อ่าน 6 นาที
ดับเบิลยูดีอาร์12
โปรตีน WDR12 ซึ่งเป็น โปรตีน ที่เกี่ยวข้องกับการสร้างไรโบโซมนั้น ในมนุษย์จะถูกเข้ารหัสโดย ยีน WDR12 บน โครโมโซม 2 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] โปรตีน...
ดับเบิลยูดีอาร์12
| ดับเบิลยูดีอาร์12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | WDR12 , YTM1, โดเมนซ้ำ WD 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 616620 ; เอ็มจีไอ : 1927241 ; โฮโมโลยีน : 10098 ; การ์ดยีน : WDR12 ; OMA : WDR12 - ออโธโลจี | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
โปรตีน WDR12ซึ่งเป็นโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการสร้างไรโบโซมนั้น ในมนุษย์จะถูกเข้ารหัสโดยยีนWDR12 บนโครโมโซม 2 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] โปรตีนนี้แสดงออกอย่างแพร่หลายในเนื้อเยื่อและเซลล์หลายชนิด[ 8 ] WDR12 มีส่วนร่วมในการสร้างไรโบโซมและการเพิ่มจำนวนเซลล์ในฐานะส่วนประกอบของคอมเพล็กซ์ PeBoW [ 5 ]โปรตีนนี้เกี่ยวข้องกับโรคหัวใจและหลอดเลือดเช่นโรคหลอดเลือดหัวใจตีบและกล้ามเนื้อหัวใจตาย [ 9 ] ยีน PCSK9 ยังมีหนึ่งใน 27 ตำแหน่งที่เกี่ยวข้องกับความเสี่ยงที่เพิ่มขึ้นของโรคหลอดเลือดหัวใจตีบ[ 10 ]
โครงสร้าง
ยีน
ยีนWDR12อยู่บนโครโมโซม 2 ที่แถบ 2q33.2 และประกอบด้วยเอ็กซอน 13 เอ็กซอน[ 7 ]
โปรตีน
WDR12 เป็นสมาชิกของตระกูล WD repeat WDR12/YTM1 และประกอบด้วยWD repeat จำนวน 7 ชุด[ 11 ] [ 5 ]โดยทั่วไปแล้ว WD repeat แต่ละชุดจะมีไดเปปไทด์ทริปโต แฟน - แอสปา ร์ติกแอ ซิด ที่ปลาย C และไดเปปไทด์ไกลซีน - ฮิสติดีนที่ปลาย N [ 12 ]การรบกวน WD repeat ทั้ง 7 ชุดนี้จะทำให้โครงสร้างคล้ายใบพัดที่คาดการณ์ไว้เปลี่ยนแปลงไป และส่งผลให้ตำแหน่งในนิวคลีโอลัส เปลี่ยนแปลง ไป ด้วย [ 5 ]ที่ปลาย N ของ WDR12 มีโดเมนคล้ายยูบิควิติน (UBL)ซึ่งมีโครงสร้าง β-grasp fold คล้ายกับที่พบในยูบิควิติน โดเมน UBL จะจับกับโปรตีนมอเตอร์midasinและช่วยให้ปล่อยคอมเพล็กซ์ PeBoW ซึ่งประกอบด้วย WDR12, Pescadillo 1 ( PES1 ) และ Block of proliferation 1 ( BOP1 ) ออกจากอนุภาคก่อนไรโบโซม[ 12 ] [ 13 ]
การทำงาน
ยีน WDR12 มีการแสดงออกอย่างแพร่หลายในระหว่างการเจริญเติบโตของ ตัวอ่อน และพบในระดับสูงในต่อมไทมัสและอัณฑะของหนูโตเต็มวัย[ 5 ]เป็นปัจจัยสำคัญใน เส้นทางการสร้างไร โบโซม ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม ที่สร้างคอมเพล็กซ์ที่เสถียรชื่อ PeboW ร่วมกับPes1 และ Bop1 [ 5 ] [ 6 ] WDR12จำเป็นสำหรับการประมวลผลของrRNA ต้นแบบ 32S โดยไม่ส่งผลกระทบต่อการสังเคราะห์ทรานสคริปต์หลัก 45S/47S และทำหน้าที่ในการเจริญเติบโตของหน่วยย่อยไรโบโซม 