การควบคุมศัตรูพืชทางชีวภาพเป็นวิธีการควบคุมศัตรูพืช เช่นแมลงและไรโดยใช้สิ่งมีชีวิตอื่น [ ^{12 ] วิธี}นี้อาศัยการล่าเหยื่อปรสิตการ กิน พืชปรสิตชนิดอื่นหรือกลไกทางธรรมชาติอื่นๆ แต่โดยทั่วไปแล้วยังเกี่ยวข้องกับบทบาทการจัดการของมนุษย์ด้วย การควบคุมทางชีวภาพแบบดั้งเดิมเกี่ยวข้องกับการนำศัตรูธรรมชาติของศัตรูพืชที่เพาะพันธุ์ในห้องปฏิบัติการและปล่อยสู่สิ่งแวดล้อม แนวทางอื่นคือการเพิ่มจำนวนศัตรูธรรมชาติที่มีอยู่ในพื้นที่นั้นๆ โดยการปล่อยเพิ่มขึ้น ไม่ว่าจะเป็นการปล่อยเป็นชุดเล็กๆ ซ้ำๆ หรือปล่อยในครั้งเดียวในปริมาณมาก ในอุดมคติแล้ว สิ่งมีชีวิตที่ปล่อยออกมาจะสามารถขยายพันธุ์และอยู่รอดได้ และให้การควบคุมในระยะยาว^{[ 13 ]}การควบคุมทางชีวภาพสามารถเป็นองค์ประกอบสำคัญของโปรแกรมการจัดการศัตรูพืชแบบบูรณาการได้

ตัวอย่างเช่น ยุงมักถูกควบคุมโดยการใส่Bt Bacillus thuringiensis ssp. israelensisซึ่งเป็นแบคทีเรียที่ติดเชื้อและฆ่าตัวอ่อนยุง ลงในแหล่งน้ำในท้องถิ่น^{[ 14 ]}

การควบคุมศัตรูพืชทางกลคือการใช้เทคนิคด้วยมือ รวมถึงอุปกรณ์และเครื่องมืออย่างง่าย ๆ ที่สร้างแนวป้องกันระหว่างพืชและแมลงวิธีนี้เรียกว่าการไถพรวนและเป็นหนึ่งในวิธีการควบคุมวัชพืชที่เก่าแก่ที่สุด รวมถึงมีประโยชน์ในการควบคุมศัตรูพืชด้วย หนอนลวด ซึ่งเป็นตัวอ่อนของด้วงคลิกทั่วไปเป็นศัตรูพืชที่สร้างความเสียหายอย่างมากต่อทุ่งหญ้าที่เพิ่งไถพรวน และการไถพรวนซ้ำ ๆ จะทำให้พวกมันตกเป็นเหยื่อของนกและสัตว์นักล่าอื่น ๆ ที่กินพวกมัน^{[ 15 ]}

การหมุนเวียนพืชสามารถช่วยควบคุมศัตรูพืชได้โดยการกำจัดพืชที่เป็นแหล่งอาหาร ของพวกมัน ถือเป็นกลยุทธ์หลักในการควบคุมหนอนรากข้าวโพดและช่วยลดการระบาดของด้วงมันฝรั่งโคโลราโด ในช่วงต้นฤดู ได้มากถึง 95% ^{[ 16 ]}

พืชล่อแมลงคือพืชที่ดึงดูดแมลงศัตรูพืช ทำให้พวกมันเบี่ยงเบนความสนใจจากพืชใกล้เคียง^{[ 17 ]}แมลงศัตรูพืชที่รวมตัวกันบนพืชล่อแมลงสามารถควบคุมได้ง่ายขึ้นโดยใช้ยาฆ่าแมลงหรือวิธีการอื่น ๆ^{[ 18 ]}อย่างไรก็ตาม การปลูกพืชล่อแมลงเพียงอย่างเดียวมักไม่สามารถลดความหนาแน่นของแมลงศัตรูพืชได้อย่างคุ้มค่าในระดับเชิงพาณิชย์ขนาดใหญ่ โดยไม่ต้องใช้ยาฆ่าแมลง อาจเป็นเพราะแมลงศัตรูพืชสามารถแพร่กระจายกลับไปยังแปลงหลักได้^{[ 18 ]}

