ในช่วงสามสิบปีแรก PS ได้ให้เงินสนับสนุนจำนวนเล็กน้อยรวมประมาณ 19,000 ดอลลาร์แก่โรงเรียนองค์กร และทุนการศึกษาของชาวอินเดียนแดง เงินสนับสนุนครั้งแรกได้รับการจัดสรรในปี 1915 เป็นจำนวน 1,000 ดอลลาร์แก่บาทหลวงเฮนรี โร คลาวด์และศาสตราจารย์เอฟเอ แมคเคนซีเพื่อทำการสำรวจเบื้องต้นเกี่ยวกับสถานการณ์ของโรงเรียนชาวอินเดียนแดง

ในปี ค.ศ. 1926 PS ได้มอบเงินทุนสนับสนุนจำนวน 5,000 ดอลลาร์ให้กับสถาบันวิจัยการปกครอง (ปัจจุบันคือสถาบันบรูคกิ้งส์ ) เพื่อดำเนินโครงการวิจัยภายใต้การนำของลูอิส เมเรียม โดยจอห์น ร็อกกีเฟลเลอร์ จูเนียร์เป็นผู้ให้การสนับสนุนทางการเงินหลักสำหรับโครงการนั้น รายงานเรื่อง " ปัญหาของการบริหารจัดการชนพื้นเมืองอเมริกัน " หรือที่รู้จักกันทั่วไปในชื่อรายงานเมเรียมได้เป็นพื้นฐานสำหรับ นโยบาย ของรัฐบาลรูสเวลต์ที่มีต่อชนพื้นเมืองอเมริกันในช่วงทศวรรษ ค.ศ. 1930 นโยบายนี้แตกต่างจากนโยบายก่อนหน้านี้ โดยเรียกร้องให้รัฐบาลสหรัฐฯ อนุญาตให้ชนพื้นเมืองอเมริกันดำรงอยู่เป็นชนชาติที่มีเอกลักษณ์ทางวัฒนธรรม และรักษาที่ดินในเขตสงวนไว้ในความควบคุมของพวกเขา นโยบายนี้ยังได้จัดตั้งรัฐบาลชนเผ่าส่วนใหญ่ในปัจจุบันขึ้นผ่านทางพระราชบัญญัติการจัดระเบียบชนพื้นเมืองอเมริกัน

ในปี ค.ศ. 1939 สมาคมสิทธิชาวอินเดียนแดง (IRA) ได้ขอความช่วยเหลือในการศึกษาข้อพิพาทเกี่ยวกับการจัดการทุ่งหญ้าในเขตสงวนนาวาโฮ เฟลป์ส สโตกส์ได้บริจาคเงิน 1,800 ดอลลาร์สำหรับการศึกษาครั้งนี้ การศึกษาดังกล่าวได้รับการตีพิมพ์ในที่สุดโดยโทมัส เจสซี โจนส์ในชื่อThe Navajo Problem: An Inquiryส่วนหนึ่งของการศึกษานั้นคือ หนังสือ The Navajo Indian Problem ของเอลลา เดโลเรีย ในปีเดียวกันนั้น PS ยังช่วยก่อตั้งสถาบันชาวอเมริกันอินเดียนในวิชิตา รัฐแคนซัสภายใต้การนำของเฮนรี โร คลาวด์

การมีส่วนร่วมของ Phelps Stokes ในชุมชนชาวอเมริกันพื้นเมืองลดลงหลังสงครามโลกครั้งที่สองจนกระทั่งมีการแต่งตั้ง ดร. วิลตัน ดิลลอนเป็นเลขาธิการบริหารและผู้อำนวยการฝ่ายวิจัยในปี 1957 ในช่วงปีแรก ๆ ของการเป็นผู้นำของดิลลอน PS ได้เข้ามามีส่วนร่วมในการวางแผนการศึกษาและการประชุมที่เกี่ยวข้องกับการพัฒนาชาวอเมริกันพื้นเมือง ความช่วยเหลือนี้มักมาในรูปแบบของเงินทุนสนับสนุนจำนวน 1,500 ดอลลาร์ให้กับองค์กรต่าง ๆ เช่น Arrow, Inc. ซึ่งเป็นองค์กรในเครือของสภาแห่งชาติของชาวอเมริกันพื้นเมือง

