กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 13 นาที

เอทีพี ซินเทส

เอนไซม์ ATP synthase เป็น เอนไซม์ ที่เร่งปฏิกิริยาการสร้างโมเลกุลเก็บพลังงาน อะดีโนซีนไตรฟอสเฟต (ATP) โดยใช้ อะดีโนซีนไดฟอสเฟต (ADP) และ ฟอสเฟต อนินทรีย์ (Pi ) ATP synthase เป็น...

เอทีพี ซินเทส

เอทีพี ซินเทส
แบบจำลองโมเลกุลของเอนไซม์ ATP synthase ที่ได้จากการวิเคราะห์ด้วยรังสีเอกซ์ ส่วนสเตเตอร์ไม่ได้แสดงในภาพนี้
ตัวระบุ
หมายเลข EC7.1.2.2
หมายเลข CAS9000-83-3
ฐานข้อมูล
อินท์เอ็นซ์มุมมองของ IntEnz
เบรนด้าเบรนด้าเข้าร่วม
เอ็กซ์แพซี่มุมมองของ NiceZyme
เคกก์รายการ KEGG
เมตาไซค์วิถีการเผาผลาญ
ไพรแอมประวัติโดยย่อ
โครงสร้างPDBRCSB PDB PDBe PDBsum
ออนโทโลยีของยีนอามิโก้ / ควิกโก้
ค้นหา
พีเอ็มซีบทความ
พับเมดบทความ
เอ็นซีบีไอโปรตีน

เอนไซม์ ATP synthaseเป็นเอนไซม์ที่เร่งปฏิกิริยาการสร้างโมเลกุลเก็บพลังงานอะดีโนซีนไตรฟอสเฟต (ATP) โดยใช้อะดีโนซีนไดฟอสเฟต (ADP) และฟอสเฟต อนินทรีย์ (Pi ) ATP synthase เป็นเครื่องจักรระดับโมเลกุลปฏิกิริยารวมที่เร่งโดย ATP synthase คือ:

  • ADP + Pi + 2H + ออก ⇌ ATP + H2O + 2H + เข้า

เอนไซม์ ATP synthase อยู่บริเวณเยื่อหุ้มเซลล์และสร้างช่องเปิดที่โปรตอนสามารถเคลื่อนที่ผ่านจากบริเวณที่มีความเข้มข้นสูงไปยังบริเวณที่มีความเข้มข้นต่ำ ทำให้เกิดพลังงานสำหรับการสังเคราะห์ ATP ความแตกต่างของศักย์ไฟฟ้า เคมีนี้ เกิดขึ้นจากห่วงโซ่การขนส่งอิเล็กตรอนและช่วยให้เซลล์สามารถเก็บพลังงานในรูป ATP ไว้ใช้ในภายหลัง ใน เซลล์โปรคาริโอต เอนไซม์ ATP synthase อยู่บริเวณเยื่อหุ้มพลาสมาในขณะที่ใน เซลล์ยูคาริโอตจะอยู่บริเวณเยื่อหุ้มไมโทคอนเดรีย ชั้นใน สิ่งมีชีวิตที่สามารถสังเคราะห์แสงได้ยังมีเอนไซม์ ATP synthase อยู่บริเวณเยื่อไทลาคอยด์ซึ่งในพืชจะอยู่ในคลอโรพลาสต์และในไซยาโนแบคทีเรียจะอยู่ในไซโตพลาสซึม

ATP synthase ของยูคาริโอตเป็นF-ATPases (ซึ่งโดยปกติจะทำงานเป็น ATP synthase แทนที่จะเป็นATPaseในสภาพแวดล้อมของเซลล์) และทำงาน "ในทิศทางตรงกันข้าม" กับ ATPase (ATPases เร่งปฏิกิริยาการสลายตัวของATPเป็นADPและไอออนฟอสเฟต อิสระ ) บทความนี้กล่าวถึงประเภทนี้เป็นหลัก F-ATPase ประกอบด้วยหน่วยย่อยหลักสองหน่วยคือ F Oและ F 1ซึ่งมีกลไกมอเตอร์แบบหมุนที่ช่วยให้สามารถผลิต ATP ได้[ 1 ] [ 2 ]

