆ เมื่ออำนาจส่วนกลางของโรมันแตกสลายไปตลอดช่วงปลายศตวรรษที่ 5 การควบคุมคาบสมุทรอิตาลีจึงเปลี่ยนมือไปมาหลายครั้ง ตกอยู่ภายใต้ อำนาจของ อาริ อุส ของโอโดอาเซอร์ในปี 473 และในปี 493 ธีโอดอริก กษัตริย์ แห่งออ สโตรกอธ กษัตริย์ออสโตรก อธจะยังคงปกครองอิตาลีส่วนใหญ่ต่อไปจนถึงปี 554 คริสตจักรโรมันจำเป็นต้องยอมจำนนต่ออำนาจอธิปไตยของพวกเขา ในขณะเดียวกันก็ยืนยันอำนาจทางจิตวิญญาณเหนือคริสต์ศาสนาทั้งหมด^{[ 17 ]}

นับตั้งแต่ปี 535 จักรพรรดิจัสติเนียนที่ 1 แห่งไบแซนไทน์ ได้เริ่ม การรณรงค์หลายครั้งเพื่อแย่งชิงอิตาลีจากชาวออสโตรกอธ ซึ่งดำเนินต่อไปจนถึงปี 554 และทำลายโครงสร้างทางการเมืองและเศรษฐกิจของอิตาลี ไบแซนไทน์ได้ก่อตั้งเขตปกครองราเวนนาขึ้น โดย ที่ดัชชีแห่งโรมซึ่ง เป็นพื้นที่ที่มีอาณาเขตใกล้เคียงกับ แคว้นลาซิโอในปัจจุบันเป็นเขตการปกครองย่อย ในปี 568 ชาวลอมบาร์ดได้เข้ามาในคาบสมุทรจากทางเหนือ ก่อตั้งอาณาจักรอิตาลี ของตนเอง และในอีกสองศตวรรษต่อมา พวกเขาก็ได้พิชิตดินแดนอิตาลีส่วนใหญ่ที่ไบแซนไทน์เพิ่งยึดคืนมาได้ ในศตวรรษที่ 7 อำนาจของไบแซนไทน์ส่วนใหญ่จำกัดอยู่เพียงแถบแนวทแยงที่ทอดยาวจากราเวนนา ซึ่งเป็นที่ตั้งของผู้ว่าการหรือ เอกซาร์คของจักรพรรดิไปยังโรมและลงใต้ไปยังเนเปิลส์รวมทั้งดินแดนชายฝั่งที่แยกออกไป^{[ 18 ]}ทางเหนือของเนเปิลส์ แถบการควบคุมของไบแซนไทน์หดตัวลง และพรมแดนของทางเดินโรม-ราเวนนาก็แคบลงอย่างมาก^{[ 19 ] [ 20 ] [ 21 ]}

ด้วยอำนาจของไบแซนไทน์ที่มีอิทธิพลอย่างมากทางตะวันออกเฉียงเหนือของดินแดนนี้ พระสันตะปาปาในฐานะเจ้าของที่ดินรายใหญ่ที่สุดและบุคคลที่มีเกียรติที่สุดในอิตาลี จึงเริ่มรับอำนาจการปกครองส่วนใหญ่ที่ไบแซนไทน์ไม่สามารถใช้ได้ในพื้นที่รอบเมืองโรมโดยปริยาย^{[ 22 ]}แม้ว่าตามกฎหมายแล้วพระสันตะปาปายังคงเป็น "พลเมืองโรมัน" ภายใต้อำนาจของไบแซนไทน์ แต่ในทางปฏิบัติ ดัชชีแห่งโรมกลายเป็นรัฐอิสระ^{[ 23 ]}

การสนับสนุนจากประชาชนที่มีต่อพระสันตะปาปาในอิตาลีทำให้พระสันตะปาปาหลายองค์สามารถฝ่าฝืนพระประสงค์ของจักรพรรดิไบแซนไทน์ได้ เช่น พระสันตะปาปาเกรกอรีที่ 2 ขับไล่จักรพรรดิเลโอที่ 3 ออกจากศาสนา ในช่วงสงครามทำลายรูปเคารพ [ ^{24 ] อย่างไรก็ตาม}พระสันตะปาปาและผู้ปกครองแคว้นยังคงทำงานร่วมกันเพื่อจำกัดอำนาจที่เพิ่มขึ้นของชาวลอมบาร์ดในอิตาลี แม้ว่าอำนาจของไบแซนไทน์จะอ่อนแอลง แต่พระสันตะปาปาก็มีบทบาทมากขึ้นในการปกป้องกรุงโรมจากชาวลอมบาร์ด แต่เนื่องจากขาดการควบคุมโดยตรงเหนือทรัพย์สินทางทหารจำนวนมาก พระสันตะปาปาจึงต้องพึ่งพาการทูตเป็นหลักเพื่อให้บรรลุเป้าหมาย^{[ 25 ]}ในทางปฏิบัติ ความพยายามของพระสันตะปาปาเหล่านี้ทำให้การขยายอำนาจ ของชาวลอมบาร์ดมุ่งเป้า ไปที่ผู้ปกครองแคว้นและเมืองราเวนนา ช่วงเวลาสำคัญในการก่อตั้งรัฐสันตะปาปาคือข้อตกลงเกี่ยวกับเขตแดนที่ระบุไว้ในการบริจาคเมืองสุตรี (728) ของ กษัตริย์ลอม บาร์ด ลิวท์ ปรานด์ ให้แก่ พระสันตะปาปาเกรกอรีที่ 2 ^{[ 26 ]}

เมื่อเขตปกครองราเวนนาตกอยู่ภายใต้การปกครองของชาวลอมบาร์ดในที่สุดในปี 751 ^{[ 27 ]}ดัชชีแห่งโรมจึงถูกตัดขาดจากจักรวรรดิไบแซนไทน์โดยสิ้นเชิง ซึ่งในทางทฤษฎีแล้วยังคงเป็นส่วนหนึ่งของจักรวรรดิไบแซนไทน์อยู่ พระสันตะปาปาได้พยายามอีกครั้งเพื่อขอการสนับสนุนจากชาวแฟรงก์ในปี 751 พระสันตะปาปาแซคารีได้ สวม มงกุฎให้เปแปงผู้เตี้ยเป็นกษัตริย์แทนที่กษัตริย์ ชิลเดอริก ที่ 3 แห่งราชวงศ์เมโรวิงเกียน ผู้ไร้อำนาจ ต่อมาพระสันตะปาปาสตีเฟนที่ 2 ผู้สืบทอดตำแหน่งของแซคารี ได้พระราชทานตำแหน่งแพทริเชียนแห่งโรมัน แก่เป แปง เปแปงนำกองทัพแฟรงก์เข้าสู่อิตาลีในปี 754 และ 756 เอาชนะชาวลอมบาร์ด จึงเข้าควบคุมอิตาลีตอนเหนือ และมอบดินแดนที่เคยเป็นเขตปกครองราเวนนาให้แก่พระสันตะปาปา

ต่อมามีผู้กล่าวอ้างว่าในปี 781 ชาร์lemagneได้ขยายอาณาเขตที่พระสันตะปาปาจะทรงเป็นผู้ปกครองทางโลก ได้แก่ ดัชชีแห่งโรม ราเวนนาดัชชีแห่งเพนตาโพลิสบางส่วนของดัชชีแห่งเบเนเวนโตทัสคานีคอร์ซิกาลอมบาร์ดีและเมืองต่างๆ ในอิตาลี ความร่วมมือระหว่างพระสันตะปาปาและราชวงศ์คาโรลิงเจียนถึงจุดสูงสุดในปี 800 เมื่อพระสันตะปาปาเลโอที่ 3 ทรงสวมมงกุฎให้ชาร์lemagne เป็น' จักรพรรดิแห่งชาวโรมัน '

ตั้งแต่ศตวรรษที่ 9 ถึงศตวรรษที่ 12 ลักษณะความสัมพันธ์ที่แท้จริงระหว่างพระสันตะปาปาและจักรพรรดิรวมถึงระหว่างรัฐสันตะปาปาและจักรวรรดิยังคงเป็นที่ถกเถียงกันอยู่ ยังไม่ชัดเจนว่ารัฐสันตะปาปาเป็นอาณาจักรแยกต่างหากที่มีพระสันตะปาปาเป็นผู้ปกครองสูงสุด หรือเป็นส่วนหนึ่งของจักรวรรดิแฟรงก์ที่พระสันตะปาปามีอำนาจปกครอง ดังที่เสนอไว้ในตำราLibellus de imperatoria potestate in urbe Roma ในช่วงปลายศตวรรษที่ 9 หรือว่าจักรพรรดิโรมันอันศักดิ์สิทธิ์เป็นผู้แทนของพระสันตะปาปาในการปกครองคริสต์ศาสนา โดยพระสันตะปาปามีหน้าที่รับผิดชอบโดยตรงเฉพาะบริเวณรอบกรุงโรมและหน้าที่ทางจิตวิญญาณเท่านั้น