สารกำจัดศัตรูพืชเป็นสารที่ใช้กับพืชผลเพื่อควบคุมศัตรูพืช ซึ่งรวมถึงสารกำจัดวัชพืชสารกำจัดเชื้อรา และสารกำจัดแมลงวิธีการใช้ได้แก่ การฉีดพ่นด้วยมือ รถแทรกเตอร์ หรือเครื่องบิน หรือการเคลือบเมล็ดพืชเพื่อให้ได้ผล ต้องใช้สารที่ถูกต้อง ในเวลาที่เหมาะสม และวิธีการใช้มีความสำคัญเพื่อให้แน่ใจว่ามีการครอบคลุมและคงอยู่บนพืชอย่างเพียงพอ ควรลดการฆ่าศัตรูตามธรรมชาติของศัตรูพืชเป้าหมายให้น้อยที่สุด สิ่งนี้มีความสำคัญอย่างยิ่งในประเทศที่มีแหล่งสะสมตามธรรมชาติของศัตรูพืชและศัตรูของพวกมันในพื้นที่ชนบทโดยรอบพืชผลทางการเกษตร และสิ่งเหล่านี้อยู่ร่วมกันอย่างสมดุล บ่อยครั้งในประเทศที่กำลังพัฒนา พืชผลปรับตัวเข้ากับสภาพแวดล้อมในท้องถิ่นได้ดี และไม่จำเป็นต้องใช้สารกำจัดศัตรูพืช ในขณะที่เกษตรกรที่ก้าวหน้าใช้ปุ๋ยเพื่อปลูกพืชพันธุ์ที่ดีขึ้น พืชเหล่านั้นมักจะอ่อนแอต่อความเสียหายจากศัตรูพืชมากขึ้น แต่การใช้สารกำจัดศัตรูพืชอย่างไม่เลือกปฏิบัติอาจเป็นอันตรายในระยะยาว^{[ 19 ]} ประสิทธิภาพของสารเคมีกำจัดศัตรูพืชมีแนวโน้มลดลงเมื่อเวลาผ่านไป เนื่องจากสิ่งมีชีวิตใดๆ ที่สามารถรอดชีวิตจากการใช้ครั้งแรกจะส่งต่อยีนของตนไปยังลูกหลานและ จะเกิด สายพันธุ์ที่ต้านทานขึ้น ด้วยวิธีนี้ ศัตรูพืชที่ร้ายแรงที่สุดบางชนิดจึงพัฒนาความต้านทานและไม่ถูกฆ่าด้วยสารเคมีกำจัดศัตรูพืชที่เคยฆ่าบรรพบุรุษของพวกมันได้อีกต่อไป ซึ่งจำเป็นต้องใช้สารเคมีที่มีความเข้มข้นสูงขึ้น การใช้บ่อยขึ้น และการเปลี่ยนไปใช้สูตรที่มีราคาแพงกว่า^{[ 20 ]}

สารกำจัดศัตรูพืชมีจุดประสงค์เพื่อฆ่าศัตรูพืช แต่หลายชนิดมีผลเสียต่อสิ่งมีชีวิตที่ไม่ใช่เป้าหมาย โดยเฉพาะอย่างยิ่งความเสียหายที่เกิดขึ้นกับผึ้ง ผึ้งเดี่ยว และแมลงผสมเกสร อื่นๆ และในเรื่องนี้ เวลาที่ฉีดพ่นอาจมีความสำคัญ^{[ 21 ]} สาร นีโอนิโคตินอยด์ที่ใช้กันอย่างแพร่หลายถูกห้ามใช้ในพืชดอกในบางประเทศเนื่องจากมีผลกระทบต่อผึ้ง^{[ 21 ]}สารกำจัดศัตรูพืชบางชนิดอาจก่อให้เกิดมะเร็งและปัญหาสุขภาพอื่นๆ ในมนุษย์ รวมถึงเป็นอันตรายต่อสัตว์ป่าด้วย^{[ 22 ]}อาจมีผลกระทบเฉียบพลันทันทีหลังจากการสัมผัส หรือผลกระทบเรื้อรังหลังจากการสัมผัสในระดับต่ำอย่างต่อเนื่อง หรือการสัมผัสเป็นครั้งคราว^{[ 23 ]} หลายประเทศกำหนดขีดจำกัดสูงสุดของสาร ตกค้างสำหรับสารกำจัดศัตรูพืชในอาหารและอาหารสัตว์ ^{[ 24 ]}