การตั้งชื่อ

เศษส่วน F 1ได้รับชื่อมาจากคำว่า "เศษส่วน 1" และ F O (เขียนเป็นตัวห้อย "o" ไม่ใช่ "ศูนย์") ได้รับชื่อมาจากการเป็นเศษส่วนที่จับกับโอลิโกไมซินซึ่งเป็นยาปฏิชีวนะที่ได้จากธรรมชาติชนิดหนึ่งที่สามารถยับยั้งหน่วย F Oของ ATP synthase ได้ [ 3 ] [ 4 ]บริเวณการทำงานเหล่านี้ประกอบด้วยหน่วยย่อยโปรตีนที่แตกต่างกัน — โปรดดูตาราง เอนไซม์นี้ใช้ในการสังเคราะห์ ATP ผ่านการหายใจแบบใช้ออกซิเจน

โครงสร้างและหน้าที่

ไมโตคอนเดรียล ATP ซินเทสของวัว บริเวณ F O , F 1 , แกน และสเตเตอร์ มีรหัสสีเป็นสีม่วงแดง สีเขียว สีส้ม และสีฟ้า ตามลำดับ เช่นF O , F 1 , แกน , สเตเตอร์[ 5 ] [ 6 ]
แบบจำลองอย่างง่ายของ F O F 1 -ATPase หรือ ATP synthase ของE. coliหน่วยย่อยของเอนไซม์ถูกระบุชื่อไว้อย่างเหมาะสม
กลไกการหมุนของเอนไซม์ ATP synthase

ATP synthase ซึ่งอยู่ภายในเยื่อไทลาคอยด์และเยื่อไมโทคอนเดรียชั้นในประกอบด้วยสองส่วนคือ F Oและ F 1 F Oทำให้เกิดการหมุนของ F 1และประกอบด้วยวงแหวน c และหน่วยย่อย a, b สองหน่วย และ F6 F 1ประกอบด้วยหน่วยย่อย α, β, γ และ δ F 1มีส่วนที่ละลายน้ำได้ซึ่งสามารถไฮโดรไลซ์ ATP ได้ ในทางกลับกัน F Oส่วนใหญ่มีบริเวณที่ไม่ชอบน้ำ F Oและ F 1สร้างทางเดินสำหรับการเคลื่อนที่ของโปรตอนข้ามเยื่อหุ้มเซลล์[ 7 ]

ภูมิภาคF 1

ส่วน F1 ของเอนไซม์ ATP synthase มี คุณสมบัติ ชอบน้ำและทำหน้าที่ไฮโดรไลซ์ ATP หน่วย F1 ยื่นเข้าไปในไซโตพลาสซึม ( เมทริกซ์และสโตรมาในไมโทคอนเดรียและคลอโรพลาสต์ตามลำดับ) หน่วยย่อย α และ β รวมกันเป็นเฮกซาเมอร์ที่มีตำแหน่งจับ 6 ตำแหน่ง โดยสามตำแหน่งนั้นไม่มีฤทธิ์เร่งปฏิกิริยาและจับกับ ADP

หน่วยย่อยอีกสามหน่วยทำหน้าที่เร่งปฏิกิริยาการสังเคราะห์ ATP หน่วยย่อย F 1 อื่นๆ γ, δ และ ε เป็นส่วนหนึ่งของกลไกมอเตอร์หมุน (โรเตอร์/แกน) หน่วยย่อย γ ช่วยให้ β เปลี่ยนแปลงโครงสร้าง (เช่น สถานะปิด สถานะเปิดครึ่งหนึ่ง และสถานะเปิด) ซึ่งช่วยให้ ATP สามารถจับและปล่อยออกมาได้เมื่อสังเคราะห์แล้ว อนุภาค F 1มีขนาดใหญ่และสามารถมองเห็นได้ในกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่งผ่านโดยการย้อมสีแบบลบ[ 8 ]อนุภาคเหล่านี้มีเส้นผ่านศูนย์กลาง 9 นาโนเมตรที่กระจายอยู่ทั่วเยื่อหุ้มไมโทคอนเดรียชั้นใน

F 1 – หน่วยย่อย[ 9 ]
หน่วยย่อยยีนมนุษย์บันทึก
อัลฟ่าเอทีพี5เอฟ1เอ ,เอทีพีเอเอฟ2
เบต้าเอทีพี5เอฟ1บี ,เอทีพีเอเอฟ1
แกมมาเอทีพี5เอฟ1ซี
เดลต้าเอทีพี5เอฟ1ดี"เดลต้า" ของไมโทคอนเดรีย คือ "เอปซิลอน" ของแบคทีเรีย/คลอโรพลาสต์
เอปซิลอนเอทีพี5เอฟ1อีลักษณะเฉพาะของไมโทคอนเดรีย
โอเอสซีพีเอทีพี5พีโอเรียกว่า "เดลต้า" ในรูปแบบแบคทีเรียและคลอโรพลาสต์