จักรวรรดิโรมันอันศักดิ์สิทธิ์ในรูปแบบของแฟรงก์ล่มสลายลงเมื่อถูกแบ่งแยกออกเป็นส่วนๆ ในหมู่ หลานๆ ของ ชาร์เลมาญอำนาจของจักรวรรดิในอิตาลีลดลงและเกียรติภูมิของสันตะปาปาก็เสื่อมถอยลง ส่งผลให้อำนาจของขุนนางโรมันท้องถิ่นเพิ่มสูงขึ้น และการควบคุมรัฐสันตะปาปาในช่วงต้นศตวรรษที่ 10 ตกอยู่ภายใต้การปกครองของตระกูลขุนนางที่มีอำนาจและฉ้อฉลอย่างตระกูลธีโอฟิแลคติช่วงเวลานี้ต่อมาถูกขนานนามว่าSaeculum obscurum ("ยุคมืด") และบางครั้งก็เรียกว่า "การปกครองโดยโสเภณี" ^{[ 28 ]}

ในทางปฏิบัติ บรรดาพระสันตะปาปาไม่สามารถใช้อำนาจอธิปไตยได้อย่างมีประสิทธิภาพเหนือดินแดนอันกว้างใหญ่และเป็นภูเขาของรัฐสันตะปาปา และภูมิภาคนี้ยังคงรักษาระบบการปกครองแบบเดิมไว้ โดยมีเขตปกครองย่อยและเขตมาร์ควิสจำนวนมาก แต่ละแห่งมีศูนย์กลางอยู่ที่ป้อมปราการร็อคกา

ในช่วงกลางศตวรรษที่ 10 ผู้ปกครองชาวเยอรมันออตโตที่ 1ได้พิชิตอิตาลีตอนเหนือ ในช่วงการรณรงค์หลายครั้ง สมเด็จพระสันตะปาปาจอห์นที่ 12ทรงสวมมงกุฎให้เขาเป็นจักรพรรดิ (เป็นจักรพรรดิองค์แรกที่ได้รับการสวมมงกุฎในรอบกว่า 40 ปี) และทั้งสองพระองค์ได้ให้สัตยาบันในDiploma Ottonianumซึ่งทำให้จักรพรรดิกลายเป็นผู้ค้ำประกันความเป็นอิสระของรัฐสันตะปาปา^{[ 29 ]}อย่างไรก็ตาม ในอีกสองศตวรรษต่อมา สมเด็จพระสันตะปาปาและจักรพรรดิได้ทะเลาะวิวาทกันในหลายประเด็น และผู้ปกครองชาวเยอรมันมักจะปฏิบัติต่อรัฐสันตะปาปาเสมือนเป็นส่วนหนึ่งของอาณาจักรของตนในโอกาสที่พวกเขาขยายอำนาจไปยังอิตาลีตอนเหนือและตอนกลาง เมื่อการปฏิรูปเกรกอเรียนได้ ดำเนินการเพื่อปลดปล่อยการบริหารงานของศาสนจักรจากการแทรกแซงของจักรวรรดิ ความเป็นอิสระของรัฐสันตะปาปาจึงมีความสำคัญมากขึ้น หลังจาก ราชวงศ์โฮเฮนสเตาเฟนสิ้นสุดลง จักรพรรดิ ชาวเยอรมันก็แทบจะไม่แทรกแซงกิจการของอิตาลีอีกเลย เพื่อตอบสนองต่อการต่อสู้ระหว่างกเวลฟ์และกิเบลลินสนธิสัญญาเวนิสจึงถูกลงนามในปี 1177 ในสนธิสัญญานี้ สิทธิของราชบัลลังก์ในกรุงโรมและในทรัพย์สินของนักบุญปีเตอร์ถูกปล่อยให้คลุมเครือ ในขณะที่สิทธิในการครอบครองของพระสันตะปาปา รวมถึงตำแหน่งผู้สำเร็จราชการแห่งเมืองโรม ได้รับการยอมรับ แต่ "สงวนสิทธิทั้งหมดของจักรวรรดิ" ^{[ 30 ]}ภายในปี 1300 รัฐสันตะปาปาพร้อมกับรัฐเจ้าผู้ครองนครอิตาลีที่เหลือก็เป็นอิสระอย่างแท้จริง

ตั้งแต่ปี ค.ศ. 1305 ถึง 1378 พระสันตะปาปาประทับอยู่ในเขตปกครองของพระสันตะปาปาที่เมืองอาวิญงซึ่งล้อมรอบด้วยแคว้นโปรวองซ์และอยู่ภายใต้อิทธิพลของกษัตริย์ฝรั่งเศส^{[ 31 ] [ 32 ] [ 33 ] [ 34 ] [ 35 ]}ช่วงเวลานี้เป็นที่รู้จักกันในชื่อ "ยุคอาวิญง" หรือ "ยุคถูกจองจำในบาบิโลน" ^{[ 36 ]}ในช่วงเวลานี้ เมืองอาวิญงและเมืองComtat Venaissin ที่อยู่โดยรอบถูกผนวกเข้ากับรัฐสันตะปาปา และยังคงเป็นดินแดนของพระสันตะปาปาเป็นเวลาประมาณ 400 ปี แม้หลังจากที่พระสันตะปาปาเสด็จกลับไปยังกรุงโรม แล้วจนกระทั่งถูกยึดและผนวกเข้ากับรัฐฝรั่งเศสในช่วงการปฏิวัติฝรั่งเศส

ในช่วงที่พระสันตะปาปาประทับอยู่ที่อาวิญงเหล่าผู้ปกครองท้องถิ่นได้ฉวยโอกาสในช่วงที่พระสันตะปาปาไม่อยู่ เพื่อสถาปนาตนเองในเมืองที่ถือว่าเป็นเมืองของพระสันตะปาปาอย่างเป็นทางการ เช่นตระกูลเปโปลีในโบโลญญาตระกูลออร์เดลาฟีในฟอร์ลี ตระกูล มันเฟรดีในฟาเอนซาและตระกูลมาลาเตสตาในริมินีต่างก็ให้การยอมรับผู้ปกครองที่เป็นพระสันตะปาปาอย่างเป็นทางการ และได้รับการประกาศให้เป็นผู้แทนของศาสนจักร

ในเฟอร์รารา การเสียชีวิตของAzzo VIII d'Esteโดยไม่มีทายาทโดยชอบธรรม (1308 ^{[ 37 ]} ) กระตุ้นให้สมเด็จพระสันตะปาปาเคลเมนต์ที่ 5 ทรง นำเฟอร์รารามาอยู่ภายใต้การปกครองโดยตรงของพระองค์ อย่างไรก็ตาม เฟอร์ราราถูกปกครองโดยผู้แทนที่พระองค์ทรงแต่งตั้ง คือ พระเจ้าโรเบิร์ตแห่งเนเปิลส์เพียงเก้าปีก่อนที่พลเมืองจะเรียกตัวEste กลับจากการเนรเทศ (1317) การห้ามและการขับไล่ออกจากศาสนาเป็นโมฆะ เพราะในปี 1332 จอห์นที่ 22 จำเป็นต้องแต่งตั้งพี่น้อง Este สามคนเป็นผู้แทนของพระองค์ในเฟอร์รารา^{[ 38 ]}

ในกรุงโรมเอง ตระกูลออร์ซินีและโคลอนนาต่อสู้แย่งชิงอำนาจกัน^{[ 39 ]} โดยแบ่งเขต การปกครองของเมืองระหว่างกัน ความวุ่นวายของชนชั้นสูงที่เกิดขึ้นในเมืองเป็นฉากหลังให้กับความฝันอันเพ้อเจ้อเรื่องประชาธิปไตยสากลของโคลา ดิ ริเอนโซผู้ได้รับการยกย่องให้เป็นผู้แทนราษฎรในปี 1347 ^{[ 40 ]}และต้องพบกับจุดจบที่โหดร้ายในช่วงต้นเดือนตุลาคมปี 1354 เมื่อเขาถูกลอบสังหารโดยผู้สนับสนุนของตระกูลโคลอนนา^{[ 41 ]}สำหรับหลายคน แทนที่จะเป็นผู้แทนราษฎรโรมันโบราณที่เกิดใหม่ เขากลับกลายเป็นเพียงทรราชอีกคนหนึ่งที่ใช้ถ้อยคำเกี่ยวกับการฟื้นฟูและการเกิดใหม่ของโรมันเพื่อปกปิดการแย่งชิงอำนาจของเขา^{[ 41 ]}ดังที่กุยโด รุจเจโรกล่าวไว้ว่า "แม้จะได้รับการสนับสนุนจากเปตราร์คการกลับไปสู่ยุคแรกเริ่มและการเกิดใหม่ของกรุงโรมโบราณของเขาก็ไม่อาจประสบความสำเร็จได้" ^{[ 41 ]}

