ไวรัสRNAเป็นไวรัส ที่มี จีโน มเป็นกรดไรโบนิวคลี อิก( RNA ) ^{[ 1 ]}จีโนมอาจเป็นRNA สายเดี่ยว ( ssRNA ) หรือ RNA สายคู่ ( dsRNA ) ^{[ 2 ]}โรคสำคัญในมนุษย์ที่เกิดจากไวรัส RNA ได้แก่ไข้หวัดใหญ่ , SARS , MERS , COVID - 19 , ไวรัสเดงกี่ , ไวรัสตับอักเสบซี , ไวรัสตับอักเสบ อี , ไข้เวส ต์ ไนล์ , โรคไวรัสอีโบลา , โรค พิษสุนัขบ้า , โปลิโอ , คางทูมและหัด

ไวรัส RNA ทั้งหมดใช้พอลิเมอเรสที่ขึ้นอยู่กับ RNA ที่เป็นโฮโมล็อกสำหรับการจำลองแบบ และถูกจัดประเภทโดยคณะกรรมการระหว่างประเทศว่าด้วยการจำแนกประเภทของไวรัส (ICTV) ให้อยู่ในอาณาจักรRiboviria ^{[ 3 ]}ซึ่งรวมถึงไวรัสที่อยู่ในกลุ่ม III , กลุ่ม IV , กลุ่ม Vและกลุ่ม VIของ ระบบ การจำแนกประเภท Baltimoreกลุ่ม VI ประกอบด้วยเรโทรไวรัสซึ่งมีสารพันธุกรรมเป็น RNA แต่ใช้ตัวกลางDNA ใน วงจรชีวิตของพวกมัน Riboviria ไม่รวมไวรอยด์และกรดนิวคลีอิกแซทเทลไลต์: Deltavirus, Avsunviroidae และ Pospiviroidae เป็นกลุ่มสิ่งมีชีวิตที่ถูกรวมไว้โดยไม่ได้ตั้งใจในปี 2019 [ a ^{] ​​แต่ได้}รับการแก้ไขในปี 2020 ^{[ 4 ]}

ไวรัส RNA สามารถจำแนกเพิ่มเติมได้ตามทิศทางหรือขั้วของ RNA เป็นไวรัส RNA สายลบและสายบวกหรือไวรัส RNA สายคู่ ไวรัส RNA สายบวกมีลักษณะคล้ายกับ mRNA ดังนั้น เซลล์เจ้าบ้านจึงสามารถแปลได้ ทันที ไวรัส RNA สายลบเป็นส่วนเสริมของ mRNA ดังนั้นจึงต้องถูกแปลงเป็น RNA สายบวกโดยเอนไซม์ RNA-dependent RNA polymeraseก่อนการแปล RNA บริสุทธิ์ของไวรัสสายบวกสามารถทำให้เกิดการติดเชื้อได้โดยตรง แม้ว่าอาจจะติดเชื้อได้น้อยกว่าอนุภาคไวรัสทั้งหมด ในทางตรงกันข้าม RNA บริสุทธิ์ของไวรัสสายลบไม่สามารถทำให้เกิดการติดเชื้อได้ด้วยตัวเอง เนื่องจากต้องถูกถอดรหัสเป็น RNA สายบวกก่อนไวรัส แต่ละตัว สามารถถูกถอดรหัสเป็น RNA สายบวกได้หลายตัว ไวรัส RNA สายคู่มีลักษณะคล้ายกับไวรัส RNA สายลบ ยกเว้นว่าพวกมันแปลยีนจากสายลบและสายบวก^{[ 5 ]}

ไวรัส RNA สายคู่ (dsRNA)เป็นกลุ่มไวรัสที่มีความหลากหลายซึ่งแตกต่างกันอย่างมากในขอบเขตของโฮสต์ (มนุษย์ สัตว์ พืชเชื้อรา [b] และแบคทีเรีย^{)จำนวนส่วน}ของจีโนม (หนึ่งถึงสิบสอง) และโครงสร้างของไวริออน ( จำนวนสามเหลี่ยมชั้นแคปซิดหนาม หอคอย ฯลฯ) สมาชิกในกลุ่มนี้ได้แก่โรตาไวรัสซึ่งเป็นสาเหตุที่พบบ่อยที่สุดของ โรคกระเพาะและลำไส้ อักเสบในเด็กเล็ก และพิโคเบอร์นา ไวรัส ซึ่งเป็นไวรัสที่พบบ่อยที่สุดในตัวอย่างอุจจาระของทั้งมนุษย์และสัตว์ที่มีหรือไม่มีอาการท้องเสียไวรัสบลูทังเป็นเชื้อก่อโรคที่มีความสำคัญทางเศรษฐกิจที่ติดเชื้อในวัวและแกะ ในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมา มีความก้าวหน้าในการกำหนดโครงสร้างระดับอะตอมและระดับซับนาโนเมตรของโปรตีนไวรัสที่สำคัญจำนวนหนึ่งและแคปซิดไวริออนของไวรัส dsRNA หลายชนิด ซึ่งเน้นให้เห็นถึงความคล้ายคลึงกันอย่างมีนัยสำคัญในโครงสร้างและกระบวนการจำลองแบบของไวรัสเหล่านี้หลายชนิด^{[ 2 ]}