ภูมิภาคF O

หน่วยย่อย F O F6 จากบริเวณก้านรอบนอกของ ATP synthase [ 10 ]

F Oเป็น โปรตีน ที่ไม่ละลาย น้ำ มีซับยูนิต 8 หน่วยและวงแหวนทรานส์เมมเบรน วงแหวนมีรูปร่างแบบเตตระเมอร์ ที่มีโปรตีน แบบเฮลิกซ์-ลูป-เฮลิกซ์ซึ่งจะมีการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างเมื่อถูกโปรตอนและดีโปรตอนทำให้ซับยูนิตข้างเคียงหมุน ส่งผลให้ F O หมุน ซึ่งส่งผลต่อโครงสร้างของ F 1ด้วยส่งผลให้สถานะของซับยูนิตอัลฟาและเบตาเปลี่ยนไป บริเวณ F Oของ ATP synthase เป็นรูพรุนโปรตอนที่ฝังอยู่ในเยื่อหุ้มไมโทคอนเดรีย ประกอบด้วยซับยูนิตหลัก 3 หน่วย คือ a, b และ c ซับยูนิต c 6 หน่วยประกอบเป็นวงแหวนโรเตอร์ และซับยูนิต b ประกอบเป็นก้านที่เชื่อมต่อกับ F 1 OSCP ซึ่งป้องกันไม่ให้เฮกซาเมอร์ αβ หมุน ซับยูนิต a เชื่อมต่อ b กับวงแหวน c [ 11 ]มนุษย์มีซับยูนิตเพิ่มเติมอีก 6 หน่วย คือd , e , f , g , F6และ8 (หรือ A6L) ส่วนนี้ของเอนไซม์ตั้งอยู่ในเยื่อหุ้มชั้นในของไมโทคอนเดรีย และเชื่อมโยงการเคลื่อนย้ายโปรตอนเข้ากับการหมุนซึ่งก่อให้เกิดการสังเคราะห์ ATP ในบริเวณ F1

ในยูคาริโอต F O ของไมโทคอนเดรีย จะก่อตัวเป็นไดเมอร์ที่โค้งงอเยื่อหุ้มเซลล์ ไดเมอร์เหล่านี้จะจัดเรียงตัวเองเป็นแถวยาวที่ปลายคริสเตซึ่งอาจเป็นขั้นตอนแรกของการก่อตัวของคริสเต[ 12 ] แบบจำลองอะตอมสำหรับบริเวณ F Oไดเมอร์ของยีสต์ถูกกำหนดโดย cryo-EM ที่ความละเอียดโดยรวม 3.6 Å [ 13 ]

F O -หน่วยย่อยหลัก
หน่วยย่อยยีนมนุษย์
เอเอ็มที-เอทีพี6
เอทีพี5พีบี
ATP5MC1 , ATP5MC2 , ATP5MC3

แบบจำลองการผูกมัด

กลไกการทำงานของ ATP synthase แสดงให้เห็นว่า ADP และ Pi (สีชมพู) รวมกันเป็น ATP (สีแดง) ในขณะที่หน่วยย่อยแกมมา (γ) ที่หมุนอยู่ (สีดำ) ทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงโครงสร้าง
ภาพแสดงการทำงานของเอนไซม์ ATP synthase โดยใช้ ความแตกต่างของศักย์โปรตอน แบบเคมิโอสมอติกในการขับเคลื่อนการสังเคราะห์ ATP ผ่านกระบวนการออกซิเดชั่นฟอสโฟรีเลชั่

ในช่วงทศวรรษ 1960 ถึง 1970 พอล บอยเออร์ศาสตราจารย์จาก UCLAได้พัฒนาทฤษฎีกลไกการเปลี่ยนแปลงการจับตัว หรือกลไกพลิกกลับ (flip-flop) ซึ่งตั้งสมมติฐานว่าการสังเคราะห์ ATP ขึ้นอยู่กับการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของ ATP synthase ที่เกิดจากการหมุนของหน่วยย่อยแกมมา กลุ่มวิจัยของจอห์น อี. วอล์คเกอร์ซึ่งขณะนั้นอยู่ที่ห้องปฏิบัติการชีววิทยาโมเลกุล MRCในเคมบริดจ์ได้ตกผลึกโดเมนเร่งปฏิกิริยา F1 ของ ATP synthase โครงสร้างดังกล่าว ซึ่งในขณะนั้นเป็นโครงสร้างโปรตีนแบบไม่สมมาตรที่ใหญ่ที่สุดเท่าที่รู้จัก บ่งชี้ว่าแบบจำลองการเร่งปฏิกิริยาแบบหมุนของบอยเออร์นั้นถูกต้องโดยพื้นฐานแล้ว สำหรับการไขปริศนานี้ บอยเออร์และวอล์คเกอร์จึงได้รับรางวัลโนเบลสาขาเคมีร่วมกันใน ปี 1997