เหตุการณ์ที่เมืองริเอนโซก่อให้เกิดความพยายามครั้งใหม่จากสันตะปาปาที่ไม่อยู่ในพื้นที่ เพื่อฟื้นฟูความสงบเรียบร้อยในรัฐสันตะปาปาที่กำลังแตกสลาย ส่งผลให้คาร์ดินัล กิล อัลวาเรซ การ์ริลโล เด อัลบอร์โนซซึ่งได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้แทนสันตะปาปา และกองทหารรับจ้างขนาดเล็กของเขา มีความคืบหน้าทางทหาร หลังจากได้รับการสนับสนุนจากอาร์คบิชอปแห่งมิลาน โจวันนี วิสคอนติเขาได้เอาชนะโจวันนี ดิ วิโกเจ้าเมืองวิแตร์โบ และ เคลื่อนทัพเข้าโจมตีกาเลออตโต มาลาเตสตาแห่งริมินี และตระกูล ออร์เดลาฟฟี แห่งฟอร์ลี ตระกูลมอนเต เฟลโต แห่งอูร์บิโนและตระกูลดา โปเลนตา แห่งราเวนนารวมถึงเมืองเซนิกัลเลียและอันโคนาผู้ที่ยังคงต่อต้านการควบคุมของสันตะปาปาอย่างเต็มรูปแบบเป็นกลุ่มสุดท้ายคือโจวันนี มันเฟรดีแห่งฟาเอนซา และฟรานเชสโกที่ 2 ออร์เดลาฟฟีแห่งฟอร์ลี เมื่ออัลบอร์โนซถูกเรียกตัวกลับ ในการประชุมกับผู้แทนพระสันตะปาปาทั้งหมดเมื่อวันที่ 29 เมษายน ค.ศ. 1357 ได้ประกาศใช้กฎหมาย Constitutiones Sanctæ Matris Ecclesiæซึ่งแทนที่กฎหมายท้องถิ่นที่กระจัดกระจายและ 'เสรีภาพ' แบบดั้งเดิมที่สะสมมาด้วยประมวลกฎหมายแพ่งที่เป็นเอกภาพ กฎหมายConstitutiones Aegidianae (ตามที่เรียกกันอย่างไม่เป็นทางการ) นี้ถือเป็นจุดเปลี่ยนสำคัญในประวัติศาสตร์กฎหมายของรัฐสันตะปาปา และยังคงมีผลบังคับใช้จนถึงปี ค.ศ. 1816 สมเด็จพระสันตะปาปาเออร์บันที่ 5ทรงพยายามเสด็จกลับอิตาลีในปี ค.ศ. 1367 ซึ่งพิสูจน์แล้วว่าเร็วเกินไป พระองค์เสด็จกลับอาวิญงในปี ค.ศ. 1370 ก่อนสิ้นพระชนม์ไม่นาน^{[ 42 ]}

ในช่วงยุคฟื้นฟูศิลปวิทยา อาณาเขตของพระสันตะปาปาขยายตัวอย่างมาก โดยเฉพาะอย่างยิ่งในสมัยของพระสันตะปาปาอเล็กซานเดอร์ที่ 6และจูเลียสที่ 2นอกจากจะเป็นประมุขของศาสนจักรแล้ว พระสันตะปาปายังกลายเป็นผู้ปกครองทางโลกที่สำคัญที่สุดคนหนึ่งของอิตาลี โดยทรงลงนามในสนธิสัญญากับกษัตริย์องค์อื่นๆ และทำสงคราม อย่างไรก็ตาม ในทางปฏิบัติ ดินแดนส่วนใหญ่ของรัฐสันตะปาปายังคงอยู่ภายใต้การควบคุมของพระสันตะปาปาเพียงในนามเท่านั้น และดินแดนส่วนใหญ่ถูกปกครองโดยเจ้าชายเล็กๆ การควบคุมนั้นมีการแย่งชิงกันอยู่เสมอ ที่จริงแล้ว ต้องรอจนถึงศตวรรษที่ 16 กว่าที่พระสันตะปาปาจะมีอำนาจควบคุมอย่างแท้จริงเหนือดินแดนทั้งหมดของพระองค์

ความรับผิดชอบของพระสันตะปาปามักขัดแย้งกัน รัฐสันตะปาปามีส่วนเกี่ยวข้องในสงครามอย่างน้อยสามครั้งในช่วงสองทศวรรษแรกของศตวรรษที่ 16 ^{[ 43 ]}จูเลียสที่ 2 "พระสันตะปาปานักรบ" ต่อสู้เพื่อพวกเขา

การปฏิรูปศาสนาเริ่มต้นขึ้นในปี 1517 ในปี 1527 ก่อนที่จักรวรรดิโรมันอันศักดิ์สิทธิ์จะต่อสู้กับพวกโปรเตสแตนต์ กองทหารที่ภักดีต่อจักรพรรดิชาร์ลส์ที่ 5 ได้เข้าปล้นสะดมกรุงโรมอย่างโหดร้ายและคุมขังสมเด็จพระสันตะปาปาเคลเมนต์ที่ 7ซึ่งเป็นผลข้างเคียงของการต่อสู้แย่งชิงรัฐสันตะปาปา^{[ 44 ]}ดังนั้นเคลเมนต์ที่ 7 จึงถูกบังคับให้สละเมืองปาร์มาโมเดนาและดินแดนเล็กๆ อีกหลายแห่ง^{[ 45 ] [ 44 ]}หนึ่งชั่วอายุคนต่อมา กองทัพของพระเจ้าฟิลิปที่ 2 แห่งสเปนได้เอาชนะกองทัพของสมเด็จพระสันตะปาปาปอลที่ 4ในสงครามอิตาลีปี 1551–1559ซึ่งเป็นการต่อสู้เพื่อป้องกันการครอบงำของสเปนในอิตาลีที่เพิ่มมากขึ้น^{[ 46 ]}

ช่วงเวลานี้ได้เห็นการฟื้นคืนอำนาจทางโลกของพระสันตะปาปาในรัฐสันตะปาปาอย่างค่อยเป็นค่อยไป ตลอดศตวรรษที่ 16 ดินแดนศักดินา ที่แทบจะเป็นอิสระ เช่น ริมินี (ซึ่งเป็นทรัพย์สินของตระกูลมาลาเตสตา) ได้ถูกนำกลับมาอยู่ภายใต้การควบคุมของพระสันตะปาปา ในปี 1512 รัฐของศาสนจักรได้ผนวกปาร์มาและปิอาเชนซา ซึ่งในปี 1545 ได้กลายเป็นดัชชี อิสระ ภายใต้โอรสที่เกิดจากภรรยานอกสมรสของพระสันตะปาปาปอลที่ 3แม้ว่าจะยังคงเป็นดินแดนศักดินาของพระสันตะปาปา กระบวนการนี้สิ้นสุดลงด้วยการทวงคืนดัชชีเฟอร์ราราในปี 1598 ^{[ 47 ] [ 48 ]}และดัชชีอูร์บิโนในปี 1631 ^{[ 49 ]}

แม้ว่ารัฐสันตะปาปาจะมีการรวมศูนย์การบริหารอย่างมีนัยสำคัญ แต่ในทางปฏิบัติแล้ว รัฐบาลของพวกเขายังคงตั้งอยู่บนสองเสาหลัก ได้แก่ แกนนำทางศาสนาที่อยู่ใจกลางประเทศ และเครือข่ายของขุนนางในเมืองต่างๆ ในภูมิภาค โดยเฉพาะอย่างยิ่งในภูมิภาคอย่างเช่นมาร์ชแห่งอันโคนาซึ่งขุนนาง ในเมืองเหล่านี้ ได้ก่อตั้งระบบการปกครองแบบสองอำนาจระหว่างสำนักวาติกันและขุนนางในเมืองท้องถิ่น

ในปี ค.ศ. 1649 หลังจากการผนวกดัชชีแห่งกาสโตรรัฐสันตะปาปาได้ขยายอาณาเขตไปถึงจุดสูงสุด ครอบคลุมพื้นที่ส่วนใหญ่ของอิตาลีตอนกลาง ได้แก่ลาซิโอมอุมเบรีย มาร์เคและเขตการปกครองของ รา เวนนาเฟอร์ราราและโบโลญญาซึ่งขยายไปทางเหนือสู่โรมาญญา นอกจากนี้ยังรวมถึงดินแดนเล็กๆ อย่าง เบเนเวนโตและปอนเตกอร์โวทางตอนใต้ของอิตาลี และเขตการปกครองขนาดใหญ่อย่างคอมตาต์ เวแนสซินรอบๆอาวิญงทางตอนใต้ของฝรั่งเศสด้วย

พื้นผิวนี้ได้รับการรักษาไว้จนถึงปี 1791 เมื่อการปฏิวัติฝรั่งเศสส่งผลกระทบต่อดินแดนทางโลกของพระสันตะปาปา เช่นเดียวกับคริสตจักรโรมันโดยทั่วไป ในปี 1791 การลงประชามติในComtat VenaissinและAvignonตามมาด้วยการยึดครองโดยฝรั่งเศสปฏิวัติ^{[ 50 ]}ต่อมา เมื่อฝรั่งเศสบุกอิตาลีในปี 1796 คณะผู้แทน (ดินแดนทางเหนือของรัฐสันตะปาปา^{[ 50 ]} ) ถูกยึดและกลายเป็นส่วนหนึ่งของสาธารณรัฐCispadane