ในปี 1958 เฟลป์ส สโตกส์ ได้มอบเงิน 1,500 ดอลลาร์สหรัฐฯ ให้แก่กลุ่มผู้นำชนพื้นเมืองอเมริกันเพื่อเดินทางไปยังเปอร์โตริโกที่นั่น กลุ่มดังกล่าวได้ศึกษาโครงการพัฒนาชุมชนท้องถิ่น ซึ่งส่งผลให้มีการมอบทุนการศึกษาแก่นักเรียนชนพื้นเมืองเพื่อศึกษาต่อที่มหาวิทยาลัยเปอร์โตริโก นอกจากนี้ในระดับที่เล็กกว่านั้น เฟลป์ส สโตกส์ ยังได้ให้ความช่วยเหลืออย่างไม่เป็นทางการแก่พิพิธภัณฑ์ศิลปะดั้งเดิมในนิวยอร์กในการจัดนิทรรศการศิลปะอีกด้วย

ในปี 1960 ดิลลอนได้จัดงานสัมมนาเกี่ยวกับการพัฒนาเศรษฐกิจของชนพื้นเมืองอเมริกันในระหว่างการประชุมประจำปีของสมาคมมานุษยวิทยาประยุกต์ที่มหาวิทยาลัยพิตต์สเบิร์กในช่วงหลายปีต่อมา PS ยังคงให้ทุนสนับสนุนโครงการขนาดเล็กอย่างต่อเนื่อง เช่น ทุนสนับสนุน 500 ดอลลาร์ในปี 1961 สำหรับการศึกษาด้านการศึกษาของชาวนาวาโฮ โดยใช้ภาพถ่าย ในปี 1963 ดิลลอนเป็นตัวแทนของ PS ในการประชุมผู้นำสภาแห่งชาติของชนพื้นเมืองอเมริกัน ซึ่งการอภิปรายที่ PS สนับสนุนนั้นมุ่งเน้นไปที่ปัญหาเยาวชนกระทำผิด การบังคับใช้กฎหมาย ปัญหาการถือครองที่ดิน และความสัมพันธ์กับรัฐบาลของรัฐต่างๆ

ในปี 1970 แฟรงคลิน วิลเลียมส์ดำรงตำแหน่งประธานของเฟลป์ส สโตกส์ วิลเลียมส์ได้ประสานงานกับองค์กรต่างๆ เช่นAmerican Indian Community Houseเพื่อเสริมสร้างบทบาทของเฟลป์ส สโตกส์ในชุมชนชาวอเมริกันพื้นเมือง นอกจากนี้เขายังได้รับเงินสนับสนุนจาก US AID เพื่อสนับสนุนโครงการสองโครงการในการนำชาวแอฟริกันมาศึกษาต่อในมหาวิทยาลัยของสหรัฐอเมริกา

ในปีต่อมา PS เริ่มดำเนินการจัดทำหนังสืออ้างอิงเกี่ยวกับชาวอเมริกันพื้นเมือง โดยใช้รูปแบบเดียวกับหนังสืออ้างอิงเกี่ยวกับชาวอเมริกันผิวดำ ที่จัดทำขึ้นก่อนหน้านี้ โดยใช้เงินทุนสนับสนุนจากมูลนิธิฟอร์ดจำนวน 7,500 ดอลลาร์สหรัฐ เฟรด ด็อกสแตเดอร์ ผู้อำนวยการพิพิธภัณฑ์ชาวอเมริกันพื้นเมืองในนิวยอร์ก เป็นสมาชิกของคณะกรรมการ ต่อมาพิพิธภัณฑ์ดังกล่าวถูกควบรวมเข้ากับพิพิธภัณฑ์แห่งชาติของชาวอเมริกันพื้นเมือง (NMAI) เนื่องจากสถาบันสมิธโซเนียนกำลังจะจัดทำหนังสืออ้างอิงเกี่ยวกับชาวอเมริกันพื้นเมืองที่ครอบคลุมมากกว่า PS จึงยุติความพยายามดังกล่าวและคืนเงินทุนสนับสนุนที่เหลือให้กับมูลนิธิฟอร์ดในปี 1975