การใช้พืชที่มี ความต้านทานต่อ ศัตรูพืชที่ถ่ายทอดทางพันธุกรรมเรียกว่าความต้านทานของพืชเจ้าบ้าน และช่วยลดความจำเป็นในการใช้สารกำจัดศัตรูพืช พืชเหล่านี้สามารถทำร้ายหรือแม้กระทั่งฆ่าศัตรูพืช ขับไล่การกิน ป้องกันการแพร่กระจาย หรือทนต่อการมีอยู่ของศัตรูพืชโดยไม่ส่งผลกระทบต่อผลผลิตอย่างมีนัยสำคัญ^{[ 25 ] [ 26 ] [ 27 ]}ความต้านทานยังสามารถเกิดขึ้นได้ผ่านวิศวกรรมพันธุกรรมเพื่อให้มีลักษณะที่ต้านทานต่อแมลง เช่นข้าวโพด Btหรือความต้านทานของมะละกอต่อไวรัสจุดวงแหวน^{[ 28 ]}เมื่อเกษตรกรซื้อเมล็ดพันธุ์ ข้อมูลพันธุ์มักจะรวมถึงความต้านทานต่อศัตรูพืชที่เลือกไว้ นอกเหนือจากลักษณะอื่นๆ^{[ 29 ]}

การควบคุมศัตรูพืชยังสามารถทำได้โดยการกำจัดสัตว์ที่เป็นศัตรูพืช ซึ่งโดยทั่วไปแล้วจะเป็นสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมหรือนกป่าหรือสัตว์ป่าขนาดเล็กถึงขนาดกลางที่อาศัยอยู่ในแหล่งที่อยู่อาศัยทางนิเวศวิทยาใกล้ฟาร์มทุ่งหญ้าหรือชุมชนมนุษย์อื่นๆโดยใช้คนล่าหรือคนดักจับเพื่อติดตาม ฆ่า และนำพวกมันออกจากพื้นที่ สัตว์ที่ถูกกำจัด ซึ่งเรียกว่าสัตว์รบกวนอาจถูกกำจัดเพราะถือว่าเป็นอันตรายต่อพืชผลทางการเกษตร ปศุสัตว์ หรือสิ่งอำนวยความสะดวกเป็นพาหะหรือตัวนำเชื้อโรคที่แพร่ข้ามสายพันธุ์หรือสู่มนุษย์หรือเพื่อควบคุมประชากรเพื่อเป็นการปกป้อง สายพันธุ์ และระบบนิเวศที่เปราะบางอื่นๆ^{[ 30 ]}

การควบคุมศัตรูพืชโดยการล่าสัตว์ เช่นเดียวกับการเก็บเกี่ยวทุกรูปแบบ ได้สร้างแรงกดดันในการคัดเลือกเทียมต่อสิ่งมีชีวิตที่เป็นเป้าหมาย ในขณะที่การล่าสัตว์รบกวนอาจเป็นการคัดเลือกให้เกิด การเปลี่ยนแปลง พฤติกรรมและประชากร ที่ต้องการ (เช่น สัตว์หลีกเลี่ยงพื้นที่ที่มีมนุษย์อาศัยอยู่ พืชผล และปศุสัตว์) แต่ก็อาจส่งผลให้เกิดผลลัพธ์ที่ไม่คาดคิด เช่น สัตว์ที่เป็นเป้าหมายปรับตัวให้มีวงจรการสืบพันธุ์ที่เร็วขึ้น^{[ 31 ]}

Physical pest control involves trapping or killing pests such as insects and rodents. Historically, local people or paid rat-catchers caught and killed rodents using dogs and traps.^[36] On a domestic scale, sticky flypapers are used to trap flies. In larger buildings, insects may be trapped using such means as pheromones, synthetic volatile chemicals or ultraviolet light to attract the insects; some have a sticky base or an electrically charged grid to kill them. Glueboards are sometimes used for monitoring cockroaches and to catch rodents. Rodents can be killed by suitably baited spring traps and can be caught in cage traps for relocation. Talcum powder or "tracking powder" can be used to establish routes used by rodents inside buildings and acoustic devices can be used for detecting beetles in structural timbers.^[35]

Historically, firearms have been one of the primary methods used for pest control. "Garden Guns" are smooth bore shotguns specifically made to fire .22 calibersnake shot or 9mm Flobert, and are commonly used by gardeners and farmers for snakes, rodents, birds, and other pest. Garden Guns are short-range weapons that can do little harm past 15 to 20 yards, and they're relatively quiet when fired with snake shot, compared to standard ammunition. These guns are especially effective inside of barns and sheds, as the snake shot will not shoot holes in the roof or walls, or more importantly, injure livestock with a ricochet. They are also used for pest control at airports, warehouses, stockyards, etc.^[37]