สองปีต่อมา กองกำลังฝรั่งเศสได้บุกเข้ายึดพื้นที่ที่เหลืออยู่ของรัฐสันตะปาปา และในเดือนกุมภาพันธ์ ค.ศ. 1798 นายพลหลุยส์-อเล็กซานเดอร์ แบร์ติเยร์ได้ประกาศจัดตั้งสาธารณรัฐโรมัน^{[ 50 ]}สมเด็จพระสันตะปาปาปิอุสที่ 6เสด็จลี้ภัยจากโรมไปยังเซียนาและสิ้นพระชนม์ในต่างแดนที่เมืองวาเลนซ์ในปี ค.ศ. 1799 ^{[ 50 ]} ในเดือนตุลาคม ค.ศ. 1799 กองทัพเนเปิลส์ ภายใต้การนำของพระเจ้า เฟอร์ดินานด์ได้บุกเข้ายึดสาธารณรัฐที่เพิ่งก่อตั้งขึ้นใหม่และฟื้นฟูรัฐสันตะปาปา ทำให้สาธารณรัฐสิ้นสุดลง ฝรั่งเศสขับไล่ชาวเนเปิลส์ออกไปอย่างรวดเร็วและยึดครองรัฐสันตะปาปาอีกครั้ง แต่ไม่ได้ฟื้นฟูสาธารณรัฐ เนื่องจากพวกเขายังคงบุกโจมตีเนเปิลส์ต่อไป ซึ่งพวกเขาได้ก่อตั้งสาธารณรัฐขึ้นอีกแห่งหนึ่งในเดือนมิถุนายน ค.ศ. 1800 คณะกงสุลฝรั่งเศสได้ยุติการยึดครองอย่างเป็นทางการและฟื้นฟูรัฐสันตะปาปา โดยสมเด็จพระสันตะปาปาปิอุสที่ 7 ที่ได้รับการเลือกตั้งใหม่ ได้ประทับอยู่ในกรุงโรม อย่างไรก็ตาม ในปี ค.ศ. 1808 จักรวรรดิฝรั่งเศสภายใต้การนำของนโปเลียนได้บุกเข้ามาอีกครั้ง จากนั้นในวันที่ 2 เมษายน พ.ศ. 2351 นโปเลียนได้ออกพระราชกฤษฎีกาให้ดินแดนของพระสันตะปาปา ได้แก่ อูร์บิโน อันโคนา มาเชราตา และกาเมริโน (โดยพื้นฐานแล้วคือภูมิภาคที่รู้จักกันในชื่อมาร์เชส) ถูกผนวกเข้ากับ ราชอาณาจักรอิตาลี ของนโปเลียนประมาณ 13 เดือนต่อมา ในวันที่ 17 พฤษภาคม พ.ศ. 2352 ดินแดนที่เหลือของรัฐสันตะปาปา (รวมถึงโรม) ถูกผนวกเข้ากับจักรวรรดิฝรั่งเศสที่หนึ่ง^{[ 50 ]}ก่อตั้งเป็นจังหวัดติเบรอและตราซิเมเน

หลังจากการล่มสลายของจักรวรรดิฝรั่งเศสที่หนึ่งในปี พ.ศ. 2357 การประชุมแห่งเวียนนาได้คืนดินแดนอิตาลีของรัฐสันตะปาปาอย่างเป็นทางการ แต่ไม่ได้คืน Comtat Venaissin หรือ Avignon ให้กับวาติกัน^{[ 50 ]}

เมื่อรัฐสันตะปาปาได้รับอำนาจอธิปไตยคืน สมเด็จพระสันตะปาปาปิอุสที่ 7 ทรงตัดสินใจยกเลิกระบบศักดินา โดยเปลี่ยนบรรดาศักดิ์ขุนนางทั้งหมด (ซึ่งถูกยกเลิกชั่วคราวในช่วงการยึดครองของนโปเลียน) ให้เป็นเกียรติยศที่ไม่เกี่ยวข้องกับสิทธิพิเศษทางดินแดน ในปี ค.ศ. 1853 สมเด็จพระสันตะปาปาปิอุสที่ 9ทรงยุติความแตกต่างที่ดำรงอยู่มานานหลายศตวรรษระหว่างขุนนางของสันตะปาปาและตระกูลขุนนางโรมัน โดยทรงเทียบเคียงฐานะพลเมืองของกรุงโรมกับขุนนางที่สมเด็จพระสันตะปาปาทรงสถาปนาขึ้น

ตั้งแต่ปี ค.ศ. 1814 จนกระทั่งการสิ้นพระชนม์ของสมเด็จพระสันตะปาปาเกรกอรีที่ 16ในปี ค.ศ. 1846 บรรดาพระสันตะปาปาได้ดำเนิน นโยบาย อนุรักษ์นิยมในรัฐสันตะปาปา ตัวอย่างเช่น กรุงโรมยังคงรักษาเขตชุมชนชาวยิว แห่งสุดท้าย ในยุโรปตะวันตกไว้

กระแสชาตินิยมอิตาลีถูกปลุกเร้าในช่วงยุคของนโปเลียน แต่ก็ถูกปราบปรามลงด้วยข้อตกลงของสภาคองเกรสแห่งเวียนนา (ค.ศ. 1814–1815) ซึ่งมุ่งหวังที่จะฟื้นฟูสภาพการณ์ก่อนยุคนโปเลียน โดยส่วนใหญ่ของอิตาลีตอนเหนืออยู่ภายใต้การปกครองของราชวงศ์ย่อยของราชวงศ์ฮับส์บูร์กและ ราชวงศ์ บูร์บงส่วนรัฐสันตะปาปาในภาคกลางของอิตาลีและราชอาณาจักรบูร์บงแห่งสองซิซิลีทางตอนใต้ได้รับการฟื้นฟู การต่อต้านของประชาชนต่อรัฐบาลนักบวชที่ทุจริตซึ่งได้รับการจัดตั้งขึ้นใหม่ นำไปสู่การก่อจลาจลในปี ค.ศ. 1830และค.ศ. 1848ซึ่งถูกปราบปรามโดยการแทรกแซงของกองทัพออสเตรีย

การปฏิวัติชาตินิยมและเสรีนิยมในปี 1848 ส่งผลกระทบต่อหลายพื้นที่ในยุโรป ในเดือนกุมภาพันธ์ 1849 ได้มีการประกาศจัดตั้งสาธารณรัฐโรมัน^{[ 51 ]} และ สมเด็จพระสันตะปาปาปิอุสที่ 9ซึ่งก่อนหน้านี้มีแนวโน้มไปทางเสรีนิยมต้องหนีออกจากเมือง การปฏิวัติถูกปราบปรามด้วย ความช่วยเหลือ จากฝรั่งเศสในปี 1849 และปิอุสที่ 9 เปลี่ยนไปใช้แนวทางการปกครองแบบอนุรักษ์นิยม จนกระทั่งพระองค์เสด็จกลับกรุงโรมในปี 1850 รัฐสันตะปาปาถูกปกครองโดยกลุ่มพระคาร์ดินัลที่รู้จักกันในชื่อคณะไตรภาคีแดง^{[ 52 ]}

ผลจากสงครามประกาศอิสรภาพอิตาลีครั้งที่สองทำให้ปีเอมอนเต-ซาร์ดิเนียผนวก ลอมบาร์ดีเข้าเป็นส่วนหนึ่ง ของอิตาลีขณะที่จูเซปเป การิบัลดีโค่นล้มราชวงศ์บูร์บงทางตอนใต้^{[ 53 ] [ 54 ]} ด้วยความกลัวว่าการิบัลดีจะจัดตั้งรัฐบาลแบบสาธารณรัฐ รัฐบาลปีเอมอนเตจึงยื่นคำร้องต่อจักรพรรดิน โปเลียนที่ 3แห่งฝรั่งเศสเพื่อขออนุญาตส่งกองทหารผ่านรัฐสันตะปาปาเพื่อควบคุมทางตอนใต้ ซึ่งได้รับอนุญาตโดยมีเงื่อนไขว่าต้องไม่รบกวนกรุงโรม

ในปี ค.ศ. 1860 ขณะที่พื้นที่ส่วนใหญ่ของภูมิภาคกำลังก่อกบฏต่อต้านการปกครองของพระสันตะปาปา แคว้นปีเอมอนเต-ซาร์ดิเนียได้บุกและยึดครองพื้นที่สองในสามทางตะวันออกของรัฐสันตะปาปา ทำให้การควบคุมทางใต้มีความมั่นคงยิ่งขึ้น เมืองโบโลญญา เฟอร์รารา อุมเบรีย มาร์เคส เบเนเวนโต และปอนเตกอร์โว ต่างถูกผนวกเข้าเป็นส่วนหนึ่งของรัฐสันตะปาปาอย่างเป็นทางการภายในเดือนพฤศจิกายนของปีเดียวกัน แม้ว่าอาณาเขตของรัฐสันตะปาปาจะลดลงอย่างมาก แต่ก็ยังคงครอบคลุมแคว้นลาซิโอและพื้นที่ขนาดใหญ่ทางตะวันตกเฉียงเหนือของกรุงโรม