ในปี 1973 ทอม เคทัสเข้าร่วมงานกับ PS ในตำแหน่งผู้ประสานงานโครงการ เคทัสได้ช่วยพัฒนาเครือข่ายความร่วมมือด้านการศึกษาระดับสูงของชาวอเมริกันพื้นเมือง (AIHEC) และริเริ่มโครงการฝึกงานเพื่อพัฒนาการศึกษาของชาวพื้นเมืองของ PS นอกจากนี้ยังได้มีการหารือกับสำนักกิจการการศึกษาและวัฒนธรรมแห่งกระทรวงการต่างประเทศสหรัฐฯ เพื่อพัฒนาโครงการแลกเปลี่ยนการศึกษาระหว่างประเทศสำหรับชาวอเมริกันพื้นเมืองและกลุ่มชนพื้นเมืองทั่วโลก

บริษัท Phelps Stokes ได้ริเริ่มจัดการประชุมแลกเปลี่ยนทางการศึกษาของชาวอินเดียในระดับนานาชาติ โดยเปิดโอกาสให้เจ้าหน้าที่ของวิทยาลัยชุมชนนาวาโฮ ได้เข้าร่วมโครงการแลกเปลี่ยนกับนักการศึกษาจากแคริบเบียนและแอฟริกา นอกจากนี้ยังช่วยก่อตั้ง วิทยาลัยชุมชน Turtle Mountainในเมืองเบลคอร์ต รัฐนอร์ทดาโคตาในปี 1974 PS เริ่มพัฒนาAmerican Indian College Fundโดยใช้รูปแบบของUnited Negro College Fundซึ่ง Phelps Stokes ให้การสนับสนุนการก่อตั้ง บาร์บารา บราโทน เจ้าหน้าที่ฝ่ายพัฒนาของ PS ได้ช่วย AIHEC เปิดตัว AICF และสำนักงานเริ่มต้นตั้งอยู่ที่สำนักงานใหญ่ของ Phelps Stokes ในนครนิวยอร์ก

PS, มูลนิธิจอห์นสัน และ AIHEC ร่วมกันจัดงานประชุมการกุศลครั้งแรกที่เคยจัดขึ้นใน "ดินแดนของชนพื้นเมืองอเมริกัน" โดยมีนักการกุศลมากกว่า 40 คนจากทั่วสหรัฐอเมริกาเข้าร่วมการประชุมที่โรงแรม Chief Gall Inn ในเขตสงวน Standing Rock Siouxผลจากการประชุมครั้งนั้น PS และ AIHEC ได้ตีพิมพ์รายงานเกี่ยวกับการศึกษาระดับอุดมศึกษาและการกุศลของชนพื้นเมืองอเมริกัน Baker, Martin และ Katus เป็นผู้ทำการวิจัยและเขียนหนังสือ " The Directory of American Indian Private Funding Sources " ซึ่งตีพิมพ์โดย AIHEC หนังสือเล่มนี้ได้รับการยกย่องจาก The Foundation News ว่าเป็น "หนังสือรวบรวมข้อมูลแหล่งทุนที่ดีที่สุดเท่าที่เคยตีพิมพ์มา"

ในปี 1975 เพจ เบเกอร์ จูเนียร์ ได้ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโครงการชนพื้นเมืองอเมริกันที่ PS ซึ่งเขายังคงพัฒนาโครงการแลกเปลี่ยนระหว่างประเทศกับประเทศกานาเขตปกครองตนเองของแอฟริกาใต้เคนยาและชนพื้นเมืองอเมริกันในละตินอเมริกา ต่อ ไป

ในปี 1976 เฟลป์ส สโตกส์ ได้รับเงินทุนเริ่มต้นเพื่อเปิดตัวสำนักข่าวเพื่อการกุศลของชนพื้นเมืองอเมริกัน (NAPNS) โดยมีโรส โรบินสัน ( ชาวโฮปิ ) เป็นผู้อำนวยการ เธอได้ตีพิมพ์The Exchangeซึ่งเป็นสิ่งพิมพ์รายไตรมาสสำหรับการแลกเปลี่ยนข้อมูลระหว่างชาวอินเดียนแดงและแวดวงการกุศล; The Roundupซึ่งเป็นข่าวสั้นและโอกาสสำหรับกลุ่มชาวอินเดียนแดง; Bulletinsซึ่งเป็นเอกสารให้ข้อมูลเกี่ยวกับการประชุมและกิจกรรมต่างๆ; และRed Book ที่มีชื่อเสียง ซึ่งเป็นสมุดรายชื่อขนาดพกพาที่อัปเดตทุกไตรมาสของเจ้าหน้าที่รัฐบาลกลางที่สำคัญทั้งหมดที่มีความสนใจในโครงการของชนพื้นเมืองอเมริกัน ในปี 1977 โรบินสันได้สืบทอดตำแหน่งต่อจากเบเกอร์ในฐานะผู้อำนวยการโครงการของชนพื้นเมืองอเมริกันของเฟลป์ส สโตกส์