โดยทั่วไปไวรัส RNA มีอัตรา การกลายพันธุ์สูงมากเมื่อเทียบกับไวรัส DNA [ ^{7 ]}เนื่องจาก พอ ลิเมอเรส RNA ของไวรัส ขาดความสามารถในการตรวจสอบความถูก ต้องของพอลิเม อ เร ^ส DNA ^{[ 8 ]}ความหลากหลายทางพันธุกรรมของไวรัส RNA เป็นหนึ่งในเหตุผลที่ทำให้การสร้างวัคซีน ที่มีประสิทธิภาพ ต่อต้านไวรัสเหล่านี้ เป็นเรื่องยาก ^{[ 9 ]}เรโทรไวรัสยังมีอัตราการกลายพันธุ์สูง แม้ว่าดีเอ็นเอตัวกลางของพวกมันจะรวมเข้ากับจีโนมของโฮสต์ (และอยู่ภายใต้การตรวจสอบความถูกต้องของดีเอ็นเอของโฮสต์เมื่อรวมเข้าด้วยกันแล้ว) เนื่องจากข้อผิดพลาดระหว่างการถอดรหัสย้อนกลับจะฝังอยู่ในสายดีเอ็นเอทั้งสองสายก่อนการรวมเข้าด้วยกัน^{[ 10 ]}ไวรัส HIVเองมีอัตราการกลายพันธุ์สูงที่สุดในบรรดาจุลินทรีย์ที่รู้จักกันทั้งหมด โดยมีอัตราการกลายพันธุ์โดยประมาณสูงถึง 4.1 × 10 ⁻³การแทนที่ต่อคู่เบส^{[ 11 ]}ยีนบางส่วนของไวรัส RNA มีความสำคัญต่อวงจรการจำลองแบบของไวรัส และการกลายพันธุ์เป็นสิ่งที่ยอมรับไม่ได้ ตัวอย่างเช่น บริเวณของ จีโนม ไวรัสตับอักเสบซีที่เข้ารหัสโปรตีนแกนกลางนั้นมี^การอนุรักษ์ไว้อย่างสูง [ ^{12 ]}เนื่องจากมีโครงสร้าง RNA ที่เกี่ยวข้องกับ ไซต์การเข้าสู่ ไรโบโซมภายใน^{[ 13 ]}

โดยเฉลี่ยแล้ว ไวรัส dsRNA แสดงความซ้ำซ้อนของลำดับที่ต่ำกว่าเมื่อเทียบกับไวรัส ssRNA ในทางตรงกันข้าม ไวรัส dsDNA มีลำดับจีโนมที่ซ้ำซ้อนมากที่สุด ในขณะที่ไวรัส ssDNA มีความซ้ำซ้อนน้อยที่สุด^{[ 14 ]}ความซับซ้อนของลำดับของไวรัสได้รับการพิสูจน์แล้วว่าเป็นลักษณะสำคัญสำหรับการจำแนกประเภทไวรัสแบบไม่ต้องอ้างอิงที่แม่นยำ^{[ 14 ]}

ไวรัส RNA สามารถแบ่งออกเป็น 3 กลุ่มที่แตกต่างกัน โดยพิจารณาจากจีโนมและวิธีการจำลองตัวเอง:

• ไวรัสอาร์เอ็นเอสายคู่ (กลุ่ม III) ประกอบด้วยโมเลกุลอาร์เอ็นเอที่แตกต่างกันตั้งแต่หนึ่งถึงสิบสองโมเลกุล โดยแต่ละโมเลกุลทำหน้าที่สร้างโปรตีนไวรัสหนึ่งชนิดหรือมากกว่านั้น
• ไวรัส RNA สายเดี่ยวที่มีทิศทางบวก (กลุ่ม IV) ใช้จีโนมของไวรัสโดยตรงในรูปของ mRNA โดยไรโบโซม ของโฮสต์ จะแปล mRNA นั้นเป็นโปรตีนเดี่ยว ซึ่งจะถูกดัดแปลงโดยโปรตีนของโฮสต์และไวรัสเพื่อสร้างโปรตีนต่างๆ ที่จำเป็นสำหรับการจำลองแบบ หนึ่งในนั้นคือ RNA-dependent RNA polymerase (RNA replicase) ซึ่งทำหน้าที่คัดลอก RNA ของไวรัสเพื่อสร้าง RNA สายคู่ที่สามารถจำลองแบบได้ จากนั้น RNA สายคู่นี้จะควบคุมการสร้าง RNA ของไวรัสตัวใหม่
• ไวรัส RNA สายเดี่ยวที่มีทิศทางลบ (กลุ่ม V) จำเป็นต้องมีเอนไซม์ RNA replicase คัดลอกจีโนมเพื่อสร้าง RNA สายเดี่ยวที่มีทิศทางบวก ซึ่งหมายความว่าไวรัสต้องมีเอนไซม์ RNA replicase ติดตัวไปด้วย โมเลกุล RNA สายเดี่ยวที่มีทิศทางบวกนี้จะทำหน้าที่เป็น mRNA ของไวรัส ซึ่งจะถูกแปลเป็นโปรตีนโดยไรโบโซมของโฮสต์
• ไวรัสกลุ่มเรโทร (กลุ่ม VI) มีจีโนมเป็น RNA สายเดี่ยว แต่ใช้ DNA เป็นตัวกลางในการจำลองตัวเอง เอนไซม์ รีเวอร์สทรานสคริปเทสซึ่งเป็นเอนไซม์ของไวรัสที่สร้างขึ้นจากตัวไวรัสเองหลังจากที่เปลือกหุ้มถูกทำลาย จะแปลง RNA ของไวรัสให้เป็น DNA สายคู่ที่เสริมกัน จากนั้น DNA สายคู่นี้จะถูกคัดลอกเพื่อสร้างโมเลกุล DNA ของไวรัสที่เป็นสายคู่ หลังจากที่ DNA นี้ถูกรวมเข้ากับจีโนมของโฮสต์โดยใช้เอนไซม์อินทิเก รสของไวรัส การแสดงออกของยีนที่เข้ารหัสอาจนำไปสู่การสร้างไวริออนใหม่ได้

ไวรัส RNA จำนวนมากสามารถเกิดการรวมตัวทางพันธุกรรม ได้ เมื่อ มี จีโนม ไวรัสอย่างน้อยสองตัว อยู่ในเซลล์โฮสต์เดียวกัน^{[ 15 ]}ในบางกรณี RNA ของไวรัสสามารถรวมตัวกับ RNA ของโฮสต์ได้^{[ 16 ]}การรวมตัวของ RNA ดูเหมือนจะเป็นแรงผลักดันหลักในการกำหนดโครงสร้างจีโนมและเส้นทางการวิวัฒนาการของไวรัสในกลุ่มPicornaviridae ( (+)ssRNA ) เช่นไวรัสโปลิโอ [ ^{17 ] ใน}กลุ่มRetroviridae ((+)ssRNA) เช่นHIVความเสียหายในจีโนม RNA ดูเหมือนจะถูกหลีกเลี่ยงในระหว่างการถอดรหัสย้อนกลับโดยการสลับสาย ซึ่งเป็นรูปแบบหนึ่งของการรวมตัว^{[ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]}การรวมตัวยังเกิดขึ้นในReoviridae (dsRNA) เช่น ไวรัสรีโอ; Orthomyxoviridae ((-)ssRNA) เช่นไวรัสไข้หวัดใหญ่ ; ^{[ 20 ]}และCoronaviridae ((+)ssRNA) เช่นSARS ^{[ 21} ] การรวมตัวใหม่ในไวรัส RNA ดูเหมือนจะเป็นการปรับตัวเพื่อรับมือกับความเสียหายของจีโนม^{[ 15 ] การ}รวมตัวใหม่สามารถเกิดขึ้นได้ไม่บ่อยนักระหว่างไวรัสสัตว์ชนิดเดียวกันแต่มีสายพันธุ์ที่แตกต่างกัน ไวรัสลูกผสมที่เกิดขึ้นอาจทำให้เกิดการระบาดของการติดเชื้อในมนุษย์ได้ในบางครั้ง^{[ 21 ]}