60Sการลดปริมาณ WDR12 อย่างรุนแรงจะยับยั้งการเพิ่มจำนวนเซลล์[ 6 ]พบว่าการปิดกั้น WDR12 ด้วย siRNAในหลอดทดลองส่งผลให้การฟอสโฟรีเลชันของp38 MAPK , HSP27และERK1/2 ลดลง ในเซลล์กล้ามเนื้อหัวใจของทารกแรกเกิด ซึ่งอาจอธิบายบทบาทเชิงกลไกของ WDR12 ในการควบคุมการเพิ่มจำนวนเซลล์ การแยกแยะ และการอยู่รอดได้บางส่วน[ 14 ] [ 15 ]จากหลักฐานการจับกันของ WDR12 กับโดเมนไซโตพลาสมิกของNotch1 ในหลอดทดลอง จึงสันนิษฐานได้ว่า WDR12 ยังทำหน้าที่ในการปรับเปลี่ยนกิจกรรมการส่งสัญญาณของ Notch อีกด้วย [ 16 ]
ความสำคัญทางคลินิก
ในมนุษย์การศึกษาการเชื่อมโยงจีโนมทั่วทั้งจีโนม (GWAS) ขนาดใหญ่ได้ระบุโพลีมอร์ฟิซึมของนิวคลีโอไทด์เดี่ยว (SNP) หลายตัวที่สามารถทำซ้ำได้และมีความสัมพันธ์อย่างมากกับความเสี่ยงต่อโรคหลอดเลือดหัวใจและกล้ามเนื้อหัวใจตาย (เช่นหัวใจวาย ) ในการศึกษาทางพันธุกรรมขนาดใหญ่นี้ ตำแหน่งจีโนมทั้งหมด 46 ตำแหน่งเชื่อมโยงกับความแปรผันในความไวต่อโรคหลอดเลือดหัวใจ[ 17 ]ในบรรดา SNP ทั่วทั้งจีโนม 46 ตัว มี 12 ตัวที่แสดงความสัมพันธ์กับระดับไขมัน และ 5 ตัวแสดงความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญกับความดันโลหิตสูงดังนั้น หนึ่งในตัวแปรที่มีความสัมพันธ์อย่างมากที่สุดจึงตั้งอยู่บนตำแหน่ง WDR12 ซึ่งในตอนแรกมีความสัมพันธ์กับความเสี่ยงของกล้ามเนื้อหัวใจตายที่เกิดขึ้นในวัยหนุ่มสาวด้วย[ 17 ]อย่างไรก็ตาม บทบาททางเซลล์และหน้าที่ที่แน่นอนในหัวใจยังคงอยู่ระหว่างการระบุ
ไบโอมาร์กเกอร์
การแสดงออกของ WDR12 ในหัวใจหนูและหัวใจมนุษย์ได้รับการศึกษาโดยใช้การส่งยีน WDR12 เพื่อตรวจสอบผลกระทบโดยตรงของการทำงานและโครงสร้างของ WDR12 ต่อการปรับโครงสร้าง หัวใจที่ไม่เหมาะสม โดยเฉพาะอย่างยิ่งในห้องหัวใจซ้ายการศึกษาล่าสุดนี้เปิดเผยว่าการแสดงออกของ WDR12 ที่มากเกินไปโดยการส่งยีนอาจทำให้การทำงานของหัวใจทั้งในระยะซิสโตลและไดแอสโตลแย่ลง ในทำนองเดียวกัน การวิเคราะห์กลุ่มตัวอย่างมนุษย์ 1400 คนในภายหลังยืนยันว่าตัวแปร WDR12 เกี่ยวข้องกับความผิดปกติของไดแอสโตล[ 12 ]
นอกจากนี้ การศึกษาคะแนนความเสี่ยงทางพันธุกรรมแบบหลายตำแหน่ง ซึ่งอิงจากการรวมกันของ 27 ตำแหน่ง รวมถึงยีน WDR12 ได้ระบุบุคคลที่มีความเสี่ยงเพิ่มขึ้นต่อการเกิด โรค หลอดเลือดหัวใจ และการเกิดซ้ำ ตลอด จนได้รับประโยชน์ทางคลินิกที่เพิ่มขึ้นจาก การรักษา ด้วยสแตติน การศึกษานี้อิงจากการศึกษากลุ่มประชากรในชุมชน (การศึกษา Malmo Diet and Cancer) และ การทดลองแบบสุ่มควบคุมเพิ่มเติมอีกสี่ครั้งของกลุ่มประชากรป้องกันขั้นต้น (JUPITER และ ASCOT) และกลุ่มประชากรป้องกันขั้นทุติยภูมิ (CARE และ PROVE IT-TIMI 22) [ 10 ]
ปฏิสัมพันธ์