ในปี 1977 เคทัสได้ก่อตั้งสำนักงานสาขาตะวันตกของเฟลป์ส สโตกส์ ซึ่งตั้งอยู่ที่เมืองแรพิดซิตี รัฐเซาท์ดาโคตาและเปิดตัวสถาบันชาติพันธุ์ชนบท (Rural Ethnic Institute) วัน เฟเธอร์และเคทัสร่วมกันเป็น พิธีกรรายการโทรทัศน์สนทนาระหว่างชนพื้นเมืองอเมริกันและชนพื้นเมืองอเมริกัน ( Red-White TV Dialogue ) รายการนี้ออกอากาศทางสถานีโทรทัศน์เชิงพาณิชย์กว่า 20 แห่งใน 8 รัฐ เป็นเวลา 7 ปี โดยมีผู้ชมถึง 4.3 ล้านคน ในปีเดียวกันนั้นเอง เฟลป์ส สโตกส์ได้จัดตั้งคณะกรรมการที่ปรึกษาชนพื้นเมืองอเมริกัน (Indian Advisory Board) ซึ่งเดินทางไปเม็กซิโกและกัวเตมาลาเพื่อประเมินโครงการแลกเปลี่ยนระหว่างกลุ่มชนพื้นเมืองอเมริกันในอเมริกากลางและอเมริกาเหนือ

โครงการชาวอเมริกันพื้นเมืองของมูลนิธิเฟลป์ส สโตกส์ อาศัยเงินสนับสนุนหลักจากมูลนิธิและบริษัทต่างๆ รวมถึงมูลนิธิเจเนอรัล มิลส์ , มูลนิธิดอนเนอร์, มูลนิธิเอตนา, มูลนิธิร็อกกีเฟล เลอร์ , มูลนิธินิวแลนด์, มูลนิธิเอ็ดนา แมคคอนเนลล์ คลาร์ก, บริษัทเอแม็กซ์ และยูเนียน คาร์ไบด์โดยในช่วงปลายทศวรรษ 1970 งบประมาณของมูลนิธิเฟลป์ส สโตกส์ สำหรับโครงการชาวอเมริกันพื้นเมืองอยู่ที่ 114,000 ดอลลาร์สหรัฐ

จากเงินช่วยเหลือของ USAID นั้น PS ได้ดำเนินโครงการต่างๆ เพื่อนำข้าราชการจากกระทรวงเกษตรของบอตสวานา เลโซโท และสวาซิแลนด์ มาศึกษาต่อในมหาวิทยาลัยของสหรัฐฯ โดยมีเป้าหมายเพื่อพัฒนาความเข้าใจและความรู้เกี่ยวกับนโยบายและเศรษฐศาสตร์การเกษตร เงินช่วยเหลืออีกโครงการหนึ่งได้นำนักเรียนจากแอฟริกาตะวันตกมาศึกษาต่อในวิทยาลัยชุมชนของสหรัฐฯ เพื่อเรียนรู้พื้นฐานการเป็นพาราเมดิก นอกจากนี้ PS ยังบริหารจัดการโครงการช่วยเหลือด้านการเงินฉุกเฉินระยะสั้นสำหรับนักเรียนชาวแอฟริกันทั่วสหรัฐฯ ผ่านกองทุนช่วยเหลือด้านการศึกษาสำหรับนักเรียนแอฟริกัน นักเรียนสามารถขอรับเงินช่วยเหลือฉุกเฉินได้ไม่เกิน 500 ดอลลาร์สหรัฐฯ ต่อครั้ง สำหรับค่าใช้จ่ายที่ไม่คาดคิด ทำให้หลายคนสามารถเรียนต่อได้ โครงการเหล่านี้ดำเนินต่อไปตลอดช่วงทศวรรษ 1980