การจำแนกประเภทนั้นอาศัยหลักการพื้นฐานจากชนิดของจีโนม (สายคู่, สายเดี่ยวลบ หรือสายเดี่ยวบวก) และจำนวนและการจัดเรียงของยีน ปัจจุบันมีการยอมรับไวรัส RNA 5 อันดับ และ 47 วงศ์ นอกจากนี้ยังมีสปีชีส์และสกุลอีกมากมายที่ยังไม่ได้รับการจัดจำแนก

ไวรอยด์และกรดนิวคลีอิกดาวเทียม RNA มีความเกี่ยวข้องแต่ก็แตกต่างจากไวรัส RNA ปัจจุบันยังไม่จัดกลุ่มสิ่งเหล่านี้เป็นไวรัส RNA และมีการอธิบายรายละเอียดไว้ในหน้าเว็บแยกต่างหาก

การศึกษาไวรัส RNA หลายพันตัวแสดงให้เห็นถึงการมีอยู่ของกลุ่มหลักอย่างน้อยห้ากลุ่ม ได้แก่ กลุ่มเลวิไวรัสและญาติ กลุ่มใหญ่พิคอร์นาไวรัส กลุ่มใหญ่แอลฟาไวรัสบวกกลุ่มใหญ่ฟลาวิไวรัส ไวรัส dsRNA และไวรัสสายลบ^{[ 22 ]}กลุ่มเลนติไวรัส ดูเหมือนจะเป็นฐานของไวรัส RNA ที่เหลือทั้งหมด การแบ่งกลุ่มหลักถัดไปอยู่ระหว่างกลุ่มใหญ่พิคอร์นาไวรัสและไวรัสที่เหลือ ไวรัส dsRNA ดูเหมือนจะวิวัฒนาการ มา จากบรรพบุรุษ RNA บวก และไวรัส RNA ลบมาจากภายในไวรัส dsRNA ความสัมพันธ์ที่ใกล้ชิดที่สุดกับไวรัส RNA สายลบคือReoviridae

นี่คือกลุ่มไวรัส RNA ที่ใหญ่ที่สุดเพียงกลุ่มเดียว^{[ 23 ] และ}ได้รับการจัดระเบียบโดยICTVให้เป็นไฟลัมKitrinoviricota , LenarviricotaและPisuviricotaในอาณาจักรOrthornaviraeและอาณาจักรRiboviria [ ^{24 ]}

ไวรัส RNA สายบวกยังสามารถจำแนกตาม RNA-dependent RNA polymerase ได้อีกด้วย โดยแบ่งออกเป็น 3 กลุ่ม: ^{[ 25 ]}

1. ไวรัสกลุ่มไบโมไวรัส โคโมไวรัส เนโปไวรัส โนดาไวรัส พิคอร์นาไวรัส โพตีไวรัส โซเบโมไวรัส และไวรัสกลุ่มลูเทโอไวรัสบางส่วน (ไวรัสโรคใบเหลืองตะวันตกของหัวบีท และไวรัสโรคใบม้วนของมันฝรั่ง) ซึ่งจัดอยู่ในกลุ่มคล้ายพิคอร์นา (Picornavirata)
2. คาร์โมไวรัส, ไดแอนโทไวรัส, ฟลาวิไวรัส, เพสติไวรัส, สตาโทไวรัส, ทอมบัสไวรัส, แบคทีริโอเฟจ RNA สายเดี่ยว, ไวรัสตับอักเสบซี และลูทีโอไวรัสบางส่วน (ไวรัสแคระเหลืองข้าวบาร์เลย์) ซึ่งจัดอยู่ในกลุ่มฟลาวิไลค์ (Flavivirata)
3. ไวรัสกลุ่มอัลฟา (Rubivirata) ได้แก่ อัลฟาไวรัส คาร์ลาไวรัส ฟูโรไวรัส ฮอร์เดไวรัส โพเท็กซ์ไวรัส รูบิไวรัส โทบราไวรัส ไตรคอร์นาไวรัส ไทโมไวรัส ไวรัสจุดใบคลอโรติกในแอปเปิล ไวรัสใบเหลืองในบีท และไวรัสตับอักเสบอี

มีการเสนอการแบ่งกลุ่มซูเปอร์กรุ๊ปอัลฟาไลค์ (ซินด์บิสไลค์) โดยอาศัยโดเมนใหม่ที่ตั้งอยู่ใกล้กับปลาย N ของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการจำลองแบบของไวรัส^{[ 26 ]}กลุ่มที่เสนอสองกลุ่ม ได้แก่ กลุ่ม 'อัลโตไวรัส' (อัลฟาไวรัส, ฟูโรไวรัส, ไวรัสตับอักเสบอี, ฮอร์เดไวรัส, โทบาโมไวรัส, โทบราไวรัส, ไตรคอร์นาไวรัส และอาจรวมถึงรูบิไวรัส) และกลุ่ม 'ไทโปไวรัส' (ไวรัสจุดใบคลอโรติกของแอปเปิล, คาร์ลาไวรัส, โพเท็กซ์ไวรัส และไทโมไวรัส)