โครงสร้างผลึกของ F1 แสดง ให้เห็น ซับยูนิตอัลฟาและเบตาที่สลับกัน(อย่างละ 3 หน่วย) เรียงตัวคล้ายกลีบส้มรอบซับยูนิตแกมมาที่ไม่สมมาตรซึ่งหมุนอยู่ ตามแบบจำลองปัจจุบันของการสังเคราะห์ ATP (ที่รู้จักกันในชื่อแบบจำลองเร่งปฏิกิริยาแบบสลับ) ศักย์ไฟฟ้าข้ามเยื่อหุ้มเซลล์ที่สร้างขึ้นโดยไอออนโปรตอน (H+) ที่ส่งมาจากห่วงโซ่การขนส่งอิเล็กตรอน จะผลักดันไอออนโปรตอน (H+) จากช่องว่างระหว่างเยื่อหุ้มเซลล์ผ่านเยื่อหุ้มเซลล์โดยผ่านบริเวณ F1O ของ ATP synthase ส่วนหนึ่งของ F1O (วงแหวนของซับยูนิต c ) จะหมุนเมื่อโปรตอนผ่านเยื่อหุ้มเซลล์วงแหวน cยึดติดแน่นกับก้านกลางที่ไม่สมมาตร (ซึ่งประกอบด้วยซับยูนิตแกมมาเป็นหลัก) ทำให้มันหมุนภายในอัลฟา3เบตา3ของ F1 ส่งผลให้ตำแหน่งการจับนิวคลีโอไทด์เร่งปฏิกิริยา 3 ตำแหน่งเกิดการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างหลายขั้นตอนซึ่งนำไปสู่การสังเคราะห์ ATP หน่วยย่อย หลัก F1 ถูกขัดขวางไม่ให้หมุนไปพร้อมกับแกนหมุนกลางโดยแกนรอบนอกที่เชื่อมต่ออัลฟา3เบตา3กับส่วนที่ไม่หมุนของ F2O โครงสร้างของเอนไซม์ ATP synthase ที่สมบูรณ์ในปัจจุบันเป็นที่ทราบกันในระดับความละเอียดต่ำจาก การศึกษา ด้วยกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบแช่แข็ง (cryo-EM) แบบจำลอง cryo-EM ของ ATP synthase ชี้ให้เห็นว่าแกนรอบนอกเป็นโครงสร้างที่ยืดหยุ่นซึ่งพันรอบคอมเพล็กซ์ขณะที่เชื่อมต่อ F1 กับ F2O ภายใต้สภาวะที่เหมาะสม ปฏิกิริยาของเอนไซม์ยังสามารถเกิดขึ้นในทางกลับกันได้ โดยการไฮโดรไลซิสของATPจะขับเคลื่อนการปั๊มโปรตอนข้ามเยื่อหุ้มเซลล์

กลไกการเปลี่ยนแปลงการจับยึดเกี่ยวข้องกับการหมุนเวียนของไซต์ที่ใช้งานอยู่ของซับยูนิต β ระหว่างสามสถานะ[ 14 ]ในสถานะ "หลวม" ADP และฟอสเฟตจะเข้าสู่ไซต์ที่ใช้งานอยู่ ในแผนภาพด้านข้างนี้แสดงด้วยสีชมพู จากนั้นเอนไซม์จะมีการเปลี่ยนแปลงรูปร่างและบังคับให้โมเลกุลเหล่านี้มารวมกัน โดยไซต์ที่ใช้งานอยู่ในสถานะ "แน่น" ที่เกิดขึ้น (แสดงด้วยสีแดง) จะจับกับโมเลกุล ATP ที่ผลิตขึ้นใหม่ด้วยความสัมพันธ์ ที่สูงมาก สุดท้าย ไซต์ที่ใช้งานอยู่จะหมุนเวียนกลับไปสู่สถานะเปิด (สีส้ม) ปล่อย ATP และจับกับ ADP และฟอสเฟตเพิ่มเติม พร้อมสำหรับรอบการผลิต ATP ครั้งต่อไป[ 15 ]