ในทศวรรษ 1980 เฟลป์ส สโตกส์ (PS) ยังคงดำเนินโครงการแลกเปลี่ยนระหว่างประเทศต่อไป ในปี 1983 เจ้าหน้าที่ของ PS เดินทางไปยังแอฟริกาตะวันตก ( ไนจีเรียไอวอรี่โคสต์ เซียร์ราลีโอเนและโมร็อกโก ) เพื่อศึกษาสถาบันทางกฎหมายและการศึกษาในประเทศเหล่านั้น เปรียบเทียบกับสถาบันของชนพื้นเมืองอเมริกัน โรส โรบินสัน ดำรงตำแหน่งรองประธานของเฟลป์ส สโตกส์ PS ทำงานร่วมกับสมาคมวิทยาศาสตร์ชนพื้นเมืองอเมริกัน รวมถึงงานป้องกันการฆ่าตัวตายของเซลมา มินธอร์น การมีส่วนร่วมของเฟลป์ส สโตกส์ในประเด็นชนพื้นเมืองอเมริกันลดลงอีกครั้งในทศวรรษ 1990 ภายใต้การนำของเอกอัครราชทูตแฟรงคลิน วิลเลียมส์ กองทุนได้ดำเนินการต่อต้านการแบ่งแยกสีผิวโดยการเป็นเจ้าภาพต้อนรับสมาชิกของพรรค ANC และ Africa Roundtable รวมถึงการตีพิมพ์บทพูดของบิชอปเดสมอนด์ ตูตู เนลสัน แมนเดลา และโวล โซยินกา โครงการศิลปะและวรรณกรรมริเริ่มโครงการสาธารณะร่วมกับนักเขียนและศิลปิน รวมถึงโทนี มอร์ริสันจอห์น โอลิเวอร์ คิลเลนส์แคทเธอรีน เจมส์ แคตติและจอห์น วิลเลียมส์ มีการจัดกิจกรรมระดมทุน เช่น การประมูลศิลปะแอฟริกันประจำปี และงานกาล่าที่สหประชาชาติ

บาดี ฟอสเตอร์ ดำรงตำแหน่งประธานคนที่หกของเฟลป์ส สโตกส์ในปี 2001 ในปี 2007 เฟลป์ส สโตกส์ ได้จัดงานประชุมและเทศกาลภาพยนตร์สามวัน ณโรงเรียนฟอนดูแล็ก โอจิบเวในเมืองโคลเควต รัฐมินนิโซตาโครงการสำคัญอีกโครงการหนึ่งของเฟลป์ส สโตกส์ คือการมีส่วนร่วมในฐานะองค์กรจัดโปรแกรมระดับชาติสำหรับโครงการผู้นำผู้เยี่ยมชมระหว่างประเทศ ของกระทรวงการต่างประเทศ สหรัฐฯ

เฟลป์ส สโตกส์ ได้จัดตั้งคณะกรรมการหลายชุดเพื่อศึกษาเงื่อนไขและความต้องการด้านการศึกษาของชาวแอฟริกันผิวดำ และได้เสนอแนะแนวทางในการปรับปรุงการเข้าถึงและคุณภาพ การศึกษา ดร. เจมส์ อีเค แอกเกรย์ซึ่งเป็นที่รู้จักในฐานะ "บุคเกอร์ ที. วอชิงตันแห่งแอฟริกา" ได้ช่วยนำคณะกรรมการเหล่านี้และวางรูปแบบการศึกษาที่ครอบคลุม

เฟลป์ส สโตกส์ ให้การสนับสนุนศูนย์วัฒนธรรมแพนแอฟริกันดูบอยส์ในเมืองอักกรา ซึ่งก่อตั้งขึ้นใน ปี1985 ในฐานะอนุสรณ์สถานแห่งชาติของกานา

ความสัมพันธ์ของ Phelps Stokes กับแอฟริกาใต้เริ่มต้นขึ้นในปี 1929 ด้วยการก่อตั้งคณะกรรมการว่าด้วยความสัมพันธ์ทางเชื้อชาติแห่งแอฟริกาใต้ ซึ่งต่อมาได้กลายเป็นสถาบันว่าด้วยความสัมพันธ์ทางเชื้อชาติ แห่งแอฟริกาใต้ กองทุนนี้ยังดำเนินงาน กองทุนทุนการศึกษาผู้ลี้ภัยจากแอฟริกาใต้ ของอาร์ชบิชอปเดสมอนด์ ตูตูและกองทุนทุนการศึกษาแอฟริกาใต้ ซึ่งในทศวรรษ 1980 ได้มอบการศึกษาในระดับวิทยาลัยฟรีให้กับเยาวชนผิวดำหลายร้อยคนจากแอฟริกาใต้