กระสุนปืนลูกซองที่ใช้กันทั่วไปมากที่สุดคือ .22 Long Rifle บรรจุลูกปืนเบอร์ 12 ที่ระยะห่างประมาณ10 ฟุต (3.0 เมตร)ซึ่งเป็นระยะหวังผลสูงสุด กลุ่มกระสุนจะมีขนาดเส้นผ่านศูนย์กลางประมาณ8 นิ้ว (20 เซนติเมตร)จากปืนไรเฟิลมาตรฐาน ปืนลูกซองลำกล้องเรียบแบบพิเศษ เช่นMarlin Model 25MGสามารถสร้างกลุ่มกระสุนที่มีประสิทธิภาพได้ไกลถึง 15 หรือ 20 หลา โดยใช้กระสุน .22 WMR ซึ่งบรรจุลูกปืนเบอร์ 12 ขนาด 1/8 ออนซ์ ในแคปซูลพลาสติก    

เหยื่อพิษเป็นวิธีการทั่วไปในการควบคุมหนู นก ทาก หอยทาก มด แมลงสาบ และศัตรูพืชอื่นๆ เม็ดพื้นฐานหรือสูตรอื่นๆ ประกอบด้วยสารดึงดูดอาหารสำหรับสัตว์เป้าหมายและสารพิษที่เหมาะสม สำหรับมด จำเป็นต้องใช้สารพิษที่ออกฤทธิ์ช้าเพื่อให้มดงานมีเวลาขนสารกลับไปยังรัง และสำหรับแมลงวัน จำเป็นต้องใช้สารที่ออกฤทธิ์เร็วเพื่อป้องกันการวางไข่และการรบกวนเพิ่มเติม^{[ 38 ]}เหยื่อสำหรับทากและหอยทากมักมีสารฆ่าหอยทากเมทัลดีไฮด์ซึ่งเป็นอันตรายต่อเด็กและสัตว์เลี้ยงในบ้าน^{[ 39 ]}

บทความในScientific Americanในปี พ.ศ. 2428 อธิบายถึงการกำจัดแมลงสาบ อย่างมีประสิทธิภาพโดยใช้ เปลือกแตงกวาสด^{[ 40 ]}

วาร์ฟารินถูกใช้เพื่อฆ่าหนูมาแต่เดิม แต่ประชากรหนูจำนวนมากได้พัฒนาความต้านทานต่อสารต้านการแข็งตัวของเลือด ชนิดนี้ และ อาจใช้ ไดฟีนาคุมแทนได้ สารพิษเหล่านี้มีฤทธิ์สะสม จึงต้องเติมเหยื่อในสถานีเหยื่ออย่างสม่ำเสมอ^{[ 38 ]}เนื้อสัตว์ที่ปนเปื้อนสารพิษถูกใช้มานานหลายศตวรรษเพื่อฆ่าสัตว์ต่างๆ เช่น หมาป่า^{[ 41 ]}และนกเหยี่ยว^{[ 42 ]}อย่างไรก็ตาม ซากสัตว์ที่ปนเปื้อนสารพิษจะฆ่าสัตว์กินซากได้หลากหลายชนิด ไม่ใช่เฉพาะชนิดที่กำหนดเป้าหมายไว้เท่านั้น^{[ 41 ]}นกเหยี่ยวในอิสราเอลเกือบสูญพันธุ์หลังจากช่วงเวลาที่มีการวางยาพิษหนูและศัตรูพืชอื่นๆ อย่างรุนแรง^{[ 43 ]}

การรมควันคือการบำบัดโครงสร้างเพื่อฆ่าศัตรูพืช เช่น ด้วงเจาะไม้ โดยการปิดผนึกหรือล้อมรอบด้วยวัสดุกันอากาศ เช่น เต็นท์ และพ่นด้วยยาฆ่าแมลงเหลวเป็นระยะเวลานาน โดยทั่วไปคือ 24–72 ชั่วโมง วิธีนี้มีราคาแพงและไม่สะดวก เนื่องจากโครงสร้างไม่สามารถใช้งานได้ในระหว่างการบำบัด แต่สามารถกำจัดศัตรูพืชได้ทุกระยะของวงจรชีวิต^{[ 44 ]}