บทบาททางสรีรวิทยา

เช่นเดียวกับเอนไซม์อื่นๆ กิจกรรมของ F1FO ATP synthase สามารถย้อนกลับได้ หาก มีATP ในปริมาณมากพอ จะทำให้เกิดการไล่ระดับโปรตอน ข้ามเยื่อหุ้มเซลล์ ซึ่งแบคทีเรีย ที่หมักอาหารจะใช้ประโยชน์จากสิ่งนี้ โดยแบคทีเรียเหล่านี้ไม่มีห่วงโซ่การขนส่งอิเล็กตรอน แต่จะไฮโดรไลซ์ ATP เพื่อสร้างการไล่ระดับโปรตอน ซึ่งใช้ในการขับเคลื่อนแฟลเจลลาและการขนส่งสารอาหารเข้าสู่เซลล์

ในแบคทีเรีย ที่หายใจ ภายใต้สภาวะทางสรีรวิทยา เอนไซม์ ATP synthase โดยทั่วไปจะทำงานในทิศทางตรงกันข้าม โดยสร้าง ATP โดยใช้แรงขับเคลื่อนโปรตอนที่สร้างขึ้นโดย ห่วงโซ่ การขนส่งอิเล็กตรอนเป็นแหล่งพลังงาน กระบวนการโดยรวมของการสร้างพลังงานในลักษณะนี้เรียกว่าการฟอสฟอริเลชันแบบออกซิเดชันกระบวนการเดียวกันนี้เกิดขึ้นในไมโทคอนเดรียซึ่ง ATP synthase ตั้งอยู่ในเยื่อหุ้มไมโทคอนเดรียชั้นใน และส่วน F1 ยื่นเข้าไปในเมทริกซ์ของไมโทคอนเดรียโดยการปั๊มไอออนโปรตอนเข้าไปในเมทริกซ์ ATP-synthase จะเปลี่ยน ADP ให้เป็น ATP

วิวัฒนาการ

เชื่อกันว่า วิวัฒนาการของ ATP synthase เป็นแบบโมดูลาร์ โดยที่หน่วยย่อยสองหน่วยที่ทำงานแยกจากกันได้มารวมกันและได้รับฟังก์ชันการทำงานใหม่[ 16 ] [ 17 ] การรวมตัวนี้ดูเหมือนจะเกิดขึ้นในช่วงต้นของประวัติศาสตร์วิวัฒนาการ เนื่องจากโครงสร้างและกิจกรรมของเอนไซม์ ATP synthase ที่เหมือนกันโดยพื้นฐานนั้นมีอยู่ในสิ่งมีชีวิตทุกอาณาจักร[ 16 ] F-ATP synthase แสดงความคล้ายคลึงกันในเชิงฟังก์ชันและกลไกกับV-ATPaseอย่าง มาก [ 18 ]อย่างไรก็ตาม ในขณะที่ F-ATP synthase สร้าง ATP โดยใช้การไล่ระดับโปรตอน V-ATPase สร้างการไล่ระดับโปรตอนโดยใช้ ATP ทำให้ค่า pH ต่ำถึง 1 [ 19 ]

บริเวณ F1 ยังแสดงความคล้ายคลึงอย่างมีนัยสำคัญกับดีเอ็นเอเฮลิเคส แบบเฮกซาเมอร์ (โดยเฉพาะปัจจัย Rho ) และบริเวณเอนไซม์ทั้งหมดแสดงความคล้ายคลึงกับH ใน ระดับหนึ่ง+-ขับเคลื่อนT3SSหรือคอมเพล็กซ์มอเตอร์แฟลเจลลา[ 18 ] [ 20 ] [ 21 ] เฮกซาเมอร์ α 3 β 3ของบริเวณ F 1แสดงความคล้ายคลึงทางโครงสร้างอย่างมีนัยสำคัญกับเฮลิเคส DNA แบบเฮกซาเมอร์ ทั้งสองก่อตัวเป็นวงแหวนที่มีสมมาตรการหมุน 3 เท่าโดยมีรูพรุนตรงกลาง ทั้งสองมีบทบาทที่ขึ้นอยู่กับการหมุนสัมพัทธ์ของโมเลกุลขนาดใหญ่ภายในรูพรุน เฮลิเคส DNA ใช้รูปร่างเกลียวของ DNA เพื่อขับเคลื่อนการเคลื่อนที่ไปตามโมเลกุล DNA และตรวจจับการขดตัว ในขณะที่เฮกซาเมอร์ α 3 β 3ใช้การเปลี่ยนแปลงโครงสร้างผ่านการหมุนของซับยูนิต γ เพื่อขับเคลื่อนปฏิกิริยาเอนไซม์[ 22 ]