ครอบครัวเฟลป์ส สโตกส์ ได้ช่วยเหลือทาสชาวอเมริกันที่ได้รับการปลดปล่อยให้ไปตั้งถิ่นฐานในไลบีเรียและธงชาติไลบีเรียผืน แรก ถูกเย็บขึ้นในบ้านของแอนสัน เฟลป์ส สโตกส์ ในช่วงกลางศตวรรษที่ 19 ประธานาธิบดีคนแรกของไลบีเรียโจเซฟ เจนกินส์ โรเบิร์ตส์รู้จักทั้งแอนสัน กรีน เฟลป์ส และโทมัส สโตกส์ แอนสัน เฟลป์ส ให้ทุนสนับสนุนแผนกศาสนศาสตร์ในไลบีเรีย ซึ่งนำไปสู่การก่อตั้งวิทยาลัยไลบีเรียในปี 1851 ระหว่างปี 1911 ถึง 1946 นักเรียนชาวแอฟริกันจำนวนมากได้ผ่านเข้ามาศึกษาในสำนักงานนี้ โดยได้รับเงินสนับสนุนด้านการศึกษาเกือบ 21,000 ดอลลาร์สหรัฐ

ในปี ค.ศ. 1898 แคโรไลน์ เฟลป์ส สโตกส์หลานสาวของแอนสัน ได้มอบทุนการศึกษาอนุสรณ์โรเบิร์ตส์ที่วิทยาลัยทัสเคกีเพื่อเป็นเกียรติแก่ประธานาธิบดีคนแรกของไลบีเรีย นอกจากทุนการศึกษาแล้ว แคโรไลน์ยังได้มอบเงินสนับสนุนการจัดตั้งกองทุนเฟลป์ส สโตกส์ เมื่อเธอเสียชีวิตในปี ค.ศ. 1909 ด้วยมรดกนี้ กองทุนเฟลป์ส สโตกส์ จึงได้รับการจัดตั้งขึ้นอย่างเป็นทางการในปี ค.ศ. 1911 กองทุนเฟลป์ส สโตกส์ ได้ดำเนินงานอย่างเป็นทางการในไลบีเรียมาตั้งแต่ทศวรรษ ค.ศ. 1920 โดยมีเพียงช่วงสั้นๆ ที่หยุดชะงักเนื่องจากสงครามเท่านั้น

ในปี ค.ศ. 1924 กองทุนได้จัดตั้งคณะกรรมการที่ปรึกษาด้านการศึกษาในไลบีเรีย นำโดยเจมส์ ซิบลีย์ ผู้สนับสนุนปรัชญาการศึกษาของบุคเกอร์ วอชิงตัน คณะกรรมการสรุปว่างานส่วนใหญ่ที่ดำเนินการโดยคณะมิชชันนารีทางศาสนานั้นผิวเผินและขาดการติดต่อกับชุมชน ต่อมาซิบลีย์ได้จัดชุดการบรรยายสำหรับครู ซึ่งมีครูในไลบีเรียเข้าร่วมถึง 95% และในที่สุดก็โน้มน้าวให้รัฐบาลสนับสนุนเงินทุนสำหรับการจัดพิมพ์ตำราเรียนที่ปรับให้เข้ากับสภาพของไลบีเรียและแอฟริกาตะวันตก ในปี ค.ศ. 1927 ซิบลีย์ได้จัดตั้งสมาคมครูฌาเนสแห่งไลบีเรีย ซึ่งสนับสนุนการขยายตัวของสถาบันอุตสาหกรรมแม่น้ำเซนต์พอลของนิกายเมธอดิสต์เอพิสโคปัล และเปลี่ยนชื่อเป็นสถาบันบุคเกอร์ วอชิงตันในช่วงปลายปี ค.ศ. 1927 สภานิติบัญญัติของไลบีเรียได้อนุมัติกฎบัตรให้สมาคมจัดตั้งสถาบันเกษตรและอุตสาหกรรมบุคเกอร์ ที. วอชิงตัน ขึ้น ในขณะเดียวกัน คุณโอลิเวีย เอเกิลสตัน เฟลป์ส สโตกส์ ซึ่งได้บริจาคทรัพย์สินเพื่อก่อตั้งกองทุนเฟลป์ส สโตกส์ ได้ให้การสนับสนุนทางการเงินอย่างมากแก่สถาบันบุคเกอร์ วอชิงตันที่เพิ่งก่อตั้งขึ้น และกองทุนดังกล่าวก็ยังคงทำงานร่วมกับสถาบันนี้ต่อไป ประธานกองทุนเฟลป์ส สโตกส์ คุณบาดี ฟอสเตอร์ ได้รับการแต่งตั้งให้ดำรงตำแหน่งในคณะกรรมการบริหารของสถาบันบุคเกอร์ วอชิงตัน ในฤดูใบไม้ผลิปี 2008