แผนที่เส้นทางแบบโต้ตอบ
WDR12 มีส่วนร่วมในปฏิกิริยาภายในเส้นทางหลักของการประมวลผล rRNA ในนิวคลีโอลัส(เก็บถาวรเมื่อ 2016-08-26 ที่Wayback Machine )
อ่านเพิ่มเติม
- Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (มกราคม 2545). "การวิเคราะห์โปรตีนโดยตรงของนิวคลีโอลัสของมนุษย์" Current Biology . 12 (1): 1– 11. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
- Nal B, Mohr E, Silva MI, Tagett R, Navarro C, Carroll P, Depetris D, Verthuy C, Jordan BR, Ferrier P (มกราคม 2545). "Wdr12 ยีนของหนูที่เข้ารหัสโปรตีน WD-Repeat ใหม่ที่มีโดเมนปลายอะมิโนคล้าย notchless" Genomics . 79 (1): 77– 86. doi : 10.1006/geno.2001.6682 . PMID 11827460 .
- เชิร์ล เอ, คูเต้ วาย, เดออน ซี, คัลเล่ เอ, คินไบเตอร์ เค, ซานเชซ เจซี, เกรโก เอ, โฮชสตราเซอร์ ดี, ดิแอซ เจเจ (พฤศจิกายน 2545) "การวิเคราะห์โปรตีโอมิกเชิงหน้าที่ของนิวเคลียสของมนุษย์" . อณูชีววิทยาของเซลล์ . 13 (11): 4100– 9. ดอย : 10.1091/ mbc.E02-05-0271 PMC 133617 . PMID 12429849 .
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (มกราคม 2548). "พลวัตของโปรตีนในนิวเคลียส" Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
- Higa LA, Wu M, Ye T, Kobayashi R, Sun H, Zhang H (พฤศจิกายน 2549). "CUL4-DDB1 ubiquitin ligase มีปฏิสัมพันธ์กับโปรตีน WD40-repeat หลายตัวและควบคุมการเมทิลเลชั่นของฮิสโตน" Nature Cell Biology . 8 (11): 1277– 83. doi : 10.1038/ncb1490 . hdl : 10397/34293 . PMID 17041588 . S2CID 22180568 .
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ดับเบิลยูดีอาร์12
โปรตีน WDR12 ซึ่งเป็น โปรตีน ที่เกี่ยวข้องกับการสร้างไรโบโซมนั้น ในมนุษย์จะถูกเข้ารหัสโดย ยีน WDR12 บน โครโมโซม 2 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] โปรตีน...
ยีน
ยีน WDR12 อยู่บนโครโมโซม 2 ที่แถบ 2q33.2 และประกอบด้วยเอ็กซอน 13 เอ็ก ซอน [ 7 ]
โปรตีน
WDR12 เป็นสมาชิกของตระกูล WD repeat WDR12/YTM1 และประกอบด้วย WD repeat จำนวน 7 ชุด [ 11 ] [ 5 ] โดยทั่วไปแล้ว WD repeat แต่ละชุดจะมี ไดเปปไทด์ ทริปโต แฟน - แอสปา ร์ติกแอ ซิด ที่ปลาย C และไดเปป ไทด์ไกลซีน - ฮิสติดีน ที่ปลาย N [ 12 ] การรบกวน WD repeat ทั้ง 7...
การทำงาน
ยีน WDR12 มีการแสดงออกอย่างแพร่หลายในระหว่าง การเจริญเติบโตของ ตัวอ่อน และพบในระดับสูงใน ต่อมไทมัส และ อัณฑะ ของหนูโตเต็มวัย [ 5 ] เป็นปัจจัยสำคัญใน เส้นทางการสร้างไร โบโซม ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม ที่สร้างคอมเพล็กซ์ที่เสถียรชื่อ PeboW ร่วมกับPes1 และ Bop1 [ 5...