กลุ่มอัลฟ่าคล้ายซูเปอร์กรุ๊ปสามารถแบ่งออกเป็นสามกลุ่มย่อย ได้อีก คือ ไวรัสคล้ายรูบี ไวรัสคล้ายโทบาโม และไวรัสคล้ายไทโม^{[ 27 ]}

งานวิจัยเพิ่มเติมได้ระบุกลุ่มไวรัส RNA สายบวก 5 กลุ่ม ซึ่งประกอบด้วย 4, 3, 3, 3 และ 1 อันดับ ตามลำดับ^{[ 28 ]}อันดับทั้ง 14 นี้ประกอบด้วย 31 วงศ์ไวรัส (รวมถึง 17 วงศ์ของไวรัสพืช) และ 48 สกุล (รวมถึง 30 สกุลของไวรัสพืช) การวิเคราะห์นี้ชี้ให้เห็นว่าอัลฟาไวรัสและฟลาวิไวรัสสามารถแยกออกเป็น 2 วงศ์ ได้แก่ Togaviridae และ Flaviridae ตามลำดับ แต่ชี้ให้เห็นว่าการจัดจำแนกทางอนุกรมวิธานอื่นๆ เช่น เพสติไวรัส ไวรัสตับอักเสบซี รูบิไวรัส ไวรัสตับอักเสบอี และอาร์เทอริไวรัส อาจไม่ถูกต้อง โคโรนาไวรัสและโทโรไวรัสดูเหมือนจะเป็นวงศ์ที่แตกต่างกันในอันดับที่แตกต่างกัน ไม่ใช่สกุลที่แตกต่างกันของวงศ์เดียวกันตามที่จัดจำแนกไว้ในปัจจุบัน ลูเทโอไวรัสดูเหมือนจะเป็น 2 วงศ์มากกว่า 1 วงศ์ และไวรัสจุดใบคลอโรติกของแอปเปิลดูเหมือนจะไม่ใช่คลอสเตอโรไวรัส แต่เป็นสกุลใหม่ของ Potexviridae

วิวัฒนาการของพิคอร์นาไวรัสโดยอาศัยการวิเคราะห์พอลิเมอเรส RNA และเฮลิเคส ของพวกมัน ดูเหมือนว่าจะมีอายุย้อนไปถึงการแยกตัวของยูคาริโอต [ ^{29 ] บรรพบุรุษ}ที่สันนิษฐานได้ของพวกมัน ได้แก่เรโทรเอเลเมนต์ กลุ่ม II ของแบคทีเรีย ตระกูล โปรตีเอส HtrA และแบคทีริโอเฟจ DNA

ไวรัส Partitivirus มีความเกี่ยวข้องและอาจวิวัฒนาการมาจากบรรพบุรุษ Totivirus ^{[ 30 ]}

ไฮโปไวรัสและบาร์นาไวรัสดูเหมือนจะมีบรรพบุรุษร่วมกันกับสายพันธุ์โพตีไวรัสและโซเบโมไวรัสตามลำดับ^{[ 30 ]}

การวิเคราะห์นี้ยังชี้ให้เห็นว่าไวรัส dsRNA ไม่มีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกัน แต่จัดอยู่ในอีกสี่คลาสเพิ่มเติม ได้แก่ Birnaviridae, Cystoviridae, Partitiviridae และ Reoviridae และอีกหนึ่งอันดับเพิ่มเติม (Totiviridae) ซึ่งเป็นหนึ่งในคลาสของไวรัส ssRNA ที่เป็นบวก ในซับไฟลัมเดียวกันกับไวรัส RNA สายบวก

การศึกษาหนึ่งได้แนะนำว่ามีกลุ่มใหญ่สองกลุ่ม: กลุ่มหนึ่งประกอบด้วยวงศ์Caliciviridae , FlaviviridaeและPicornaviridae และกลุ่มที่ ^สองประกอบด้วยวงศ์Alphatetraviridae , Birnaviridae , Cystoviridae , NodaviridaeและPermutotretraviridae ^{[ 31} ]