มีการประกาศจัดตั้งราชอาณาจักรอิตาลีที่เป็นเอกภาพ และในเดือนมีนาคม ค.ศ. 1861 รัฐสภาอิตาลี ชุดแรก ซึ่งประชุมกันที่เมืองตูรินเมืองหลวงเก่าของแคว้นปีเอมอนเต ได้ประกาศให้กรุงโรมเป็นเมืองหลวงของราชอาณาจักรใหม่ อย่างไรก็ตาม รัฐบาลอิตาลีไม่สามารถเข้ายึดครองเมืองได้เนื่องจากกองทหารฝรั่งเศสในกรุงโรมได้คุ้มครองสมเด็จพระสันตะปาปาปิอุสที่ 9

โอกาสที่ราชอาณาจักรอิตาลีจะกำจัดรัฐสันตะปาปามาถึงในปี 1870 การปะทุของสงครามฝรั่งเศส-ปรัสเซียในเดือนกรกฎาคมกระตุ้นให้จักรพรรดินโปเลียนที่ 3 เรียกกองทหารรักษาการณ์จากโรมกลับ และการล่มสลายของจักรวรรดิฝรั่งเศสที่สองในยุทธการเซดานทำให้โรมสูญเสียผู้ปกป้องจากฝรั่งเศส

ในตอนแรก พระเจ้าวิกเตอร์ เอ็มมานูเอลที่ 2ทรงตั้งพระทัยที่จะยึดครองกรุงโรมอย่างสันติ และทรงเสนอที่จะส่งกองทัพเข้าไปในกรุงโรม โดยอ้างว่าเป็นการให้ความคุ้มครองแก่พระสันตะปาปา แต่เมื่อพระสันตะปาปาปฏิเสธ อิตาลีจึงประกาศสงครามในวันที่ 10 กันยายน ค.ศ. 1870 และกองทัพหลวงอิตาลี ภาย ใต้การบัญชาการของพลเอกราฟาเอเล คาดอร์นาได้ข้ามพรมแดนดินแดนของพระสันตะปาปาในวันที่ 11 กันยายน และค่อยๆ รุกคืบไปยังกรุงโรม

กองทัพอิตาลีมาถึงกำแพงออเรเลียนในวันที่ 19 กันยายน และปิดล้อมกรุงโรม แม้ว่ากองทัพเล็กๆ ของพระสันตะปาปาจะไม่สามารถป้องกันเมืองได้ แต่ปิอุสที่ 9 ก็สั่งให้ต่อต้านอย่างจริงจังเพื่อเน้นย้ำว่าอิตาลีเข้ายึดกรุงโรมด้วยกำลัง ไม่ใช่ด้วยความยินยอม เหตุการณ์นี้เป็นประโยชน์ต่อรัฐอิตาลีและก่อให้เกิดตำนานการบุกประตูปิอาซึ่งในความเป็นจริงแล้วเป็นเหตุการณ์ที่ไม่รุนแรงนัก มีเพียงการยิงปืนใหญ่ในระยะประชิดทำลายกำแพงอายุ 1600 ปีที่ชำรุดทรุดโทรม การป้องกันกรุงโรมไม่ได้ปราศจากเลือดเนื้อ โดยมีทหารฝ่ายพระสันตะปาปาเสียชีวิต 12 นายและบาดเจ็บ 47 นาย ส่วนทหารฝ่ายอิตาลีเสียชีวิต 32 นายและบาดเจ็บ 145 นาย^{[ 55 ]}

สมเด็จพระสันตะปาปาปิอุสที่ 9 ทรงมีพระราชดำรัสให้ผู้บัญชาการกองกำลังของพระสันตะปาปาจำกัดการป้องกันเมืองเพื่อหลีกเลี่ยงการนองเลือด^{[ 56 ]}เมืองถูกยึดครองเมื่อวันที่ 20 กันยายน พ.ศ. 2313 กรุงโรมและส่วนที่เหลือของรัฐสันตะปาปาถูกผนวกเข้ากับราชอาณาจักรอิตาลีอันเป็นผลมาจากการลงประชามติในเดือนตุลาคมปีถัดมา ซึ่งถือเป็นจุดจบอย่างเด็ดขาดของรัฐสันตะปาปา^{[ 50 ]}

แม้ว่ามหาอำนาจคาทอลิกดั้งเดิมจะไม่ให้ความช่วยเหลือแก่พระสันตะปาปา แต่สำนักวาติกันก็ปฏิเสธ " กฎหมายรับประกัน " ปี 1871 และการประนีประนอมใดๆ กับราชอาณาจักรอิตาลี โดยเฉพาะอย่างยิ่งข้อเสนอใดๆ ที่กำหนดให้พระสันตะปาปาต้องเป็นพลเมืองอิตาลี แทนที่จะเป็นเช่นนั้น สำนักวาติกันกลับจำกัดตัวเอง (ดูนักโทษในวาติกัน ) ไว้เฉพาะในพระราชวังอัครสาวกและอาคารใกล้เคียงในบริเวณป้อมปราการโบราณที่รู้จักกันในชื่อเมืองลีโอนีนบนเนินวาติกันจากที่นั่น สำนักวาติกันยังคงรักษาอำนาจอธิปไตยหลายประการ เช่น ความสัมพันธ์ทางการทูต เนื่องจากในกฎหมายศาสนจักร สิ่งเหล่านี้เป็นอำนาจโดยกำเนิดของสำนักวาติกัน

ในช่วงทศวรรษ 1920 สันตะปาปา – ซึ่งในขณะนั้นอยู่ภายใต้การปกครอง ของ ปิอุสที่ 11 – ได้สละดินแดนส่วนใหญ่ของรัฐสันตะปาปาสนธิสัญญาลาเตรานกับอิตาลี (ซึ่งในขณะนั้นปกครองโดยพรรคฟาสซิสต์แห่งชาติภายใต้เบนิโต มุสโซลินี^{[ 57 ]} ) ได้ลงนามเมื่อวันที่ 11 กุมภาพันธ์ 1929 ^{[ 57 ]} ซึ่ง ก่อตั้งรัฐนครวาติกันขึ้น เป็นดินแดนอธิปไตยของสำนักวาติกันซึ่งได้รับการชดเชยในระดับหนึ่งสำหรับการสูญเสียดินแดนด้วย

จนกระทั่งถึงศตวรรษที่ 17 การจัดระเบียบการบริหารของรัฐสันตะปาปาขึ้นอยู่กับรัฐธรรมนูญของเอจิเดียนซึ่งแบ่งดินแดนออกเป็น 5 จังหวัดหรือเขตการปกครองตามประเพณี^{[ 59 ]}

• สำนักมรดกนักบุญปีเตอร์แห่งทัสเซียซึ่งมีที่ตั้งอยู่ที่เมืองมอนเตฟิอัสโค เน ต่อมาได้ย้ายไปอยู่ที่เมืองวิแตร์โบ
• จังหวัดกัมปาญญา เอ มาริตติมาที่นั่งในเฟเรนติโน (ในโฟรซีโนเนตั้งแต่ปี 1589 เป็นต้นไป)
• ดัชชีแห่งสโปเลโตประทับในสโปเลโตต่อมาในเปรูจา
• เขตปกครองอันโคนา ศูนย์กลางอยู่ที่เมืองมาเชราตา ( เมืองเฟอร์โมจนถึงศตวรรษที่ 15)
• จังหวัด โรมัญญาที่นั่งในฟาเอนซาหรือเชเซนาต่อมาในโบโลญญาและราเวนนา

แต่ละมณฑลมีความเป็นอิสระทางการเงิน โรมทำหน้าที่เพียงประสานงานเท่านั้น อำนาจสูงสุดของแต่ละมณฑลอยู่ที่ผู้แทนพระสันตะปาปาซึ่งปฏิบัติหน้าที่ด้วยอำนาจเต็มในนามของพระสันตะปาปา ผู้แทนพระสันตะปาปาปกครองร่วมกับอธิการการกำหนดเขตแดนของมณฑลต่างๆ ยังคงไม่แน่นอนเป็นเวลานาน จนกระทั่งในสมัยของสมเด็จพระสันตะปาปาปิอุสที่ 4 (ค.ศ. 1559–1565) จึงมีการกำหนดเขตแดนที่แน่นอนและเฉพาะเจาะจงสำหรับแต่ละมณฑล

จนกระทั่งปี 1540 ดินแดนทางเหนือทั้งหมด ( โรมาญญา ) อยู่ภายใต้การปกครองของคณะผู้แทนพระสันตะปาปาเพียงคณะเดียว พระคาร์ดินัลผู้แทนพระสันตะปาปา ซึ่งเป็นหัวหน้าของรัฐบาลท้องถิ่น พำนักอยู่ในโบโลญญาเมืองที่ใหญ่ที่สุดในภูมิภาคและกลายเป็น เมืองหลวง โดยพฤตินัยในปี 1540 สมเด็จพระสันตะปาปาปอลที่ 3ทรงตัดสินใจแต่งตั้งผู้แทนพระสันตะปาปาประจำราเวนนาทำให้แคว้นโรมาญญาถูกแบ่งออกเป็นสองส่วน คือ ผู้แทนพระสันตะปาปาประจำโบโลญญาและผู้แทนพระสันตะปาปาประจำราเวนนา