มูลนิธิเฟลป์ส สโตกส์ ยังมีส่วนร่วมในการพัฒนาสถาบันการศึกษาระดับอุดมศึกษาอื่นๆ ในประเทศไลบีเรีย โดยเฉพาะอย่างยิ่ง มูลนิธิเฟลป์ส สโตกส์ ช่วยพัฒนาหลักสูตรและฝึกอบรมคณาจารย์ที่วิทยาลัยคัตติงตันและเป็นเจ้าภาพวิทยาลัยคัตติงตันลี้ภัยที่สำนักงานของมูลนิธิเฟลป์ส สโตกส์ ในนครนิวยอร์ก ในช่วงที่สงครามกลางเมืองไลบีเรีย กำลังรุนแรง นอกจากนี้ มูลนิธิ เฟลป์ส สโตกส์ ยังสนับสนุนการพัฒนาสถาบันริกส์ในรัฐเวอร์จิเนีย ประเทศไลบีเรีย เมื่อสงครามกลางเมืองไลบีเรียยุติลงชั่วคราวในปี 1997 มูลนิธิได้ดำเนินโครงการฝึกอบรมสำหรับอดีตนักรบที่สถาบันบุคเกอร์ ที. วอชิงตัน (BWI) โดยร่วมมือกับUSAIDผลจากโครงการนี้ ชาวไลบีเรียเกือบ 2,500 คนได้รับการฝึกฝนให้เป็นช่างฝีมือและช่างเทคนิคที่มีทักษะ นอกเหนือจากโครงการฝึกอบรมนี้แล้ว ห้องสมุดและอาคารหลายแห่งที่ BWI ก็ได้รับการปรับปรุงใหม่ด้วย

ในปี 2549 มูลนิธิเฟลป์ส สโตกส์ ได้ริเริ่มโครงการเสริมสร้างศักยภาพและพัฒนาภาวะผู้นำของเด็กหญิงและสตรี โดยใช้เทคโนโลยีการสื่อสารทางวิทยุและสารสนเทศ เพื่อให้เสียงแก่เด็กหญิงและสตรีที่ตกเป็นเหยื่อในประเทศไลบีเรีย โครงการนี้ให้ข้อมูลทางการศึกษาทั้งแบบไม่เป็นทางการและเป็นทางการแก่บุคคล โดยเฉพาะอย่างยิ่งสตรีและเยาวชน ที่ขาดโอกาสในการเข้าถึงโรงเรียนแบบดั้งเดิม มูลนิธิเฟลป์ส สโตกส์ ได้ร่วมมือกับองค์กรท้องถิ่นเพื่อจัดตั้งชมรมวิทยุซึ่งสมาชิกจะได้เรียนรู้ส่วนประกอบทางเทคนิคของการผลิตเนื้อหาเพื่อเผยแพร่ผ่านสถานีวิทยุชุมชนวิทยุผ่านดาวเทียมและสื่ออื่นๆ ในปี 2550 โครงการนี้ได้ขยายไปสู่หลักสูตรคอมพิวเตอร์และหลักสูตรการอ่านออกเขียนได้สำหรับผู้ใหญ่ฟรีแก่ประชากรที่ด้อยโอกาสในเมืองมอนโรเวียโครงการริเริ่มอื่นๆ ของมูลนิธิเฟลป์ส สโตกส์ ในไลบีเรีย ได้แก่ การจัดตั้งคณะกรรมการที่ปรึกษาร่วมด้านการศึกษา การแต่งตั้งที่ปรึกษาด้านการศึกษาเพื่อสนับสนุนรัฐบาลไลบีเรีย การประเมินความต้องการด้านการศึกษาในไลบีเรียโดยบุคคลที่สามหลายครั้ง และการจัดทำและให้ทุนสนับสนุนข้อเสนอโครงการของภาคเอกชน