ทางเลือกอื่นคือการบำบัดในอากาศ โดยการพ่นหมอกหรือละอองเพื่อกระจายยาฆ่าแมลงเหลวในบรรยากาศภายในอาคารโดยไม่ต้องอพยพหรือปิดผนึกอย่างแน่นหนา ทำให้สามารถดำเนินงานส่วนใหญ่ภายในอาคารต่อไปได้ แม้ว่าจะลดประสิทธิภาพในการซึมผ่านลงก็ตาม โดยทั่วไปจะใช้ยาฆ่าแมลงแบบสัมผัสเพื่อลดผลกระทบตกค้างในระยะยาว^{[ 44 ]}

บางครั้งประชากรของแมลงศัตรูพืชสามารถลดลงอย่างมากได้ด้วยการปล่อยตัวที่เป็นหมัน วิธีนี้เกี่ยวข้องกับการเพาะเลี้ยงแมลงศัตรูพืชจำนวนมาก ทำให้เป็นหมันโดยใช้รังสีเอ็กซ์หรือวิธีอื่น ๆ แล้วปล่อยกลับคืนสู่ประชากรในธรรมชาติ วิธีนี้มีประโยชน์อย่างยิ่งในกรณีที่ตัวเมียผสมพันธุ์เพียงครั้งเดียวและแมลงไม่แพร่กระจายอย่างกว้างขวาง^{[ 45 ]}เทคนิคนี้ได้รับการใช้ประสบความสำเร็จในการกำจัดแมลงวันหนอนเจาะลำต้นในโลกใหม่ แมลงวันเซ็ตซีบางชนิดแมลงวันผลไม้เขตร้อนหนอนเจาะฝักสีชมพูและหนอนเจาะผลแอปเปิ้ลเป็นต้น^{[ 46 ]}

เพื่อฆ่าเชื้อศัตรูพืชด้วยสารเคมีโดยใช้สารเคมีฆ่าเชื้อ มีการศึกษาในห้องปฏิบัติการโดยใช้U-5897 (3-chloro-1,2-propanediol) ในช่วงต้นทศวรรษ 1970 เพื่อควบคุมหนู แม้ว่าจะไม่ประสบความสำเร็จก็ตาม^{[ 47 ]}ในปี 2013 นครนิวยอร์กได้ทดสอบกับดักฆ่าเชื้อ^{[ 48 ]}ซึ่งแสดงให้เห็นว่าประชากรหนูลดลง 43% ^{[ 48 ]}ผลิตภัณฑ์ContraPestได้รับการอนุมัติให้ใช้ฆ่าเชื้อหนูโดยสำนักงานคุ้มครองสิ่งแวดล้อมแห่งสหรัฐอเมริกาในเดือนสิงหาคม 2016 ในฐานะสารเคมีฆ่าเชื้อ^{[ 49 ]}

โบรอนซึ่งเป็นสารกำจัดศัตรูพืชที่รู้จักกันดี สามารถแทรกซึมเข้าไปในเส้นใยกระดาษของฉนวนเซลลูโลสในระดับหนึ่ง เพื่อให้ได้ปัจจัยการฆ่าเชิงกลสำหรับแมลงที่ทำความสะอาดตัวเอง เช่น มด แมลงสาบ ปลวก และอื่นๆ การเพิ่มฉนวนเข้าไปในห้องใต้หลังคาและผนังของโครงสร้างสามารถช่วยควบคุมศัตรูพืชทั่วไปได้ นอกเหนือจากประโยชน์ของฉนวนที่รู้จักกันดี เช่น ฉนวนกันความร้อนที่แข็งแรง และคุณสมบัติในการลดเสียงรบกวนEPAควบคุมสารกำจัดศัตรูพืชประเภทนี้ที่ใช้กันทั่วไปในสหรัฐอเมริกา โดยอนุญาตให้ขายและติดตั้งโดยผู้เชี่ยวชาญด้านการจัดการศัตรูพืชที่ได้รับใบอนุญาตเท่านั้น ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของโปรแกรมการจัดการศัตรูพืชแบบบูรณาการ^{[ 50 ]}การเติมโบรอนหรือสารกำจัดศัตรูพืชที่จดทะเบียนกับ EPA ลงในฉนวนเพียงอย่างเดียวไม่ได้ทำให้มีคุณสมบัติเป็นสารกำจัดศัตรูพืช ปริมาณและวิธีการต้องได้รับการควบคุมและตรวจสอบอย่างระมัดระวัง