ไวรัสเหล่านี้มีจีโนมหลายประเภท ตั้งแต่โมเลกุล RNA เดี่ยวไปจนถึงแปดส่วน แม้จะมีความหลากหลาย แต่ดูเหมือนว่าอาจมีต้นกำเนิดมาจากสัตว์ขาปล้องและมีการแตกแขนงออกไปจากที่นั่น^{[ 32 ]}

ไวรัสดาวเทียมจำนวนหนึ่ง—ไวรัสที่ต้องการความช่วยเหลือจากไวรัสอื่นเพื่อทำให้วงจรชีวิตสมบูรณ์—ก็เป็นที่รู้จักเช่นกัน การจัดจำแนกทางอนุกรมวิธานของไวรัสเหล่านี้ยังไม่ได้รับการสรุป มีการเสนอสกุลต่อไปนี้ 4 สกุลสำหรับไวรัสดาวเทียม RNA สายเดี่ยวที่มีทิศทางบวกที่ติดเชื้อในพืช— Albetovirus , Aumaivirus , PapanivirusและVirtovirus ^{[ 33 ]} มีการเสนอ วงศ์— Sarthroviridaeซึ่งรวมถึงสกุลMacronovirus—สำหรับไวรัสดาวเทียม RNA สายเดี่ยวที่มีทิศทางบวกที่ติดเชื้อในสัตว์ขาปล้อง

มีสิบสองวงศ์และสกุลและชนิดที่ไม่ได้รับการกำหนดจำนวนหนึ่งที่ได้รับการยอมรับในกลุ่มนี้^{[ 8 ]}

• วงศ์Amalgaviridae
• วงศ์Birnaviridae
• วงศ์Chrysoviridae
• วงศ์ไวรัสCystoviridae
• วงศ์Endornaviridae
• วงศ์Hypoviridae
• วงศ์Megabirnaviridae
• วงศ์Partitiviridae
• วงศ์Picobirnaviridae
• วงศ์Reoviridae  – รวมถึงไวรัสโรตา
• วงศ์Totiviridae
• วงศ์Quadriviridae
• สกุลBotybirnavirus
• สายพันธุ์ที่ยังไม่ได้ระบุ
  • ไวรัส RNA Botrytis porri 1
  • ไวรัสเซอร์คูลิเฟอร์เทเนลลัส 1
  • ไวรัสเส้นใยคอลเลโตตริชุม คาเมลเลีย 1
  • ไวรัสที่เกี่ยวข้องกับโรคใบเหลืองในพืชตระกูลแตง
  • ไวรัสที่เกี่ยวข้องกับโรค Sclerotinia sclerotiorum
  • ไวรัส Spissistilus festinus 1

ในกลุ่มนี้มีการจัดจำแนกออกเป็น 3 อันดับ และ 34 วงศ์ นอกจากนี้ยังมีชนิดและสกุลที่ยังไม่ได้รับการจัดจำแนกอีกจำนวนหนึ่ง