หลังจากผนวกดินแดนสำคัญบางแห่ง เช่นดัชชีแห่งเฟอร์ราราดัชชีแห่งอูร์บิโนและดัชชีแห่งกาสโตรซึ่งเกิดขึ้นระหว่างปี 1598 ถึง 1649 สันตะสำนักได้จัดตั้งคณะผู้แทนใหม่สองแห่ง ได้แก่ คณะผู้แทนแห่งเฟอร์รารา (ในสมัยการปกครองของสมเด็จพระสันตะปาปาเคลเมนต์ที่ 8 (1592–1605)) และคณะผู้แทนแห่งอูร์บิโน ( ซึ่ง สมเด็จพระสันตะปาปาเออร์บันที่ 8 ทรงปรารถนาอย่างยิ่ง ) ดินแดนกาสโตร แม้จะขึ้นตรงต่อวิแตร์โบแต่ก็ยังคงมีอำนาจปกครองตนเองอย่างกว้างขวาง^{[ a ]}ในช่วงปีเดียวกันนั้นเอง บางสังฆมณฑลของลาซิโอและอุมเบรียได้ขอให้จัดตั้งจังหวัดใหม่ชื่อซาบีนาโดยมีโคลเลเวคคิโอเป็นเมืองหลวง (1605)

ในปี ค.ศ. 1627 ได้มีการจัดตั้ง สภาเขตแดน ขึ้น องค์กรนี้มีหน้าที่ป้องกันการละเมิดและไกล่เกลี่ยข้อพิพาทที่เกิดขึ้นบ่อยครั้งเกี่ยวกับเขตอำนาจศาลระหว่างจังหวัดต่างๆ และภายในจังหวัดเหล่านั้น ระหว่างสังฆมณฑลหรือเทศบาลต่างๆ ในช่วงศตวรรษที่ 17 แม้ว่ารัฐธรรมนูญของเอจิเดียนจะยังคงใช้อย่างเป็นทางการอยู่ แต่ก็พิสูจน์แล้วว่าไม่เพียงพอต่อยุคสมัยใหม่มากขึ้นเรื่อยๆ

ในช่วงต้นศตวรรษที่สิบแปดสมเด็จพระสันตะปาปาเคลเมนต์ที่ 11และผู้สืบทอดตำแหน่งต่อจากพระองค์ สมเด็จ พระสันตะปาปา อินโนเซนต์ที่ 13ทรงตระหนักถึงการเปลี่ยนแปลงที่เกิดขึ้นในศตวรรษก่อนหน้า และทรงผลักดันกระบวนการปฏิรูปโครงสร้างทางการเมืองและการบริหารของรัฐอย่างจริงจังและเด็ดขาดมากขึ้น ด้วยการสร้างจังหวัดใหม่และการจัดระเบียบเขตเลือกตั้งต่างๆ ใหม่บนพื้นฐานทางภูมิศาสตร์ที่เป็นเอกภาพมากขึ้น จุดมุ่งหมายคือเพื่อให้สามารถควบคุมพื้นที่ได้อย่างทั่วถึงมากขึ้นและบรรเทาผลกระทบที่เป็นอันตรายจากสิทธิพิเศษของชนชั้นขุนนางและเทศบาลจำนวนมากที่ขัดขวางการทำงานที่เหมาะสมของรัฐ

การแบ่งเขตจังหวัดแบบใหม่ที่มีรายละเอียดมากขึ้น ซึ่งยังไม่ได้ร่างขึ้นในปี ค.ศ. 1701 ในช่วงเวลาของการสำรวจสำมะโนประชากรครั้งแรก (บางส่วน) ของศตวรรษที่ 18 จะถูกนำไปใช้เต็มรูปแบบในอีกยี่สิบปีต่อมา และจะสะท้อนให้เห็นอย่างสมบูรณ์ในการสำรวจสำมะโนประชากรครั้งถัดไป (ค.ศ. 1767–1769) การแบ่งเขตนี้ประกอบด้วย:

• สิบสองจังหวัด: ลาซิโอมรดกของนักบุญเปโตรกัมปาญญาและมาริตติมาซาบีน่า ดัชชีแห่งสโปเลโตเปรูเกียมาร์ชแห่งอันโคนา อูร์บิโนมอนเต เฟล โต ร โรมันญาโบโลญญาและเฟอร์รารา ;
• สถานทูตนอกเขตแดน: อาวิญง ;
• เขตปกครอง: Comtat Venaissin ;
• ดินแดนขึ้นสองแห่ง: เบเนเวนโตและปอนเตกอร์โว

และยังแบ่งย่อยออกเป็นดังนี้:

• สถานทูต:
  • โบโลญญา , โรมันญาหรือราเวนนา , เฟอร์รารา , อูร์บิโนและเปซาโร , อาวีญงและคอมทัต เวอเนสซิน ;
  • มรดกของนักบุญเปโตร , กัมปาญญา และ มาริตติมา , ลาซิโอหรือ กัมปาญญาโรมานา;
• คณะผู้แทน: Fano , Camerino , Iesi ;
• อธิการบดี: MontefeltroและPennabilli , Sabina ;
• รัฐบาล: เปรูจา , ซิตตา ดิ กาสเตลโล , ปอนเตคอร์โว ;
• ประเทศ (รัฐบาล) ที่มีชื่อเรียก: ดัชชีแห่งสโปเลโต , ดัชชีแห่งคาสโตรและรอนซิกลิโอเน , ดัชชีแห่งบรัชชาโน , ดัชชีแห่งเบเนเวนโต , มาร์ชแห่งอันโคนา , มาร์ชแห่งเฟอร์โม , จังหวัดแห่งภูเขา ( นอร์เซีย )
• ดินแดนศักดินาปกครองตนเอง:
  • ดัชชีแห่งซัลชี ตกเป็นของเจ้าชายเบเนลลี กิสลิเอรี (ค.ศ. 1568–1816)
  • เทศมณฑล Castiglione de' Gatti จนถึงPepoli (1340–1796)
  • เทศมณฑลบาญนี ดิ พอร์เรตตา จนถึงรานุซซี (1474–1797)
  • แคว้นชิวิเตลลา รานิเอรี จนถึงรานิเอรี (1078–1816)
  • เขตปกครองปิออบบิโก มอบให้แก่ตระกูลบรันคาเลโอนี (ค.ศ. 1100–1816)
  • เทศมณฑลเรสคิโอ จนถึงบิชี รุสโปลี (1355–1817)

นอกเหนือจากดินแดนที่บริหารโดยตรงแล้ว รัฐสันตะปาปายังรวมถึงluoghi baronali จำนวนมาก ที่ถือครองโดยสถาบันทางศาสนาและตระกูลขุนนาง ซึ่งเจ้าของที่ดินเหล่านี้มีอำนาจปกครองท้องถิ่นในขณะที่ยังคงอยู่ภายใต้อำนาจอธิปไตยของพระสันตะปาปา^{[ 63 ]}ในปี ค.ศ. 1701 ดินแดนเหล่านี้มีประชากรประมาณ 264,000 คนในกว่า 500 ตำบล โดยส่วนใหญ่ถูกควบคุมโดยตระกูลขุนนางชั้นนำ เช่นเจ้าอาวาสแห่ง Subiaco , Barberini , Pamphili , BorgheseและColonna ^{[ 63 ]} หลังจากการฟื้นฟูอำนาจของพระ สันตะปาปาในปี ค.ศ. 1815 อำนาจศาลศักดินาถูกยกเลิกในหลายจังหวัดและค่อยๆ ลดลงในที่อื่นๆ การปฏิรูปในปี ค.ศ. 1816 ได้นำมาซึ่งความเป็นเอกภาพทางการบริหารและส่งเสริมการสละอำนาจของขุนนางที่เหลืออยู่ทีละน้อย^{[ 64 ]}

จากการสำรวจสำมะโนประชากรในปี พ.ศ. 2496 พบว่า 99.7% ของประชากรนับถือศาสนาคาทอลิก ชาวยิวเป็นกลุ่มที่ไม่ใช่คาทอลิกที่ใหญ่ที่สุด มีจำนวน 9,237 คน และส่วนใหญ่กระจุกตัวอยู่ในเขตปกครองโรมและจังหวัดอันโคนา เฟอร์รารา และเปซาโร เอ อูร์บิโน กลุ่มที่ไม่ใช่คาทอลิกอื่นๆ ทั้งหมดรวมกันมีจำนวน 263 คน^{[ 71 ]}

ในช่วงกลางศตวรรษที่ 19 เมืองที่ใหญ่ที่สุดในรัฐสันตะปาปาคือกรุงโรมโดยมีประชากรประมาณ 170,000 คน ซึ่งมากกว่าเมืองอื่นๆ อย่างมาก รองลงมาคือเมืองโบโลญญามีประชากรประมาณ 71,000 คน และเมืองเปรูจามีประชากรประมาณ 30,000 คน^{[ 72 ]}

เมืองขนาดใหญ่ลำดับที่สอง ได้แก่อันโคนาและเฟอร์ราราซึ่งแต่ละเมืองมีประชากรประมาณ 24,000 คน และเบเนเวนโตมีประชากรประมาณ 18,000 คนราเวนนาก็เป็นหนึ่งในศูนย์กลางที่มีประชากรหนาแน่นเช่นกัน โดยมีประชากรประมาณ 16,000 คน^{[ 72 ]}