เอ+มอเตอร์ของอนุภาค F Oแสดงให้เห็นถึงความคล้ายคลึงกันในเชิงฟังก์ชันอย่างมากกับH+มอเตอร์ที่ขับเคลื่อนแฟลเจลลา[ 18 ]ทั้งสองมีวงแหวนของโปรตีนอัลฟาเฮลิกซ์ขนาดเล็กจำนวนมากที่หมุนสัมพันธ์กับโปรตีนที่อยู่กับที่ใกล้เคียง โดยใช้H+ความชันศักยภาพเป็นแหล่งพลังงาน อย่างไรก็ตาม การเชื่อมโยงนี้ค่อนข้างอ่อนแอ เนื่องจากโครงสร้างโดยรวมของมอเตอร์แฟลเจลลัมมีความซับซ้อนมากกว่าอนุภาค F O มาก และวงแหวนที่มีโปรตีนหมุนประมาณ 30 ตัวนั้นมีขนาดใหญ่กว่าโปรตีนเกลียว 10, 11 หรือ 14 ตัวในคอมเพล็กซ์ F O มาก อย่างไรก็ตาม ข้อมูลโครงสร้างล่าสุดแสดงให้เห็นว่าวงแหวนและก้านมีโครงสร้างคล้ายกับ อนุภาคF 1 [ 21 ]

การเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของ ATP synthase ระหว่างการสังเคราะห์

ทฤษฎีวิวัฒนาการแบบโมดูลาร์สำหรับการกำเนิดของ ATP synthase ชี้ให้เห็นว่ามีหน่วยย่อยสองหน่วยที่มีหน้าที่อิสระต่อกัน ได้แก่ DNA helicase ที่มีกิจกรรม ATPase และH+มอเตอร์สามารถจับกันได้ และการหมุนของมอเตอร์จะขับเคลื่อนกิจกรรม ATPase ของเฮลิเคสในทิศทางตรงกันข้าม[ 16 ] [ 22 ]จากนั้นคอมเพล็กซ์นี้ก็พัฒนาให้มีประสิทธิภาพมากขึ้นและในที่สุดก็พัฒนาเป็น ATP synthase ที่ซับซ้อนในปัจจุบัน หรืออีกทางหนึ่ง DNA helicase/ H+คอมเพล็กซ์มอเตอร์อาจมีH+กิจกรรมของปั๊มร่วมกับกิจกรรม ATPase ของเฮลิเคสที่ขับเคลื่อนH+มอเตอร์กลับทิศทาง[ 16 ]สิ่งนี้อาจวิวัฒนาการเพื่อดำเนินการปฏิกิริยาย้อนกลับและทำหน้าที่เป็น ATP synthase [ 17 ] [ 23 ] [ 24 ]

สารยับยั้ง

มีการค้นพบสารยับยั้ง ATP synthase ทั้งจากธรรมชาติและสังเคราะห์หลายชนิด[ 25 ]สารเหล่านี้ถูกนำมาใช้เพื่อตรวจสอบโครงสร้างและกลไกของ ATP synthase บางชนิดอาจมีประโยชน์ในการรักษา มีสารยับยั้ง ATP synthase หลายประเภท ได้แก่ สารยับยั้งเปปไทด์ สารเคมีจากพืชกลุ่ม โพลีฟี นอล โพลีคี ไทด์ สารประกอบออร์กา โนทิน อนุพันธ์โพลีเอนิก α-ไพโรน สารยับยั้งประจุบวก สารอะนาล็อกของสารตั้งต้น สารปรับเปลี่ยนกรดอะมิโน และสารเคมีอื่นๆ[ 25 ]สารยับยั้ง ATP synthase ที่ใช้กันทั่วไปบางชนิด ได้แก่โอลิโกไมซิน และDCCD

ในสิ่งมีชีวิตต่าง ๆ

แบคทีเรีย

E. coli ATP synthase เป็น ATP synthase รูปแบบที่ง่ายที่สุดที่รู้จัก โดยมีหน่วยย่อยที่แตกต่างกัน 8 ชนิด [ 11 ]

F-ATPases ของแบคทีเรียบางครั้งสามารถทำงานย้อนกลับได้ ทำให้กลายเป็น ATPase [ 26 ]แบคทีเรียบางชนิดไม่มี F-ATPase แต่ใช้ ATPase ชนิด A/V ที่ทำงานแบบสองทิศทาง[ 9 ]

ยีสต์

ยีสต์ ATP synthase เป็นหนึ่งใน ATP synthase ของยูคาริโอตที่ได้รับการศึกษามากที่สุด และมีการระบุซับยูนิต F 1 จำนวน 5 ซับยูนิต F O จำนวน 8 ซับยูนิต และโปรตีนที่เกี่ยวข้องอีก 7 ซับยูนิต [ 7 ]โปรตีนเหล่านี้ส่วนใหญ่มีโฮโมล็อกในยูคาริโอตอื่นๆ[ 27 ] [ 28 ] [ 29 ] [ 30 ]