• ลำดับNidovirales
  • วงศ์Arteriviridae
  • วงศ์Coronaviridae – ประกอบด้วยไวรัสโคโรนาในมนุษย์ (ไวรัสไข้หวัดธรรมดาHCoV-229E , HCoV-HKU1 , HCoV-NL63และHCoV-OC43 ), MERS-CoV , SARS-CoV-1และSARS-CoV-2
  • วงศ์Mesoniviridae
  • วงศ์Roniviridae
• ลำดับPicornavirales
  • วงศ์Dicistroviridae
  • วงศ์Iflaviridae
  • วงศ์Marnaviridae
  • ตระกูลPicornaviridae - รวมถึงโปลิโอไวรัส , ไรโนไวรัส (ไวรัสไข้หวัด), ไวรัสตับอักเสบเอ
  • วงศ์Secoviridaeรวมถึงวงศ์ย่อยComovirinae
  • สกุลBacillariornavirus
  • ไวรัสแมลงวันสาหร่ายทะเล
• สั่งซื้อไทโมไวรัส
  • วงศ์Alphaflexiviridae
  • วงศ์Betaflexiviridae
  • วงศ์Gammaflexiviridae
  • วงศ์Tymoviridae
• ยังไม่ได้กำหนด
  • วงศ์ไวรัสAlphatetraviridae
  • วงศ์Alvernaviridae
  • วงศ์Astroviridae
  • วงศ์Barnaviridae
  • วงศ์Benyviridae
  • วงศ์Botourmiaviridae
  • วงศ์Bromoviridae
  • วงศ์ไวรัสCaliciviridae – รวมถึงไวรัส Norwalk
  • วงศ์Carmotetraviridae
  • วงศ์Closteroviridae
  • วงศ์Flaviviridae – ประกอบด้วยไวรัสไข้เหลืองไวรัสเวสต์ไนล์ไวรัสตับอักเสบซีไวรัสไข้เลือดออก และ ไวรัสซิกา
  • วงศ์Fusariviridae
  • วงศ์Hepeviridae
  • วงศ์Hypoviridae
  • วงศ์Leviviridae
  • วงศ์Luteoviridae – รวมถึงไวรัสแคระเหลืองในข้าวบาร์เลย์
  • วงศ์Polycipiviridae
  • วงศ์Narnaviridae
  • วงศ์Nodaviridae
  • วงศ์ไวรัสPermutotetraviridae
  • วงศ์Potyviridae
  • วงศ์Sarthroviridae
  • ไวรัส ตระกูลสแตโต
  • วงศ์Togaviridae - รวมถึง ไวรัส หัดเยอรมัน , ไวรัส Ross River , ไวรัส Sindbis , ไวรัส Chikungunya
  • วงศ์ไวรัสTombusviridae
  • วงศ์Virgaviridae ^{[ 34 ]}
  • สกุลที่ยังไม่ได้กำหนด
    • สกุลบลูเนอร์ไวรัส
    • สกุลCilevirus
    • สกุลHigrevirus
    • สกุลIdaeovirus
    • สกุลNegevirus
    • สกุลOurmiavirus
    • สกุลPolemovirus
    • สกุลไวรัสไซนาย
    • สกุลโซเบโมไวรัส
  • สายพันธุ์ที่ยังไม่ได้ระบุ
    • ไวรัสอะซีร์โทซิฟอนพิซัม
    • บาสโตรไวรัส
    • ไวรัสแบล็กฟอร์ด
    • ไวรัสโรคเน่าวงแหวนของบลูเบอร์รี่
    • ไวรัสคาดิซิสโทร
    • ไวรัส Chara australis
    • ไวรัสขนาดเล็กพิเศษ
    • ไวรัสโรคใบเหลืองในโกจิเบอร์รี่
    • ไวรัส Harmonia axyridis 1
    • เฮเพลิไวรัส
    • ไวรัสเห็บจิงเหมิน
    • ไวรัสเลอ บลองก์
    • เนดิซิสโทรไวรัส
    • ไวรัส Nesidiocoris tenuis 1
    • ไวรัสนิฟลา
    • ไวรัส Nylanderia fulva 1
    • ไวรัสออร์เซย์
    • ไวรัส RNA Osedax japonicus 1
    • ไวรัสพิคาลิ
    • ไวรัสนิโดเซลล์หลั่งของแพลนารีเนีย
    • ไวรัสพลาสโมพารา ฮัลสเตดีไอ
    • โรเซลลิเนีย เนคาทริกซ์ ฟูซาริไวรัส 1
    • ไวรัสซานเตยล์
    • เซคาลิไวรัส
    • ไวรัส Solenopsis invicta 3
    • ไวรัสพยาธิตัวกลมสุกรใหญ่หวู่ฮั่น

ไวรัสดาวเทียม

• วงศ์Sarthroviridae
• สกุลอัลเบโตไวรัส
• สกุลAumaivirus
• สกุลPapanivirus
• สกุลไวรัส
• ไวรัสอัมพาตผึ้งเรื้อรัง

มีการอธิบายไวรัสคล้ายแอสโตรไวรัส/เฮเปไวรัสที่ไม่ได้รับการจำแนกประเภทไว้ด้วย^{[ 35 ]}

ไวรัสกลุ่มนี้ถูกจัดอยู่ในไฟลัมเดียวคือ Negarnaviricotaไฟลัมนี้ถูกแบ่งออกเป็นสองไฟลัมย่อยคือ HaploviricotinaและPolyploviricotinaภายในไฟลัมย่อย Haploviricotina ปัจจุบันมีการจำแนกออกเป็นสี่คลาส ได้แก่Chunqiuviricetes , Milneviricetes , MonjiviricetesและYunchangviricetesส่วนในไฟลัมย่อย Polyploviricotina มีการจำแนกออกเป็นสองคลาสได้แก่ EllioviricetesและInsthoviricetes

ปัจจุบันกลุ่มนี้ได้รับการยอมรับว่าเป็น 6 ชั้น 8 อันดับ และ 30 วงศ์ นอกจากนี้ยังมีจำนวนชนิดและสกุลที่ยังไม่ได้รับการจัดจำแนกอีกจำนวนมาก^{[ 8 ]}