ถัดจากเมืองใหญ่เหล่านี้คือเมืองเล็กๆ ในระดับจังหวัด เช่นViterbo , Rieti , MacerataและAscoliซึ่งแต่ละเมืองมีประชากรประมาณ 12,000 ถึง 13,000 คน ในขณะที่เมืองอย่างOrvieto , LoretoและCivitavecchiaมีประชากรระหว่างประมาณ 7,000 ถึง 8,000 คน^{[ 72 ]}

ในศตวรรษที่ 17 รัฐสันตะปาปาเผชิญกับวิกฤตการณ์ทางการเงินเรื้อรัง รายได้เพียงกว่า 2 ล้านสกูดีส่วนใหญ่ถูกใช้ไปกับดอกเบี้ยหนี้ และหนี้สาธารณะเพิ่มขึ้นอย่างรวดเร็วจากประมาณ 15 ล้านสกูดีในช่วงทศวรรษ 1620 เป็นประมาณ 50 ล้านสกูดีในช่วงทศวรรษ 1670 ^{[ 74 ]}นอกจากนี้ยังมีการเก็บภาษีพิเศษในช่วงเวลาวิกฤต รวมถึงเงินอุดหนุนประมาณ 700,000 สกูดีในช่วงที่เกิดภาวะอดอยากในปี 1647 ถึง 1648 ^{[ 75 ]}ในปี 1676 รัฐมีหนี้สาธารณะที่ก่อให้เกิดภาระดอกเบี้ยประจำปีประมาณ 2.4 ล้านสกูดี^{[ 75 ]}แรงกดดันทางการคลังอย่างหนักและค่าใช้จ่ายสงครามส่งผลให้เกิดความยากจนและความซบเซาทางเศรษฐกิจอย่างกว้างขวาง

ในศตวรรษที่ 18 การเงินของรัฐสันตะปาปามีลักษณะของความไม่สมดุลเชิงโครงสร้างระหว่างรายได้ปกติและรายจ่ายที่เพิ่มขึ้น ในปี 1729 รายได้ประจำปีอยู่ที่ประมาณ 2.7 ล้านสกูดี ในขณะที่รายจ่ายอยู่ที่ประมาณ 2.4 ล้านสกูดี แต่การยกเว้นภาษีและการเพิ่มเงินเดือนทำให้ส่วนเกินหมดไปอย่างรวดเร็วและทำให้เกิดการขาดดุลประจำปีประมาณ 120,000 สกูดี^{[ 76 ]}ในปี 1716 เวนิสได้รับเงินอุดหนุน 175,000 สกูดี และต่อมา 300,000 สกูดี ในระหว่างสงครามกับจักรวรรดิออตโตมันแม้ว่าจะมีทรัพยากรจำกัดก็ตาม^{[ 76 ]}

ค่าใช้จ่ายของราชสำนักยังคงสูง และโครงการสาธารณะขนาดใหญ่ได้รับเงินทุนผ่านการกู้ยืม ในปี 1736 ค่าใช้จ่ายของพระสันตะปาปาสูงถึงประมาณ 15.8 ล้านลีร์ ในปี 1736 เคลเมนต์ที่ 12 ลงทุน 200,000 สกูดีในท่าเรืออันโคนา หลังจากทำสัญญากู้ยืม 600,000 สกูดี ทำให้ภาระดอกเบี้ยของคลังเพิ่มขึ้น^{[ 76 ]}ในปี 1753 เบเนดิกต์ที่ 14 ขายสิทธิ์เหนือผลประโยชน์และรายได้ให้กับสเปนในราคาประมาณ 6.7 ล้านลีร์ในรูปทองคำ ภาวะอดอยากในปี 1763–1764 ทำให้ต้องนำเข้าธัญพืชจำนวนมากเข้าสู่กรุงโรม และเผยให้เห็นถึงความเปราะบางทางเศรษฐกิจ แม้ว่าจะมีการฟื้นตัวบางส่วนในภายหลังของศตวรรษ แต่คลังยังคงไม่สมดุลภายใต้ปิอุสที่ 6 เนื่องจากความวุ่นวายในการบริหารและค่าใช้จ่ายของราชสำนักที่ยืดเยื้อ^{[ 76 ]}

การรุกรานของฝรั่งเศสสร้างภาระทางการเงินอย่างหนักให้กับรัฐสันตะปาปา ข้อตกลงหยุดยิงที่โบโลญญาในปี 1796 กำหนดให้ต้องจ่ายเงิน 21 ล้านลีร์ ซึ่งจ่ายจริงเพียง 5 ล้านลีร์ และสนธิสัญญาโตเลนติโนในเดือนกุมภาพันธ์ 1797 กำหนดให้ต้องจ่ายเงินเพิ่มอีก 30 ล้านลีร์ พร้อมกับการยกโบโลญญา เฟอร์รารา และราเวนนา หนี้สาธารณะเพิ่มขึ้นเป็น 12.3 ล้านสกูดี โดยมีหนี้สินของเทศบาล 8 ล้าน และหนี้ของโรมันแอนโนนาอีก 3.3 ล้าน ^{[ 77 ]}

ในเดือนกุมภาพันธ์ ค.ศ. 1798 สาธารณรัฐโรมันตกลงที่จะจ่ายเงินให้ฝรั่งเศส 3.6 ล้านสกูดี ในปี ค.ศ. 1806 ค่าใช้จ่ายในการบำรุงรักษากองทัพของนโปเลียนอยู่ที่ 1.3 ล้านสกูดีในระยะเวลาสี่เดือน เทียบกับรายได้ประจำปีประมาณ 4 ล้านสกูดี ในปี ค.ศ. 1811 หนี้ของรัฐบาลสูงถึง 74 ล้านสกูดี และทางการฝรั่งเศสได้ชำระหนี้โดยการปราบปรามองค์กรทางศาสนาและยึดทรัพย์สินของพวกเขา^{[ 77 ]}

ในศตวรรษที่ 19 รัฐสันตะปาปามีรายได้ประจำปีประมาณ 13.5 ล้านฟลอริน ระบบการคลังส่วนใหญ่พึ่งพาภาษีทางอ้อมซึ่งสร้างรายได้ประมาณ 10 ล้านฟลอริน ในขณะที่ภาษีทางตรงคิดเป็นประมาณ 2.3 ล้านฟลอริน ภาระภาษีโดยรวมเฉลี่ยอยู่ที่ประมาณ 5 ฟลอรินต่อคน หนี้สาธารณะมีจำนวนประมาณ 187 ล้านฟลอริน ซึ่งเป็นจำนวนเงินที่มากกว่ารายได้ประจำปีของรัฐมาก^{[ 78 ]}

ในช่วงทศวรรษ 1850 รัฐสันตะปาปาใช้เงินสคูโดโรมันเป็นหน่วยเงินหลัก โดยแบ่งออกเป็น 10 ปาโอลีแต่ละปาโอลีมีมูลค่า 10 ไบออคคีเหรียญทองที่หมุนเวียนอยู่ในระบบ ได้แก่เซคคิโนซึ่งมีมูลค่า 2 สคูดีและ 8 ไบออคคี และดอปเปีย โรมานาซึ่งมีมูลค่า 3 สคูดีและ 21 ไบออคคี นอกจากนี้ยังมีเหรียญทองมูลค่า 8 สคูดีและ2 + 1 ⁄ 2สคูดี อีกด้วย ^{[ 79 ]}

เหรียญเงินประกอบด้วยเหรียญ scudo และเหรียญครึ่งหนึ่งของ scudo, เหรียญtestoneมูลค่า 3 paoli, เหรียญ papettoมูลค่า 2 paoli, เหรียญ paolo และเหรียญครึ่ง paolo เหรียญ baiocco เป็นหน่วยเงินตราที่ใช้กันทั่วไปที่เล็กที่สุด การแปลงค่าเงินในสมัยนั้นทำให้ scudo มีมูลค่าประมาณ 3.37 ฟรังก์ฝรั่งเศส^{[ 79 ]}

ในอดีต รัฐสันตะปาปาเคยมีกองกำลังทหารที่ประกอบด้วยอาสาสมัครทหารรับจ้าง (รวมถึงกององครักษ์คอร์ซิกา ) และคณะทหาร คาทอลิก เป็นมหาอำนาจทางทหารระดับภูมิภาคที่โดดเด่นตั้งแต่ยุคกลางตอนปลายจนถึง สงครามของคาสโตรในช่วงกลางศตวรรษที่ 17