ปลูก

ในพืช เอนไซม์ ATP synthase ยังพบได้ในคลอโรพลาสต์ (CF 1 F O -ATP synthase) เอนไซม์นี้ถูกรวมเข้ากับ เยื่อ ไทลาคอยด์ส่วนCF 1 จะยึดติดอยู่ใน สโตรมาซึ่งเป็นที่เกิดปฏิกิริยามืดของการสังเคราะห์แสง (เรียกอีกอย่างว่าปฏิกิริยาที่ไม่ขึ้นกับแสงหรือวัฏจักรแคลวิน ) และการสังเคราะห์ ATP โครงสร้างโดยรวมและกลไกการเร่งปฏิกิริยาของ ATP synthase ในคลอโรพลาสต์นั้นเกือบจะเหมือนกับเอนไซม์ในแบคทีเรีย อย่างไรก็ตาม ในคลอโรพลาสต์แรงขับเคลื่อนโปรตอนไม่ได้เกิดจากห่วงโซ่การขนส่งอิเล็กตรอนของการหายใจ แต่เกิดจากโปรตีนสังเคราะห์แสงขั้นต้นซินเทสมีส่วนแทรก 40 กรดอะมิโนในหน่วยย่อยแกมมาเพื่อยับยั้งกิจกรรมที่สิ้นเปลืองเมื่ออยู่ในที่มืด[ 31 ]

สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม

เอนไซม์ ATP synthase ที่แยกได้จากไมโทคอนเดรียหัวใจวัว ( Bos taurus ) ถือเป็น ATP synthase ที่ได้รับการศึกษาลักษณะเฉพาะมากที่สุดในแง่ของชีวเคมีและโครงสร้าง หัวใจวัวถูกใช้เป็นแหล่งของเอนไซม์เนื่องจากมีไมโทคอนเดรียในกล้ามเนื้อ หัวใจในปริมาณมาก ยีนของ เอนไซม์เหล่านี้มีความคล้ายคลึงกับ ATP synthase ของมนุษย์[ 32 ] [ 33 ] [ 34 ]

ยีนของมนุษย์ที่เข้ารหัสส่วนประกอบของเอนไซม์ ATP synthase:

ยูคาริโอตอื่นๆ

ยูคาริ โอตที่อยู่ในสายพันธุ์ที่แตกต่างกันบางสายพันธุ์มีโครงสร้างพิเศษของ ATP synthase ATP synthase ของยูเกลโนซัวก่อตัวเป็นไดเมอร์ที่มีหัว F 1 รูปทรงบูมเมอแรง เช่นเดียวกับ ATP synthase ไมโทคอนเดรียอื่นๆ แต่ซับคอมเพล็กซ์ F Oมีซับยูนิตเฉพาะจำนวนมาก มันใช้คาร์ดิโอลิปิน นอกจากนี้ IF 1 ที่ยับยั้ง ยังจับตัวในลักษณะที่แตกต่างกัน ซึ่งเป็นลักษณะที่พบได้ในไทรพาโนโซมาติดา[ 35 ]

อะพิคอมเพล็กซานเช่นพลาสโมเดียมใช้โครงสร้าง ATP ซินเทสแบบเฮกซาเมอร์ิกซึ่งมีอยู่เป็นไตรเมอร์ของไดเมอร์ ATP ซินเทส โครงสร้างเฮกซาเมอร์ิกเหล่านี้จัดเรียงตัวเป็นพีระมิดห้าเหลี่ยมซึ่งทำให้เกิดรูปร่างของเยื่อหุ้มคริสตาที่มีลักษณะเป็นกระเปาะที่เป็นเอกลักษณ์ โครงสร้างนี้ได้รับการสนับสนุนโดยทั้งซับยูนิตเฉพาะของอะพิคอมเพล็กซานและคาร์ดิโอลิปิน[ 36 ]

อาร์เคีย

โดยทั่วไปอาร์เคียไม่มี F-ATPase แต่พวกมันสังเคราะห์ ATP โดยใช้ A-ATPase/synthase ซึ่งเป็นเครื่องจักรหมุนที่มีโครงสร้างคล้ายกับ V-ATPase แต่ส่วนใหญ่ทำหน้าที่เป็น ATP synthase [ 26 ]เช่นเดียวกับ F-ATPase ของแบคทีเรีย เชื่อกันว่ามันยังทำหน้าที่เป็น ATPase ด้วย[ 9 ]