• อาณาจักรริโบวิเรีย
  • อาณาจักรออร์ธอร์นาเวียร์
    • ไฟลัมNegarnaviricota ^{[ 36 ]}
      • ไฟลัมย่อยHaploviricotina
        • คลาสชุนฉิววิริเซทส์
          • คำสั่งมูวิราเลส
            • วงศ์Qinviridae
        • ชั้นMilneviricetes
          • ลำดับของเซอร์เพนโตไวรัส
            • วงศ์Aspiviridae
        • ชั้นMonjiviricetes
          • สั่งซื้อจิงชูไวรัล
            • วงศ์Chuviridae
          • สั่งซื้อMononegavirales
            • วงศ์Bornaviridae – ไวรัสโรคบอร์นา
            • วงศ์Filoviridae – รวมถึงไวรัสอีโบลา และ ไวรัสมาร์เบิร์ก
            • วงศ์Mymonaviridae
            • วงศ์Nyamiviridae ^{[ 37 ]}
            • วงศ์Paramyxoviridae – ประกอบด้วยไวรัสโรคหัดไวรัสคางทูม ไวรัส นิปาห์ไวรัสเฮนดราและไวรัส NDV
            • วงศ์Pneumoviridae – รวมถึงไวรัส RSVและMetapneumovirus
            • วงศ์ไวรัสRhabdoviridae – รวมถึงไวรัสโรคพิษสุนัขบ้า
            • วงศ์Sunviridae
              • สกุลAnphevirus
              • สกุลอาร์ลิไวรัส
              • สกุลChengtivirus
              • สกุลครัสตาไวรัส
              • สกุลWastrivirus
        • ชั้นYunchangviricetes
          • สั่งซื้อกูเจียนไวรัลส์
            • วงศ์Yueviridae
      • ไฟลัมย่อยPolyploviricotina
        • ชั้นบุนยาวิริเซเต ส
          • สั่งซื้อElliovirales
            • วงศ์Cruliviridae
            • วงศ์Fimoviridae
            • วงศ์Hantaviridae
            • วงศ์Peribunyaviridae
            • วงศ์ไวรัสPhasmaviridae
            • วงศ์ไวรัสTospoviridae
            • วงศ์ไวรัสTulasviridae
          • การสั่งซื้อไวรัส
            • วงศ์ไวรัสArenaviridae – รวมถึงไวรัส Lassa
            • วงศ์Discoviridae
            • วงศ์Konkoviridae
            • วงศ์Leishbuviridae
            • วงศ์Mypoviridae
            • วงศ์Nairoviridae
            • วงศ์Phenuiviridae
            • วงศ์ไวรัสTosoviridae
            • วงศ์Wupedeviridae
        • ชั้นInsthoviricetes
          • สั่งซื้อArticulavirales
            • วงศ์Amnoonviridae  – รวมถึงไวรัส Taastrup
            • วงศ์Orthomyxoviridae  – รวมถึงไวรัสไข้หวัดใหญ่

• 
  ไวรัสลาสซา ( Arenaviridae )
• 
  ไวรัสเยื่อหุ้มสมองอักเสบจากลิมโฟไซต์ ( Arenaviridae )
• 
  ไวรัสฮันตา ( Bunyaviridae )
• 
  ไวรัสมาเบิร์ก ( Filoviridae )
• 
  ไวรัสอีโบลา ( Filoviridae )
• 
  ไข้หวัดใหญ่ ( Orthomyxoviridae )
• 
  โรคหัด ( Paramyxoviridae )
• 
  ไวรัสคางทูม ( Paramyxoviridae )
• 
  ไวรัสซิงไซเชียลระบบทางเดินหายใจของมนุษย์ ( Paramyxoviridae )
• 
  ไวรัสพาราอินฟลูเอนซา ( Paramyxoviridae )
• 
  โรคพิษสุนัขบ้า ( Rhabdoviridae )
• 
  ไวรัสโรคปากและเท้าเปื่อย ( Rhabdoviridae )

• การจำแนกประเภทไวรัส
• รายชื่อไวรัส
• การจำลองแบบของไวรัส
• ความหมายเชิงบวก/เชิงลบ
• ไวรัสสัตว์
• ไวรัสอาร์เอ็นเอสายคู่
• เรโทรไวรัส
• ไวรัสดีเอ็นเอ
• องค์ประกอบการจำลองแบบซิสแอคติ้งของโนโรไวรัส
• ไวรอยด์

• ไวรัส RNA ในฐานข้อมูล Medical Subject Headings (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
• ไวรัสสัตว์