หลังปี 1600 และโดยเฉพาะอย่างยิ่งหลังปี 1644 กองทัพของสันตะปาปาเริ่มมีความสำคัญน้อยลงสำหรับรัฐ และเสื่อมโทรมลง มีหลายสาเหตุที่ทำให้เกิดเรื่องนี้ สาเหตุหลักคือการเสื่อมถอยของจักรวรรดิออตโตมันทางตะวันออก (โดยเฉพาะอย่างยิ่งหลังจากพ่ายแพ้ต่อจักรวรรดิโรมันอันศักดิ์สิทธิ์ในสงครามตุรกีครั้งใหญ่ ) และการขึ้นมามีอำนาจของจักรวรรดิโรมันอันศักดิ์สิทธิ์/ออสเตรียและสเปนในอิตาลีหลังจากสิ้นสุดสงครามอิตาลี เหตุการณ์แรกทำให้ความจำเป็นในการทำสงครามข้ามยุโรปลดลง ในขณะที่เหตุการณ์หลังทำให้เกิดระเบียบภูมิภาคที่มั่นคงมากขึ้น ซึ่งทั้งสองอย่างทำให้การลงทุนในกองทัพลดลง แม้จะปกครองดินแดนที่ค่อนข้างกว้างใหญ่และร่ำรวย แต่กำลังทหารของสันตะปาปาแทบไม่มีความสำคัญในบริบทของภูมิภาค ภัยคุกคามที่อาจคุกคามอำนาจของผู้นำท้องถิ่น (หรือภัยคุกคามจากผู้นำนั้นเอง) จะเป็นสิ่งที่สันตะปาปาไร้กำลังที่จะต่อต้านได้ ไม่ว่าจะเตรียมการไว้อย่างไรก็ตาม ประเด็นนโยบายต่างประเทศของโรม เช่น ความเป็นอิสระของคริสตจักรแห่งชาติ จึงได้รับการแก้ไขผ่านทางการทูตและอำนาจทางจิตวิญญาณ แทนที่จะใช้กำลังทหาร กองทัพของพระสันตะปาปาตั้งแต่กลางศตวรรษที่ 17 เป็นต้นมา มีบทบาทจำกัดในการรักษาความสงบเรียบร้อยภายในพรมแดนของตนเองเท่านั้น เมื่อถึงปี 1796 กองทัพของรัฐสันตะปาปาอาจเป็นกองทัพที่อ่อนแอที่สุดในยุโรป และไม่คาดว่าจะมีการสู้รบที่จริงจังใดๆ^{[ 82 ]}

ในปี ค.ศ. 1792 กองทัพของพระสันตะปาปามีทหารประจำการเพียง 5,000 นาย สำหรับรัฐที่ควบคุมพื้นที่ส่วนใหญ่ของอิตาลีตอนกลางในทางทฤษฎีแล้ว จำนวนทหารสามารถเพิ่มขึ้นได้ด้วยทหารสำรองและกองกำลังพลเรือนอีก 80,000 นาย แต่ในความเป็นจริงแล้วไม่มีการเรียกกำลังพลจำนวนมากขนาดนั้นเลย การควบคุมกองทัพถูกแบ่งออกเป็นหลายส่วน ได้แก่ ผู้บัญชาการอาวุธ (ควบคุมกำลังพลส่วนใหญ่) เหรัญญิกทั่วไป (ควบคุมทหารรักษาการณ์ศุลกากรและกองกำลังรักษาการณ์นอกแคว้นลาซิโอ) เลขานุการคณะที่ปรึกษา (ควบคุมเจ้าหน้าที่จำนวนหนึ่ง) และเจ้ากรมวัง (ควบคุมทหารรักษาการณ์วัง) ผู้บัญชาการแต่ละคนต่างหวงแหนอำนาจของตน และกองทัพถูกจำกัดให้ปฏิบัติหน้าที่เฉพาะการรักษาความปลอดภัยในพิธีการ การรักษาการณ์ในป้อมปราการ การลาดตระเวนชายแดน ตำรวจศุลกากร การเฝ้าระวังชายฝั่ง และการบังคับใช้กฎหมาย นอกเหนือจากการดำเนินการต่อต้านโจรสลัด โจร และผู้บุกรุกแล้ว การปฏิบัติการทางทหารครั้งล่าสุดเกิดขึ้นในปี 1739 เมื่อดินแดนของพระสันตะปาปาในโรมาญญาได้ใช้กำลังพล 500 นายบุกซานมาริโนเนื่องจากข้อพิพาททางกฎหมาย กองทัพเรือประกอบด้วยเรือกัลลีย์เพียง 3 ลำ เรือคอร์เว็ตชายฝั่ง 2 ลำ และเรือขนาดเล็กอีกจำนวนหนึ่ง^{[ 83 ]}เมื่อกองทัพอิตาลีของนโปเลียนบุกดินแดนของพระสันตะปาปาเป็นครั้งแรกในปี 1796 หน่วยทหารที่ขวางทางยอมจำนนหรือหนีทัพเมื่อฝรั่งเศสปรากฏตัวครั้งแรก และโรมาญญาก็ถูกยกให้แก่สาธารณรัฐฝรั่งเศสโดยไม่มีการต่อสู้^{[ 84 ]}ด้วยการสนับสนุนของจักรพรรดิ รัฐสันตะปาปาจึงยกเลิกการยกดินแดนและพยายามบังคับเรื่องนี้ด้วยกองทัพที่สร้างขึ้นใหม่จำนวน 10,000 นาย โดยคิดว่าฝรั่งเศสจะยุ่งอยู่กับการต่อสู้กับจักรวรรดิจนไม่มีเวลาตอบโต้ นายทหารจักรวรรดิมิเกลันเจโล อเลสซานโดร คอลลี-มาร์คีได้รับแต่งตั้งให้เป็นผู้บัญชาการทหารสูงสุดของกองทัพพระสันตะปาปาด้วยความหวังว่าจะสามารถฟื้นฟูคุณภาพได้ แต่กลับกลายเป็นว่าฝรั่งเศสได้รุกรานอีกครั้งในปี 1797–1798หลังจากเอาชนะกองทัพจักรวรรดิ (ออสเตรียและปิเอมอนเต) ในการรบที่อิตาลีในปี 1796–1797กองทหารพระสันตะปาปาซึ่งไม่เคยคาดคิดว่าจะต้องต่อสู้กับกองทัพฝรั่งเศสอย่างจริงจัง กลับพ่ายแพ้อย่างรวดเร็ว และดินแดนทั้งหมดของพระสันตะปาปาถูกยึดครองโดยสาธารณรัฐฝรั่งเศส^{[ 85 ]}

ระหว่างปี 1860 ถึง 1870 กองทัพพระสันตะปาปา ( ภาษาอิตาลี: Esercito Pontificio ) ประกอบด้วยทหารราบชาวอิตาลีที่เกณฑ์มาจากท้องถิ่น 2 กรม ทหารสวิส 2 กรม และกองพันอาสาสมัครชาวไอริช 1 กองพัน รวมทั้งปืนใหญ่และทหารม้า [ ^{86 ] ใน}ปี 1861 ได้มีการจัดตั้งกองกำลังอาสาสมัครคาทอลิกนานาชาติขึ้น ซึ่งเรียกว่าPapal Zouavesตามชื่อทหารราบชาวแอลจีเรียพื้นเมืองในยุคอาณานิคมของฝรั่งเศส และเลียนแบบเครื่องแบบของพวกเขา กองกำลังนี้ประกอบด้วยอาสาสมัครชาวเบลเยียม ฝรั่งเศส ดัตช์ และควิเบก^{[ 87 ]}กองกำลังนี้ได้เข้าร่วมรบกับ ทหาร เสื้อแดงของGaribaldiผู้รักชาติชาวอิตาลี และในที่สุดก็คือกองกำลังของอิตาลีที่เพิ่งรวมชาติใหม่^{[ 88 ]}ผู้บัญชาการทหารสูงสุดของศาสนจักร ( ภาษาอิตาลี: Capitano generale della Chiesa ) เป็นผู้บัญชาการทหารสูงสุด โดยพฤตินัยของกองกำลังติดอาวุธของรัฐสันตะปาปา เช่นเดียวกับในปี 1797 กองทัพของพระสันตะปาปาที่แข็งกระด้างแทบไม่มีการต่อต้านใดๆ เมื่อชาวปีเอมอนเต-ซาร์ดิเนียรุกรานเข้ามาหลายครั้งในช่วงการรวมชาติอิตาลี

กองทัพพระสันตะปาปาถูกยุบในปี พ.ศ. 2413 เหลือเพียงกององครักษ์พระราชวังซึ่งถูกยุบในวันที่ 14 กันยายน พ.ศ. 2513 โดยสมเด็จพระสันตะปาปาปอลที่ 6 [ ^{89 ] กอง}องครักษ์ขุนนางซึ่งถูกยุบในปี พ.ศ. 2513 เช่นกัน และกององครักษ์สวิสซึ่งยังคงทำหน้าที่เป็นหน่วยพิธีการในวาติกันและเป็นกองกำลังคุ้มครองพระสันตะปาปา

กองทัพเรือของพระสันตะปาปา ยังคงมี ขนาดเล็กโดยประจำการอยู่ที่เมืองซีวิทาเวคเคียทางชายฝั่งตะวันตก และเมืองอันโคนาทางชายฝั่งตะวันออก เมื่อรัฐสันตะปาปาล่มสลายในปี 1870 เรือลำสุดท้ายของกองเรือได้แล่นไปยังฝรั่งเศส และถูกขายต่อหลังจากที่สมเด็จพระสันตะปาปาปิอุสที่ 9 สิ้นพระชนม์