LUCA และรุ่นก่อนหน้า

การเชื่อมโยงยีน F-ATPase และลำดับยีนได้รับการอนุรักษ์อย่างกว้างขวางในสายพันธุ์โปรคาริโอตโบราณ ซึ่งหมายความว่าระบบนี้มีอยู่แล้วตั้งแต่ก่อนบรรพบุรุษร่วมสากลสุดท้าย LUCA [ 37 ]

ดูเพิ่มเติม

อ่านเพิ่มเติม

  • Nick Lane: คำถามสำคัญ: พลังงาน วิวัฒนาการ และต้นกำเนิดของสิ่งมีชีวิตที่ซับซ้อน , Ww Norton, 2015-07-20, ISBN 978-0393088816(ลิงก์ไปยังรูปที่ 10 ซึ่งแสดงแบบจำลองของเอนไซม์ ATP synthase)
  • Boris A. Feniouk: "เอนไซม์ ATP synthase — เครื่องจักรโมเลกุลอันน่าทึ่ง"
  • วิดีโอบรรยายเรื่อง ATP synthase ที่มีภาพประกอบอย่างดีถูกเก็บไว้ในWayback Machine เมื่อวันที่ 2 ธันวาคม 2008 โดย Antony Crofts จากมหาวิทยาลัยอิลลินอยส์ เออร์บานา-แชมเปญ
  • โปรตอนและโซเดียมทรานสโลเคติง ATPase ชนิด F, V และ A ในฐานข้อมูล OPM
  • รางวัลโนเบลสาขาเคมีประจำปี 1997มอบให้แก่ พอล ดี. โบเยอร์ และ จอห์น อี. วอล์กเกอร์ สำหรับกลไกทางเอนไซม์ของการสังเคราะห์ ATP และมอบให้แก่ เยนส์ ซี. สโกว์ สำหรับการค้นพบเอนไซม์ขนส่งไอออนNa++, เค+-เอทีพีเอส
  • เว็บไซต์ผลิตสื่อมัลติมีเดียของมหาวิทยาลัยฮาร์วาร์ด — วิดีโอ – แอนิเมชั่นการสังเคราะห์ ATP
  • เดวิด กู๊ดเซลล์: "เอนไซม์ ATP Synthase - โมเลกุลประจำเดือน" เก็บถาวรเมื่อ 5 กันยายน 2015 ที่Wayback Machine
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=ATP_synthase&oldid=1356424084 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เอทีพี ซินเทส

เอนไซม์ ATP synthase เป็น เอนไซม์ ที่เร่งปฏิกิริยาการสร้างโมเลกุลเก็บพลังงาน อะดีโนซีนไตรฟอสเฟต (ATP) โดยใช้ อะดีโนซีนไดฟอสเฟต (ADP) และ ฟอสเฟต อนินทรีย์ (Pi ) ATP synthase เป็น...

การตั้งชื่อ

เศษส่วน F 1 ได้รับชื่อมาจากคำว่า "เศษส่วน 1" และ F O (เขียนเป็นตัวห้อย "o" ไม่ใช่ "ศูนย์") ได้รับชื่อมาจากการเป็นเศษส่วนที่จับกับ โอลิโกไมซิน ซึ่งเป็นยาปฏิชีวนะที่ได้จากธรรมชาติชนิดหนึ่งที่สามารถยับยั้งหน่วย F O ของ ATP synthase ได้ [ 3 ] [ 4 ]...

โครงสร้างและหน้าที่

ATP synthase ซึ่งอยู่ภายใน เยื่อไทลาคอยด์ และ เยื่อไมโทคอนเดรียชั้นใน ประกอบด้วยสองส่วนคือ F O และ F 1 F O ทำให้เกิดการหมุนของ F 1 และประกอบด้วยวงแหวน c และหน่วยย่อย a, b สองหน่วย และ F6 F 1 ประกอบด้วยหน่วยย่อย α, β, γ และ δ F 1...

ภูมิภาคF 1

ส่วน F1 ของเอนไซม์ ATP synthase มี คุณสมบัติ ชอบน้ำ และทำหน้าที่ไฮโดรไลซ์ ATP หน่วย F1 ยื่น เข้าไปในไซโตพลาสซึม ( เมทริกซ์ และ สโตรมา ใน ไมโทคอนเดรียและคลอโรพลาสต์ตามลำดับ) หน่วยย่อย α และ β รวมกันเป็นเฮกซาเมอร์ที่มีตำแหน่งจับ 6 ตำแหน่ง...